Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0017
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0017, 1217 aa
  1>>>pF1KSDA0017 1217 - 1217 aa - 1217 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0014+/-0.000497; mu= 23.7311+/- 0.031
 mean_var=59.7589+/-12.019, 0's: 0 Z-trim(107.3): 49  B-trim: 248 in 2/50
 Lambda= 0.165910
 statistics sampled from 15359 (15368) to 15359 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.523), E-opt: 0.2 (0.18), width:  16
 Scan time: 13.150

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_036558 (OMIM: 605592) splicing factor 3B subuni (1217) 8032 1932.1       0
NP_001914 (OMIM: 600045) DNA damage-binding protei (1140)  367 97.4 5.5e-19
XP_011515299 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage an (1365)  157 47.2 0.00086
XP_011515300 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage an (1365)  157 47.2 0.00086
XP_006716612 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage an (1365)  157 47.2 0.00086
XP_011515301 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage an (1365)  157 47.2 0.00086
XP_006716611 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage an (1440)  157 47.2  0.0009
NP_037423 (OMIM: 606027) cleavage and polyadenylat (1443)  157 47.2  0.0009
XP_006716613 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage an ( 785)  152 45.9  0.0012


>>NP_036558 (OMIM: 605592) splicing factor 3B subunit 3   (1217 aa)
 initn: 8032 init1: 8032 opt: 8032  Z-score: 10376.9  bits: 1932.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8032; 100.0% identity (100.0% similar) in 1217 aa overlap (1-1217:1-1217)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MFLYNLTLQRATGISFAIHGNFSGTKQQEIVVSRGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MFLYNLTLQRATGISFAIHGNFSGTKQQEIVVSRGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD VIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIVILEYQPSKNMFEKIHQETFGKSGCRRIVPGQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 VIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIVILEYQPSKNMFEKIHQETFGKSGCRRIVPGQF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD LAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYILNRDAAARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVGFENP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYILNRDAAARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVGFENP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD MFACLEMDYEEADNDPTGEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKYSEPLEEHGNFLITVPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MFACLEMDYEEADNDPTGEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKYSEPLEEHGNFLITVPG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD GSDGPSGVLICSENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 GSDGPSGVLICSENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD FLAQTEQGDIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAAAMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 FLAQTEQGDIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAAAMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD IAHLGDDDEEPEFSSAMPLEEGDTFFFQPRPLKNLVLVDELDSLSPILFCQIADLANEDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 IAHLGDDDEEPEFSSAMPLEEGDTFFFQPRPLKNLVLVDELDSLSPILFCQIADLANEDT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD PQLYVACGRGPRSSLRVLRHGLEVSEMAVSELPGNPNAVWTVRRHIEDEFDAYIIVSFVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 PQLYVACGRGPRSSLRVLRHGLEVSEMAVSELPGNPNAVWTVRRHIEDEFDAYIIVSFVN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD ATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDALVQVYPDGIRHIRADKRVNEWKTPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 ATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDALVQVYPDGIRHIRADKRVNEWKTPG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD KKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSLANVPPGEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 KKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSLANVPPGEQ
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD RSRFLAVGLVDNTVRIISLDPSDCLQPLSMQALPAQPESLCIVEMGGTEKQDELGERGSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 RSRFLAVGLVDNTVRIISLDPSDCLQPLSMQALPAQPESLCIVEMGGTEKQDELGERGSI
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD GFLYLNIGLQNGVLLRTVLDPVTGDLSDTRTRYLGSRPVKLFRVRMQGQEAVLAMSSRSW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 GFLYLNIGLQNGVLLRTVLDPVTGDLSDTRTRYLGSRPVKLFRVRMQGQEAVLAMSSRSW
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD LSYSYQSRFHLTPLSYETLEFASGFASEQCPEGIVAISTNTLRILALEKLGAVFNQVAFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LSYSYQSRFHLTPLSYETLEFASGFASEQCPEGIVAISTNTLRILALEKLGAVFNQVAFP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD LQYTPRKFVIHPESNNLIIIETDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LQYTPRKFVIHPESNNLIIIETDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD AFLNENLPESIFGAPKAGNGQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 AFLNENLPESIFGAPKAGNGQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD EDWYVLVGVAKDLILNPRSVAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 EDWYVLVGVAKDLILNPRSVAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVL
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD IGVGKLLRVYDLGKKKLLRKCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 IGVGKLLRVYDLGKKKLLRKCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQ
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD LIIFADDTYPRWVTTASLLDYDTVAGADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LIIFADDTYPRWVTTASLLDYDTVAGADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD LLNGASQKAEVIMNYHVGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFTSHEDHDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LLNGASQKAEVIMNYHVGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFTSHEDHDF
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD FQHVEMHLRSEHPPLCGRDHLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 FQHVEMHLRSEHPPLCGRDHLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRT
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210       
pF1KSD PPEVSKKLEDIRTRYAF
       :::::::::::::::::
NP_036 PPEVSKKLEDIRTRYAF
             1210       

>>NP_001914 (OMIM: 600045) DNA damage-binding protein 1   (1140 aa)
 initn: 376 init1: 160 opt: 367  Z-score: 461.9  bits: 97.4 E(85289): 5.5e-19
Smith-Waterman score: 871; 23.5% identity (54.5% similar) in 1217 aa overlap (4-1197:5-1112)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD  MFLYNLTLQRATGISFAIHGNFSGTKQQEIVVSRGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVF
           : .: :. :...  . :.:..... .......  ::.     .   .. .  : ..
NP_001 MSYNYVVTAQKPTAVNGCVTGHFTSAEDLNLLIAKNTRLEIYVVTAEG--LRPVKEVGMY
               10        20        30        40          50        

      60        70        80        90          100       110      
pF1KSD GVIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIVILEYQPSK---NMFEKIHQETFGKSGCRRIV
       : :  .  ::  : .:: . . . .    ::::. :    ... . : ..  . : :   
NP_001 GKIAVMELFRPKGESKDLLFILTAKYNACILEYKQSGESIDIITRAHGNVQDRIG-RPSE
       60        70        80        90       100       110        

        120       130       140       150       160       170      
pF1KSD PGQFLAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYILNRDAAARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVG
        : .  .::. : . .   .    :  :.::       .. :.: .      ::.  :: 
NP_001 TGIIGIIDPECRMIGLRLYDGLFKVIPLDRD-------NKELKAFNIRLEELHVI--DVK
       120       130       140              150       160          

        180       190       200       210       220       230      
pF1KSD FENPMFACLEMDYEEADNDPTGEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKYSEPLEEHGNFLI
       :   ...:       . .:: :. . . . .:   :.. :  .     .: .: .....:
NP_001 F---LYGCQAPTICFVYQDPQGRHVKTYEVSLREKEFNKGPWK-----QENVEAEASMVI
         170       180       190       200            210       220

