Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0139
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0139, 1382 aa
  1>>>pF1KSDA0139 1382 - 1382 aa - 1382 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.3232+/-0.000625; mu= -17.6128+/- 0.039
 mean_var=782.4102+/-163.830, 0's: 0 Z-trim(118.8): 183  B-trim: 297 in 1/54
 Lambda= 0.045852
 statistics sampled from 31861 (32046) to 31861 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.376), width:  16
 Scan time: 12.510

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_003741 (OMIM: 602039) eukaryotic translation in (1382) 9408 639.8 4.2e-182
NP_009044 (OMIM: 190370) trichohyalin [Homo sapien (1943)  642 60.1 1.9e-07
NP_055885 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domain-c (1564)  531 52.6 2.7e-05
XP_005266369 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1564)  531 52.6 2.7e-05
NP_001317496 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1668)  531 52.6 2.8e-05
NP_001317495 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1668)  531 52.6 2.8e-05
NP_001317494 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1668)  531 52.6 2.8e-05
XP_005266367 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669)  531 52.6 2.8e-05
XP_016875969 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669)  531 52.6 2.8e-05
XP_016875968 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669)  531 52.6 2.8e-05
NP_001070256 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1669)  531 52.6 2.8e-05
XP_016875966 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669)  531 52.6 2.8e-05
XP_016875967 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669)  531 52.6 2.8e-05
NP_001317493 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1669)  531 52.6 2.8e-05
XP_005266364 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1696)  518 51.8 5.1e-05
XP_005266360 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1697)  518 51.8 5.1e-05
XP_016875964 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1697)  518 51.8 5.1e-05
XP_005266361 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1697)  518 51.8 5.1e-05
XP_005266358 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1697)  518 51.8 5.1e-05
XP_005266363 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1697)  518 51.8 5.1e-05
XP_016875965 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1697)  518 51.8 5.1e-05
XP_005266359 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1697)  518 51.8 5.1e-05
XP_005266362 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1697)  518 51.8 5.1e-05


>>NP_003741 (OMIM: 602039) eukaryotic translation initia  (1382 aa)
 initn: 9408 init1: 9408 opt: 9408  Z-score: 3390.3  bits: 639.8 E(85289): 4.2e-182
Smith-Waterman score: 9408; 100.0% identity (100.0% similar) in 1382 aa overlap (1-1382:1-1382)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MPAYFQRPENALKRANEFLEVGKKQPALDVLYDVMKSKKHRTWQKIHEPIMLKYLELCVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MPAYFQRPENALKRANEFLEVGKKQPALDVLYDVMKSKKHRTWQKIHEPIMLKYLELCVD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LRKSHLAKEGLYQYKNICQQVNIKSLEDVVRAYLKMAEEKTEAAKEESQQMVLDIEDLDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LRKSHLAKEGLYQYKNICQQVNIKSLEDVVRAYLKMAEEKTEAAKEESQQMVLDIEDLDN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD IQTPESVLLSAVSGEDTQDRTDRLLLTPWVKFLWESYRQCLDLLRNNSRVERLYHDIAQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IQTPESVLLSAVSGEDTQDRTDRLLLTPWVKFLWESYRQCLDLLRNNSRVERLYHDIAQQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD AFKFCLQYTRKAEFRKLCDNLRMHLSQIQRHHNQSTAINLNNPESQSMHLETRLVQLDSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AFKFCLQYTRKAEFRKLCDNLRMHLSQIQRHHNQSTAINLNNPESQSMHLETRLVQLDSA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD ISMELWQEAFKAVEDIHGLFSLSKKPPKPQLMANYYNKVSTVFWKSGNALFHASTLHRLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ISMELWQEAFKAVEDIHGLFSLSKKPPKPQLMANYYNKVSTVFWKSGNALFHASTLHRLY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD HLSREMRKNLTQDEMQRMSTRVLLATLSIPITPERTDIARLLDMDGIIVEKQRRLATLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 HLSREMRKNLTQDEMQRMSTRVLLATLSIPITPERTDIARLLDMDGIIVEKQRRLATLLG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD LQAPPTRIGLINDMVRFNVLQYVVPEVKDLYNWLEVEFNPLKLCERVTKVLNWVREQPEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LQAPPTRIGLINDMVRFNVLQYVVPEVKDLYNWLEVEFNPLKLCERVTKVLNWVREQPEK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD EPELQQYVPQLQNNTILRLLQQVSQIYQSIEFSRLTSLVPFVDAFQLERAIVDAARHCDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EPELQQYVPQLQNNTILRLLQQVSQIYQSIEFSRLTSLVPFVDAFQLERAIVDAARHCDL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD QVRIDHTSRTLSFGSDLNYATREDAPIGPHLQSMPSEQIRNQLTAMSSVLAKALEVIKPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QVRIDHTSRTLSFGSDLNYATREDAPIGPHLQSMPSEQIRNQLTAMSSVLAKALEVIKPA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD HILQEKEEQHQLAVTAYLKNSRKEHQRILARRQTIEERKERLESLNIQREKEELEQREAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 HILQEKEEQHQLAVTAYLKNSRKEHQRILARRQTIEERKERLESLNIQREKEELEQREAE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD LQKVRKAEEERLRQEAKEREKERILQEHEQIKKKTVRERLEQIKKTELGAKAFKDIDIED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LQKVRKAEEERLRQEAKEREKERILQEHEQIKKKTVRERLEQIKKTELGAKAFKDIDIED
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD LEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEIPLIKSAYEEQRIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEIPLIKSAYEEQRIK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD DMDLWEQQEEERITTMQLEREKALEHKNRMSRMLEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLKQFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DMDLWEQQEEERITTMQLEREKALEHKNRMSRMLEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLKQFE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD ERLAEERHNRLEERKRQRKEERRITYYREKEEEEQRRAEEQMLKEREERERAERAKREEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ERLAEERHNRLEERKRQRKEERRITYYREKEEEEQRRAEEQMLKEREERERAERAKREEE
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD LREYQERVKKLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGDSSLSRKDSRWGDRDSEGTWR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LREYQERVKKLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGDSSLSRKDSRWGDRDSEGTWR
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD KGPEADSEWRRGPPEKEWRRGEGRDEDRSHRRDEERPRRLGDDEDREPSLRPDDDRVPRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KGPEADSEWRRGPPEKEWRRGEGRDEDRSHRRDEERPRRLGDDEDREPSLRPDDDRVPRR
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD GMDDDRGPRRGPEEDRFSRRGADDDRPSWRNTDDDRPPRRIADEDRGNWRHADDDRPPRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GMDDDRGPRRGPEEDRFSRRGADDDRPSWRNTDDDRPPRRIADEDRGNWRHADDDRPPRR
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD GLDEDRGSWRTADEDRGPRRGMDDDRGPRRGGADDERSSWRNADDDRGPRRGLDDDRGPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GLDEDRGSWRTADEDRGPRRGMDDDRGPRRGGADDERSSWRNADDDRGPRRGLDDDRGPR
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD RGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGLDDDRGPWRNADDDRIPRRGAEDDRGPW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGLDDDRGPWRNADDDRIPRRGAEDDRGPW
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD RNMDDDRLSRRADDDRFPRRGDDSRPGPWRPLVKPGGWREKEKAREESWGPPRESRPSEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RNMDDDRLSRRADDDRFPRRGDDSRPGPWRPLVKPGGWREKEKAREESWGPPRESRPSEE
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD REWDREKERDRDNQDREENDKDPERERDRERDVDREDRFRRPRDEGGWRRGPAEESSSWR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 REWDREKERDRDNQDREENDKDPERERDRERDVDREDRFRRPRDEGGWRRGPAEESSSWR
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD DSSRRDDRDRDDRRRERDDRRDLRERRDLRDDRDRRGPPLRSEREEVSSWRRADDRKDDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DSSRRDDRDRDDRRRERDDRRDLRERRDLRDDRDRRGPPLRSEREEVSSWRRADDRKDDR
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD VEERDPPRRVPPPALSRDRERDRDREREGEKEKASWRAEKDRESLRRTKNETDEDGWTTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VEERDPPRRVPPPALSRDRERDRDREREGEKEKASWRAEKDRESLRRTKNETDEDGWTTV
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

         
pF1KSD RR
       ::
NP_003 RR
         

>>NP_009044 (OMIM: 190370) trichohyalin [Homo sapiens]    (1943 aa)
 initn: 288 init1: 213 opt: 642  Z-score: 254.7  bits: 60.1 E(85289): 1.9e-07
Smith-Waterman score: 698; 23.8% identity (60.1% similar) in 843 aa overlap (538-1353:255-1054)

