Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0230
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0230, 1479 aa
  1>>>pF1KSDA0230 1479 - 1479 aa - 1479 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8334+/-0.00157; mu= -9.9493+/- 0.092
 mean_var=373.5959+/-78.049, 0's: 0 Z-trim(105.1): 323  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.066355
 statistics sampled from 7933 (8267) to 7933 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.254), width:  16
 Scan time:  4.090

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS46221.1 PXDN gene_id:7837|Hs108|chr2           (1479) 10083 981.8       0
CCDS47855.1 PXDNL gene_id:137902|Hs108|chr8        (1463) 6186 608.7  4e-173
CCDS11602.1 EPX gene_id:8288|Hs108|chr17           ( 715) 1739 182.8 3.2e-45
CCDS11604.1 MPO gene_id:4353|Hs108|chr17           ( 745) 1721 181.1 1.1e-44
CCDS54149.1 LPO gene_id:4025|Hs108|chr17           ( 629) 1598 169.3 3.4e-41
CCDS32689.1 LPO gene_id:4025|Hs108|chr17           ( 712) 1598 169.3 3.7e-41
CCDS1643.1 TPO gene_id:7173|Hs108|chr2             ( 933) 1285 139.4 4.8e-32
CCDS1646.1 TPO gene_id:7173|Hs108|chr2             ( 760)  868 99.4 4.2e-20
CCDS1644.1 TPO gene_id:7173|Hs108|chr2             ( 876)  795 92.5   6e-18
CCDS30956.1 HMCN1 gene_id:83872|Hs108|chr1         (5635)  710 84.9 7.3e-15
CCDS43109.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3          (1378)  597 73.7 4.4e-12
CCDS54609.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3          (1394)  597 73.7 4.4e-12
CCDS54611.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3          (1651)  593 73.4 6.6e-12
CCDS54610.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3          (1551)  578 71.9 1.7e-11
CCDS46872.2 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3          (1606)  578 71.9 1.7e-11
CCDS11952.1 DCC gene_id:1630|Hs108|chr18           (1447)  565 70.6 3.8e-11
CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11        (1386)  557 69.9 6.2e-11


>>CCDS46221.1 PXDN gene_id:7837|Hs108|chr2                (1479 aa)
 initn: 10083 init1: 10083 opt: 10083  Z-score: 5237.8  bits: 981.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10083; 100.0% identity (100.0% similar) in 1479 aa overlap (1-1479:1-1479)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAKRSRGPGRRCLLALVLFCAWGTLAVVAQKPGAGCPSRCLCFRTTVRCMHLLLEAVPAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAKRSRGPGRRCLLALVLFCAWGTLAVVAQKPGAGCPSRCLCFRTTVRCMHLLLEAVPAV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD APQTSILDLRFNRIREIQPGAFRRLRNLNTLLLNNNQIKRIPSGAFEDLENLKYLYLYKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APQTSILDLRFNRIREIQPGAFRRLRNLNTLLLNNNQIKRIPSGAFEDLENLKYLYLYKN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD EIQSIDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPDSFQHLPKLERLFLHNNRITHLVPGTFNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EIQSIDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPDSFQHLPKLERLFLHNNRITHLVPGTFNH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LESMKRLRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LESMKRLRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD LNCERPRITSEPQDADVTSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LNCERPRITSEPQDADVTSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD TLMIQNTQETDQGIYQCMAKNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVGESVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TLMIQNTQETDQGIYQCMAKNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVGESVT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD LECSATGHPPPRISWTRGDRTPLPVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGEYACSATNNIDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LECSATGHPPPRISWTRGDRTPLPVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGEYACSATNNIDS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD VHATAFIIVQALPQFTVTPQDRVVIEGQTVDFQCEAKGNPPPVIAWTKGGSQLSVDRRHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VHATAFIIVQALPQFTVTPQDRVVIEGQTVDFQCEAKGNPPPVIAWTKGGSQLSVDRRHL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD VLSSGTLRISGVALHDQGQYECQAVNIIGSQKVVAHLTVQPRVTPVFASIPSDTTVEVGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VLSSGTLRISGVALHDQGQYECQAVNIIGSQKVVAHLTVQPRVTPVFASIPSDTTVEVGA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD NVQLPCSSQGEPEPAITWNKDGVQVTESGKFHISPEGFLTINDVGPADAGRYECVARNTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NVQLPCSSQGEPEPAITWNKDGVQVTESGKFHISPEGFLTINDVGPADAGRYECVARNTI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD GSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDSRPRSPNDLLAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDSRPRSPNDLLAL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD FRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLVSPQYLNLIANL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLVSPQYLNLIANL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD SGCTAHRRVNNCSDMCFHQKYRTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKSVYENGFNTPRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SGCTAHRRVNNCSDMCFHQKYRTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKSVYENGFNTPRG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD INPHRLYNGHALPMPRLVSTTLIGTETVTPDEQFTHMLMQWGQFLDHDLDSTVVALSQAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 INPHRLYNGHALPMPRLVSTTLIGTETVTPDEQFTHMLMQWGQFLDHDLDSTVVALSQAR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD FSDGQHCSNVCSNDPPCFSVMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSPVCGSGMTSLLMNSVYPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FSDGQHCSNVCSNDPPCFSVMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSPVCGSGMTSLLMNSVYPR
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD EQINQLTSYIDASNVYGSTEHEARSIRDLASHRGLLRQGIVQRSGKPLLPFATGPPTECM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EQINQLTSYIDASNVYGSTEHEARSIRDLASHRGLLRQGIVQRSGKPLLPFATGPPTECM
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD RDENESPIPCFLAGDHRANEQLGLTSMHTLWFREHNRIATELLKLNPHWDGDTIYYETRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RDENESPIPCFLAGDHRANEQLGLTSMHTLWFREHNRIATELLKLNPHWDGDTIYYETRK
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD IVGAEIQHITYQHWLPKILGEVGMRTLGEYHGYDPGINAGIFNAFATAAFRFGHTLVNPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IVGAEIQHITYQHWLPKILGEVGMRTLGEYHGYDPGINAGIFNAFATAAFRFGHTLVNPL
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD LYRLDENFQPIAQDHLPLHKAFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFGVAGKMRVPSQLLNTELT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LYRLDENFQPIAQDHLPLHKAFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFGVAGKMRVPSQLLNTELT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD ERLFSMAHTVALDLAAINIQRGRDHGIPPYHDYRVYCNLSAAHTFEDLKNEIKNPEIREK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ERLFSMAHTVALDLAAINIQRGRDHGIPPYHDYRVYCNLSAAHTFEDLKNEIKNPEIREK
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD LKRLYGSTLNIDLFPALVVEDLVPGSRLGPTLMCLLSTQFKRLRDGDRLWYENPGVFSPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LKRLYGSTLNIDLFPALVVEDLVPGSRLGPTLMCLLSTQFKRLRDGDRLWYENPGVFSPA
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD QLTQIKQTSLARILCDNADNITRVQSDVFRVAEFPHGYGSCDEIPRVDLRVWQDCCEDCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLTQIKQTSLARILCDNADNITRVQSDVFRVAEFPHGYGSCDEIPRVDLRVWQDCCEDCR
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD TRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKKTRPRKIPSVGRQGEHLSNSTSAFSTRSDAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKKTRPRKIPSVGRQGEHLSNSTSAFSTRSDAS
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD GTNDFREFVLEMQKTITDLRTQIKKLESRLSTTECVDAGGESHANNTKWKKDACTICECK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GTNDFREFVLEMQKTITDLRTQIKKLESRLSTTECVDAGGESHANNTKWKKDACTICECK
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470         
pF1KSD DGQVTCFVEACPPATCAVPVNIPGACCPVCLQKRAEEKP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DGQVTCFVEACPPATCAVPVNIPGACCPVCLQKRAEEKP
             1450      1460      1470         

>>CCDS47855.1 PXDNL gene_id:137902|Hs108|chr8             (1463 aa)
 initn: 5738 init1: 1891 opt: 6186  Z-score: 3221.6  bits: 608.7 E(32554): 4e-173
Smith-Waterman score: 6186; 60.9% identity (83.2% similar) in 1459 aa overlap (18-1470:5-1450)

