Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0154
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0154, 690 aa
  1>>>pF1KSDA0154 690 - 690 aa - 690 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7192+/-0.000948; mu= -2.7570+/- 0.057
 mean_var=320.1043+/-67.038, 0's: 0 Z-trim(115.6): 29  B-trim: 414 in 1/53
 Lambda= 0.071685
 statistics sampled from 16163 (16186) to 16163 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.784), E-opt: 0.2 (0.497), width:  16
 Scan time:  3.860

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11716.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17         ( 690) 4563 485.6 9.9e-137
CCDS54164.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17         ( 651) 4110 438.8 1.2e-122
CCDS11717.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17         ( 723) 4110 438.8 1.3e-122
CCDS58597.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17         ( 592) 3739 400.4  4e-111
CCDS10611.1 GGA2 gene_id:23062|Hs108|chr16         ( 613)  769 93.2 1.2e-18
CCDS54526.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22         ( 566)  742 90.4 7.7e-18
CCDS13951.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22         ( 639)  742 90.5 8.5e-18
CCDS33643.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22         ( 552)  737 89.9 1.1e-17


>>CCDS11716.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17              (690 aa)
 initn: 4563 init1: 4563 opt: 4563  Z-score: 2568.2  bits: 485.6 E(32554): 9.9e-137
Smith-Waterman score: 4563; 100.0% identity (100.0% similar) in 690 aa overlap (1-690:1-690)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQEW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQEW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EALQALTYLGDRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EALQALTYLGDRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD RLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRELMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRELMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDND
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD NSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD TTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD LLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSAL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD HHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD PKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD TAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690
pF1KSD YKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
              670       680       690

>>CCDS54164.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17              (651 aa)
 initn: 4110 init1: 4110 opt: 4110  Z-score: 2315.4  bits: 438.8 E(32554): 1.2e-122
Smith-Waterman score: 4110; 100.0% identity (100.0% similar) in 623 aa overlap (68-690:29-651)

        40        50        60        70        80        90       
pF1KSD KELEGPQIAVRLLAHKIQSPQEWEALQALTYLGDRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54   MKNCGRRFHNEVGKFRFLNELIKVVSPKYLGDRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAK
                 10        20        30        40        50        

       100       110       120       130       140       150       
pF1KSD IKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDL
       60        70        80        90       100       110        

       160       170       180       190       200       210       
pF1KSD QEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRELMKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRELMKE
      120       130       140       150       160       170        

       220       230       240       250       260       270       
pF1KSD LFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLT
      180       190       200       210       220       230        

       280       290       300       310       320       330       
pF1KSD LPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELDTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELDTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRS
      240       250       260       270       280       290        

       340       350       360       370       380       390       
pF1KSD SSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFF
      300       310       320       330       340       350        

       400       410       420       430       440       450       
pF1KSD SPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAP
      360       370       380       390       400       410        

       460       470       480       490       500       510       
pF1KSD ALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPL
      420       430       440       450       460       470        

       520       530       540       550       560       570       
pF1KSD LPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRIL
      480       490       500       510       520       530        

       580       590       600       610       620       630       
pF1KSD FHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPI
      540       550       560       570       580       590        

       640       650       660       670       680       690
pF1KSD QPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
      600       610       620       630       640       650 

>>CCDS11717.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17              (723 aa)
 initn: 4110 init1: 4110 opt: 4110  Z-score: 2314.7  bits: 438.8 E(32554): 1.3e-122
Smith-Waterman score: 4480; 95.4% identity (95.4% similar) in 722 aa overlap (2-690:2-723)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQEW
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQEW
               10        20        30        40        50        60

                                                70        80       
pF1KSD EALQALT---------------------------------YLGDRVSEKVKTKVIELLYS
       :::::::                                 ::::::::::::::::::::
CCDS11 EALQALTVLEACMKNCGRRFHNEVGKFRFLNELIKVVSPKYLGDRVSEKVKTKVIELLYS
               70        80        90       100       110       120

        90       100       110       120       130       140       
pF1KSD WTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAK
              130       140       150       160       170       180

       150       160       170       180       190       200       
pF1KSD LLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDS
              190       200       210       220       230       240

       210       220       230       240       250       260       
pF1KSD SDGDRELMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SDGDRELMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQ
              250       260       270       280       290       300

