Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0032
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0032, 1050 aa
  1>>>pF1KSDA0032 1050 - 1050 aa - 1050 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6032+/-0.00113; mu= 19.6512+/- 0.067
 mean_var=67.0216+/-13.806, 0's: 0 Z-trim(101.5): 76  B-trim: 0 in 0/47
 Lambda= 0.156663
 statistics sampled from 6483 (6559) to 6483 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.201), width:  16
 Scan time:  3.320

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34028.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4          (1050) 7061 1605.9       0
CCDS41533.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10        (1057) 3972 907.7       0
CCDS7274.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10         (1049) 3969 907.0       0
CCDS60541.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10        ( 979) 2729 626.8 7.1e-179
CCDS82939.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4          ( 368) 2466 567.1 2.4e-161
CCDS54777.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4         ( 986) 1024 241.4 7.3e-63
CCDS47098.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4         (1022) 1024 241.4 7.5e-63
CCDS32177.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15         ( 852)  960 226.9 1.4e-58
CCDS45191.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15         ( 872)  960 226.9 1.5e-58
CCDS45192.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15         ( 875)  960 226.9 1.5e-58
CCDS3630.1 HERC5 gene_id:51191|Hs108|chr4          (1024)  808 192.6 3.7e-48
CCDS58769.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20         ( 752)  641 154.8 6.5e-37
CCDS13234.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20         ( 862)  641 154.8 7.4e-37
CCDS58768.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20         ( 903)  641 154.8 7.7e-37
CCDS45876.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18       ( 834)  640 154.6 8.4e-37
CCDS77499.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2         (1216)  642 155.1 8.5e-37
CCDS45875.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18       ( 854)  640 154.6 8.6e-37
CCDS58632.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18       ( 911)  640 154.6 9.1e-37
CCDS59323.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18       ( 947)  640 154.6 9.4e-37
CCDS45873.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18       ( 955)  640 154.6 9.4e-37
CCDS45874.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18       ( 967)  640 154.6 9.5e-37
CCDS45872.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18       ( 975)  640 154.6 9.6e-37
CCDS33354.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2         (1572)  642 155.1 1.1e-36
CCDS45265.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15         ( 900)  620 150.1 2.1e-35
CCDS10156.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15         (1247)  620 150.1 2.7e-35
CCDS61643.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15         (1303)  620 150.1 2.8e-35
CCDS61644.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15         (1319)  620 150.1 2.9e-35
CCDS58477.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16         ( 431)  607 147.0 8.3e-35
CCDS58476.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16         ( 754)  607 147.1 1.3e-34
CCDS10885.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16         ( 870)  607 147.1 1.5e-34
CCDS32707.1 SMURF2 gene_id:64750|Hs108|chr17       ( 748)  599 145.3 4.7e-34
CCDS69286.1 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7         (1572)  596 144.7 1.4e-33
CCDS5469.2 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7          (1606)  596 144.7 1.5e-33
CCDS10021.1 HERC2 gene_id:8924|Hs108|chr15         (4834)  593 144.3 6.2e-33
CCDS6242.1 WWP1 gene_id:11059|Hs108|chr8           ( 922)  574 139.7 2.8e-32
CCDS5050.1 HACE1 gene_id:57531|Hs108|chr6          ( 909)  546 133.3 2.2e-30
CCDS14246.1 RPGR gene_id:6103|Hs108|chrX           ( 815)  544 132.9 2.8e-30
CCDS35229.1 RPGR gene_id:6103|Hs108|chrX           (1152)  544 132.9 3.8e-30
CCDS35301.1 HUWE1 gene_id:10075|Hs108|chrX         (4374)  551 134.8 4.1e-30
CCDS73571.1 RCBTB2 gene_id:1102|Hs108|chr13        ( 527)  535 130.8 7.8e-30
CCDS9411.1 RCBTB2 gene_id:1102|Hs108|chr13         ( 551)  535 130.8 8.1e-30
CCDS73572.1 RCBTB2 gene_id:1102|Hs108|chr13        ( 556)  535 130.8 8.2e-30
CCDS9418.1 RCBTB1 gene_id:55213|Hs108|chr13        ( 531)  526 128.7 3.2e-29
CCDS34689.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7        ( 731)  526 128.8 4.3e-29
CCDS34690.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7        ( 757)  526 128.8 4.4e-29
CCDS34789.1 UBE3C gene_id:9690|Hs108|chr7          (1083)  495 121.8 7.7e-27
CCDS45277.1 HERC1 gene_id:8925|Hs108|chr15         (4861)  499 123.0 1.5e-26
CCDS60591.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10      ( 780)  442 109.8 2.3e-23
CCDS7414.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10       ( 776)  439 109.1 3.7e-23
CCDS5577.1 RCC1L gene_id:81554|Hs108|chr7          ( 464)  431 107.2 8.3e-23


