Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0282
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0282, 664 aa
1>>>pF1KSDA0282 664 - 664 aa - 664 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9523+/-0.00093; mu= 8.5157+/- 0.056
mean_var=173.4577+/-36.194, 0's: 0 Z-trim(111.5): 64 B-trim: 730 in 1/51
Lambda= 0.097382
statistics sampled from 12355 (12415) to 12355 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.719), E-opt: 0.2 (0.381), width: 16
Scan time: 3.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9703.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14 ( 710) 4566 654.0 2e-187
CCDS45105.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14 ( 550) 3691 531.0 1.7e-150
CCDS73048.1 TRIM67 gene_id:440730|Hs108|chr1 ( 721) 2411 351.3 2.8e-96
CCDS44333.1 TRIM67 gene_id:440730|Hs108|chr1 ( 783) 2387 347.9 3.1e-95
CCDS75287.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 ( 716) 610 98.2 4.1e-20
CCDS4115.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 ( 728) 610 98.2 4.2e-20
CCDS14533.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX ( 705) 562 91.5 4.4e-18
CCDS14138.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX ( 667) 558 90.9 6.2e-18
CCDS14532.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX ( 735) 507 83.8 9.6e-16
CCDS78047.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 ( 573) 487 80.9 5.5e-15
CCDS72932.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 ( 633) 402 69.0 2.4e-11
>>CCDS9703.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14 (710 aa)
initn: 4566 init1: 4566 opt: 4566 Z-score: 3478.3 bits: 654.0 E(32554): 2e-187
Smith-Waterman score: 4566; 99.8% identity (100.0% similar) in 661 aa overlap (1-661:1-661)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQTPESESPQSHRAAGSGVSDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQTPESESPQSHRAAGSGVSDY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPNGVRVFPPAMPPPATHLSPALAPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPNGVRVFPPAMPPPATHLSPALAPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQSKAAALKCQLCEKAPKEATV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 PRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQSKAAALKCQLCEKAPKEATV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD MCEQCDVFYCDPCRLRCHPPRGPLAKHRLVPPAQGRVSRRLSPRKVSTCTDHELENHSMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MCEQCDVFYCDPCRLRCHPPRGPLAKHRLVPPAQGRVSRRLSPRKVSTCTDHELENHSMY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWKLHKSQLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 CVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWKLHKSQLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRKAQLLARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRKAQLLARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIRRVHLTEDQWGKGTLTPRMTTDFDLSLDNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 RQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIRRVHLTEDQWGKGTLTPRMTTDFDLSLDNS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEECCTHNNSATLSWKQPPLSTVPADGYILELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 PLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEECCTHNNSATLSWKQPPLSTVPADGYILELD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD DGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNSTYNARVKAFNKTGVSPYSKTLVLQTSEVAWFAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNSTYNARVKAFNKTGVSPYSKTLVLQTSEVAWFAF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DPGSAHSDIILSNDNLTVTCSSYDDRVVLGKTGFSKGIHYWELTVDRYDNHPDPAFGVAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DPGSAHSDIILSNDNLTVTCSSYDDRVVLGKTGFSKGIHYWELTVDRYDNHPDPAFGVAR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD MDVMKDVMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHNNSHTNRTEGGITKGATIGVLLDFNRKNLTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS97 MDVMKDVMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHNNSHTNRTEGGITKGATIGVLLDLNRKNLTF
610 620 630 640 650 660
pF1KSD FYQR
:
CCDS97 FINDEQQGPIAFDNVEGLFFPAVSLNRNVQVTLHTGLPVPDFYSSRASIA
670 680 690 700 710
>>CCDS45105.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14 (550 aa)
initn: 3691 init1: 3691 opt: 3691 Z-score: 2815.5 bits: 531.0 E(32554): 1.7e-150
