Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0019
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0019, 828 aa
  1>>>pF1KSDA0019 828 - 828 aa - 828 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3778+/-0.00111; mu= -1.8098+/- 0.066
 mean_var=266.7186+/-55.082, 0's: 0 Z-trim(112.5): 74  B-trim: 348 in 1/52
 Lambda= 0.078532
 statistics sampled from 13213 (13284) to 13213 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.732), E-opt: 0.2 (0.408), width:  16
 Scan time:  4.220

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10        ( 828) 5642 653.0 5.8e-187
CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10        ( 845) 5630 651.7 1.5e-186
CCDS11069.2 USP6 gene_id:9098|Hs108|chr17          (1406)  918 118.0 1.2e-25
CCDS74042.1 TBC1D3K gene_id:101060351|Hs108|chr17  ( 549)  865 111.7 3.5e-24
CCDS42300.1 TBC1D3B gene_id:414059|Hs108|chr17     ( 549)  863 111.5 4.1e-24
CCDS74045.1 TBC1D3C gene_id:414060|Hs108|chr17     ( 549)  858 110.9   6e-24
CCDS45658.1 TBC1D3 gene_id:729873|Hs108|chr17      ( 549)  858 110.9   6e-24
CCDS74040.1 TBC1D3G gene_id:101060321|Hs108|chr17  ( 549)  856 110.7 7.1e-24
CCDS74039.1 TBC1D3I gene_id:102724862|Hs108|chr17  ( 549)  855 110.6 7.6e-24
CCDS74044.1 LOC101060389 gene_id:101060389|Hs108|c ( 549)  854 110.5 8.3e-24
CCDS77009.1 TBC1D3E gene_id:102723859|Hs108|chr17  ( 549)  853 110.4 8.9e-24
CCDS45653.1 TBC1D3H gene_id:729877|Hs108|chr17     ( 549)  850 110.0 1.1e-23
CCDS74043.1 TBC1D3L gene_id:101060376|Hs108|chr17  ( 549)  843 109.2   2e-23
CCDS42265.1 TBC1D26 gene_id:353149|Hs108|chr17     ( 250)  596 81.0 2.7e-15
CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1           ( 810)  525 73.3 1.9e-12
CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1           ( 821)  525 73.3 1.9e-12
CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19       ( 794)  519 72.6   3e-12
CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19       ( 805)  519 72.6   3e-12
CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22     ( 508)  504 70.8 6.7e-12
CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22     ( 515)  502 70.6 7.9e-12
CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16     ( 808)  503 70.8 1.1e-11


