Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0050
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0050, 740 aa
  1>>>pF1KSDA0050 740 - 740 aa - 740 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1654+/-0.000471; mu= 4.1831+/- 0.030
 mean_var=331.2036+/-66.576, 0's: 0 Z-trim(120.2): 214  B-trim: 609 in 2/51
 Lambda= 0.070474
 statistics sampled from 34961 (35214) to 34961 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.733), E-opt: 0.2 (0.413), width:  16
 Scan time: 10.340

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_055531 (OMIM: 607763) arf-GAP with coiled-coil, ( 740) 4937 516.5 1.5e-145
NP_036419 (OMIM: 607766) arf-GAP with coiled-coil, ( 778) 1872 204.9 9.9e-52
XP_006713620 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 785) 1828 200.5 2.2e-50
XP_011510905 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 813) 1799 197.5 1.7e-49
XP_011510904 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 820) 1775 195.1 9.5e-49
XP_011510908 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776)  757 91.6 1.3e-17
XP_011510906 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776)  757 91.6 1.3e-17
XP_011510907 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776)  757 91.6 1.3e-17
XP_016861536 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 841)  757 91.6 1.4e-17
XP_016861535 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 848)  757 91.6 1.4e-17
XP_016861538 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 806)  753 91.2 1.8e-17
XP_016861537 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 813)  753 91.2 1.8e-17
XP_016867224 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 462)  445 59.6 3.4e-08
XP_016867222 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 527)  445 59.7 3.7e-08
XP_005250000 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 565)  445 59.7 3.8e-08
XP_016867223 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 580)  445 59.7 3.9e-08
NP_001268229 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 580)  445 59.7 3.9e-08
XP_016867221 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 630)  445 59.8 4.1e-08
XP_011514082 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 683)  445 59.8 4.3e-08
NP_060177 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domain,  ( 903)  446 60.0 4.8e-08
XP_016857174 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 924)  446 60.0 4.9e-08
XP_016857175 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 905)  445 59.9 5.2e-08
NP_114152 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, ANK  ( 911)  445 59.9 5.2e-08
XP_011540057 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 926)  445 59.9 5.3e-08
XP_016857176 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 883)  442 59.6 6.3e-08
XP_016857177 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 793)  434 58.8   1e-07
XP_016857178 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 774)  433 58.6 1.1e-07
NP_001137250 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domai ( 894)  426 58.0   2e-07
NP_055729 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK  ( 804)  407 56.0   7e-07
XP_005246116 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 808)  407 56.0   7e-07
NP_001032208 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 857)  407 56.0 7.3e-07
XP_006712298 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 882)  407 56.1 7.4e-07
XP_006712297 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 886)  407 56.1 7.4e-07
XP_011508851 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1073)  407 56.2 8.4e-07
XP_011508850 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1098)  407 56.2 8.5e-07
XP_016858771 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1106)  407 56.2 8.6e-07
XP_011508849 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1126)  407 56.2 8.7e-07
XP_006712300 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1147)  407 56.2 8.8e-07
XP_006712302 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1151)  407 56.2 8.8e-07
NP_055585 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK  ( 836)  381 53.4 4.5e-06
XP_005268683 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit ( 856)  381 53.4 4.5e-06
XP_005268682 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1172)  381 53.6 5.6e-06
XP_016874261 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1192)  381 53.6 5.6e-06
NP_001116244 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, A (1192)  381 53.6 5.6e-06
XP_011508711 (OMIM: 603817) PREDICTED: arf-GAP wit ( 891)  350 50.3 4.1e-05
XP_011508710 (OMIM: 603817) PREDICTED: arf-GAP wit ( 959)  350 50.3 4.3e-05
NP_001128663 (OMIM: 603817) arf-GAP with SH3 domai ( 961)  350 50.3 4.3e-05
XP_006711965 (OMIM: 603817) PREDICTED: arf-GAP wit ( 964)  350 50.3 4.4e-05
XP_006711964 (OMIM: 603817) PREDICTED: arf-GAP wit ( 970)  350 50.3 4.4e-05
XP_011508709 (OMIM: 603817) PREDICTED: arf-GAP wit ( 975)  350 50.3 4.4e-05


