Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0080
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0080, 431 aa
  1>>>pF1KSDA0080 431 - 431 aa - 431 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7519+/-0.00093; mu= 15.5524+/- 0.056
 mean_var=86.1457+/-16.779, 0's: 0 Z-trim(107.4): 115  B-trim: 140 in 2/48
 Lambda= 0.138184
 statistics sampled from 9399 (9536) to 9399 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.293), width:  16
 Scan time:  2.360

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1122.1 SYT11 gene_id:23208|Hs108|chr1          ( 431) 2851 578.4 4.6e-165
CCDS11922.1 SYT4 gene_id:6860|Hs108|chr18          ( 425) 1497 308.5 8.2e-84
CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19          ( 382)  811 171.7 1.1e-42
CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19          ( 386)  797 168.9 7.7e-42
CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12          ( 419)  788 167.1 2.9e-41
CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1          ( 419)  787 166.9 3.3e-41
CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12           ( 422)  785 166.5 4.4e-41
CCDS31577.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11          ( 403)  774 164.3 1.9e-40
CCDS73298.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11          ( 447)  774 164.4 2.1e-40
CCDS58139.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11          ( 478)  774 164.4 2.2e-40
CCDS871.1 SYT6 gene_id:148281|Hs108|chr1           ( 425)  750 159.6 5.5e-39
CCDS8732.1 SYT10 gene_id:341359|Hs108|chr12        ( 523)  740 157.6 2.6e-38
CCDS12798.1 SYT3 gene_id:84258|Hs108|chr19         ( 590)  724 154.5 2.6e-37
CCDS7778.1 SYT9 gene_id:143425|Hs108|chr11         ( 491)  711 151.8 1.4e-36
CCDS81952.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16        ( 413)  619 133.4 3.9e-31
CCDS76835.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16        ( 470)  619 133.5 4.3e-31
CCDS10575.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16        ( 474)  619 133.5 4.4e-31
CCDS73934.1 DOC2B gene_id:8447|Hs108|chr17         ( 412)  539 117.5 2.5e-26
CCDS8154.1 SYT12 gene_id:91683|Hs108|chr11         ( 421)  438 97.4 2.9e-20
CCDS73103.1 SYT15 gene_id:83849|Hs108|chr10        ( 421)  434 96.6   5e-20
CCDS7726.2 SYT8 gene_id:90019|Hs108|chr11          ( 401)  418 93.4 4.4e-19
CCDS31470.1 SYT13 gene_id:57586|Hs108|chr11        ( 426)  412 92.2 1.1e-18
CCDS73104.1 SYT15 gene_id:83849|Hs108|chr10        ( 390)  343 78.4 1.4e-14
CCDS298.1 SYTL1 gene_id:84958|Hs108|chr1           ( 550)  294 68.7 1.6e-11
CCDS53286.1 SYTL1 gene_id:84958|Hs108|chr1         ( 562)  294 68.7 1.6e-11
CCDS10666.1 DOC2A gene_id:8448|Hs108|chr16         ( 400)  291 68.0 1.8e-11
CCDS31904.1 RPH3A gene_id:22895|Hs108|chr12        ( 690)  285 67.0 6.5e-11
CCDS44979.1 RPH3A gene_id:22895|Hs108|chr12        ( 694)  285 67.0 6.6e-11


>>CCDS1122.1 SYT11 gene_id:23208|Hs108|chr1               (431 aa)
 initn: 2851 init1: 2851 opt: 2851  Z-score: 3076.9  bits: 578.4 E(32554): 4.6e-165
Smith-Waterman score: 2851; 99.8% identity (100.0% similar) in 431 aa overlap (1-431:1-431)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKHKNPPYKFIHMLK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS11 MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKQKNPPYKFIHMLK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GISIYPETLSNKKKIIKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSGSCID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GISIYPETLSNKKKIIKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSGSCID
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD QLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD AHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD YQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD ESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCESPRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCESPRK
              370       380       390       400       410       420

              430 
pF1KSD PVAKWHSLSEY
       :::::::::::
CCDS11 PVAKWHSLSEY
              430 

>>CCDS11922.1 SYT4 gene_id:6860|Hs108|chr18               (425 aa)
 initn: 1124 init1: 825 opt: 1497  Z-score: 1618.2  bits: 308.5 E(32554): 8.2e-84
Smith-Waterman score: 1497; 53.0% identity (79.5% similar) in 434 aa overlap (1-430:1-424)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKHKNPPYKFIHMLK
       :: ::. :  ::  :.:.:...:  ::  ::.  :.: ::.... :..:.:::::.:.::
CCDS11 MAPITTSREEFDEIPTVVGIFSAFGLVFTVSL--FAWICCQRKSSKSNKTPPYKFVHVLK
               10        20        30          40        50        

