Result of FASTA (omim) for pF1KB5544
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5544, 1445 aa
  1>>>pF1KB5544 1445 - 1445 aa - 1445 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4818+/-0.000501; mu= -1.7307+/- 0.031
 mean_var=238.4822+/-48.563, 0's: 0 Z-trim(116.0): 475  B-trim: 11 in 1/58
 Lambda= 0.083051
 statistics sampled from 26328 (26809) to 26328 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.314), width:  16
 Scan time: 16.630

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_002832 (OMIM: 176886) receptor-type tyrosine-pr (1445) 9740 1181.6       0
XP_016862453 (OMIM: 176886) PREDICTED: receptor-ty (1329) 8916 1082.8       0
XP_016862451 (OMIM: 176886) PREDICTED: receptor-ty (1458) 8528 1036.4       0
XP_016862450 (OMIM: 176886) PREDICTED: receptor-ty (1485) 8528 1036.4       0
XP_005265410 (OMIM: 176886) PREDICTED: receptor-ty (1416) 5170 634.0 2.4e-180
XP_016862452 (OMIM: 176886) PREDICTED: receptor-ty (1456) 4391 540.7 3.1e-152
NP_001193768 (OMIM: 176891,600263) receptor-type t (1448) 3178 395.3 1.7e-108
XP_005250576 (OMIM: 176891,600263) PREDICTED: rece (2308) 3178 395.4 2.6e-108
NP_001193767 (OMIM: 176891,600263) receptor-type t (1455) 3154 392.5 1.3e-107
XP_016867966 (OMIM: 176891,600263) PREDICTED: rece (2301) 3154 392.6 1.9e-107
NP_002842 (OMIM: 176891,600263) receptor-type tyro (2315) 3154 392.6 1.9e-107
XP_011524019 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty (1128) 1288 168.8 2.1e-40
XP_016881396 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty (1269) 1288 168.9 2.3e-40
XP_011524017 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty (1294) 1288 168.9 2.3e-40
XP_011524015 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty (1445) 1288 168.9 2.6e-40
XP_016881390 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty (1464) 1288 168.9 2.6e-40
XP_016881388 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty (1477) 1288 168.9 2.6e-40
XP_011524014 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty (1482) 1288 168.9 2.6e-40
XP_016881385 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty (1489) 1288 168.9 2.6e-40
XP_016881384 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty (1498) 1288 168.9 2.6e-40
XP_016881383 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty (1502) 1288 168.9 2.7e-40
XP_011524010 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty (1507) 1288 168.9 2.7e-40
NP_543031 (OMIM: 176884) receptor-type tyrosine-pr ( 793) 1217 160.3 5.5e-38
NP_543030 (OMIM: 176884) receptor-type tyrosine-pr ( 793) 1217 160.3 5.5e-38
NP_002827 (OMIM: 176884) receptor-type tyrosine-pr ( 802) 1217 160.3 5.6e-38
XP_016883100 (OMIM: 608712) PREDICTED: receptor-ty (1456) 1189 157.0 9.6e-37
NP_569119 (OMIM: 600926) receptor-type tyrosine-pr ( 642) 1172 154.8 1.9e-36
NP_006495 (OMIM: 600926) receptor-type tyrosine-pr ( 700) 1172 154.9 2.1e-36
NP_001303606 (OMIM: 600926) receptor-type tyrosine ( 700) 1172 154.9 2.1e-36
XP_016871957 (OMIM: 600926) PREDICTED: receptor-ty ( 700) 1172 154.9 2.1e-36
NP_001310283 (OMIM: 600926) receptor-type tyrosine ( 700) 1172 154.9 2.1e-36
XP_005252748 (OMIM: 600926) PREDICTED: receptor-ty ( 700) 1172 154.9 2.1e-36
NP_001303605 (OMIM: 600926) receptor-type tyrosine ( 711) 1172 154.9 2.1e-36
NP_001310285 (OMIM: 600926) receptor-type tyrosine ( 718) 1172 154.9 2.1e-36
NP_001310284 (OMIM: 600926) receptor-type tyrosine ( 720) 1172 154.9 2.1e-36
XP_016871956 (OMIM: 600926) PREDICTED: receptor-ty ( 720) 1172 154.9 2.1e-36
XP_011538297 (OMIM: 600926) PREDICTED: receptor-ty ( 711) 1045 139.6 8.1e-32
XP_006716902 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1491) 1036 138.7 3.2e-31
XP_006716901 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1495) 1036 138.7 3.2e-31
NP_569077 (OMIM: 601598) receptor-type tyrosine-pr (1496) 1036 138.7 3.2e-31
XP_006716900 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1496) 1036 138.7 3.2e-31
XP_016870484 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1501) 1036 138.7 3.3e-31
XP_016870483 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1501) 1036 138.7 3.3e-31
NP_001035802 (OMIM: 601598) receptor-type tyrosine (1502) 1036 138.7 3.3e-31
XP_016870482 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1502) 1036 138.7 3.3e-31
XP_006716898 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1502) 1036 138.7 3.3e-31
XP_016870481 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1503) 1036 138.7 3.3e-31
XP_006716895 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1505) 1036 138.7 3.3e-31
NP_569075 (OMIM: 601598) receptor-type tyrosine-pr (1505) 1036 138.7 3.3e-31
XP_006716896 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1505) 1036 138.7 3.3e-31