>>NP_055531 (OMIM: 607763) arf-GAP with coiled-coil, ANK  (740 aa)
 initn: 4937 init1: 4937 opt: 4937  Z-score: 2734.1  bits: 516.5 E(85289): 1.5e-145
Smith-Waterman score: 4937; 100.0% identity (100.0% similar) in 740 aa overlap (1-740:1-740)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD VGICDLARLGPPEPMMAECLEKFTVSLNHKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VGICDLARLGPPEPMMAECLEKFTVSLNHKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD REARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 REARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD EDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD RHVLLKQKELGGEEPEPSLREGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFTIQSNQLVYQKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RHVLLKQKELGGEEPEPSLREGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFTIQSNQLVYQKK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD YKDPVTVVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YKDPVTVVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SAFSQARLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SAFSQARLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQC
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD CDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD INQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKLPEIRGRRGGRGRPRGQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 INQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKLPEIRGRRGGRGRPRGQP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD PVPPKPSIRPRPGSLRSKPEPPSEDLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PVPPKPSIRPRPGSLRSKPEPPSEDLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNW
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD VNGGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VNGGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD KRGADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKMREAEAAQGQAGDETYLDIFRDFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KRGADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKMREAEAAQGQAGDETYLDIFRDFS
              670       680       690       700       710       720

              730       740
pF1KSD LMASDDPEKLSRRSHDLHTL
       ::::::::::::::::::::
NP_055 LMASDDPEKLSRRSHDLHTL
              730       740

>>NP_036419 (OMIM: 607766) arf-GAP with coiled-coil, ANK  (778 aa)
 initn: 2432 init1: 709 opt: 1872  Z-score: 1049.7  bits: 204.9 E(85289): 9.9e-52
Smith-Waterman score: 2479; 51.6% identity (75.0% similar) in 779 aa overlap (1-732:1-770)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFV
       : . .::::::::::::::..: ::..:.::: .:.::.::  .....:. . .:.. :.
NP_036 MKMTVDFEECLKDSPRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQFM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD VGICDLARLGPPEPMMAECLEKFTVSLNHKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGF
        :: :::. .  . ..   : ::. ::.. .. :. :.: ::.... :.:..::: :: :
NP_036 NGIRDLAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD REARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVI
       ..:...: . .:  : ::..::.: : . .:.:::   : ..:  .:  ::::.:::::.
NP_036 KDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD EDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQ
       ..::. .:.. .: .. :. . :.::.. .:.:. : :.::::: .::...:.:::.:::
NP_036 QSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260        270       280       290         
pF1KSD RHVLLKQKELGGEEPEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFTIQSNQLVYQK
       .:  ..::...... .     .. .:.::::.::::::::::::.::::.::.:::::::
NP_036 KHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNNQLVYQK
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD KYKDPVTVVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSI
       :.::  ::::.:::::::: : : :::::::::: .:::.::::::.: : :..:::.::
NP_036 KFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSI
              310       320       330       340       350       360

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD ASAFSQARLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQ
       :.:. . . :.: .   ..:      :...: ::. .. .   : . .. .:: . :::.
NP_036 ATAYRE-KGDESEKLDKKSSP-----STGSLDSGNESKEKLLKGES-ALQRVQCIPGNAS
               370       380            390       400        410   

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD CCDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNV
       ::::    :.:::::::.::::.:::::::::::::::::::::.:::::.:::::::: 
NP_036 CCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGND
           420       430       440       450       460       470   

     480       490       500       510       520             530   
pF1KSD IINQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKL------PEIRGRRGGR
       .::..::: :: :..::: :. .::::::.:.:::::.::. :       :: . .  ..
NP_036 VINRVYEANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSK
           480       490        500       510       520       530  

                      540                        550       560     
pF1KSD GR-----------PRGQPPVPPKPSIR-----------------PRPGSLRSKPEPPSE-
       .            :  :  .  . :.:                 :   :  :  :: .: 
NP_036 SSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGER
            540       550       560       570       580       590  

                 570       580       590       600       610       
pF1KSD -------DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQATAA
              :   :.::  :.::: .  .:: ::.::::::::::.:. ...:::::::. .
NP_036 QDSSMFLDSKHLNPGLQLYRAS-YEKNLPKMAEALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLG
            600       610        620       630       640       650 

       620       630       640       650       660       670       
pF1KSD NSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGRDPL
       .::..::::::::::::: :  :::::::::.::::: .::::::::.  : : ::.:::
NP_036 GSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPL
             660       670       680       690       700       710 

       680       690           700       710       720       730   
pF1KSD TIAMETANADIVTLLRLAKM----REAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRR
       .::.:.::::::::::::.:    ::.:.  :: ::::: ::::::: :::..::::.: 
NP_036 SIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRF
             720       730       740       750       760       770 

           740
pF1KSD SHDLHTL
              
NP_036 QQDSQKF
              

>>XP_006713620 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co  (785 aa)
 initn: 2310 init1: 709 opt: 1828  Z-score: 1025.5  bits: 200.5 E(85289): 2.2e-50
Smith-Waterman score: 2430; 51.0% identity (74.1% similar) in 781 aa overlap (1-727:1-772)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFV
       : . .::::::::::::::..: ::..:.::: .:.::.::  .....:. . .:.. :.
XP_006 MKMTVDFEECLKDSPRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQFM
               10        20        30        40        50        60