       510       520       530       540       550       560       
pF1KSD GPHLQSMPSEQIRNQLTAMSSVLAKALEVIKPAHILQEKEEQHQLAVTAYLKNSRK-EHQ
                                     :  . :::.: :.:  .    .. :: :.:
NP_009 EKQQQRRERQDRVFQEEEEKEWRKRETVLRKEEEKLQEEEPQRQRELQEEEEQLRKLERQ
          230       240       250       260       270       280    

        570       580       590       600       610       620      
pF1KSD RILARRQTIEERKERLESLNIQREKEELEQREAELQKVRKAEEERLRQEAKEREKERILQ
       ..  .::  :....::.  .  :.:.: :.::   :. :. ..:: :.. .::..... .
NP_009 ELRRERQEEEQQQQRLRREQQLRRKQEEERREQ--QEERREQQER-REQQEERREQQLRR
          290       300       310         320        330       340 

        630       640       650       660       670       680      
pF1KSD EHEQIKKKTVRERLEQIKKTELGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQE
       :.:. ... .:.. :. .. .   .  ..   :.  . . ..   .:... .. ..: : 
NP_009 EQEERREQQLRREQEEERREQQLRREQEEERREQQLRREQQLRREQQLRREQQLRREQQL
             350       360       370       380       390       400 

        690       700       710       720       730       740      
pF1KSD RLKNQEKKIDYFERAKRLEEIPLIKSAYEEQRIKDMDLWEQQEEERITTMQLEREKALEH
       : ..: .. . ..: ..:..   ..   ::.: ...   ....:.:.   : ::.  :..
NP_009 RREQQLRREQQLRREQQLRREQQLRREQEEER-HEQKHEQERREQRLKREQEERRDWLKR
             410       420       430        440       450       460

        750       760       770       780       790       800      
pF1KSD KNRMSRMLEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLKQFEERLAEERHNRLEERKRQRKEERRITY
       ...  :  ..:    ..::  ..   .:.  ..::.  .:...: :.. :...::::   
NP_009 EEETERHEQERRK--QQLKRDQEEERRERWLKLEEEERREQQERREQQLRREQEERREQR
              470         480       490       500       510        

        810           820       830       840       850       860  
pF1KSD YREKEEEE---QR-RAEEQMLKEREERERAERAKREEELREYQERVKKLEEVERKKRQRE
        ...::::   :: :.:.:. .:.::: : .  ::::: :  ::: ..  . :...:. .
NP_009 LKRQEEEERLQQRLRSEQQLRREQEER-REQLLKREEEKRLEQERREQRLKREQEERRDQ
      520       530       540        550       560       570       

            870            880       890       900       910       
pF1KSD LEIEERERR-----REEERRLGDSSLSRKDSRWGDRDSEGTWRKGPEADSEWRRGPPEKE
       :  .:.:::     ::.:.:: .. :.:.. .  ... .   :   :   : ::    : 
NP_009 LLKREEERRQQRLKREQEERL-EQRLKREEVERLEQEERREQRLKREEPEEERRQQLLKS
       580       590        600       610       620       630      

       920       930       940       950       960       970       
pF1KSD WRRGEGRDEDRSHRRDEERPRRLGDDEDREPSLRPDDDRVPRRGMDDDRGPRRGPEEDRF
        .. : :...  ....:.: .::  .:..:  :   ..:. :.  .. :  . . ::.. 
NP_009 EEQEERRQQQLRREQQERREQRLKREEEEE-RL---EQRLKREHEEERREQELAEEEQEQ
        640       650       660           670       680       690  

       980       990         1000         1010      1020      1030 
pF1KSD SRRGADDDRPSWR---NTDDDRPPRRIADEDR---GNWRHADDDRPPRRGLDEDRGSWRT
       .:.   .  :.:.   ... :    .. .. :   :. :. ....  ::   :.. .:. 
NP_009 ARERIKSRIPKWQWQLESEADARQSKVYSRPRKQEGQRRRQEQEEKRRR--RESELQWQ-
            700       710       720       730       740            

            1040      1050      1060      1070      1080           
pF1KSD ADEDRGPRRGMDDDRGPRRGGADDERSSWRNADDDRGPRRGLDDDRGPRRGMDDD--RGP
        .:.:. :. .....  ::    :   .:.  . ..  :. :.  : : : . .   :. 
NP_009 -EEERAHRQQQEEEQ--RR----DFTWQWQAEEKSERGRQRLSA-RPPLREQRERQLRAE
      750       760             770       780        790       800 

    1090       1100      1110      1120      1130      1140        
pF1KSD RRGMDDDRG-PRRGMDDDRGPRRGLDDDRGPWRNADDDRIPRRGAEDDRGPWRNMDDDRL
       .: . ..:  :..   ..:  .:   . .  . . ...   :. :.. .    ....:. 
NP_009 ERQQREQRFLPEEEEKEQRRRQRREREKELQFLEEEEQLQRRERAQQLQEEEDGLQEDQE
             810       820       830       840       850       860 

     1150      1160          1170      1180      1190      1200    
pF1KSD SRRADDDRFPRRG----DDSRPGPWRPLVKPGGWREKEKAREESWGPPRESRPSEEREWD
        ::....:  ..     .. :    . :    . .:. . ...     .:    ::::  
NP_009 RRRSQEQRRDQKWRWQLEEERKRRRHTLYAKPALQEQLRKEQQLLQEEEEELQREEREKR
             870       880       890       900       910       920 

         1210      1220          1230      1240      1250      1260
pF1KSD REKERDRDNQDREENDKDPER----ERDRERDVDREDRFRRPRDEGGWRRGPAEESSSWR
       :..:..:. ...:. ... :.    ::...:  .:: ..:. .     .    ::.   .
NP_009 RRQEQERQYREEEQLQQEEEQLLREEREKRRRQERERQYRKDK-----KLQQKEEQLLGE
             930       940       950       960            970      

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD DSSRRDDRDRDDRRRERDDRRDLRERRDLRDDRDRRGPPLRSEREEVSSWRRADDRKDDR
       .  .:  ..:. . ::... .. .:.. ::..:..:      .:.:   :.:   .::. 
NP_009 EPEKRRRQEREKKYREEEELQQ-EEEQLLREEREKR------RRQE---WERQYRKKDEL
        980       990       1000      1010               1020      

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD VEERDPPRRVPPPALSRDRERDRDREREGEKEKASWRAEKDRESLRRTKNETDEDGWTTV
        .:..   :       :...: ..:::. ..:.                           
NP_009 QQEEEQLLREE-----REKRRLQERERQYREEEELQQEEEQLLGEERETRRRQELERQYR
       1030           1040      1050      1060      1070      1080 

                                                                   
pF1KSD RR                                                          
                                                                   
NP_009 KEEELQQEEEQLLREEPEKRRRQERERQCREEEELQQEEEQLLREEREKRRRQELERQYR
            1090      1100      1110      1120      1130      1140 

>--
 initn: 435 init1: 157 opt: 498  Z-score: 203.2  bits: 50.5 E(85289): 0.00014
Smith-Waterman score: 559; 26.0% identity (59.0% similar) in 791 aa overlap (562-1324:1058-1745)

             540       550       560       570       580       590 
pF1KSD KALEVIKPAHILQEKEEQHQLAVTAYLKNSRKEHQRILARRQTIEERKERLESLNIQREK
                                     ..:.: .  .:.:  .:...::     :..
NP_009 QEEEQLLREEREKRRLQERERQYREEEELQQEEEQLLGEERET--RRRQELERQ--YRKE
      1030      1040      1050      1060      1070          1080   

