Result of FASTA (ccds) for pF1KA1883
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1883, 1460 aa
  1>>>pF1KA1883 1460 - 1460 aa - 1460 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.5209+/-0.00122; mu= -13.5300+/- 0.074
 mean_var=784.7330+/-163.612, 0's: 0 Z-trim(118.2): 200  B-trim: 124 in 1/54
 Lambda= 0.045784
 statistics sampled from 18859 (19060) to 18859 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.819), E-opt: 0.2 (0.585), width:  16
 Scan time:  6.520

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS46136.1 LMTK3 gene_id:114783|Hs108|chr19       (1489) 10365 701.2  6e-201
CCDS45807.1 AATK gene_id:9625|Hs108|chr17          (1374) 1775 133.7 3.6e-30
CCDS5654.1 LMTK2 gene_id:22853|Hs108|chr7          (1503) 1579 120.8   3e-26
CCDS58607.1 AATK gene_id:9625|Hs108|chr17          (1271) 1491 115.0 1.5e-24


>>CCDS46136.1 LMTK3 gene_id:114783|Hs108|chr19            (1489 aa)
 initn: 10365 init1: 10365 opt: 10365  Z-score: 3721.2  bits: 701.2 E(32554): 6e-201
Smith-Waterman score: 10365; 100.0% identity (100.0% similar) in 1460 aa overlap (1-1460:30-1489)

                                            10        20        30 
pF1KA1                              MPAPGALILLAAVSASGCLASPAHPDGFALG
                                    :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MRQVLWLCNVCVTARETRHHLHLPAILDKMPAPGALILLAAVSASGCLASPAHPDGFALG
               10        20        30        40        50        60

              40        50        60        70        80        90 
pF1KA1 RAPLAPPYAVVLISCSGLLAFIFLLLTCLCCKRGDVGFKEFENPEGEDCSGEYTPPAEET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RAPLAPPYAVVLISCSGLLAFIFLLLTCLCCKRGDVGFKEFENPEGEDCSGEYTPPAEET
               70        80        90       100       110       120

             100       110       120       130       140       150 
pF1KA1 SSSQSLPDVYILPLAEVSLPMPAPQPSHSDMTTPLGLSRQHLSYLQEIGSGWFGKVILGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SSSQSLPDVYILPLAEVSLPMPAPQPSHSDMTTPLGLSRQHLSYLQEIGSGWFGKVILGE
              130       140       150       160       170       180

             160       170       180       190       200       210 
pF1KA1 IFSDYTPAQVVVKELRASAGPLEQRKFISEAQPYRSLQHPNVLQCLGLCVETLPFLLIME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IFSDYTPAQVVVKELRASAGPLEQRKFISEAQPYRSLQHPNVLQCLGLCVETLPFLLIME
              190       200       210       220       230       240

             220       230       240       250       260       270 
pF1KA1 FCQLGDLKRYLRAQRPPEGLSPELPPRDLRTLQRMGLEIARGLAHLHSHNYVHSDLALRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FCQLGDLKRYLRAQRPPEGLSPELPPRDLRTLQRMGLEIARGLAHLHSHNYVHSDLALRN
              250       260       270       280       290       300

             280       290       300       310       320       330 
pF1KA1 CLLTSDLTVRIGDYGLAHSNYKEDYYLTPERLWIPLRWAAPELLGELHGTFMVVDQSRES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CLLTSDLTVRIGDYGLAHSNYKEDYYLTPERLWIPLRWAAPELLGELHGTFMVVDQSRES
              310       320       330       340       350       360

             340       350       360       370       380       390 
pF1KA1 NIWSLGVTLWELFEFGAQPYRHLSDEEVLAFVVRQQHVKLARPRLKLPYADYWYDILQSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NIWSLGVTLWELFEFGAQPYRHLSDEEVLAFVVRQQHVKLARPRLKLPYADYWYDILQSC
              370       380       390       400       410       420

             400       410       420       430       440       450 
pF1KA1 WRPPAQRPSASDLQLQLTYLLSERPPRPPPPPPPPRDGPFPWPWPPAHSAPRPGTLSSPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WRPPAQRPSASDLQLQLTYLLSERPPRPPPPPPPPRDGPFPWPWPPAHSAPRPGTLSSPF
              430       440       450       460       470       480

             460       470       480       490       500       510 
pF1KA1 PLLDGFPGADPDDVLTVTESSRGLNLECLWEKARRGAGRGGGAPAWQPASAPPAPHANPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PLLDGFPGADPDDVLTVTESSRGLNLECLWEKARRGAGRGGGAPAWQPASAPPAPHANPS
              490       500       510       520       530       540

             520       530       540       550       560       570 
pF1KA1 NPFYEALSTPSVLPVISARSPSVSSEYYIRLEEHGSPPEPLFPNDWDPLDPGVPAPQAPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NPFYEALSTPSVLPVISARSPSVSSEYYIRLEEHGSPPEPLFPNDWDPLDPGVPAPQAPQ
              550       560       570       580       590       600

             580       590       600       610       620       630 
pF1KA1 APSEVPQLVSETWASPLFPAPRPFPAQSSASGSFLLSGWDPEGRGAGETLAGDPAEVLGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APSEVPQLVSETWASPLFPAPRPFPAQSSASGSFLLSGWDPEGRGAGETLAGDPAEVLGE
              610       620       630       640       650       660