               10        20        30          40        50        
pF1KSD MAKRSRGPGRRCLLALVLFCAWGTLAVVAQK--PGAGCPSRCLCFRTTVRCMHLLLEAVP
                        ::: : :: ..:    ::  ::::::::..:::::::.:. .:
CCDS47              MEPRLFC-WTTLFLLAGWCLPGLPCPSRCLCFKSTVRCMHLMLDHIP
                             10        20        30        40      

       60        70        80        90       100       110        
pF1KSD AVAPQTSILDLRFNRIREIQPGAFRRLRNLNTLLLNNNQIKRIPSGAFEDLENLKYLYLY
        :  ::..:::::::::::  .::..:.::::::::::.:..:  .::: :::: :::::
CCDS47 QVPQQTTVLDLRFNRIREIPGSAFKKLKNLNTLLLNNNHIRKISRNAFEGLENLLYLYLY
         50        60        70        80        90       100      

      120       130       140       150       160       170        
pF1KSD KNEIQSIDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPDSFQHLPKLERLFLHNNRITHLVPGTF
       ::::...:.:.:::: :::.::.::::.: :.:..:  : .:::::::::.....  :.:
CCDS47 KNEIHALDKQTFKGLISLEHLYIHFNQLEMLQPETFGDLLRLERLFLHNNKLSKIPAGSF
        110       120       130       140       150       160      

      180       190       200       210       220       230        
pF1KSD NHLESMKRLRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITP
       ..:.:.::::::::.: :::...::..::. .:. :..:::: ::::::..::.::..: 
CCDS47 SNLDSLKRLRLDSNALVCDCDLMWLGELLQGFAQHGHTQAAATCEYPRRLHGRAVASVTV
        170       180       190       200       210       220      

      240       250       260       270       280       290        
pF1KSD EELNCERPRITSEPQDADVTSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLD
       ::.::. :::: ::::..: :::::::::::::::::::::..::. :... :.:::..:
CCDS47 EEFNCQSPRITFEPQDVEVPSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIWIHNNHSLDLEDDTRLNVFD
        230       240       250       260       270       280      

      300       310       320       330       340       350        
pF1KSD DGTLMIQNTQETDQGIYQCMAKNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVGES
       ::::::.::.:.:::.:::::.: :::.::: . ::: . ::.:.::::::.::::.: :
CCDS47 DGTLMIRNTRESDQGVYQCMARNSAGEAKTQSAMLRYSSLPAKPSFVIQPQDTEVLIGTS
        290       300       310       320       330       340      

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pF1KSD VTLECSATGHPPPRISWTRGDRTPLPVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGEYACSATNNI
       .:::: ::::: : :.::: .   : .:   ... :.:::.::..: : :...: :.:. 
CCDS47 TTLECMATGHPHPLITWTRDN--GLELDGSRHVATSSGLYLQNITQRDHGRFTCHANNSH
        350       360         370       380       390       400    

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pF1KSD DSVHATAFIIVQALPQFTVTPQDRVVIEGQTVDFQCEAKGNPPPVIAWTKGGSQLSVDRR
        .:.:.: ::::: :::::::.:.::.: ..:.. ::: :::::::.::: :.:: :. .
CCDS47 GTVQAAANIIVQAPPQFTVTPKDQVVLEEHAVEWLCEADGNPPPVIVWTKTGGQLPVEGQ
          410       420       430       440       450       460    

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pF1KSD HLVLSSGTLRISGVALHDQGQYECQAVNIIGSQKVVAHLTVQPRVTPVFASIPSDTTVEV
       : :::::::::. .: :::::::::::. .: .:: ..:::.:..  ::...:.::.:::
CCDS47 HTVLSSGTLRIDRAAQHDQGQYECQAVSSLGVKKVSVQLTVKPKALAVFTQLPQDTSVEV
          470       480       490       500       510       520    

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pF1KSD GANVQLPCSSQGEPEPAITWNKDGVQVTESGKFHISPEGFLTINDVGPADAGRYECVARN
       : :... : .::::.: :::::.:::.:::::::.. :: ::: :.:  : :::::::::
CCDS47 GKNINISCHAQGEPQPIITWNKEGVQITESGKFHVDDEGTLTIYDAGFPDQGRYECVARN
          530       540       550       560       570       580    

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pF1KSD TIGSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDSRPRSPNDLL
       ..: : ..: :.:.. .  . :: :: .::..:.  :: :::::: :::...:.. .:::
CCDS47 SFGLAVTNMFLTVTAIQGRQAGDDFVESSILDAVQRVDSAINSTRRHLFSQKPHTSSDLL
          590       600       610       620       630       640    

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pF1KSD ALFRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLVSPQYLNLIA
       : :.:::::  ::.::::::::.:::::.:.:..:: :::.:  ..:::::::. :.:::
CCDS47 AQFHYPRDPLIVEMARAGEIFEHTLQLIRERVKQGLTVDLEGKEFRYNDLVSPRSLSLIA
          650       660       670       680       690       700    

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pF1KSD NLSGCTAHRRVNNCSDMCFHQKYRTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKSVYENGFNTP
       :::::::.: . :::. ::: :::.:::::::::.: :::.:::: :::. .:..:. .:
CCDS47 NLSGCTARRPLPNCSNRCFHAKYRAHDGTCNNLQQPTWGAALTAFARLLQPAYRDGIRAP
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pF1KSD RGIN-PHRLYNGHALPMPRLVSTTLIGTETVTPDEQFTHMLMQWGQFLDHDLDSTVVALS
       ::.. :  . . . :: ::::.:.   . .::::...:.:::.:: ::.:::: :: :::
CCDS47 RGLGLP--VGSRQPLPPPRLVATVWARAAAVTPDHSYTRMLMHWGWFLEHDLDHTVPALS
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pF1KSD QARFSDGQHCSNVCSNDPPCFSVMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSPVCGSGMTSLLMNSV
        ::::::. ::.::.:::::: .     : :. . : ::.:.::::.:.::  :  ..::
CCDS47 TARFSDGRPCSSVCTNDPPCFPMNTRHADPRG-THAPCMLFARSSPACASGRPSATVDSV
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pF1KSD YPREQINQLTSYIDASNVYGSTEHEARSIRDLASHRGLLRQGIVQR-SGKPLLPFATGPP
       : :::::: :.:::.::::::.:.:....:: .  ::::. :.    ::::::::.::::
CCDS47 YAREQINQQTAYIDGSNVYGSSERESQALRDPSVPRGLLKTGFPWPPSGKPLLPFSTGPP
             890       900       910       920       930       940 

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pF1KSD TECMRDENESPIPCFLAGDHRANEQLGLTSMHTLWFREHNRIATELLKLNPHWDGDTIYY
       ::: :.:.:::  :::::::::::.:.:..:::::::::::.::::  :::::.:.:.: 
CCDS47 TECARQEQESP--CFLAGDHRANEHLALAAMHTLWFREHNRMATELSALNPHWEGNTVYQ
             950         960       970       980       990         

       1020      1030      1040      1050      1060      1070      
pF1KSD ETRKIVGAEIQHITYQHWLPKILGEVGMRTLGEYHGYDPGINAGIFNAFATAAFRFGHTL
       :.:::::::.:::::.:::::.::. : : :  :.::.:..::::.:.::::::::::::
CCDS47 EARKIVGAELQHITYSHWLPKVLGDPGTRMLRGYRGYNPNVNAGIINSFATAAFRFGHTL
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pF1KSD VNPLLYRLDENFQPIAQDHLPLHKAFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFGVAGKMRVPSQLLN
       .::.::::. ..  :.. :::.:::.::: ::..::::::.::::::::.: :.:: ::.
CCDS47 INPILYRLNATLGEISEGHLPFHKALFSPSRIIKEGGIDPVLRGLFGVAAKWRAPSYLLS
    1060      1070      1080      1090      1100      1110         