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pF1KSD VGICDLARLGPPEPMMAECLEKFTVSLNHKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGF
        :: :::. .  . ..   : ::. ::.. .. :. :.: ::.... :.:..::: :: :
XP_006 NGIRDLAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKF
               70        80        90       100       110       120

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pF1KSD REARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVI
       ..:...: . .:  : ::..::.: : . .:.:::   : ..:  .:  ::::.:::::.
XP_006 KDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVL
              130       140       150       160       170       180

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pF1KSD EDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQ
       ..::. .:.. .: .. :. . :.::.. .:.:. : :.::::: .::...:.:::.:::
XP_006 QSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQ
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              250       260        270       280              290  
pF1KSD RHVLLKQKELGGEEPEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSR-------RWFTIQS
       .:  ..::...... .     .. .:.::::.::::::::::::.:       :::.::.
XP_006 KHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRKKPDHIRRWFSIQN
              250       260       270       280       290       300

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pF1KSD NQLVYQKKYKDPVTVVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWV
       ::::::::.::  ::::.:::::::: : : :::::::::: .:::.::::::.: : :.
XP_006 NQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWI
              310       320       330       340       350       360

            360       370       380       390       400       410  
pF1KSD SAVQSSIASAFSQARLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQ
       .:::.:::.:. . . :.: .   ..:      :...: ::. .. .   : . .. .::
XP_006 KAVQTSIATAYRE-KGDESEKLDKKSSP-----STGSLDSGNESKEKLLKGES-ALQRVQ
              370        380            390       400        410   

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pF1KSD SVDGNAQCCDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKL
        . :::.::::    :.:::::::.::::.:::::::::::::::::::::.:::::.::
XP_006 CIPGNASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKL
           420       430       440       450       460       470   

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pF1KSD MCELGNVIINQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKL------PEI
       :::::: .::..::: :: :..::: :. .::::::.:.:::::.::. :       :: 
XP_006 MCELGNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQ
           480       490       500        510       520       530  

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pF1KSD RGRRGGRGR-----------PRGQPPVPPKPSIR-----------------PRPGSLRSK
       . .  ...            :  :  .  . :.:                 :   :  : 
XP_006 QKKFVSKSSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSL
            540       550       560       570       580       590  

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pF1KSD PEPPSE--------DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGGQDNATP
        :: .:        :   :.::  :.::: .  .:: ::.::::::::::.:. ...:::
XP_006 YEPEGERQDSSMFLDSKHLNPGLQLYRAS-YEKNLPKMAEALAHGADVNWANSEENKATP
            600       610       620        630       640       650 

              620       630       640       650       660       670
pF1KSD LIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGARD
       ::::. ..::..::::::::::::: :  :::::::::.::::: .::::::::.  : :
XP_006 LIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGANQHATD
             660       670       680       690       700       710 

              680       690           700       710       720      
pF1KSD SEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKM----REAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDD
        ::.:::.::.:.::::::::::::.:    ::.:.  :: ::::: ::::::: :::..
XP_006 EEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQMASNN
             720       730       740       750       760       770 

        730       740
pF1KSD PEKLSRRSHDLHTL
       :             
XP_006 PEKLNRFQQDSQKF
             780     

>>XP_011510905 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co  (813 aa)
 initn: 2497 init1: 709 opt: 1799  Z-score: 1009.4  bits: 197.5 E(85289): 1.7e-49
Smith-Waterman score: 2269; 49.3% identity (71.7% similar) in 777 aa overlap (1-699:1-768)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFV
       : . .::::::::::::::..: ::..:.::: .:.::.::  .....:. . .:.. :.
XP_011 MKMTVDFEECLKDSPRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQFM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD VGICDLARLGPPEPMMAECLEKFTVSLNHKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGF
        :: :::. .  . ..   : ::. ::.. .. :. :.: ::.... :.:..::: :: :
XP_011 NGIRDLAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKF
               70        80        90       100       110       120

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pF1KSD REARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVI
       ..:...: . .:  : ::..::.: : . .:.:::   : ..:  .:  ::::.:::::.
XP_011 KDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVL
              130       140       150       160       170       180

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pF1KSD EDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQ
       ..::. .:.. .: .. :. . :.::.. .:.:. : :.::::: .::...:.:::.:::
XP_011 QSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQ
              190       200       210       220       230       240