>>NP_002832 (OMIM: 176886) receptor-type tyrosine-protei  (1445 aa)
 initn: 9740 init1: 9740 opt: 9740  Z-score: 6317.9  bits: 1181.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 9740; 100.0% identity (100.0% similar) in 1445 aa overlap (1-1445:1-1445)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MRRLLEPCWWILFLKITSSVLHYVVCFPALTEGYVGALHENRHGSAVQIRRRKASGDPYW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MRRLLEPCWWILFLKITSSVLHYVVCFPALTEGYVGALHENRHGSAVQIRRRKASGDPYW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 AYSGAYGPEHWVTSSVSCGGRHQSPIDILDQYARVGEEYQELQLDGFDNESSNKTWMKNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AYSGAYGPEHWVTSSVSCGGRHQSPIDILDQYARVGEEYQELQLDGFDNESSNKTWMKNT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GKTVAILLKDDYFVSGAGLPGRFKAEKVEFHWGHSNGSAGSEHSINGRRFPVEMQIFFYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GKTVAILLKDDYFVSGAGLPGRFKAEKVEFHWGHSNGSAGSEHSINGRRFPVEMQIFFYN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 PDDFDSFQTAISENRIIGAMAIFFQVSPRDNSALDPIIHGLKGVVHHEKETFLDPFVLRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PDDFDSFQTAISENRIIGAMAIFFQVSPRDNSALDPIIHGLKGVVHHEKETFLDPFVLRD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 LLPASLGSYYRYTGSLTTPPCSEIVEWIVFRRPVPISYHQLEAFYSIFTTEQQDHVKSVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LLPASLGSYYRYTGSLTTPPCSEIVEWIVFRRPVPISYHQLEAFYSIFTTEQQDHVKSVE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 YLRNNFRPQQRLHDRVVSKSAVRDSWNHDMTDFLENPLGTEASKVCSSPPIHMKVQPLNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YLRNNFRPQQRLHDRVVSKSAVRDSWNHDMTDFLENPLGTEASKVCSSPPIHMKVQPLNQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 TALQVSWSQPETIYHPPIMNYMISYSWTKNEDEKEKTFTKDSDKDLKATISHVSPDSLYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TALQVSWSQPETIYHPPIMNYMISYSWTKNEDEKEKTFTKDSDKDLKATISHVSPDSLYL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 FRVQAVCRNDMRSDFSQTMLFQANTTRIFQGTRIVKTGVPTASPASSADMAPISSGSSTW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FRVQAVCRNDMRSDFSQTMLFQANTTRIFQGTRIVKTGVPTASPASSADMAPISSGSSTW
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 TSSGIPFSFVSMATGMGPSSSGSQATVASVVTSTLLAGLGFGGGGISSFPSTVWPTRLPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TSSGIPFSFVSMATGMGPSSSGSQATVASVVTSTLLAGLGFGGGGISSFPSTVWPTRLPT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 AASASKQAARPVLATTEALASPGPDGDSSPTKDGEGTEEGEKDEKSESEDGEREHEEDGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AASASKQAARPVLATTEALASPGPDGDSSPTKDGEGTEEGEKDEKSESEDGEREHEEDGE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 KDSEKKEKSGVTHAAEERNQTEPSPTPSSPNRTAEGGHQTIPGHEQDHTAVPTDQTGGRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KDSEKKEKSGVTHAAEERNQTEPSPTPSSPNRTAEGGHQTIPGHEQDHTAVPTDQTGGRR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 DAGPGLDPDMVTSTQVPPTATEEQYAGSDPKRPEMPSKKPMSRGDRFSEDSRFITVNPAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DAGPGLDPDMVTSTQVPPTATEEQYAGSDPKRPEMPSKKPMSRGDRFSEDSRFITVNPAE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 KNTSGMISRPAPGRMEWIIPLIVVSALTFVCLILLIAVLVYWRGCNKIKSKGFPRRFREV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KNTSGMISRPAPGRMEWIIPLIVVSALTFVCLILLIAVLVYWRGCNKIKSKGFPRRFREV