>>CCDS34028.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4               (1050 aa)
 initn: 7061 init1: 7061 opt: 7061  Z-score: 8615.9  bits: 1605.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7061; 100.0% identity (100.0% similar) in 1050 aa overlap (1-1050:1-1050)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MLCWGYWSLGQPGISTNLQGIVAEPQVCGFISDRSVKEVACGGNHSVFLLEDGEVYTCGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MLCWGYWSLGQPGISTNLQGIVAEPQVCGFISDRSVKEVACGGNHSVFLLEDGEVYTCGL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD NTKGQLGHEREGNKPEQIGALADQHIIHVACGESHSLALSDRGQLFSWGAGSDGQLGLMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NTKGQLGHEREGNKPEQIGALADQHIIHVACGESHSLALSDRGQLFSWGAGSDGQLGLMT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD TEDSVAVPRLIQKLNQQTILQVSCGNWHCLALAADGQFFTWGKNSHGQLGLGKEFPSQAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TEDSVAVPRLIQKLNQQTILQVSCGNWHCLALAADGQFFTWGKNSHGQLGLGKEFPSQAS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD PQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFGWGMNNAGQLGLSDEKDRESPCHVKLLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFGWGMNNAGQLGLSDEKDRESPCHVKLLR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD TQKVVYISCGEEHTAVLTKSGGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELMGSEVTQIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TQKVVYISCGEEHTAVLTKSGGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELMGSEVTQIA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD CGRQHTLAFVPSSGLIYAFGCGARGQLGTGHTCNVKCPSPVKGYWAAHSGQLSARADRFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CGRQHTLAFVPSSGLIYAFGCGARGQLGTGHTCNVKCPSPVKGYWAAHSGQLSARADRFK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD YHIVKQIFSGGDQTFVLCSKYENYSPAVDFRTMNQAHYTSLINDETIAVWRQKLSEHNNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YHIVKQIFSGGDQTFVLCSKYENYSPAVDFRTMNQAHYTSLINDETIAVWRQKLSEHNNA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD NTINGVVQILSSAACWNGSFLEKKIDEHFKTSPKIPGIDLNSTRVLFEKLMNSQHSMILE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NTINGVVQILSSAACWNGSFLEKKIDEHFKTSPKIPGIDLNSTRVLFEKLMNSQHSMILE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD QILNSFESCLIPQLSSSPPDVEAMRIYLILPEFPLLQDSKYYITLTIPLAMAILRLDTNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QILNSFESCLIPQLSSSPPDVEAMRIYLILPEFPLLQDSKYYITLTIPLAMAILRLDTNP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD SKVLDNWWSQVCPKYFMKLVNLYKGAVLYLLRGRKTFLIPVLFNNYITAALKLLEKLYKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SKVLDNWWSQVCPKYFMKLVNLYKGAVLYLLRGRKTFLIPVLFNNYITAALKLLEKLYKV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD NLKVKHVEYDTFYIPEISNLVDIQEDYLMWFLHQAGMKARPSIIQDTVTLCSYPFIFDAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NLKVKHVEYDTFYIPEISNLVDIQEDYLMWFLHQAGMKARPSIIQDTVTLCSYPFIFDAQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD AKTKMLQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALRELS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AKTKMLQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALRELS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD IHSDIDLKKPLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQDSNLLWFSDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IHSDIDLKKPLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQDSNLLWFSDT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD CFVEHNWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CFVEHNWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQE
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD LLDYPGEDVEETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDAYVNYVFQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLDYPGEDVEETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDAYVNYVFQI
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD SVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHP
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD TVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQIVIQSTASGEEYLPVAHTCYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQIVIQSTASGEEYLPVAHTCYN
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050
pF1KSD LLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA
             1030      1040      1050

>>CCDS41533.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10             (1057 aa)
 initn: 3818 init1: 2042 opt: 3972  Z-score: 4842.6  bits: 907.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3972; 56.0% identity (78.7% similar) in 1057 aa overlap (1-1049:1-1056)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MLCWGYWSLGQPGISTNLQGIVAEPQVCGFISDRSVKEVACGGNHSVFLLEDGEVYTCGL
       :::::  :.:: :..   . :: ::.   :. .. :..:.::  :.::.:.:: ::::: 
CCDS41 MLCWGNASFGQLGLGGIDEEIVLEPRKSDFFINKRVRDVGCGLRHTVFVLDDGTVYTCGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD NTKGQLGHEREGNKPEQIGALADQHIIHVACGESHSLALSDRGQLFSWGAGSDGQLGLMT
       :  ::::::.  .::::. ::  :.:. :.:::.:.:::.:.::...::  :::::::. 
CCDS41 NDLGQLGHEKSRKKPEQVVALDAQNIVAVSCGEAHTLALNDKGQVYAWGLDSDGQLGLVG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD TEDSVAVPRLIQKLNQQTILQVSCGNWHCLALAADGQFFTWGKNSHGQLGLGKEFPSQAS
       .:. . ::: :..:..  :.::.:: .: :::.  .. : ::.:..:::::: .  .:.:
CCDS41 SEECIRVPRNIKSLSDIQIVQVACGYYHSLALSKASEVFCWGQNKYGQLGLGTDCKKQTS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD PQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFGWGMNNAGQLGLSDEKDRESPCHVKLLR
       :: ..:: :::. ::::::::::.:.::::.:::: :. :::::.::.::  :  .: ::
CCDS41 PQLLKSLLGIPFMQVAAGGAHSFVLTLSGAIFGWGRNKFGQLGLNDENDRYVPNLLKSLR
              190       200       210       220       230       240

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pF1KSD TQKVVYISCGEEHTAVLTKSGGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELMGSEVTQIA
       .::.::: :::.:::.::: :::::::::. :::::.: . :.:::.:.::::: ::.::
CCDS41 SQKIVYICCGEDHTAALTKEGGVFTFGAGGYGQLGHNSTSHEINPRKVFELMGSIVTEIA
              250       260       270       280       290       300

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pF1KSD CGRQHTLAFVPSSGLIYAFGCGARGQLGTGHTCNVKCPSPVKGYWAAHSGQLSARADRFK
       :::::: ::::::: ::.:: :. :::::: : : : :  ::: :  ..::     :  .
CCDS41 CGRQHTSAFVPSSGRIYSFGLGGNGQLGTGSTSNRKSPFTVKGNWYPYNGQCLPDIDSEE
              310       320       330       340       350       360

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pF1KSD YHIVKQIFSGGDQTFVLCSKYENYSPAVDFRTMNQAHYTSLINDETIAVWRQKLSEHNNA
       :  ::.:::::::.:   :. .: .:  :::  : ..    .:.  :  : .  : .  .
CCDS41 YFCVKRIFSGGDQSFSHYSSPQNCGPPDDFRCPNPTKQIWTVNEALIQKWLSYPSGRFPV
              370       380       390       400       410       420