             600       610         620       630       640         
pF1KSD EELEQREAELQKVRKAEEERLRQEAKE--REKERILQEHEQIKKKTVRERLEQIKKTELG
       :::.:.: .:  .:.  :.: ::: ..  ::.:.. ::.::.    .::. :. .. :: 
NP_009 EELQQEEEQL--LREEPEKRRRQERERQCREEEELQQEEEQL----LREEREKRRRQELE
          1090        1100      1110      1120          1130       

     650       660           670       680          690       700  
pF1KSD AKAFKDIDIEDLEEL----DPDFIMAKQVEQLEKEKKELQ---ERLKNQEKKIDYFERAK
        .  .. .... ::     .:.    ...:.  .:..:::   :.:  .:..    :: .
NP_009 RQYREEEEVQQEEEQLLREEPEKRRRQELERQYREEEELQQEEEQLLREEQEKRRQERER
      1140      1150      1160      1170      1180      1190       

            710       720            730       740       750       
pF1KSD RLEEIPLIKSAYEEQRIKDMDL-----WEQQEEERITTMQLEREKALEHKNRMSRMLEDR
       . .:   ..   ..:: .: :      : : : :. .... ..     ..:.. :.::: 
NP_009 QYREEEELQRQKRKQRYRDEDQRSDLKW-QWEPEKENAVRDNKVYCKGRENEQFRQLEDS
      1200      1210      1220       1230      1240      1250      

       760       770       780       790       800       810       
pF1KSD DLFVMRLKAARQSVYEEKLKQFEERLAEERHNRLEERKRQRKEERRITYYREKEEEEQRR
       .:   : . ..:.. .. : . .::  :... : ..: :.  ::...   ::...: .::
NP_009 QL---RDRQSQQDL-QHLLGEQQERDREQERRRWQQRDRHFPEEEQLE--REEQKEAKRR
          1260       1270      1280      1290      1300        1310

            820        830          840         850       860      
pF1KSD -----AEEQMLKE-REERER---AERAKREEE--LREYQERVKKLEEVERKKRQRELEIE
             :.:.:.: :::..:   ..:  ::::  :.: .:.  . .: .:: :..::. .
NP_009 DRKSQEEKQLLREEREEKRRRQETDRKFREEEQLLQEREEQPLRRQERDRKFREEELRHQ
             1320      1330      1340      1350      1360      1370

        870        880       890       900       910       920     
pF1KSD ERERRR-EEERRLGDSSLSRKDSRWGDRDSEGTWRKGPEADSEWRRGPPEKEWRRGEGRD
       :. :.  :::.::          :  .:.     ::  . ... :    :.. :    .:
NP_009 EQGRKFLEEEQRL----------RRQERE-----RKFLKEEQQLRCQEREQQLR----QD
             1380                     1390      1400          1410 

         930       940       950       960       970       980     
pF1KSD EDRSHRRDEERPRRLGDDEDREPSLRPDDDRVPRRGMDDDRGPRRGPEEDRFSRRGADDD
       .::. :..:..  :    ..:. ..: ....: :.    .:  :.  ::..  :.   . 
NP_009 RDRKFREEEQQLSR----QERDRKFREEEQQVRRQ----ER-ERKFLEEEQQLRQ---ER
            1420          1430      1440           1450            

         990      1000      1010      1020      1030      1040     
pF1KSD RPSWRNTDDDRPPRRIADEDRGNWRHADDDRPPRRGLDEDRGSWRTADEDRGPRRGMDDD
       . ..:. ..    :    :..   :.  :    :. :.:.. . :  ..::  :.    .
NP_009 HRKFREEEQLLQER----EEQQLHRQERD----RKFLEEEQ-QLRRQERDRKFREQELRS
    1460      1470          1480          1490       1500      1510

        1050      1060      1070      1080      1090      1100     
pF1KSD RGPRRGGADDERSSWRNADDDRGPRRGLDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDD
       . :.:   ..:..  :.    .  :. :....  ::   ..:: .: .: ::  :.    
NP_009 QEPERKFLEEEQQLHRQ----QRQRKFLQEEQQLRR---QERGQQRRQDRDRKFRE----
             1520          1530      1540         1550             

        1110      1120      1130      1140      1150      1160     
pF1KSD DRGPRRGLDDDRGPWRNADDDRIPRRGAEDDRGPWRNMDDDRLSRRADDDRFPRRGDDSR
           .. : ..:      ..... :.  : ::  .: ...... :. .. .: .  :...
NP_009 ----EEQLRQER------EEQQLSRQ--ERDR-KFR-LEEQKVRRQEQERKFME--DEQQ
        1560            1570         1580       1590        1600   

        1170      1180      1190      1200       1210      1220    
pF1KSD PGPWRPLVKPGGWREKEKAREESWGPPRESRPSEEREWDREKER-DRDNQDREENDKDPE
             : .  : .. .. :.      :. : .:.   .::...  :...::.  ...:.
NP_009 ------LRRQEGQQQLRQERD------RKFREDEQLLQEREEQQLHRQERDRKFLEEEPQ
                1610            1620      1630      1640      1650 

          1230      1240      1250      1260      1270      1280   
pF1KSD -RERDRERDVDREDRFRRPRDEGGWRRGPAEESSSWRDSSRRDDRDRDDRRRERDDRRDL
        :...::... :.:: :. :.:    .   :..       ::..:::  :..:.. ::. 
NP_009 LRRQEREQQL-RHDRDRKFREEEQLLQEGEEQQL------RRQERDRKFREEEQQLRRQE
            1660       1670      1680            1690      1700    

          1290      1300      1310      1320      1330      1340   
pF1KSD RERRDLRDDRDRRGPPLRSEREEVSSWRRADDRKDDRVEERDPPRRVPPPALSRDRERDR
       :::. :..... :   :. . .:  . :.  .... : .::                   
NP_009 RERKFLQEEQQLRRQELERKFREEEQLRQETEQEQLRRQERYRKILEEEQLRPEREEQQL
         1710      1720      1730      1740      1750      1760    

          1350      1360      1370      1380                       
pF1KSD DREREGEKEKASWRAEKDRESLRRTKNETDEDGWTTVRR                     
                                                                   
NP_009 RRQERDRKFREEEQLRQEREEQQLRSQESDRKFREEEQLRQEREEQQLRPQQRDGKYRWE
         1770      1780      1790      1800      1810      1820    

>>NP_055885 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domain-conta  (1564 aa)
 initn: 640 init1: 263 opt: 531  Z-score: 216.1  bits: 52.6 E(85289): 2.7e-05
Smith-Waterman score: 586; 26.3% identity (52.9% similar) in 779 aa overlap (678-1371:79-829)

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD LGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEI
                                     :.   .:.::.::... .:   . .  :: 
NP_055 GNCLYGNTCRFVHGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEES
       50        60        70        80        90       100        

         710        720            730                             
pF1KSD --PLIK-SAYEEQRIK-DMDLWEQQ----EEERIT---------------------TMQL
         :. : :.  ..: : :. . ...    ::: .                      ....
NP_055 SSPVRKESSRGRHREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDDSDNGDINYDYVHELSLEM
      110       120       130       140       150       160        

      740       750        760       770          780       790    
pF1KSD EREKALEHKNRMSRM-LEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLK---QFEERLAEERHNRLEER
       .:.:  ..  .. .  .: :. .... : .   : . ::.   ....     ...   . 
NP_055 KRQKIQRELMKLEQENMEKREEIIIK-KEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKS
      170       180       190        200       210       220       

          800       810       820       830       840              
pF1KSD KRQRKEERRITYYREKEEEEQRRAEEQMLKEREERERAERAKREEEL---REYQERVK--
       .   :..:. .       ..:: .. .. :..  :  .      :..   ..:.:. :  
NP_055 SSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVK
       230       240       250       260       270       280       

      850       860       870       880                890         
pF1KSD -KLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGD-----SSLSRK----DSRWGD---RDSE
        ..::  :  ..:  ..:.....:.. :  .      : .: .    .:. :.   : : 
NP_055 DRIEEKTRDGKDRGRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSP
       290       300       310       320       330       340       

        900       910        920       930            940       950
pF1KSD GTWRKGPEADSEWRR-GPPEKEWRRGEGRDEDRSHRRDEERPR-----RLGDDEDREPSL
       .  ::   . :  :   :: ..           : .: .  ::     :    .:.: . 
NP_055 SPRRKRTPSPSYQRTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTS
       350       360       370       380       390       400       

