seq1 = pF1KSDA0250.tfa, 3273 bp seq2 = pF1KSDA0250/gi568815597f_183415871.tfa (gi568815597f:183415871_183651928), 236058 bp >pF1KSDA0250 3273 >gi568815597f:183415871_183651928 (Chr1) 1-29 (56751-56779) 100% -> 30-61 (96967-96998) 100% -> 62-179 (100004-100121) 100% -> 180-312 (101818-101950) 99% -> 313-484 (110726-110897) 100% -> 485-556 (112086-112157) 100% -> 557-707 (113022-113172) 100% -> 708-843 (113528-113663) 100% -> 844-1006 (117294-117456) 100% -> 1007-1163 (117806-117962) 100% -> 1164-1234 (121275-121345) 100% -> 1235-1295 (122510-122570) 100% -> 1296-1415 (125114-125233) 100% -> 1416-1704 (126206-126494) 100% -> 1705-1849 (128483-128627) 100% -> 1850-2232 (129060-129442) 100% -> 2233-2604 (130096-130467) 99% -> 2605-2685 (133338-133418) 100% -> 2686-2845 (133894-134053) 100% -> 2846-3016 (134881-135051) 100% -> 3017-3162 (135175-135320) 100% -> 3163-3273 (135948-136058) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGAGCCTGCAGAGCGCGCAGTACCTCCG GCAGGCAGAAGT |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||| 56751 ATGAGCCTGCAGAGCGCGCAGTACCTCCGGTG...TAGGCAGGCAGAAGT 50 . : . : . : . : . : 42 CCTGAAGGCTGACATGACAG ATTCTAAGCTGGGTCCAGCTG ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 96979 CCTGAAGGCTGACATGACAGGTA...CAGATTCTAAGCTGGGTCCAGCTG 100 . : . : . : . : . : 83 AAGTCTGGACATCCAGGCAGGCTCTGCAGGACCTGTACCAGAAAATGCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100025 AAGTCTGGACATCCAGGCAGGCTCTGCAGGACCTGTACCAGAAAATGCTA 150 . : . : . : . : . : 133 GTTACCGATTTGGAATACGCTTTAGACAAGAAAGTAGAACAGGATCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 100075 GTTACCGATTTGGAATACGCTTTAGACAAGAAAGTAGAACAGGATCTGTA 200 . : . : . : . : . : 180 CTGGAATCACGCCTTTAAGAATCAGATCACAACACTACAAGGCC ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| 100125 ...CAGCTGGAATCACGCCTTTAAGAATCAGATCACAACACTGCAAGGCC 250 . : . : . : . : . : 224 AGGCAAAGAATCGAGCAAATCCGAATCGGAGTGAAGTTCAGGCAAACCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101862 AGGCAAAGAATCGAGCAAATCCGAATCGGAGTGAAGTTCAGGCAAACCTT 300 . : . : . : . : . : 274 TCTCTGTTCCTAGAGGCAGCTAGTGGCTTCTATACTCAG TT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 101912 TCTCTGTTCCTAGAGGCAGCTAGTGGCTTCTATACTCAGGTG...TAGTT 350 . : . : . : . : . : 315 ATTACAAGAACTGTGTACAGTATTTAATGTAGATTTACCATGCCGTGTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110728 ATTACAAGAACTGTGTACAGTATTTAATGTAGATTTACCATGCCGTGTGA 400 . : . : . : . : . : 365 AGTCTTCCCAATTGGGAATTATCAGCAATAAACAGACGCATACCAGCGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110778 AGTCTTCCCAATTGGGAATTATCAGCAATAAACAGACGCATACCAGCGCC 450 . : . : . : . : . : 415 ATAGTGAAGCCACAGTCTAGCTCCTGTTCCTATATCTGCCAGCACTGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110828 ATAGTGAAGCCACAGTCTAGCTCCTGTTCCTATATCTGCCAGCACTGCCT 500 . : . : . : . : . : 