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pF1KSD NTINGVVQILSSAACWNGSFLEKKIDEHFKTSPKIPGIDLNSTRVLFEKLMNSQHSMILE
       .  : .   .::..: :::::  . :.:..:. .. :.:.:..:.::.::.. .: .: .
CCDS41 EIANEIDGTFSSSGCLNGSFLAVSNDDHYRTGTRFSGVDMNAARLLFHKLIQPDHPQISQ
              430       440       450       460       470       480

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pF1KSD QILNSFESCLIPQLSSSPPDVEAMRIYLILPEFPLLQDSKYYITLTIPLAMAILRLDTNP
       :.  :.:. :::.:.:: :::::.:.:: ::: ::..::. . :..::.. :.. :.  :
CCDS41 QVAASLEKNLIPKLTSSLPDVEALRFYLTLPECPLMSDSNNFTTIAIPFGTALVNLEKAP
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pF1KSD SKVLDNWWSQVCPKYFMKLVNLYKGAVLYLLRGRKTFLIPV---LFNNYITAALKLLEKL
        :::.:::: . :  :.:.:.:.: .:..::.  :  . :    .::... .:::.:: :
CCDS41 LKVLENWWSVLEPPLFLKIVELFKEVVVHLLKLYKIGIPPSERRIFNSFLHTALKVLEIL
              550       560       570       580       590       600

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pF1KSD YKVNLKVKHV-EYDTFYIPEISNLVDIQEDYLMWFLHQA-GMKARPSIIQ--DT-VTLCS
       ..:: :. .. .:: ::: :...:.::..::. :  .:: :: .  .. .  :  ::.:.
CCDS41 HRVNEKMGQIIQYDKFYIHEVQELIDIRNDYINWVQQQAYGMDVNHGLTELADIPVTICT
              610       620       630       640       650       660

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pF1KSD YPFIFDAQAKTKMLQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLV
       :::.::::::: .::::: ::::.:.. :. :::  :. :  . . .: :.: :::.:.:
CCDS41 YPFVFDAQAKTTLLQTDAVLQMQMAIDQAHRQNVSSLF-LPVIESVNPCLILVVRRENIV
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pF1KSD GDALRELSIHSDIDLKKPLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQDS
       :::.. :   ..:: :::::::: ::.::::::: ::::::...:::.: :::: ::.::
CCDS41 GDAMEVLRKTKNIDYKKPLKVIFVGEDAVDAGGVRKEFFLLIMRELLDPKYGMFRYYEDS
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pF1KSD NLLWFSDTCFVEHNWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSP
        :.::::  : . . :::::. ::::::: :.::::::::::::::. ::.:.::::: :
CCDS41 RLIWFSDKTFEDSDLFHLIGVICGLAIYNCTIVDLHFPLALYKKLLKKKPSLDDLKELMP
     780       790       800       810       820       830         

            840       850       860       870       880       890  
pF1KSD TEGRSLQELLDYPGEDVEETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDA
         :::.:.::::: .:.::::::::::  :..:. : :.:. .: ...: :.::::::::
CCDS41 DVGRSMQQLLDYPEDDIEETFCLNFTITVENFGATEVKELVLNGADTAVNKQNRQEFVDA
     840       850       860       870       880       890         