              960       970       980       990      1000      1010
pF1KSD RPDDDRVPRRGMDDDRGPRRGPEEDRFSRRGADDDRPSWRNTDDDRPPRRIADEDRGNWR
       .  : :  ::  .: :: .:  :.:   .:  ..:. : :.  ::: ::    .::   :
NP_055 QSHDRRHERR--EDTRG-KRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDREPRD--GRDR---R
       410         420        430       440       450              

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KSD HADDDRPPRRGLDEDRGSWRTADEDRGPRRGMDDDRGPRRGGADDERSSWRNADDDRGPR
        : : :  :: : ..: . : . : :   :   ..: ::     : ::. :.: : :  :
NP_055 DARDTRD-RRELRDSR-DMRDSREMRDYSRDTKESRDPR-----DSRST-RDAHDYRD-R
     460        470        480       490            500         510

             1080      1090      1100       1110       1120        
pF1KSD RGLDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGM-DDDRGPRRG-LDDDRGPWRNADDDRI
       .: :  :      ...:.  :.   ... :  . ...:.  :. . .::     .   ..
NP_055 EGRDTHRKEDTYPEESRSYGRNHLREESSRTEIRNESRNESRSEIRNDRMGRSRGRVPEL
              520       530       540       550       560       570

     1130      1140             1150        1160        1170       
pF1KSD PRRGAEDDRGPW-------RNMDDDRLSRRA--DDDRFPRRG--DDSRPGPWRPLVKPGG
       :..:.. .::          :. :.  .: .  . ::.:.:   :..: . ..   .  :
NP_055 PEKGSRGSRGSQIDSHSSNSNYHDSWETRSSYPERDRYPERDNRDQARDSSFE---RRHG
              580       590       600       610       620          

      1180      1190           1200       1210        1220         
pF1KSD WREKEKAREESWGP--P--RESRPSE-EREWDREKER-DR--DNQDREENDKDPERERDR
        :...  ::..  :  :  ...: .: ::.  ::..: ::  : .:..  ..: ::::::
NP_055 ERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDR
       630       640       650       660       670       680       

    1230         1240      1250      1260      1270       1280     
pF1KSD ERDVDRE---DRFRRPRDEGGWRRGPAEESSSWRDSSRRDDRDRD-DRRRERDDRRDL-R
       ::. .::   :: :. . :   .:.  .:    .. .:. ::::: ::.:::. .::  .
NP_055 ERERERERERDREREKERELERERAREREREREKERDRERDRDRDHDRERERERERDREK
       690       700       710       720       730       740       

         1290      1300      1310      1320      1330      1340    
pF1KSD ERRDLRDDRDRRGPPLRSEREEVSSWRRADDRKDDRVEERDPPRRVPPPALSRDRERDRD
       ::.  :..:.:       :::.    .:  .:. .:..:::  :.      ..:. ::  
NP_055 EREREREERER-------ERERERERERERERERERARERDKERERQRDWEDKDKGRDDR
       750              760       770       780       790       800

         1350       1360       1370      1380                      
pF1KSD REREGE-KEKASWRAEKD-RESLRRTKNETDEDGWTTVRR                    
       ::.. : .:  . :  .: :.: .: .::                               
NP_055 REKREEIREDRNPRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEK
              810       820       830       840       850       860

>>XP_005266369 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger CCC  (1564 aa)
 initn: 640 init1: 263 opt: 531  Z-score: 216.1  bits: 52.6 E(85289): 2.7e-05
Smith-Waterman score: 586; 26.3% identity (52.9% similar) in 779 aa overlap (678-1371:79-829)

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD LGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEI
                                     :.   .:.::.::... .:   . .  :: 
XP_005 GNCLYGNTCRFVHGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEES
       50        60        70        80        90       100        

         710        720            730                             
pF1KSD --PLIK-SAYEEQRIK-DMDLWEQQ----EEERIT---------------------TMQL
         :. : :.  ..: : :. . ...    ::: .                      ....
XP_005 SSPVRKESSRGRHREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDDSDNGDINYDYVHELSLEM
      110       120       130       140       150       160        

      740       750        760       770          780       790    
pF1KSD EREKALEHKNRMSRM-LEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLK---QFEERLAEERHNRLEER
       .:.:  ..  .. .  .: :. .... : .   : . ::.   ....     ...   . 
XP_005 KRQKIQRELMKLEQENMEKREEIIIK-KEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKS
      170       180       190        200       210       220       

          800       810       820       830       840              
pF1KSD KRQRKEERRITYYREKEEEEQRRAEEQMLKEREERERAERAKREEEL---REYQERVK--
       .   :..:. .       ..:: .. .. :..  :  .      :..   ..:.:. :  
XP_005 SSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVK
       230       240       250       260       270       280       

      850       860       870       880                890         
pF1KSD -KLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGD-----SSLSRK----DSRWGD---RDSE
        ..::  :  ..:  ..:.....:.. :  .      : .: .    .:. :.   : : 
XP_005 DRIEEKTRDGKDRGRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSP
       290       300       310       320       330       340       

        900       910        920       930            940       950
pF1KSD GTWRKGPEADSEWRR-GPPEKEWRRGEGRDEDRSHRRDEERPR-----RLGDDEDREPSL
       .  ::   . :  :   :: ..           : .: .  ::     :    .:.: . 
XP_005 SPRRKRTPSPSYQRTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTS
       350       360       370       380       390       400       

              960       970       980       990      1000      1010
pF1KSD RPDDDRVPRRGMDDDRGPRRGPEEDRFSRRGADDDRPSWRNTDDDRPPRRIADEDRGNWR
       .  : :  ::  .: :: .:  :.:   .:  ..:. : :.  ::: ::    .::   :
XP_005 QSHDRRHERR--EDTRG-KRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDREPRD--GRDR---R
       410         420        430       440       450              

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KSD HADDDRPPRRGLDEDRGSWRTADEDRGPRRGMDDDRGPRRGGADDERSSWRNADDDRGPR
        : : :  :: : ..: . : . : :   :   ..: ::     : ::. :.: : :  :
XP_005 DARDTRD-RRELRDSR-DMRDSREMRDYSRDTKESRDPR-----DSRST-RDAHDYRD-R
     460        470        480       490            500         510

             1080      1090      1100       1110       1120        
pF1KSD RGLDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGM-DDDRGPRRG-LDDDRGPWRNADDDRI
       .: :  :      ...:.  :.   ... :  . ...:.  :. . .::     .   ..
XP_005 EGRDTHRKEDTYPEESRSYGRNHLREESSRTEIRNESRNESRSEIRNDRMGRSRGRVPEL
              520       530       540       550       560       570

     1130      1140             1150        1160        1170       
pF1KSD PRRGAEDDRGPW-------RNMDDDRLSRRA--DDDRFPRRG--DDSRPGPWRPLVKPGG
       :..:.. .::          :. :.  .: .  . ::.:.:   :..: . ..   .  :
XP_005 PEKGSRGSRGSQIDSHSSNSNYHDSWETRSSYPERDRYPERDNRDQARDSSFE---RRHG
              580       590       600       610       620          

      1180      1190           1200       1210        1220         
pF1KSD WREKEKAREESWGP--P--RESRPSE-EREWDREKER-DR--DNQDREENDKDPERERDR
        :...  ::..  :  :  ...: .: ::.  ::..: ::  : .:..  ..: ::::::
XP_005 ERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDR
       630       640       650       660       670       680       

    1230         1240      1250      1260      1270       1280     
pF1KSD ERDVDRE---DRFRRPRDEGGWRRGPAEESSSWRDSSRRDDRDRD-DRRRERDDRRDL-R
       ::. .::   :: :. . :   .:.  .:    .. .:. ::::: ::.:::. .::  .
XP_005 ERERERERERDREREKERELERERAREREREREKERDRERDRDRDHDRERERERERDREK
       690       700       710       720       730       740       

         1290      1300      1310      1320      1330      1340    
pF1KSD ERRDLRDDRDRRGPPLRSEREEVSSWRRADDRKDDRVEERDPPRRVPPPALSRDRERDRD
       ::.  :..:.:       :::.    .:  .:. .:..:::  :.      ..:. ::  
XP_005 EREREREERER-------ERERERERERERERERERARERDKERERQRDWEDKDKGRDDR
       750              760       770       780       790       800