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB5 PSSGERGEKGSRKCFQTAHFYVEDSSSPRVVPNESIPIIPIPDDMEAIPVKQFVKHIGEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PSSGERGEKGSRKCFQTAHFYVEDSSSPRVVPNESIPIIPIPDDMEAIPVKQFVKHIGEL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB5 YSNNQHGFSEDFEEVQRCTADMNITAEHSNHPENKHKNRYINILAYDHSRVKLRPLPGKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YSNNQHGFSEDFEEVQRCTADMNITAEHSNHPENKHKNRYINILAYDHSRVKLRPLPGKD
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB5 SKHSDYINANYVDGYNKAKAYIATQGPLKSTFEDFWRMIWEQNTGIIVMITNLVEKGRRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SKHSDYINANYVDGYNKAKAYIATQGPLKSTFEDFWRMIWEQNTGIIVMITNLVEKGRRK
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB5 CDQYWPTENSEEYGNIIVTLKSTKIHACYTVRRFSIRNTKVKKGQKGNPKGRQNERVVIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 CDQYWPTENSEEYGNIIVTLKSTKIHACYTVRRFSIRNTKVKKGQKGNPKGRQNERVVIQ
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB5 YHYTQWPDMGVPEYALPVLTFVRRSSAARMPETGPVLVHCSAGVGRTGTYIVIDSMLQQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YHYTQWPDMGVPEYALPVLTFVRRSSAARMPETGPVLVHCSAGVGRTGTYIVIDSMLQQI
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB5 KDKSTVNVLGFLKHIRTQRNYLVQTEEQYIFIHDALLEAILGKETEVSSNQLHSYVNSIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KDKSTVNVLGFLKHIRTQRNYLVQTEEQYIFIHDALLEAILGKETEVSSNQLHSYVNSIL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB5 IPGVGGKTRLEKQFKLVTQCNAKYVECFSAQKECNKEKNRNSSVVPSERARVGLAPLPGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IPGVGGKTRLEKQFKLVTQCNAKYVECFSAQKECNKEKNRNSSVVPSERARVGLAPLPGM
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB5 KGTDYINASYIMGYYRSNEFIITQHPLPHTTKDFWRMIWDHNAQIIVMLPDNQSLAEDEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KGTDYINASYIMGYYRSNEFIITQHPLPHTTKDFWRMIWDHNAQIIVMLPDNQSLAEDEF
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB5 VYWPSREESMNCEAFTVTLISKDRLCLSNEEQIIIHDFILEATQDDYVLEVRHFQCPKWP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VYWPSREESMNCEAFTVTLISKDRLCLSNEEQIIIHDFILEATQDDYVLEVRHFQCPKWP
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB5 NPDAPISSTFELINVIKEEALTRDGPTIVHDEYGAVSAGMLCALTTLSQQLENENAVDVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NPDAPISSTFELINVIKEEALTRDGPTIVHDEYGAVSAGMLCALTTLSQQLENENAVDVF
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB5 QVAKMINLMRPGVFTDIEQYQFIYKAMLSLVSTKENGNGPMTVDKNGAVLIADESDPAES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QVAKMINLMRPGVFTDIEQYQFIYKAMLSLVSTKENGNGPMTVDKNGAVLIADESDPAES
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