            900       910       920       930       940       950  
pF1KSD YVNYVFQISVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYK
       ::.:.:. ::   . :: .:: :::::::: ::::.::.::..::.::.:.:::... ::
CCDS41 YVDYIFNKSVASLFDAFHAGFHKVCGGKVLLLFQPNELQAMVIGNTNYDWKELEKNTEYK
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pF1KSD GDYSATHPTVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQIVIQSTASGEEYL
       :.: : :::.:.:::.:::.::::::.::::::::::::: :: ::..:::::..:::::
CCDS41 GEYWAEHPTIKIFWEVFHELPLEKKKQFLLFLTGSDRIPILGMKSLKLVIQSTGGGEEYL
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pF1KSD PVAHTCYNLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA
       ::.:::.::::::::. :: : ..: ::.:. ::::: 
CCDS41 PVSHTCFNLLDLPKYTEKETLRSKLIQAIDHNEGFSLI
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>>CCDS7274.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10              (1049 aa)
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               10        20        30        40        50        60
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       :::::  :.:: :..   . :: ::.   :. .. :..:.::  :.::.:.:: ::::: 
CCDS72 MLCWGNASFGQLGLGGIDEEIVLEPRKSDFFINKRVRDVGCGLRHTVFVLDDGTVYTCGC
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CCDS72 NDLGQLGHEKSRKKPEQVVALDAQNIVAVSCGEAHTLALNDKGQVYAWGLDSDGQLGLVG
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       .:. . ::: :..:..  :.::.:: .: :::.  .. : ::.:..:::::: .  .:.:
CCDS72 SEECIRVPRNIKSLSDIQIVQVACGYYHSLALSKASEVFCWGQNKYGQLGLGTDCKKQTS
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pF1KSD PQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFGWGMNNAGQLGLSDEKDRESPCHVKLLR
       :: ..:: :::. ::::::::::.:.::::.:::: :. :::::.::.::  :  .: ::
CCDS72 PQLLKSLLGIPFMQVAAGGAHSFVLTLSGAIFGWGRNKFGQLGLNDENDRYVPNLLKSLR
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pF1KSD TQKVVYISCGEEHTAVLTKSGGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELMGSEVTQIA
       .::.::: :::.:::.::: :::::::::. :::::.: . :.:::.:.::::: ::.::
CCDS72 SQKIVYICCGEDHTAALTKEGGVFTFGAGGYGQLGHNSTSHEINPRKVFELMGSIVTEIA
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pF1KSD CGRQHTLAFVPSSGLIYAFGCGARGQLGTGHTCNVKCPSPVKGYWAAHSGQLSARADRFK
       :::::: ::::::: ::.:: :. :::::: : : : :  ::: :  ..::     :  .
CCDS72 CGRQHTSAFVPSSGRIYSFGLGGNGQLGTGSTSNRKSPFTVKGNWYPYNGQCLPDIDSEE
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pF1KSD YHIVKQIFSGGDQTFVLCSKYENYSPAVDFRTMNQAHYTSLINDETIAVWRQKLSEHNNA
       :  ::.:::::::.:   :. .: .:  :::  : ..    .:.  :  : .  : .  .
CCDS72 YFCVKRIFSGGDQSFSHYSSPQNCGPPDDFRCPNPTKQIWTVNEALIQKWLSYPSGRFPV
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pF1KSD NTINGVVQILSSAACWNGSFLEKKIDEHFKTSPKIPGIDLNSTRVLFEKLMNSQHSMILE
       .  : .   .::..: :::::  . :.:..:. .. :.:.:..:.::.::.. .: .: .
CCDS72 EIANEIDGTFSSSGCLNGSFLAVSNDDHYRTGTRFSGVDMNAARLLFHKLIQPDHPQISQ
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pF1KSD QILNSFESCLIPQLSSSPPDVEAMRIYLILPEFPLLQDSKYYITLTIPLAMAILRLDTNP
       :.  :.:. :::.:.:: :::::.:.:: ::: ::..::. . :..::.. :.. :.  :
CCDS72 QVAASLEKNLIPKLTSSLPDVEALRFYLTLPECPLMSDSNNFTTIAIPFGTALVNLEKAP
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pF1KSD SKVLDNWWSQVCPKYFMKLVNLYKGAVLYLLRGRKTFLIPV---LFNNYITAALKLLEKL
        :::.:::: . :  :.:.:.:.: .:..::.  :  . :    .::... .:::.:: :
CCDS72 LKVLENWWSVLEPPLFLKIVELFKEVVVHLLKLYKIGIPPSERRIFNSFLHTALKVLEIL
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pF1KSD YKVNLKVKHV-EYDTFYIPEISNLVDIQEDYLMWFLHQA-GMKARPSIIQDTVTLCSYPF
       ..:: :. .. .:: ::: :...:.::..::. :  .:: :: :     .  ::.:.:::
CCDS72 HRVNEKMGQIIQYDKFYIHEVQELIDIRNDYINWVQQQAYGMLA-----DIPVTICTYPF
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pF1KSD IFDAQAKTKMLQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDA
       .::::::: .::::: ::::.:.. :. :::  :. :  . . .: :.: :::.:.::::
CCDS72 VFDAQAKTTLLQTDAVLQMQMAIDQAHRQNVSSLF-LPVIESVNPCLILVVRRENIVGDA
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pF1KSD LRELSIHSDIDLKKPLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQDSNLL
       .. :   ..:: :::::::: ::.::::::: ::::::...:::.: :::: ::.:: :.
CCDS72 MEVLRKTKNIDYKKPLKVIFVGEDAVDAGGVRKEFFLLIMRELLDPKYGMFRYYEDSRLI
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pF1KSD WFSDTCFVEHNWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEG
       ::::  : . . :::::. ::::::: :.::::::::::::::. ::.:.::::: :  :
CCDS72 WFSDKTFEDSDLFHLIGVICGLAIYNCTIVDLHFPLALYKKLLKKKPSLDDLKELMPDVG
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pF1KSD RSLQELLDYPGEDVEETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDAYVN
       ::.:.::::: .:.::::::::::  :..:. : :.:. .: ...: :.::::::::::.
CCDS72 RSMQQLLDYPEDDIEETFCLNFTITVENFGATEVKELVLNGADTAVNKQNRQEFVDAYVD
          840       850       860       870       880       890    

         900       910       920       930       940       950     
pF1KSD YVFQISVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDY
       :.:. ::   . :: .:: :::::::: ::::.::.::..::.::.:.:::... :::.:
CCDS72 YIFNKSVASLFDAFHAGFHKVCGGKVLLLFQPNELQAMVIGNTNYDWKELEKNTEYKGEY
          900       910       920       930       940       950    

         960       970       980       990      1000      1010     
pF1KSD SATHPTVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQIVIQSTASGEEYLPVA
        : :::.:.:::.:::.::::::.::::::::::::: :: ::..:::::..:::::::.
CCDS72 WAEHPTIKIFWEVFHELPLEKKKQFLLFLTGSDRIPILGMKSLKLVIQSTGGGEEYLPVS
          960       970       980       990      1000      1010    

        1020      1030      1040      1050
pF1KSD HTCYNLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA
       :::.::::::::. :: : ..: ::.:. ::::: 
CCDS72 HTCFNLLDLPKYTEKETLRSKLIQAIDHNEGFSLI
         1020      1030      1040         