             640       650       660       670       680       690 
pF1KA1 RGTAPWVEEEEEEEEGSSPGEDSSSLGGGPSRRGPLPCPLCSREGACSCLPLERGDAVAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RGTAPWVEEEEEEEEGSSPGEDSSSLGGGPSRRGPLPCPLCSREGACSCLPLERGDAVAG
              670       680       690       700       710       720

             700       710       720       730       740       750 
pF1KA1 WGGHPALGCPHPPEDDSSLRAERGSLADLPMAPPASAPPEFLDPLMGAAAPQYPGRGPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WGGHPALGCPHPPEDDSSLRAERGSLADLPMAPPASAPPEFLDPLMGAAAPQYPGRGPPP
              730       740       750       760       770       780

             760       770       780       790       800       810 
pF1KA1 APPPPPPPPRAPADPAASPDPPSAVASPGSGLSSPGPKPGDSGYETETPFSPEGAFPGGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APPPPPPPPRAPADPAASPDPPSAVASPGSGLSSPGPKPGDSGYETETPFSPEGAFPGGG
              790       800       810       820       830       840

             820       830       840       850       860       870 
pF1KA1 AAEEEGVPRPRAPPEPPDPGAPRPPPDPGPLPLPGPREKPTFVVQVSTEQLLMSLREDVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AAEEEGVPRPRAPPEPPDPGAPRPPPDPGPLPLPGPREKPTFVVQVSTEQLLMSLREDVT
              850       860       870       880       890       900

             880       890       900       910       920       930 
pF1KA1 RNLLGEKGATARETGPRKAGRGPGNREKVPGLNRDPTVLGNGKQAPSLSLPVNGVTVLEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RNLLGEKGATARETGPRKAGRGPGNREKVPGLNRDPTVLGNGKQAPSLSLPVNGVTVLEN
              910       920       930       940       950       960

             940       950       960       970       980       990 
pF1KA1 GDQRAPGIEEKAAENGALGSPEREEKVLENGELTPPRREEKALENGELRSPEAGEKVLVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GDQRAPGIEEKAAENGALGSPEREEKVLENGELTPPRREEKALENGELRSPEAGEKVLVN
              970       980       990      1000      1010      1020

            1000      1010      1020      1030      1040      1050 
pF1KA1 GGLTPPKSEDKVSENGGLRFPRNTERPPETGPWRAPGPWEKTPESWGPAPTIGEPAPETS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GGLTPPKSEDKVSENGGLRFPRNTERPPETGPWRAPGPWEKTPESWGPAPTIGEPAPETS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

            1060      1070      1080      1090      1100      1110 
pF1KA1 LERAPAPSAVVSSRNGGETAPGPLGPAPKNGTLEPGTERRAPETGGAPRAPGAGRLDLGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LERAPAPSAVVSSRNGGETAPGPLGPAPKNGTLEPGTERRAPETGGAPRAPGAGRLDLGS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

            1120      1130      1140      1150      1160      1170 
pF1KA1 GGRAPVGTGTAPGGGPGSGVDAKAGWVDNTRPQPPPPPLPPPPEAQPRRLEPAPPRARPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GGRAPVGTGTAPGGGPGSGVDAKAGWVDNTRPQPPPPPLPPPPEAQPRRLEPAPPRARPE
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

            1180      1190      1200      1210      1220      1230 
pF1KA1 VAPEGEPGAPDSRAGGDTALSGDGDPPKPERKGPEMPRLFLDLGPPQGNSEQIKARLSRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VAPEGEPGAPDSRAGGDTALSGDGDPPKPERKGPEMPRLFLDLGPPQGNSEQIKARLSRL
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

            1240      1250      1260      1270      1280      1290 
pF1KA1 SLALPPLTLTPFPGPGPRRPPWEGADAGAAGGEAGGAGAPGPAEEDGEDEDEDEEEDEEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SLALPPLTLTPFPGPGPRRPPWEGADAGAAGGEAGGAGAPGPAEEDGEDEDEDEEEDEEA
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

            1300      1310      1320      1330      1340      1350 
pF1KA1 AAPGAAAGPRGPGRARAAPVPVVVSSADADAARPLRGLLKSPRGADEPEDSELERKRKMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AAPGAAAGPRGPGRARAAPVPVVVSSADADAARPLRGLLKSPRGADEPEDSELERKRKMV
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

            1360      1370      1380      1390      1400      1410 
pF1KA1 SFHGDVTVYLFDQETPTNELSVQAPPEGDTDPSTPPAPPTPPHPATPGDGFPSNDSGFGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SFHGDVTVYLFDQETPTNELSVQAPPEGDTDPSTPPAPPTPPHPATPGDGFPSNDSGFGG
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

            1420      1430      1440      1450      1460
pF1KA1 SFEWAEDFPLLPPPGPPLCFSRFSVSPALETPGPPARAPDARPAGPVEN
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SFEWAEDFPLLPPPGPPLCFSRFSVSPALETPGPPARAPDARPAGPVEN
             1450      1460      1470      1480         