Smith-Waterman score: 3691; 100.0% identity (100.0% similar) in 534 aa overlap (1-534:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQTPESESPQSHRAAGSGVSDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQTPESESPQSHRAAGSGVSDY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPNGVRVFPPAMPPPATHLSPALAPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPNGVRVFPPAMPPPATHLSPALAPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQSKAAALKCQLCEKAPKEATV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQSKAAALKCQLCEKAPKEATV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD MCEQCDVFYCDPCRLRCHPPRGPLAKHRLVPPAQGRVSRRLSPRKVSTCTDHELENHSMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MCEQCDVFYCDPCRLRCHPPRGPLAKHRLVPPAQGRVSRRLSPRKVSTCTDHELENHSMY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWKLHKSQLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWKLHKSQLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRKAQLLARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRKAQLLARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIRRVHLTEDQWGKGTLTPRMTTDFDLSLDNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIRRVHLTEDQWGKGTLTPRMTTDFDLSLDNS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEECCTHNNSATLSWKQPPLSTVPADGYILELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEECCTHNNSATLSWKQPPLSTVPADGYILELD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD DGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNSTYNARVKAFNKTGVSPYSKTLVLQTSEVAWFAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNSTYNARVKAFNKTGVSPYSKTLVLQTSEGKALQQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DPGSAHSDIILSNDNLTVTCSSYDDRVVLGKTGFSKGIHYWELTVDRYDNHPDPAFGVAR
CCDS45 YPSERELRGI
550
>>CCDS73048.1 TRIM67 gene_id:440730|Hs108|chr1 (721 aa)
initn: 1912 init1: 1282 opt: 2411 Z-score: 1841.9 bits: 351.3 E(32554): 2.8e-96
Smith-Waterman score: 3147; 66.6% identity (84.5% similar) in 686 aa overlap (4-661:1-671)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQTPESESPQSHRAAGSGVSDY
::::::::::::..:::::::::::.: :::.: ::::.. : . ..:.: .
CCDS73 MEEELKCPVCGSLFREPIILPCSHNVCLPCARTIAVQTPDGGSAAGGLGGGAG-GGG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPNGVRVFPPAMPPPATHLSPALAPV
:. ::.:::::.::::::: :: ::::::::.: . ::.. . : . .
CCDS73 DHA--DKLSLYSETDSGYGSY--------TPSLKSPNGVRVLPMVPAPPGSSAAAARGAA
60 70 80 90 100
130 140 150 160
pF1KSD -----PRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQ--------SKAAALK
.: ::::::::: :: :::::: .::.::....:::: : :::.
CCDS73 CSSLSSSSSSITCPQCHRSASLDHRGLRGFQRNRLLEAIVQRYQQGRGAVPGTSAAAAVA
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KSD -CQLCEKAPKE-ATVMCEQCDVFYCDPCRLRCHPPRGPLAKHRLVPPAQGRVSRRLSP--
::::...: : :...::::::.::. :.:.::: :::.::::: :. : . ::
CCDS73 ICQLCDRTPPEPAATLCEQCDVLYCSACQLKCHPSRGPFAKHRLGAPSGGGGCK--SPGG
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KSD -----------RKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWKL
:: :: .::.::.:::::.:. :::: :::::.:..:::: ::::::
CCDS73 AGAGATGGSTARKFPTCPEHEMENYSMYCVSCRTPVCYLCLEEGRHAKHEVKPLGAMWKQ
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KSD HKSQLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRNMVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRKA
::.::::::::.::.:::::::::::.:..::::::....:::::::::::.:::.:.::
CCDS73 HKAQLSQALNGVSDKAKEAKEFLVQLKNILQQIQENGLDYEACLVAQCDALVDALTRQKA
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QLLARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIRR
.::..:.::.:::::.: :::.:::.::::.:::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS73 KLLTKVTKEREHKLKMVWDQINHCTLKLRQSTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIKR
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KSD VHLTEDQWGKGTLTPRMTTDFDLSLDNSPLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEECC
:.....:: ::.: :.....:::.::. ::::.::::::.:.: :: .:.::::.::
CCDS73 VQVSQEQWVKGALEPKVSAEFDLTLDSEPLLQAIHQLDFIQMKCR--VPPVPLLQLEKCC
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KSD THNNSATLSWKQPPLSTVPADGYILELDDGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNSTYNAR
:.:::.::.:..::.. :.:::::::::: :::::::::::::.::.::::::::::::
CCDS73 TRNNSVTLAWRMPPFTHSPVDGYILELDDGAGGQFREVYVGKETLCTIDGLHFNSTYNAR
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KSD VKAFNKTGVSPYSKTLVLQTSEVAWFAFDPGSAHSDIILSNDNLTVTCSSYDDRVVLGKT
:::::..::.:::::.:::::.::::.:::.:.: :::::::: :.:::::::::::: .