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pF1KSD RHVLLKQKELGGEEPEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFTIQSNQLVYQK
       .:  ..::...... .     .. .:.::::.::::::::::::.::::.::.:::::::
XP_011 KHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNNQLVYQK
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     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD KYKDPVTVVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSI
       :.::  ::::.:::::::: : : :::::::::: .:::.::::::.: : :..:::.::
XP_011 KFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSI
              310       320       330       340       350       360

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pF1KSD ASAFSQARLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQ
       :.:. . . :.: .   ..:      :...: ::. .. .   : . .. .:: . :::.
XP_011 ATAYRE-KGDESEKLDKKSSP-----STGSLDSGNESKEKLLKGES-ALQRVQCIPGNAS
               370       380            390       400        410   

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD CCDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNV
       ::::    :.:::::::.::::.:::::::::::::::::::::.:::::.:::::::: 
XP_011 CCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGND
           420       430       440       450       460       470   

     480       490       500       510       520                   
pF1KSD IINQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKL------PEIRGR----
       .::..::: :: :..::: :. .::::::.:.:::::.::. :       :: . .    
XP_011 VINRVYEANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSK
           480       490        500       510       520       530  

               530          540                                    
pF1KSD ----------RGGRG---RPRGQPPV---------------PPK--------------PS
                 . : :   :  .:  :               : .               :
XP_011 SSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVIAVNSDEARRESLFCPDELDSLFSYFDTSSKLRS
            540       550       560       570       580       590  

                        550       560               570       580  
pF1KSD IR-----------------PRPGSLRSKPEPPSE--------DLGSLHPGALLFRASGHP
       ::                 :   :  :  :: .:        :   :.::  :.::: . 
XP_011 IRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGERQDSSMFLDSKHLNPGLQLYRAS-YE
            600       610       620       630       640        650 

            590       600       610       620       630       640  
pF1KSD PSLPTMADALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRG
        .:: ::.::::::::::.:. ...:::::::. ..::..::::::::::::: :  :::
XP_011 KNLPKMAEALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRG
             660       670       680       690       700       710 

            650       660       670       680       690       700  
pF1KSD PLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKMREAEA
       ::::::.::::: .::::::::.  : : ::.:::.::.:.::::::::::::.: :   
XP_011 PLHHATVLGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMR
             720       730       740       750       760       770 

            710       720       730       740    
pF1KSD AQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL    
                                                 
XP_011 ESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRFQQDSQKF
             780       790       800       810   

>>XP_011510904 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co  (820 aa)
 initn: 2375 init1: 709 opt: 1775  Z-score: 996.1  bits: 195.1 E(85289): 9.5e-49
Smith-Waterman score: 2233; 48.8% identity (71.1% similar) in 781 aa overlap (1-696:1-772)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFV
       : . .::::::::::::::..: ::..:.::: .:.::.::  .....:. . .:.. :.
XP_011 MKMTVDFEECLKDSPRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQFM
               10        20        30        40        50        60

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pF1KSD VGICDLARLGPPEPMMAECLEKFTVSLNHKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGF
        :: :::. .  . ..   : ::. ::.. .. :. :.: ::.... :.:..::: :: :
XP_011 NGIRDLAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKF
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pF1KSD REARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVI
       ..:...: . .:  : ::..::.: : . .:.:::   : ..:  .:  ::::.:::::.
XP_011 KDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVL
              130       140       150       160       170       180

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pF1KSD EDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQ
       ..::. .:.. .: .. :. . :.::.. .:.:. : :.::::: .::...:.:::.:::
XP_011 QSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260        270       280              290  
pF1KSD RHVLLKQKELGGEEPEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSR-------RWFTIQS
       .:  ..::...... .     .. .:.::::.::::::::::::.:       :::.::.
XP_011 KHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRKKPDHIRRWFSIQN
              250       260       270       280       290       300

            300       310       320       330       340       350  
pF1KSD NQLVYQKKYKDPVTVVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWV
       ::::::::.::  ::::.:::::::: : : :::::::::: .:::.::::::.: : :.
XP_011 NQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWI
              310       320       330       340       350       360

            360       370       380       390       400       410  
pF1KSD SAVQSSIASAFSQARLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQ
       .:::.:::.:. . . :.: .   ..:      :...: ::. .. .   : . .. .::
XP_011 KAVQTSIATAYRE-KGDESEKLDKKSSP-----STGSLDSGNESKEKLLKGES-ALQRVQ
              370        380            390       400        410   

            420       430       440       450       460       470  
pF1KSD SVDGNAQCCDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKL
        . :::.::::    :.:::::::.::::.:::::::::::::::::::::.:::::.::
XP_011 CIPGNASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKL
           420       430       440       450       460       470   