            
pF1KB5 MESLV
       :::::
NP_002 MESLV
            

>>XP_016862453 (OMIM: 176886) PREDICTED: receptor-type t  (1329 aa)
 initn: 8916 init1: 8916 opt: 8916  Z-score: 5784.9  bits: 1082.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8916; 100.0% identity (100.0% similar) in 1329 aa overlap (117-1445:1-1329)

         90       100       110       120       130       140      
pF1KB5 DILDQYARVGEEYQELQLDGFDNESSNKTWMKNTGKTVAILLKDDYFVSGAGLPGRFKAE
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                               MKNTGKTVAILLKDDYFVSGAGLPGRFKAE
                                             10        20        30

        150       160       170       180       190       200      
pF1KB5 KVEFHWGHSNGSAGSEHSINGRRFPVEMQIFFYNPDDFDSFQTAISENRIIGAMAIFFQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KVEFHWGHSNGSAGSEHSINGRRFPVEMQIFFYNPDDFDSFQTAISENRIIGAMAIFFQV
               40        50        60        70        80        90

        210       220       230       240       250       260      
pF1KB5 SPRDNSALDPIIHGLKGVVHHEKETFLDPFVLRDLLPASLGSYYRYTGSLTTPPCSEIVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPRDNSALDPIIHGLKGVVHHEKETFLDPFVLRDLLPASLGSYYRYTGSLTTPPCSEIVE
              100       110       120       130       140       150

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pF1KB5 WIVFRRPVPISYHQLEAFYSIFTTEQQDHVKSVEYLRNNFRPQQRLHDRVVSKSAVRDSW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WIVFRRPVPISYHQLEAFYSIFTTEQQDHVKSVEYLRNNFRPQQRLHDRVVSKSAVRDSW
              160       170       180       190       200       210

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pF1KB5 NHDMTDFLENPLGTEASKVCSSPPIHMKVQPLNQTALQVSWSQPETIYHPPIMNYMISYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NHDMTDFLENPLGTEASKVCSSPPIHMKVQPLNQTALQVSWSQPETIYHPPIMNYMISYS
              220       230       240       250       260       270

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pF1KB5 WTKNEDEKEKTFTKDSDKDLKATISHVSPDSLYLFRVQAVCRNDMRSDFSQTMLFQANTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WTKNEDEKEKTFTKDSDKDLKATISHVSPDSLYLFRVQAVCRNDMRSDFSQTMLFQANTT
              280       290       300       310       320       330

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pF1KB5 RIFQGTRIVKTGVPTASPASSADMAPISSGSSTWTSSGIPFSFVSMATGMGPSSSGSQAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RIFQGTRIVKTGVPTASPASSADMAPISSGSSTWTSSGIPFSFVSMATGMGPSSSGSQAT
              340       350       360       370       380       390

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pF1KB5 VASVVTSTLLAGLGFGGGGISSFPSTVWPTRLPTAASASKQAARPVLATTEALASPGPDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VASVVTSTLLAGLGFGGGGISSFPSTVWPTRLPTAASASKQAARPVLATTEALASPGPDG
              400       410       420       430       440       450

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pF1KB5 DSSPTKDGEGTEEGEKDEKSESEDGEREHEEDGEKDSEKKEKSGVTHAAEERNQTEPSPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSSPTKDGEGTEEGEKDEKSESEDGEREHEEDGEKDSEKKEKSGVTHAAEERNQTEPSPT
              460       470       480       490       500       510

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pF1KB5 PSSPNRTAEGGHQTIPGHEQDHTAVPTDQTGGRRDAGPGLDPDMVTSTQVPPTATEEQYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PSSPNRTAEGGHQTIPGHEQDHTAVPTDQTGGRRDAGPGLDPDMVTSTQVPPTATEEQYA
              520       530       540       550       560       570

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pF1KB5 GSDPKRPEMPSKKPMSRGDRFSEDSRFITVNPAEKNTSGMISRPAPGRMEWIIPLIVVSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSDPKRPEMPSKKPMSRGDRFSEDSRFITVNPAEKNTSGMISRPAPGRMEWIIPLIVVSA
              580       590       600       610       620       630

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pF1KB5 LTFVCLILLIAVLVYWRGCNKIKSKGFPRRFREVPSSGERGEKGSRKCFQTAHFYVEDSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LTFVCLILLIAVLVYWRGCNKIKSKGFPRRFREVPSSGERGEKGSRKCFQTAHFYVEDSS
              640       650       660       670       680       690