CCDS73 VKAFNSSGVGPYSKTVVLQTSDVAWFTFDPNSGHRDIILSNDNQTATCSSYDDRVVLGTA
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KSD GFSKGIHYWELTVDRYDNHPDPAFGVARMDVMKDVMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHNNS
.::::.::::: :::::::::::::::: .:.::.:::::::::::::::::::::: ::
CCDS73 AFSKGVHYWELHVDRYDNHPDPAFGVARASVVKDMMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHCNS
590 600 610 620 630 640
640 650 660
pF1KSD HTNRTEGGITKGATIGVLLDFNRKNLTFFYQR
::::::::. ::::.:::::.:...::::
CCDS73 HTNRTEGGVCKGATVGVLLDLNKHTLTFFINGQQQGPTAFSHVDGVFMPALSLNRNVQVT
650 660 670 680 690 700
>>CCDS44333.1 TRIM67 gene_id:440730|Hs108|chr1 (783 aa)
initn: 1920 init1: 1282 opt: 2387 Z-score: 1823.2 bits: 347.9 E(32554): 3.1e-95
Smith-Waterman score: 2885; 62.4% identity (79.8% similar) in 697 aa overlap (19-661:47-733)
10 20 30 40
pF1KSD MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQTPESESPQ
.:..: . .: . : .. . .:
CCDS44 PIILPCSHNVCLPCARTIAVQTPDGEQHLPQPLLLSRGSGLQAGAAAAASLEHDAAAGPA
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KSD SHRAAGS------GVSDYDYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPNGVRVF
:.:: : . ::.:::::.::::::: :: ::::::::.
CCDS44 CGGAGGSAAGGLGGGAGGGGDHADKLSLYSETDSGYGSY--------TPSLKSPNGVRVL
80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KSD PPAMPPPATHLSPALAPV-----PRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGVIDR
: . ::.. . : . . .: ::::::::: :: :::::: .::.::....:
CCDS44 PMVPAPPGSSAAAARGAACSSLSSSSSSITCPQCHRSASLDHRGLRGFQRNRLLEAIVQR
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KSD YQQ--------SKAAALK-CQLCEKAPKE-ATVMCEQCDVFYCDPCRLRCHPPRGPLAKH
::: : :::. ::::...: : :...::::::.::. :.:.::: :::.:::
CCDS44 YQQGRGAVPGTSAAAAVAICQLCDRTPPEPAATLCEQCDVLYCSACQLKCHPSRGPFAKH
190 200 210 220 230 240
210 220 230
pF1KSD RLV-------PPA----------QGRVSRR---LSP-------------RKVSTCTDHEL
::: ::: :: : :: :: :: .::.
CCDS44 RLVQPPPPPPPPAEAASGPTGTAQGAPSGGGGCKSPGGAGAGATGGSTARKFPTCPEHEM
250 260 270 280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWKLHKSQLSQALNGLSDRAKEAKEF
::.:::::.:. :::: :::::.:..:::: :::::: ::.::::::::.::.:::::::
CCDS44 ENYSMYCVSCRTPVCYLCLEEGRHAKHEVKPLGAMWKQHKAQLSQALNGVSDKAKEAKEF
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LVQLRNMVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRKAQLLARVNKEHEHKLKVVRDQIS
::::.:..::::::....:::::::::::.:::.:.::.::..:.::.:::::.: :::.