               70        80          90       100        110       
pF1KSD GISIYPETLSNKKKIIKVRRD--KDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSR-DKDPRGPSSGS
       :..::::.:..:::.    ..  :. :.    . .: .:  .  : .   :    :.: :
CCDS11 GVDIYPENLNSKKKFGADDKNEVKNKPAVP--KNSLHLDLEKRDLNGNFPKTNLKPGSPS
       60        70        80          90       100       110      

       120       130       140        150       160       170      
pF1KSD CIDQLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKT-TSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVV
        ...   :.     :..   :..:   :. :: .: :..  ::.: ::..::: .::.::
CCDS11 DLENATPKL----FLEGEKESVSPESLKSSTSLTSEEKQEKLGTLFFSLEYNFERKAFVV
        120           130       140       150       160       170  

        180       190       200       210       220       230      
pF1KSD TIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQ
       .:.::.:::.::.:.. :::::::::::.:.:.::::::::::::.::::::::::::.:
CCDS11 NIKEARGLPAMDEQSMTSDPYIKMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDPAFDETFTFYGIPYTQ
            180       190       200       210       220       230  

        240       250       260       270       280       290      
pF1KSD LQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQ
       .:.:.::: .::::::::::.::::..::.:.. : ::. ..:.:::::..:  .:::: 
CCDS11 IQELALHFTILSFDRFSRDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMNREIIKRNVRKSSGRGELL
            240       250       260       270       280       290  

        300       310       320       330       340       350      
pF1KSD VSLSYQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLN
       .:: :: ... .:::::::::::: :..::: .::::::.:...:::.:::::::::: :
CCDS11 ISLCYQSTTNTLTVVVLKARHLPKSDVSGLS-DPYVKVNLYHAKKRISKKKTHVKKCTPN
            300       310       320        330       340       350 

        360       370       380       390       400       410      
pF1KSD PIFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCE
        .::: :..::: . : :::.::::.: .: ..:::.:.:.::: .. ..:.:::.:.:.
CCDS11 AVFNELFVFDIPCEGLEDISVEFLVLDSERGSRNEVIGQLVLGA-AAEGTGGEHWKEICD
             360       370       380       390        400       410

        420       430 
pF1KSD SPRKPVAKWHSLSEY
        ::. .:::: : . 
CCDS11 YPRRQIAKWHVLCDG
              420     

>>CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19               (382 aa)
 initn: 613 init1: 253 opt: 811  Z-score: 879.8  bits: 171.7 E(32554): 1.1e-42
Smith-Waterman score: 811; 42.0% identity (67.9% similar) in 333 aa overlap (108-428:48-370)

        80        90       100       110       120       130       
pF1KSD VRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSGSCIDQLPIKMDYGEELRSPIT
                                     :: : :   :   : :  .    .: .:..
CCDS74 HGSWSSLLCVGLKGRLGWEWGTRVLECLCRKDSRTPPPCSRSPQ-PRGLHRPTRLPTPVA
        20        30        40        50        60         70      

       140            150           160       170       180        
pF1KSD SLTPG-----ESKTTSPSSPEEDVM----LGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPVMD
       : :       :    .::.: ..:     :: : .:.::.: .  :.: : .: :: ..:
CCDS74 SATAQVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHELGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALD
         80        90       100       110       120       130      

      190       200       210       220       230       240        
pF1KSD DQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLS
           .::::... .:::::.: .:.: :.::.: : :::.:  .:: .:   :: . : .
CCDS74 -LGGSSDPYVRVYLLPDKRRRYETKVHRQTLNPHFGETFAFK-VPYVELGGRVLVMAVYD
         140       150       160       170        180       190    

      250       260       270        280         290       300     
pF1KSD FDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGK-VQLTRDI--IKRNIQKCISRGELQVSLSYQPVA
       ::::::.:.:::: ::...::   :. ::  :..    :. .:    :..  :: : :.:
CCDS74 FDRFSRNDAIGEVRVPMSSVD--LGRPVQAWRELQAAPREEEKL---GDICFSLRYVPTA
          200       210         220       230          240         

