Result of FASTA (omim) for pF1KB3816
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3816, 2012 aa
  1>>>pF1KB3816 2012 - 2012 aa - 2012 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6631+/-0.000711; mu= 3.0635+/- 0.043
 mean_var=371.9236+/-78.727, 0's: 0 Z-trim(112.0): 627  B-trim: 33 in 1/55
 Lambda= 0.066504
 statistics sampled from 20140 (20832) to 20140 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.244), width:  16
 Scan time: 15.750

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001380 (OMIM: 602523) Down syndrome cell adhesi (2012) 13294 1293.0       0
NP_001258463 (OMIM: 602523) Down syndrome cell adh (1994) 12532 1219.8       0
XP_016883770 (OMIM: 602523) PREDICTED: Down syndro (1776) 11733 1143.1       0
NP_065744 (OMIM: 611782) Down syndrome cell adhesi (2113) 8228 806.9       0
XP_011541220 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1977) 7227 710.9 3.5e-203
XP_011541219 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (2065) 7227 710.9 3.6e-203
XP_011541221 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1626) 6487 639.8 7.3e-182
XP_011541222 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1543) 6117 604.2 3.4e-171
XP_011541223 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1344) 4801 477.9 3.2e-133
XP_011541226 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1270) 4779 475.8 1.3e-132
XP_011541227 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1264) 4760 473.9 4.7e-132
XP_011523218 (OMIM: 607217) PREDICTED: protein sid (1142) 1176 130.0 1.4e-28
XP_011532070 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028)  859 99.5 1.9e-19
XP_005264814 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028)  852 98.9 3.1e-19
XP_016861996 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028)  852 98.9 3.1e-19
NP_065923 (OMIM: 601325) contactin-3 precursor [Ho (1028)  852 98.9 3.1e-19
XP_011507621 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1347)  826 96.5   2e-18
XP_011507616 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1418)  826 96.5 2.1e-18
XP_011507622 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1443)  826 96.5 2.1e-18
XP_016877727 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1381)  820 95.9 3.1e-18
XP_016877720 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1434)  820 96.0 3.2e-18
XP_016861997 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 ( 970)  810 94.8 4.8e-18
NP_001180513 (OMIM: 601581) neuronal cell adhesion (1180)  806 94.5 7.1e-18
NP_001180512 (OMIM: 601581) neuronal cell adhesion (1192)  806 94.5 7.2e-18
XP_016867746 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1192)  806 94.5 7.2e-18
XP_016867738 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1195)  806 94.5 7.2e-18
XP_016867736 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1196)  806 94.5 7.2e-18
XP_016867739 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1199)  806 94.5 7.2e-18
XP_016867731 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1273)  806 94.6 7.5e-18
XP_016867729 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1285)  806 94.6 7.5e-18
XP_016867728 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1286)  806 94.6 7.5e-18
XP_016867727 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1288)  806 94.6 7.5e-18
XP_016867730 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1289)  806 94.6 7.5e-18
XP_011514564 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1292)  806 94.6 7.5e-18
XP_016867744 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1189)  757 89.8 1.9e-16
XP_011507618 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1364)  757 89.9   2e-16
XP_011507614 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1435)  757 89.9 2.1e-16
XP_011507620 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1460)  757 89.9 2.1e-16
XP_016860311 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (33101)  787 94.4 2.1e-16
NP_596869 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60880 (33423)  787 94.4 2.2e-16
XP_016860310 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (34087)  787 94.4 2.2e-16
XP_016860309 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (34088)  787 94.4 2.2e-16
NP_001243779 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (34350)  787 94.4 2.2e-16
XP_016856226 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1133)  754 89.5 2.2e-16
XP_016860308 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (35622)  787 94.5 2.2e-16
NP_001254479 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (35991)  787 94.5 2.3e-16
NP_001153803 (OMIM: 609145) neurofascin isoform 2  (1189)  754 89.5 2.3e-16
XP_011507627 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1190)  754 89.5 2.3e-16
XP_011507626 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1195)  754 89.5 2.3e-16
XP_005245046 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1266)  754 89.6 2.4e-16