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pF1KSD TELTERLFSMAHTVALDLAAINIQRGRDHGIPPYHDYRVYCNLSAAHTFEDLKNEIKNPE
        :::.:::: :...:.: ::  :::::::::::: :.::.:::.....::::.::::. :
CCDS47 PELTQRLFSAAYSAAVDSAATIIQRGRDHGIPPYVDFRVFCNLTSVKNFEDLQNEIKDSE
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pF1KSD IREKLKRLYGSTLNIDLFPALVVEDLVPGSRLGPTLMCLLSTQFKRLRDGDRLWYENPGV
       ::.::..::::  .:::.:::.::::.::.:.:::::::. :::.:::::::.:::::::
CCDS47 IRQKLRKLYGSPGDIDLWPALMVEDLIPGTRVGPTLMCLFVTQFQRLRDGDRFWYENPGV
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pF1KSD FSPAQLTQIKQTSLARILCDNADNITRVQSDVFRVAEFPHGYGSCDEIPRVDLRVWQDCC
       :.::::::.::.::.:.::::.:.: .::.:::  ::.:. : .:.:::.::::::::::
CCDS47 FTPAQLTQLKQASLSRVLCDNGDSIQQVQADVFVKAEYPQDYLNCSEIPKVDLRVWQDCC
    1240      1250      1260      1270      1280      1290         

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pF1KSD EDCRTRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKKT--RPRKIPSVGRQGEHLSNSTSAFS
        :::.:::: : . . . .:: ..::  ::  . .  : :.  ..   ::   : :   .
CCDS47 ADCRSRGQFRAVTQESQKKRSAQYSYPVDKDMELSHLRSRQQDKI-YVGEDARNVTVLAK
    1300      1310      1320      1330      1340       1350        

         1380      1390      1400      1410      1420      1430    
pF1KSD TRSDASGTNDFREFVLEMQKTITDLRTQIKKLESRLSTTECVDAGGESHANNTKWKKDAC
       :.     ..::  :. :.:.::: :: ::.:::.::  . :.:. :  .  . .: :. :
CCDS47 TKF----SQDFSTFAAEIQETITALREQINKLEARLRQAGCTDVRGVPRKAEERWMKEDC
     1360          1370      1380      1390      1400      1410    

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pF1KSD TICECKDGQVTCFVEACPPATCAVPVNIPGACCPVCLQKRAEEKP    
       : : :..::::: :: :::: :  :  . :.:::::             
CCDS47 THCICESGQVTCVVEICPPAPCPSPELVKGTCCPVCRDRGMPSDSPEKR
         1420      1430      1440      1450      1460   

>>CCDS11602.1 EPX gene_id:8288|Hs108|chr17                (715 aa)
 initn: 1199 init1: 633 opt: 1739  Z-score: 925.3  bits: 182.8 E(32554): 3.2e-45
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       600       610       620       630       640          650    
pF1KSD NTIGSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHL---FDSRPRSP
                                     :.::   :: : : :.  .   . :   ::
CCDS11 VLATLVLAQPCEGTDPASPGAVETSVLRDCIAEAKLLVDAAYNWTQKSIKQRLRSGSASP
      10        20        30        40        50        60         

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pF1KSD NDLLALFRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLVSPQYL
        :::. :. :    :   .::.. .. .: :..:..:     . .:  .. .:...   :
CCDS11 MDLLSYFKQPV-AATRTVVRAADYMHVALGLLEEKLQP----QRSGP-FNVTDVLTEPQL
      70        80         90       100           110        120   

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pF1KSD NLIANLSGCTAHRRVNNCSDMCFHQKYRTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKSVYENG
        :... :::. . ... :::     ::::  : ::: ..:. :::  :. : : . ::.:
CCDS11 RLLSQASGCALRDQAERCSD-----KYRTITGRCNNKRRPLLGASNQALARWLPAEYEDG
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pF1KSD FNTPRGINPHRLYNGHALPMPRLVSTTLI--GTETVTPDEQFTHMLMQWGQFLDHDLDST
       .. : : .: :  ::  ::. : ::. ..   .: .: :.  . :.::::::.::::: .
CCDS11 LSLPFGWTPSRRRNGFLLPLVRAVSNQIVRFPNERLTSDRGRALMFMQWGQFIDHDLDFS
      180       190       200       210       220       230        

            840       850       860       870       880       890  
pF1KSD VVALSQARFSDGQHCSNVCSNDPPCFSVMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSPVCGSGMTSL
         . ... :. :  :  .:.. :::: . ::::: : ..   :. : ::.: : .     
CCDS11 PESPARVAFTAGVDCERTCAQLPPCFPIKIPPNDPRIKNQRDCIPFFRSAPSCPQ-----
      240       250       260       270       280       290        

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pF1KSD LMNSVYPREQINQLTSYIDASNVYGSTEHEARSIRDLASHRGLLRQGIVQR---SGKPLL
         :.   :.::: :::..::: ::::    .  .:. ... :::  .: ::   .:. ::
CCDS11 --NKNRVRNQINALTSFVDASMVYGSEVSLSLRLRNRTNYLGLL--AINQRFQDNGRALL
             300       310       320       330         340         

     950       960       970       980       990      1000         
pF1KSD PFATGPPTECMRDENESPIPCFLAGDHRANEQLGLTSMHTLWFREHNRIATELLKLNPHW
       :: .     :.  .  . :::::::: :..:   :..::::..:::::.:::: .:::.:
CCDS11 PFDNLHDDPCLLTNRSARIPCFLAGDTRSTETPKLAAMHTLFMREHNRLATELRRLNPRW
     350       360       370       380       390       400         

    1010      1020      1030      1040       1050      1060        
pF1KSD DGDTIYYETRKIVGAEIQHITYQHWLPKILGEV-GMRTLGEYHGYDPGINAGIFNAFATA
       .:: .: :.:::.:: .: :::. .:: .::.. . ::::.:.::  ...  . :.: : 
CCDS11 NGDKLYNEARKIMGAMVQIITYRDFLPLVLGKARARRTLGHYRGYCSNVDPRVANVF-TL
     410       420       430       440       450       460         

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pF1KSD AFRFGHTLVNPLLYRLDENFQPIAQD-HLPLHKAFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFGVAGK
       :::::::...:...::: ...  : . :.:: .:::. .::: ::::::.::::... .:
CCDS11 AFRFGHTMLQPFMFRLDSQYRASAPNSHVPLSSAFFASWRIVYEGGIDPILRGLMATPAK
      470       480       490       500       510       520        

      1130      1140      1150      1160      1170      1180       
pF1KSD MRVPSQLLNTELTERLFSMAHTVALDLAAINIQRGRDHGIPPYHDYRVYCNLSAAHTFED
       .   . .:  :: .::: ... ..:::::.:.::.::::.: :. .: .:.::  ... .
CCDS11 LNRQDAMLVDELRDRLFRQVRRIGLDLAALNMQRSRDHGLPGYNAWRRFCGLSQPRNLAQ
      530       540       550       560       570       580        

      1190      1200      1210      1220      1230      1240       
pF1KSD LKNEIKNPEIREKLKRLYGSTLNIDLFPALVVEDLVPGSRLGPTLMCLLSTQFKRLRDGD
       :.  .:: .. .:.  :::.  :::.. . ..: :.::.:.:: : ::. .::.: ::::
CCDS11 LSRVLKNQDLARKFLNLYGTPDNIDIWIGAIAEPLLPGARVGPLLACLFENQFRRARDGD
      590       600       610       620       630       640        

      1250      1260      1270      1280      1290      1300       
pF1KSD RLWYENPGVFSPAQLTQIKQTSLARILCDNADNITRVQSDVFRVAEFPHGYGSCDEIPRV
       :.:... :::.  :   ... ::.::.:::. .:: :. :.::.  .:.:. .:..:::.
CCDS11 RFWWQKRGVFTKRQRKALSRISLSRIICDNT-GITTVSRDIFRANIYPRGFVNCSRIPRL
      650       660       670        680       690       700       

      1310      1320      1330      1340      1350      1360       
pF1KSD DLRVWQDCCEDCRTRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKKTRPRKIPSVGRQGEHLS
       .: .:.                                                      
CCDS11 NLSAWRGT                                                    
       710                                                         

