Result of FASTA (ccds) for pF1KB8795
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8795, 331 aa
  1>>>pF1KB8795 331 - 331 aa - 331 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0141+/-0.0017; mu= 9.6317+/- 0.100
 mean_var=238.1561+/-48.742, 0's: 0 Z-trim(105.2): 943  B-trim: 108 in 1/48
 Lambda= 0.083108
 statistics sampled from 7287 (8312) to 7287 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.572), E-opt: 0.2 (0.255), width:  16
 Scan time:  2.190

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2716.1 ZNF660 gene_id:285349|Hs108|chr3        ( 331) 2335 293.5 1.6e-79
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19       ( 488) 1363 177.2 2.4e-44
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616) 1348 175.5 9.7e-44
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658) 1348 175.5   1e-43
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670) 1348 175.6   1e-43
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682) 1348 175.6   1e-43
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3        ( 754) 1329 173.4 5.3e-43
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19      ( 475) 1315 171.4 1.3e-42
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5           ( 461) 1312 171.0 1.6e-42
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3         ( 544) 1313 171.2 1.7e-42
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 568) 1313 171.3 1.7e-42
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5         ( 604) 1313 171.3 1.8e-42
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 620) 1313 171.3 1.8e-42
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5       ( 563) 1311 171.0   2e-42
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19       ( 678) 1311 171.1 2.2e-42
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19      ( 688) 1307 170.7 3.1e-42
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19      (1058) 1309 171.2 3.4e-42
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19      (1090) 1309 171.2 3.5e-42
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19      ( 568) 1300 169.7   5e-42
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 585) 1300 169.7 5.1e-42
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 643) 1300 169.8 5.4e-42
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17        ( 502) 1296 169.1 6.5e-42
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19       ( 670) 1297 169.4 7.1e-42
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 536) 1292 168.7 9.4e-42
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 592) 1292 168.8   1e-41
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6          ( 751) 1292 168.9 1.1e-41
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9          ( 364) 1286 167.8 1.2e-41
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 665) 1289 168.5 1.4e-41
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 667) 1289 168.5 1.4e-41
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 692) 1289 168.5 1.4e-41
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9          ( 474) 1286 167.9 1.4e-41
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9           ( 498) 1286 167.9 1.5e-41
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 580) 1287 168.2 1.5e-41
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 644) 1287 168.2 1.6e-41
CCDS62623.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19        ( 574) 1284 167.8 1.9e-41
CCDS74324.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19        ( 586) 1284 167.8 1.9e-41
CCDS74323.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19        ( 618) 1284 167.8   2e-41
CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19        ( 659) 1284 167.9 2.1e-41
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 503) 1280 167.2 2.5e-41
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8           ( 682) 1282 167.7 2.5e-41
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 555) 1280 167.3 2.6e-41
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 564) 1280 167.3 2.6e-41
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 577) 1280 167.3 2.7e-41
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19      ( 616) 1280 167.4 2.8e-41
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 616) 1280 167.4 2.8e-41
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 629) 1280 167.4 2.8e-41
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 527) 1277 166.9 3.3e-41
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19       ( 782) 1279 167.4 3.5e-41
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19       ( 818) 1279 167.4 3.6e-41
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 686) 1277 167.1 3.8e-41


>>CCDS2716.1 ZNF660 gene_id:285349|Hs108|chr3             (331 aa)
 initn: 2335 init1: 2335 opt: 2335  Z-score: 1541.1  bits: 293.5 E(32554): 1.6e-79
Smith-Waterman score: 2335; 100.0% identity (100.0% similar) in 331 aa overlap (1-331:1-331)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MRRKTRNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MRRKTRNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 QSANLTVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 QSANLTVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 LIRHQGIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LIRHQGIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 QRMHRGKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 QRMHRGKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 RREKPYKCNECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTFRQTSQVILHLRTHTKEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 RREKPYKCNECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTFRQTSQVILHLRTHTKEK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330 
pF1KB8 PYKCSECGKAYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 PYKCSECGKAYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS
              310       320       330 

>>CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19            (488 aa)
 initn: 2475 init1: 1351 opt: 1363  Z-score: 909.5  bits: 177.2 E(32554): 2.4e-44
Smith-Waterman score: 1363; 58.0% identity (80.9% similar) in 324 aa overlap (5-328:47-368)

                                         10        20        30    
pF1KB8                           MRRKTRNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQC
                                     : ...:. .. .. : :   .:  :: :  
CCDS12 DWECKNQFERKQGSQEGHFSEMIFTPEDMPTFSIQHQRIHTDEKLLEC--KECGKDFSFV
         20        30        40        50        60          70    