         1350       1360       1370      1380                      
pF1KSD REREGE-KEKASWRAEKD-RESLRRTKNETDEDGWTTVRR                    
       ::.. : .:  . :  .: :.: .: .::                               
XP_005 REKREEIREDRNPRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEK
              810       820       830       840       850       860

>>NP_001317496 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domain-co  (1668 aa)
 initn: 640 init1: 263 opt: 531  Z-score: 215.8  bits: 52.6 E(85289): 2.8e-05
Smith-Waterman score: 586; 26.3% identity (52.9% similar) in 779 aa overlap (678-1371:79-829)

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD LGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEI
                                     :.   .:.::.::... .:   . .  :: 
NP_001 GNCLYGNTCRFVHGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEES
       50        60        70        80        90       100        

         710        720            730                             
pF1KSD --PLIK-SAYEEQRIK-DMDLWEQQ----EEERIT---------------------TMQL
         :. : :.  ..: : :. . ...    ::: .                      ....
NP_001 SSPVRKESSRGRHREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDDSDNGDINYDYVHELSLEM
      110       120       130       140       150       160        

      740       750        760       770          780       790    
pF1KSD EREKALEHKNRMSRM-LEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLK---QFEERLAEERHNRLEER
       .:.:  ..  .. .  .: :. .... : .   : . ::.   ....     ...   . 
NP_001 KRQKIQRELMKLEQENMEKREEIIIK-KEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKS
      170       180       190        200       210       220       

          800       810       820       830       840              
pF1KSD KRQRKEERRITYYREKEEEEQRRAEEQMLKEREERERAERAKREEEL---REYQERVK--
       .   :..:. .       ..:: .. .. :..  :  .      :..   ..:.:. :  
NP_001 SSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVK
       230       240       250       260       270       280       

      850       860       870       880                890         
pF1KSD -KLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGD-----SSLSRK----DSRWGD---RDSE
        ..::  :  ..:  ..:.....:.. :  .      : .: .    .:. :.   : : 
NP_001 DRIEEKTRDGKDRGRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSP
       290       300       310       320       330       340       

        900       910        920       930            940       950
pF1KSD GTWRKGPEADSEWRR-GPPEKEWRRGEGRDEDRSHRRDEERPR-----RLGDDEDREPSL
       .  ::   . :  :   :: ..           : .: .  ::     :    .:.: . 
NP_001 SPRRKRTPSPSYQRTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTS
       350       360       370       380       390       400       

              960       970       980       990      1000      1010
pF1KSD RPDDDRVPRRGMDDDRGPRRGPEEDRFSRRGADDDRPSWRNTDDDRPPRRIADEDRGNWR
       .  : :  ::  .: :: .:  :.:   .:  ..:. : :.  ::: ::    .::   :
NP_001 QSHDRRHERR--EDTRG-KRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDREPRD--GRDR---R
       410         420        430       440       450              

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KSD HADDDRPPRRGLDEDRGSWRTADEDRGPRRGMDDDRGPRRGGADDERSSWRNADDDRGPR
        : : :  :: : ..: . : . : :   :   ..: ::     : ::. :.: : :  :
NP_001 DARDTRD-RRELRDSR-DMRDSREMRDYSRDTKESRDPR-----DSRST-RDAHDYRD-R
     460        470        480       490            500         510

             1080      1090      1100       1110       1120        
pF1KSD RGLDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGM-DDDRGPRRG-LDDDRGPWRNADDDRI
       .: :  :      ...:.  :.   ... :  . ...:.  :. . .::     .   ..
NP_001 EGRDTHRKEDTYPEESRSYGRNHLREESSRTEIRNESRNESRSEIRNDRMGRSRGRVPEL
              520       530       540       550       560       570

     1130      1140             1150        1160        1170       
pF1KSD PRRGAEDDRGPW-------RNMDDDRLSRRA--DDDRFPRRG--DDSRPGPWRPLVKPGG
       :..:.. .::          :. :.  .: .  . ::.:.:   :..: . ..   .  :
NP_001 PEKGSRGSRGSQIDSHSSNSNYHDSWETRSSYPERDRYPERDNRDQARDSSFE---RRHG
              580       590       600       610       620          

      1180      1190           1200       1210        1220         
pF1KSD WREKEKAREESWGP--P--RESRPSE-EREWDREKER-DR--DNQDREENDKDPERERDR
        :...  ::..  :  :  ...: .: ::.  ::..: ::  : .:..  ..: ::::::
NP_001 ERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDR
       630       640       650       660       670       680       

    1230         1240      1250      1260      1270       1280     
pF1KSD ERDVDRE---DRFRRPRDEGGWRRGPAEESSSWRDSSRRDDRDRD-DRRRERDDRRDL-R
       ::. .::   :: :. . :   .:.  .:    .. .:. ::::: ::.:::. .::  .
NP_001 ERERERERERDREREKERELERERAREREREREKERDRERDRDRDHDRERERERERDREK
       690       700       710       720       730       740       

         1290      1300      1310      1320      1330      1340    
pF1KSD ERRDLRDDRDRRGPPLRSEREEVSSWRRADDRKDDRVEERDPPRRVPPPALSRDRERDRD
       ::.  :..:.:       :::.    .:  .:. .:..:::  :.      ..:. ::  
NP_001 EREREREERER-------ERERERERERERERERERARERDKERERQRDWEDKDKGRDDR
       750              760       770       780       790       800

         1350       1360       1370      1380                      
pF1KSD REREGE-KEKASWRAEKD-RESLRRTKNETDEDGWTTVRR                    
       ::.. : .:  . :  .: :.: .: .::                               
NP_001 REKREEIREDRNPRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEK
              810       820       830       840       850       860

>>NP_001317495 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domain-co  (1668 aa)
 initn: 640 init1: 263 opt: 531  Z-score: 215.8  bits: 52.6 E(85289): 2.8e-05
Smith-Waterman score: 586; 26.3% identity (52.9% similar) in 779 aa overlap (678-1371:79-829)

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD LGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEI
                                     :.   .:.::.::... .:   . .  :: 
NP_001 GNCLYGNTCRFVHGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEES
       50        60        70        80        90       100        

         710        720            730                             
pF1KSD --PLIK-SAYEEQRIK-DMDLWEQQ----EEERIT---------------------TMQL
         :. : :.  ..: : :. . ...    ::: .                      ....
NP_001 SSPVRKESSRGRHREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDDSDNGDINYDYVHELSLEM
      110       120       130       140       150       160        

      740       750        760       770          780       790    
pF1KSD EREKALEHKNRMSRM-LEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLK---QFEERLAEERHNRLEER
       .:.:  ..  .. .  .: :. .... : .   : . ::.   ....     ...   . 
NP_001 KRQKIQRELMKLEQENMEKREEIIIK-KEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKS
      170       180       190        200       210       220       

          800       810       820       830       840              
pF1KSD KRQRKEERRITYYREKEEEEQRRAEEQMLKEREERERAERAKREEEL---REYQERVK--
       .   :..:. .       ..:: .. .. :..  :  .      :..   ..:.:. :  
NP_001 SSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVK
       230       240       250       260       270       280       

      850       860       870       880                890         
pF1KSD -KLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGD-----SSLSRK----DSRWGD---RDSE
        ..::  :  ..:  ..:.....:.. :  .      : .: .    .:. :.   : : 
NP_001 DRIEEKTRDGKDRGRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSP
       290       300       310       320       330       340       

        900       910        920       930            940       950
pF1KSD GTWRKGPEADSEWRR-GPPEKEWRRGEGRDEDRSHRRDEERPR-----RLGDDEDREPSL
       .  ::   . :  :   :: ..           : .: .  ::     :    .:.: . 
NP_001 SPRRKRTPSPSYQRTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTS
       350       360       370       380       390       400       

              960       970       980       990      1000      1010
pF1KSD RPDDDRVPRRGMDDDRGPRRGPEEDRFSRRGADDDRPSWRNTDDDRPPRRIADEDRGNWR
       .  : :  ::  .: :: .:  :.:   .:  ..:. : :.  ::: ::    .::   :
NP_001 QSHDRRHERR--EDTRG-KRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDREPRD--GRDR---R
       410         420        430       440       450              