         310       320       330       340       350       360     
pF1KSD QRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNESFIY
        ..::.::.:..: :::. ::: .:::::..  : :.. :::: .:: :::: .::.: .
CCDS74 GKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLS-DPYVKVHLLQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSF
     250       260       270        280       290       300        

         370       380       390       400       410       420     
pF1KSD DIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCESPRKPVAKW
       ..: : .  ...:. :.:.:.  :::..::. .:: .. ..: .:: ..  .::.:.:.:
CCDS74 EVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRVAVGA-AAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQW
      310       320       330       340        350       360       

         430          
pF1KSD HSLSEY         
       :::            
CCDS74 HSLRPPDRVRLLPAP
       370       380  

>>CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19               (386 aa)
 initn: 666 init1: 253 opt: 797  Z-score: 864.6  bits: 168.9 E(32554): 7.7e-42
Smith-Waterman score: 797; 43.0% identity (71.2% similar) in 302 aa overlap (133-428:79-374)

            110       120       130       140        150           
pF1KSD LLSRDKDPRGPSSGSCIDQLPIKMDYGEELRSPITSLTPG-ESKTTSPSSPEEDVM----
                                     .: : .. :  :    .::.: ..:     
CCDS12 CLYRKSCRRRTGKKSQAQAQVHLQEVKGLGQSYIDKVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHE
       50        60        70        80        90       100        

       160       170       180       190       200       210       
pF1KSD LGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRK
       :: : .:.::.: .  :.: : .: :: ..:    .::::... .:::::.: .:.: :.
CCDS12 LGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALD-LGGSSDPYVRVYLLPDKRRRYETKVHRQ
      110       120       130        140       150       160       

       220       230       240       250       260       270       
pF1KSD TLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGK-VQ
       ::.: : :::.:  .:: .:   :: . : .::::::.:.:::: ::...::   :. ::
CCDS12 TLNPHFGETFAFK-VPYVELGGRVLVMAVYDFDRFSRNDAIGEVRVPMSSVD--LGRPVQ
       170       180        190       200       210         220    

        280       290       300       310       320       330      
pF1KSD LTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLSYQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNV
         :..     ..  . :..  :: : :.: ..::.::.:..: :::. ::: .:::::..
CCDS12 AWRELQAAPREEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLS-DPYVKVHL
          230       240       250       260       270        280   

        340       350       360       370       380       390      
pF1KSD YYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRL
         : :.. :::: .:: :::: .::.: ...: : .  ...:. :.:.:.  :::..::.
CCDS12 LQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRV
           290       300       310       320       330       340   

        400       410       420       430          
pF1KSD ILGAHSVTASGAEHWREVCESPRKPVAKWHSLSEY         
        .:: .. ..: .:: ..  .::.:.:.::::            
CCDS12 AVGA-AAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQWHSLRPPDRVRLLPAP
            350       360       370       380      

>>CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12               (419 aa)
 initn: 588 init1: 231 opt: 788  Z-score: 854.4  bits: 167.1 E(32554): 2.9e-41
Smith-Waterman score: 788; 39.7% identity (69.6% similar) in 335 aa overlap (103-428:84-405)

             80        90       100       110         120       130
pF1KSD KKIIKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSG--SCIDQLPIKMDYGE
                                     :... .  .:  .:  . :..  .: : :.
CCDS76 IPLPPWALIAIAIVAVLLVLTCCFCICKKCLFKKKNKKKGKEKGGKNAINMKDVK-DLGK
            60        70        80        90       100        110  

                  140       150       160       170       180      
pF1KSD ELRSPI----TSLTPGESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPV
        ...      :.:: :: :      :.:.  ::.: .:.::.: .. :.: : .:  ::.
CCDS76 TMKDQDDDAETGLTDGEEKEE----PKEEEKLGKLQYSLDYDFQNNQLLVGIIQAAELPA
            120       130           140       150       160        

        190       200       210       220       230       240      
pF1KSD MDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLV
       .: .   ::::.:. .::::... .:.: ::::.:::.: :::  .:::.:   .: . :
CCDS76 LD-MGGTSDPYVKVFLLPDKKKKFETKVHRKTLNPVFNEQFTFK-VPYSELGGKTLVMAV
      170        180       190       200       210        220      

        250       260       270        280       290       300     
pF1KSD LSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKV-QLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLSYQPVA
        .:::::. :.:::  ::.  ::   :.: .  ::. . . ..  . :..  :: : :.:
CCDS76 YDFDRFSKHDIIGEFKVPMNTVD--FGHVTEEWRDLQSAEKEEQEKLGDICFSLRYVPTA
        230       240         250       260       270       280    