        240       250       260        270       280       290     
pF1KSD TVPGGSDGPSGVLICSENYITYKNFGDQP-DIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKT
       .::   .  .:..: ... :::.: ::.   :  :: .. .          .::      
NP_001 AVP---EPFGGAIIIGQESITYHN-GDKYLAIAPPIIKQST----------IVCHNRVDP
                 230       240        250                 260      

         300       310       320            330       340       350
pF1KSD KSMFFFLAQTEQGDIFKITLETDEDM---VT--EIRLKYFDTVPVAAAMCVLKTGFLFVA
       ..  ..:.. : : .: . :: .:.:   ::  ..:.. .  . .:  .  : .: .::.
NP_001 NGSRYLLGDME-GRLFMLLLEKEEQMDGTVTLKDLRVELLGETSIAECLTYLDNGVVFVG
        270        280       290       300       310       320     

              360       370       380       390       400       410
pF1KSD SEFGNHYLYQIAHLGDDDEEPEFSSAMPLEEGDTFFFQPRPLKNLVLVDELDSLSPILFC
       :..:.  : ..    :..:.  .  ::     .::                 .:.::.  
NP_001 SRLGDSQLVKLNV--DSNEQGSYVVAM-----ETF----------------TNLGPIVDM
         330         340       350                            360  

              420       430       440       450       460       470
pF1KSD QIADLANEDTPQLYVACGRGPRSSLRVLRHGLEVSEMAVSELPGNPNAVWTVRRHIEDEF
        ..::  .   :: .  :   ..:::..:.:. . : :  .:::  ...: .:   . : 
NP_001 CVVDLERQGQGQLVTCSGAFKEGSLRIIRNGIGIHEHASIDLPGI-KGLWPLRSDPNRET
            370       380       390       400        410       420 

              480        490       500       510       520         
pF1KSD DAYIIVSFVNATLVLSI-GETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDALVQVYPDGIRHIRA
       :  ...:::. : :: . :: :::.   ::.    :. :. .. . :.:.   ..: .  
NP_001 DDTLVLSFVGQTRVLMLNGEEVEETELMGFVDDQQTFFCGNVAHQQLIQITSASVRLVSQ
             430       440       450       460       470       480 

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pF1KSD DKR--VNEWKTPGKKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADV
       . .  :.::: :  :.:   . :. :::.:. :  : :... :. .: . ..  ::  .:
NP_001 EPKALVSEWKEPQAKNISVASCNSSQVVVAV-GRALYYLQIHPQ-ELRQISHT-EMEHEV
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pF1KSD VCMSLANVPPGEQRSRFLAVGL-VDNTVRIISLDPSDCLQPLSMQALPAQPESLCIVEMG
       .:.... .  ..  : . :.:: .: ..::..: ::  :    : .    :.:. .. . 
NP_001 ACLDITPLGDSNGLSPLCAIGLWTDISARILKL-PSFELLHKEMLGGEIIPRSILMTTFE
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pF1KSD GTEKQDELGERGSIGFLYLNIGLQNGVLLRTVLDPVTGDLSDTRTRYLGSRPVKLFRVRM
       ...              ::  .: .:.:.   :.  :: ::: .   ::..:. :   : 
NP_001 SSH--------------YLLCALGDGALFYFGLNIETGLLSDRKKVTLGTQPTVLRTFRS
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pF1KSD QGQEAVLAMSSRSWLSYSYQSRFHLTPLSYETLEFASGFASEQCPEGIVAISTNTLRILA
        .   :.: :.:  . :: . .. .. .. . ...   . :.  :....  ...:: : .
NP_001 LSTTNVFACSDRPTVIYSSNHKLVFSNVNLKEVNYMCPLNSDGYPDSLALANNSTLTIGT
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pF1KSD LEKLGAVFNQVAFPLQYTPRKFVIHPESNNLIIIETDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEA
       ....  .  ... ::  .:::.  .  :. . .. .         ..:  .  .  .  .
NP_001 IDEIQKLHIRTV-PLYESPRKICYQEVSQCFGVLSSR-------IEVQDTSGGTTALRPS
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pF1KSD AGEDERELAAEMAAAFLNENLP-ESIFGAPKAGNGQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQN
       :. .    ..  .  : . . : :. ::     ..     . ...    ..:   :. ::
NP_001 ASTQALSSSVSSSKLFSSSTAPHETSFGEEVEVHN-----LLIIDQHTFEVLHAHQFLQN
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pF1KSD EAAFSVAVCRFSNTGEDWYVLVGVAKDLILNPRSVAG--GFVYTYKLVNNGEKLEFLHKT
       : :.:.. :....   . : .::.:   .. :. .    : . ...  ..: ::. . . 
NP_001 EYALSLVSCKLGKD-PNTYFIVGTA---MVYPEEAEPKQGRIVVFQY-SDG-KLQTVAEK
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pF1KSD PVEEVPAAIAPFQGRVLIGVGKLLRVYDLGKKKLLRKCENKHIANYIS-GIQTIGHRVIV
        :. .  ... :.:..: .... .:.:.   .: ::  : .:  : ..  ..: :  ..:
NP_001 EVKGAVYSMVEFNGKLLASINSTVRLYEWTTEKELRT-ECNHYNNIMALYLKTKGDFILV
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pF1KSD SDVQESFIWVRYKRNENQLIIFADDTYPRWVTTASLLDYDTVAGADKFGNICVVRLPPNT
       .:...: . . ::  :...  .: :  : :.... .:: :.  ::..  :. : .   ..
NP_001 GDLMRSVLLLAYKPMEGNFEEIARDFNPNWMSAVEILDDDNFLGAENAFNLFVCQ--KDS
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pF1KSD NDEVDEDPTGNKALWDRGLLNGASQKAEVIMNYHVGETVL-SLQKTTLIPGGSESLVYTT
          .::.    . : . ::..     .: .  .  :  :. .: .:.    ::  ... :
NP_001 AATTDEE---RQHLQEVGLFH----LGEFVNVFCHGSLVMQNLGETSTPTQGS--VLFGT
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pF1KSD LSGGIGILVPFTSHEDHDFFQHVEMHLRSEHPPLCGRDHLSFRSYYF-----PVKNVIDG
       ..: :: ::   :.  ....  .. .: .    .   .:  .::..      :. . :::
NP_001 VNGMIG-LVTSLSESWYNLLLDMQNRLNKVIKSVGKIEHSFWRSFHTERKTEPATGFIDG
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pF1KSD DLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRTPPEVSKKLEDIRTRYAF        
       :: :.: ..   :...:  .:                            
NP_001 DLIESFLDISRPKMQEVVANLQYDDGSGMKREATADDLIKVVEELTRIH
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>>XP_011515299 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage and po  (1365 aa)
 initn: 113 init1:  70 opt: 157  Z-score: 189.1  bits: 47.2 E(85289): 0.00086
Smith-Waterman score: 188; 19.8% identity (52.9% similar) in 501 aa overlap (717-1201:871-1348)