       270       280       290       300       310       320       
pF1KSD VINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELDTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELDTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPP
              310       320       330       340       350       360

       330       340       350       360       370       380       
pF1KSD QASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLL
              370       380       390       400       410       420

       390       400       410       420       430       440       
pF1KSD QREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAG
              430       440       450       460       470       480

       450       460       470       480       490       500       
pF1KSD SSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPL
              490       500       510       520       530       540

       510       520       530       540       550       560       
pF1KSD IPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVT
              550       560       570       580       590       600

       570       580       590       600       610       620       
pF1KSD AYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPS
              610       620       630       640       650       660

       630       640       650       660       670       680       
pF1KSD GTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQW
              670       680       690       700       710       720

       690
pF1KSD GNL
       :::
CCDS11 GNL
          

>>CCDS58597.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17              (592 aa)
 initn: 3817 init1: 3739 opt: 3739  Z-score: 2108.6  bits: 400.4 E(32554): 4e-111
Smith-Waterman score: 3739; 99.6% identity (100.0% similar) in 568 aa overlap (90-657:1-568)

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD WEALQALTYLGDRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPV
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58                               MALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPV
                                             10        20        30

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD DRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVT
               40        50        60        70        80        90

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD KRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRELMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRELMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDN
              100       110       120       130       140       150

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD DNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAEL
              160       170       180       190       200       210

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD DTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDE
              220       230       240       250       260       270

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD ELLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAP
              280       290       300       310       320       330

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD SSSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SSSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSA
              340       350       360       370       380       390

     480       490       500       510       520       530         
pF1KSD LHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGS
              400       410       420       430       440       450

     540       550       560       570       580       590         
pF1KSD PPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSML
              460       470       480       490       500       510

     600       610       620       630       640       650         
pF1KSD NTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:  
CCDS58 NTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKKQVLS
              520       530       540       550       560       570

     660       670       680       690
pF1KSD RYKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
                                      
CCDS58 FLGKACLQPWGQAILLTTSCLA         
              580       590           

>>CCDS10611.1 GGA2 gene_id:23062|Hs108|chr16              (613 aa)
 initn: 1200 init1: 664 opt: 769  Z-score: 448.3  bits: 93.2 E(32554): 1.2e-18
Smith-Waterman score: 1275; 37.8% identity (58.0% similar) in 722 aa overlap (8-688:25-611)

                                10        20        30        40   
pF1KSD                  MAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGP
                               ::: ::::::.::  ..::  : .::.:.: . .::
CCDS10 MAATAVAAAVAGTESAQGPPGPAASLELWLNKATDPSMSEQDWSAIQNFCEQVNTDPNGP
               10        20        30        40        50        60

            50        60                                         70
pF1KSD QIAVRLLAHKIQSPQEWEALQALT---------------------------------YLG
         :  ::::::::::: ::: :::                                 :::
CCDS10 THAPWLLAHKIQSPQEKEALYALTVLEMCMNHCGEKFHSEVAKFRFLNELIKVLSPKYLG
               70        80        90       100       110       120

               80        90       100       110       120       130
pF1KSD DRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPR
       . .. ::: .:::.:.:::. .::. ::.:::.:::.:::...:: .:::. : : : : 
CCDS10 SWATGKVKGRVIEILFSWTVWFPEDIKIRDAYQMLKKQGIIKQDPKLPVDKIL-PPPSPW
              130       140       150       160       170          

               140       150       160       170       180         
pF1KSD PKNPVFD-DEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVN
       ::. .:: ::::::::..::::..:.::: ::.:::..:::.. . .::.::. ..::: 
CCDS10 PKSSIFDADEEKSKLLTRLLKSNHPEDLQAANRLIKNLVKEEQEKSEKVSKRVSAVEEVR
     180       190       200       210       220       230         

     190       200       210       220       230       240         
pF1KSD NNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRELMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQA
       ..:..:.:::  : .  ..  :.: .. ....::. : :::.:::.: :.:..:..::::
CCDS10 SHVKVLQEMLSMYRRPGQAPPDQEALQVVYERCEKLRPTLFRLASDTTDDDDALAEILQA
     240       250       260       270       280       290         