>>CCDS11604.1 MPO gene_id:4353|Hs108|chr17                (745 aa)
 initn: 1571 init1: 560 opt: 1721  Z-score: 915.7  bits: 181.1 E(32554): 1.1e-44
Smith-Waterman score: 1785; 39.7% identity (66.5% similar) in 753 aa overlap (583-1314:14-743)

            560       570       580       590       600       610  
pF1KSD EPAITWNKDGVQVTESGKFHISPEGFLTINDVGPADAGRYECVARNTIGSASVSMVLSVN
                                     :.::  ::      .  .. :..  .:.  
CCDS11                  MGVPFFSSLRCMVDLGPCWAGGLTAEMKLLLALAGLLAILA--
                                10        20        30        40   

            620                630       640          650       660
pF1KSD VPDVSRNGDP---------FVATSIVEAIATVDRAINSTRTHL---FDSRPRSPNDLLAL
       .:. :... :         .: .:. ::   ::.: .  :  .   . :   :: .::. 
CCDS11 TPQPSEGAAPAVLGEVDTSLVLSSMEEAKQLVDKAYKERRESIKQRLRSGSASPMELLSY
              50        60        70        80        90       100 

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD FRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLVSPQYLNLIANL
       :. :    :   .::.. .. .:.:......     .:    .. .:...:  ::.... 
CCDS11 FKQPVAA-TRTAVRAADYLHVALDLLERKLR-----SLWRRPFNVTDVLTPAQLNVLSKS
              110       120       130            140       150     

              730        740       750       760       770         
pF1KSD SGCTAHRRVN-NCSDMCFHQKYRTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKSVYENGFNTPR
       ::: :.. :. .: .   ..::::  : ::: . :  :::  :: : : . ::.::. : 
CCDS11 SGC-AYQDVGVTCPE---QDKYRTITGMCNNRRSPTLGASNRAFVRWLPAEYEDGFSLPY
          160          170       180       190       200       210 

     780       790       800         810       820       830       
pF1KSD GINPHRLYNGHALPMPRLVSTTLI--GTETVTPDEQFTHMLMQWGQFLDHDLDSTVVALS
       : .:    ::  . . : ::. ..   :. .:::.. . :.:::::.:::::: :    .
CCDS11 GWTPGVKRNGFPVALARAVSNEIVRFPTDQLTPDQERSLMFMQWGQLLDHDLDFTPEPAA
             220       230       240       250       260       270 

       840       850       860       870       880        890      
pF1KSD QARFSDGQHCSNVCSNDPPCFSVMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSPVC-GSGMTSLLMNS
       .: :  : .: . : ..:::: . ::::: : .. : :. : :: :.: ::..:      
CCDS11 RASFVTGVNCETSCVQQPPCFPLKIPPNDPRIKNQADCIPFFRSCPACPGSNITI-----
             280       290       300       310       320           

        900       910       920       930       940          950   
pF1KSD VYPREQINQLTSYIDASNVYGSTEHEARSIRDLASHRGLLRQGIVQR---SGKPLLPFAT
          :.::: :::..::: :::: :  ::..:..... :::  .. ::   .:. :::: .
CCDS11 ---RNQINALTSFVDASMVYGSEEPLARNLRNMSNQLGLL--AVNQRFQDNGRALLPFDN
           330       340       350       360         370       380 

           960       970       980       990      1000      1010   
pF1KSD GPPTECMRDENESPIPCFLAGDHRANEQLGLTSMHTLWFREHNRIATELLKLNPHWDGDT
            :.  .  . :::::::: :..:.  ::::::: .:::::.:::: .:::.:::. 
CCDS11 LHDDPCLLTNRSARIPCFLAGDTRSSEMPELTSMHTLLLREHNRLATELKSLNPRWDGER
             390       400       410       420       430       440 

          1020      1030      1040       1050      1060      1070  
pF1KSD IYYETRKIVGAEIQHITYQHWLPKILGEVGMRT-LGEYHGYDPGINAGIFNAFATAAFRF
       .: :.:::::: .: :::. .:: .:: ..::  :  :..:. ...  : :.: : :::.
CCDS11 LYQEARKIVGAMVQIITYRDYLPLVLGPTAMRKYLPTYRSYNDSVDPRIANVF-TNAFRY
             450       460       470       480       490        500

           1080      1090       1100      1110      1120      1130 
pF1KSD GHTLVNPLLYRLDENFQPIAQD-HLPLHKAFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFGVAGKMRVP
       ::::..:...:::. .::.  . ..:: ..::. .:.: ::::::.::::... .:.   
CCDS11 GHTLIQPFMFRLDNRYQPMEPNPRVPLSRVFFASWRVVLEGGIDPILRGLMATPAKLNRQ
              510       520       530       540       550       560

            1140      1150      1160      1170      1180      1190 
pF1KSD SQLLNTELTERLFSMAHTVALDLAAINIQRGRDHGIPPYHDYRVYCNLSAAHTFEDLKNE
       .:.   :. :::: ..  ..::: :.:.::.::::.: :. .: .:.:   .:  .: . 
CCDS11 NQIAVDEIRERLFEQVMRIGLDLPALNMQRSRDHGLPGYNAWRRFCGLPQPETVGQLGTV
              570       580       590       600       610       620

            1200      1210      1220      1230      1240      1250 
pF1KSD IKNPEIREKLKRLYGSTLNIDLFPALVVEDLVPGSRLGPTLMCLLSTQFKRLRDGDRLWY
       ..: .. .:: . ::.  :::.. . : : :   .:.:: : :...:::..::::::.:.
CCDS11 LRNLKLARKLMEQYGTPNNIDIWMGGVSEPLKRKGRVGPLLACIIGTQFRKLRDGDRFWW
              630       640       650       660       670       680

            1260      1270      1280      1290      1300      1310 
pF1KSD ENPGVFSPAQLTQIKQTSLARILCDNADNITRVQSDVFRVAEFPHGYGSCDEIPRVDLRV
       :: ::::  :   . : :: ::.:::.   :  ....:    .:. . .:. .: ..:  
CCDS11 ENEGVFSMQQRQALAQISLPRIICDNTGITTVSKNNIFMSNSYPRDFVNCSTLPALNLAS
              690       700       710       720       730       740

            1320      1330      1340      1350      1360      1370 
pF1KSD WQDCCEDCRTRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKKTRPRKIPSVGRQGEHLSNSTS
       :..                                                         
CCDS11 WREAS                                                       
                                                                   

>>CCDS54149.1 LPO gene_id:4025|Hs108|chr17                (629 aa)
 initn: 1395 init1: 522 opt: 1598  Z-score: 853.1  bits: 169.3 E(32554): 3.4e-41
Smith-Waterman score: 1598; 41.9% identity (69.7% similar) in 597 aa overlap (722-1312:39-624)

             700       710       720       730       740       750 
pF1KSD HGLMVDLNGTSYHYNDLVSPQYLNLIANLSGCTAHRRVNNCSDMCFHQKYRTHDGTCNNL
                                     :: :   :  : : :  . :::  : ::: 
CCDS54 ALLASLILLQAAASTTRDPSLDLTSLSLEVGCGAPAPVVRC-DPC--SPYRTITGDCNNR
       10        20        30        40         50          60     

             760       770       780       790       800           
pF1KSD QHPMWGASLTAFERLLKSVYENGFNTPRGINPHRLYNGHALPMPRLVSTTLIG--TETVT
       ..:  ::.  :. : : . ::.:.. : : .: .  ::  ::. : ::. ..:  .:  .
CCDS54 RKPALGAANRALARWLPAEYEDGLSLPFGWTPGKTRNGFPLPLAREVSNKIVGYLNEEGV
          70        80        90       100       110       120     

     810       820       830        840       850       860        
pF1KSD PDEQFTHMLMQWGQFLDHDLD-STVVALSQARFSDGQHCSNVCSNDPPCFSVMIPPNDSR
        :.. . ..:::::..::::: .  . :.....: .: :.. : .   :: .:.:::: .
CCDS54 LDQNRSLLFMQWGQIVDHDLDFAPDTELGSSEYSKAQ-CDEYCIQGDNCFPIMFPPNDPK
         130       140       150       160        170       180    