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pF1KSD SDTRTRYLGSRPVKLFRVRMQGQEAVLAMSSRSWLSYSYQSRFHLTPLSYE-TLEFASGF
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XP_011 EEGAGARGRVARFRYFEDIYGYSGVFICGPSPHWLLVTGRGALRLHPMAIDGPVDSFAPF
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pF1KSD ASEQCPEGIVAISTN-TLRILALE---KLGAVFNQVAFPLQYTPRKFVIHPESNNLIIIE
        . .::.:.. .. .  ::: .:    .  : .    .::. : .  . : ::. .  . 
XP_011 HNVNCPRGFLYFNRQGELRISVLPAYLSYDAPWPVRKIPLRCTAHYVAYHVESK-VYAVA
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pF1KSD TDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAAAFLNENLPESIFGAPKAGN--
       :. :  :  ..  : .   :.  :.  .::: .  .. :  ..   : :  . :.:    
XP_011 TSTN--TPCARIPR-MTGEEKEFETIERDERYIHPQQEAFSIQLISPVSWEAIPNARIEL
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pF1KSD GQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTGEDWYVLVGVAKDLILNPRS
        .:  :   :. ..  . . :.  .. .: .. . .  ..     .:.  . ... .:  
XP_011 QEWEHVT-CMKTVSLRSEETVSGLKGYVAAGTCLMQGEEVTCRGRILIMDVIEVVPEP--
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pF1KSD VAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVLIGVGKLLRVYDLGKKKLLR
         :  .   :.    :: .   : ::    .:.   .:... ..:. . ...: . . : 
XP_011 --GQPLTKNKFKVLYEKEQ---KGPV----TALCHCNGHLVSAIGQKIFLWSL-RASELT
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pF1KSD KCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQLIIFADDTYPRWVTTASLL
                ::  . .. . ....::..:.  .::... . : . . :. :  : .....
XP_011 GMAFIDTQLYIHQMISVKNFILAADVMKSISLLRYQEESKTLSLVSRDAKPLEVYSVDFM
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pF1KSD DYDTVAG---ADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRGLLNGASQKAEVIMNYH
         ..  :   .:.  :. :    :    :. :.  : . :    .  ::  .....    
XP_011 VDNAQLGFLVSDRDRNLMVYMYLP----EAKESFGGMRLLRRADFHVGA--HVNTFWRTP
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pF1KSD VGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFT--SHEDHDFFQHVEMHLRSEHPP
          .. .:.: ...  ...   ..::.::::.:.:.   ...   ..:..   .  .:  
XP_011 CRGATEGLSKKSVVWENKHITWFATLDGGIGLLLPMQEKTYRRLLMLQNALTTMLPHHAG
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pF1KSD LCGRD----HLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRTPPEVSKKLED
       :  :     :.. :.    :.::.::.: ...  .   .........  ::         
XP_011 LNPRAFRMLHVDRRTLQNAVRNVLDGELLNRYLYLSTMERSELAKKIGTTPDIILDDLLE
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pF1KSD IRTRYAF 
               
XP_011 TDRVTAHF
      1360     

>--
 initn: 158 init1:  70 opt: 157  Z-score: 189.1  bits: 47.2 E(85289): 0.00086
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pF1KSD RGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFGVIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIVILEYQ
                                     :. . .:.:. .: ....  .... ..::.
XP_011                              MSMASVQLAGAKRDALLLSFKDAKLSVVEYD
                                            10        20        30 

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pF1KSD PS----KNMFEKIHQETFGKSGCRRIVPGQFLAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYILNRDAA
       :.    :..  .  .:   ..:  . :    . ::: :: . . .   . .:  . :.. 
XP_011 PGTHDLKTLSLHYFEEPELRDGFVQNVHTPRVRVDPDGRCAAMLVYGTRLVVLPFRRESL
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pF1KSD ARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVGFENPMFACLEMDYEEADNDPT------------
       :.   .   :..... :  ... : . ... ..  ..... ..  .::            
XP_011 AEEHEGLVGEGQRSSFLPSYIIDVRA-LDEKLLNIIDLQFLHGYYEPTLLILFEPNQTWP
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pF1KSD GEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKY-----SEPLEEHGNFLITVPGGSDGPSGVLICS
       :..:.  :.: ..  ..:.... :.       : :..    . .  : :     ::.. .
XP_011 GRVAVR-QDTCSIVAISLNITQKVHPVIWSLTSLPFDCTQALAVPKPIG-----GVVVFA
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pF1KSD ENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFF----FLAQTEQG
        : . : : .  :          .    : : .  :  .   ... :.    .. . . :
XP_011 VNSLLYLNQSVPPYGVALNSLTTGTTAFPLRTQEGVRITLDCAQATFISYDKMVISLKGG
          210       220       230       240       250       260    

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pF1KSD DIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAA---AMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQ-----
       .:. .:: ::   .  .:  .:: . ...   .: ... :.::..:..::  : .     
XP_011 EIYVLTLITDG--MRSVRAFHFDKAAASVLTTSMVTMEPGYLFLGSRLGNSLLLKYTEKL
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pF1KSD -------IAHLGDDDEEPE----------FSSA---MPLEEGDTF-FFQPRPLKNLVLV-
              . . .: .: :           .:.:   .: .: : .  .  .  ..  :. 
XP_011 QEPPASAVREAADKEEPPSKKKRVDATAGWSAAGKSVPQDEVDEIEVYGSEAQSGTQLAT
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pF1KSD ---DELDSLSPILFCQIA----------DLANEDTPQL-YVAC-GRGPRSSLRVLRHGLE
          .  ::.  :  :  :          .. :   :.:  :.: :.:  ..: ::.....
XP_011 YSFEVCDSILNIGPCANAAVGEPAFLSEEFQNSPEPDLEIVVCSGHGKNGALSVLQKSIR
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pF1KSD VSEMAVSELPGNPNAVWTV----RRHIED---------------EFD------AYIIVSF
        . ... ::::  . .:::    :.. ::               : :      ...:.: 
XP_011 PQVVTTFELPGCYD-MWTVIAPVRKEEEDNPKGEGTEQEPSTTPEADDDGRRHGFLILSR
            450        460       470       480       490       500 

      480       490       500       510        520       530       
pF1KSD VNATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDA-LVQVYPDGIRHIRADKRVNEWK
        ..:..:. :. . :.  :::    ::.  . .::.  .::: : ::: ... ....   
XP_011 EDSTMILQTGQEIMELDTSGFATQGPTVFAGNIGDNRYIVQVSPLGIRLLEGVNQLHFIP
             510       520       530       540       550       560 