>>CCDS60541.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10             (979 aa)
 initn: 3063 init1: 2042 opt: 2729  Z-score: 3324.8  bits: 626.8 E(32554): 7.1e-179
Smith-Waterman score: 3416; 50.7% identity (72.4% similar) in 1057 aa overlap (1-1049:1-978)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MLCWGYWSLGQPGISTNLQGIVAEPQVCGFISDRSVKEVACGGNHSVFLLEDGEVYTCGL
       :::::  :.:: :..   . :: ::.   :. .. :..:.::  :.::.:.:: ::::: 
CCDS60 MLCWGNASFGQLGLGGIDEEIVLEPRKSDFFINKRVRDVGCGLRHTVFVLDDGTVYTCGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD NTKGQLGHEREGNKPEQIGALADQHIIHVACGESHSLALSDRGQLFSWGAGSDGQLGLMT
       :  ::::::.  .::::. ::  :.:. :.:::.:.:::.:.::...::  :::::::. 
CCDS60 NDLGQLGHEKSRKKPEQVVALDAQNIVAVSCGEAHTLALNDKGQVYAWGLDSDGQLGLVG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD TEDSVAVPRLIQKLNQQTILQVSCGNWHCLALAADGQFFTWGKNSHGQLGLGKEFPSQAS
       .:. . ::: :..:..  :.::.:: .: :::.  .. : ::.:..:::::: .  .:.:
CCDS60 SEECIRVPRNIKSLSDIQIVQVACGYYHSLALSKASEVFCWGQNKYGQLGLGTDCKKQTS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD PQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFGWGMNNAGQLGLSDEKDRESPCHVKLLR
       :: ..:: :::. ::::::::::.:.::::.:::: :. :::::.::.::  :  .: ::
CCDS60 PQLLKSLLGIPFMQVAAGGAHSFVLTLSGAIFGWGRNKFGQLGLNDENDRYVPNLLKSLR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD TQKVVYISCGEEHTAVLTKSGGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELMGSEVTQIA
       .::.::: :::.:::.::: :::::::::. :::::.: . :.:::.:.::::: ::.::
CCDS60 SQKIVYICCGEDHTAALTKEGGVFTFGAGGYGQLGHNSTSHEINPRKVFELMGSIVTEIA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD CGRQHTLAFVPSSGLIYAFGCGARGQLGTGHTCNVKCPSPVKGYWAAHSGQLSARADRFK
       :::::: ::::::: ::.:: :. :::::: : : : :  ::: :  ..::     :  .
CCDS60 CGRQHTSAFVPSSGRIYSFGLGGNGQLGTGSTSNRKSPFTVKGNWYPYNGQCLPDIDSEE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD YHIVKQIFSGGDQTFVLCSKYENYSPAVDFRTMNQAHYTSLINDETIAVWRQKLSEHNNA
       :  ::.:::::::.:   :. .: .:  :::  : ..    .:.  :  : .  : .  .
CCDS60 YFCVKRIFSGGDQSFSHYSSPQNCGPPDDFRCPNPTKQIWTVNEALIQKWLSYPSGRFPV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD NTINGVVQILSSAACWNGSFLEKKIDEHFKTSPKIPGIDLNSTRVLFEKLMNSQHSMILE
       .  : .   .::..: :::::  . :.:..:. .. :.:.:..:.::.::.. .: .: .
CCDS60 EIANEIDGTFSSSGCLNGSFLAVSNDDHYRTGTRFSGVDMNAARLLFHKLIQPDHPQISQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD QILNSFESCLIPQLSSSPPDVEAMRIYLILPEFPLLQDSKYYITLTIPLAMAILRLDTNP
       :.  :.:. :::.:.:: :::::.:.:: ::: ::..::. . :..::.. :.. :.  :
CCDS60 QVAASLEKNLIPKLTSSLPDVEALRFYLTLPECPLMSDSNNFTTIAIPFGTALVNLEKAP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580          590       
pF1KSD SKVLDNWWSQVCPKYFMKLVNLYKGAVLYLLRGRKTFLIPV---LFNNYITAALKLLEKL
        :::.:::: . :  :.:.:.:.: .:..::.  :  . :    .::... .:::.:: :
CCDS60 LKVLENWWSVLEPPLFLKIVELFKEVVVHLLKLYKIGIPPSERRIFNSFLHTALKVLEIL
              550       560       570       580       590       600

       600        610       620       630        640          650  
pF1KSD YKVNLKVKHV-EYDTFYIPEISNLVDIQEDYLMWFLHQA-GMKARPSIIQ--DT-VTLCS
       ..:: :. .. .:: ::: :...:.::..::. :  .:: :: .  .. .  :  ::.:.
CCDS60 HRVNEKMGQIIQYDKFYIHEVQELIDIRNDYINWVQQQAYGMDVNHGLTELADIPVTICT
              610       620       630       640       650       660

            660       670       680       690       700       710  
pF1KSD YPFIFDAQAKTKMLQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLV
       :::.::::::: .::::: ::::.:.. :. :::  :. :  . . .: :.: :::.:.:
CCDS60 YPFVFDAQAKTTLLQTDAVLQMQMAIDQAHRQNVSSLF-LPVIESVNPCLILVVRRENIV
              670       680       690        700       710         

            720       730       740       750       760       770  
pF1KSD GDALRELSIHSDIDLKKPLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQDS
       :::.. :   ..:: :::::::: ::.::::::: ::::::...:::.: :::: ::.::
CCDS60 GDAMEVLRKTKNIDYKKPLKVIFVGEDAVDAGGVRKEFFLLIMRELLDPKYGMFRYYEDS
     720       730       740       750       760       770         

            780       790       800       810       820       830  
pF1KSD NLLWFSDTCFVEHNWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSP
        :.::::   ::.                                               
CCDS60 RLIWFSDKITVEN-----------------------------------------------
     780       790                                                 

            840       850       860       870       880       890  
pF1KSD TEGRSLQELLDYPGEDVEETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDA
                                      .:. : :.:. .: ...: :.::::::::
CCDS60 -------------------------------FGATEVKELVLNGADTAVNKQNRQEFVDA
                                           800       810       820 

            900       910       920       930       940       950  
pF1KSD YVNYVFQISVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYK
       ::.:.:. ::   . :: .:: :::::::: ::::.::.::..::.::.:.:::... ::
CCDS60 YVDYIFNKSVASLFDAFHAGFHKVCGGKVLLLFQPNELQAMVIGNTNYDWKELEKNTEYK
             830       840       850       860       870       880 

            960       970       980       990      1000      1010  
pF1KSD GDYSATHPTVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQIVIQSTASGEEYL
       :.: : :::.:.:::.:::.::::::.::::::::::::: :: ::..:::::..:::::
CCDS60 GEYWAEHPTIKIFWEVFHELPLEKKKQFLLFLTGSDRIPILGMKSLKLVIQSTGGGEEYL
             890       900       910       920       930       940 

           1020      1030      1040      1050
pF1KSD PVAHTCYNLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA
       ::.:::.::::::::. :: : ..: ::.:. ::::: 
CCDS60 PVSHTCFNLLDLPKYTEKETLRSKLIQAIDHNEGFSLI
             950       960       970         