         310       320       330       340       350       360     
pF1KSD QRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNESFIY
        ..:::.:.:..: :::. ::: .::::.... . ::. :::: .:: :::: .:::: .
CCDS76 GKLTVVILEAKNLKKMDVGGLS-DPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTIKKNTLNPYYNESFSF
          290       300        310       320       330       340   

         370       380       390       400         410       420   
pF1KSD DIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAE--HWREVCESPRKPVA
       ..: . .  ...   :.:.:.  ::...:....: .:   .:::  :: ..  .::.:.:
CCDS76 EVPFEQIQKVQVVVTVLDYDKIGKNDAIGKVFVGYNS---TGAELRHWSDMLANPRRPIA
           350       360       370       380          390       400

           430            
pF1KSD KWHSLSEY           
       .::.:              
CCDS76 QWHTLQVEEEVDAMLAVKK
              410         

>>CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1               (419 aa)
 initn: 661 init1: 234 opt: 787  Z-score: 853.3  bits: 166.9 E(32554): 3.3e-41
Smith-Waterman score: 790; 39.9% identity (70.6% similar) in 326 aa overlap (106-428:93-405)

          80        90       100       110       120       130     
pF1KSD IKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSGSCIDQLPIKMDYGEELRSP
                                     ..:  .: .  . ...  .:   :..  . 
CCDS14 WALIAIAVVAGLLLLTCCFCICKKCCCKKKKNKKEKGKGMKNAMNMKDMK--GGQDDDDA
             70        80        90       100       110         120

         140       150       160       170       180       190     
pF1KSD ITSLTPGESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPVMDDQTQGSD
        :.:: ::..    . ::.   ::.: ::.::.:  . :.: . .:  ::..: .   ::
CCDS14 ETGLTEGEGEGEEEKEPEN---LGKLQFSLDYDFQANQLTVGVLQAAELPALD-MGGTSD
              130          140       150       160       170       

         200       210       220       230       240       250     
pF1KSD PYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLSFDRFSRD
       ::.:. .::::... .:.: ::::.:.:.:::::  .::..:   .: . . .:::::. 
CCDS14 PYVKVFLLPDKKKKYETKVHRKTLNPAFNETFTFK-VPYQELGGKTLVMAIYDFDRFSKH
        180       190       200       210        220       230     

         260       270        280       290       300       310    
pF1KSD DVIGEVMVPLAGVDPSTGK-VQLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLSYQPVAQRMTVVVLK
       :.:::: ::.  ::   :. ..  ::.   . ..  . :.. .:: : :.: ..:: .:.
CCDS14 DIIGEVKVPMNTVD--LGQPIEEWRDLQGGEKEEPEKLGDICTSLRYVPTAGKLTVCILE
         240         250       260       270       280       290   

          320       330       340       350       360       370    
pF1KSD ARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNESFIYDIPTDLLPD
       :..: :::. ::: .::::.... . ::. :::: ::: :::: ::::: ..:: . .  
CCDS14 AKNLKKMDVGGLS-DPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTVKKKTLNPYFNESFSFEIPFEQIQK
           300        310       320       330       340       350  

          380       390       400         410       420       430  
pF1KSD ISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAE--HWREVCESPRKPVAKWHSLSEY 
       ...   :.:.:.  :::..:....:..   :.:.:  :: ..  .::.:.:.::::    
CCDS14 VQVVVTVLDYDKLGKNEAIGKIFVGSN---ATGTELRHWSDMLANPRRPIAQWHSLKPEE
            360       370          380       390       400         

CCDS14 EVDALLGKNK
     410         

>>CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12                (422 aa)
 initn: 588 init1: 231 opt: 785  Z-score: 851.1  bits: 166.5 E(32554): 4.4e-41
Smith-Waterman score: 785; 39.3% identity (68.9% similar) in 338 aa overlap (103-428:84-408)

             80        90       100       110         120       130
pF1KSD KKIIKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSG--SCIDQLPIKMDYGE
                                     :... .  .:  .:  . :..  .: : :.
CCDS90 IPLPPWALIAIAIVAVLLVLTCCFCICKKCLFKKKNKKKGKEKGGKNAINMKDVK-DLGK
            60        70        80        90       100        110  

                     140       150       160       170       180   
pF1KSD ELRSPI-------TSLTPGESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHG
        ...         :.:: :: :      :.:.  ::.: .:.::.: .. :.: : .:  
CCDS90 TMKDQALKDDDAETGLTDGEEKEE----PKEEEKLGKLQYSLDYDFQNNQLLVGIIQAAE
            120       130           140       150       160        