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KSD HADDDRPPRRGLDEDRGSWRTADEDRGPRRGMDDDRGPRRGGADDERSSWRNADDDRGPR
        : : :  :: : ..: . : . : :   :   ..: ::     : ::. :.: : :  :
NP_001 DARDTRD-RRELRDSR-DMRDSREMRDYSRDTKESRDPR-----DSRST-RDAHDYRD-R
     460        470        480       490            500         510

             1080      1090      1100       1110       1120        
pF1KSD RGLDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGM-DDDRGPRRG-LDDDRGPWRNADDDRI
       .: :  :      ...:.  :.   ... :  . ...:.  :. . .::     .   ..
NP_001 EGRDTHRKEDTYPEESRSYGRNHLREESSRTEIRNESRNESRSEIRNDRMGRSRGRVPEL
              520       530       540       550       560       570

     1130      1140             1150        1160        1170       
pF1KSD PRRGAEDDRGPW-------RNMDDDRLSRRA--DDDRFPRRG--DDSRPGPWRPLVKPGG
       :..:.. .::          :. :.  .: .  . ::.:.:   :..: . ..   .  :
NP_001 PEKGSRGSRGSQIDSHSSNSNYHDSWETRSSYPERDRYPERDNRDQARDSSFE---RRHG
              580       590       600       610       620          

      1180      1190           1200       1210        1220         
pF1KSD WREKEKAREESWGP--P--RESRPSE-EREWDREKER-DR--DNQDREENDKDPERERDR
        :...  ::..  :  :  ...: .: ::.  ::..: ::  : .:..  ..: ::::::
NP_001 ERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDR
       630       640       650       660       670       680       

    1230         1240      1250      1260      1270       1280     
pF1KSD ERDVDRE---DRFRRPRDEGGWRRGPAEESSSWRDSSRRDDRDRD-DRRRERDDRRDL-R
       ::. .::   :: :. . :   .:.  .:    .. .:. ::::: ::.:::. .::  .
NP_001 ERERERERERDREREKERELERERAREREREREKERDRERDRDRDHDRERERERERDREK
       690       700       710       720       730       740       

         1290      1300      1310      1320      1330      1340    
pF1KSD ERRDLRDDRDRRGPPLRSEREEVSSWRRADDRKDDRVEERDPPRRVPPPALSRDRERDRD
       ::.  :..:.:       :::.    .:  .:. .:..:::  :.      ..:. ::  
NP_001 EREREREERER-------ERERERERERERERERERARERDKERERQRDWEDKDKGRDDR
       750              760       770       780       790       800

         1350       1360       1370      1380                      
pF1KSD REREGE-KEKASWRAEKD-RESLRRTKNETDEDGWTTVRR                    
       ::.. : .:  . :  .: :.: .: .::                               
NP_001 REKREEIREDRNPRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEK
              810       820       830       840       850       860

>>NP_001317494 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domain-co  (1668 aa)
 initn: 640 init1: 263 opt: 531  Z-score: 215.8  bits: 52.6 E(85289): 2.8e-05
Smith-Waterman score: 586; 26.3% identity (52.9% similar) in 779 aa overlap (678-1371:79-829)

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD LGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEI
                                     :.   .:.::.::... .:   . .  :: 
NP_001 GNCLYGNTCRFVHGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEES
       50        60        70        80        90       100        

         710        720            730                             
pF1KSD --PLIK-SAYEEQRIK-DMDLWEQQ----EEERIT---------------------TMQL
         :. : :.  ..: : :. . ...    ::: .                      ....
NP_001 SSPVRKESSRGRHREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDDSDNGDINYDYVHELSLEM
      110       120       130       140       150       160        

      740       750        760       770          780       790    
pF1KSD EREKALEHKNRMSRM-LEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLK---QFEERLAEERHNRLEER
       .:.:  ..  .. .  .: :. .... : .   : . ::.   ....     ...   . 
NP_001 KRQKIQRELMKLEQENMEKREEIIIK-KEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKS
      170       180       190        200       210       220       

          800       810       820       830       840              
pF1KSD KRQRKEERRITYYREKEEEEQRRAEEQMLKEREERERAERAKREEEL---REYQERVK--
       .   :..:. .       ..:: .. .. :..  :  .      :..   ..:.:. :  
NP_001 SSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVK
       230       240       250       260       270       280       

      850       860       870       880                890         
pF1KSD -KLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGD-----SSLSRK----DSRWGD---RDSE
        ..::  :  ..:  ..:.....:.. :  .      : .: .    .:. :.   : : 
NP_001 DRIEEKTRDGKDRGRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSP
       290       300       310       320       330       340       

        900       910        920       930            940       950
pF1KSD GTWRKGPEADSEWRR-GPPEKEWRRGEGRDEDRSHRRDEERPR-----RLGDDEDREPSL
       .  ::   . :  :   :: ..           : .: .  ::     :    .:.: . 
NP_001 SPRRKRTPSPSYQRTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTS
       350       360       370       380       390       400       

              960       970       980       990      1000      1010
pF1KSD RPDDDRVPRRGMDDDRGPRRGPEEDRFSRRGADDDRPSWRNTDDDRPPRRIADEDRGNWR
       .  : :  ::  .: :: .:  :.:   .:  ..:. : :.  ::: ::    .::   :
NP_001 QSHDRRHERR--EDTRG-KRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDREPRD--GRDR---R
       410         420        430       440       450              

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KSD HADDDRPPRRGLDEDRGSWRTADEDRGPRRGMDDDRGPRRGGADDERSSWRNADDDRGPR
        : : :  :: : ..: . : . : :   :   ..: ::     : ::. :.: : :  :
NP_001 DARDTRD-RRELRDSR-DMRDSREMRDYSRDTKESRDPR-----DSRST-RDAHDYRD-R
     460        470        480       490            500         510

             1080      1090      1100       1110       1120        
pF1KSD RGLDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGM-DDDRGPRRG-LDDDRGPWRNADDDRI
       .: :  :      ...:.  :.   ... :  . ...:.  :. . .::     .   ..
NP_001 EGRDTHRKEDTYPEESRSYGRNHLREESSRTEIRNESRNESRSEIRNDRMGRSRGRVPEL
              520       530       540       550       560       570

     1130      1140             1150        1160        1170       
pF1KSD PRRGAEDDRGPW-------RNMDDDRLSRRA--DDDRFPRRG--DDSRPGPWRPLVKPGG
       :..:.. .::          :. :.  .: .  . ::.:.:   :..: . ..   .  :
NP_001 PEKGSRGSRGSQIDSHSSNSNYHDSWETRSSYPERDRYPERDNRDQARDSSFE---RRHG
              580       590       600       610       620          

      1180      1190           1200       1210        1220         
pF1KSD WREKEKAREESWGP--P--RESRPSE-EREWDREKER-DR--DNQDREENDKDPERERDR
        :...  ::..  :  :  ...: .: ::.  ::..: ::  : .:..  ..: ::::::
NP_001 ERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDR
       630       640       650       660       670       680       

    1230         1240      1250      1260      1270       1280     
pF1KSD ERDVDRE---DRFRRPRDEGGWRRGPAEESSSWRDSSRRDDRDRD-DRRRERDDRRDL-R
       ::. .::   :: :. . :   .:.  .:    .. .:. ::::: ::.:::. .::  .
NP_001 ERERERERERDREREKERELERERAREREREREKERDRERDRDRDHDRERERERERDREK
       690       700       710       720       730       740       

         1290      1300      1310      1320      1330      1340    
pF1KSD ERRDLRDDRDRRGPPLRSEREEVSSWRRADDRKDDRVEERDPPRRVPPPALSRDRERDRD
       ::.  :..:.:       :::.    .:  .:. .:..:::  :.      ..:. ::  
NP_001 EREREREERER-------ERERERERERERERERERARERDKERERQRDWEDKDKGRDDR
       750              760       770       780       790       800