           40        50        60        70        80        90    
pF1KB8 CDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANLTVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLV
          . ..:... .. : : ::::::...:::. :.::::::::..::::::::. .:::.
CCDS12 SVLVRHQRIHTGEKPYECKECGKAFGSGANLAYHQRIHTGEKPFECKECGKAFGSGSNLT
           80        90       100       110       120       130    

          100       110       120       130       140       150    
pF1KB8 VHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQGIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHR
        :.::::: ::: :.::::.::  : ::::: :::::: ::::::::.::  :.:: :::
CCDS12 HHQRIHTGEKPYECKECGKAFSFGSGLIRHQIIHSGEKPYECKECGKSFSFESALIRHHR
          140       150       160       170       180       190    

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB8 VHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHRGKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTG
       .::::::: ::.:::::. .::::::.:.: :.: :.:: :: . .:.. .  :::::::
CCDS12 IHTGEKPYECIDCGKAFGSGSNLTQHRRIHTGEKPYECKACGMAFSSGSALTRHQRIHTG
          200       210       220       230       240       250    

          220       230       240       250       260       270    
pF1KB8 EKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKPYKCNECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPY
       :::: :.::::.: . ..:..:::.:  :::: :.::::::.:. .:..:::.:::::::
CCDS12 EKPYICNECGKAFSFGSALTRHQRIHTGEKPYVCKECGKAFNSGSDLTQHQRIHTGEKPY
          260       270       280       290       300       310    

          280       290       300       310       320       330    
pF1KB8 KCNECGKTFRQTSQVILHLRTHTKEKPYKCSECGKAYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS   
       .:.:: :.::. :..: : : :: ::::.:.::::..  .:.: ::.: :. ::      
CCDS12 ECKECEKAFRSGSKLIQHQRMHTGEKPYECKECGKTFSSGSDLTQHHRIHTGEKPYECKE
          320       330       340       350       360       370    

CCDS12 CGKAFGSGSKLIQHQLIHTGERPYECKECGKSFSSGSALNRHQRIHTGEKPYECKECGKA
          380       390       400       410       420       430    

>--
 initn: 1391 init1: 524 opt: 524  Z-score: 365.8  bits: 76.6 E(32554): 4.7e-14
Smith-Waterman score: 524; 61.9% identity (83.2% similar) in 113 aa overlap (77-189:369-481)

         50        60        70        80        90       100      
pF1KB8 KRQYVCTECGKAFSQSANLTVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPY
                                     ::.::::::::. .:.:. :. :::: .::
CCDS12 EKPYECKECGKTFSSGSDLTQHHRIHTGEKPYECKECGKAFGSGSKLIQHQLIHTGERPY
      340       350       360       370       380       390        

        110       120       130       140       150       160      
pF1KB8 TCSECGKSFSGKSHLIRHQGIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIE
        :.:::::::. : : ::: ::.::: ::::::::::  .:.: .:.:.::::: : : .
CCDS12 ECKECGKSFSSGSALNRHQRIHTGEKPYECKECGKAFYSGSSLTQHQRIHTGEKLYECKN
      400       410       420       430       440       450        

        170       180       190       200       210       220      
pF1KB8 CGKAFSRSSNLTQHQRMHRGKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKT
       ::::..:.:.. ::.. : :::.                                     
CCDS12 CGKAYGRDSEFQQHKKSHNGKKLCELETIN                              
      460       470       480                                      

>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (616 aa)
 initn: 1348 init1: 1348 opt: 1348  Z-score: 898.7  bits: 175.5 E(32554): 9.7e-44
Smith-Waterman score: 1348; 60.9% identity (83.7% similar) in 289 aa overlap (40-328:274-562)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KB8 HKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANLTVHE
                                     .::... .. : :.:::::: :: .:: : 
CCDS74 IQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHL
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pF1KB8 RIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQGIHS
       :::::::::.: ::::::::::.:. :.::::: ::: : ::::.:.  . ::.::  :.
CCDS74 RIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHT
           310       320       330       340       350       360   

     130       140       150       160       170       180         
pF1KB8 GEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHRGKKV
       ::: ::: :::::::.:. :  :.:.:::::::.: ::::.::.::.:.::.: : :.: 
CCDS74 GEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKP
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pF1KB8 YKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKPYKCN
       :.:..:::.  ..:.. .:::::::::::::..:::.:   ..:..:::.:  ::::.::
CCDS74 YECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECN
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pF1KB8 ECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTFRQTSQVILHLRTHTKEKPYKCSECGK
       .::.::..   :..:::.:::::::.::.::..: :.: .: : : ::::::: :.::::
CCDS74 QCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGK
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pF1KB8 AYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS                                      
       .. .::.: ::.: :. ::                                         
CCDS74 SFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTH
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>--
 initn: 1377 init1: 495 opt: 500  Z-score: 349.2  bits: 73.8 E(32554): 3.9e-13
Smith-Waterman score: 500; 47.9% identity (74.3% similar) in 144 aa overlap (36-179:130-273)