       540       550       560       570       580       590       
pF1KSD TPGKKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSLANVPP
       .     ::.::: .  :::  . :....:                               
XP_011 VDLGAPIVQCAVADPYVVIMSAEGHVTMFLLKSDSYGGRHHRLALHKPPLHHQSKVITLC
             570       580       590       600       610       620 

>>XP_011515300 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage and po  (1365 aa)
 initn: 113 init1:  70 opt: 157  Z-score: 189.1  bits: 47.2 E(85289): 0.00086
Smith-Waterman score: 188; 19.8% identity (52.9% similar) in 501 aa overlap (717-1201:871-1348)

        690       700       710       720       730        740     
pF1KSD SDTRTRYLGSRPVKLFRVRMQGQEAVLAMSSRSWLSYSYQSRFHLTPLSYE-TLEFASGF
                                     :  ::  . .. ..: :.. .  ..  . :
XP_011 EEGAGARGRVARFRYFEDIYGYSGVFICGPSPHWLLVTGRGALRLHPMAIDGPVDSFAPF
              850       860       870       880       890       900

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pF1KSD ASEQCPEGIVAISTN-TLRILALE---KLGAVFNQVAFPLQYTPRKFVIHPESNNLIIIE
        . .::.:.. .. .  ::: .:    .  : .    .::. : .  . : ::. .  . 
XP_011 HNVNCPRGFLYFNRQGELRISVLPAYLSYDAPWPVRKIPLRCTAHYVAYHVESK-VYAVA
              910       920       930       940       950          

             810       820       830       840       850           
pF1KSD TDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAAAFLNENLPESIFGAPKAGN--
       :. :  :  ..  : .   :.  :.  .::: .  .. :  ..   : :  . :.:    
XP_011 TSTN--TPCARIPR-MTGEEKEFETIERDERYIHPQQEAFSIQLISPVSWEAIPNARIEL
     960         970        980       990      1000      1010      

     860       870       880       890       900       910         
pF1KSD GQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTGEDWYVLVGVAKDLILNPRS
        .:  :   :. ..  . . :.  .. .: .. . .  ..     .:.  . ... .:  
XP_011 QEWEHVT-CMKTVSLRSEETVSGLKGYVAAGTCLMQGEEVTCRGRILIMDVIEVVPEP--
       1020       1030      1040      1050      1060      1070     

     920       930       940       950       960       970         
pF1KSD VAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVLIGVGKLLRVYDLGKKKLLR
         :  .   :.    :: .   : ::    .:.   .:... ..:. . ...: . . : 
XP_011 --GQPLTKNKFKVLYEKEQ---KGPV----TALCHCNGHLVSAIGQKIFLWSL-RASELT
            1080      1090             1100      1110       1120   

     980       990      1000      1010      1020      1030         
pF1KSD KCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQLIIFADDTYPRWVTTASLL
                ::  . .. . ....::..:.  .::... . : . . :. :  : .....
XP_011 GMAFIDTQLYIHQMISVKNFILAADVMKSISLLRYQEESKTLSLVSRDAKPLEVYSVDFM
          1130      1140      1150      1160      1170      1180   

    1040         1050      1060      1070      1080      1090      
pF1KSD DYDTVAG---ADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRGLLNGASQKAEVIMNYH
         ..  :   .:.  :. :    :    :. :.  : . :    .  ::  .....    
XP_011 VDNAQLGFLVSDRDRNLMVYMYLP----EAKESFGGMRLLRRADFHVGA--HVNTFWRTP
          1190      1200          1210      1220        1230       

       1100      1110      1120      1130        1140      1150    
pF1KSD VGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFT--SHEDHDFFQHVEMHLRSEHPP
          .. .:.: ...  ...   ..::.::::.:.:.   ...   ..:..   .  .:  
XP_011 CRGATEGLSKKSVVWENKHITWFATLDGGIGLLLPMQEKTYRRLLMLQNALTTMLPHHAG
      1240      1250      1260      1270      1280      1290       

             1160      1170      1180      1190      1200      1210
pF1KSD LCGRD----HLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRTPPEVSKKLED
       :  :     :.. :.    :.::.::.: ...  .   .........  ::         
XP_011 LNPRAFRMLHVDRRTLQNAVRNVLDGELLNRYLYLSTMERSELAKKIGTTPDIILDDLLE
      1300      1310      1320      1330      1340      1350       

               
pF1KSD IRTRYAF 
               
XP_011 TDRVTAHF
      1360     

>--
 initn: 158 init1:  70 opt: 157  Z-score: 189.1  bits: 47.2 E(85289): 0.00086
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            40        50        60        70        80        90   
pF1KSD RGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFGVIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIVILEYQ
                                     :. . .:.:. .: ....  .... ..::.
XP_011                              MSMASVQLAGAKRDALLLSFKDAKLSVVEYD
                                            10        20        30 

               100       110       120       130       140         
pF1KSD PS----KNMFEKIHQETFGKSGCRRIVPGQFLAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYILNRDAA
       :.    :..  .  .:   ..:  . :    . ::: :: . . .   . .:  . :.. 
XP_011 PGTHDLKTLSLHYFEEPELRDGFVQNVHTPRVRVDPDGRCAAMLVYGTRLVVLPFRRESL
              40        50        60        70        80        90 

     150       160       170       180       190                   
pF1KSD ARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVGFENPMFACLEMDYEEADNDPT------------
       :.   .   :..... :  ... : . ... ..  ..... ..  .::            
XP_011 AEEHEGLVGEGQRSSFLPSYIIDVRA-LDEKLLNIIDLQFLHGYYEPTLLILFEPNQTWP
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       200       210       220            230       240       250  
pF1KSD GEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKY-----SEPLEEHGNFLITVPGGSDGPSGVLICS
       :..:.  :.: ..  ..:.... :.       : :..    . .  : :     ::.. .
XP_011 GRVAVR-QDTCSIVAISLNITQKVHPVIWSLTSLPFDCTQALAVPKPIG-----GVVVFA
               160       170       180       190            200    

            260       270       280       290       300            
pF1KSD ENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFF----FLAQTEQG
        : . : : .  :          .    : : .  :  .   ... :.    .. . . :
XP_011 VNSLLYLNQSVPPYGVALNSLTTGTTAFPLRTQEGVRITLDCAQATFISYDKMVISLKGG
          210       220       230       240       250       260    

      310       320       330          340       350       360     
pF1KSD DIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAA---AMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQ-----
       .:. .:: ::   .  .:  .:: . ...   .: ... :.::..:..::  : .     
XP_011 EIYVLTLITDG--MRSVRAFHFDKAAASVLTTSMVTMEPGYLFLGSRLGNSLLLKYTEKL
          270         280       290       300       310       320  

                     370                    380        390         
pF1KSD -------IAHLGDDDEEPE----------FSSA---MPLEEGDTF-FFQPRPLKNLVLV-
              . . .: .: :           .:.:   .: .: : .  .  .  ..  :. 
XP_011 QEPPASAVREAADKEEPPSKKKRVDATAGWSAAGKSVPQDEVDEIEVYGSEAQSGTQLAT
            330       340       350       360       370       380  