>>NP_001380 (OMIM: 602523) Down syndrome cell adhesion m  (2012 aa)
 initn: 13294 init1: 13294 opt: 13294  Z-score: 6914.6  bits: 1293.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 13294; 100.0% identity (100.0% similar) in 2012 aa overlap (1-2012:1-2012)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MWILALSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MWILALSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 ATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 LYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAMAGQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
NP_001 LYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFDHRKAMAGQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 RVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 TAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 RITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 SNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQ
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 PFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 LMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPT
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 IVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSM
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 YLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTK
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 EVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKART
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKART
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB3 ITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRM
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB3 YAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGY
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB3 QIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEII
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB3 TTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEI
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB3 KNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAA
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB3 SASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVW
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB3 VVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWM
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB3 KDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPP
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB3 DQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLEN
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB3 LKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWN
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KB3 DGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQ
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KB3 ANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRR
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KB3 REQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDD
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KB3 RSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGP
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KB3 TARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSS
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KB3 MVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KB3 STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPGDLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPGDLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSR
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
pF1KB3 DLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELG
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

             1990      2000      2010  
pF1KB3 QAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV
             1990      2000      2010  

>>NP_001258463 (OMIM: 602523) Down syndrome cell adhesio  (1994 aa)
 initn: 12528 init1: 12528 opt: 12532  Z-score: 6519.5  bits: 1219.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 13120; 99.1% identity (99.1% similar) in 2012 aa overlap (1-2012:1-1994)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MWILALSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MWILALSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 ATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 LYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAMAGQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
NP_001 LYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFDHRKAMAGQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 RVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 TAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 RITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 SNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQ
              550       560       570       580       590       600

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pF1KB3 PFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 LMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPT
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 IVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSM
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 YLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTK
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 EVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKART
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKART
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB3 ITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRM
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB3 YAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGY
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB3 QIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEII
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB3 TTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEI
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB3 KNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAA
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB3 SASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVW
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

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pF1KB3 VVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWM
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pF1KB3 KDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPP
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pF1KB3 DQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLEN
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

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pF1KB3 LKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWN
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pF1KB3 DGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQ
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pF1KB3 ANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRR
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pF1KB3 REQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDD
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pF1KB3 RSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGP
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pF1KB3 TARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSS
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pF1KB3 MVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS
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pF1KB3 STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPGDLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::                  ::::::
NP_001 STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPG------------------GPGTSR
             1870      1880      1890                        1900  

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
pF1KB3 DLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELG
           1910      1920      1930      1940      1950      1960  

             1990      2000      2010  
pF1KB3 QAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV
           1970      1980      1990    

>>XP_016883770 (OMIM: 602523) PREDICTED: Down syndrome c  (1776 aa)
 initn: 11733 init1: 11733 opt: 11733  Z-score: 6105.8  bits: 1143.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 11733; 100.0% identity (100.0% similar) in 1776 aa overlap (237-2012:1-1776)

        210       220       230       240       250       260      
pF1KB3 TRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAMAGQRVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLE
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                               MAGQRVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLE
                                             10        20        30

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pF1KB3 LSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSS
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pF1KB3 VGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCF
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pF1KB3 VRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSPAEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSPAEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDP
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pF1KB3 ILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPAS
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pF1KB3 IRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKNSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKNSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQK
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pF1KB3 EVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPI
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pF1KB3 TITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIV
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pF1KB3 RVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVL
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pF1KB3 SNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKE
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pF1KB3 MSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCH
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pF1KB3 AINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKS
              640       650       660       670       680       690

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pF1KB3 DSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDG
              700       710       720       730       740       750

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pF1KB3 PPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDS
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pF1KB3 EVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESIS
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pF1KB3 ISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVL
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pF1KB3 AFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFC
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pF1KB3 SHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPA
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pF1KB3 RILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFII
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pF1KB3 RTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGG
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pF1KB3 SSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEII
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pF1KB3 EAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQR
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pF1KB3 TSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEG
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pF1KB3 PMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYA
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XP_016 PMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYA
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       2010  
pF1KB3 KSYTLV
       ::::::
XP_016 KSYTLV
             

>>NP_065744 (OMIM: 611782) Down syndrome cell adhesion m  (2113 aa)
 initn: 4633 init1: 2653 opt: 8228  Z-score: 4287.5  bits: 806.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8230; 60.9% identity (84.2% similar) in 1991 aa overlap (1-1974:61-2032)