         1350       1360       1370      1380                      
pF1KSD REREGE-KEKASWRAEKD-RESLRRTKNETDEDGWTTVRR                    
       ::.. : .:  . :  .: :.: .: .::                               
NP_001 REKREEIREDRNPRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEK
              810       820       830       840       850       860

>>XP_005266367 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger CCC  (1669 aa)
 initn: 640 init1: 263 opt: 531  Z-score: 215.8  bits: 52.6 E(85289): 2.8e-05
Smith-Waterman score: 586; 26.3% identity (52.9% similar) in 779 aa overlap (678-1371:79-829)

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD LGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEI
                                     :.   .:.::.::... .:   . .  :: 
XP_005 GNCLYGNTCRFVHGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEES
       50        60        70        80        90       100        

         710        720            730                             
pF1KSD --PLIK-SAYEEQRIK-DMDLWEQQ----EEERIT---------------------TMQL
         :. : :.  ..: : :. . ...    ::: .                      ....
XP_005 SSPVRKESSRGRHREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDDSDNGDINYDYVHELSLEM
      110       120       130       140       150       160        

      740       750        760       770          780       790    
pF1KSD EREKALEHKNRMSRM-LEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLK---QFEERLAEERHNRLEER
       .:.:  ..  .. .  .: :. .... : .   : . ::.   ....     ...   . 
XP_005 KRQKIQRELMKLEQENMEKREEIIIK-KEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKS
      170       180       190        200       210       220       

          800       810       820       830       840              
pF1KSD KRQRKEERRITYYREKEEEEQRRAEEQMLKEREERERAERAKREEEL---REYQERVK--
       .   :..:. .       ..:: .. .. :..  :  .      :..   ..:.:. :  
XP_005 SSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVK
       230       240       250       260       270       280       

      850       860       870       880                890         
pF1KSD -KLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGD-----SSLSRK----DSRWGD---RDSE
        ..::  :  ..:  ..:.....:.. :  .      : .: .    .:. :.   : : 
XP_005 DRIEEKTRDGKDRGRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSP
       290       300       310       320       330       340       

        900       910        920       930            940       950
pF1KSD GTWRKGPEADSEWRR-GPPEKEWRRGEGRDEDRSHRRDEERPR-----RLGDDEDREPSL
       .  ::   . :  :   :: ..           : .: .  ::     :    .:.: . 
XP_005 SPRRKRTPSPSYQRTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTS
       350       360       370       380       390       400       

              960       970       980       990      1000      1010
pF1KSD RPDDDRVPRRGMDDDRGPRRGPEEDRFSRRGADDDRPSWRNTDDDRPPRRIADEDRGNWR
       .  : :  ::  .: :: .:  :.:   .:  ..:. : :.  ::: ::    .::   :
XP_005 QSHDRRHERR--EDTRG-KRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDREPRD--GRDR---R
       410         420        430       440       450              

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KSD HADDDRPPRRGLDEDRGSWRTADEDRGPRRGMDDDRGPRRGGADDERSSWRNADDDRGPR
        : : :  :: : ..: . : . : :   :   ..: ::     : ::. :.: : :  :
XP_005 DARDTRD-RRELRDSR-DMRDSREMRDYSRDTKESRDPR-----DSRST-RDAHDYRD-R
     460        470        480       490            500         510

             1080      1090      1100       1110       1120        
pF1KSD RGLDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGM-DDDRGPRRG-LDDDRGPWRNADDDRI
       .: :  :      ...:.  :.   ... :  . ...:.  :. . .::     .   ..
XP_005 EGRDTHRKEDTYPEESRSYGRNHLREESSRTEIRNESRNESRSEIRNDRMGRSRGRVPEL
              520       530       540       550       560       570

     1130      1140             1150        1160        1170       
pF1KSD PRRGAEDDRGPW-------RNMDDDRLSRRA--DDDRFPRRG--DDSRPGPWRPLVKPGG
       :..:.. .::          :. :.  .: .  . ::.:.:   :..: . ..   .  :
XP_005 PEKGSRGSRGSQIDSHSSNSNYHDSWETRSSYPERDRYPERDNRDQARDSSFE---RRHG
              580       590       600       610       620          

      1180      1190           1200       1210        1220         
pF1KSD WREKEKAREESWGP--P--RESRPSE-EREWDREKER-DR--DNQDREENDKDPERERDR
        :...  ::..  :  :  ...: .: ::.  ::..: ::  : .:..  ..: ::::::
XP_005 ERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDR
       630       640       650       660       670       680       

    1230         1240      1250      1260      1270       1280     
pF1KSD ERDVDRE---DRFRRPRDEGGWRRGPAEESSSWRDSSRRDDRDRD-DRRRERDDRRDL-R
       ::. .::   :: :. . :   .:.  .:    .. .:. ::::: ::.:::. .::  .
XP_005 ERERERERERDREREKERELERERAREREREREKERDRERDRDRDHDRERERERERDREK
       690       700       710       720       730       740       

         1290      1300      1310      1320      1330      1340    
pF1KSD ERRDLRDDRDRRGPPLRSEREEVSSWRRADDRKDDRVEERDPPRRVPPPALSRDRERDRD
       ::.  :..:.:       :::.    .:  .:. .:..:::  :.      ..:. ::  
XP_005 EREREREERER-------ERERERERERERERERERARERDKERERQRDWEDKDKGRDDR
       750              760       770       780       790       800

         1350       1360       1370      1380                      
pF1KSD REREGE-KEKASWRAEKD-RESLRRTKNETDEDGWTTVRR                    
       ::.. : .:  . :  .: :.: .: .::                               
XP_005 REKREEIREDRNPRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEK
              810       820       830       840       850       860

>>XP_016875969 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger CCC  (1669 aa)
 initn: 640 init1: 263 opt: 531  Z-score: 215.8  bits: 52.6 E(85289): 2.8e-05
Smith-Waterman score: 586; 26.3% identity (52.9% similar) in 779 aa overlap (678-1371:79-829)

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD LGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEI
                                     :.   .:.::.::... .:   . .  :: 
XP_016 GNCLYGNTCRFVHGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEES
       50        60        70        80        90       100        

         710        720            730                             
pF1KSD --PLIK-SAYEEQRIK-DMDLWEQQ----EEERIT---------------------TMQL
         :. : :.  ..: : :. . ...    ::: .                      ....
XP_016 SSPVRKESSRGRHREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDDSDNGDINYDYVHELSLEM
      110       120       130       140       150       160        

      740       750        760       770          780       790    
pF1KSD EREKALEHKNRMSRM-LEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLK---QFEERLAEERHNRLEER
       .:.:  ..  .. .  .: :. .... : .   : . ::.   ....     ...   . 
XP_016 KRQKIQRELMKLEQENMEKREEIIIK-KEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKS
      170       180       190        200       210       220       

          800       810       820       830       840              
pF1KSD KRQRKEERRITYYREKEEEEQRRAEEQMLKEREERERAERAKREEEL---REYQERVK--
       .   :..:. .       ..:: .. .. :..  :  .      :..   ..:.:. :  
XP_016 SSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVK
       230       240       250       260       270       280       

      850       860       870       880                890         
pF1KSD -KLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGD-----SSLSRK----DSRWGD---RDSE
        ..::  :  ..:  ..:.....:.. :  .      : .: .    .:. :.   : : 
XP_016 DRIEEKTRDGKDRGRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSP
       290       300       310       320       330       340       

        900       910        920       930            940       950
pF1KSD GTWRKGPEADSEWRR-GPPEKEWRRGEGRDEDRSHRRDEERPR-----RLGDDEDREPSL
       .  ::   . :  :   :: ..           : .: .  ::     :    .:.: . 
XP_016 SPRRKRTPSPSYQRTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTS
       350       360       370       380       390       400       

              960       970       980       990      1000      1010
pF1KSD RPDDDRVPRRGMDDDRGPRRGPEEDRFSRRGADDDRPSWRNTDDDRPPRRIADEDRGNWR
       .  : :  ::  .: :: .:  :.:   .:  ..:. : :.  ::: ::    .::   :
XP_016 QSHDRRHERR--EDTRG-KRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDREPRD--GRDR---R
       410         420        430       440       450              