>>CCDS82939.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4               (368 aa)
 initn: 2880 init1: 2466 opt: 2466  Z-score: 3010.3  bits: 567.1 E(32554): 2.4e-161
Smith-Waterman score: 2466; 99.4% identity (99.7% similar) in 358 aa overlap (1-358:1-358)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MLCWGYWSLGQPGISTNLQGIVAEPQVCGFISDRSVKEVACGGNHSVFLLEDGEVYTCGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MLCWGYWSLGQPGISTNLQGIVAEPQVCGFISDRSVKEVACGGNHSVFLLEDGEVYTCGL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD NTKGQLGHEREGNKPEQIGALADQHIIHVACGESHSLALSDRGQLFSWGAGSDGQLGLMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NTKGQLGHEREGNKPEQIGALADQHIIHVACGESHSLALSDRGQLFSWGAGSDGQLGLMT
               70        80        90       100       110       120

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pF1KSD TEDSVAVPRLIQKLNQQTILQVSCGNWHCLALAADGQFFTWGKNSHGQLGLGKEFPSQAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TEDSVAVPRLIQKLNQQTILQVSCGNWHCLALAADGQFFTWGKNSHGQLGLGKEFPSQAS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD PQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFGWGMNNAGQLGLSDEKDRESPCHVKLLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFGWGMNNAGQLGLSDEKDRESPCHVKLLR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD TQKVVYISCGEEHTAVLTKSGGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELMGSEVTQIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TQKVVYISCGEEHTAVLTKSGGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELMGSEVTQIA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD CGRQHTLAFVPSSGLIYAFGCGARGQLGTGHTCNVKCPSPVKGYWAAHSGQLSARADRFK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .  
CCDS82 CGRQHTLAFVPSSGLIYAFGCGARGQLGTGHTCNVKCPSPVKGYWAAHSGQLSARAGKND
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD YHIVKQIFSGGDQTFVLCSKYENYSPAVDFRTMNQAHYTSLINDETIAVWRQKLSEHNNA
                                                                   
CCDS82 CLWNLKVF                                                    
                                                                   

>>CCDS54777.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4              (986 aa)
 initn: 1703 init1: 676 opt: 1024  Z-score: 1242.1  bits: 241.4 E(32554): 7.3e-63
Smith-Waterman score: 2181; 38.6% identity (66.4% similar) in 1018 aa overlap (38-1047:27-978)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KSD SLGQPGISTNLQGIVAEPQVCGFISDRSVKEVACGGNHSVFLLEDGEVYTCGLNTKGQLG
                                     ..: :  ::..:: . .: .:: :..::::
CCDS54     MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCGDNSRGQLG
                   10        20        30        40        50      

          70        80        90       100       110       120     
pF1KSD HE--REGNKPEQIGALADQHIIHVACGESHSLALSDRGQLFSWGAGSDGQLGLMTTEDSV
       ..  ..:. :: : ::    .  :.::. ::::.  .:..:.:::::.::::.   ..  
CCDS54 RRGAQRGELPEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLGIGEFKEIS
         60        70        80        90       100       110      

         130       140       150       160       170       180     
pF1KSD AVPRLIQKLNQQTILQVSCGNWHCLALAADGQFFTWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVR
        .:. :. ::.  :.:::::..: :::. :.: :.:::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVR
        120       130       140       150       160       170      

         190       200       210       220          230       240  
pF1KSD SLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFGWGMNNAGQLGLSDEK---DRESPCHVKLLRTQ
       :::::::::::::::::::::: :. :::: :.::::.:: ..   . ..:  :  :.. 
CCDS54 SLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPLSVGALKNL
        180       190       200       210       220       230      

            250       260       270       280       290       300  
pF1KSD KVVYISCGEEHTAVLTKSGGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELMGSEVTQIACG
        :::::::. ::::::..: ::::: .  ::::..   .. .:. ..: . . :.:: ::
CCDS54 GVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQ-LVERIDGLVSQIDCG
        240       250       260       270       280        290     

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pF1KSD RQHTLAFVPSSGLIYAFGCGARGQLGTGHTCNVKCPSPVKGYWAAHSGQLSARADRFKYH
         ::::.: ..: . .:: :           ... :.  ..     . .    :. :   
CCDS54 SYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPS---------DTSKPTHPEALTENFDISCLISAEDFVDV
         300       310                320       330       340      

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pF1KSD IVKQIFSGGDQTFVLCSKYENYSPAVDFRTMNQAHYTSL-INDETIAVWRQKLSEHNNAN
        ::.::.:   .::  .. .. :  .  .:. .    :  . .. ::: :.. .::. :.
CCDS54 QVKHIFAGTYANFVT-THQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAVKRRS-TEHEMAK
        350       360        370       380       390        400    

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pF1KSD TINGVVQILSSAACWNGSFLEKKIDEHFKTSPKIPGIDLNSTRVLFEKLMNSQHSMILEQ
       .   . .:.:: :: ..:::.:.      ::  .   ::. .:  :.::  ...  :  .
CCDS54 S--EIRMIFSSPACLTASFLKKR-GTGETTSIDV---DLEMARDTFKKL--TKKEWISSM
            410       420        430          440         450      

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pF1KSD ILNSFESCLIPQLSSSPPDVEAMRIYLILPEFPLLQDSKYYITLTIPLAMAILRLDTNPS
       : . .:. :.  :    :  ::. ..:.::: :...::: . .:..:.: :. ... .  
CCDS54 ITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSKQSL
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pF1KSD KVLDNWWSQVCPKYFMKLVNLYKGAVL-YLLRGRKTFLIPVLFNNYITAALKLLEKLYKV
       .:: . :. .  . .  :... :.:..  ::.  ::       .  . : : ....:.::
CCDS54 QVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTKTEQD----HCNVKALLGMMKELHKV
        520       530       540       550           560       570  