CCDS44 LVQLKNILQQIQENGLDYEACLVAQCDALVDALTRQKAKLLTKVTKEREHKLKMVWDQIN
370 380 390 400 410 420
360 370 380 390 400 410
pF1KSD HCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIRRVHLTEDQWGKGTLTPRMTTDFD
:::.::::.:::::::::::::::::::::::::::.::.....:: ::.: :.....::
CCDS44 HCTLKLRQSTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIKRVQVSQEQWVKGALEPKVSAEFD
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KSD LSLDNSPLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEECCTHNNSATLSWKQPPLSTVPADG
:.::. ::::.::::::.:.: :: .:.::::.:::.:::.::.:..::.. :.::
CCDS44 LTLDSEPLLQAIHQLDFIQMKCR--VPPVPLLQLEKCCTRNNSVTLAWRMPPFTHSPVDG
490 500 510 520 530 540
480 490 500 510 520 530
pF1KSD YILELDDGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNSTYNARVKAFNKTGVSPYSKTLVLQTSE
:::::::: :::::::::::::.::.:::::::::::::::::..::.:::::.:::::.
CCDS44 YILELDDGAGGQFREVYVGKETLCTIDGLHFNSTYNARVKAFNSSGVGPYSKTVVLQTSD
550 560 570 580 590 600
540 550 560 570 580 590
pF1KSD VAWFAFDPGSAHSDIILSNDNLTVTCSSYDDRVVLGKTGFSKGIHYWELTVDRYDNHPDP
::::.:::.:.: :::::::: :.:::::::::::: ..::::.::::: ::::::::::
CCDS44 VAWFTFDPNSGHRDIILSNDNQTATCSSYDDRVVLGTAAFSKGVHYWELHVDRYDNHPDP
610 620 630 640 650 660
600 610 620 630 640 650
pF1KSD AFGVARMDVMKDVMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHNNSHTNRTEGGITKGATIGVLLDFN
:::::: .:.::.:::::::::::::::::::::: ::::::::::. ::::.:::::.:
CCDS44 AFGVARASVVKDMMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHCNSHTNRTEGGVCKGATVGVLLDLN
670 680 690 700 710 720
660
pF1KSD RKNLTFFYQR
...::::
CCDS44 KHTLTFFINGQQQGPTAFSHVDGVFMPALSLNRNVQVTLHTGLEVPTNLGRPKLSGN
730 740 750 760 770 780
>>CCDS75287.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 (716 aa)
initn: 595 init1: 223 opt: 610 Z-score: 474.5 bits: 98.2 E(32554): 4.1e-20
Smith-Waterman score: 748; 25.9% identity (56.2% similar) in 644 aa overlap (1-613:12-594)
10 20 30 40
pF1KSD MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQTPESESPQS
....:.:: ::.: .. .:.::::.:..:. :....:
CCDS75 MEGDGSDSPVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKELL-----------
10 20 30 40
50 60 70 80 90 100
pF1KSD HRAAGSGVSDYDYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPNGVRVFPPAMPPP
: :: :: ... :. : ..: . :. :.:
CCDS75 -------------LTLD--------DS-FNDVGSDNSNQSSPRLRLPS------PSMDKI
50 60 70 80
110 120 130 140 150 160
pF1KSD ATHLSPAL---APVPRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQSK--AA
:. . .::.. . :: :.... : .::. :. .: .:: ...::.:. :.
CCDS75 DRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAAT
90 100 110 120 130 140
170 180 190 200 210 220
pF1KSD ALKCQLCEKAPKEATVMCEQCDVFYCDPCRLRCHPPRGPL-AKHRLVPPAQGRVSRRLSP
:. :.::. :.:.: : .:.. ::. : .. : : : . :.:. : : . . :
CCDS75 AIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCNEC-FKIHHPWGTIKAQHEYVGP-----TTNFRP
150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KSD RKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWKLHKSQLSQALNG
:. : .:: : .::: :. :::. : :.:..:.: .... .: : .::. ..
CCDS75 -KILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDY
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KSD LSDRAKEAKEFLVQLRNMVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRKAQLLARVNKEHE
: . ...: . .: .... . :. . . ... . :...:..::...: ... ..
CCDS75 LIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKK
260 270 280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KSD HKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIRRVHLTEDQWGKG
.: . :. . : ...::. : ::.::.: : :.: . : :.. . ..