                                              10        20         
pF1KB3                               MWILA-LSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNA
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NP_065 GGWERAERGRGAAARPATGPPPRRIGPLYGMWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVND
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pF1KB3 SLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYLATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPS
       :::.:.:.:..:..::::::: : ..::::::::..::::: ::::: :::::..:: ::
NP_065 SLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWYLATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPS
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pF1KB3 SFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKAVLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPS
       .:...:::: :.::::: .::::: ....:::.:::::::::::..::::::::::.:::
NP_065 AFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPS
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pF1KB3 SVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGALYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQ
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pF1KB3 SNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAMAGQRVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSG
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NP_065 SNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADS
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pF1KB3 RFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGS
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NP_065 RWTKRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGS
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pF1KB3 QVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRK
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NP_065 TVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATR
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pF1KB3 DKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSPAEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILK
          .:::.. ..::::::.:.:.::::::.:.:  :::: .::.: ::.::.:::.::..
NP_065 KAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVR
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pF1KB3 GGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRP
        :::: .:.  :.:...:..:... :.:::::::::: : .: . :::::::::: ::: 
NP_065 DGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRA
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pF1KB3 MKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKNSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVD
       :.::::.::::: :.:::::::::::::::.. ::: :::::.::: :::::.:::: .:
NP_065 MRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFEN-GTLKLTDVQKGMD
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pF1KB3 EGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITIT
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NP_065 EGEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRIT
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pF1KB3 WQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVP
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NP_065 WRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVP
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pF1KB3 PKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQ-FQPIALNGRIQVLSN
       :.::::: .:::::::: .::::..::: : ..:: .::.: :: ..:. :.::::.: :
NP_065 PRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPN
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pF1KB3 GSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMS
       .::::.::.::: :::::..:: ::.:.::::.:::::::::::.::::.: .:. ::..
NP_065 SSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELN
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pF1KB3 CTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPE-MARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHA
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NP_065 CTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHA
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pF1KB3 INSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSD
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NP_065 INSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSD
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pF1KB3 SWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGP
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pF1KB3 PQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSE
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NP_065 PMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSE
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pF1KB3 VYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISI
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NP_065 VYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVI
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pF1KB3 SWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLA
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NP_065 SWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLA
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pF1KB3 FTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCS
       .:.:::::::  .. .:::::::::::.::. .::: : :::::: : ::.:::::.:::
NP_065 YTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCS
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pF1KB3 HP---YPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKA
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NP_065 SPGSGQPAP-SEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKA
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pF1KB3 PARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSF
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NP_065 PAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTL
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NP_065 LLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDN
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       :::::::..:::: ::::.: .  :: ::::..:..::::::::  :.:.:.:: :::::
NP_065 GGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISE
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pF1KB3 IIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTA
       :::::: :.::.:::.:.::. ::.:..:::: :::.::::::...::::: :: .:  .
NP_065 IIEAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQ-G
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pF1KB3 QRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNE
        :.. :   .: .:.:::::::.::.::::::... :.::::.:::::::: :::. :.:
NP_065 LRANSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPP-IKSA-QGE
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pF1KB3 EGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTR
            .. .: : ::.: .. . :  .::..::..:.:.:::::::::::::::.:::.:
NP_065 -----GDDVKKLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNR
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pF1KB3 TSDTLSK-QQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETI-DDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTV
       . ::  :   :  :.::::::.:::::... .. . ::..:. .:::.:..:.. .:. .
NP_065 SFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCT
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           1710      1720      1730      1740      1750      1760  
pF1KB3 THTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAH
         ..:. .. :.::::.:.:: ::::::..:.:.:.. ..::::.:::::.. . .  :.
NP_065 GVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPAR
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pF1KB3 TLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAK
       :::.:::  .    : .  ::::::.: :::::..:.:::::::::::::::::::::::
NP_065 TLTSDWRT-VGSQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAK
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pF1KB3 MEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS-STPSESGICRFTASPPKPQDG
       .::::.:::: ::::::::.::.:.:.:::: .::.:: ::::: ::::::::::::::.
NP_065 LEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDA
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pF1KB3 GRVMNMAVPKAHRPG--DLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSRDLSLGQAC--LEPQKS--R
        :  :.:::  :: .  :  .:: : . . .. : . :        . :  . :...  :
NP_065 DRGKNVAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSEAFF-RKADGR-------EPCPVVPPREASIR
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pF1KB3 TLKRP--TVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLL
       .: :   :  . . .. ::.. .  .  .   ...::::::                   
NP_065 NLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPT
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pF1KB3 DSRGHLKGNNPYAKSYTLV                                         
                                                                   
NP_065 PAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYT
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>>XP_011541220 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c  (1977 aa)
 initn: 5296 init1: 1862 opt: 7227  Z-score: 3768.8  bits: 710.9 E(85289): 3.5e-203
Smith-Waterman score: 7806; 60.5% identity (83.5% similar) in 1911 aa overlap (92-1974:5-1896)