>>CCDS45807.1 AATK gene_id:9625|Hs108|chr17               (1374 aa)
 initn: 1354 init1: 795 opt: 1775  Z-score: 655.2  bits: 133.7 E(32554): 3.6e-30
Smith-Waterman score: 2273; 36.0% identity (55.3% similar) in 1501 aa overlap (19-1439:12-1342)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MPAPGALILLAAVSASGCLASPAHPDGFALGRAPLAPPYAVVLISCSGLLAFIFLLLTCL
                         ..:   :::  :..       ::: .: :::.: : :.:.::
CCDS45        MSSSFFNPSFAFSSHFDPDGAPLSELSWPSSLAVVAVSFSGLFAVIVLMLACL
                      10        20        30        40        50   

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 CCKRGDVGFKEFENPEGEDCSGEYTPPAEETSSSQSLPDVYILPLAEVSLPMPAPQPSHS
       :::.: .::::::: ::.. ... .  .  :.. :. ::::.:::.:::::: : ::..:
CCDS45 CCKKGGIGFKEFENAEGDEYAADLAQGSPATAA-QNGPDVYVLPLTEVSLPM-AKQPGRS
            60        70        80         90       100        110 

               130       140       150       160       170         
pF1KA1 -DMTTPLGLSRQHLSYLQEIGSGWFGKVILGEIFSDYTPAQVVVKELRASAGPLEQRKFI
        ..     ..:. : ::.::: ::::::.:::. :  . ::::::::.:::.  :: .:.
CCDS45 VQLLKSTDVGRHSLLYLKEIGRGWFGKVFLGEVNSGISSAQVVVKELQASASVQEQMQFL
             120       130       140       150       160       170 

     180       190       200       210       220       230         
pF1KA1 SEAQPYRSLQHPNVLQCLGLCVETLPFLLIMEFCQLGDLKRYLRAQRPPEGLSPELPPRD
        :.::::.:.: :.::::. :.:. :.::.:::: ::::: :::. :  :...:     :
CCDS45 EEVQPYRALKHSNLLQCLAQCAEVTPYLLVMEFCPLGDLKGYLRSCRVAESMAP-----D
             180       190       200       210       220           

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA1 LRTLQRMGLEIARGLAHLHSHNYVHSDLALRNCLLTSDLTVRIGDYGLAHSNYKEDYYLT
        ::::::. :.: :. ::: .:.:::::::::::::.::::.:::::::: .:.:::..:
CCDS45 PRTLQRMACEVACGVLHLHRNNFVHSDLALRNCLLTADLTVKIGDYGLAHCKYREDYFVT
        230       240       250       260       270       280      

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA1 PERLWIPLRWAAPELLGELHGTFMVVDQSRESNIWSLGVTLWELFEFGAQPYRHLSDEEV
        ..::.:::: ::::. :.:....::::.. .:.::::::.:::::.:.::: . ::..:
CCDS45 ADQLWVPLRWIAPELVDEVHSNLLVVDQTKSGNVWSLGVTIWELFELGTQPYPQHSDQQV
        290       300       310       320       330       340      

     360       370       380       390       400       410         
pF1KA1 LAFVVRQQHVKLARPRLKLPYADYWYDILQSCWRPPAQRPSASDLQLQLTYLLS------
       ::..::.:..:: .:.:.:  .: ::...: ::  : :::.: ...: :.:: .      
CCDS45 LAYTVREQQLKLPKPQLQLTLSDRWYEVMQFCWLQPEQRPTAEEVHLLLSYLCAKGATEA
        350       360       370       380       390       400      

               420       430       440       450           460     
pF1KA1 ----ERPPRPPPPPPPPRDGPFPWPWPPAHSAPRPGTLSSPFPLLDGFPG----ADPDDV
           ::  :   :      :: :    :  ..    . .: ::::. : :    :: :::
CCDS45 EEEFERRWRSLRPGGGGV-GPGPGAAGPMLGGVVELAAASSFPLLEQFAGDGFHADGDDV
        410       420        430       440       450       460     

         470       480       490       500       510       520     
pF1KA1 LTVTESSRGLNLECLWEKARRGAGRGGGAPAWQPASAPPAPHANPSNPFYEALSTPSVLP
       :::::.:::::.:  ::     ::::  : :. ::.  :.  :  ..      . :.:.:
CCDS45 LTVTETSRGLNFEYKWE-----AGRG--AEAF-PATLSPGRTARLQELCAPDGAPPGVVP
         470       480              490        500       510       

         530       540                  550       560              
pF1KA1 VISARSPSVSSEYYIRLEE------H-----GSPPEPLFPNDWDPLDPGVPA------PQ
       :.::.:::..:::.:::::      :     :  : :    : :  . :  :      : 
CCDS45 VLSAHSPSLGSEYFIRLEEAAPAAGHDPDCAGCAPSPPATADQDDDSDGSTAASLAMEPL
       520       530       540       550       560       570       

      570        580             590          600       610        
pF1KA1 APQAPS-EVPQLVSETWA------SPLFPAPRPFPAQ---SSASGSFLLSGWDPEGRGA-
         ..:  .::   .. .       .:: :.  : :.    : : :.   . :   : .: 
CCDS45 LGHGPPVDVPWGRGDHYPRRSLARDPLCPSRSPSPSAGPLSLAEGGAEDADW---GVAAF
       580       590       600       610       620          630    