>>CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10             (828 aa)
 initn: 5642 init1: 5642 opt: 5642  Z-score: 3470.1  bits: 653.0 E(32554): 5.8e-187
Smith-Waterman score: 5642; 100.0% identity (100.0% similar) in 828 aa overlap (1-828:1-828)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MNSDQDVALKLAQERAEIVAKYDRGREGAEIEPWEDADYLVYKVTDRFGFLHEEELPDHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MNSDQDVALKLAQERAEIVAKYDRGREGAEIEPWEDADYLVYKVTDRFGFLHEEELPDHN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD VAVERQKHLEIERTTKWLKMLKGWEKYKNTEKFHRRIYKGIPLQLRGEVWALLLEIPKMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VAVERQKHLEIERTTKWLKMLKGWEKYKNTEKFHRRIYKGIPLQLRGEVWALLLEIPKMK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD EETRDLYSKLKHRARGCSPDIRQIDLDVNRTFRDHIMFRDRYGVKQQSLFHVLAAYSIYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EETRDLYSKLKHRARGCSPDIRQIDLDVNRTFRDHIMFRDRYGVKQQSLFHVLAAYSIYN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD TEVGYCQGMSQITALLLMYMNEEDAFWALVKLFSGPKHAMHGFFVQGFPKLLRFQEHHEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TEVGYCQGMSQITALLLMYMNEEDAFWALVKLFSGPKHAMHGFFVQGFPKLLRFQEHHEK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD ILNKFLSKLKQHLDSQEIYTSFYTMKWFFQCFLDRTPFTLNLRIWDIYIFEGERVLTAMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ILNKFLSKLKQHLDSQEIYTSFYTMKWFFQCFLDRTPFTLNLRIWDIYIFEGERVLTAMS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD YTILKLHKKHLMKLSMEELVEFFQETLAKDFFFEDDFVIEQLQISMTELKRAKLDLPEPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YTILKLHKKHLMKLSMEELVEFFQETLAKDFFFEDDFVIEQLQISMTELKRAKLDLPEPG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD KEDEYPKKPLGQLPPELQSWGVHHLSNGQRSVGRPSPLASGRRESGAPHRRHEHSPHPQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KEDEYPKKPLGQLPPELQSWGVHHLSNGQRSVGRPSPLASGRRESGAPHRRHEHSPHPQS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD RTGTPERAQPPRRKSVEEESKKLKDEADFQRKLPSGPQDSSRQYNHAAANQNSNATSNIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RTGTPERAQPPRRKSVEEESKKLKDEADFQRKLPSGPQDSSRQYNHAAANQNSNATSNIR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD KEFVPKWNKPSDVSATERTAKYTMEGKGRAAHPALAVTVPGPAEVRVSNVRPKMKALDAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KEFVPKWNKPSDVSATERTAKYTMEGKGRAAHPALAVTVPGPAEVRVSNVRPKMKALDAE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD DGKRGSTASQYDNVPGPELDSGASVEEALERAYSQSPRHALYPPSPRKHAEPSSSPSKVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DGKRGSTASQYDNVPGPELDSGASVEEALERAYSQSPRHALYPPSPRKHAEPSSSPSKVS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD NKFTFKVQPPSHARYPSQLDGEARGLAHPPSYSNPPVYHGNSPKHFPTANSSFASPQFSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NKFTFKVQPPSHARYPSQLDGEARGLAHPPSYSNPPVYHGNSPKHFPTANSSFASPQFSP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD GTQLNPSRRPHGSTLSVSASPEKSYSRPSPLVLPSSRIEVLPVDTGAGGYSGNSGSPKNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GTQLNPSRRPHGSTLSVSASPEKSYSRPSPLVLPSSRIEVLPVDTGAGGYSGNSGSPKNG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD KLIIPPVDYLPDNRTWSEVSYTYRPETQGQSWTRDASRGNLPKYSAFQLAPFQDHGLPAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KLIIPPVDYLPDNRTWSEVSYTYRPETQGQSWTRDASRGNLPKYSAFQLAPFQDHGLPAV
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820        
pF1KSD SVDSPVRYKASPAAEDASPSGYPYSGPPPPAYHYRNRDGLSIQESVLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SVDSPVRYKASPAAEDASPSGYPYSGPPPPAYHYRNRDGLSIQESVLL
              790       800       810       820        

>>CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10             (845 aa)
 initn: 5630 init1: 5630 opt: 5630  Z-score: 3462.6  bits: 651.7 E(32554): 1.5e-186
Smith-Waterman score: 5630; 99.9% identity (100.0% similar) in 827 aa overlap (2-828:19-845)

                                10        20        30        40   
pF1KSD                  MNSDQDVALKLAQERAEIVAKYDRGREGAEIEPWEDADYLVYK
                         .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MRTEAVVNSQGQTDYLTKDSDQDVALKLAQERAEIVAKYDRGREGAEIEPWEDADYLVYK
               10        20        30        40        50        60

            50        60        70        80        90       100   
pF1KSD VTDRFGFLHEEELPDHNVAVERQKHLEIERTTKWLKMLKGWEKYKNTEKFHRRIYKGIPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VTDRFGFLHEEELPDHNVAVERQKHLEIERTTKWLKMLKGWEKYKNTEKFHRRIYKGIPL
               70        80        90       100       110       120

           110       120       130       140       150       160   
pF1KSD QLRGEVWALLLEIPKMKEETRDLYSKLKHRARGCSPDIRQIDLDVNRTFRDHIMFRDRYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QLRGEVWALLLEIPKMKEETRDLYSKLKHRARGCSPDIRQIDLDVNRTFRDHIMFRDRYG
              130       140       150       160       170       180

           170       180       190       200       210       220   
pF1KSD VKQQSLFHVLAAYSIYNTEVGYCQGMSQITALLLMYMNEEDAFWALVKLFSGPKHAMHGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VKQQSLFHVLAAYSIYNTEVGYCQGMSQITALLLMYMNEEDAFWALVKLFSGPKHAMHGF
              190       200       210       220       230       240