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pF1KSD NLKVKHVEYDTFYIPEISNLVDIQEDYLMWFLHQAGMKARPSIIQDTVTLCSYPFIFDAQ
       :    ..  .:: : :.:::...  :           ..: ....:.  .        ..
CCDS54 NKANCRLPENTFNINELSNLLNFYID-----------RGR-QLFRDNHLM--------SE
            580       590                  600        610          

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pF1KSD AKTKMLQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALRELS
        :. ::. .. ::          .. :      :    :: ..:.:::. :: ::::.::
CCDS54 KKAYMLMHETILQK---------KDEF-----PP----SPRFILRVRRSRLVKDALRQLS
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pF1KSD IHSDIDLKKPLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQDSNLLWFSDT
            :. : : : : .:   ..:::..:::  ...:. .: :::: : . .. .::   
CCDS54 QAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEFFHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAK
          660       670       680       690       700       710    

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pF1KSD CFVEHNWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQE
          :.. . :.:. :::...: .:..: ::::::::::. ::.:::::::::  :.::::
CCDS54 PKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFPLALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQE
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              850       860       870       880       890       900
pF1KSD LLDYPGEDVEETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDAYVNYVFQI
       .::  ..:. ...:. :.:  ..  :     :::.: .. : . :....:. :..:.:..
CCDS54 VLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDV----DLIPNGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNV
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pF1KSD SVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHP
       ::.  :  :. :: .::  ..:. : : :: . ..::..:.:...:... :.  :. .::
CCDS54 SVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHP
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pF1KSD TVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQIVIQSTAS-GEEYLPVAHTCY
       :..:::..::.. :..:::::.:::: ::.   :. ...::..   . .:.  :.. ::.
CCDS54 TIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCH
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pF1KSD NLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA     
       :.:.:::::. : .   :  :..: .::        
CCDS54 NILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLTQS
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>>CCDS47098.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4              (1022 aa)
 initn: 1777 init1: 676 opt: 1024  Z-score: 1241.9  bits: 241.4 E(32554): 7.5e-63
Smith-Waterman score: 2319; 39.2% identity (68.0% similar) in 1018 aa overlap (38-1047:27-1014)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KSD SLGQPGISTNLQGIVAEPQVCGFISDRSVKEVACGGNHSVFLLEDGEVYTCGLNTKGQLG
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CCDS47     MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCGDNSRGQLG
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pF1KSD HE--REGNKPEQIGALADQHIIHVACGESHSLALSDRGQLFSWGAGSDGQLGLMTTEDSV
       ..  ..:. :: : ::    .  :.::. ::::.  .:..:.:::::.::::.   ..  
CCDS47 RRGAQRGELPEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLGIGEFKEIS
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pF1KSD AVPRLIQKLNQQTILQVSCGNWHCLALAADGQFFTWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVR
        .:. :. ::.  :.:::::..: :::. :.: :.:::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVR
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pF1KSD SLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFGWGMNNAGQLGLSDEK---DRESPCHVKLLRTQ
       :::::::::::::::::::::: :. :::: :.::::.:: ..   . ..:  :  :.. 
CCDS47 SLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPLSVGALKNL
        180       190       200       210       220       230      