465 CGTCCACCTTGGAGACATTG CTCGATACAGAAACCAGACCA ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 110878 CGTCCACCTTGGAGACATTGGTG...TAGCTCGATACAGAAACCAGACCA 550 . : . : . : . : . : 506 GCCAGGCAGAGTCCTACTATAGGCATGCAGCTCAGCTTGTCCCCTCCAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112107 GCCAGGCAGAGTCCTACTATAGGCATGCAGCTCAGCTTGTCCCCTCCAAT 600 . : . : . : . : . : 556 G GTCAGCCTTATAATCAGTTGGCTATCTTAGCTTCTTCCAA |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112157 GGTG...TAGGTCAGCCTTATAATCAGTTGGCTATCTTAGCTTCTTCCAA 650 . : . : . : . : . : 597 AGGAGACCATCTGACCACAATTTTCTACTACTGCAGAAGCATTGCTGTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113062 AGGAGACCATCTGACCACAATTTTCTACTACTGCAGAAGCATTGCTGTGA 700 . : . : . : . : . : 647 AGTTCCCTTTCCCAGCTGCCTCCACTAATCTGCAAAAAGCACTTTCTAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113112 AGTTCCCTTTCCCAGCTGCCTCCACTAATCTGCAAAAAGCACTTTCTAAA 750 . : . : . : . : . : 697 GCACTGGAAAG CCGAGATGAGGTGAAAACCAAGTGGGGTGT |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| 113162 GCACTGGAAAGGTA...CAGCCGAGATGAGGTGAAAACCAAGTGGGGTGT 800 . : . : . : . : . : 738 TTCTGACTTCATCAAGGCCTTTATTAAATTCCACGGTCATGTGTACCTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113558 TTCTGACTTCATCAAGGCCTTTATTAAATTCCACGGTCATGTGTACCTGA 850 . : . : . : . : . : 788 GTAAGAGCTTGGAAAAGTTGAGCCCTCTTCGAGAGAAATTGGAAGAACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113608 GTAAGAGCTTGGAAAAGTTGAGCCCTCTTCGAGAGAAATTGGAAGAACAG 900 . : . : . : . : . : 838 TTTAAG AGGCTGCTATTCCAAAAAGCTTTCAACTCTCAGCA ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113658 TTTAAGGTT...CAGAGGCTGCTATTCCAAAAAGCTTTCAACTCTCAGCA 950 . : . : . : . : . : 879 GTTAGTTCATGTCACTGTCATTAACCTGTTTCAACTTCATCACCTTCGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117329 GTTAGTTCATGTCACTGTCATTAACCTGTTTCAACTTCATCACCTTCGTG 1000 . : . : . : . : . : 929 ACTTTAGCAATGAAACCGAGCAGCACACTTATAGCCAAGATGAGCAGCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117379 ACTTTAGCAATGAAACCGAGCAGCACACTTATAGCCAAGATGAGCAGCTA 1050 . : . : . : . : . : 979 TGTTGGACACAGTTGCTGGCCCTCTTTA TGTCTTTTCTTGG ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 117429 TGTTGGACACAGTTGCTGGCCCTCTTTAGTG...AAGTGTCTTTTCTTGG 1100 . : . : . : . : . : 1020 CATCCTGTGCAAGTGTCCTCTACAGAATGAGTCTCAGGAGGAGTCCTACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117819 CATCCTGTGCAAGTGTCCTCTACAGAATGAGTCTCAGGAGGAGTCCTACA 1150 . : . : . : . : . : 1070 ATGCCTATCCTCTTCCAGCAGTCAAGGTCTCCATGGACTGGCTAAGACTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117869 ATGCCTATCCTCTTCCAGCAGTCAAGGTCTCCATGGACTGGCTAAGACTC 1200 . : . : . : . : . : 1120 AGACCCAGGGTCTTTCAGGAGGCAGTGGTGGATGAAAGACAGTA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>... 117919 AGACCCAGGGTCTTTCAGGAGGCAGTGGTGGATGAAAGACAGTAGTA... 