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XP_011                           MTPCSSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAV
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pF1KB3 LREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGAL
       .:::::::::::..::::::::::.:::::. :..::::::::::..   ::.::  :.:
XP_011 FREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPEHRFFITYHGGL
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pF1KB3 YIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVS------------DPANSAPSILD
       ::.:::.::.: .:::::.:.:.:::::::.::: :.            :::.: :.:::
XP_011 YISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTGLARAADPLCLPDPAESIPTILD
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pF1KB3 GFEHRKAMAGQRVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSG
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pF1KB3 SYVCEVSNRYGTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYR
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XP_011 TYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYR
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XP_011 NTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRI
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pF1KB3 NISSSQVRDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIG
       :... :.:::::::::: : .: . :::::::::: ::: :.::::.::::: :.:::::
XP_011 NVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVIG
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pF1KB3 YPYYSIKWYKNSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSV
       ::::::::::.. ::: :::::.::: :::::.:::: .::::: :.::.::::: ::::
XP_011 YPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFEN-GTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSV
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pF1KB3 HVTVKVPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNID
       ::.:::::.:::::::  :::: ..::::: :::.:: :::.:::. : .. ::::.. .
XP_011 HVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKE
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pF1KB3 FTSSLRISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVIL
       : :::.::..:: ::::::::: : ::.: .. ::::::::.::::: .:::::::: .:
XP_011 FMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVL
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pF1KB3 NCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQ-FQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKV
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XP_011 NCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQA
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pF1KB3 SNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRII
       :: ::.:.::::.:::::::::::.::::.: .:. ::..:::.::.:::.:::: : .:
XP_011 SNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVI
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pF1KB3 NPE-MARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPD
       .:. . :: ..::. :.::.:::.. :. : :: :::::::::::::::.::::::::::
XP_011 DPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPPD
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pF1KB3 PPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATI
       :::.::..::::...::::. ::::: :::.::: ::::::::  : :...:: .:.:.:
XP_011 PPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTINQANI
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pF1KB3 IDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKA
       .:.::.:.::::::. :.::.::::.::::...::::::::..: :.:..::::.:::::
XP_011 VDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKA
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pF1KB3 PKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQAC
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XP_011 PKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAF
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pF1KB3 NRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVI
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XP_011 NRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVI
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pF1KB3 YWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKED
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XP_011 FWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKED
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pF1KB3 VPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHP---YPTVISEFEASPDSF
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XP_011 VPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAP-SEYETSPEQL
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pF1KB3 SYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIV
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XP_011 FYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVR
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pF1KB3 LPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNN
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XP_011 LPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNT
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XP_011 IGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFEN-GTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQ
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XP_011 SVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIES
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XP_011 KEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAG
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XP_011 VLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLC
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pF1KB3 KVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDR
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XP_011 QASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDT
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XP_011 VIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEP
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>>XP_011541222 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c  (1543 aa)
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       :::..:.:::::::::::::::::::::::.::::.:::: ::::::::.::.:.:.:::
XP_011 DTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTN
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pF1KB3 EYTDSLTS-STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPG--DLIHLPPYLRMDF
       : .::.:: ::::: ::::::::::::::. :  :.:::  :: .  :  .:: : . . 
XP_011 ENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSEA
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pF1KB3 LLNRGGPGTSRDLSLGQAC--LEPQKS--RTLKRP--TVLEPIPMEAASSASSTREGQSW
       .. : . :        . :  . :...  :.: :   :  . . .. ::.. .  .  . 
XP_011 FF-RKADGR-------EPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAP
    1400              1410      1420      1430      1440      1450 

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pF1KB3 QPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV           
         ...::::::                                                 
XP_011 AAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPHTKMG
            1460      1470      1480      1490      1500      1510 

>>XP_011541223 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c  (1344 aa)
 initn: 3842 init1: 1862 opt: 4801  Z-score: 2512.8  bits: 477.9 E(85289): 3.2e-133
Smith-Waterman score: 4803; 58.6% identity (81.8% similar) in 1260 aa overlap (734-1974:26-1263)

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                                     : :. . :     ::.:     :.  . . 
XP_011      MDYAFPDAPQSKLMSPNPLMKHSSDFPPVHVAGAATECSNSS----PVTVTSRNP
                    10        20        30        40            50 