CCDS75 LRLDKFQTQMEEYQ-GLLENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATESLK--
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KSD TLTPRMTTDF-DLSLDNSPLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEECCTHNNSATLSW
.. : :.: : ...: . . .:.: :: . . : .. :. ..:: : ..:
CCDS75 SFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFF----SSGIDV-PEINEEQSKVYNN-ALINW
380 390 400 410 420
470 480 490 500 510
pF1KSD KQPPLSTVPADGYILE---LDDGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNSTYNARVKAFNKT
..: . ::.:.:: .. . .. :. : : .. :. .::: ::.:.. .
CCDS75 HHPEKD--KADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCG-TSKIIQDLENSSTYAFRVRAYKGS
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550
pF1KSD GVSPYSKTLVLQT--SEVAWFAFDPGSAHSD-------------------IILSNDNLTV
:: :. :.:.: . : : :: .... ..:. . . :
CCDS75 ICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQV
490 500 510 520 530 540
560 570 580 590 600 610
pF1KSD TCSSYDDRVVLGKTGFSKGIHYWELTVDRYDNHPDPAFGVARMDVMKDVMLGKDDKAWAM
. : .. : ::..:: :.: . :. :. ::: : ... . . :
CCDS75 GYYTSLDYII-GDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVK--VGVASSDKLQEWLRSPRDAVSPR
550 560 570 580 590
620 630 640 650 660
pF1KSD YVDNNRSWFMHNNSHTNRTEGGITKGATIGVLLDFNRKNLTFFYQR
CCDS75 YEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRVLPMPTSIGIFLD
600 610 620 630 640 650
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10 20 30
pF1KSD MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNI
....:.:: ::.: .. .:.::::.:..:. :....
CCDS41 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LVQTPESESPQSHRAAGSGVSDYDYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPN
: : :: :: ... :. : ..: . :.
CCDS41 L------------------------LTLD--------DS-FNDVGSDNSNQSSPRLRLPS
70 80
100 110 120 130 140 150
pF1KSD GVRVFPPAMPPPATHLSPAL---APVPRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGV
:.: :. . .::.. . :: :.... : .::. :. .: .:: .
CCDS41 ------PSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETI
90 100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KSD IDRYQQSK--AAALKCQLCEKAPKEATVMCEQCDVFYCDPCRLRCHPPRGPL-AKHRLVP
..::.:. :.:. :.::. :.:.: : .:.. ::. : .. : : : . :.:. :
CCDS41 VERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCNEC-FKIHHPWGTIKAQHEYVG
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KSD PAQGRVSRRLSPRKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWK
: . . : :. : .:: : .::: :. :::. : :.:..:.: .... .:
CCDS41 P-----TTNFRP-KILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYK
210 220 230 240 250
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LHKSQLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRNMVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRK
: .::. .. : . ...: . .: .... . :. . . ... . :...:..::
CCDS41 TLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERK
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370 380 390
pF1KSD AQLLARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIR
...: ... .. .: . :. . : ...::. : ::.::.: : :.: . :
CCDS41 SSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQ-GLLENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHL
320 330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KSD RVHLTEDQWGKGTLTPRMTTDF-DLSLDNSPLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEE
:.. . .. .. : :.: : ...: . . .:.: :: . . : .. :.
CCDS41 RIQKATESLK--SFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFF----SSGIDV-PEINEEQ
380 390 400 410 420
460 470 480 490 500
pF1KSD CCTHNNSATLSWKQPPLSTVPADGYILE---LDDGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNS
..:: : ..:..: . ::.:.:: .. . .. :. : : .. :. .:
CCDS41 SKVYNN-ALINWHHPEKD--KADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCG-TSKIIQDLENSS
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540
pF1KSD TYNARVKAFNKTGVSPYSKTLVLQT--SEVAWFAFDPGSAHSD-----------------
:: ::.:.. . :: :. :.:.: . : : :: ....
CCDS41 TYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD --IILSNDNLTVTCSSYDDRVVLGKTGFSKGIHYWELTVDRYDNHPDPAFGVARMDVMKD
..:. . . : . : .. : ::..:: :.: . :. :. ::: : ...
CCDS41 FNLLLAAERIQVGYYTSLDYII-GDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVK--VGVASSDKLQE
550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHNNSHTNRTEGGITKGATIGVLLDFNRKNLTFFYQR
. . :
CCDS41 WLRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRV
600 610 620 630 640 650
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10 20 30 40
pF1KSD MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQ
:: .: :: ::.: ....:..:::.:.:: .::. :::.