          10        20        30        40        50        60     
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CCDS74 SLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDL
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       .: ..  . ::::::.:::::::::: :. :.: ::: .:: : :: :.: ..: : .::
CCDS74 NVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQ
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pF1KB8 GIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHR
        ::.::: :.: .::..:.. . ::.:.:.::::::: : ::::.::  :...:      
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>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (658 aa)
 initn: 1348 init1: 1348 opt: 1348  Z-score: 898.4  bits: 175.5 E(32554): 1e-43
Smith-Waterman score: 1348; 60.9% identity (83.7% similar) in 289 aa overlap (40-328:316-604)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KB8 HKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANLTVHE
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CCDS74 IQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHL
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pF1KB8 RIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQGIHS
       :::::::::.: ::::::::::.:. :.::::: ::: : ::::.:.  . ::.::  :.
CCDS74 RIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHT
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pF1KB8 GEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHRGKKV
       ::: ::: :::::::.:. :  :.:.:::::::.: ::::.::.::.:.::.: : :.: 
CCDS74 GEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKP
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pF1KB8 YKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKPYKCN
       :.:..:::.  ..:.. .:::::::::::::..:::.:   ..:..:::.:  ::::.::
CCDS74 YECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECN
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pF1KB8 ECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTFRQTSQVILHLRTHTKEKPYKCSECGK
       .::.::..   :..:::.:::::::.::.::..: :.: .: : : ::::::: :.::::
CCDS74 QCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGK
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pF1KB8 AYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS                                      
       .. .::.: ::.: :. ::                                         
CCDS74 SFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTH
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>--
 initn: 1377 init1: 495 opt: 500  Z-score: 348.9  bits: 73.9 E(32554): 4.1e-13
Smith-Waterman score: 500; 47.9% identity (74.3% similar) in 144 aa overlap (36-179:172-315)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB8 RNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANL
                                     .:   .. .. .::   :   ..  .. .:
CCDS74 SLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDL
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pF1KB8 TVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQ
       .: ..  . ::::::.:::::::::: :. :.: ::: .:: : :: :.: ..: : .::
CCDS74 NVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQ
             210       220       230       240       250       260 

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pF1KB8 GIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHR
        ::.::: :.: .::..:.. . ::.:.:.::::::: : ::::.::  :...:      
CCDS74 RIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHT
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pF1KB8 GKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKP
                                                                   
CCDS74 GEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKP
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>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (670 aa)
 initn: 1348 init1: 1348 opt: 1348  Z-score: 898.3  bits: 175.6 E(32554): 1e-43
Smith-Waterman score: 1348; 60.9% identity (83.7% similar) in 289 aa overlap (40-328:328-616)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KB8 HKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANLTVHE
                                     .::... .. : :.:::::: :: .:: : 
CCDS12 IQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHL
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pF1KB8 RIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQGIHS
       :::::::::.: ::::::::::.:. :.::::: ::: : ::::.:.  . ::.::  :.
CCDS12 RIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHT
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pF1KB8 GEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHRGKKV
       ::: ::: :::::::.:. :  :.:.:::::::.: ::::.::.::.:.::.: : :.: 
CCDS12 GEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKP
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pF1KB8 YKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKPYKCN
       :.:..:::.  ..:.. .:::::::::::::..:::.:   ..:..:::.:  ::::.::
CCDS12 YECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECN
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pF1KB8 ECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTFRQTSQVILHLRTHTKEKPYKCSECGK
       .::.::..   :..:::.:::::::.::.::..: :.: .: : : ::::::: :.::::
CCDS12 QCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGK
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pF1KB8 AYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS                                      
       .. .::.: ::.: :. ::                                         
CCDS12 SFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTH
       600       610       620       630       640       650       

>--
 initn: 1377 init1: 495 opt: 500  Z-score: 348.8  bits: 73.9 E(32554): 4.1e-13
Smith-Waterman score: 500; 47.9% identity (74.3% similar) in 144 aa overlap (36-179:184-327)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB8 RNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANL
                                     .:   .. .. .::   :   ..  .. .:
CCDS12 SLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDL
           160       170       180       190       200       210   