           230       240       250       260       270       280   
pF1KSD FVQGFPKLLRFQEHHEKILNKFLSKLKQHLDSQEIYTSFYTMKWFFQCFLDRTPFTLNLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FVQGFPKLLRFQEHHEKILNKFLSKLKQHLDSQEIYTSFYTMKWFFQCFLDRTPFTLNLR
              250       260       270       280       290       300

           290       300       310       320       330       340   
pF1KSD IWDIYIFEGERVLTAMSYTILKLHKKHLMKLSMEELVEFFQETLAKDFFFEDDFVIEQLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IWDIYIFEGERVLTAMSYTILKLHKKHLMKLSMEELVEFFQETLAKDFFFEDDFVIEQLQ
              310       320       330       340       350       360

           350       360       370       380       390       400   
pF1KSD ISMTELKRAKLDLPEPGKEDEYPKKPLGQLPPELQSWGVHHLSNGQRSVGRPSPLASGRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ISMTELKRAKLDLPEPGKEDEYPKKPLGQLPPELQSWGVHHLSNGQRSVGRPSPLASGRR
              370       380       390       400       410       420

           410       420       430       440       450       460   
pF1KSD ESGAPHRRHEHSPHPQSRTGTPERAQPPRRKSVEEESKKLKDEADFQRKLPSGPQDSSRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ESGAPHRRHEHSPHPQSRTGTPERAQPPRRKSVEEESKKLKDEADFQRKLPSGPQDSSRQ
              430       440       450       460       470       480

           470       480       490       500       510       520   
pF1KSD YNHAAANQNSNATSNIRKEFVPKWNKPSDVSATERTAKYTMEGKGRAAHPALAVTVPGPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YNHAAANQNSNATSNIRKEFVPKWNKPSDVSATERTAKYTMEGKGRAAHPALAVTVPGPA
              490       500       510       520       530       540

           530       540       550       560       570       580   
pF1KSD EVRVSNVRPKMKALDAEDGKRGSTASQYDNVPGPELDSGASVEEALERAYSQSPRHALYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EVRVSNVRPKMKALDAEDGKRGSTASQYDNVPGPELDSGASVEEALERAYSQSPRHALYP
              550       560       570       580       590       600

           590       600       610       620       630       640   
pF1KSD PSPRKHAEPSSSPSKVSNKFTFKVQPPSHARYPSQLDGEARGLAHPPSYSNPPVYHGNSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PSPRKHAEPSSSPSKVSNKFTFKVQPPSHARYPSQLDGEARGLAHPPSYSNPPVYHGNSP
              610       620       630       640       650       660

           650       660       670       680       690       700   
pF1KSD KHFPTANSSFASPQFSPGTQLNPSRRPHGSTLSVSASPEKSYSRPSPLVLPSSRIEVLPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KHFPTANSSFASPQFSPGTQLNPSRRPHGSTLSVSASPEKSYSRPSPLVLPSSRIEVLPV
              670       680       690       700       710       720

           710       720       730       740       750       760   
pF1KSD DTGAGGYSGNSGSPKNGKLIIPPVDYLPDNRTWSEVSYTYRPETQGQSWTRDASRGNLPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DTGAGGYSGNSGSPKNGKLIIPPVDYLPDNRTWSEVSYTYRPETQGQSWTRDASRGNLPK
              730       740       750       760       770       780

           770       780       790       800       810       820   
pF1KSD YSAFQLAPFQDHGLPAVSVDSPVRYKASPAAEDASPSGYPYSGPPPPAYHYRNRDGLSIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YSAFQLAPFQDHGLPAVSVDSPVRYKASPAAEDASPSGYPYSGPPPPAYHYRNRDGLSIQ
              790       800       810       820       830       840