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pF1KSD MCELGNVIINQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKL------PEI
       :::::: .::..::: :: :..::: :. .::::::.:.:::::.::. :       :: 
XP_011 MCELGNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQ
           480       490       500        510       520       530  

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pF1KSD RGR--------------RGGRG---RPRGQPPV---------------PPK---------
       . .              . : :   :  .:  :               : .         
XP_011 QKKFVSKSSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVIAVNSDEARRESLFCPDELDSLFSYFD
            540       550       560       570       580       590  

                               550       560               570     
pF1KSD -----PSIR-----------------PRPGSLRSKPEPPSE--------DLGSLHPGALL
             :::                 :   :  :  :: .:        :   :.::  :
XP_011 TSSKLRSIRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGERQDSSMFLDSKHLNPGLQL
            600       610       620       630       640       650  

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pF1KSD FRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQ
       .::: .  .:: ::.::::::::::.:. ...:::::::. ..::..:::::::::::::
XP_011 YRAS-YEKNLPKMAEALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQ
             660       670       680       690       700       710 

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pF1KSD ADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLA
        :  :::::::::.::::: .::::::::.  : : ::.:::.::.:.::::::::::::
XP_011 RDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLA
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pF1KSD KMREAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL    
       .                                                
XP_011 RMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRFQQDSQKF
             780       790       800       810       820

>>XP_011510908 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co  (776 aa)
 initn: 2196 init1: 566 opt: 757  Z-score: 437.0  bits: 91.6 E(85289): 1.3e-17
Smith-Waterman score: 2216; 48.8% identity (70.6% similar) in 781 aa overlap (45-736:1-772)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KSD PRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFVVGICDLARLGPPEP
                                     ....:. . .:.. :. :: :::. .  . 
XP_011                               MIDTGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDA
                                             10        20        30

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pF1KSD MMAECLEKFTVSLNHKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGFREARRDFWRGAESL
       ..   : ::. ::.. .. :. :.: ::.... :.:..::: :: :..:...: . .:  
XP_011 VVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEK
               40        50        60        70        80        90

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pF1KSD EAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLR
       : ::..::.: : . .:.:::   : ..:  .:  ::::.:::::...::. .:.. .: 
XP_011 ENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLS
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pF1KSD LVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEE
       .. :. . :.::.. .:.:. : :.::::: .::...:.:::.:::.:  ..::......
XP_011 FMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQKDFSSDD
              160       170       180       190       200       210

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pF1KSD PEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSR-------RWFTIQSNQLVYQKKYKDPVT
        .     .. .:.::::.::::::::::::.:       :::.::.::::::::.::  :
XP_011 SKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRKKPDHIRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPT
              220       230       240       250       260       270

        310       320       330       340       350       360      
pF1KSD VVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFSQA
       :::.:::::::: : : :::::::::: .:::.::::::.: : :..:::.:::.:. . 
XP_011 VVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYRE-
              280       290       300       310       320          

        370       380       390       400       410       420      
pF1KSD RLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQCCDCREP
       . :.: .   ..:      :...: ::. .. .   : . .. .:: . :::.::::   
XP_011 KGDESEKLDKKSS-----PSTGSLDSGNESKEKLLKGES-ALQRVQCIPGNASCCDCGLA
     330       340            350       360        370       380   

        430       440       450       460       470       480      
pF1KSD APEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVIINQIYE
        :.:::::::.::::.:::::::::::::::::::::.:::::.:::::::: .::..::
XP_011 DPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYE
           390       400       410       420       430       440   

        490       500       510       520                          
pF1KSD ARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKL------PEIRGR-----------
       : :: :..::: :. .::::::.:.:::::.::. :       :: . .           
XP_011 ANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSKSSEEKRL
           450        460       470       480       490       500  

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pF1KSD ---RGGRG---RPRGQPPV---------------PPK--------------PSIR-----
          . : :   :  .:  :               : .               :::     
XP_011 SISKFGPGDQVRASAQSSVIAVNSDEARRESLFCPDELDSLFSYFDTSSKLRSIRSNDSG
            510       520       530       540       550       560  

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pF1KSD ------------PRPGSLRSKPEPPSE--------DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMA
                   :   :  :  :: .:        :   :.::  :.::: .  .:: ::
XP_011 IQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGERQDSSMFLDSKHLNPGLQLYRAS-YEKNLPKMA
            570       580       590       600       610        620 

     590       600       610       620       630       640         
pF1KSD DALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATI
       .::::::::::.:. ...:::::::. ..::..::::::::::::: :  :::::::::.
XP_011 EALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATV
             630       640       650       660       670       680 