1250 . : . : . : . : . : 1164 CATTTGGCCCTGGTTGATTTCTCTTCTGAATAGTTTCCATCCCCATG >>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121272 CAGCATTTGGCCCTGGTTGATTTCTCTTCTGAATAGTTTCCATCCCCATG 1300 . : . : . : . : . : 1211 AAGAGGACCTCTCAAGTATTAGTG CGACACCACTTCCAGAG ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 121322 AAGAGGACCTCTCAAGTATTAGTGGTA...TAGCGACACCACTTCCAGAG 1350 . : . : . : . : . : 1252 GAGTTTGAATTACAAGGATTTTTGGCATTGAGACCTTCTTTCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>... 122527 GAGTTTGAATTACAAGGATTTTTGGCATTGAGACCTTCTTTCAGGTA... 1400 . : . : . : . : . : 1296 GAACTTGGATTTTTCCAAAGGTCACCAGGGTATTACAGGGGACAAAG >>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125111 TAGGAACTTGGATTTTTCCAAAGGTCACCAGGGTATTACAGGGGACAAAG 1450 . : . : . : . : . : 1343 AAGGCCAGCAACGACGAATACGACAGCAACGCTTGATCTCTATAGGCAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125161 AAGGCCAGCAACGACGAATACGACAGCAACGCTTGATCTCTATAGGCAAA 1500 . : . : . : . : . : 1393 TGGATTGCTGATAATCAGCCAAG GCTGATTCAGTGTGAAAA |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 125211 TGGATTGCTGATAATCAGCCAAGGTA...TAGGCTGATTCAGTGTGAAAA 1550 . : . : . : . : . : 1434 TGAGGTAGGGAAATTGTTGTTTATCACAGAAATCCCAGAATTAATACTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126224 TGAGGTAGGGAAATTGTTGTTTATCACAGAAATCCCAGAATTAATACTGG 1600 . : . : . : . : . : 1484 AAGACCCCAGTGAAGCCAAAGAGAACCTCATTCTGCAAGAAACATCTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126274 AAGACCCCAGTGAAGCCAAAGAGAACCTCATTCTGCAAGAAACATCTGTG 1650 . : . : . : . : . : 1534 ATAGAGTCGCTGGCTGCAGATGGGAGCCCAGGGCTAAAATCAGTGCTATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126324 ATAGAGTCGCTGGCTGCAGATGGGAGCCCAGGGCTAAAATCAGTGCTATC 1700 . : . : . : . : . : 1584 TACAAGCCGAAATTTAAGCAACAACTGTGACACAGGAGAGAAGCCAGTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126374 TACAAGCCGAAATTTAAGCAACAACTGTGACACAGGAGAGAAGCCAGTGG 1750 . : . : . : . : . : 1634 TTACCTTCAAAGAAAACATTAAGACACGAGAAGTGAACAGAGACCAAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126424 TTACCTTCAAAGAAAACATTAAGACACGAGAAGTGAACAGAGACCAAGGA 1800 . : . : . : . : . : 1684 AGAAGTTTTCCTCCCAAAGAG GTAAAATCCCAGACAGAACT |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| 126474 AGAAGTTTTCCTCCCAAAGAGGTG...CAGGTAAAATCCCAGACAGAACT 1850 . : . : . : . : . : 1725 AAGAAAGACTCCAGTGTCTGAAGCCAGAAAAACACCTGTAACTCAAACCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128503 AAGAAAGACTCCAGTGTCTGAAGCCAGAAAAACACCTGTAACTCAAACCC 1900 . : . : . : . : . : 1775 CAACTCAAGCAAGTAACTCCCAGTTCATCCCCATTCATCACCCTGGAGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128553 CAACTCAAGCAAGTAACTCCCAGTTCATCCCCATTCATCACCCTGGAGCC 1950 . : . : . : . : . : 1825 TTCCCTCCTCTTCCCAGCAGGCCAG GGTTTCCGCCCCCAAC |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 128603 