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pF1KB3 YLCKVSNDVGADVSK-SMY---LTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIV
        .:.    : :..::  .:   :  ..::::::.::::.: .:. ::..:::.::.:::.
XP_011 RICSHHITVIANISKYHLYAALLQDHVPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIII
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pF1KB3 RWEKEDRIINPE-MARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGII
       :::: : .:.:. . :: ..::. :.::.:::.. :. : :: :::::::::::::::.:
XP_011 RWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLI
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       ::::::::::::.::..::::...::::. ::::: :::.::: ::::::::  : :...
XP_011 QLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNI
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pF1KB3 SPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISS
       :: .:.:.:.:.::.:.::::::. :.::.::::.::::...::::::::..: :.:..:
XP_011 SPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTS
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pF1KB3 QSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFT
       :::.::::::::.::::.:::::::::: : :.: :..:. . ..:::::::::::.::.
XP_011 QSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFA
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pF1KB3 QYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALN
       :::.:::: :::::::::.:: .:::::::: :::::.:.. . .   ::::   . .::
XP_011 QYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLN
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pF1KB3 GILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSE
       :.:.:.:::.:.  .::: ::..:::::.  .:: :.::.::::.::::.:.::::::: 
XP_011 GVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSS
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pF1KB3 QIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHP---YPTVIS
        .. .:::::::::::.::. .::: : :::::: : ::.:::::.::: :    :.  :
XP_011 VLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAP-S
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pF1KB3 EFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTV
       :.:.::... ::: .:.:..:: .::.:::::::::::: .:.:: .::::.:..:.:::
XP_011 EYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTV
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pF1KB3 TTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSG
       :::::::. :::..::::.::::: :::. .   :..::.: : .::....:.:::::::
XP_011 TTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSG
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pF1KB3 YYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQ
       ::.: :.:. : : ::.:: :::::::::::::::..:::::.:.:::::::::::..::
XP_011 YYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQ
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pF1KB3 YSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEP
       :: ::::.: .  :: ::::..:..::::::::  :.:.:.:: ::::::::::: :.::
XP_011 YSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREP
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pF1KB3 QFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYIL
       .:::.:.::. ::.:..:::: :::.::::::...::::: :: .:  . :.. :   .:
XP_011 SFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQ-GLRANSSGEVFL
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pF1KB3 YDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKM
        .:.:::::::.::.::::::... :.::::.:::::::: :::. :.:     .. .: 
XP_011 TELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPP-IKSA-QGE-----GDDVKK
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pF1KB3 LVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSK-QQQ
       : ::.: .. . :  .::..::..:.:.:::::::::::::::.:::.:. ::  :   :
XP_011 LFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQ
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pF1KB3 TLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETI-DDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQ
         :.::::::.:::::... .. . ::..:. .:::.:..:.. .:. .  ..:. .. :
XP_011 GPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQ
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pF1KB3 ATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTP
       .::::.:.:: ::::::..:.:.:.. ..::::.:::::.. . .  :.:::.:::    
XP_011 STGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGS
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pF1KB3 RAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFT
       . . .:  ::::::.: :::::..:.:::::::::::::::::::::::.::::.:::: 
XP_011 QHGVTVT-ESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFE
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pF1KB3 ITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS-STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKA
       ::::::::.::.:.:.:::: .::.:: ::::: ::::::::::::::. :  :.:::  
XP_011 ITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIP
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pF1KB3 HRPG--DLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSRDLSLGQAC--LEPQKS--RTLKRP--TVLE
       :: .  :  .:: : . . .. : . :        . :  . :...  :.: :   :  .
XP_011 HRANKSDYCNLPLYAKSEAFF-RKADGR-------EPCPVVPPREASIRNLARTYHTQAR
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pF1KB3 PIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNP
        . .. ::.. .  .  .   ...::::::                              
XP_011 HLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAA
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>>XP_011541226 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c  (1270 aa)
 initn: 3842 init1: 1862 opt: 4779  Z-score: 2501.6  bits: 475.8 E(85289): 1.3e-132
Smith-Waterman score: 4781; 60.1% identity (83.4% similar) in 1203 aa overlap (786-1974:4-1189)

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pF1KB3 VVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEK
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XP_011                            MESVPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGER
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pF1KB3 PIIVRWEKEDRIINPE-MARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGED
       :::.:::: : .:.:. . :: ..::. :.::.:::.. :. : :: :::::::::::::
XP_011 PIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGED
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pF1KB3 RGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQR
       ::.:::::::::::::.::..::::...::::. ::::: :::.::: ::::::::  : 
XP_011 RGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQS
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pF1KB3 TKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLE
       :...:: .:.:.:.:.::.:.::::::. :.::.::::.::::...::::::::..: :.
XP_011 TRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQ
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pF1KB3 PISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNL
       :..::::.::::::::.::::.:::::::::: : :.: :..:. . ..:::::::::::
XP_011 PVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNL
           220       230       240       250       260       270   

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pF1KB3 NKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSK
       .::.:::.:::: :::::::::.:: .:::::::: :::::.:.. . .   ::::   .
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