            
pF1KSD ESVLL
       :::::
CCDS44 ESVLL
            

>>CCDS11069.2 USP6 gene_id:9098|Hs108|chr17               (1406 aa)
 initn: 934 init1: 900 opt: 918  Z-score: 574.1  bits: 118.0 E(32554): 1.2e-25
Smith-Waterman score: 926; 36.1% identity (64.3% similar) in 451 aa overlap (12-462:12-447)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MNSDQDVALKLAQERAEIVAKYDRGREGAEIEPWEDADYLVYKVTDRFGFLHEEELPDHN
                  :::: .:. :::.:....  :        . .  ::::.::: :::  .
CCDS11 MDMVENADSLQAQERKDILMKYDKGHRAGLPEDKGPEPVGINSSIDRFGILHETELPPVT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD VAVERQKHLEIERTTKWLKMLKGWEKYKNTEKFHRRIYKGIPLQLRGEVWALLLEIPKMK
       .   .. . :. ::.::..::  :: ::.. :.  :.:::::...:: ::..::.: ..:
CCDS11 AREAKKIRREMTRTSKWMEMLGEWETYKHSSKLIDRVYKGIPMNIRGPVWSVLLNIQEIK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD EETRDLYSKLKHRARGCSPDIRQIDLDVNRTFRDHIMFRDRYGVKQQSLFHVLAAYSIYN
        ..   :. .:.:..  :  :..:::::  :.:.:..::::::.::. ::..: ::: ::
CCDS11 LKNPGRYQIMKERGKRSSEHIHHIDLDVRTTLRNHVFFRDRYGAKQRELFYILLAYSEYN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD TEVGYCQGMSQITALLLMYMNEEDAFWALVKLFSGPKHAMHGFFVQGFPKLLRFQEHHEK
        :::::. .:.::::.:.:. :::::::::.:... .:.. ::   .   .  .:...:.
CCDS11 PEVGYCRDLSHITALFLLYLPEEDAFWALVQLLASERHSLPGFHSPNGGTVQGLQDQQEH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD ILNKFLSKLKQHLDSQEIYTSFYTMKWFFQCFLDRTPFTLNLRIWDIYIFEGERVLTAMS
       .. :   :   : :.. .  .  ..  ... ..:   . :.::.::.:. :::.::  ..
CCDS11 VVPKSQPKTMWHQDKEGLCGQCASLGCLLRNLIDGISLGLTLRLWDVYLVEGEQVLMPIT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD YTILKLHKKHLMKLSMEELVEFFQETLAKDFFFEDDFVIEQLQISMTELKRAKLDLPEPG
          ::...:.::: :   :   ... .   . ..:: :...:. :  .: : . ::: :.
CCDS11 SIALKVQQKRLMKTSRCGLWARLRNQFFDTWAMNDDTVLKHLRASTKKLTRKQGDLPPPA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD KEDEYPKKPLGQLPPELQSWGVHHLSNGQRSVGRPSPLASGRRESGAPHRRHEHSPHPQS
       :...    :     :   : : . : .: :..  :.: :. .:   .       ::   :
CCDS11 KREQGSLAPR----PVPASRGGKTLCKGYRQAP-PGPPAQFQRPICSA------SPPWAS
              370           380        390       400               

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD RTGTPERAQPPRRKSVEEESKKLKDEADFQRKLPSGPQDSSRQYNHAAANQNSNATSNIR
       : .::  .   :. .    .. . . :  :    .::: : :                  
CCDS11 RFSTPCPGGAVREDTYPVGTQGVPSLALAQ----GGPQGSWRFLEWKSMPRLPTDLDIGG
     410       420       430           440       450       460     

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD KEFVPKWNKPSDVSATERTAKYTMEGKGRAAHPALAVTVPGPAEVRVSNVRPKMKALDAE
                                                                   
CCDS11 PWFPHYDFEWSCWVRAISQEDQLATCWQAEHCGEVHNKDMSWPEEMSFTANSSKIDRQKV
         470       480       490       500       510       520     

>>CCDS74042.1 TBC1D3K gene_id:101060351|Hs108|chr17       (549 aa)
 initn: 825 init1: 778 opt: 865  Z-score: 547.7  bits: 111.7 E(32554): 3.5e-24
Smith-Waterman score: 869; 34.8% identity (63.9% similar) in 463 aa overlap (12-465:12-453)