     250       260       270       280             290       300   
pF1KSD SDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDS------EGNSQCSNQGTLIDLAELDTTN
       .: :.. .  :: ..::.:  :. .: .: :       .. . : .   :::: :.:   
CCDS10 NDLLTQGVLLYKQVMEGRVTFGNRVTSSLGDIPVSRVFQNPAGCMKTCPLIDL-EVD---
     300       310       320       330       340       350         

           310       320       330       340       350       360   
pF1KSD SLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLC
                                 .:: .        .:. ::        : ..:  
CCDS10 --------------------------NGPAQM-------GTVVPS-------LLHQDLAA
                                   360                     370     

           370       380       390       400       410       420   
pF1KSD LGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSS
       ::..: ::       .:  .                  :   :        .   ::::.
CCDS10 LGISD-AP------VTGMVS------------------GQNCCE-------EKRNPSSST
         380                                390              400   

           430       440       450        460       470       480  
pF1KSD SQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVA-PALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHH
           ::         ..:  :::  .:..   : ::  :                     
CCDS10 ----LPG--------GGVQNPSADRNLLDLLSAQPAPCP---------------------
                       410       420       430                     

            490       500       510       520       530       540  
pF1KSD LDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPK
       :. ..:              ..   .:  : . :   . .:: .:     : .::..:  
CCDS10 LNYVSQ-------------KSVPKEVPPGTKSSPGWSWEAGPLAP-----SPSSQNTP--
                           440       450       460            470  

            550       560       570       580       590       600  
pF1KSD GPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTA
            ::.. :::::.::::  :. .::.::::::.::..   ::.:.: :....:..::
CCDS10 -----LAQVFVPLESVKPSSLPPLIVYDRNGFRILLHFSQTGAPGHPEVQVLLLTMMSTA
                   480       490       500       510       520     

            610       620       630       640       650       660  
pF1KSD PLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYK
       : :: .:..:.::::::.::::: :...:  :::..:::.:.:..:: :: :: .:::::
CCDS10 PQPVWDIMFQVAVPKSMRVKLQPASSSKLPAFSPLMPPAVISQMLLLDNPHKEPIRLRYK
         530       540       550       560       570       580     

            670       680       690
pF1KSD LTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
       :::  : :  .::::: .:: .   :  
CCDS10 LTFNQGGQPFSEVGEVKDFPDLAVLGAA
         590       600       610   

>>CCDS54526.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22              (566 aa)
 initn: 1334 init1: 715 opt: 742  Z-score: 433.7  bits: 90.4 E(32554): 7.7e-18
Smith-Waterman score: 1617; 48.1% identity (69.4% similar) in 624 aa overlap (68-690:29-566)

        40        50        60        70        80        90       
pF1KSD KELEGPQIAVRLLAHKIQSPQEWEALQALTYLGDRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAK
                                     :::.:.:::::.:..:::::::..::::.:
CCDS54   MKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYLGSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVK
                 10        20        30        40        50        

       100       110       120       130       140       150       
pF1KSD IKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDL
       : .::.:::.::::.::: .: : : .: ::::::: .:.::::::.::.::::..:.::
CCDS54 IAEAYQMLKKQGIVKSDPKLP-DDTTFPLPPPRPKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDL
       60        70         80        90       100       110       

       160       170       180       190       200       210       
pF1KSD QEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRE-LMK
       . :::::: ::.::. :..:..::....:::::::.::.::.. .::  .. :. : :::
CCDS54 RAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNNNVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMK
       120       130       140       150       160       170       

        220       230       240       250       260       270      
pF1KSD ELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATL
       ::...::  : :::.:::.:::::..:..::::.:::..::: :: ...:. .::.... 
CCDS54 ELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQANDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAG
       180       190       200       210       220       230       

        280       290       300       310       320       330      
pF1KSD TLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELDTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSR
       ..: :         ..:.::. ::        : :: :      : .:          .:
CCDS54 SIPGST--------SALLDLSGLD--------LPPAGTT----YPAMP----------TR
       240               250               260                     

        340       350       360       370       380       390      
pF1KSD SSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDF
        . ::    .: . : ..: ::.::. :::.::.:  :   :  .. :. .:        
CCDS54 PGEQA----SPEQPSASVSLLDDELMSLGLSDPTP--PSGPSLDGTGWNSFQ--------
       270           280       290         300       310           