         400       410                 420         430       440   
pF1KSD ---DELDSLSPILFCQIA----------DLANEDTPQL-YVAC-GRGPRSSLRVLRHGLE
          .  ::.  :  :  :          .. :   :.:  :.: :.:  ..: ::.....
XP_011 YSFEVCDSILNIGPCANAAVGEPAFLSEEFQNSPEPDLEIVVCSGHGKNGALSVLQKSIR
            390       400       410       420       430       440  

           450       460                          470              
pF1KSD VSEMAVSELPGNPNAVWTV----RRHIED---------------EFD------AYIIVSF
        . ... ::::  . .:::    :.. ::               : :      ...:.: 
XP_011 PQVVTTFELPGCYD-MWTVIAPVRKEEEDNPKGEGTEQEPSTTPEADDDGRRHGFLILSR
            450        460       470       480       490       500 

      480       490       500       510        520       530       
pF1KSD VNATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDA-LVQVYPDGIRHIRADKRVNEWK
        ..:..:. :. . :.  :::    ::.  . .::.  .::: : ::: ... ....   
XP_011 EDSTMILQTGQEIMELDTSGFATQGPTVFAGNIGDNRYIVQVSPLGIRLLEGVNQLHFIP
             510       520       530       540       550       560 

       540       550       560       570       580       590       
pF1KSD TPGKKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSLANVPP
       .     ::.::: .  :::  . :....:                               
XP_011 VDLGAPIVQCAVADPYVVIMSAEGHVTMFLLKSDSYGGRHHRLALHKPPLHHQSKVITLC
             570       580       590       600       610       620 

>>XP_006716612 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage and po  (1365 aa)
 initn: 113 init1:  70 opt: 157  Z-score: 189.1  bits: 47.2 E(85289): 0.00086
Smith-Waterman score: 188; 19.8% identity (52.9% similar) in 501 aa overlap (717-1201:871-1348)

        690       700       710       720       730        740     
pF1KSD SDTRTRYLGSRPVKLFRVRMQGQEAVLAMSSRSWLSYSYQSRFHLTPLSYE-TLEFASGF
                                     :  ::  . .. ..: :.. .  ..  . :
XP_006 EEGAGARGRVARFRYFEDIYGYSGVFICGPSPHWLLVTGRGALRLHPMAIDGPVDSFAPF
              850       860       870       880       890       900

         750       760           770       780       790       800 
pF1KSD ASEQCPEGIVAISTN-TLRILALE---KLGAVFNQVAFPLQYTPRKFVIHPESNNLIIIE
        . .::.:.. .. .  ::: .:    .  : .    .::. : .  . : ::. .  . 
XP_006 HNVNCPRGFLYFNRQGELRISVLPAYLSYDAPWPVRKIPLRCTAHYVAYHVESK-VYAVA
              910       920       930       940       950          

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pF1KSD TDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAAAFLNENLPESIFGAPKAGN--
       :. :  :  ..  : .   :.  :.  .::: .  .. :  ..   : :  . :.:    
XP_006 TSTN--TPCARIPR-MTGEEKEFETIERDERYIHPQQEAFSIQLISPVSWEAIPNARIEL
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pF1KSD GQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTGEDWYVLVGVAKDLILNPRS
        .:  :   :. ..  . . :.  .. .: .. . .  ..     .:.  . ... .:  
XP_006 QEWEHVT-CMKTVSLRSEETVSGLKGYVAAGTCLMQGEEVTCRGRILIMDVIEVVPEP--
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pF1KSD VAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVLIGVGKLLRVYDLGKKKLLR
         :  .   :.    :: .   : ::    .:.   .:... ..:. . ...: . . : 
XP_006 --GQPLTKNKFKVLYEKEQ---KGPV----TALCHCNGHLVSAIGQKIFLWSL-RASELT
            1080      1090             1100      1110       1120   

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pF1KSD KCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQLIIFADDTYPRWVTTASLL
                ::  . .. . ....::..:.  .::... . : . . :. :  : .....
XP_006 GMAFIDTQLYIHQMISVKNFILAADVMKSISLLRYQEESKTLSLVSRDAKPLEVYSVDFM
          1130      1140      1150      1160      1170      1180   

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pF1KSD DYDTVAG---ADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRGLLNGASQKAEVIMNYH
         ..  :   .:.  :. :    :    :. :.  : . :    .  ::  .....    
XP_006 VDNAQLGFLVSDRDRNLMVYMYLP----EAKESFGGMRLLRRADFHVGA--HVNTFWRTP
          1190      1200          1210      1220        1230       

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pF1KSD VGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFT--SHEDHDFFQHVEMHLRSEHPP
          .. .:.: ...  ...   ..::.::::.:.:.   ...   ..:..   .  .:  
XP_006 CRGATEGLSKKSVVWENKHITWFATLDGGIGLLLPMQEKTYRRLLMLQNALTTMLPHHAG
      1240      1250      1260      1270      1280      1290       

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pF1KSD LCGRD----HLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRTPPEVSKKLED
       :  :     :.. :.    :.::.::.: ...  .   .........  ::         
XP_006 LNPRAFRMLHVDRRTLQNAVRNVLDGELLNRYLYLSTMERSELAKKIGTTPDIILDDLLE
      1300      1310      1320      1330      1340      1350       

               
pF1KSD IRTRYAF 
               
XP_006 TDRVTAHF
      1360     

>--
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                                     :. . .:.:. .: ....  .... ..::.
XP_006                              MSMASVQLAGAKRDALLLSFKDAKLSVVEYD
                                            10        20        30 

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       :.    :..  .  .:   ..:  . :    . ::: :: . . .   . .:  . :.. 
XP_006 PGTHDLKTLSLHYFEEPELRDGFVQNVHTPRVRVDPDGRCAAMLVYGTRLVVLPFRRESL
              40        50        60        70        80        90 

     150       160       170       180       190                   
pF1KSD ARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVGFENPMFACLEMDYEEADNDPT------------
       :.   .   :..... :  ... : . ... ..  ..... ..  .::            
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       :..:.  :.: ..  ..:.... :.       : :..    . .  : :     ::.. .
XP_006 GRVAVR-QDTCSIVAISLNITQKVHPVIWSLTSLPFDCTQALAVPKPIG-----GVVVFA
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pF1KSD ENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFF----FLAQTEQG
        : . : : .  :          .    : : .  :  .   ... :.    .. . . :
XP_006 VNSLLYLNQSVPPYGVALNSLTTGTTAFPLRTQEGVRITLDCAQATFISYDKMVISLKGG
          210       220       230       240       250       260    