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KSD HADDDRPPRRGLDEDRGSWRTADEDRGPRRGMDDDRGPRRGGADDERSSWRNADDDRGPR
        : : :  :: : ..: . : . : :   :   ..: ::     : ::. :.: : :  :
XP_016 DARDTRD-RRELRDSR-DMRDSREMRDYSRDTKESRDPR-----DSRST-RDAHDYRD-R
     460        470        480       490            500         510

             1080      1090      1100       1110       1120        
pF1KSD RGLDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGM-DDDRGPRRG-LDDDRGPWRNADDDRI
       .: :  :      ...:.  :.   ... :  . ...:.  :. . .::     .   ..
XP_016 EGRDTHRKEDTYPEESRSYGRNHLREESSRTEIRNESRNESRSEIRNDRMGRSRGRVPEL
              520       530       540       550       560       570

     1130      1140             1150        1160        1170       
pF1KSD PRRGAEDDRGPW-------RNMDDDRLSRRA--DDDRFPRRG--DDSRPGPWRPLVKPGG
       :..:.. .::          :. :.  .: .  . ::.:.:   :..: . ..   .  :
XP_016 PEKGSRGSRGSQIDSHSSNSNYHDSWETRSSYPERDRYPERDNRDQARDSSFE---RRHG
              580       590       600       610       620          

      1180      1190           1200       1210        1220         
pF1KSD WREKEKAREESWGP--P--RESRPSE-EREWDREKER-DR--DNQDREENDKDPERERDR
        :...  ::..  :  :  ...: .: ::.  ::..: ::  : .:..  ..: ::::::
XP_016 ERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDR
       630       640       650       660       670       680       

    1230         1240      1250      1260      1270       1280     
pF1KSD ERDVDRE---DRFRRPRDEGGWRRGPAEESSSWRDSSRRDDRDRD-DRRRERDDRRDL-R
       ::. .::   :: :. . :   .:.  .:    .. .:. ::::: ::.:::. .::  .
XP_016 ERERERERERDREREKERELERERAREREREREKERDRERDRDRDHDRERERERERDREK
       690       700       710       720       730       740       

         1290      1300      1310      1320      1330      1340    
pF1KSD ERRDLRDDRDRRGPPLRSEREEVSSWRRADDRKDDRVEERDPPRRVPPPALSRDRERDRD
       ::.  :..:.:       :::.    .:  .:. .:..:::  :.      ..:. ::  
XP_016 EREREREERER-------ERERERERERERERERERARERDKERERQRDWEDKDKGRDDR
       750              760       770       780       790       800

         1350       1360       1370      1380                      
pF1KSD REREGE-KEKASWRAEKD-RESLRRTKNETDEDGWTTVRR                    
       ::.. : .:  . :  .: :.: .: .::                               
XP_016 REKREEIREDRNPRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEK
              810       820       830       840       850       860

>>XP_016875968 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger CCC  (1669 aa)
 initn: 640 init1: 263 opt: 531  Z-score: 215.8  bits: 52.6 E(85289): 2.8e-05
Smith-Waterman score: 586; 26.3% identity (52.9% similar) in 779 aa overlap (678-1371:79-829)

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD LGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEI
                                     :.   .:.::.::... .:   . .  :: 
XP_016 GNCLYGNTCRFVHGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEES
       50        60        70        80        90       100        

         710        720            730                             
pF1KSD --PLIK-SAYEEQRIK-DMDLWEQQ----EEERIT---------------------TMQL
         :. : :.  ..: : :. . ...    ::: .                      ....
XP_016 SSPVRKESSRGRHREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDDSDNGDINYDYVHELSLEM
      110       120       130       140       150       160        

      740       750        760       770          780       790    
pF1KSD EREKALEHKNRMSRM-LEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLK---QFEERLAEERHNRLEER
       .:.:  ..  .. .  .: :. .... : .   : . ::.   ....     ...   . 
XP_016 KRQKIQRELMKLEQENMEKREEIIIK-KEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKS
      170       180       190        200       210       220       

          800       810       820       830       840              
pF1KSD KRQRKEERRITYYREKEEEEQRRAEEQMLKEREERERAERAKREEEL---REYQERVK--
       .   :..:. .       ..:: .. .. :..  :  .      :..   ..:.:. :  
XP_016 SSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVK
       230       240       250       260       270       280       

      850       860       870       880                890         
pF1KSD -KLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGD-----SSLSRK----DSRWGD---RDSE
        ..::  :  ..:  ..:.....:.. :  .      : .: .    .:. :.   : : 
XP_016 DRIEEKTRDGKDRGRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSP
       290       300       310       320       330       340       

        900       910        920       930            940       950
pF1KSD GTWRKGPEADSEWRR-GPPEKEWRRGEGRDEDRSHRRDEERPR-----RLGDDEDREPSL
       .  ::   . :  :   :: ..           : .: .  ::     :    .:.: . 
XP_016 SPRRKRTPSPSYQRTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTS
       350       360       370       380       390       400       

              960       970       980       990      1000      1010
pF1KSD RPDDDRVPRRGMDDDRGPRRGPEEDRFSRRGADDDRPSWRNTDDDRPPRRIADEDRGNWR
       .  : :  ::  .: :: .:  :.:   .:  ..:. : :.  ::: ::    .::   :
XP_016 QSHDRRHERR--EDTRG-KRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDREPRD--GRDR---R
       410         420        430       440       450              

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KSD HADDDRPPRRGLDEDRGSWRTADEDRGPRRGMDDDRGPRRGGADDERSSWRNADDDRGPR
        : : :  :: : ..: . : . : :   :   ..: ::     : ::. :.: : :  :
XP_016 DARDTRD-RRELRDSR-DMRDSREMRDYSRDTKESRDPR-----DSRST-RDAHDYRD-R
     460        470        480       490            500         510

             1080      1090      1100       1110       1120        
pF1KSD RGLDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGM-DDDRGPRRG-LDDDRGPWRNADDDRI
       .: :  :      ...:.  :.   ... :  . ...:.  :. . .::     .   ..
XP_016 EGRDTHRKEDTYPEESRSYGRNHLREESSRTEIRNESRNESRSEIRNDRMGRSRGRVPEL
              520       530       540       550       560       570

     1130      1140             1150        1160        1170       
pF1KSD PRRGAEDDRGPW-------RNMDDDRLSRRA--DDDRFPRRG--DDSRPGPWRPLVKPGG
       :..:.. .::          :. :.  .: .  . ::.:.:   :..: . ..   .  :
XP_016 PEKGSRGSRGSQIDSHSSNSNYHDSWETRSSYPERDRYPERDNRDQARDSSFE---RRHG
              580       590       600       610       620          

      1180      1190           1200       1210        1220         
pF1KSD WREKEKAREESWGP--P--RESRPSE-EREWDREKER-DR--DNQDREENDKDPERERDR
        :...  ::..  :  :  ...: .: ::.  ::..: ::  : .:..  ..: ::::::
XP_016 ERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDR
       630       640       650       660       670       680       

    1230         1240      1250      1260      1270       1280     
pF1KSD ERDVDRE---DRFRRPRDEGGWRRGPAEESSSWRDSSRRDDRDRD-DRRRERDDRRDL-R
       ::. .::   :: :. . :   .:.  .:    .. .:. ::::: ::.:::. .::  .
XP_016 ERERERERERDREREKERELERERAREREREREKERDRERDRDRDHDRERERERERDREK
       690       700       710       720       730       740       

         1290      1300      1310      1320      1330      1340    
pF1KSD ERRDLRDDRDRRGPPLRSEREEVSSWRRADDRKDDRVEERDPPRRVPPPALSRDRERDRD
       ::.  :..:.:       :::.    .:  .:. .:..:::  :.      ..:. ::  
XP_016 EREREREERER-------ERERERERERERERERERARERDKERERQRDWEDKDKGRDDR
       750              760       770       780       790       800

         1350       1360       1370      1380                      
pF1KSD REREGE-KEKASWRAEKD-RESLRRTKNETDEDGWTTVRR                    
       ::.. : .:  . :  .: :.: .: .::                               
XP_016 REKREEIREDRNPRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEK
              810       820       830       840       850       860




1382 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 00:11:48 2016 done: Thu Nov  3 00:11:50 2016
 Total Scan time: 12.510 Total Display time:  0.350

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com