Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0201
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0201, 858 aa
1>>>pF1KSDA0201 858 - 858 aa - 858 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1413+/-0.00124; mu= 7.8145+/- 0.074
mean_var=140.9392+/-27.429, 0's: 0 Z-trim(105.7): 36 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.108033
statistics sampled from 8537 (8562) to 8537 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 3.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9340.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 858) 5657 894.2 0
CCDS66526.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 860) 5420 857.2 0
CCDS73559.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 782) 4227 671.3 1.9e-192
CCDS66525.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 814) 3466 552.7 9.8e-157
CCDS4166.1 HSPA4 gene_id:3308|Hs108|chr5 ( 840) 2545 409.1 1.6e-113
CCDS3734.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs108|chr4 ( 839) 2415 388.9 2.1e-107
CCDS82953.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs108|chr4 ( 813) 2214 357.5 5.4e-98
CCDS34415.1 HSPA1B gene_id:3304|Hs108|chr6 ( 641) 941 159.1 2.3e-38
CCDS34414.1 HSPA1A gene_id:3303|Hs108|chr6 ( 641) 941 159.1 2.3e-38
CCDS34413.1 HSPA1L gene_id:3305|Hs108|chr6 ( 641) 933 157.8 5.5e-38
CCDS8440.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 ( 646) 923 156.3 1.6e-37
CCDS1231.1 HSPA6 gene_id:3310|Hs108|chr1 ( 643) 920 155.8 2.3e-37
CCDS9766.1 HSPA2 gene_id:3306|Hs108|chr14 ( 639) 897 152.2 2.7e-36
CCDS6863.1 HSPA5 gene_id:3309|Hs108|chr9 ( 654) 882 149.9 1.4e-35
CCDS44754.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 ( 493) 875 148.7 2.3e-35
CCDS4208.1 HSPA9 gene_id:3313|Hs108|chr5 ( 679) 789 135.4 3.3e-31
CCDS7103.1 HSPA14 gene_id:51182|Hs108|chr10 ( 509) 670 116.8 9.9e-26
CCDS8408.1 HYOU1 gene_id:10525|Hs108|chr11 ( 999) 410 76.4 2.8e-13
>>CCDS9340.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 (858 aa)
initn: 5657 init1: 5657 opt: 5657 Z-score: 4772.6 bits: 894.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5657; 100.0% identity (100.0% similar) in 858 aa overlap (1-858:1-858)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSVVGLDVGSQSCYIAVARAGGIETIANEFSDRCTPSVISFGSKNRTIGVAAKNQQITHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MSVVGLDVGSQSCYIAVARAGGIETIANEFSDRCTPSVISFGSKNRTIGVAAKNQQITHA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NNTVSNFKRFHGRAFNDPFIQKEKENLSYDLVPLKNGGVGIKVMYMGEEHLFSVEQITAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 NNTVSNFKRFHGRAFNDPFIQKEKENLSYDLVPLKNGGVGIKVMYMGEEHLFSVEQITAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LLTKLKETAENSLKKPVTDCVISVPSFFTDAERRSVLDAAQIVGLNCLRLMNDMTAVALN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 LLTKLKETAENSLKKPVTDCVISVPSFFTDAERRSVLDAAQIVGLNCLRLMNDMTAVALN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YGIYKQDLPSLDEKPRIVVFVDMGHSAFQVSACAFNKGKLKVLGTAFDPFLGGKNFDEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 YGIYKQDLPSLDEKPRIVVFVDMGHSAFQVSACAFNKGKLKVLGTAFDPFLGGKNFDEKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VEHFCAEFKTKYKLDAKSKIRALLRLYQECEKLKKLMSSNSTDLPLNIECFMNDKDVSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 VEHFCAEFKTKYKLDAKSKIRALLRLYQECEKLKKLMSSNSTDLPLNIECFMNDKDVSGK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MNRSQFEELCAELLQKIEVPLYSLLEQTHLKVEDVSAVEIVGGATRIPAVKERIAKFFGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MNRSQFEELCAELLQKIEVPLYSLLEQTHLKVEDVSAVEIVGGATRIPAVKERIAKFFGK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DISTTLNADEAVARGCALQCAILSPAFKVREFSVTDAVPFPISLIWNHDSEDTEGVHEVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 