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pF1KB8 TVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQ
       .: ..  . ::::::.:::::::::: :. :.: ::: .:: : :: :.: ..: : .::
CCDS12 NVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQ
           220       230       240       250       260       270   

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB8 GIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHR
        ::.::: :.: .::..:.. . ::.:.:.::::::: : ::::.::  :...:      
CCDS12 RIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHT
           280       290       300       310       320       330   

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB8 GKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKP
                                                                   
CCDS12 GEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKP
           340       350       360       370       380       390   

>>CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (682 aa)
 initn: 1348 init1: 1348 opt: 1348  Z-score: 898.2  bits: 175.6 E(32554): 1e-43
Smith-Waterman score: 1348; 60.9% identity (83.7% similar) in 289 aa overlap (40-328:340-628)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KB8 HKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANLTVHE
                                     .::... .. : :.:::::: :: .:: : 
CCDS54 IQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHL
     310       320       330       340       350       360         

      70        80        90       100       110       120         
pF1KB8 RIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQGIHS
       :::::::::.: ::::::::::.:. :.::::: ::: : ::::.:.  . ::.::  :.
CCDS54 RIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHT
     370       380       390       400       410       420         

     130       140       150       160       170       180         
pF1KB8 GEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHRGKKV
       ::: ::: :::::::.:. :  :.:.:::::::.: ::::.::.::.:.::.: : :.: 
CCDS54 GEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKP
     430       440       450       460       470       480         

     190       200       210       220       230       240         
pF1KB8 YKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKPYKCN
       :.:..:::.  ..:.. .:::::::::::::..:::.:   ..:..:::.:  ::::.::
CCDS54 YECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECN
     490       500       510       520       530       540         

     250       260       270       280       290       300         
pF1KB8 ECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTFRQTSQVILHLRTHTKEKPYKCSECGK
       .::.::..   :..:::.:::::::.::.::..: :.: .: : : ::::::: :.::::
CCDS54 QCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGK
     550       560       570       580       590       600         

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pF1KB8 AYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS                                      
       .. .::.: ::.: :. ::                                         
CCDS54 SFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTH
     610       620       630       640       650       660         

>--
 initn: 1291 init1: 495 opt: 500  Z-score: 348.7  bits: 73.9 E(32554): 4.2e-13
Smith-Waterman score: 500; 47.9% identity (74.3% similar) in 144 aa overlap (36-179:196-339)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB8 RNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANL
                                     .:   .. .. .::   :   ..  .. .:
CCDS54 SLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDL
         170       180       190       200       210       220     

          70        80        90       100       110       120     
pF1KB8 TVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQ
       .: ..  . ::::::.:::::::::: :. :.: ::: .:: : :: :.: ..: : .::
CCDS54 NVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQ
         230       240       250       260       270       280     

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB8 GIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHR
        ::.::: :.: .::..:.. . ::.:.:.::::::: : ::::.::  :...:      
CCDS54 RIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHT
         290       300       310       320       330       340     

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB8 GKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKP
                                                                   
CCDS54 GEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKP
         350       360       370       380       390       400     

>>CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3             (754 aa)
 initn: 2569 init1: 1329 opt: 1329  Z-score: 885.5  bits: 173.4 E(32554): 5.3e-43
Smith-Waterman score: 1329; 59.9% identity (84.3% similar) in 287 aa overlap (42-328:431-717)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KB8 TVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANLTVHERI
                                     :... .. : :.:::::. .:..:  :.:.
CCDS27 HQRIHTGEKPYECNECGKTFRQTSQLIVHLRTHTGEKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRL
              410       420       430       440       450       460

              80        90       100       110       120       130 
pF1KB8 HTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQGIHSGE
       :.:::::::.::.:::..:: :. :.: ::: ::: :.:::..:  .. : ::: .:.:.
CCDS27 HNGEKPYKCNECAKAFTQSSRLTDHQRTHTGEKPYECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGK
              470       480       490       500       510       520

             140       150       160       170       180       190 
pF1KB8 KTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHRGKKVYK
       : :.:.:::.::  . .::.:.:.::::::: : :::::::::. : .:: .: :.: ::
CCDS27 KPYKCNECGRAFCSNRNLIDHQRIHTGEKPYECSECGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYK
              530       540       550       560       570       580

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB8 CKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKPYKCNEC
       :.::::. ..:.....:.::::::::.::.::::.: : : : .:::::  :::::::::
CCDS27 CSECGKAFNQNSQLIEHERIHTGEKPFECSECGKAFGLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCNEC
              590       600       610       620       630       640