               10        20        30        40         50         
pF1KSD MNSDQDVALKLAQERAEIVAKYDRGREGAEIEPWEDADYLVYKVT-DRFGFLHEEELPDH
                  :::: .:. ::..:....  :      .  :. . :..:..:: :::  
CCDS74 MDVVEVAGSWWAQEREDIIMKYEKGHRAGLPEDKGPKPFRSYNNNVDHLGIVHETELPPL
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD NVAVERQKHLEIERTTKWLKMLKGWEKYKNTEKFHRRIYKGIPLQLRGEVWALLLEIPKM
       ..   .: . :: : .::. ::  :::::...:.  : :::.:...:: .:..::.: .:
CCDS74 TAREAKQIRREISRKSKWVDMLGDWEKYKSSRKLIDRAYKGMPMNIRGPMWSVLLNIEEM
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD KEETRDLYSKLKHRARGCSPDIRQIDLDVNRTFRDHIMFRDRYGVKQQSLFHVLAAYSIY
       : ..   :. .:....  :  :..:: ::. :.: ::.::::::.::. :.:.: ::  :
CCDS74 KLKNPGRYQIMKEKGKKSSEHIQRIDRDVSGTLRKHIFFRDRYGTKQRELLHILLAYEEY
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD NTEVGYCQGMSQITALLLMYMNEEDAFWALVKLFSGPKHAMHGFFVQGFPKLLRFQEHHE
       : :::::. .:.:.::.:.:. :::::::::.:... .:...::   .   .  .:...:
CCDS74 NPEVGYCRDLSHIAALFLLYLPEEDAFWALVQLLASERHSLQGFHSPNGGTVQGLQDQQE
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD KILNKFLSKLKQHLDSQEIYTSFYTMKWFFQCFLDRTPFTLNLRIWDIYIFEGERVLTAM
       ...     :   : :....  .   .  ... ..:   . :.::.::.:. :::..:  .
CCDS74 HVVATSQPKTMGHQDKKDLCGQCSPLGCLIRILIDGISLGLTLRLWDVYLVEGEQALMPI
              250       260       270       280       290       300

     300       310           320       330       340       350     
pF1KSD SYTILKLHKKHLMKLS----MEELVEFFQETLAKDFFFEDDFVIEQLQISMTELKRAKLD
       .   .:...:.: : :      .. . : .: :.:    .: :...:. :: .: : : :
CCDS74 TRIAFKVQQKRLTKTSRCGPWARFCNRFVDTWARD----EDTVLKHLRASMKKLTRKKGD
              310       320       330           340       350      

         360       370       380       390       400         410   
pF1KSD LPEPGKEDEYPKKPLGQLPPELQSWGVHHLSNGQRSVGRPSPLASGRRE--SGAPHRRHE
       :: :.:    :..  .   :   : : . : .:.:..  :.: :   :   :..: :   
CCDS74 LPPPAK----PEQGSSASRPVPASRGGKTLCKGDRQAP-PGPPARFPRPIWSASPPR---
        360           370       380       390        400           

           420       430       440       450       460         470 
pF1KSD HSPHPQSRTGTPERAQPPRRKSVEEESKKLKDEADFQRKLPSGPQDSSR--QYNHAAANQ
        .:    :..::  .   :. .    .. . . :  :    .::: : :  :.:      
CCDS74 -AP----RSSTPCPGGAVREDTYPVGTQGVPSPALAQ----GGPQGSWRFLQWNSMPRLP
       410           420       430       440           450         

             480       490       500       510       520       530 
pF1KSD NSNATSNIRKEFVPKWNKPSDVSATERTAKYTMEGKGRAAHPALAVTVPGPAEVRVSNVR
                                                                   
CCDS74 TDLDVEGPWFRHYDFRQSCWVRAISQEDQLAPCWQAEHPAERVRSAFAAPSTDSDQGTPF
     460       470       480       490       500       510         

>>CCDS42300.1 TBC1D3B gene_id:414059|Hs108|chr17          (549 aa)
 initn: 822 init1: 775 opt: 863  Z-score: 546.4  bits: 111.5 E(32554): 4.1e-24
Smith-Waterman score: 867; 34.3% identity (64.1% similar) in 463 aa overlap (12-465:12-453)