DISTTLNADEAVARGCALQCAILSPAFKVREFSVTDAVPFPISLIWNHDSEDTEGVHEVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SRNHAAPFSKVLTFLRRGPFELEAFYSDPQGVPYPEAKIGRFVVQNVSAQKDGEKSRVKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 SRNHAAPFSKVLTFLRRGPFELEAFYSDPQGVPYPEAKIGRFVVQNVSAQKDGEKSRVKV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KVRVNTHGIFTISTASMVEKVPTEENEMSSEADMECLNQRPPENPDTDKNVQQDNSEAGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 KVRVNTHGIFTISTASMVEKVPTEENEMSSEADMECLNQRPPENPDTDKNVQQDNSEAGT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QPQVQTDAQQTSQSPPSPELTSEENKIPDADKANEKKVDQPPEAKKPKIKVVNVELPIEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 QPQVQTDAQQTSQSPPSPELTSEENKIPDADKANEKKVDQPPEAKKPKIKVVNVELPIEA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NLVWQLGKDLLNMYIETEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEFRDKLCGPYEKFICEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 NLVWQLGKDLLNMYIETEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEFRDKLCGPYEKFICEQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD DHQNFLRLLTETEDWLYEEGEDQAKQAYVDKLEELMKIGTPVKVRFQEAEERPKMFEELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 DHQNFLRLLTETEDWLYEEGEDQAKQAYVDKLEELMKIGTPVKVRFQEAEERPKMFEELG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD QRLQHYAKIAADFRNKDEKYNHIDESEMKKVEKSVNEVMEWMNNVMNAQAKKSLDQDPVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 QRLQHYAKIAADFRNKDEKYNHIDESEMKKVEKSVNEVMEWMNNVMNAQAKKSLDQDPVV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD RAQEIKTKIKELNNTCEPVVTQPKPKIESPKLERTPNGPNIDKKEEDLEDKNNFGAEPPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 RAQEIKTKIKELNNTCEPVVTQPKPKIESPKLERTPNGPNIDKKEEDLEDKNNFGAEPPH
790 800 810 820 830 840
850
pF1KSD QNGECYPNEKNSVNMDLD
::::::::::::::::::
CCDS93 QNGECYPNEKNSVNMDLD
850
>>CCDS66526.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 (860 aa)
initn: 5420 init1: 5420 opt: 5420 Z-score: 4572.9 bits: 857.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5420; 100.0% identity (100.0% similar) in 822 aa overlap (37-858:39-860)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD DVGSQSCYIAVARAGGIETIANEFSDRCTPSVISFGSKNRTIGVAAKNQQITHANNTVSN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GPAAHWVESFQKAREEGSGSGTWRGRWRRRSVISFGSKNRTIGVAAKNQQITHANNTVSN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FKRFHGRAFNDPFIQKEKENLSYDLVPLKNGGVGIKVMYMGEEHLFSVEQITAMLLTKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FKRFHGRAFNDPFIQKEKENLSYDLVPLKNGGVGIKVMYMGEEHLFSVEQITAMLLTKLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ETAENSLKKPVTDCVISVPSFFTDAERRSVLDAAQIVGLNCLRLMNDMTAVALNYGIYKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ETAENSLKKPVTDCVISVPSFFTDAERRSVLDAAQIVGLNCLRLMNDMTAVALNYGIYKQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLPSLDEKPRIVVFVDMGHSAFQVSACAFNKGKLKVLGTAFDPFLGGKNFDEKLVEHFCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DLPSLDEKPRIVVFVDMGHSAFQVSACAFNKGKLKVLGTAFDPFLGGKNFDEKLVEHFCA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EFKTKYKLDAKSKIRALLRLYQECEKLKKLMSSNSTDLPLNIECFMNDKDVSGKMNRSQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EFKTKYKLDAKSKIRALLRLYQECEKLKKLMSSNSTDLPLNIECFMNDKDVSGKMNRSQF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EELCAELLQKIEVPLYSLLEQTHLKVEDVSAVEIVGGATRIPAVKERIAKFFGKDISTTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EELCAELLQKIEVPLYSLLEQTHLKVEDVSAVEIVGGATRIPAVKERIAKFFGKDISTTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NADEAVARGCALQCAILSPAFKVREFSVTDAVPFPISLIWNHDSEDTEGVHEVFSRNHAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NADEAVARGCALQCAILSPAFKVREFSVTDAVPFPISLIWNHDSEDTEGVHEVFSRNHAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PFSKVLTFLRRGPFELEAFYSDPQGVPYPEAKIGRFVVQNVSAQKDGEKSRVKVKVRVNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PFSKVLTFLRRGPFELEAFYSDPQGVPYPEAKIGRFVVQNVSAQKDGEKSRVKVKVRVNT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD HGIFTISTASMVEKVPTEENEMSSEADMECLNQRPPENPDTDKNVQQDNSEAGTQPQVQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 HGIFTISTASMVEKVPTEENEMSSEADMECLNQRPPENPDTDKNVQQDNSEAGTQPQVQT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DAQQTSQSPPSPELTSEENKIPDADKANEKKVDQPPEAKKPKIKVVNVELPIEANLVWQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DAQQTSQSPPSPELTSEENKIPDADKANEKKVDQPPEAKKPKIKVVNVELPIEANLVWQL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GKDLLNMYIETEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEFRDKLCGPYEKFICEQDHQNFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GKDLLNMYIETEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEFRDKLCGPYEKFICEQDHQNFL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD RLLTETEDWLYEEGEDQAKQAYVDKLEELMKIGTPVKVRFQEAEERPKMFEELGQRLQHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RLLTETEDWLYEEGEDQAKQAYVDKLEELMKIGTPVKVRFQEAEERPKMFEELGQRLQHY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD AKIAADFRNKDEKYNHIDESEMKKVEKSVNEVMEWMNNVMNAQAKKSLDQDPVVRAQEIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AKIAADFRNKDEKYNHIDESEMKKVEKSVNEVMEWMNNVMNAQAKKSLDQDPVVRAQEIK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD TKIKELNNTCEPVVTQPKPKIESPKLERTPNGPNIDKKEEDLEDKNNFGAEPPHQNGECY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 TKIKELNNTCEPVVTQPKPKIESPKLERTPNGPNIDKKEEDLEDKNNFGAEPPHQNGECY
790 800 810 820 830 840
850
pF1KSD PNEKNSVNMDLD
::::::::::::
CCDS66 PNEKNSVNMDLD
850 860
>>CCDS73559.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 (782 aa)
initn: 4227 init1: 4227 opt: 4227 Z-score: 3568.7 bits: 671.3 E(32554): 1.9e-192
Smith-Waterman score: 4742; 90.5% identity (90.5% similar) in 822 aa overlap (37-858:39-782)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD DVGSQSCYIAVARAGGIETIANEFSDRCTPSVISFGSKNRTIGVAAKNQQITHANNTVSN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GPAAHWVESFQKAREEGSGSGTWRGRWRRRSVISFGSKNRTIGVAAKNQQITHANNTVSN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FKRFHGRAFNDPFIQKEKENLSYDLVPLKNGGVGIKVMYMGEEHLFSVEQITAMLLTKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FKRFHGRAFNDPFIQKEKENLSYDLVPLKNGGVGIKVMYMGEEHLFSVEQITAMLLTKLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ETAENSLKKPVTDCVISVPSFFTDAERRSVLDAAQIVGLNCLRLMNDMTAVALNYGIYKQ
::::::::::::::::::
CCDS73 ETAENSLKKPVTDCVISV------------------------------------------
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLPSLDEKPRIVVFVDMGHSAFQVSACAFNKGKLKVLGTAFDPFLGGKNFDEKLVEHFCA
::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ------------------------------------LGTAFDPFLGGKNFDEKLVEHFCA
150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EFKTKYKLDAKSKIRALLRLYQECEKLKKLMSSNSTDLPLNIECFMNDKDVSGKMNRSQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EFKTKYKLDAKSKIRALLRLYQECEKLKKLMSSNSTDLPLNIECFMNDKDVSGKMNRSQF
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EELCAELLQKIEVPLYSLLEQTHLKVEDVSAVEIVGGATRIPAVKERIAKFFGKDISTTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EELCAELLQKIEVPLYSLLEQTHLKVEDVSAVEIVGGATRIPAVKERIAKFFGKDISTTL
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NADEAVARGCALQCAILSPAFKVREFSVTDAVPFPISLIWNHDSEDTEGVHEVFSRNHAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NADEAVARGCALQCAILSPAFKVREFSVTDAVPFPISLIWNHDSEDTEGVHEVFSRNHAA
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PFSKVLTFLRRGPFELEAFYSDPQGVPYPEAKIGRFVVQNVSAQKDGEKSRVKVKVRVNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PFSKVLTFLRRGPFELEAFYSDPQGVPYPEAKIGRFVVQNVSAQKDGEKSRVKVKVRVNT
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KSD HGIFTISTASMVEKVPTEENEMSSEADMECLNQRPPENPDTDKNVQQDNSEAGTQPQVQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HGIFTISTASMVEKVPTEENEMSSEADMECLNQRPPENPDTDKNVQQDNSEAGTQPQVQT