      870       880       890       900       910       920        
pF1KSD ARSGARCMFFVRSSPVCGSGMTSLLMNSVYPREQINQLTSYIDASNVYGSTEHEARSIRD
       : . ..:: : :.. :: .   . :      ::::: :::..::: ::.:    :  .:.
CCDS54 AGTQGKCMPFFRAGFVCPTPPYKSLA-----REQINALTSFLDASFVYSSEPSLASRLRN
          190       200       210            220       230         

      930       940        950       960       970       980       
pF1KSD LASHRGLLRQGI-VQRSGKPLLPFATGPPTECMRDENESPIPCFLAGDHRANEQLGLTSM
       :.:  ::.  .  :.  : : ::. .  :. :   .. . .::::::: ::.:.. :.. 
CCDS54 LSSPLGLMAVNQEVSDHGLPYLPYDSKKPSPCEFINTTARVPCFLAGDSRASEHILLATS
     240       250       260       270       280       290         

       990      1000      1010      1020      1030      1040       
pF1KSD HTLWFREHNRIATELLKLNPHWDGDTIYYETRKIVGAEIQHITYQHWLPKILGEVGMRTL
       :::..:::::.: :: .:::.:::. .: :.:::.:: .: ::.. .:: .::.  .. .
CCDS54 HTLFLREHNRLARELKRLNPQWDGEKLYQEARKILGAFVQIITFRDYLPILLGDHMQKWI
     300       310       320       330       340       350         

      1050      1060      1070      1080      1090       1100      
pF1KSD GEYHGYDPGINAGIFNAFATAAFRFGHTLVNPLLYRLDENFQPIAQD-HLPLHKAFFSPF
         :.::. ...  : :.: : ::::::  :   ..:::::.:: . . .::::  ::. .
CCDS54 PPYQGYSESVDPRISNVF-TFAFRFGHLEVPSSMFRLDENYQPWGPEPELPLHTLFFNTW
     360       370        380       390       400       410        

       1110      1120      1130      1140      1150       1160     
pF1KSD RIVNEGGIDPLLRGLFGVAGKMRVPSQLLNTELTERLFSMAHTV-ALDLAAINIQRGRDH
       :.:..::::::.:::..  .:.   ..... :: ..::. .: . ..:::::: :: :::
CCDS54 RMVKDGGIDPLVRGLLAKKSKLMKQNKMMTGELRNKLFQPTHRIHGFDLAAINTQRCRDH
      420       430       440       450       460       470        

        1170      1180      1190      1200      1210      1220     
pF1KSD GIPPYHDYRVYCNLSAAHTFEDLKNEIKNPEIREKLKRLYGSTLNIDLFPALVVEDLVPG
       : : :...:..:.::  .:.:.:.. .:.  . .::  :::.  :::.. . ..: ::  
CCDS54 GQPGYNSWRAFCDLSQPQTLEELNTVLKSKMLAKKLLGLYGTPDNIDIWIGAIAEPLVER
      480       490       500       510       520       530        

        1230      1240      1250      1260      1270      1280     
pF1KSD SRLGPTLMCLLSTQFKRLRDGDRLWYENPGVFSPAQLTQIKQTSLARILCDNADNITRVQ
       .:.:: : :::. ::...:::::.:.::::::.  :  .... :..:..:::.  ::.: 
CCDS54 GRVGPLLACLLGKQFQQIRDGDRFWWENPGVFTNEQKDSLQKMSFSRLVCDNT-RITKVP
      540       550       560       570       580       590        

        1290      1300      1310      1320      1330      1340     
pF1KSD SDVFRVAEFPHGYGSCDEIPRVDLRVWQDCCEDCRTRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQED
        : : .  .:. . .:. : ..::  :                                 
CCDS54 RDPFWANSYPYDFVDCSAIDKLDLSPWASVKN                            
       600       610       620                                     

>>CCDS32689.1 LPO gene_id:4025|Hs108|chr17                (712 aa)
 initn: 1425 init1: 522 opt: 1598  Z-score: 852.4  bits: 169.3 E(32554): 3.7e-41
Smith-Waterman score: 1626; 38.7% identity (68.1% similar) in 698 aa overlap (624-1312:34-707)

           600       610       620       630       640          650
pF1KSD CVARNTIGSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHL---FDSR
                                     .. .. .: . :..:. ..::.:   ..:.
CCDS32 LLHLPALLASLILLQAAASTTRAQTTRTSAISDTVSQAKVQVNKAFLDSRTRLKTAMSSE
            10        20        30        40        50        60   

              660       670       680       690       700       710
pF1KSD PRSPNDLLALFRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLVS
         .  .:   ... .   :    : :...:..:. ..   :.. .....  :    ::.:
CCDS32 TPTSRQLSEYLKHAKG-RTRTAIRNGQVWEESLKRLR---QKASLTNVTDPSL---DLTS
            70         80        90          100       110         

              720       730       740       750       760       770
pF1KSD PQYLNLIANLSGCTAHRRVNNCSDMCFHQKYRTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKSV
          :.: .   :: :   :  : : :  . :::  : ::: ..:  ::.  :. : : . 
CCDS32 ---LSLEV---GCGAPAPVVRC-DPC--SPYRTITGDCNNRRKPALGAANRALARWLPAE
           120          130          140       150       160       

              780       790       800         810       820        
pF1KSD YENGFNTPRGINPHRLYNGHALPMPRLVSTTLIG--TETVTPDEQFTHMLMQWGQFLDHD
       ::.:.. : : .: .  ::  ::. : ::. ..:  .:  . :.. . ..:::::..:::
CCDS32 YEDGLSLPFGWTPGKTRNGFPLPLAREVSNKIVGYLNEEGVLDQNRSLLFMQWGQIVDHD
       170       180       190       200       210       220       

      830        840       850       860       870       880       
pF1KSD LD-STVVALSQARFSDGQHCSNVCSNDPPCFSVMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSPVCGS
       :: .  . :.....: .: :.. : .   :: .:.:::: .: . ..:: : :.. :: .
CCDS32 LDFAPDTELGSSEYSKAQ-CDEYCIQGDNCFPIMFPPNDPKAGTQGKCMPFFRAGFVCPT
       230       240        250       260       270       280      

       890       900       910       920       930       940       
pF1KSD GMTSLLMNSVYPREQINQLTSYIDASNVYGSTEHEARSIRDLASHRGLLRQGI-VQRSGK
          . :      ::::: :::..::: ::.:    :  .:.:.:  ::.  .  :.  : 
CCDS32 PPYKSLA-----REQINALTSFLDASFVYSSEPSLASRLRNLSSPLGLMAVNQEVSDHGL
        290            300       310       320       330       340 

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pF1KSD PLLPFATGPPTECMRDENESPIPCFLAGDHRANEQLGLTSMHTLWFREHNRIATELLKLN
       : ::. .  :. :   .. . .::::::: ::.:.. :.. :::..:::::.: :: .::
CCDS32 PYLPYDSKKPSPCEFINTTARVPCFLAGDSRASEHILLATSHTLFLREHNRLARELKRLN
             350       360       370       380       390       400 

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pF1KSD PHWDGDTIYYETRKIVGAEIQHITYQHWLPKILGEVGMRTLGEYHGYDPGINAGIFNAFA
       :.:::. .: :.:::.:: .: ::.. .:: .::.  .. .  :.::. ...  : :.: 
CCDS32 PQWDGEKLYQEARKILGAFVQIITFRDYLPILLGDHMQKWIPPYQGYSESVDPRISNVF-
             410       420       430       440       450       460 

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pF1KSD TAAFRFGHTLVNPLLYRLDENFQPIAQD-HLPLHKAFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFGVA
       : ::::::  :   ..:::::.:: . . .::::  ::. .:.:..::::::.:::..  
CCDS32 TFAFRFGHLEVPSSMFRLDENYQPWGPEPELPLHTLFFNTWRMVKDGGIDPLVRGLLAKK
              470       480       490       500       510       520