        400       410       420       430       440       450      
pF1KSD FSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVA
                  .:::   .: ::. .  :::     : :.  .:.:: :. ..:   :  
CCDS54 -----------SSDA--TEPPAPALA--QAPSMESRP-PA-QTSLPASSGLDDLDLLG--
                        320         330         340       350      

        460       470       480       490       500       510      
pF1KSD PALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARP
        .:  .  :  :  . .   ..      .: .: ....  :.  . .:: :. :..:   
CCDS54 KTLLQQSLP--PESQQVRWEKQQPTPRLTLRDLQNKSSSCSSPSSSATS-LLHTVSPE--
          360         370       380       390       400            

        520       530       540       550       560       570      
pF1KSD LLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRI
              :  :  ::.       :    ::::::: :::::::::. ::::.::..::::
CCDS54 -------PPRPPQQPV-------PT---ELSLASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGFRI
            410              420          430       440       450  

        580       590       600       610       620       630      
pF1KSD LFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSP
       :::::..  ::: ::::::::::.::: :...::.:.:::: :::::::::::::  :.:
CCDS54 LFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAFNP
            460       470       480       490       500       510  

        640       650       660       670       680       690
pF1KSD IQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
       :  :.:::::.::::: ::::::::::::..:.:  .:.:.:::::: : ::.:
CCDS54 IVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
            520       530       540       550       560      

>>CCDS13951.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22              (639 aa)
 initn: 1437 init1: 715 opt: 742  Z-score: 433.0  bits: 90.5 E(32554): 8.5e-18
Smith-Waterman score: 1838; 47.4% identity (67.8% similar) in 720 aa overlap (5-690:6-639)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD  MAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQE
            : :.::. .:.:::: :.. ::  : :::.:.:...::: .:.::::::::::::
CCDS13 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGPPLATRLLAHKIQSPQE
               10        20        30        40        50        60

      60                                         70        80      
pF1KSD WEALQALT---------------------------------YLGDRVSEKVKTKVIELLY
       :::.::::                                 :::.:.:::::.:..::::
CCDS13 WEAIQALTVLETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYLGSRTSEKVKNKILELLY
               70        80        90       100       110       120

         90       100       110       120       130       140      
pF1KSD SWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLA
       :::..::::.:: .::.:::.::::.::: .: : : .: ::::::: .:.::::::.::
CCDS13 SWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLP-DDTTFPLPPPRPKNVIFEDEEKSKMLA
              130       140       150        160       170         

        150       160       170       180       190       200      
pF1KSD KLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQED
       .::::..:.::. :::::: ::.::. :..:..::....:::::::.::.::.. .::  
CCDS13 RLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNNNVKLLTEMVMSHSQGG
     180       190       200       210       220       230         

        210        220       230       240       250       260     
pF1KSD SSDGDRE-LMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIE
       .. :. : :::::...::  : :::.:::.:::::..:..::::.:::..::: :: ...
CCDS13 AAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQANDNLTQVINLYKQLVR
     240       250       260       270       280       290         

         270       280       290       300       310       320     
pF1KSD GQVINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELDTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPP
       :. .::.... ..: : .        .:.::. ::        : :: :      : .: 
CCDS13 GEEVNGDATAGSIPGSTS--------ALLDLSGLD--------LPPAGTT----YPAMP-
     300       310               320               330             

         330       340       350       360       370       380     
pF1KSD PPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWH
                .: . ::    .: . : ..: ::.::. :::.::.:  :   :  .. :.
CCDS13 ---------TRPGEQA----SPEQPSASVSLLDDELMSLGLSDPTP--PSGPSLDGTGWN
               340           350       360       370         380   

         390       400       410       420       430       440     
pF1KSD LLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPS
        .:                   .:::   .: ::.   .:::     : :.  .:.:: :
CCDS13 SFQ-------------------SSDA--TEPPAPAL--AQAPSMESRP-PA-QTSLPASS
                              390           400        410         

         450       460       470       480       490       500     
pF1KSD AGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTS
       . ..:   :   .:  .  :  :  . .   ..      .: .: ....  :.  . .::
CCDS13 GLDDLDLLG--KTLLQQSLP--PESQQVRWEKQQPTPRLTLRDLQNKSSSCSSPSSSATS
      420         430         440       450       460       470    