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DAQQTSQSPPSPELTSEENKIPDADKANEKKVDQPPEAKKPKIKVVNVELPIEANLVWQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DAQQTSQSPPSPELTSEENKIPDADKANEKKVDQPPEAKKPKIKVVNVELPIEANLVWQL
480 490 500 510 520 530
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GKDLLNMYIETEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEFRDKLCGPYEKFICEQDHQNFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GKDLLNMYIETEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEFRDKLCGPYEKFICEQDHQNFL
540 550 560 570 580 590
670 680 690 700 710 720
pF1KSD RLLTETEDWLYEEGEDQAKQAYVDKLEELMKIGTPVKVRFQEAEERPKMFEELGQRLQHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RLLTETEDWLYEEGEDQAKQAYVDKLEELMKIGTPVKVRFQEAEERPKMFEELGQRLQHY
600 610 620 630 640 650
730 740 750 760 770 780
pF1KSD AKIAADFRNKDEKYNHIDESEMKKVEKSVNEVMEWMNNVMNAQAKKSLDQDPVVRAQEIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AKIAADFRNKDEKYNHIDESEMKKVEKSVNEVMEWMNNVMNAQAKKSLDQDPVVRAQEIK
660 670 680 690 700 710
790 800 810 820 830 840
pF1KSD TKIKELNNTCEPVVTQPKPKIESPKLERTPNGPNIDKKEEDLEDKNNFGAEPPHQNGECY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TKIKELNNTCEPVVTQPKPKIESPKLERTPNGPNIDKKEEDLEDKNNFGAEPPHQNGECY
720 730 740 750 760 770
850
pF1KSD PNEKNSVNMDLD
::::::::::::
CCDS73 PNEKNSVNMDLD
780
>>CCDS66525.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 (814 aa)
initn: 3454 init1: 3454 opt: 3466 Z-score: 2927.4 bits: 552.7 E(32554): 9.8e-157
Smith-Waterman score: 5270; 94.9% identity (94.9% similar) in 858 aa overlap (1-858:1-814)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSVVGLDVGSQSCYIAVARAGGIETIANEFSDRCTPSVISFGSKNRTIGVAAKNQQITHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MSVVGLDVGSQSCYIAVARAGGIETIANEFSDRCTPSVISFGSKNRTIGVAAKNQQITHA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NNTVSNFKRFHGRAFNDPFIQKEKENLSYDLVPLKNGGVGIKVMYMGEEHLFSVEQITAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NNTVSNFKRFHGRAFNDPFIQKEKENLSYDLVPLKNGGVGIKVMYMGEEHLFSVEQITAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LLTKLKETAENSLKKPVTDCVISVPSFFTDAERRSVLDAAQIVGLNCLRLMNDMTAVALN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LLTKLKETAENSLKKPVTDCVISVPSFFTDAERRSVLDAAQIVGLNCLRLMNDMTAVALN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YGIYKQDLPSLDEKPRIVVFVDMGHSAFQVSACAFNKGKLKVLGTAFDPFLGGKNFDEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 YGIYKQDLPSLDEKPRIVVFVDMGHSAFQVSACAFNKGKLKVLGTAFDPFLGGKNFDEKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VEHFCAEFKTKYKLDAKSKIRALLRLYQECEKLKKLMSSNSTDLPLNIECFMNDKDVSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VEHFCAEFKTKYKLDAKSKIRALLRLYQECEKLKKLMSSNSTDLPLNIECFMNDKDVSGK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MNRSQFEELCAELLQKIEVPLYSLLEQTHLKVEDVSAVEIVGGATRIPAVKERIAKFFGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MNRSQFEELCAELLQKIEVPLYSLLEQTHLKVEDVSAVEIVGGATRIPAVKERIAKFFGK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DISTTLNADEAVARGCALQCAILSPAFKVREFSVTDAVPFPISLIWNHDSEDTEGVHEVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DISTTLNADEAVARGCALQCAILSPAFKVREFSVTDAVPFPISLIWNHDSEDTEGVHEVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SRNHAAPFSKVLTFLRRGPFELEAFYSDPQGVPYPEAKIGRFVVQNVSAQKDGEKSRVKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SRNHAAPFSKVLTFLRRGPFELEAFYSDPQGVPYPEAKIGRFVVQNVSAQKDGEKSRVKV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KVRVNTHGIFTISTASMVEKVPTEENEMSSEADMECLNQRPPENPDTDKNVQQDNSEAGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KVRVNTHGIFTISTASMVEKVPTEENEMSSEADMECLNQRPPENPDTD------------
490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QPQVQTDAQQTSQSPPSPELTSEENKIPDADKANEKKVDQPPEAKKPKIKVVNVELPIEA
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 --------------------------------ANEKKVDQPPEAKKPKIKVVNVELPIEA