CCDS14 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD TPESESPQSHRAAGSGVSDYDYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPNGVR
. : : . : : :
CCDS14 SCSS--------------------------------------GESIEPITAFQ-------
70
110 120 130 140 150 160
pF1KSD VFPPAMPPPATHLSPALAPVPRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQ
:: :. . :. ::: :. .: .:...:::.:.
CCDS14 ---------------------------CPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQK
80 90 100
170 180 190
pF1KSD SKAAA-----------------------LKCQLCEK-APKEATVMCEQCDVFYCDPCRLR
..... . ::.::. :..:. : :.: ::: :
CCDS14 ASVSGPNSPSESRRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRA
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KSD CHPPRGPLAKHRLVPPAQGRVSRRLSPRKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEG
:: . :...:::: :. : . :: ::: :. .::::. . .: : :
CCDS14 THPNKKPFTSHRLVEPVPDTHLRGI------TCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVG
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KSD KHSSHEVKALGAMWKLHKSQLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRNMVQQIQENSVEFEACL
.: .:.: .:. .. :. : . :..: : .: .. ...: .. ::.. :.. :: :
CCDS14 RHRDHQVASLNDRFEKLKQTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKL
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KSD VAQCDALIDALNRRKAQLLARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKE
. .:: :.. ...:: .. ..... . ::. . .:...: :...: :.. ...::
CCDS14 MEECDELVEIIQQRKQMIAVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKE
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KSD NDPSGFLQISDALIRRVHLTEDQWGKGTLTPRMTTD--FD-LSLDNSPLLQSIHQLDFVQ
:: . ::: . . .:: .. . . .: : .. . :. ..:: : . .. ::..
CCDS14 NDQARFLQSAKNIAERVAMATAS--SQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYL-
350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KSD VKASSPVPATPILQLEECCTHNNSATLSWKQPPLSTVPADGYILELDDGNG-GQFREVYV
..: : : .. : : . ... :. : . .. . : :. .: ..: .:
CCDS14 ---TAPNP--PSIREELCTASHDTITVHWISDDEFSISS--YELQYTIFTGQANFISLYN
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540
pF1KSD G----------KETMCTVDGLHFNSTYNARVKAFNKTGVSPYSKTLVLQTSEVAWFAFDP
. :.. :: ::. .. : :::.:..: : :. :.:. : .::
CCDS14 SVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYIFIVKAINQAG-SRNSEPTRLKTNSQP-FKLDP
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580
pF1KSD GSAHSDIILSNDNL-------TVTCSSYDDRV----VLGKTG---FSKGIHYWELTVDRY
.:. . .:::.: .. : .: : .: ...: ::::...
CCDS14 KMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPERFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSS
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KSD DNHPDPAFGVARMDVMKDVMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHNNSHTNRTEGGITKGATIG
. :.:.: .. :. .::. ..:.. :. :::.. : .:
CCDS14 TWY---AIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRCNSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLK--RLG
580 590 600 610 620
650 660
pF1KSD VLLDFNRKNLTFFYQR
::::.. . :.:.
CCDS14 VLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPTFTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPER
630 640 650 660 670 680
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQTPESESPQSHRAAGSGVSDY
:: .: :: ::.: ....:..:::.:.:: ::. ::: ::
CCDS14 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILV---------SH----------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPNGVRVFPPAMPPPATHLSPALAPV
: ::. : :
CCDS14 -------------------------------C-----------------ATNES-----V
130 140 150 160
pF1KSD PRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQ--------------------
. . :: :.. . :..::: :. .: .:...:::.:.
CCDS14 ESITAFQCPTCRHVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDA
50 60 70 80 90 100
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pF1KSD ---SKAAALKCQLCEKAP-KEATVMCEQCDVFYCDPCRLRCHPPRGPLAKHRLVPPAQGR
..: . ::.:.. : ..:. : :.: ::: : :: . :.. :::. :
CCDS14 NTMTSAEKVLCQFCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDS
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KSD VSRRLSPRKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWKLHKSQ
: : : .:: :. .:::: . .: : :.: .:.: ::. . :..