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB8 GKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTFRQTSQVILHLRTHTKEKPYKCSECGKAY
       ::.:..: .:. :::.:::::::.::::::.:  .:....: :::: ::::::..::::.
CCDS27 GKSFNQNSHLIIHQRIHTGEKPYECNECGKVFSYSSSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGKAF
              650       660       670       680       690       700

             320       330                                   
pF1KB8 RYSSQLIQHQRKHNEEKETS                                  
         ::::: ::: :. ::                                     
CCDS27 SDSSQLIVHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQRSTFNHHQRTHTGEKSSGLAWSVS
              710       720       730       740       750    

>>CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19           (475 aa)
 initn: 1310 init1: 1310 opt: 1315  Z-score: 878.5  bits: 171.4 E(32554): 1.3e-42
Smith-Waterman score: 1315; 59.8% identity (81.1% similar) in 296 aa overlap (32-327:180-475)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KB8 RRKTRNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQ
                                     ::  .   ..:..  ...: : :::: :: 
CCDS12 TFIQQTFLTLHQIINNEDRPYECKKCGKAFSQNSQFIQHQRIHIGEKSYECKECGKFFSC
     150       160       170       180       190       200         

              70        80        90       100       110       120 
pF1KB8 SANLTVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHL
       ....: : .:::::::..::::::::: :: :  :.::::: ::: :.::::.::  :.:
CCDS12 GSHVTRHLKIHTGEKPFECKECGKAFSCSSYLSQHQRIHTGKKPYECKECGKAFSYCSNL
     210       220       230       240       250       260         

             130       140       150       160       170       180 
pF1KB8 IRHQGIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQ
       : :: ::.::: :::: :::::..:: :..: :.::::::: : ::::::..::.:.:::
CCDS12 IDHQRIHTGEKPYECKVCGKAFTKSSQLFQHARIHTGEKPYECKECGKAFTQSSKLVQHQ
     270       280       290       300       310       320         

             190       200       210       220       230       240 
pF1KB8 RMHRGKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHR
       :.: :.: :.::::::. .:.. . .:::::::::::.: ::::.:   . : .:::.: 
CCDS12 RIHTGEKPYECKECGKAFSSGSALTNHQRIHTGEKPYDCKECGKAFTQSSQLRQHQRIHA
     330       340       350       360       370       380         

             250       260       270       280       290       300 
pF1KB8 REKPYKCNECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTFRQTSQVILHLRTHTKEKP
        :::..: :::::::.: .: .:::.:: ::::.::::::.: . :..  ::: :: :::
CCDS12 GEKPFECLECGKAFTQNSQLFQHQRIHTDEKPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGEKP
     390       400       410       420       430       440         

             310       320       330 
pF1KB8 YKCSECGKAYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS
       :.:.:::::.  .:.::.::  :...    
CCDS12 YNCKECGKAFSSGSDLIRHQGIHTNK    
     450       460       470         

>>CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5                (461 aa)
 initn: 1310 init1: 1310 opt: 1312  Z-score: 876.7  bits: 171.0 E(32554): 1.6e-42
Smith-Waterman score: 1312; 57.9% identity (81.6% similar) in 299 aa overlap (26-324:162-460)

                    10        20        30        40        50     
pF1KB8      MRRKTRNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTEC
                                     :  :  ::  . ....:... .. : : ::
CCDS44 CNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKEC
             140       150       160       170       180       190 

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB8 GKAFSQSANLTVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSF
       :::: ....:  :::::::::::::.::::::..: ::.::.: ::: ::: :.::::.:
CCDS44 GKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECGKAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAF
             200       210       220       230       240       250 

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB8 SGKSHLIRHQGIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSS
       : . ::: ::  :.::: :::..::::::.:: :  :.: :::::::.: .:::.::.:.
CCDS44 SQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFSKSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQST
             260       270       280       290       300       310 

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB8 NLTQHQRMHRGKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNE
        : .:::.: : : ..:.::::. ..:... .:.:::::::::::  ::: :  :..:. 
CCDS44 YLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTV
             320       330       340       350       360       370 

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB8 HQRLHRREKPYKCNECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTFRQTSQVILHLRT
       :: .:  ::::.::::::::...  :..:::.:::::::.:..:::.: ..:.. .: ::
CCDS44 HQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRT
             380       390       400       410       420       430 

         300       310       320       330 
pF1KB8 HTKEKPYKCSECGKAYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS
       :: ::::.:.:::::.  :..: .::: :       
CCDS44 HTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTHT      
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>>CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3              (544 aa)
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        :.. .  : : :: :.::::::::::.  :  ::.:::.:. ::               
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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