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pF1KB5 SPRVVPNESIPIIPIPDDMEAIPVKQFVKHIGELYSNNQHGFSEDFEEVQRCTADMNITA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPRVVPNESIPIIPIPDDMEAIPVKQFVKHIGELYSNNQHGFSEDFEEVQRCTADMNITA
              700       710       720       730       740       750

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pF1KB5 EHSNHPENKHKNRYINILAYDHSRVKLRPLPGKDSKHSDYINANYVDGYNKAKAYIATQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EHSNHPENKHKNRYINILAYDHSRVKLRPLPGKDSKHSDYINANYVDGYNKAKAYIATQG
              760       770       780       790       800       810

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pF1KB5 PLKSTFEDFWRMIWEQNTGIIVMITNLVEKGRRKCDQYWPTENSEEYGNIIVTLKSTKIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLKSTFEDFWRMIWEQNTGIIVMITNLVEKGRRKCDQYWPTENSEEYGNIIVTLKSTKIH
              820       830       840       850       860       870

        990      1000      1010      1020      1030      1040      
pF1KB5 ACYTVRRFSIRNTKVKKGQKGNPKGRQNERVVIQYHYTQWPDMGVPEYALPVLTFVRRSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ACYTVRRFSIRNTKVKKGQKGNPKGRQNERVVIQYHYTQWPDMGVPEYALPVLTFVRRSS
              880       890       900       910       920       930

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pF1KB5 AARMPETGPVLVHCSAGVGRTGTYIVIDSMLQQIKDKSTVNVLGFLKHIRTQRNYLVQTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AARMPETGPVLVHCSAGVGRTGTYIVIDSMLQQIKDKSTVNVLGFLKHIRTQRNYLVQTE
              940       950       960       970       980       990

       1110      1120      1130      1140      1150      1160      
pF1KB5 EQYIFIHDALLEAILGKETEVSSNQLHSYVNSILIPGVGGKTRLEKQFKLVTQCNAKYVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EQYIFIHDALLEAILGKETEVSSNQLHSYVNSILIPGVGGKTRLEKQFKLVTQCNAKYVE
             1000      1010      1020      1030      1040      1050

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pF1KB5 CFSAQKECNKEKNRNSSVVPSERARVGLAPLPGMKGTDYINASYIMGYYRSNEFIITQHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CFSAQKECNKEKNRNSSVVPSERARVGLAPLPGMKGTDYINASYIMGYYRSNEFIITQHP
             1060      1070      1080      1090      1100      1110

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pF1KB5 LPHTTKDFWRMIWDHNAQIIVMLPDNQSLAEDEFVYWPSREESMNCEAFTVTLISKDRLC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPHTTKDFWRMIWDHNAQIIVMLPDNQSLAEDEFVYWPSREESMNCEAFTVTLISKDRLC
             1120      1130      1140      1150      1160      1170

       1290      1300      1310      1320      1330      1340      
pF1KB5 LSNEEQIIIHDFILEATQDDYVLEVRHFQCPKWPNPDAPISSTFELINVIKEEALTRDGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSNEEQIIIHDFILEATQDDYVLEVRHFQCPKWPNPDAPISSTFELINVIKEEALTRDGP
             1180      1190      1200      1210      1220      1230

       1350      1360      1370      1380      1390      1400      
pF1KB5 TIVHDEYGAVSAGMLCALTTLSQQLENENAVDVFQVAKMINLMRPGVFTDIEQYQFIYKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TIVHDEYGAVSAGMLCALTTLSQQLENENAVDVFQVAKMINLMRPGVFTDIEQYQFIYKA
             1240      1250      1260      1270      1280      1290

       1410      1420      1430      1440     
pF1KB5 MLSLVSTKENGNGPMTVDKNGAVLIADESDPAESMESLV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MLSLVSTKENGNGPMTVDKNGAVLIADESDPAESMESLV
             1300      1310      1320         

>>XP_016862451 (OMIM: 176886) PREDICTED: receptor-type t  (1458 aa)
 initn: 8528 init1: 8528 opt: 8528  Z-score: 5533.0  bits: 1036.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 9442; 97.3% identity (97.3% similar) in 1457 aa overlap (29-1445:2-1458)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MRRLLEPCWWILFLKITSSVLHYVVCFPALTEGYVGALHENRHGSAVQIRRRKASGDPYW
                                   ::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                            MALTEGYVGALHENRHGSAVQIRRRKASGDPYW
                                          10        20        30   