CCDS14 HIRGL------MCLEHEDEKVNMYCVTDDQLICALCKLVGRHRDHQVAALSERYDKLKQN
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRNMVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRKAQLLA
: . :..: : : . .:..: . :... :. . :: :. .:: ::. ...:. . .
CCDS14 LESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGT
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KSD RVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIRRVHLT
.... . .:. . .::..: ......:. . .:::: . ::: . . .:: ..
CCDS14 KIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMA
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KSD EDQWGKGTLTPRMTTD--FD-LSLDNSPLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEECCT
. . .: :... . :: ..:: : . .. ::.. ..: : : .. : : .
CCDS14 TAS--SQVLIPEINLNDTFDTFALDFSREKKLLECLDYL----TAPNP--PTIREELCTA
350 360 370 380 390
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pF1KSD HNNSATLSW-KQPPLSTVPAD-GYILELDDGN-------GGQFREVYVGKETMCTVDGLH
.. :. : .. .:.: . : . ..: . .. : :.. :: ::.
CCDS14 SYDTITVHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQ
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550
pF1KSD FNSTYNARVKAFNKTGVSPYSKTLVLQTSEVAWFAFDPGSAHSDIILSNDNLTVT-----
.. : :::.:..: : :. :.:. : .:: ::: . .:.:::::
CCDS14 SGTKYIFMVKAINQAG-SRSSEPGKLKTNSQP-FKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESS
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KSD ---------CSSYDDRVVLGKTGFSKGIHYWELTVDRYDNHPDPAFGVARMDVMKDVMLG
.: . : :.. ...: ::::.... . :.:.: .. : .:
CCDS14 SKKSHTPERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTWY---AIGLAYKSAPKHEWIG
520 530 540 550 560
620 630 640 650 660
pF1KSD KDDKAWAMYVDNNRSWFMHNNSHTNRTEGGITKGATIGVLLDFNRKNLTFFYQR
:.. .::. :: .: ...::. : . . .:.:::.. ...:.
CCDS14 KNSASWALCRCNN-NWVVRHNSKEIPIEPA-PHLRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLY
570 580 590 600 610 620
CCDS14 TFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP
630 640 650 660
>>CCDS14532.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX (735 aa)
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10 20 30 40
pF1KSD MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQ
:: .: :: ::.: ....:..:::.:.:: .::. :::.
CCDS14 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD TPESESPQSHRAAGSGVSDYDYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPNGVR
. : : . : : :
CCDS14 SCSS--------------------------------------GESIEPITAFQ-------
70
110 120 130 140 150 160
pF1KSD VFPPAMPPPATHLSPALAPVPRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQ
:: :. . :. ::: :. .: .:...:::.:.
CCDS14 ---------------------------CPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQK
80 90 100
170 180 190
pF1KSD SKAAA-----------------------LKCQLCEK-APKEATVMCEQCDVFYCDPCRLR
..... . ::.::. :..:. : :.: ::: :
CCDS14 ASVSGPNSPSESRRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRA
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KSD CHPPRGPLAKHRLVPPAQGRVSRRLSPRKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEG
:: . :...:::: :. : . :: ::: :. .::::. . .: : :
CCDS14 THPNKKPFTSHRLVEPVPDTHLRGI------TCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVG
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KSD KHSSHEVKALGAMWKLHKSQLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRNMVQQIQENSVEFEACL
.: .:.: .:. .. :. : . :..: : .: .. ...: .. ::.. :.. :: :
CCDS14 RHRDHQVASLNDRFEKLKQTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKL
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KSD VAQCDALIDALNRRKAQLLARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKE
. .:: :.. ...:: .. ..... . ::. . .:...: :...: :.. ...::
CCDS14 MEECDELVEIIQQRKQMIAVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKE
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KSD NDPSGFLQISDALIRRVHLTEDQWGKGTLTPRMTTD--FD-LSLDNSPLLQSIHQLDFVQ
:: . ::: . . .:: .. . . .: : .. . :. ..:: : . .. ::..
CCDS14 NDQARFLQSAKNIAERVAMATAS--SQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYL-
350 360 370 380 390
440 450 460 470 480
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