       620         630         640       650       660       670   
pF1KA1 GETLAGDP--AEVLGERGTAPW--VEEEEEEEEGSSPGEDSSSLGGGPSRRGPLPCPLCS
         ..  ::  .  ::  :. :   . :.: :: :.  .          ..::     . .
CCDS45 CPAFFEDPLGTSPLGSSGAPPLPLTGEDELEEVGARRA----------AQRGHWRSNVSA
          640       650       660       670                 680    

           680       690       700       710       720       730   
pF1KA1 REGACSCLPLERGDAVAGWGGHPALGCPHPPEDDSSLRAERGSLADLPMAPPASAPPEFL
        ... :  : :  : :.. ::: : ::: : .               : : :  . :   
CCDS45 NNNSGSRCP-ESWDPVSA-GGH-AEGCPSPKQT--------------PRASPEPGYPG--
          690        700         710                     720       

             740       750       760       770       780       790 
pF1KA1 DPLMG--AAAPQYPGRGPPPAPPPPPPPPRAPADPAASPDPPSAVASPGSGLSSPGPKPG
       .::.:  ::. : ::  :   :        :::   ..   :: . . .:: . :  .: 
CCDS45 EPLLGLQAASAQEPGCCPG-LPHLCSAQGLAPAPCLVT---PSWTETASSGGDHPQAEP-
         730       740        750       760          770       780 

             800       810       820       830       840       850 
pF1KA1 DSGYETETPFSPEGAFPGGGAAEEEGVPRPRAPPEPPDPGAPRPPPDPGPLPLPGPREKP
         . :.:   .:.  .:.  .  .::.: :      ::  ::   :: .: :  :     
CCDS45 KLATEAEGTTGPRLPLPSVPSPSQEGAPLPSEEASAPD--APDALPD-SPTPATGG----
              790       800       810         820        830       

             860       870       880       890       900        910
pF1KA1 TFVVQVSTEQLLMSLREDVTRNLLGEKGATARETGPRKAGRGPGNREKVPGLN-RDPTVL
           .::. .:  .:  . .   .  .. ....    .:  :  .  .  ::. : : :.
CCDS45 ----EVSAIKLASALNGSSSSPEV--EAPSSEDEDTAEATSGIFTDTSSDGLQARRPDVV
               840       850         860       870       880       

              920       930       940       950       960       970
pF1KA1 GNGKQAPSLSLPVNGVTVLENGDQRAPGIEEKAAENGALGSPEREEKVLENGELTPPRRE
          .   ::.  :.    :.. :     :  .:...:         .:.  .   :   .
CCDS45 PAFR---SLQKQVGTPDSLDSLD-----IPSSASDGGY--------EVFSPSATGPSGGQ
       890          900            910               920       930 

               980       990        1000      1010      1020       
pF1KA1 EKALENG-ELRSPEAGEKVLVNG--GLTPPKSEDKVSENGGLRFPRNTERPPETG-PWRA
        .::..: . .. :. : :: ..  :  :    . .::. :   :      :::      
CCDS45 PRALDSGYDTENYESPEFVLKEAQEGCEPQAFAELASEGEG---P-----GPETRLSTSL
             940       950       960       970               980   

       1030      1040      1050      1060      1070      1080      
pF1KA1 PGPWEKTPESWGPAPTIGEPAPETSLERAPAPSAVVSSRNGGETAPGPLGPAPKNGTLEP
        :  ::.:          . :  ..::     ..   .. ::. ::::    :..:  .:
CCDS45 SGLNEKNPYR--------DSAYFSDLEAEAEATSGPEKKCGGDRAPGPELGLPSTG--QP
           990              1000      1010      1020      1030     

       1090      1100      1110      1120      1130      1140      
pF1KA1 GTERRAPETGGAPRAPGAGRLDLGSGGRAPVGTGTAPGGGPGSGVDAKAGWVDNTRPQPP
       . .        .   ::.              .: : :.:::  :      .... :.: 
CCDS45 SEQ--------VCLRPGV--------------SGEAQGSGPGE-VLPPLLQLEGSSPEPS
                  1040                    1050       1060      1070

          1150      1160      1170      1180      1190      1200   
pF1KA1 PPP---LPPPPEAQPRRLEPAPPRARPEVAPEGEPGAPDSRAGGDTALSGDGDPPKPERK
         :   .: ::: :      .: ..::  .:   :.  .      . : ..:.  . : .
CCDS45 TCPSGLVPEPPEPQ------GPAKVRP--GPS--PSCSQFFLLTPVPLRSEGN--SSEFQ
             1080            1090          1100      1110          

          1210       1220      1230      1240      1250      1260  
pF1KA1 GPEMPRLFLDLGP-PQGNSEQIKARLSRLSLALPPLTLTPFPGPGPRRPPWEGADAGAAG
       ::  : :.   :: ::          .:..            :::  : : . :  :   
CCDS45 GP--PGLL--SGPAPQ----------KRMG------------GPGTPRAPLRLALPGLP-
     1120          1130                            1140      1150  

           1270      1280      1290      1300      1310      1320  
pF1KA1 GEAGGAGAPGPAEEDGEDEDEDEEEDEEAAAPGAAAGPRGPGRARAAPVPVVVSSADADA
         :.  : :   :::.:: ::..:: .  ..      :   .. .:  :::::  :....
CCDS45 --AALEGRPEEEEEDSEDSDESDEELRCYSVQE----PSEDSEEEAPAVPVVV--AESQS
              1160      1170      1180          1190        1200   