               10        20        30        40         50         
pF1KSD MNSDQDVALKLAQERAEIVAKYDRGREGAEIEPWEDADYLVYKVT-DRFGFLHEEELPDH
                  :::: .:. ::..:....  :      .  :. . :..:..:: :::  
CCDS42 MDVVEVAGSWWAQEREDIIMKYEKGHRAGLPEDKGPKPFRSYNNNVDHLGIVHETELPPL
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD NVAVERQKHLEIERTTKWLKMLKGWEKYKNTEKFHRRIYKGIPLQLRGEVWALLLEIPKM
       ..   .: . :: : .::. ::  :::::...:.  : :::.:...:: .:..::.: .:
CCDS42 TAREAKQIRREISRKSKWVDMLGDWEKYKSSRKLIDRAYKGMPMNIRGPMWSVLLNIEEM
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD KEETRDLYSKLKHRARGCSPDIRQIDLDVNRTFRDHIMFRDRYGVKQQSLFHVLAAYSIY
       : ..   :. .:....  :  :..:: :.. :.: :..::::::.::. :.:.: ::  :
CCDS42 KLKNPGRYQIMKEKGKRSSEHIQRIDRDISGTLRKHMFFRDRYGTKQRELLHILLAYEEY
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD NTEVGYCQGMSQITALLLMYMNEEDAFWALVKLFSGPKHAMHGFFVQGFPKLLRFQEHHE
       : :::::. .:.:.::.:.:. :::::::::.:... .:...::   .   .  .:...:
CCDS42 NPEVGYCRDLSHIAALFLLYLPEEDAFWALVQLLASERHSLQGFHSPNGGTVQGLQDQQE
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD KILNKFLSKLKQHLDSQEIYTSFYTMKWFFQCFLDRTPFTLNLRIWDIYIFEGERVLTAM
       ...    ::   : :....  .   .  ... ..:   . :.::.::.:. :::..:  .
CCDS42 HVVATSQSKTMGHQDKKDLCGQCSPLGCLIRILIDGISLGLTLRLWDVYLVEGEQALMPI
              250       260       270       280       290       300

     300       310           320       330       340       350     
pF1KSD SYTILKLHKKHLMKLS----MEELVEFFQETLAKDFFFEDDFVIEQLQISMTELKRAKLD
       .   .:...:.: : :      .. . : .: :.:    .: :...:. :: .: : . :
CCDS42 TRIAFKVQQKRLTKTSRCGPWARFCNRFVDTWARD----EDTVLKHLRASMKKLTRKQGD
              310       320       330           340       350      

         360       370       380       390       400         410   
pF1KSD LPEPGKEDEYPKKPLGQLPPELQSWGVHHLSNGQRSVGRPSPLASGRRE--SGAPHRRHE
       :: :.:    :..  .   :   : : . : .:.:..  :.: :   :   :..: :   
CCDS42 LPPPAK----PEQGSSASRPVPASRGRKTLCKGDRQAP-PGPPARFPRPIWSASPPR---
        360           370       380       390        400           

           420       430       440       450       460         470 
pF1KSD HSPHPQSRTGTPERAQPPRRKSVEEESKKLKDEADFQRKLPSGPQDSSR--QYNHAAANQ
        .:    :..::  .   :. .    .. . . :  :    .::: : :  :.:      
CCDS42 -AP----RSSTPCPGGAVREDTYPVGTQGVPSPALAQ----GGPQGSWRFLQWNSMPRLP
       410           420       430       440           450         

             480       490       500       510       520       530 
pF1KSD NSNATSNIRKEFVPKWNKPSDVSATERTAKYTMEGKGRAAHPALAVTVPGPAEVRVSNVR
                                                                   
CCDS42 TDLDVEGPWFRHYDFRQSCWVRAISQEDQLAPCWQAEHPAERVRSAFAAPSTDSDQGTPF
     460       470       480       490       500       510         

>>CCDS74045.1 TBC1D3C gene_id:414060|Hs108|chr17          (549 aa)
 initn: 818 init1: 771 opt: 858  Z-score: 543.4  bits: 110.9 E(32554): 6e-24
Smith-Waterman score: 862; 34.6% identity (63.7% similar) in 463 aa overlap (12-465:12-453)

               10        20        30        40         50         
pF1KSD MNSDQDVALKLAQERAEIVAKYDRGREGAEIEPWEDADYLVYKVT-DRFGFLHEEELPDH
                  :::: .:. ::..:....  :      .  :. . :..:..:: :::  
CCDS74 MDVVEVAGSWWAQEREDIIMKYEKGHRAGLPEDKGPKPFRSYNNNVDHLGIVHETELPPL
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pF1KSD NVAVERQKHLEIERTTKWLKMLKGWEKYKNTEKFHRRIYKGIPLQLRGEVWALLLEIPKM
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CCDS74 TAREAKQIRREISRKSKWVDMLGDWEKYKSSRKLIDRAYKGMPMNIRGPMWSVLLNTEEM
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>>CCDS45658.1 TBC1D3 gene_id:729873|Hs108|chr17           (549 aa)
 initn: 818 init1: 771 opt: 858  Z-score: 543.4  bits: 110.9 E(32554): 6e-24
Smith-Waterman score: 862; 34.6% identity (63.7% similar) in 463 aa overlap (12-465:12-453)