530 540 550
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NLVWQLGKDLLNMYIETEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEFRDKLCGPYEKFICEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NLVWQLGKDLLNMYIETEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEFRDKLCGPYEKFICEQ
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670 680 690 700 710 720
pF1KSD DHQNFLRLLTETEDWLYEEGEDQAKQAYVDKLEELMKIGTPVKVRFQEAEERPKMFEELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DHQNFLRLLTETEDWLYEEGEDQAKQAYVDKLEELMKIGTPVKVRFQEAEERPKMFEELG
620 630 640 650 660 670
730 740 750 760 770 780
pF1KSD QRLQHYAKIAADFRNKDEKYNHIDESEMKKVEKSVNEVMEWMNNVMNAQAKKSLDQDPVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QRLQHYAKIAADFRNKDEKYNHIDESEMKKVEKSVNEVMEWMNNVMNAQAKKSLDQDPVV
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790 800 810 820 830 840
pF1KSD RAQEIKTKIKELNNTCEPVVTQPKPKIESPKLERTPNGPNIDKKEEDLEDKNNFGAEPPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RAQEIKTKIKELNNTCEPVVTQPKPKIESPKLERTPNGPNIDKKEEDLEDKNNFGAEPPH
740 750 760 770 780 790
850
pF1KSD QNGECYPNEKNSVNMDLD
::::::::::::::::::
CCDS66 QNGECYPNEKNSVNMDLD
800 810
>>CCDS4166.1 HSPA4 gene_id:3308|Hs108|chr5 (840 aa)
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:::::.:.: ::::.::::::::::::::.::::::. :::: :::.::.:::.: :..:
CCDS41 MSVVGIDLGFQSCYVAVARAGGIETIANEYSDRCTPACISFGPKNRSIGAAAKSQVISNA
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD NNTVSNFKRFHGRAFNDPFIQKEKENLSYDLVPLKNGGVGIKVMYMGEEHLFSVEQITAM
.:::..:::::::::.:::.. :: ::.::.: : .: .:::: :: ::. :..::.:::
CCDS41 KNTVQGFKRFHGRAFSDPFVEAEKSNLAYDIVQLPTGLTGIKVTYMEEERNFTTEQVTAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LLTKLKETAENSLKKPVTDCVISVPSFFTDAERRSVLDAAQIVGLNCLRLMNDMTAVALN
::.:::::::. :::::.:::.::: :.::::::::.::.::.:::::::::. :::::
CCDS41 LLSKLKETAESVLKKPVVDCVVSVPCFYTDAERRSVMDATQIAGLNCLRLMNETTAVALA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YGIYKQDLPSLDEKPRIVVFVDMGHSAFQVSACAFNKGKLKVLGTAFDPFLGGKNFDEKL
:::::::::.:.:::: ::::::::::.:::.::::.::::::.:::: :::..::: :
CCDS41 YGIYKQDLPALEEKPRNVVFVDMGHSAYQVSVCAFNRGKLKVLATAFDTTLGGRKFDEVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VEHFCAEFKTKYKLDAKSKIRALLRLYQECEKLKKLMSSNSTDLPLNIECFMNDKDVSGK
:.::: :: ::::: :::::::::: :::::::::::.:..::::.::::::: ::::
CCDS41 VNHFCEEFGKKYKLDIKSKIRALLRLSQECEKLKKLMSANASDLPLSIECFMNDVDVSGT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MNRSQFEELCAELLQKIEVPLYSLLEQTHLKVEDVSAVEIVGGATRIPAVKERIAKFFGK
:::..: :.: .:: ..: :: :.::::.:: ::. ::::::::::::::::.:.:::::
CCDS41 MNRGKFLEMCNDLLARVEPPLRSVLEQTKLKKEDIYAVEIVGGATRIPAVKEKISKFFGK
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pF1KSD DISTTLNADEAVARGCALQCAILSPAFKVREFSVTDAVPFPISLIWNHDSEDTEGVHEVF
..::::::::::.::::::::::::::::::::.::.::.:::: :: .:. . :::
CCDS41 ELSTTLNADEAVTRGCALQCAILSPAFKVREFSITDVVPYPISLRWNSPAEEGSSDCEVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SRNHAAPFSKVLTFLRRGPFELEAFYSDPQGVPYPEAKIGRFVVQNVSAQKDGEKSRVKV
:.:::::::::::: :. :: :::.::.:: .:::. :..: ::.:. :.:: .:.:::
CCDS41 SKNHAAPFSKVLTFYRKEPFTLEAYYSSPQDLPYPDPAIAQFSVQKVTPQSDGSSSKVKV
430 440 450 460 470 480
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pF1KSD KVRVNTHGIFTISTASMVEKVPTEENEMSSEADMECLNQRPPENPDTDKNVQQDNSEAGT
:::::.::::..:.::.:: .:::: :.: .: ....: :. :
CCDS41 KVRVNVHGIFSVSSASLVEVHKSEENEEPMETD---------QNAKEEEKMQVDQEE---
490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QPQVQTDAQQTSQSPPSPELTSEENKIPDADKANEKKVDQPPEAKKPKIKVVNVELPIEA
:.:. .: .:.: . ::: . .: ...::.::::.::: :.:. .:.::::
CCDS41 -PHVE---EQQQQTPAENKAESEEMETSQAG-SKDKKMDQPPQAKKAKVKTSTVDLPIEN
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NLVWQLGKDLLNMYIETEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEFRDKLCGPYEKFICEQ
.:.::. ...::.:::.:::::::::::::::::::::::::::.:::: : ::::. :.