        1130      1140      1150       1160      1170      1180    
pF1KSD GKMRVPSQLLNTELTERLFSMAHTV-ALDLAAINIQRGRDHGIPPYHDYRVYCNLSAAHT
       .:.   ..... :: ..::. .: . ..:::::: :: :::: : :...:..:.::  .:
CCDS32 SKLMKQNKMMTGELRNKLFQPTHRIHGFDLAAINTQRCRDHGQPGYNSWRAFCDLSQPQT
              530       540       550       560       570       580

         1190      1200      1210      1220      1230      1240    
pF1KSD FEDLKNEIKNPEIREKLKRLYGSTLNIDLFPALVVEDLVPGSRLGPTLMCLLSTQFKRLR
       .:.:.. .:.  . .::  :::.  :::.. . ..: ::  .:.:: : :::. ::...:
CCDS32 LEELNTVLKSKMLAKKLLGLYGTPDNIDIWIGAIAEPLVERGRVGPLLACLLGKQFQQIR
              590       600       610       620       630       640

         1250      1260      1270      1280      1290      1300    
pF1KSD DGDRLWYENPGVFSPAQLTQIKQTSLARILCDNADNITRVQSDVFRVAEFPHGYGSCDEI
       ::::.:.::::::.  :  .... :..:..:::.  ::.:  : : .  .:. . .:. :
CCDS32 DGDRFWWENPGVFTNEQKDSLQKMSFSRLVCDNT-RITKVPRDPFWANSYPYDFVDCSAI
              650       660       670        680       690         

         1310      1320      1330      1340      1350      1360    
pF1KSD PRVDLRVWQDCCEDCRTRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKKTRPRKIPSVGRQGE
        ..::  :                                                    
CCDS32 DKLDLSPWASVKN                                               
     700       710                                                 

>>CCDS1643.1 TPO gene_id:7173|Hs108|chr2                  (933 aa)
 initn: 1657 init1: 581 opt: 1285  Z-score: 688.8  bits: 139.4 E(32554): 4.8e-32
Smith-Waterman score: 1888; 41.5% identity (69.5% similar) in 737 aa overlap (604-1314:8-734)

           580       590       600       610               620     
pF1KSD SPEGFLTINDVGPADAGRYECVARNTIGSASVSMVLSVN---VPDVSRN-----GDPF--
                                     ::..:.. .    : .::.     : :   
CCDS16                        MRALAVLSVTLVMACTEAFFPFISRGKELLWGKPEES
                                      10        20        30       

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pF1KSD -VATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDSRP-RSPNDLLALFRYPRDPYTVEQARAGEIFER
        :.. . :.   :: :. .:  . . .:   :: .::.. . : .: .   :::.::.: 
CCDS16 RVSSVLEESKRLVDTAMYATMQRNLKKRGILSPAQLLSFSKLP-EPTSGVIARAAEIMET
        40        50        60        70        80         90      

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pF1KSD TLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLVSPQYLNLIANLSGCTAHRRVNNCSDMCFHQKY
       ..: ....:.   .      : : .: .: . :..:::.:::  .    .: . :. .::
CCDS16 SIQAMKRKVNLKTQ-----QSQHPTDALSEDLLSIIANMSGCLPYMLPPKCPNTCLANKY
        100       110            120       130       140       150 

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pF1KSD RTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKSVYENGFNTPRGINPHRLYNGHALPMPRLVSTT
       :   :.::: .:: :::: ::. : :  :::.::. ::: ::  ::::  ::  : :.  
CCDS16 RPITGACNNRDHPRWGASNTALARWLPPVYEDGFSQPRGWNPGFLYNGFPLPPVREVTRH
             160       170       180       190       200       210 

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pF1KSD LI--GTETVTPDEQFTHMLMQWGQFLDHDLDSTVVALSQARFSDGQHCSNVCSNDPPCFS
       .:  ..:.:: :.... .:: :::..:::.  :  . :.: :. :  :. .: :. ::: 
CCDS16 VIQVSNEVVTDDDRYSDLLMAWGQYIDHDIAFTPQSTSKAAFGGGADCQMTCENQNPCFP
             220       230       240       250       260       270 

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pF1KSD VMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSPVCGSGMTSLL---MNSVYPREQINQLTSYIDASNVY
       ...: ...:  .:. :. : ::: .::.:  . :   .... ::.:.: :::..:::.::
CCDS16 IQLP-EEARPAAGTACLPFYRSSAACGTGDQGALFGNLSTANPRQQMNGLTSFLDASTVY
              280       290       300       310       320       330

        920       930        940       950        960          970 
pF1KSD GSTEHEARSIRDLASHRGLLR-QGIVQRSGKPLLPFATG-PPTECMRDEN---ESPIPCF
       ::.    :..:. .: .:::: .. .. ::.  :::.    :. :  . .   :.  :::
CCDS16 GSSPALERQLRNWTSAEGLLRVHARLRDSGRAYLPFVPPRAPAACAPEPGIPGETRGPCF
              340       350       360       370       380       390

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pF1KSD LAGDHRANEQLGLTSMHTLWFREHNRIATELLKLNPHWDGDTIYYETRKIVGAEIQHITY
       :::: ::.:  .::..::::.:::::.:. :  :: ::..:..: :.::.:::  : :: 
CCDS16 LAGDGRASEVPSLTALHTLWLREHNRLAAALKALNAHWSADAVYQEARKVVGALHQIITL
              400       410       420       430       440       450

            1040       1050      1060      1070      1080      1090
pF1KSD QHWLPKILG-EVGMRTLGEYHGYDPGINAGIFNAFATAAFRFGHTLVNPLLYRLDENFQP
       . ..:.::: :. .. .: :.:::   :  . :.:.::::::::. ..::. ::: .:: 
CCDS16 RDYIPRILGPEAFQQYVGPYEGYDSTANPTVSNVFSTAAFRFGHATIHPLVRRLDASFQ-
              460       470       480       490       500          

                1100      1110      1120      1130      1140       
pF1KSD IAQDHLP---LHKAFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFGVAGKMRVPSQLLNTELTERLFSMA
         .  ::   ::.:::::. ..  ::.:::.:::..  .:..: .::.: ::::::: ..
CCDS16 -EHPDLPGLWLHQAFFSPWTLLRGGGLDPLIRGLLARPAKLQVQDQLMNEELTERLFVLS
      510       520       530       540       550       560        

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pF1KSD HTVALDLAAINIQRGRDHGIPPYHDYRVYCNLSAAHTFEDLKNEIKNPEIREKLKRLYGS
       .. .::::.::.:::::::.: :...: .:.:   .:  ::.. : .  . .:.  ::  
CCDS16 NSSTLDLASINLQRGRDHGLPGYNEWREFCGLPRLETPADLSTAIASRSVADKILDLYKH
      570       580       590       600       610       620        

      1210      1220      1230      1240      1250      1260       
pF1KSD TLNIDLFPALVVEDLVPGSRLGPTLMCLLSTQFKRLRDGDRLWYENPGVFSPAQLTQIKQ
         :::.. . ..:...: .: :: . ::.. :.: ::::: .:.::  ::. ::  ....
CCDS16 PDNIDVWLGGLAENFLPRARTGPLFACLIGKQMKALRDGDWFWWENSHVFTDAQRRELEK
      630       640       650       660       670       680        

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pF1KSD TSLARILCDNADNITRVQSDVFRVAEFPHGYGSCDEIPRVDLRVWQDCCEDCRTRGQFNA
        ::.:..:::. ..:::  :.:.:..::. . ::: :  ..:..:..             
CCDS16 HSLSRVICDNT-GLTRVPMDAFQVGKFPEDFESCDSITGMNLEAWRETFPQDDKCGFPES
      690        700       710       720       730       740       

      1330      1340      1350      1360      1370      1380       
pF1KSD FSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKKTRPRKIPSVGRQGEHLSNSTSAFSTRSDASGTNDFRE
                                                                   