           1330      1340      1350      1360      1370      1380  
pF1KA1 ARPLRGLLKSPRGADEPEDSELERKRKMVSFHGDVTVYLFDQETPTNELSVQAPPEGDTD
       :: ::.::: :   .:    .::::.: :::  ::::::::::.:: ::.   :   .. 
CCDS45 ARNLRSLLKMPSLLSETFCEDLERKKKAVSFFDDVTVYLFDQESPTRELGEPFPGAKESP
          1210      1220      1230      1240      1250      1260   

              1390      1400       1410      1420                  
pF1KA1 PST---PPAPPTPPHPATPGDGFPSNDSGF-GGSFEWAEDFPL----------LPP--PG
       :.     :. :. :.    .:: :.....  ::.: : .::::          : :  :.
CCDS45 PTFLRGSPGSPSAPNRPQQADGSPNGSTAEEGGGFAWDDDFPLMTAKAAFAMALDPAAPA
          1270      1280      1290      1300      1310      1320   

             1430      1440      1450      1460           
pF1KA1 P------PLCFSRFSVSPALETPGPPARAPDARPAGPVEN           
       :      :  ::::.::::                                
CCDS45 PAAPTPTPAPFSRFTVSPAPTSRFSITHVSDSDAESKRGPEAGAGGESKEA
          1330      1340      1350      1360      1370    

>>CCDS5654.1 LMTK2 gene_id:22853|Hs108|chr7               (1503 aa)
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                     10        20        30        40           50 
pF1KA1 MPAPGAL------ILLAAVSASGCLASPAHPDGFALGRAPLAPPYA---VVLISCSGLLA
       ::.: ::      .::. . :..  :.:    :   :.:: :   .   :.:  :: :. 
CCDS56 MPGPPALRRRLLLLLLVLLIAGSAGAAPLPQTG--AGEAPPAAEVSSSFVILCVCS-LII
               10        20        30          40        50        

              60         70        80        90       100       110
pF1KA1 FIFLLLTCL-CCKRGDVGFKEFENPEGEDCSGEYTPPAEETSSSQSLPDVYILPLAEVSL
       .: :. .:. :::  .. :::::  .. :   ..:::::.: : ::  .:. : . ..::
CCDS56 LIVLIANCVSCCKDPEIDFKEFE--DNFDDEIDFTPPAEDTPSVQSPAEVFTLSVPNISL
        60        70        80          90       100       110     

               120       130       140       150       160         
pF1KA1 PMPAP-QPSHSDMTTPLGLSRQHLSYLQEIGSGWFGKVILGEIFSDYTPAQVVVKELRAS
       : :.  :::   . . .  .:. :.:.::::.::::::.::::..  . :.:.::::.::
CCDS56 PAPSQFQPSVEGLKSQV--ARHSLNYIQEIGNGWFGKVLLGEIYTGTSVARVIVKELKAS
         120       130         140       150       160       170   

     170       180       190       200       210       220         
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       :.: ::  :.....::  :::::.:::.: :::..:.::..:::.::::: :::. :.  
CCDS56 ANPKEQDTFLKNGEPYYILQHPNILQCVGQCVEAIPYLLVFEFCDLGDLKAYLRSEQEHM
           180       190       200       210       220       230   

      230       240       250       260       270       280        
pF1KA1 EGLSPELPPRDLRTLQRMGLEIARGLAHLHSHNYVHSDLALRNCLLTSDLTVRIGDYGLA
       .: :  .       ::::. :.: ::: .:. ...:::::::::.:::::.:..::::..
CCDS56 RGDSQTM------LLQRMACEVAAGLAAMHKLHFLHSDLALRNCFLTSDLNVKVGDYGIG
           240             250       260       270       280       

      290       300       310       320       330       340        
pF1KA1 HSNYKEDYYLTPERLWIPLRWAAPELLGELHGTFMVVDQSRESNIWSLGVTLWELFEFGA
        : :::::  : ..  .::::.::::.  ..  ....::.. ::::::::::::::. .:
CCDS56 FSRYKEDYIETDDKKVFPLRWTAPELVTSFQDRLLTADQTKYSNIWSLGVTLWELFDNAA
       290       300       310       320       330       340       

      350       360       370       380       390       400        
pF1KA1 QPYRHLSDEEVLAFVVRQQHVKLARPRLKLPYADYWYDILQSCWRPPAQRPSASDLQLQL
       ::: .::. .::  :.:.. .:: .:.:. ::.: ::..:: ::  : .::.: :..  :
CCDS56 QPYSNLSNLDVLNQVIRERDTKLPKPQLEQPYSDRWYEVLQFCWLSPEKRPAAEDVHRLL
       350       360       370       380       390       400       

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pF1KA1 TYLLSERPPRPPPPPPPPRDGPFPWPWPPAHSAPRPGTLSSPFPLLDGFP----GADPDD
       :::      :         :    :     ..  : .. .. ::.:: :     : . ..
CCDS56 TYL------RLQSQRDSEVDFEQQWNALKPNTNSRDSSNNAAFPILDHFARDRLGREMEE
       410             420       430       440       450       460 