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CCDS45 MDVVEVAGSWWAQEREDIIMKYEKGHRAGLPEDKGPKPFRSYNNNVDHLGIVHETELPPL
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CCDS45 TAREAKQIRREISRKSKWVDMLGDWEKYKSSRKLIDRAYKGMPMNIRGPMWSVLLNTEEM
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CCDS45 HVVATSQPKTMGHQDKKDLCGQCSPLGCLIRILIDGISLGLTLRLWDVYLVEGEQALMPI
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>>CCDS74040.1 TBC1D3G gene_id:101060321|Hs108|chr17       (549 aa)
 initn: 816 init1: 769 opt: 856  Z-score: 542.2  bits: 110.7 E(32554): 7.1e-24
Smith-Waterman score: 860; 34.1% identity (63.9% similar) in 463 aa overlap (12-465:12-453)

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CCDS74 MDVVEVAGSWWAQEREDIIMKYEKGHRAGLPEDKGPKPFRSYNNNVDHLGIVHETELPPL
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       ...     :   : :....  .   .  ... ..:   . :.::.::.:. :::..:  .
CCDS74 HVVATSQPKTMGHQDKKDLCGQCSPLGCLIRILIDGISLGLTLRLWDVYLVEGEQALMPI
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       .   .:...:.: : :      .. . : .: :.:    .: :...:. :: .: : . :
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       :: :.:    :..  .   :   : : . : .:.:..  :.: :   :   :..: :   
CCDS74 LPPPAK----PEQGSSASRPVPASRGGKTLCKGDRQAP-PGPPARFPRPIWSASPPR---
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pF1KSD HSPHPQSRTGTPERAQPPRRKSVEEESKKLKDEADFQRKLPSGPQDSSR--QYNHAAANQ
        .:    :..::  .   :. .    .. . . :  :    .::: : :  :.:      
CCDS74 -AP----RSSTPCPGGAVREDTYPVGTQGVPSPALAQ----GGPQGSWRFLQWNSMPRLP
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CCDS74 TDLDVEGPWFRHYDFRQSCWVRAISQEDQLAPCWQAEHPAERVRSAFAAPSTDSDQGTPF
     460       470       480       490       500       510         

>>CCDS74039.1 TBC1D3I gene_id:102724862|Hs108|chr17       (549 aa)
 initn: 815 init1: 768 opt: 855  Z-score: 541.5  bits: 110.6 E(32554): 7.6e-24
Smith-Waterman score: 859; 34.3% identity (63.7% similar) in 463 aa overlap (12-465:12-453)

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CCDS74 MDVVEVAGSWWAQEREDIIMKYEKGHRAGLPEDKGPKPFRSYNNNVDHLGIVHETELPPL
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pF1KSD NVAVERQKHLEIERTTKWLKMLKGWEKYKNTEKFHRRIYKGIPLQLRGEVWALLLEIPKM
       ..   .: . :: : .::. ::  :::::...:.  : :::.:...:: .:..::.  .:
CCDS74 TAREAKQIRREISRKSKWVDMLGDWEKYKSSRKLIDRAYKGMPMNIRGPMWSVLLNTEEM
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pF1KSD KEETRDLYSKLKHRARGCSPDIRQIDLDVNRTFRDHIMFRDRYGVKQQSLFHVLAAYSIY
       : ..   :. .:....  :  :..:: ::. :.: ::.::::::.::. :.:.: ::  :
CCDS74 KMKNPGRYQIMKEKGKRSSEHIQRIDRDVSGTLRKHIFFRDRYGTKQRELLHILLAYEEY
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD NTEVGYCQGMSQITALLLMYMNEEDAFWALVKLFSGPKHAMHGFFVQGFPKLLRFQEHHE
       : :::::. .:.:.::.:.:. :::::::::.:... .:...::   .   .  .:...:
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       ...     :   : :....  .   .  ... ..:   . :.::.::.:. :::..:  .
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       .   .:...:.: : :      .. . : .: :.:    .: :...:. :: .: : . :
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        .:    :..::  .   :. .    .. . . :  :    .::: : :  :.:      
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