         510       520       530       540       550       560     
pF1KSD PLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALP
        :. :..:          :  :  ::.       :    ::::::: :::::::::. ::
CCDS13 -LLHTVSPE---------PPRPPQQPV-------PT---ELSLASITVPLESIKPSNILP
           480                490                 500       510    

         570       580       590       600       610       620     
pF1KSD VTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQP
       ::.::..:::::::::..  ::: ::::::::::.::: :...::.:.:::: :::::::
CCDS13 VTVYDQHGFRILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQP
          520       530       540       550       560       570    

         630       640       650       660       670       680     
pF1KSD PSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVE
       ::::::  :.::  :.:::::.::::: ::::::::::::..:.:  .:.:.:::::: :
CCDS13 PSGTELPAFNPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPE
          580       590       600       610       620       630    

         690
pF1KSD QWGNL
        ::.:
CCDS13 TWGSL
            

>>CCDS33643.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22              (552 aa)
 initn: 1446 init1: 715 opt: 737  Z-score: 431.1  bits: 89.9 E(32554): 1.1e-17
Smith-Waterman score: 1493; 44.0% identity (59.6% similar) in 720 aa overlap (5-690:6-552)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD  MAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQE
            : :.::. .:.:::: :.. ::  : :::.:.:...::: .:.::::::::::::
CCDS33 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGPPLATRLLAHKIQSPQE
               10        20        30        40        50        60

      60                                         70        80      
pF1KSD WEALQALT---------------------------------YLGDRVSEKVKTKVIELLY
       :::.::::                                 :::.:.:::::.:..::::
CCDS33 WEAIQALTVLETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYLGSRTSEKVKNKILELLY
               70        80        90       100       110       120

         90       100       110       120       130       140      
pF1KSD SWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLA
       :::..::::.:: .::.:::.::::.::: .: : : .: ::::::: .:.::::::.::
CCDS33 SWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLP-DDTTFPLPPPRPKNVIFEDEEKSKMLA
              130       140       150        160       170         

        150       160       170       180       190       200      
pF1KSD KLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQED
       .::::..:.::. :::::: ::.::. :..:..::....:::::::.::.::.. .::  
CCDS33 RLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNNNVKLLTEMVMSHSQGG
     180       190       200       210       220       230         

        210        220       230       240       250       260     
pF1KSD SSDGDRE-LMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIE
       .. :. : :::::...::  : :::.:::.:::::..::     ::          :   
CCDS33 AAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALG----LSD---------PTPPS
     240       250       260       270           280               

         270       280       290       300       310       320     
pF1KSD GQVINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELDTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPP
       :            :. .:..  : :..       :.:.  . .:: ::.  :       :
CCDS33 G------------PSLDGTGWNSFQSS-------DATEPPAPALAQAPSMESR------P
                    290       300              310       320       

         330       340       350       360       370       380     
pF1KSD PPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWH
       : :.: :               ::  . :. : . ::  .:       :: ::  . .: 
CCDS33 PAQTSLPA--------------SSGLDDLDLLGKTLLQQSL-------PP-ESQ-QVRW-
                           330       340              350          

         390       400       410       420       430       440     
pF1KSD LLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPS
         ...:       : :  .     :   :: .. : ::                  :. :
CCDS33 --EKQQ-------PTPRLT---LRD---LQNKSSSCSS------------------PSSS
         360                 370          380                      

         450       460       470       480       490       500     
pF1KSD AGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTS
       :                              .: ::                     :.:
CCDS33 A------------------------------TSLLH---------------------TVS
                                        390                        

         510       520       530       540       550       560     
pF1KSD PLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALP
       :      : ::       : .:.           :    ::::::: :::::::::. ::
CCDS33 P-----EPPRP-------PQQPV-----------PT---ELSLASITVPLESIKPSNILP
                       400                     410       420       

         570       580       590       600       610       620     
pF1KSD VTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQP
       ::.::..:::::::::..  ::: ::::::::::.::: :...::.:.:::: :::::::
CCDS33 VTVYDQHGFRILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQP
       430       440       450       460       470       480       

         630       640       650       660       670       680     
pF1KSD PSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVE
       ::::::  :.::  :.:::::.::::: ::::::::::::..:.:  .:.:.:::::: :
CCDS33 PSGTELPAFNPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPE
       490       500       510       520       530       540       

         690
pF1KSD QWGNL
        ::.:
CCDS33 TWGSL
       550  




690 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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