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       ::::::.:.::..: .:: :.        ::    : .      :.  .. . . :.:  
CCDS56 VLTVTETSQGLSFEYVWEAAKHDHFDERSRGHLDEGLSYTSIFYPVEVFESSLSDPGPGK
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pF1KA1 NPSNPFYEALSTPSVLPVISARSPSVSSEYYIRLEEH-GSP-----PEPLFPNDWDPLDP
       . ..     : .:.:.::..:.. ::.:.:::.:::. ::      :  :. .: :  .:
CCDS56 QDDSGQDVPLRVPGVVPVFDAHNLSVGSDYYIQLEEKSGSNLELDYPPALLTTDMD--NP
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pF1KA1 GVPAPQAPQAPSEVPQLVSETWASPLFPAPRPFPAQSSASGSFLLSGWDPEGRGAGETLA
          .:.  :  .     . :. ..  :      : .::  :.. ...  ::.   .    
CCDS56 ERTGPELSQLTALRSVELEESSTDEDFFQSSTDPKDSSLPGDLHVTS-GPESPFNNIFND
     580       590       600       610       620        630        

            630       640       650       660       670       680  
pF1KA1 GDPAEVLGERGTAPWVEEEEEEEEGSSPGEDSSSLGGGPSRRGPLPCPLCSREGACSCLP
        : .: :  .     . : .  .   .:.  :::: .             . .   .  :
CCDS56 VDKSEDLPSHQKIFDLMELNGVQADFKPATLSSSLDNPKESVITGHFEKEKPRKIFDSEP
      640       650       660       670       680       690        

            690       700       710          720       730         
pF1KA1 LERGDAVAGWGGHPALGCPHPPEDDSSLRAE---RGSLADLPMAPPASAPPEFLDPLMGA
       :  .: .    .   :.  .  :.   :. .   .:::..           : .. :.  
CCDS56 LCLSDNLMHQDNFDPLNVQELSENFLFLQEKNLLKGSLSS----------KEHINDLQ--
      700       710       720       730                 740        

     740       750       760       770       780       790         
pF1KA1 AAPQYPGRGPPPAPPPPPPPPRAPADPAASPDPPSAVASPGSGLSSPGPKPGDSGYETET
          .  . :   :           ..   : :     :    :::    . . .: .:..
CCDS56 --TELKNAGFTEA--------MLETSCRNSLDTELQFAENKPGLSLLQENVSTKGDDTDV
          750               760       770       780       790      

     800       810       820       830       840       850         
pF1KA1 PFSPEGAFPGGGAAEEEGVPRPRAPPEPPDPGAPRPPPDPGPLPLPGPREKPTFVVQVST
        .. .    .  .. :  :: : .      :   : :::   ::  :  .   . : :  
CCDS56 MLTGDTLSTSLQSSPEVQVP-PTSFETEETP--RRVPPD--SLPTQGETQPTCLDVIVPE
        800       810        820         830         840       850 

     860       870       880        890       900       910        
pF1KA1 EQLLMSLREDVTRNLLGEKGATAR-ETGPRKAGRGPGNREKVPGLNRDPTVLGNGKQAPS
       . : ...  :..   .   .. :: ..   ..  .::. :..  :... .::..   :  
CCDS56 DCLHQDISPDAVTVPVEILSTDARTHSLDNRSQDSPGESEETLRLTESDSVLADDILASR
             860       870       880       890       900       910 

      920       930       940       950       960       970        
pF1KA1 LSLPVNGVTVLENGDQRAPGIEEKAAENGALGSPEREEKVLENGELTPPRREEKALENGE
       .:.   : .. : :..    ...:         :  :..          :: :: ::  :
CCDS56 VSV---GSSLPELGQE----LHNK---------PFSEDH-------HSHRRLEKNLEAVE
                920                    930              940        

      980       990      1000      1010      1020      1030        
pF1KA1 LRSPEAGEKVLVNGGLTPPKSEDKVSENGGLRFPRNTERPPETGPWRAPGPWEKTPESWG
         .   .. .  ..::.   : :..:... :.   ..  :      ..:   :..    .
CCDS56 TLNQLNSKDAAKEAGLVSALSSDSTSQDSLLEDSLSAPFPASEPSLETPDSLESVDVHEA
      950       960       970       980       990      1000        

     1040      1050       1060      1070      1080        1090     
pF1KA1 PAPTIGEPAPETSLE-RAPAPSAVVSSRNGGETAPGPLGPAPKNGTL--EPGTERRAPET
          ..:  .:.  .    :: :.  .  .. :.    : :::. ::   ::.:   . ..
CCDS56 LLDSLGSHTPQKLVPPDKPADSGYET--ENLESPEWTLHPAPE-GTADSEPATTGDGGHS
     1010      1020      1030        1040       1050      1060     

        1100      1110       1120      1130      1140      1150    
pF1KA1 GGAPRAPGAGRLDLGSGGRAP-VGTGTAPGGGPGSGVDAKAGWVDNTRPQPPPPPLPPPP
       :  :  :     : :.: :.  :   :  .:. ::  :. : . ::   . :       :
CCDS56 GLPPN-PVIVISDAGDGHRGTEVTPETFTAGSQGSYRDS-AYFSDND--SEPEKRSEEVP
        1070       1080      1090      1100       1110        1120 