CCDS16 VENGDFVHCEESGRRVLVYSCRHGYELQGREQLTCTQEGWDFQPPLCKDVNECADGAHPP
       750       760       770       780       790       800       

>>CCDS1646.1 TPO gene_id:7173|Hs108|chr2                  (760 aa)
 initn: 1080 init1: 581 opt: 868  Z-score: 474.3  bits: 99.4 E(32554): 4.2e-20
Smith-Waterman score: 1085; 31.6% identity (53.2% similar) in 729 aa overlap (604-1314:8-561)

           580       590       600       610               620     
pF1KSD SPEGFLTINDVGPADAGRYECVARNTIGSASVSMVLSVN---VPDVSRN-----GDPF--
                                     ::..:.. .    : .::.     : :   
CCDS16                        MRALAVLSVTLVMACTEAFFPFISRGKELLWGKPEES
                                      10        20        30       

            630       640       650        660       670       680 
pF1KSD -VATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDSRP-RSPNDLLALFRYPRDPYTVEQARAGEIFER
        :.. . :.   :: :. .:  . . .:   :: .::.. . : .: .   :::.::.: 
CCDS16 RVSSVLEESKRLVDTAMYATMQRNLKKRGILSPAQLLSFSKLP-EPTSGVIARAAEIMET
        40        50        60        70        80         90      

             690       700       710       720       730       740 
pF1KSD TLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLVSPQYLNLIANLSGCTAHRRVNNCSDMCFHQKY
       ..: ....:.   .      : : .: .: . :..:::.:::  .    .: . :. .::
CCDS16 SIQAMKRKVNLKTQ-----QSQHPTDALSEDLLSIIANMSGCLPYMLPPKCPNTCLANKY
        100       110            120       130       140       150 

             750       760       770       780       790       800 
pF1KSD RTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKSVYENGFNTPRGINPHRLYNGHALPMPRLVSTT
       :   :.::: .:: :::: ::. : :  :::.::. ::: ::  ::::  ::  : :.  
CCDS16 RPITGACNNRDHPRWGASNTALARWLPPVYEDGFSQPRGWNPGFLYNGFPLPPVREVTRH
             160       170       180       190       200       210 

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pF1KSD LI--GTETVTPDEQFTHMLMQWGQFLDHDLDSTVVALSQARFSDGQHCSNVCSNDPPCFS
       .:  ..:.:: :.... .:: :::..:::.  :  . :.: :. :  :. .: :. ::: 
CCDS16 VIQVSNEVVTDDDRYSDLLMAWGQYIDHDIAFTPQSTSKAAFGGGADCQMTCENQNPCFP
             220       230       240       250       260       270 

     860       870       880       890       900       910         
pF1KSD VMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSPVCGSGMTSLLMNSVYPREQINQLTSYIDASNVYGST
       ..:                                                         
CCDS16 IQI---------------------------------------------------------
                                                                   

     920       930       940       950       960       970         
pF1KSD EHEARSIRDLASHRGLLRQGIVQRSGKPLLPFATGPPTECMRDENESPIPCFLAGDHRAN
                                                                   
CCDS16 ------------------------------------------------------------
                                                                   

     980       990      1000      1010      1020      1030         
pF1KSD EQLGLTSMHTLWFREHNRIATELLKLNPHWDGDTIYYETRKIVGAEIQHITYQHWLPKIL
                                                        :: . ..:.::
CCDS16 -------------------------------------------------ITLRDYIPRIL
                                                           280     

    1040       1050      1060      1070      1080      1090        
pF1KSD G-EVGMRTLGEYHGYDPGINAGIFNAFATAAFRFGHTLVNPLLYRLDENFQPIAQDHLP-
       : :. .. .: :.:::   :  . :.:.::::::::. ..::. ::: .::   .  :: 
CCDS16 GPEAFQQYVGPYEGYDSTANPTVSNVFSTAAFRFGHATIHPLVRRLDASFQ--EHPDLPG
         290       300       310       320       330         340   

        1100      1110      1120      1130      1140      1150     
pF1KSD --LHKAFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFGVAGKMRVPSQLLNTELTERLFSMAHTVALDLA
         ::.:::::. ..  ::.:::.:::..  .:..: .::.: ::::::: .... .::::
CCDS16 LWLHQAFFSPWTLLRGGGLDPLIRGLLARPAKLQVQDQLMNEELTERLFVLSNSSTLDLA
           350       360       370       380       390       400   

        1160      1170      1180      1190      1200      1210     
pF1KSD AINIQRGRDHGIPPYHDYRVYCNLSAAHTFEDLKNEIKNPEIREKLKRLYGSTLNIDLFP
       .::.:::::::.: :...: .:.:   .:  ::.. : .  . .:.  ::    :::.. 
CCDS16 SINLQRGRDHGLPGYNEWREFCGLPRLETPADLSTAIASRSVADKILDLYKHPDNIDVWL
           410       420       430       440       450       460   

        1220      1230      1240      1250      1260      1270     
pF1KSD ALVVEDLVPGSRLGPTLMCLLSTQFKRLRDGDRLWYENPGVFSPAQLTQIKQTSLARILC
       . ..:...: .: :: . ::.. :.: ::::: .:.::  ::. ::  .... ::.:..:
CCDS16 GGLAENFLPRARTGPLFACLIGKQMKALRDGDWFWWENSHVFTDAQRRELEKHSLSRVIC
           470       480       490       500       510       520   

        1280      1290      1300      1310      1320      1330     
pF1KSD DNADNITRVQSDVFRVAEFPHGYGSCDEIPRVDLRVWQDCCEDCRTRGQFNAFSYHFRGR
       ::. ..:::  :.:.:..::. . ::: :  ..:..:..                     
CCDS16 DNT-GLTRVPMDAFQVGKFPEDFESCDSITGMNLEAWRETFPQDDKCGFPESVENGDFVH
            530       540       550       560       570       580  

        1340      1350      1360      1370      1380      1390     
pF1KSD RSLEFSYQEDKPTKKTRPRKIPSVGRQGEHLSNSTSAFSTRSDASGTNDFREFVLEMQKT
                                                                   
CCDS16 CEESGRRVLVYSCRHGYELQGREQLTCTQEGWDFQPPLCKDVNECADGAHPPCHASARCR
            590       600       610       620       630       640  

>>CCDS1644.1 TPO gene_id:7173|Hs108|chr2                  (876 aa)
 initn: 1433 init1: 314 opt: 795  Z-score: 435.7  bits: 92.5 E(32554): 6e-18
Smith-Waterman score: 1535; 37.6% identity (63.0% similar) in 737 aa overlap (604-1314:8-677)

           580       590       600       610               620     
pF1KSD SPEGFLTINDVGPADAGRYECVARNTIGSASVSMVLSVN---VPDVSRN-----GDPF--
                                     ::..:.. .    : .::.     : :   
CCDS16                        MRALAVLSVTLVMACTEAFFPFISRGKELLWGKPEES
                                      10        20        30       

            630       640       650        660       670       680 
pF1KSD -VATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDSRP-RSPNDLLALFRYPRDPYTVEQARAGEIFER
        :.. . :.   :: :. .:  . . .:   :: .::.. . : .: .   :::.::.: 
CCDS16 RVSSVLEESKRLVDTAMYATMQRNLKKRGILSPAQLLSFSKLP-EPTSGVIARAAEIMET
        40        50        60        70        80         90      

             690       700       710       720       730       740 
pF1KSD TLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLVSPQYLNLIANLSGCTAHRRVNNCSDMCFHQKY
       ..: ....:.   .      : : .: .: . :..:::.:::  .    .: . :. .::
CCDS16 SIQAMKRKVNLKTQ-----QSQHPTDALSEDLLSIIANMSGCLPYMLPPKCPNTCLANKY
        100       110            120       130       140       150 

             750       760       770       780       790       800 
pF1KSD RTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKSVYENGFNTPRGINPHRLYNGHALPMPRLVSTT
       :   :.::: .:: :::: ::. : :  :::.::. ::: ::  ::::  ::  : :.  
CCDS16 RPITGACNNRDHPRWGASNTALARWLPPVYEDGFSQPRGWNPGFLYNGFPLPPVREVTRH
             160       170       180       190       200       210 