TTCCCTCCTCTTCCCAGCAGGCCAGGTA...AAGGGTTTCCGCCCCCAAC 2000 . : . : . : . : . : 1866 ATATGTTATCCCCCCGCCTGTGGCATTTTCTATGGGCTCAGGTTACACCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129076 ATATGTTATCCCCCCGCCTGTGGCATTTTCTATGGGCTCAGGTTACACCT 2050 . : . : . : . : . : 1916 TCCCAGCTGGTGTTTCTGTCCCAGGAACCTTTCTTCAGCCTACAGCTCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129126 TCCCAGCTGGTGTTTCTGTCCCAGGAACCTTTCTTCAGCCTACAGCTCAC 2100 . : . : . : . : . : 1966 TCTCCAGCAGGAAACCAGGTGCAAGCTGGGAAACAGTCCCACATTCCTTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129176 TCTCCAGCAGGAAACCAGGTGCAAGCTGGGAAACAGTCCCACATTCCTTA 2150 . : . : . : . : . : 2016 CAGCCAGCAACGGCCCTCTGGACCAGGGCCAATGAACCAGGGACCTCAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129226 CAGCCAGCAACGGCCCTCTGGACCAGGGCCAATGAACCAGGGACCTCAAC 2200 . : . : . : . : . : 2066 AATCACAGCCACCTTCCCAGCAACCCCTTACATCTTTACCAGCTCAGCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129276 AATCACAGCCACCTTCCCAGCAACCCCTTACATCTTTACCAGCTCAGCCA 2250 . : . : . : . : . : 2116 ACAGCACAGTCTACAAGCCAGCTGCAGGTTCAAGCTCTAACTCAGCAACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129326 ACAGCACAGTCTACAAGCCAGCTGCAGGTTCAAGCTCTAACTCAGCAACA 2300 . : . : . : . : . : 2166 ACAATCCCCTACAAAAGCTGTGCCGGCTTTGGGGAAAAGCCCGCCTCACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129376 ACAATCCCCTACAAAAGCTGTGCCGGCTTTGGGGAAAAGCCCGCCTCACC 2350 . : . : . : . : . : 2216 ACTCTGGATTCCAGCAG TATCAACAGGCAGATGCCTCCAAA |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 129426 ACTCTGGATTCCAGCAGGTA...TAGTATCAACAGGCAGATGCCTCCAAA 2400 . : . : . : . : . : 2257 CAGCTGTGGAATCCCCCTCAGGTTCAAGGCCCATTAGGGAAAATTATGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 130120 CAGCTGTGGAATCCCCCTCAGGTTCAAGGCCCATTAGGGAAAATTATGCC 2450 . : . : . : . : . : 2307 TGTGAAACAGCCCTACTACCTTCAGACCCAAGACCCCATAAAACTGTTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 130170 TGTGAAACAGCCCTACTACCTTCAGACCCAAGACCCCATAAAACTGTTTG 2500 . : . : . : . : . : 2357 AGCCGTCATTGCAACCTCCTGTAATGCAGCAGCAGCCTCTAGAAAAAAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 130220 AGCCGTCATTGCAACCTCCTGTAATGCAGCAGCAGCCTCTAGAAAAAAAA 2550 . : . : . : . : . : 2407 ATGAAGCCTTTTCCCATGGAGCCATATAACCATAATCCCTCAGAAGTCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 130270 ATGAAGCCTTTTCCCATGGAGCCATATAACCATAATCCCTCAGAAGTCAA 2600 . : . : . : . : . : 2457 GGTCCCAGAATTCTACTGGGATTCTTCCTACAGCATGGCTGATAACAGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 130320 GGTCCCAGAATTCTACTGGGATTCTTCCTACAGCATGGCTGATAACAGAT 2650 . : . : . : . : . : 2507 CTGTAATGGCACAGCAAGCAAACATAGACCGCAGGGGCAAACGGTCACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 130370 CTGTAATGGCACAGCAAGCAAACATAGACCGCAGGGGCAAACGGTCACCA 2700 . : . : . : . : . : 2557 GGAATCTTCCGTCCAGAGCAGGATCCTGTACCCAGAATGCCGTTTGAG ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 130420 GGAGTCTTCCGTCCAGAGCAGGATCCTGTACCCAGAATGCCGTTTGAGGT 2750 . : . : . : . : . : 2605 AAATCCTTATTGGAGAAGCCCTCAGAGCTCATGTCACATTCAT >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 130470 G...AAGAAATCCTTATTGGAGAAGCCCTCAGAGCTCATGTCACATTCAT 2800 . : . : . : . : . : 2648 CCTCTTTCCTGTCCCTCACCGGATTCTCTCTCAATCAG GAA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 133381 CCTCTTTCCTGTCCCTCACCGGATTCTCTCTCAATCAGGTA...CAGGAA 2850 . : . : . : . : . : 2689 AGATACCCAAATAATAGTATGTTCAATGAGGTATATGGGAAAAACCTGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 133897 AGATACCCAAATAATAGTATGTTCAATGAGGTATATGGGAAAAACCTGAC 2900 . : . : . : . : . : 2739 ATCCAGCTCCAAAGCAGAACTCAGTCCCTCAATGGCCCCCCAGGAAACAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 133947 ATCCAGCTCCAAAGCAGAACTCAGTCCCTCAATGGCCCCCCAGGAAACAT 2950 . : . : . : . : . : 2789 CTCTGTATTCCCTTTTTGAAGGGACTCCGTGGTCTCCATCACTTCCTGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 133997 CTCTGTATTCCCTTTTTGAAGGGACTCCGTGGTCTCCATCACTTCCTGCC 3000 . : . : . : . : . : 2839 AGTTCAG ATCATTCAACACCAGCCAGCCAGTCTCCTCATTC |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 134047 AGTTCAGGTA...TAGATCATTCAACACCAGCCAGCCAGTCTCCTCATTC 3050 . : . : . : . : . : 2880 CTCTAACCCAAGCAGCCTACCCAGCTCTCCTCCAACACACAACCATAATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134915 CTCTAACCCAAGCAGCCTACCCAGCTCTCCTCCAACACACAACCATAATT 3100 . : . : . : . : . : 2930 CTGTTCCATTCTCCAATTTTGGACCCATTGGGACTCCAGATAACAGGGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134965 CTGTTCCATTCTCCAATTTTGGACCCATTGGGACTCCAGATAACAGGGAT 3150 . : . : . : . : . : 2980 AGAAGGACTGCAGATCGGTGGAAAACTGATAAGCCAG CCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 135015 AGAAGGACTGCAGATCGGTGGAAAACTGATAAGCCAGGTG...TAGCCAT 3200 . : . : . : . : . : 3021 GGGTGGGTTTGGCATTGATTATCTCTCAGCAACGTCATCCTCTGAGAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 135179 GGGTGGGTTTGGCATTGATTATCTCTCAGCAACGTCATCCTCTGAGAGCA 3250 . : . : . : . : . : 3071 GTTGGCATCAGGCCAGCACTCCGAGTGGCACCTGGACAGGCCATGGCCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 135229 GTTGGCATCAGGCCAGCACTCCGAGTGGCACCTGGACAGGCCATGGCCCT 3300 . : . : . : . : . : 3121 TCCATGGAGGATTCCTCTGCTGTCCTCATGGAAAGCCTAAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 135279 TCCATGGAGGATTCCTCTGCTGTCCTCATGGAAAGCCTAAAGGTG...CA 3350 . : . : . : . : . : 3163 TCTATCTGGTCCAGTTCCATGATGCATCCTGGACCTTCTGCTCTGGAGC >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 135947 GTCTATCTGGTCCAGTTCCATGATGCATCCTGGACCTTCTGCTCTGGAGC 3400 . : . : . : . : . : 3212 AGCTGTTAATGCAGCAGAAGCAGAAACAGCAACGGGGACAAGGCACCATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 135997 AGCTGTTAATGCAGCAGAAGCAGAAACAGCAACGGGGACAAGGCACCATG 3450 . : 3262 AACCCTCCACAC |||||||||||| 136047 AACCCTCCACAC