         1160      1170       1180               1190              
pF1KA1 EAQPRRLEPAPPRARPE-VAPEGEPGAPDS-----RAGGD----TALSGDGD-----PPK
        ..:  :  .  .  :: : ::  :.: ::     ..  :    .:: ...:      :.
CCDS56 GTSPSALVLVQEQPLPEPVLPEQSPAAQDSCLEARKSQPDESCLSALHNSSDLELRATPE
            1130      1140      1150      1160      1170      1180 

    1200                 1210      1220                     1230   
pF1KA1 PERKG-PEM----------PRLFLDLGPPQGNSEQIKAR---------------LSRLSL
       : . : :..          :   :.    .:.. . .                 :.  . 
CCDS56 PAQTGVPQQVHPTEDEASSPWSVLNAELSSGDDFETQDDRPCTLASTGTNTNELLAYTNS
            1190      1200      1210      1220      1230      1240 

          1240      1250      1260      1270      1280             
pF1KA1 ALPPLTLTPFPGPGPRRPPWEGADAGAAGGEAGGAGAPGPAEEDGEDEDEDEEE----DE
       ::     .   ::  ..:  ::   :  :  ..:        ::: : ::..:.    ::
CCDS56 ALDKSLSSHSEGPKLKEPDIEGKYLGKLG--VSGML---DLSEDGMDADEEDENSDDSDE
            1250      1260      1270           1280      1290      

    1290      1300      1310      1320      1330      1340         
pF1KA1 EAAAPGAAAGPRGPGRARAAPVPVVVSSADADAARPLRGLLKSPRGADEPED--SELERK
       .  : .  .           :::...:. :   .: ::.::: : .:. :.    . ...
CCDS56 DLRAFNLHSLSSESEDETEHPVPIILSNED---GRHLRSLLK-PTAANAPDPLPEDWKKE
       1300      1310      1320         1330       1340      1350  

      1350      1360      1370      1380        1390       1400    
pF1KA1 RKMVSFHGDVTVYLFDQETPTNELSVQAPPEGDT-DPS-TPPAPPT-PPHPATPGDGFPS
       .: :.:  :::::::::::::.::.   :  :..  :. . ::: .  :. .   ..  :
CCDS56 KKAVTFFDDVTVYLFDQETPTKELG---PCGGEACGPDLSGPAPASGSPYLSRCINSESS
           1360      1370         1380      1390      1400         

         1410      1420      1430       1440           1450        
pF1KA1 NDSGFGGSFEWAEDFPLLPPPGPPLCFSRF-SVSPALET-----PGPPARAPDARPAGPV
       .:   ::.::: .::   : :      : . : .:.:.:     : ::::. .       
CCDS56 TDEE-GGGFEWDDDFS--PDPFMSKTTSNLLSSKPSLQTSKYFSPPPPARSTEQSWPHSA
    1410       1420        1430      1440      1450      1460      

     1460                                   
pF1KA1 EN                                   
                                            
CCDS56 PYSRFSISPANIASFSLTHLTDSDIEQGGSSEDGEKD
       1470      1480      1490      1500   

>>CCDS58607.1 AATK gene_id:9625|Hs108|chr17               (1271 aa)
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            90       100       110       120        130       140  
pF1KA1 YTPPAEETSSSQSLPDVYILPLAEVSLPMPAPQPSHS-DMTTPLGLSRQHLSYLQEIGSG
                                     : ::..: ..     ..:. : ::.::: :
CCDS58                              MAKQPGRSVQLLKSTDVGRHSLLYLKEIGRG
                                            10        20        30 

            150       160       170       180       190       200  
pF1KA1 WFGKVILGEIFSDYTPAQVVVKELRASAGPLEQRKFISEAQPYRSLQHPNVLQCLGLCVE
       :::::.:::. :  . ::::::::.:::.  :: .:. :.::::.:.: :.::::. :.:
CCDS58 WFGKVFLGEVNSGISSAQVVVKELQASASVQEQMQFLEEVQPYRALKHSNLLQCLAQCAE
              40        50        60        70        80        90 

            210       220       230       240       250       260  
pF1KA1 TLPFLLIMEFCQLGDLKRYLRAQRPPEGLSPELPPRDLRTLQRMGLEIARGLAHLHSHNY
       . :.::.:::: ::::: :::. :  :...:     : ::::::. :.: :. ::: .:.
CCDS58 VTPYLLVMEFCPLGDLKGYLRSCRVAESMAP-----DPRTLQRMACEVACGVLHLHRNNF
             100       110       120            130       140      

            270       280       290       300       310       320  
pF1KA1 VHSDLALRNCLLTSDLTVRIGDYGLAHSNYKEDYYLTPERLWIPLRWAAPELLGELHGTF
       :::::::::::::.::::.:::::::: .:.:::..: ..::.:::: ::::. :.:...
CCDS58 VHSDLALRNCLLTADLTVKIGDYGLAHCKYREDYFVTADQLWVPLRWIAPELVDEVHSNL
        150       160       170       180       190       200      

            330       340       350       360       370       380  
pF1KA1 MVVDQSRESNIWSLGVTLWELFEFGAQPYRHLSDEEVLAFVVRQQHVKLARPRLKLPYAD
       .::::.. .:.::::::.:::::.:.::: . ::..:::..::.:..:: .:.:.:  .:
CCDS58 LVVDQTKSGNVWSLGVTIWELFELGTQPYPQHSDQQVLAYTVREQQLKLPKPQLQLTLSD
        210       220       230       240       250       260      