               810       820       830       840       850         
pF1KSD LI--GTETVTPDEQFTHMLMQWGQFLDHDLDSTVVALSQARFSDGQHCSNVCSNDPPCFS
       .:  ..:.:: :.... .:: :::..:::.  :  . :.: :. :  :. .: :. ::: 
CCDS16 VIQVSNEVVTDDDRYSDLLMAWGQYIDHDIAFTPQSTSKAAFGGGADCQMTCENQNPCFP
             220       230       240       250       260       270 

     860       870       880       890          900       910      
pF1KSD VMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSPVCGSGMTSLL---MNSVYPREQINQLTSYIDASNVY
       ...: ...:  .:. :. : ::: .::.:  . :   .... ::.:.: :::..:::.::
CCDS16 IQLP-EEARPAAGTACLPFYRSSAACGTGDQGALFGNLSTANPRQQMNGLTSFLDASTVY
              280       290       300       310       320       330

        920       930        940       950        960          970 
pF1KSD GSTEHEARSIRDLASHRGLLR-QGIVQRSGKPLLPFATG-PPTECMRDEN---ESPIPCF
       ::.    :..:. .: .:::: .. .. ::.  :::.    :. :  . .   :.  :::
CCDS16 GSSPALERQLRNWTSAEGLLRVHARLRDSGRAYLPFVPPRAPAACAPEPGIPGETRGPCF
              340       350       360       370       380       390

             980       990      1000      1010      1020      1030 
pF1KSD LAGDHRANEQLGLTSMHTLWFREHNRIATELLKLNPHWDGDTIYYETRKIVGAEIQHITY
       :::: ::.:  .::..::::.:::::.:. :  :: ::..:..: :.::.:::  : :: 
CCDS16 LAGDGRASEVPSLTALHTLWLREHNRLAAALKALNAHWSADAVYQEARKVVGALHQIITL
              400       410       420       430       440       450

            1040       1050      1060      1070      1080      1090
pF1KSD QHWLPKILG-EVGMRTLGEYHGYDPGINAGIFNAFATAAFRFGHTLVNPLLYRLDENFQP
       . ..:.::: :. .. .: :.:::   :  . :.:.::::::::. ..::. ::: .:: 
CCDS16 RDYIPRILGPEAFQQYVGPYEGYDSTANPTVSNVFSTAAFRFGHATIHPLVRRLDASFQE
              460       470       480       490       500       510

                1100      1110      1120      1130      1140       
pF1KSD IAQDHLP---LHKAFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFGVAGKMRVPSQLLNTELTERLFSMA
         .  ::   ::.:::::.          ::::  :                        
CCDS16 --HPDLPGLWLHQAFFSPWT---------LLRG--G------------------------
                520                530                             

      1150      1160      1170      1180      1190      1200       
pF1KSD HTVALDLAAINIQRGRDHGIPPYHDYRVYCNLSAAHTFEDLKNEIKNPEIREKLKRLYGS
                             :...: .:.:   .:  ::.. : .  . .:.  ::  
CCDS16 ----------------------YNEWREFCGLPRLETPADLSTAIASRSVADKILDLYKH
                                 540       550       560       570 

      1210      1220      1230      1240      1250      1260       
pF1KSD TLNIDLFPALVVEDLVPGSRLGPTLMCLLSTQFKRLRDGDRLWYENPGVFSPAQLTQIKQ
         :::.. . ..:...: .: :: . ::.. :.: ::::: .:.::  ::. ::  ....
CCDS16 PDNIDVWLGGLAENFLPRARTGPLFACLIGKQMKALRDGDWFWWENSHVFTDAQRRELEK
             580       590       600       610       620       630 

      1270      1280      1290      1300      1310      1320       
pF1KSD TSLARILCDNADNITRVQSDVFRVAEFPHGYGSCDEIPRVDLRVWQDCCEDCRTRGQFNA
        ::.:..:::. ..:::  :.:.:..::. . ::: :  ..:..:..             
CCDS16 HSLSRVICDNT-GLTRVPMDAFQVGKFPEDFESCDSITGMNLEAWRETFPQDDKCGFPES
             640        650       660       670       680       690

      1330      1340      1350      1360      1370      1380       
pF1KSD FSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKKTRPRKIPSVGRQGEHLSNSTSAFSTRSDASGTNDFRE
                                                                   
CCDS16 VENGDFVHCEESGRRVLVYSCRHGYELQGREQLTCTQEGWDFQPPLCKDVNECADGAHPP
              700       710       720       730       740       750

>>CCDS30956.1 HMCN1 gene_id:83872|Hs108|chr1              (5635 aa)
 initn: 821 init1: 362 opt: 710  Z-score: 380.3  bits: 84.9 E(32554): 7.3e-15
Smith-Waterman score: 720; 32.2% identity (60.0% similar) in 428 aa overlap (221-633:866-1280)

              200       210       220          230       240       
pF1KSD SNTLHCDCEILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEYPR---RIQGRSVATITPEELNCERPR
                                     :::      .::.....:.:    .   : 
CCDS30 SRPFSVSSISQLRTGALFILNLWASDKGTYICEAENQFGKIQSETTVTVT----GLVAPL
         840       850       860       870       880           890 

       250       260        270       280       290       300      
pF1KSD ITSEPQDADVTSGNTVYFTCRA-EGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQN
       :   :. :.:  :. . . :    ::: ::  :..:.  : .  .  ... .::.: :. 
CCDS30 IGISPSVANVIEGQQLTLPCTLLAGNPIPERRWIKNSAMLLQ--NPYITVRSDGSLHIER
             900       910       920       930         940         

        310       320        330       340       350       360     
pF1KSD TQETDQGIYQCMAKNVAG-EVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVGESVTLECSA
       .:  : : : :.:.:::: . ::  :... .     ::.    :   .. :  ::: :.:
CCDS30 VQLQDGGEYTCVASNVAGTNNKTTSVVVHVL-----PTIQHGQQILSTIEGIPVTLPCKA
     950       960       970       980            990      1000    

         370       380       390       400       410           420 
pF1KSD TGHPPPRISWTRGDRTPLPVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGEYACSATNNID----SV
       .:.: : . :..  .     . . .   .:.::. .    .::::.:.:::.      .:
CCDS30 SGNPKPSVIWSKKGELISTSSAKFSAGADGSLYVVSPGGEESGEYVCTATNTAGYAKRKV
         1010      1020      1030      1040      1050      1060    

             430       440           450       460       470       
pF1KSD HATAFIIVQALPQFTVTPQDR----VVIEGQTVDFQCEAKGNPPPVIAWTKGGSQLS-VD
       . :...  ... .     ::.     :. :. : . ::.:. :::.:.:.:  . .:  .
CCDS30 QLTVYVRPRVFGDQRGLSQDKPVEISVLAGEEVTLPCEVKSLPPPIITWAKETQLISPFS
         1070      1080      1090      1100      1110      1120    

        480       490       500       510       520       530      
pF1KSD RRHLVLSSGTLRISGVALHDQGQYECQAVNIIGSQKVVAHLTVQPRVTPVFASIPSDTTV
        ::  : ::...:. .   :.:.: : :.:: :.   ...:.:.  : : .   :.   :
CCDS30 PRHTFLPSGSMKITETRTSDSGMYLCVATNIAGNVTQAVKLNVH--VPPKIQRGPKHLKV
         1130      1140      1150      1160        1170      1180  

        540       550       560       570        580       590     
pF1KSD EVGANVQLPCSSQGEPEPAITWNKDGVQVTESGKFHIS-PEGFLTINDVGPADAGRYECV
       .::  :..::..:: : :.:::.: :  .  .:. :.: :.: :.:... :.::: : ::
CCDS30 QVGQRVDIPCNAQGTPLPVITWSKGGSTMLVDGEHHVSNPDGTLSIDQATPSDAGIYTCV
           1190      1200      1210      1220      1230      1240  

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pF1KSD ARNTIGSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDSRPRSPN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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