           190       200       210       220       230       240   
pF1KSD LPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLH
       ::..: .   ::::.:. .::::... .:.: ::::.:::.: :::  .:::.:   .: 
CCDS90 LPALD-MGGTSDPYVKVFLLPDKKKKFETKVHRKTLNPVFNEQFTFK-VPYSELGGKTLV
      170        180       190       200       210        220      

           250       260       270        280       290       300  
pF1KSD FLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKV-QLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLSYQ
       . : .:::::. :.:::  ::.  ::   :.: .  ::. . . ..  . :..  :: : 
CCDS90 MAVYDFDRFSKHDIIGEFKVPMNTVD--FGHVTEEWRDLQSAEKEEQEKLGDICFSLRYV
        230       240       250         260       270       280    

            310       320       330       340       350       360  
pF1KSD PVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNES
       :.: ..:::.:.:..: :::. ::: .::::.... . ::. :::: .:: :::: .:::
CCDS90 PTAGKLTVVILEAKNLKKMDVGGLS-DPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTIKKNTLNPYYNES
          290       300        310       320       330       340   

            370       380       390       400         410       420
pF1KSD FIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAE--HWREVCESPRK
       : ...: . .  ...   :.:.:.  ::...:....: .:   .:::  :: ..  .::.
CCDS90 FSFEVPFEQIQKVQVVVTVLDYDKIGKNDAIGKVFVGYNS---TGAELRHWSDMLANPRR
           350       360       370       380          390       400

              430            
pF1KSD PVAKWHSLSEY           
       :.:.::.:              
CCDS90 PIAQWHTLQVEEEVDAMLAVKK
              410       420  

>>CCDS31577.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11               (403 aa)
 initn: 751 init1: 288 opt: 774  Z-score: 839.6  bits: 164.3 E(32554): 1.9e-40
Smith-Waterman score: 802; 37.5% identity (64.4% similar) in 424 aa overlap (9-428:13-401)

                   10        20        30        40        50      
pF1KSD     MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKHKNPPYKFI
                   :: ::      :. .....: .:::: . . ::   .:  :    .. 
CCDS31 MYRDPEAASPGAPSRDV------LLVSAIITVSLSVTVVLCGLCHWCQRKLGK----RYK
               10              20        30        40            50

         60        70          80        90       100        110   
pF1KSD HMLKGISIYPETLSNK--KKIIKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEA-GLLSRDKDPRGP
       . :. ..  :..  ..  :: ::.      :.  ::.    :..: . :   .:.. :  
CCDS31 NSLETVGT-PDSGRGRSEKKAIKL------PA--GGKA---VNTAPVPGQTPHDESDRRT
                60        70                   80        90        

           120       130       140        150       160       170  
pF1KSD SSGSCIDQLPIKMDYGEELRSPITSLTPG-ESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKK
          : ..      :  . : : .  :.:: :   .  .  .:.  :: . ::: ::: ..
CCDS31 EPRSSVS------DLVNSLTSEMLMLSPGSEEDEAHEGCSREN--LGRIQFSVGYNFQES
      100             110       120       130         140       150

            180       190       200       210       220       230  
pF1KSD ALVVTIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGI
       .:.: :..:. ::.  : .  :::..:. .::::.:...:.: ::.:.: ..::: : :.
CCDS31 TLTVKIMKAQELPA-KDFSGTSDPFVKIYLLPDKKHKLETKVKRKNLNPHWNETFLFEGF
              160        170       180       190       200         

            240       250       260       270       280       290  
pF1KSD PYSQLQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISR
       :: .. . .:.. ::..:::::.: :::: .::  :: .  ..:     .:   .   ::
CCDS31 PYEKVVQRILYLQVLDYDRFSRNDPIGEVSIPLNKVDLT--QMQTFWKDLKPCSDGSGSR
     210       220       230       240         250       260       

            300       310       320       330       340       350  
pF1KSD GELQVSLSYQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKK
       ::: .:: :.: :. . : ..:::.:  ::: : : .::::: ..:  ::. :::: . :
CCDS31 GELLLSLCYNPSANSIIVNIIKARNLKAMDIGGTS-DPYVKVWLMYKDKRVEKKKTVTMK
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pF1KSD CTLNPIFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWR
        .::::::::: .::::. : . .: . :.: :. ..:.:.:.. :. .:   . ..::.
CCDS31 RNLNPIFNESFAFDIPTEKLRETTIIITVMDKDKLSRNDVIGKIYLSWKS-GPGEVKHWK
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            420       430 
pF1KSD EVCESPRKPVAKWHSLSEY
       ..   ::.:::.::.:   
CCDS31 DMIARPRQPVAQWHQLKA 
         390       400    