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 AYSGAYGPEHWVTSSVSCGGRHQSPIDILDQYARVGEEYQELQLDGFDNESSNKTWMKNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AYSGAYGPEHWVTSSVSCGGRHQSPIDILDQYARVGEEYQELQLDGFDNESSNKTWMKNT
            40        50        60        70        80        90   

              130       140       150       160       170          
pF1KB5 GKTVAILLKDDYFVSGAGLPGRFKAEKVEFHWGHSNGSAGSEHSINGRRFPVE-------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::       
XP_016 GKTVAILLKDDYFVSGAGLPGRFKAEKVEFHWGHSNGSAGSEHSINGRRFPVEAEDARGG
           100       110       120       130       140       150   

                                            180       190       200
pF1KB5 ---------------------------------MQIFFYNPDDFDSFQTAISENRIIGAM
                                        :::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DIMLMLSQGMRFILLGLKKEQFEERKSWTTYQSMQIFFYNPDDFDSFQTAISENRIIGAM
           160       170       180       190       200       210   

              210       220       230       240       250       260
pF1KB5 AIFFQVSPRDNSALDPIIHGLKGVVHHEKETFLDPFVLRDLLPASLGSYYRYTGSLTTPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AIFFQVSPRDNSALDPIIHGLKGVVHHEKETFLDPFVLRDLLPASLGSYYRYTGSLTTPP
           220       230       240       250       260       270   

              270       280       290       300       310       320
pF1KB5 CSEIVEWIVFRRPVPISYHQLEAFYSIFTTEQQDHVKSVEYLRNNFRPQQRLHDRVVSKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CSEIVEWIVFRRPVPISYHQLEAFYSIFTTEQQDHVKSVEYLRNNFRPQQRLHDRVVSKS
           280       290       300       310       320       330   

              330       340       350       360       370       380
pF1KB5 AVRDSWNHDMTDFLENPLGTEASKVCSSPPIHMKVQPLNQTALQVSWSQPETIYHPPIMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVRDSWNHDMTDFLENPLGTEASKVCSSPPIHMKVQPLNQTALQVSWSQPETIYHPPIMN
           340       350       360       370       380       390   

              390       400       410       420       430       440
pF1KB5 YMISYSWTKNEDEKEKTFTKDSDKDLKATISHVSPDSLYLFRVQAVCRNDMRSDFSQTML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YMISYSWTKNEDEKEKTFTKDSDKDLKATISHVSPDSLYLFRVQAVCRNDMRSDFSQTML
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pF1KB5 MESLV
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XP_005 MESLV
            

>>XP_016862452 (OMIM: 176886) PREDICTED: receptor-type t  (1456 aa)
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Smith-Waterman score: 9379; 95.4% identity (95.4% similar) in 1485 aa overlap (1-1445:1-1456)

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pF1KB5 MRRLLEPCWWILFLKITSSVLHYVVCFPALTEGYVGALHENRHGSAVQIRRRKASGDPYW
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        : : .::   .   :..   .:. .:    .  .:         :     .: . :. :
NP_001 LDTGAEDSSGSSPATSAIPFISENISQGYIFSSENPETITYDVLIPESARNASEDSTSSG
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        ....:.:::..:::: .:::.:::::.:..: : .  .  .: :.::.::::.::..: 
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       :.::.:..:::::::::...: .:::.: :::..... ::::::..::.:::::::::::
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        .:::.::.:::.::::::::::::::.:::::::.::..::::::... :   ..:.::
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NP_001 QISTTTHYNRIGTKYNEAKTNRSPT-RGSEFSGKGDVPNTSLNSTSQPVTKLATEKDISL
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NP_001 TSQTVTELPPHTVEGTSASLNDGSKTVLRSPHMNLSGTAESLNTVSITEYEEESLLTSFK
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NP_001 LDTGAEDSSGSSPATSAIPFISENISQGYIFSSENPETITYDVLIPESARNASEDSTSSG
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NP_001 SEESLKDPSMEGNVWFPSSTDITAQPDVGSGRESFLQTNYTEIRVDESEKTTKSFSAGPV
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NP_001 MSQGPSVTDLEMPHYSTFAYF----PTEVTPHAFTPSSRQQDLVSTVNVVYSQTTQPVYN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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