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pF1KSD LGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKM----REAEAAQG
       ::::: .::::::::.  : : ::.:::.::.:.::::::::::::.:    ::.:.  :
XP_011 LGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYG
             690       700       710       720       730       740 

         710       720       730       740
pF1KSD QAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL
       : ::::: ::::::: :::..::::.: ..:    
XP_011 QPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRFQQDSQKF
             750       760       770      

>>XP_011510906 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co  (776 aa)
 initn: 2196 init1: 566 opt: 757  Z-score: 437.0  bits: 91.6 E(85289): 1.3e-17
Smith-Waterman score: 2216; 48.8% identity (70.6% similar) in 781 aa overlap (45-736:1-772)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KSD PRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFVVGICDLARLGPPEP
                                     ....:. . .:.. :. :: :::. .  . 
XP_011                               MIDTGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDA
                                             10        20        30

           80        90       100       110       120       130    
pF1KSD MMAECLEKFTVSLNHKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGFREARRDFWRGAESL
       ..   : ::. ::.. .. :. :.: ::.... :.:..::: :: :..:...: . .:  
XP_011 VVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEK
               40        50        60        70        80        90

          140       150       160       170       180       190    
pF1KSD EAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLR
       : ::..::.: : . .:.:::   : ..:  .:  ::::.:::::...::. .:.. .: 
XP_011 ENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLS
              100       110       120       130       140       150

          200       210       220       230       240       250    
pF1KSD LVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEE
       .. :. . :.::.. .:.:. : :.::::: .::...:.:::.:::.:  ..::......
XP_011 FMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQKDFSSDD
              160       170       180       190       200       210

          260        270       280              290       300      
pF1KSD PEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSR-------RWFTIQSNQLVYQKKYKDPVT
        .     .. .:.::::.::::::::::::.:       :::.::.::::::::.::  :
XP_011 SKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRKKPDHIRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPT
              220       230       240       250       260       270

        310       320       330       340       350       360      
pF1KSD VVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFSQA
       :::.:::::::: : : :::::::::: .:::.::::::.: : :..:::.:::.:. . 
XP_011 VVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYRE-
              280       290       300       310       320          

        370       380       390       400       410       420      
pF1KSD RLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQCCDCREP
       . :.: .   ..:      :...: ::. .. .   : . .. .:: . :::.::::   
XP_011 KGDESEKLDKKSS-----PSTGSLDSGNESKEKLLKGES-ALQRVQCIPGNASCCDCGLA
     330       340            350       360        370       380   

        430       440       450       460       470       480      
pF1KSD APEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVIINQIYE
        :.:::::::.::::.:::::::::::::::::::::.:::::.:::::::: .::..::
XP_011 DPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYE
           390       400       410       420       430       440   

        490       500       510       520                          
pF1KSD ARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKL------PEIRGR-----------
       : :: :..::: :. .::::::.:.:::::.::. :       :: . .           
XP_011 ANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSKSSEEKRL
           450        460       470       480       490       500  

        530          540                                           
pF1KSD ---RGGRG---RPRGQPPV---------------PPK--------------PSIR-----
          . : :   :  .:  :               : .               :::     
XP_011 SISKFGPGDQVRASAQSSVIAVNSDEARRESLFCPDELDSLFSYFDTSSKLRSIRSNDSG
            510       520       530       540       550       560  

                 550       560               570       580         
pF1KSD ------------PRPGSLRSKPEPPSE--------DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMA
                   :   :  :  :: .:        :   :.::  :.::: .  .:: ::
XP_011 IQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGERQDSSMFLDSKHLNPGLQLYRAS-YEKNLPKMA
            570       580       590       600       610        620 

     590       600       610       620       630       640         
pF1KSD DALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATI
       .::::::::::.:. ...:::::::. ..::..::::::::::::: :  :::::::::.
XP_011 EALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATV
             630       640       650       660       670       680 

     650       660       670       680       690           700     
pF1KSD LGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKM----REAEAAQG
       ::::: .::::::::.  : : ::.:::.::.:.::::::::::::.:    ::.:.  :
XP_011 LGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYG
             690       700       710       720       730       740 

         710       720       730       740
pF1KSD QAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL
       : ::::: ::::::: :::..::::.: ..:    
XP_011 QPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRFQQDSQKF
             750       760       770      

>>XP_011510907 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co  (776 aa)
 initn: 2196 init1: 566 opt: 757  Z-score: 437.0  bits: 91.6 E(85289): 1.3e-17
Smith-Waterman score: 2216; 48.8% identity (70.6% similar) in 781 aa overlap (45-736:1-772)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KSD PRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFVVGICDLARLGPPEP
                                     ....:. . .:.. :. :: :::. .  . 
XP_011                               MIDTGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDA
                                             10        20        30