>>CCDS73298.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11               (447 aa)
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pF1KSD     MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKHKNPPYKFI
                   :: ::      :. .....: .:::: . . ::   .:  :   ::  
CCDS73 MYRDPEAASPGAPSRDV------LLVSAIITVSLSVTVVLCGLCHWCQRKLGKR--YKNS
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pF1KSD HMLKGISIYPETLSNKKKIIKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDK-----DPR
           :     .  :.:: :  . ::  . ..   ...      .  .:. .      :::
CCDS73 LETVGTPDSGRGRSEKKAINDLDRDFWNNNESTVQQKWSSYPPKEFILNISPYAPYGDPR
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pF1KSD G----PSSGSCIDQLPI-------KMDYGEELRSPITSLT---PGESKTTSPSSPEEDVM
            :..:. ..  :.       . :   : :: ...:.    .:    ::.: :... 
CCDS73 LSLKLPAGGKAVNTAPVPGQTPHDESDRRTEPRSSVSDLVNSLTSEMLMLSPGSEEDEAH
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pF1KSD -------LGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRV
              :: . ::: ::: ...:.: :..:. ::.  : .  :::..:. .::::.:..
CCDS73 EGCSRENLGRIQFSVGYNFQESTLTVKIMKAQELPA-KDFSGTSDPFVKIYLLPDKKHKL
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pF1KSD KTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDP
       .:.: ::.:.: ..::: : :.:: .. . .:.. ::..:::::.: :::: .::  :: 
CCDS73 ETKVKRKNLNPHWNETFLFEGFPYEKVVQRILYLQVLDYDRFSRNDPIGEVSIPLNKVDL
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pF1KSD STGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLSYQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNP
       .  ..:     .:   .   ::::: .:: :.: :. . : ..:::.:  ::: : : .:
CCDS73 T--QMQTFWKDLKPCSDGSGSRGELLLSLCYNPSANSIIVNIIKARNLKAMDIGGTS-DP
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pF1KSD YVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKN
       :::: ..:  ::. :::: . : .::::::::: .::::. : . .: . :.: :. ..:
CCDS73 YVKVWLMYKDKRVEKKKTVTMKRNLNPIFNESFAFDIPTEKLRETTIIITVMDKDKLSRN
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pF1KSD EVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCESPRKPVAKWHSLSEY
       .:.:.. :. .:   . ..::...   ::.:::.::.:   
CCDS73 DVIGKIYLSWKS-GPGEVKHWKDMIARPRQPVAQWHQLKA 
      410       420        430       440        

>>CCDS58139.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11               (478 aa)
 initn: 751 init1: 288 opt: 774  Z-score: 838.5  bits: 164.4 E(32554): 2.2e-40
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CCDS58 RLGEKPAPVPPPGEDALRSGGAAPSEPGSGGKAGRGRWRTVQSHLAAGKLNLSKLPAG--
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pF1KSD SGSCIDQLPI-------KMDYGEELRSPITSLT---PGESKTTSPSSPEEDVM-------
        :. ..  :.       . :   : :: ...:.    .:    ::.: :...        
CCDS58 -GKAVNTAPVPGQTPHDESDRRTEPRSSVSDLVNSLTSEMLMLSPGSEEDEAHEGCSREN
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pF1KSD LGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRK
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CCDS58 LGRIQFSVGYNFQESTLTVKIMKAQELPA-KDFSGTSDPFVKIYLLPDKKHKLETKVKRK
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pF1KSD TLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQL
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CCDS58 NLNPHWNETFLFEGFPYEKVVQRILYLQVLDYDRFSRNDPIGEVSIPLNKVDLT--QMQT
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CCDS58 FWKDLKPCSDGSGSRGELLLSLCYNPSANSIIVNIIKARNLKAMDIGGTS-DPYVKVWLM
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CCDS58 YKDKRVEKKKTVTMKRNLNPIFNESFAFDIPTEKLRETTIIITVMDKDKLSRNDVIGKIY
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CCDS58 LSWKSGPGE-VKHWKDMIARPRQPVAQWHQLKA 
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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