CCDS41 QLLWQIDREMLNLYIENEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEMRDKLSGEYEKFVSED
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KSD DHQNFLRLLTETEDWLYEEGEDQAKQAYVDKLEELMKIGTPVKVRFQEAEERPKMFEELG
:...: : .::.::::.:::: ::.::::: :: ..: :.:.::::.:::::.:::::
CCDS41 DRNSFTLKLEDTENWLYEDGEDQPKQVYVDKLAELKNLGQPIKIRFQESEERPKLFEELG
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KSD QRLQHYAKIAADFRNKDEKYNHIDESEMKKVEKSVNEVMEWMNNVMNAQAKKSLDQDPVV
...:.: :: ..:.::...:.:.: ..: :::::.::.:::::: .: : :.:: .::::
CCDS41 KQIQQYMKIISSFKNKEDQYDHLDAADMTKVEKSTNEAMEWMNNKLNLQNKQSLTMDPVV
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830
pF1KSD RAQEIKTKIKELNNTCEPVVTQPKPKIESPKLERT---PNGPNIDKKEEDLEDKNNFGAE
...::..:::::..:: :....::::.: :: :. ::: .: . .: : .
CCDS41 KSKEIEAKIKELTSTCSPIISKPKPKVEPPKEEQKNAEQNGP-VDGQ------GDNPGPQ
770 780 790 800 810
840 850
pF1KSD PPHQNGEC-YPNE--KNSVNMDLD
.:. . :.. :. .::.:
CCDS41 AAEQGTDTAVPSDSDKKLPEMDID
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSVVGLDVGSQSCYIAVARAGGIETIANEFSDRCTPSVISFGSKNRTIGVAAKNQQITHA
:::::.:.: .:::::::.:::::::::.::::::. ::.::..:.:: :::.: .:..
CCDS37 MSVVGIDLGFLNCYIAVARSGGIETIANEYSDRCTPACISLGSRTRAIGNAAKSQIVTNV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NNTVSNFKRFHGRAFNDPFIQKEKENLSYDLVPLKNGGVGIKVMYMGEEHLFSVEQITAM
::. .::..:::.:.::..: :. : :.: . ::..:.:: :. ::. :..::.:.:
CCDS37 RNTIHGFKKLHGRSFDDPIVQTERIRLPYELQKMPNGSAGVKVRYLEEERPFAIEQVTGM
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD LLTKLKETAENSLKKPVTDCVISVPSFFTDAERRSVLDAAQIVGLNCLRLMNDMTAVALN
::.:::::.::.:::::.:::::.::::::::::::. :::..:::::::::. :::::
CCDS37 LLAKLKETSENALKKPVADCVISIPSFFTDAERRSVMAAAQVAGLNCLRLMNETTAVALA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YGIYKQDLPSLDEKPRIVVFVDMGHSAFQVSACAFNKGKLKVLGTAFDPFLGGKNFDEKL
::::::::: :::::: :::.::::::.:: .:::::::::::.:.:::.:::.:::: :
CCDS37 YGIYKQDLPPLDEKPRNVVFIDMGHSAYQVLVCAFNKGKLKVLATTFDPYLGGRNFDEAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VEHFCAEFKTKYKLDAKSKIRALLRLYQECEKLKKLMSSNSTDLPLNIECFMNDKDVSGK
:..:: :::::::...: . ::::::::::::::::::.:..:::::::::::: :::.:
CCDS37 VDYFCDEFKTKYKINVKENSRALLRLYQECEKLKKLMSANASDLPLNIECFMNDLDVSSK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MNRSQFEELCAELLQKIEVPLYSLLEQTHLKVEDVSAVEIVGGATRIPAVKERIAKFFGK
:::.:::.::: :: ..: :: ...::..:. ::.:..::::::::::::::.:.::: :
CCDS37 MNRAQFEQLCASLLARVEPPLKAVMEQANLQREDISSIEIVGGATRIPAVKEQITKFFLK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DISTTLNADEAVARGCALQCAILSPAFKVREFSVTDAVPFPISLIWNHDSEDTEGVHEVF
:::::::::::::::::::::::::::::::::.:: ::. :.: :. . :: : :::
CCDS37 DISTTLNADEAVARGCALQCAILSPAFKVREFSITDLVPYSITLRWKTSFEDGSGECEVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SRNHAAPFSKVLTFLRRGPFELEAFYSDPQGVPYPEAKIGRFVVQNVSAQKDGEKSRVKV
.:: ::::::.:: .. ::::::::.. . ::::.:.:: :..::: :.::..:.:::