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pF1KSD DIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAA---AMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQ-----
       .:. .:: ::   .  .:  .:: . ...   .: ... :.::..:..::  : .     
XP_006 EIYVLTLITDG--MRSVRAFHFDKAAASVLTTSMVTMEPGYLFLGSRLGNSLLLKYTEKL
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pF1KSD -------IAHLGDDDEEPE----------FSSA---MPLEEGDTF-FFQPRPLKNLVLV-
              . . .: .: :           .:.:   .: .: : .  .  .  ..  :. 
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            330       340       350       360       370       380  

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pF1KSD ---DELDSLSPILFCQIA----------DLANEDTPQL-YVAC-GRGPRSSLRVLRHGLE
          .  ::.  :  :  :          .. :   :.:  :.: :.:  ..: ::.....
XP_006 YSFEVCDSILNIGPCANAAVGEPAFLSEEFQNSPEPDLEIVVCSGHGKNGALSVLQKSIR
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pF1KSD VSEMAVSELPGNPNAVWTV----RRHIED---------------EFD------AYIIVSF
        . ... ::::  . .:::    :.. ::               : :      ...:.: 
XP_006 PQVVTTFELPGCYD-MWTVIAPVRKEEEDNPKGEGTEQEPSTTPEADDDGRRHGFLILSR
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pF1KSD VNATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDA-LVQVYPDGIRHIRADKRVNEWK
        ..:..:. :. . :.  :::    ::.  . .::.  .::: : ::: ... ....   
XP_006 EDSTMILQTGQEIMELDTSGFATQGPTVFAGNIGDNRYIVQVSPLGIRLLEGVNQLHFIP
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pF1KSD TPGKKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSLANVPP
       .     ::.::: .  :::  . :....:                               
XP_006 VDLGAPIVQCAVADPYVVIMSAEGHVTMFLLKSDSYGGRHHRLALHKPPLHHQSKVITLC
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>>XP_011515301 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage and po  (1365 aa)
 initn: 113 init1:  70 opt: 157  Z-score: 189.1  bits: 47.2 E(85289): 0.00086
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        . .::.:.. .. .  ::: .:    .  : .    .::. : .  . : ::. .  . 
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pF1KSD TDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAAAFLNENLPESIFGAPKAGN--
       :. :  :  ..  : .   :.  :.  .::: .  .. :  ..   : :  . :.:    
XP_011 TSTN--TPCARIPR-MTGEEKEFETIERDERYIHPQQEAFSIQLISPVSWEAIPNARIEL
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pF1KSD GQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTGEDWYVLVGVAKDLILNPRS
        .:  :   :. ..  . . :.  .. .: .. . .  ..     .:.  . ... .:  
XP_011 QEWEHVT-CMKTVSLRSEETVSGLKGYVAAGTCLMQGEEVTCRGRILIMDVIEVVPEP--
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pF1KSD VAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVLIGVGKLLRVYDLGKKKLLR
         :  .   :.    :: .   : ::    .:.   .:... ..:. . ...: . . : 
XP_011 --GQPLTKNKFKVLYEKEQ---KGPV----TALCHCNGHLVSAIGQKIFLWSL-RASELT
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pF1KSD KCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQLIIFADDTYPRWVTTASLL
                ::  . .. . ....::..:.  .::... . : . . :. :  : .....
XP_011 GMAFIDTQLYIHQMISVKNFILAADVMKSISLLRYQEESKTLSLVSRDAKPLEVYSVDFM
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pF1KSD DYDTVAG---ADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRGLLNGASQKAEVIMNYH
         ..  :   .:.  :. :    :    :. :.  : . :    .  ::  .....    
XP_011 VDNAQLGFLVSDRDRNLMVYMYLP----EAKESFGGMRLLRRADFHVGA--HVNTFWRTP
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pF1KSD VGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFT--SHEDHDFFQHVEMHLRSEHPP
          .. .:.: ...  ...   ..::.::::.:.:.   ...   ..:..   .  .:  
XP_011 CRGATEGLSKKSVVWENKHITWFATLDGGIGLLLPMQEKTYRRLLMLQNALTTMLPHHAG
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             1160      1170      1180      1190      1200      1210
pF1KSD LCGRD----HLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRTPPEVSKKLED
       :  :     :.. :.    :.::.::.: ...  .   .........  ::         
XP_011 LNPRAFRMLHVDRRTLQNAVRNVLDGELLNRYLYLSTMERSELAKKIGTTPDIILDDLLE
      1300      1310      1320      1330      1340      1350       

               
pF1KSD IRTRYAF 
               
XP_011 TDRVTAHF
      1360     

>--
 initn: 158 init1:  70 opt: 157  Z-score: 189.1  bits: 47.2 E(85289): 0.00086
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pF1KSD RGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFGVIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIVILEYQ
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XP_011                              MSMASVQLAGAKRDALLLSFKDAKLSVVEYD
                                            10        20        30 