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pF1KSD KVVYISCGEEHTAVLTKSGGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELMGSEVTQIACG
        :::::::. ::::::..: ::::: .  ::::..   .. .:. ..: . . :.:: ::
CCDS47 GVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQ-LVERIDGLVSQIDCG
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pF1KSD RQHTLAFVPSSGLIYAFGCGARGQLGTGHTCNVKCPSPVKGYWAAHSGQLSARADRFKYH
         ::::.: ..: . .:: :           ... :.  ..     . .    :. :   
CCDS47 SYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPS---------DTSKPTHPEALTENFDISCLISAEDFVDV
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pF1KSD IVKQIFSGGDQTFVLCSKYENYSPAVDFRTMNQAHYTSL-INDETIAVWRQKLSEHNNAN
        ::.::.:   .::  .. .. :  .  .:. .    :  . .. ::: :.. .::. :.
CCDS47 QVKHIFAGTYANFVT-THQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAVKRRS-TEHEMAK
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pF1KSD TINGVVQILSSAACWNGSFLEKKIDEHFKTSPKIPGIDLNSTRVLFEKLMNSQHSMILEQ
       .   . .:.:: :: ..:::.:.      ::  .   ::. .:  :.::  ...  :  .
CCDS47 S--EIRMIFSSPACLTASFLKKR-GTGETTSIDV---DLEMARDTFKKL--TKKEWISSM
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pF1KSD ILNSFESCLIPQLSSSPPDVEAMRIYLILPEFPLLQDSKYYITLTIPLAMAILRLDTNPS
       : . .:. :.  :    :  ::. ..:.::: :...::: . .:..:.: :. ... .  
CCDS47 ITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSKQSL
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pF1KSD KVLDNWWSQVCPKYFMKLVNLYKGAVL-YLLRGRKTFLIPVLFNNYITAALKLLEKLYKV
       .:: . :. .  . .  :... :.:..  ::.  ::       .  . : : ....:.::
CCDS47 QVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTKTEQD----HCNVKALLGMMKELHKV
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pF1KSD NLKVKHVEYDTFYIPEISNLVDIQEDYLMWFLHQAGMKARPSIIQDTVTLCSYPFIFDAQ
       :    ..  .:: : :.:::...  :    ....  .   :.   . : . ..::::.. 
CCDS47 NKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRGRQLFRDNHLI--PAETPSPVIFSDFPFIFNSL
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pF1KSD AKTKMLQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALRELS
       .: :.::.:....::.. . : .     .:  .  .  :: ..:.:::. :: ::::.::
CCDS47 SKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETILQKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLS
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pF1KSD IHSDIDLKKPLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQDSNLLWFSDT
            :. : : : : .:   ..:::..:::  ...:. .: :::: : . .. .::   
CCDS47 QAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEFFHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAK
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pF1KSD CFVEHNWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQE
          :.. . :.:. :::...: .:..: ::::::::::. ::.:::::::::  :.::::
CCDS47 PKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFPLALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQE
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pF1KSD LLDYPGEDVEETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDAYVNYVFQI
       .::  ..:. ...:. :.:  ..  :     :::.: .. : . :....:. :..:.:..
CCDS47 VLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDV----DLIPNGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNV
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pF1KSD SVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHP
       ::.  :  :. :: .::  ..:. : : :: . ..::..:.:...:... :.  :. .::
CCDS47 SVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHP
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pF1KSD TVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQIVIQSTAS-GEEYLPVAHTCY
       :..:::..::.. :..:::::.:::: ::.   :. ...::..   . .:.  :.. ::.
CCDS47 TIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCH
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pF1KSD NLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA     
       :.:.:::::. : .   :  :..: .::        
CCDS47 NILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLTQS
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CCDS32 AACSAAAMEEDSEASSSRIGDSSQGDNNLQKLGPDDVSVDIDAIRRVYTRLLSNEKIETA
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pF1KSD ILEQI--LNSFESCLIPQLSSSPPDVEAMRIYLILPEFPLLQDSKYYITLTIPL-AMAIL
       .:. .  :.    : .   .    : . . ...:. :   :. :  :. ...::   :. 
CCDS32 FLNALVYLSPNVECDLTYHNVYSRDPNYLNLFIIVMENRNLH-SPEYLEMALPLFCKAMS
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       .:    .  :   ::.     . .... ..  . : . . . :    : :.   :.:: :
CCDS32 KLPLAAQGKLIRLWSKYNADQIRRMMETFQQLITYKVISNE-FNSRNLVNDDDAIVAASK
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        :. .: .:.      ..: : :    ::: :.:. .::              : :   :
CCDS32 CLKMVYYANVVGGEVDTNHNEEDDEEPIPESSELT-LQELLGEERRNKKGPRVDPLETEL
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pF1KSD HQAGMKARPSII---------------------------QDTVTLCSYPFIFDAQAKTKM
           .  :  .:                           ..  .. . :::..: .:.  
CCDS32 GVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLEMDKDYTFFKVETENKFSFMTCPFILNAVTKNLG
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pF1KSD LQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALREL---SIH
       :  : ...:       . . . .: .:      .:.: :.:::.... ::: .:   ...
CCDS32 LYYDNRIRMY------SERRITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDHIIDDALVRLEMIAME
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       .  :::: : : :.::..:: :::.:::: :...:..::  ::::: ....:.::. . :
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pF1KSD VEHNWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQELL
         .. : ::::. ::::::. ..:.:::...:.::.. :  ..:: .  :.  .::..::
CCDS32 ETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLL
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       .: : .::. . ..: : . . .:   .  :  .::.. . ..::.:::. : .:... :
CCDS32 EYEG-NVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKS
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pF1KSD VHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLE-LFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHP
       :.. . ::  ::  : . . :. ::.: :.. .. :. : ... ::::. : : :.    
CCDS32 VEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSV
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pF1KSD TVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQIVIQSTASGEEYLPVAHTCYN
        .. :::  : :  :.:. :: : ::.:: :. :...:...: ...   : ::..:::.:
CCDS32 LIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTERLPTSHTCFN
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       .: ::.::::: :. :: .:.   .::.. 
CCDS32 VLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML
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pF1KSD ILEQI--LNSFESCLIPQLSSSPPDVEAMRIYLILPEFPLLQDSKYYITLTIPL-AMAIL
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CCDS45 KLPLAAQGKLIRLWSKYNADQIRRMMETFQQLITYKVISNE-FNSRNLVNDDDAIVAASK
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        :. .: .:.      ..: : :    ::: :.:. .::              : :   :
CCDS45 CLKMVYYANVVGGEVDTNHNEEDDEEPIPESSELT-LQELLGEERRNKKGPRVDPLETEL
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           .  :  .:                           ..  .. . :::..: .:.  
CCDS45 GVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLEMDKDYTFFKVETENKFSFMTCPFILNAVTKNLG
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       :  : ...:       . . . .: .:      .:.: :.:::.... ::: .:   ...
CCDS45 LYYDNRIRMY------SERRITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDHIIDDALVRLEMIAME
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         .. : ::::. ::::::. ..:.:::...:.::.. :  ..:: .  :.  .::..::
CCDS45 ETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLL
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       .: : .::. . ..: : . . .:   .  :  .::.. . ..::.:::. : .:... :
CCDS45 EYEG-NVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKS
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pF1KSD VHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLE-LFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHP
       :.. . ::  ::  : . . :. ::.: :.. .. :. : ... ::::. : : :.    
CCDS45 VEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSV
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        .. :::  : :  :.:. :: : ::.:: :. :...:...: ...   : ::..:::.:
CCDS45 LIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTERLPTSHTCFN
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       .: ::.::::: :. :: .:.   .::.. 
CCDS45 VLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML
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CCDS45 AACSAAAMEEDSEASSSRIGDSSQGDNNLQKLGPDDVSVDIDAIRRVYTRLLSNEKIETA
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CCDS45 FLNALVYLSPNVECDLTYHNVYSRDPNYLNLFIIVMENRNLH-SPEYLEMALPLFCKAMS
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pF1KSD RLDTNPSKVLDNWWSQVCPKYFMKLVNLYKGAVLYLLRGRKTFLIPVLFNN--YITAALK
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CCDS45 KLPLAAQGKLIRLWSKYNADQIRRMMETFQQLITYKVISNE-FNSRNLVNDDDAIVAASK
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        :. .: .:.      ..: : :    ::: :.:. .::              : :   :
CCDS45 CLKMVYYANVVGGEVDTNHNEEDDEEPIPESSELT-LQELLGEERRNKKGPRVDPLETEL
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CCDS45 LYYDNRIRMY------SERRITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDHIIDDALVRLEMIAME
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