           80        90       100       110       120       130    
pF1KSD MMAECLEKFTVSLNHKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGFREARRDFWRGAESL
       ..   : ::. ::.. .. :. :.: ::.... :.:..::: :: :..:...: . .:  
XP_011 VVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEK
               40        50        60        70        80        90

          140       150       160       170       180       190    
pF1KSD EAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLR
       : ::..::.: : . .:.:::   : ..:  .:  ::::.:::::...::. .:.. .: 
XP_011 ENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLS
              100       110       120       130       140       150

          200       210       220       230       240       250    
pF1KSD LVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEE
       .. :. . :.::.. .:.:. : :.::::: .::...:.:::.:::.:  ..::......
XP_011 FMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQKDFSSDD
              160       170       180       190       200       210

          260        270       280              290       300      
pF1KSD PEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSR-------RWFTIQSNQLVYQKKYKDPVT
        .     .. .:.::::.::::::::::::.:       :::.::.::::::::.::  :
XP_011 SKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRKKPDHIRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPT
              220       230       240       250       260       270

        310       320       330       340       350       360      
pF1KSD VVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFSQA
       :::.:::::::: : : :::::::::: .:::.::::::.: : :..:::.:::.:. . 
XP_011 VVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYRE-
              280       290       300       310       320          

        370       380       390       400       410       420      
pF1KSD RLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQCCDCREP
       . :.: .   ..:      :...: ::. .. .   : . .. .:: . :::.::::   
XP_011 KGDESEKLDKKSS-----PSTGSLDSGNESKEKLLKGES-ALQRVQCIPGNASCCDCGLA
     330       340            350       360        370       380   

        430       440       450       460       470       480      
pF1KSD APEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVIINQIYE
        :.:::::::.::::.:::::::::::::::::::::.:::::.:::::::: .::..::
XP_011 DPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYE
           390       400       410       420       430       440   

        490       500       510       520                          
pF1KSD ARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKL------PEIRGR-----------
       : :: :..::: :. .::::::.:.:::::.::. :       :: . .           
XP_011 ANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSKSSEEKRL
           450        460       470       480       490       500  

        530          540                                           
pF1KSD ---RGGRG---RPRGQPPV---------------PPK--------------PSIR-----
          . : :   :  .:  :               : .               :::     
XP_011 SISKFGPGDQVRASAQSSVIAVNSDEARRESLFCPDELDSLFSYFDTSSKLRSIRSNDSG
            510       520       530       540       550       560  

                 550       560               570       580         
pF1KSD ------------PRPGSLRSKPEPPSE--------DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMA
                   :   :  :  :: .:        :   :.::  :.::: .  .:: ::
XP_011 IQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGERQDSSMFLDSKHLNPGLQLYRAS-YEKNLPKMA
            570       580       590       600       610        620 

     590       600       610       620       630       640         
pF1KSD DALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATI
       .::::::::::.:. ...:::::::. ..::..::::::::::::: :  :::::::::.
XP_011 EALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATV
             630       640       650       660       670       680 

     650       660       670       680       690           700     
pF1KSD LGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKM----REAEAAQG
       ::::: .::::::::.  : : ::.:::.::.:.::::::::::::.:    ::.:.  :
XP_011 LGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYG
             690       700       710       720       730       740 

         710       720       730       740
pF1KSD QAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL
       : ::::: ::::::: :::..::::.: ..:    
XP_011 QPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRFQQDSQKF
             750       760       770      

>>XP_016861536 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co  (841 aa)
 initn: 2487 init1: 566 opt: 757  Z-score: 436.6  bits: 91.6 E(85289): 1.4e-17
Smith-Waterman score: 2161; 49.7% identity (70.3% similar) in 751 aa overlap (68-736:96-837)

        40        50        60        70        80        90       
pF1KSD LLKLGTGLLESGRHYLAASRAFVVGICDLARLGPPEPMMAECLEKFTVSLNHKLDSHAEL
                                     : : :  .  ::   . . : ..   .  :
XP_016 LAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTRQGLPLSLRLECRGMIIALLWESSHLRMIL
          70        80        90       100       110       120     

       100       110       120       130       140       150       
pF1KSD LDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGA
       .: ::.... :.:..::: :: :..:...: . .:  : ::..::.: : . .:.:::  
XP_016 FDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATN
         130       140       150       160       170       180     

       160       170       180       190       200       210       
pF1KSD ALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEELSRLSQYR
        : ..:  .:  ::::.:::::...::. .:.. .: .. :. . :.::.. .:.:. : 
XP_016 ILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYM
         190       200       210       220       230       240     