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pF1KSD PS----KNMFEKIHQETFGKSGCRRIVPGQFLAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYILNRDAA
       :.    :..  .  .:   ..:  . :    . ::: :: . . .   . .:  . :.. 
XP_011 PGTHDLKTLSLHYFEEPELRDGFVQNVHTPRVRVDPDGRCAAMLVYGTRLVVLPFRRESL
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pF1KSD ARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVGFENPMFACLEMDYEEADNDPT------------
       :.   .   :..... :  ... : . ... ..  ..... ..  .::            
XP_011 AEEHEGLVGEGQRSSFLPSYIIDVRA-LDEKLLNIIDLQFLHGYYEPTLLILFEPNQTWP
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pF1KSD GEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKY-----SEPLEEHGNFLITVPGGSDGPSGVLICS
       :..:.  :.: ..  ..:.... :.       : :..    . .  : :     ::.. .
XP_011 GRVAVR-QDTCSIVAISLNITQKVHPVIWSLTSLPFDCTQALAVPKPIG-----GVVVFA
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pF1KSD ENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFF----FLAQTEQG
        : . : : .  :          .    : : .  :  .   ... :.    .. . . :
XP_011 VNSLLYLNQSVPPYGVALNSLTTGTTAFPLRTQEGVRITLDCAQATFISYDKMVISLKGG
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pF1KSD DIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAA---AMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQ-----
       .:. .:: ::   .  .:  .:: . ...   .: ... :.::..:..::  : .     
XP_011 EIYVLTLITDG--MRSVRAFHFDKAAASVLTTSMVTMEPGYLFLGSRLGNSLLLKYTEKL
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pF1KSD -------IAHLGDDDEEPE----------FSSA---MPLEEGDTF-FFQPRPLKNLVLV-
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XP_011 QEPPASAVREAADKEEPPSKKKRVDATAGWSAAGKSVPQDEVDEIEVYGSEAQSGTQLAT
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pF1KSD ---DELDSLSPILFCQIA----------DLANEDTPQL-YVAC-GRGPRSSLRVLRHGLE
          .  ::.  :  :  :          .. :   :.:  :.: :.:  ..: ::.....
XP_011 YSFEVCDSILNIGPCANAAVGEPAFLSEEFQNSPEPDLEIVVCSGHGKNGALSVLQKSIR
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pF1KSD VSEMAVSELPGNPNAVWTV----RRHIED---------------EFD------AYIIVSF
        . ... ::::  . .:::    :.. ::               : :      ...:.: 
XP_011 PQVVTTFELPGCYD-MWTVIAPVRKEEEDNPKGEGTEQEPSTTPEADDDGRRHGFLILSR
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pF1KSD VNATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDA-LVQVYPDGIRHIRADKRVNEWK
        ..:..:. :. . :.  :::    ::.  . .::.  .::: : ::: ... ....   
XP_011 EDSTMILQTGQEIMELDTSGFATQGPTVFAGNIGDNRYIVQVSPLGIRLLEGVNQLHFIP
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pF1KSD TPGKKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSLANVPP
       .     ::.::: .  :::  . :....:                               
XP_011 VDLGAPIVQCAVADPYVVIMSAEGHVTMFLLKSDSYGGRHHRLALHKPPLHHQSKVITLC
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>>XP_006716611 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage and po  (1440 aa)
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       ..::.:.    :..  .  .:   ..:  . :    . ::: :: . . .   . .:  .
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        :.. :.   .   :..... :  ... : . ... ..  ..... ..  .::       
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pF1KSD VLICSENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFF----FLA
       :.. . : . : : .  :          .    : : .  :  .   ... :.    .. 
XP_006 VVVFAVNSLLYLNQSVPPYGVALNSLTTGTTAFPLRTQEGVRITLDCAQATFISYDKMVI
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pF1KSD QTEQGDIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAA---AMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQ
       . . :.:. .:: ::   .  .:  .:: . ...   .: ... :.::..:..::  : .
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pF1KSD ------------IAHLGDDDEEPE----------FSSA---MPLEEGDTF-FFQPRPLKN
                   . . .: .: :           .:.:   .: .: : .  .  .  ..
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pF1KSD LVLV----DELDSLSPILFCQIA----------DLANEDTPQL-YVAC-GRGPRSSLRVL
         :.    .  ::.  :  :  :          .. :   :.:  :.: :.:  ..: ::
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pF1KSD RHGLEVSEMAVSELPGNPNAVWTV----RRHIED---------------EFD------AY
       ..... . ... ::::  . .:::    :.. ::               : :      ..
XP_006 QKSIRPQVVTTFELPGCYD-MWTVIAPVRKEEEDNPKGEGTEQEPSTTPEADDDGRRHGF
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pF1KSD IIVSFVNATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDA-LVQVYPDGIRHIRADKR
       .:.:  ..:..:. :. . :.  :::    ::.  . .::.  .::: : ::: ... ..
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pF1KSD VNEWKTPGKKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSL
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XP_006 LHFIPVDLGAPIVQCAVADPYVVIMSAEGHVTMFLLKSDSYGGRHHRLALHKPPLHHQSK
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pF1KSD ANVPPGEQRSRFLAVGLVDNTVRIISLDPSDCLQPLSMQALPAQPESLCIVEMGGTEKQD
                                                                   
XP_006 VITLCLYRDLSGMFTTESRLGGARDELGGRSGPEAEGLGSETSPTVDDEEEMLYGDSGSL
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>>NP_037423 (OMIM: 606027) cleavage and polyadenylation   (1443 aa)
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Smith-Waterman score: 188; 19.8% identity (52.9% similar) in 501 aa overlap (717-1201:949-1426)

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pF1KSD SDTRTRYLGSRPVKLFRVRMQGQEAVLAMSSRSWLSYSYQSRFHLTPLSYE-TLEFASGF
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NP_037 EEGAGARGRVARFRYFEDIYGYSGVFICGPSPHWLLVTGRGALRLHPMAIDGPVDSFAPF
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pF1KSD ASEQCPEGIVAISTN-TLRILALE---KLGAVFNQVAFPLQYTPRKFVIHPESNNLIIIE
        . .::.:.. .. .  ::: .:    .  : .    .::. : .  . : ::. .  . 
NP_037 HNVNCPRGFLYFNRQGELRISVLPAYLSYDAPWPVRKIPLRCTAHYVAYHVESK-VYAVA
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pF1KSD TDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAAAFLNENLPESIFGAPKAGN--
       :. :  :  ..  : .   :.  :.  .::: .  .. :  ..   : :  . :.:    
NP_037 TSTN--TPCARIPR-MTGEEKEFETIERDERYIHPQQEAFSIQLISPVSWEAIPNARIEL
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pF1KSD GQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTGEDWYVLVGVAKDLILNPRS
        .:  :   :. ..  . . :.  .. .: .. . .  ..     .:.  . ... .:  
NP_037 QEWEHVT-CMKTVSLRSEETVSGLKGYVAAGTCLMQGEEVTCRGRILIMDVIEVVPEP--
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pF1KSD VAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVLIGVGKLLRVYDLGKKKLLR
         :  .   :.    :: .   : ::    .:.   .:... ..:. . ...: . . : 
NP_037 --GQPLTKNKFKVLYEKEQ---KGPV----TALCHCNGHLVSAIGQKIFLWSL-RASELT
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pF1KSD KCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQLIIFADDTYPRWVTTASLL
                ::  . .. . ....::..:.  .::... . : . . :. :  : .....
NP_037 GMAFIDTQLYIHQMISVKNFILAADVMKSISLLRYQEESKTLSLVSRDAKPLEVYSVDFM
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pF1KSD DYDTVAG---ADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRGLLNGASQKAEVIMNYH
         ..  :   .:.  :. :    :    :. :.  : . :    .  ::  .....    
NP_037 VDNAQLGFLVSDRDRNLMVYMYLP----EAKESFGGMRLLRRADFHVGA--HVNTFWRTP
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pF1KSD VGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFT--SHEDHDFFQHVEMHLRSEHPP
          .. .:.: ...  ...   ..::.::::.:.:.   ...   ..:..   .  .:  
NP_037 CRGATEGLSKKSVVWENKHITWFATLDGGIGLLLPMQEKTYRRLLMLQNALTTMLPHHAG
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pF1KSD LCGRD----HLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRTPPEVSKKLED
       :  :     :.. :.    :.::.::.: ...  .   .........  ::         
NP_037 LNPRAFRMLHVDRRTLQNAVRNVLDGELLNRYLYLSTMERSELAKKIGTTPDIILDDLLE
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pF1KSD IRTRYAF 
               
NP_037 TDRVTAHF
        1440   

>--
 initn: 186 init1:  70 opt: 157  Z-score: 188.7  bits: 47.2 E(85289): 0.0009
Smith-Waterman score: 268; 21.4% identity (51.2% similar) in 604 aa overlap (59-566:75-668)