CCDS37 CKNHPAPFSKVITFHKKEPFELEAFYTNLHEVPYPDARIGSFTIQNVFPQSDGDSSKVKV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KVRVNTHGIFTISTASMVEKVPTEENEMSSEADMECLNQRPPENPDTDKNVQQDNSEAGT
::::: ::::....::..:: : .. :.: :: .. :: :. ..: :. : :
CCDS37 KVRVNIHGIFSVASASVIEKQNLEGDH--SDAPMETETSFKNENKDNMDKMQVDQ-EEGH
490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QPQVQTDAQQTSQSPPSPELTSEENKIPDADKANEKKVDQPPEAKKPKIKVVNVELPIEA
: . :..: : :. : .: . .. ...: :: :.: ...:::..
CCDS37 Q---KCHAEHT----PEEEIDHTGAKTKSAVSDKQDRLNQT--LKKGKVK--SIDLPIQS
540 550 560 570 580
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pF1KSD NLVWQLGKDLLNMYIETEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEFRDKLCGPYEKFICEQ
.: :::.:::: :::.::::::::::::::::::::::::::.:::.: ::::: .
CCDS37 SLCRQLGQDLLNSYIENEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYDFRDRLGTVYEKFITPE
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KSD DHQNFLRLLTETEDWLYEEGEDQAKQAYVDKLEELMKIGTPVKVRFQEAEERPKMFEELG
: ... .: .::.::::.:::: ::.:::::.:: : : :......: ::::: ...::
CCDS37 DLSKLSAVLEDTENWLYEDGEDQPKQVYVDKLQELKKYGQPIQMKYMEHEERPKALNDLG
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KSD QRLQHYAKIAADFRNKDEKYNHIDESEMKKVEKSVNEVMEWMNNVMNAQAKKSLDQDPVV
...: :. .:::::.:.:.: .::.:::: ....: :.:. :::: : :: :::::
CCDS37 KKIQLVMKVIEAYRNKDERYDHLDPTEMEKVEKCISDAMSWLNSKMNAQNKLSLTQDPVV
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830
pF1KSD RAQEIKTKIKELNNTCEPVVTQPKPKIE----SPKLERTPNGPNIDKKE--EDLEDKNNF
...:: .: :::.: :.:.. .:::: : .:: . ::: .: . : :...
CCDS37 KVSEIVAKSKELDNFCNPIIYKPKPKAEVPEDKPKANSEHNGP-MDGQSGTETKSDSTKD
770 780 790 800 810 820
840 850
pF1KSD GAEPPHQNGECYPNEKNSVNMDLD
... ...::
CCDS37 SSQHTKSSGEMEVD
830
>>CCDS82953.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs108|chr4 (813 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD GSQSCYIAVARAGGIETIANEFSDRCTPSVISFGSKNRTIGVAAKNQQITHANNTVSNFK
::.::..:.:: :::.: .:.. ::. .::
CCDS82 MKPILLFMERACISLGSRTRAIGNAAKSQIVTNVRNTIHGFK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RFHGRAFNDPFIQKEKENLSYDLVPLKNGGVGIKVMYMGEEHLFSVEQITAMLLTKLKET
..:::.:.::..: :. : :.: . ::..:.:: :. ::. :..::.:.:::.:::::
CCDS82 KLHGRSFDDPIVQTERIRLPYELQKMPNGSAGVKVRYLEEERPFAIEQVTGMLLAKLKET
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AENSLKKPVTDCVISVPSFFTDAERRSVLDAAQIVGLNCLRLMNDMTAVALNYGIYKQDL
.::.:::::.:::::.::::::::::::. :::..:::::::::. ::::: ::::::::
CCDS82 SENALKKPVADCVISIPSFFTDAERRSVMAAAQVAGLNCLRLMNETTAVALAYGIYKQDL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PSLDEKPRIVVFVDMGHSAFQVSACAFNKGKLKVLGTAFDPFLGGKNFDEKLVEHFCAEF
: :::::: :::.::::::.:: .:::::::::::.:.:::.:::.:::: ::..:: ::
CCDS82 PPLDEKPRNVVFIDMGHSAYQVLVCAFNKGKLKVLATTFDPYLGGRNFDEALVDYFCDEF
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KTKYKLDAKSKIRALLRLYQECEKLKKLMSSNSTDLPLNIECFMNDKDVSGKMNRSQFEE
:::::...: . ::::::::::::::::::.:..:::::::::::: :::.::::.:::.