       220       230       240       250       260        270      
pF1KSD KELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRA
       :.::::: .::...:.:::.:::.:  ..::...... .     .. .:.::::.:::::
XP_016 KDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRA
         250       260       270       280       290       300     

        280       290       300       310       320       330      
pF1KSD SNAFKTWSRRWFTIQSNQLVYQKKYKDPVTVVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSK
       :::::::.::::.::.::::::::.::  ::::.:::::::: : : :::::::::: .:
XP_016 SNAFKTWNRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTK
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        340       350       360       370       380       390      
pF1KSD SCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFSQARLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMA
       ::.::::::.: : :..:::.:::.:. . . :.: .   ..:      :...: ::. .
XP_016 SCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYRE-KGDESEKLDKKSSP-----STGSLDSGNES
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pF1KSD RGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQCCDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSK
       . .   : . .. .:: . :::.::::    :.:::::::.::::.::::::::::::::
XP_016 KEKLLKGES-ALQRVQCIPGNASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSK
     420        430       440       450       460       470        

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pF1KSD VRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVIINQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVE
       :::::::.:::::.:::::::: .::..::: :: :..::: :. .::::::.:.:::::
XP_016 VRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAYIRAKYVE
      480       490       500       510       520        530       

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pF1KSD KKFLTKL------PEIRGR--------------RGGRG---RPRGQPPV-----------
       .::. :       :: . .              . : :   :  .:  :           
XP_016 RKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSKSSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVIAVNSDEARRE
       540       550       560       570       580       590       

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pF1KSD ----PPK--------------PSIR-----------------PRPGSLRSKPEPPSE---
           : .               :::                 :   :  :  :: .:   
XP_016 SLFCPDELDSLFSYFDTSSKLRSIRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGERQD
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pF1KSD -----DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQATAANS
            :   :.::  :.::: .  .:: ::.::::::::::.:. ...:::::::. ..:
XP_016 SSMFLDSKHLNPGLQLYRAS-YEKNLPKMAEALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGS
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pF1KSD LLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGRDPLTI
       :..::::::::::::: :  :::::::::.::::: .::::::::.  : : ::.:::.:
XP_016 LVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLSI
        720       730       740       750       760       770      

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pF1KSD AMETANADIVTLLRLAKM----REAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSH
       :.:.::::::::::::.:    ::.:.  :: ::::: ::::::: :::..::::.: ..
XP_016 AVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRFQQ
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         740
pF1KSD DLHTL
       :    
XP_016 DSQKF
        840 

>>XP_016861535 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co  (848 aa)
 initn: 2358 init1: 566 opt: 757  Z-score: 436.6  bits: 91.6 E(85289): 1.4e-17
Smith-Waterman score: 2137; 49.2% identity (69.7% similar) in 758 aa overlap (68-736:96-844)

        40        50        60        70        80        90       
pF1KSD LLKLGTGLLESGRHYLAASRAFVVGICDLARLGPPEPMMAECLEKFTVSLNHKLDSHAEL
                                     : : :  .  ::   . . : ..   .  :
XP_016 LAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTRQGLPLSLRLECRGMIIALLWESSHLRMIL
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pF1KSD LDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGA
       .: ::.... :.:..::: :: :..:...: . .:  : ::..::.: : . .:.:::  
XP_016 FDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATN
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pF1KSD ALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEELSRLSQYR
        : ..:  .:  ::::.:::::...::. .:.. .: .. :. . :.::.. .:.:. : 
XP_016 ILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYM
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       :.::::: .::...:.:::.:::.:  ..::...... .     .. .:.::::.:::::
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       :::::::.:       :::.::.::::::::.::  ::::.:::::::: : : ::::::
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pF1KSD IHAKYVEKKFLTKL------PEIRGR--------------RGGRG---RPRGQPPV----
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pF1KSD -----------PPK--------------PSIR-----------------PRPGSLRSKPE
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pF1KSD PPSE--------DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGGQDNATPLI
       : .:        :   :.::  :.::: .  .:: ::.::::::::::.:. ...:::::
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pF1KSD QATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGARDSE
       ::. ..::..::::::::::::: :  :::::::::.::::: .::::::::.  : : :
XP_016 QAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGANQHATDEE
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pF1KSD GRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKM----REAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPE
       :.:::.::.:.::::::::::::.:    ::.:.  :: ::::: ::::::: :::..::
XP_016 GKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQMASNNPE
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pF1KSD KLSRRSHDLHTL
       ::.: ..:    
XP_016 KLNRFQQDSQKF
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740 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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