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pF1KSD EIVVSRGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFGVIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIV
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NP_037 RDAEALTKNDRSTEGKAHREKLELAASFSFFGNVMSMASVQLAGAKRDALLLSFKDAKLS
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pF1KSD ILEYQPS----KNMFEKIHQETFGKSGCRRIVPGQFLAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYIL
       ..::.:.    :..  .  .:   ..:  . :    . ::: :: . . .   . .:  .
NP_037 VVEYDPGTHDLKTLSLHYFEEPELRDGFVQNVHTPRVRVDPDGRCAAMLVYGTRLVVLPF
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pF1KSD NRDAAARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVGFENPMFACLEMDYEEADNDPT-------
        :.. :.   .   :..... :  ... : . ... ..  ..... ..  .::       
NP_037 RRESLAEEHEGLVGEGQRSSFLPSYIIDVRA-LDEKLLNIIDLQFLHGYYEPTLLILFEP
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pF1KSD -----GEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKY-----SEPLEEHGNFLITVPGGSDGPSG
            :..:.  :.: ..  ..:.... :.       : :..    . .  : :     :
NP_037 NQTWPGRVAVR-QDTCSIVAISLNITQKVHPVIWSLTSLPFDCTQALAVPKPIG-----G
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pF1KSD VLICSENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFF----FLA
       :.. . : . : : .  :          .    : : .  :  .   ... :.    .. 
NP_037 VVVFAVNSLLYLNQSVPPYGVALNSLTTGTTAFPLRTQEGVRITLDCAQATFISYDKMVI
       280       290       300       310       320       330       

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pF1KSD QTEQGDIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAA---AMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQ
       . . :.:. .:: ::   .  .:  .:: . ...   .: ... :.::..:..::  : .
NP_037 SLKGGEIYVLTLITDG--MRSVRAFHFDKAAASVLTTSMVTMEPGYLFLGSRLGNSLLLK
       340       350         360       370       380       390     

                          370                    380        390    
pF1KSD ------------IAHLGDDDEEPE----------FSSA---MPLEEGDTF-FFQPRPLKN
                   . . .: .: :           .:.:   .: .: : .  .  .  ..
NP_037 YTEKLQEPPASAVREAADKEEPPSKKKRVDATAGWSAAGKSVPQDEVDEIEVYGSEAQSG
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              400       410                 420         430        
pF1KSD LVLV----DELDSLSPILFCQIA----------DLANEDTPQL-YVAC-GRGPRSSLRVL
         :.    .  ::.  :  :  :          .. :   :.:  :.: :.:  ..: ::
NP_037 TQLATYSFEVCDSILNIGPCANAAVGEPAFLSEEFQNSPEPDLEIVVCSGHGKNGALSVL
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pF1KSD RHGLEVSEMAVSELPGNPNAVWTV----RRHIED---------------EFD------AY
       ..... . ... ::::  . .:::    :.. ::               : :      ..
NP_037 QKSIRPQVVTTFELPGCYD-MWTVIAPVRKEEEDNPKGEGTEQEPSTTPEADDDGRRHGF
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pF1KSD IIVSFVNATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDA-LVQVYPDGIRHIRADKR
       .:.:  ..:..:. :. . :.  :::    ::.  . .::.  .::: : ::: ... ..
NP_037 LILSREDSTMILQTGQEIMELDTSGFATQGPTVFAGNIGDNRYIVQVSPLGIRLLEGVNQ
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pF1KSD VNEWKTPGKKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSL
       ..   .     ::.::: .  :::  . :....:                          
NP_037 LHFIPVDLGAPIVQCAVADPYVVIMSAEGHVTMFLLKSDSYGGRHHRLALHKPPLHHQSK
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pF1KSD ANVPPGEQRSRFLAVGLVDNTVRIISLDPSDCLQPLSMQALPAQPESLCIVEMGGTEKQD
                                                                   
NP_037 VITLCLYRDLSGMFTTESRLGGARDELGGRSGPEAEGLGSETSPTVDDEEEMLYGDSGSL
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>>XP_006716613 (OMIM: 606027) PREDICTED: cleavage and po  (785 aa)
 initn: 109 init1:  66 opt: 152  Z-score: 186.2  bits: 45.9 E(85289): 0.0012
Smith-Waterman score: 188; 19.8% identity (52.9% similar) in 501 aa overlap (717-1201:291-768)

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pF1KSD SDTRTRYLGSRPVKLFRVRMQGQEAVLAMSSRSWLSYSYQSRFHLTPLSYE-TLEFASGF
                                     :  ::  . .. ..: :.. .  ..  . :
XP_006 EEGAGARGRVARFRYFEDIYGYSGVFICGPSPHWLLVTGRGALRLHPMAIDGPVDSFAPF
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pF1KSD ASEQCPEGIVAISTN-TLRILALE---KLGAVFNQVAFPLQYTPRKFVIHPESNNLIIIE
        . .::.:.. .. .  ::: .:    .  : .    .::. : .  . : ::. .  . 
XP_006 HNVNCPRGFLYFNRQGELRISVLPAYLSYDAPWPVRKIPLRCTAHYVAYHVESK-VYAVA
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pF1KSD TDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAAAFLNENLPESIFGAPKAGN--
       :. :  :  ..  : .   :.  :.  .::: .  .. :  ..   : :  . :.:    
XP_006 TSTN--TPCARIPR-MTGEEKEFETIERDERYIHPQQEAFSIQLISPVSWEAIPNARIEL
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pF1KSD GQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTGEDWYVLVGVAKDLILNPRS
        .:  :   :. ..  . . :.  .. .: .. . .  ..     .:.  . ... .:  
XP_006 QEWEHVT-CMKTVSLRSEETVSGLKGYVAAGTCLMQGEEVTCRGRILIMDVIEVVPEP--
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pF1KSD VAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVLIGVGKLLRVYDLGKKKLLR
         :  .   :.    :: .   : ::    .:.   .:... ..:. . ...: . . : 
XP_006 --GQPLTKNKFKVLYEKEQ---KGPV----TALCHCNGHLVSAIGQKIFLWSL-RASELT
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pF1KSD KCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQLIIFADDTYPRWVTTASLL
                ::  . .. . ....::..:.  .::... . : . . :. :  : .....
XP_006 GMAFIDTQLYIHQMISVKNFILAADVMKSISLLRYQEESKTLSLVSRDAKPLEVYSVDFM
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pF1KSD DYDTVAG---ADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRGLLNGASQKAEVIMNYH
         ..  :   .:.  :. :    :    :. :.  : . :    .  ::  .....    
XP_006 VDNAQLGFLVSDRDRNLMVYMYLP----EAKESFGGMRLLRRADFHVGA--HVNTFWRTP
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pF1KSD VGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFT--SHEDHDFFQHVEMHLRSEHPP
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pF1KSD LCGRD----HLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRTPPEVSKKLED
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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