CCDS82 KTKYKINVKENSRALLRLYQECEKLKKLMSANASDLPLNIECFMNDLDVSSKMNRAQFEQ
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LCAELLQKIEVPLYSLLEQTHLKVEDVSAVEIVGGATRIPAVKERIAKFFGKDISTTLNA
::: :: ..: :: ...::..:. ::.:..::::::::::::::.:.::: :::::::::
CCDS82 LCASLLARVEPPLKAVMEQANLQREDISSIEIVGGATRIPAVKEQITKFFLKDISTTLNA
290 300 310 320 330 340
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pF1KSD DEAVARGCALQCAILSPAFKVREFSVTDAVPFPISLIWNHDSEDTEGVHEVFSRNHAAPF
:::::::::::::::::::::::::.:: ::. :.: :. . :: : ::: .:: :::
CCDS82 DEAVARGCALQCAILSPAFKVREFSITDLVPYSITLRWKTSFEDGSGECEVFCKNHPAPF
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SKVLTFLRRGPFELEAFYSDPQGVPYPEAKIGRFVVQNVSAQKDGEKSRVKVKVRVNTHG
:::.:: .. ::::::::.. . ::::.:.:: :..::: :.::..:.:::::::: ::
CCDS82 SKVITFHKKEPFELEAFYTNLHEVPYPDARIGSFTIQNVFPQSDGDSSKVKVKVRVNIHG
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KSD IFTISTASMVEKVPTEENEMSSEADMECLNQRPPENPDTDKNVQQDNSEAGTQPQVQTDA
::....::..:: : .. :.: :: .. :: :. ..: :. : : : . :
CCDS82 IFSVASASVIEKQNLEGDH--SDAPMETETSFKNENKDNMDKMQVDQEE-GHQ---KCHA
470 480 490 500 510
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pF1KSD QQTSQSPPSPELTSEENKIPDADKANEKKVDQPPEAKKPKIKVVNVELPIEANLVWQLGK
..: : :. : .: . .. ...: :: :.: ...:::...: :::.
CCDS82 EHT----PEEEIDHTGAKTKSAVSDKQDRLNQT--LKKGKVK--SIDLPIQSSLCRQLGQ
520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KSD DLLNMYIETEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEFRDKLCGPYEKFICEQDHQNFLRL
:::: :::.::::::::::::::::::::::::::.:::.: ::::: .: ... .
CCDS82 DLLNSYIENEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYDFRDRLGTVYEKFITPEDLSKLSAV
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LTETEDWLYEEGEDQAKQAYVDKLEELMKIGTPVKVRFQEAEERPKMFEELGQRLQHYAK
: .::.::::.:::: ::.:::::.:: : : :......: ::::: ...::...: :
CCDS82 LEDTENWLYEDGEDQPKQVYVDKLQELKKYGQPIQMKYMEHEERPKALNDLGKKIQLVMK
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KSD IAADFRNKDEKYNHIDESEMKKVEKSVNEVMEWMNNVMNAQAKKSLDQDPVVRAQEIKTK
. .:::::.:.:.: .::.:::: ....: :.:. :::: : :: :::::...:: .:
CCDS82 VIEAYRNKDERYDHLDPTEMEKVEKCISDAMSWLNSKMNAQNKLSLTQDPVVKVSEIVAK
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KSD IKELNNTCEPVVTQPKPKIE----SPKLERTPNGPNIDKKE--EDLEDKNNFGAEPPHQN
:::.: :.:.. .:::: : .:: . ::: .: . : :... ... ...
CCDS82 SKELDNFCNPIIYKPKPKAEVPEDKPKANSEHNGP-MDGQSGTETKSDSTKDSSQHTKSS
750 760 770 780 790 800
850
pF1KSD GECYPNEKNSVNMDLD
::
CCDS82 GEMEVD
810
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