            390       400       410                 420       430  
pF1KA1 YWYDILQSCWRPPAQRPSASDLQLQLTYLLS----------ERPPRPPPPPPPPRDGPFP
        ::...: ::  : :::.: ...: :.:: .          ::  :   :      :: :
CCDS58 RWYEVMQFCWLQPEQRPTAEEVHLLLSYLCAKGATEAEEEFERRWRSLRPGGGGV-GPGP
        270       280       290       300       310       320      

            440       450           460       470       480        
pF1KA1 WPWPPAHSAPRPGTLSSPFPLLDGFPG----ADPDDVLTVTESSRGLNLECLWEKARRGA
           :  ..    . .: ::::. : :    :: ::::::::.:::::.:  ::     :
CCDS58 GAAGPMLGGVVELAAASSFPLLEQFAGDGFHADGDDVLTVTETSRGLNFEYKWE-----A
         330       340       350       360       370            380

      490       500       510       520       530       540        
pF1KA1 GRGGGAPAWQPASAPPAPHANPSNPFYEALSTPSVLPVISARSPSVSSEYYIRLEE----
       :::  : :. ::.  :.  :  ..      . :.:.::.::.:::..:::.:::::    
CCDS58 GRG--AEAF-PATLSPGRTARLQELCAPDGAPPGVVPVLSAHSPSLGSEYFIRLEEAAPA
                 390       400       410       420       430       

                 550       560             570        580          
pF1KA1 --H-----GSPPEPLFPNDWDPLDPGVPA------PQAPQAPS-EVPQLVSETWA-----
         :     :  : :    : :  . :  :      :   ..:  .::   .. .      
CCDS58 AGHDPDCAGCAPSPPATADQDDDSDGSTAASLAMEPLLGHGPPVDVPWGRGDHYPRRSLA
       440       450       460       470       480       490       

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pF1KA1 -SPLFPAPRPFPAQ---SSASGSFLLSGWDPEGRGA-GETLAGDP--AEVLGERGTAPW-
        .:: :.  : :.    : : :.   . :   : .:   ..  ::  .  ::  :. :  
CCDS58 RDPLCPSRSPSPSAGPLSLAEGGAEDADW---GVAAFCPAFFEDPLGTSPLGSSGAPPLP
       500       510       520          530       540       550    

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pF1KA1 -VEEEEEEEEGSSPGEDSSSLGGGPSRRGPLPCPLCSREGACSCLPLERGDAVAGWGGHP
        . :.: :: :.  .          ..::     . . ... :  : :  : :.. ::: 
CCDS58 LTGEDELEEVGARRA----------AQRGHWRSNVSANNNSGSRCP-ESWDPVSA-GGH-
          560                 570       580       590         600  

        700       710       720       730         740       750    
pF1KA1 ALGCPHPPEDDSSLRAERGSLADLPMAPPASAPPEFLDPLMG--AAAPQYPGRGPPPAPP
       : ::: : .               : : :  . :   .::.:  ::. : ::  :   : 
CCDS58 AEGCPSPKQT--------------PRASPEPGYPG--EPLLGLQAASAQEPGCCPG-LPH
             610                     620         630       640     

          760       770       780       790       800       810    
pF1KA1 PPPPPPRAPADPAASPDPPSAVASPGSGLSSPGPKPGDSGYETETPFSPEGAFPGGGAAE
              :::   ..:   : . . .:: . :  .:   . :.:   .:.  .:.  .  
CCDS58 LCSAQGLAPAPCLVTP---SWTETASSGGDHPQAEP-KLATEAEGTTGPRLPLPSVPSPS
          650       660          670        680       690       700

          820       830       840       850       860       870    
pF1KA1 EEGVPRPRAPPEPPDPGAPRPPPDPGPLPLPGPREKPTFVVQVSTEQLLMSLREDVTRNL
       .::.: :      ::  ::   :: .: :  :         .::. .:  .:  . .   
CCDS58 QEGAPLPSEEASAPD--APDALPD-SPTPATGG--------EVSAIKLASALNGSSSSPE
              710         720        730               740         

          880       890       900        910       920       930   
pF1KA1 LGEKGATARETGPRKAGRGPGNREKVPGLN-RDPTVLGNGKQAPSLSLPVNGVTVLENGD
       .  .. ....    .:  :  .  .  ::. : : :.   .   ::.  :.    :.. :
CCDS58 V--EAPSSEDEDTAEATSGIFTDTSSDGLQARRPDVVPAFR---SLQKQVGTPDSLDSLD
     750         760       770       780          790       800    

           940       950       960       970        980       990  
pF1KA1 QRAPGIEEKAAENGALGSPEREEKVLENGELTPPRREEKALENG-ELRSPEAGEKVLVNG
            :  .:...:         .:.  .   :   . .::..: . .. :. : :: ..
CCDS58 -----IPSSASDGGY--------EVFSPSATGPSGGQPRALDSGYDTENYESPEFVLKEA
               810               820       830       840       850 

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pF1KA1 --GLTPPKSEDKVSENGGLRFPRNTERPPETG-PWRAPGPWEKTPESWGPAPTIGEPAPE
         :  :    . .::. :   :      :::       :  ::.:          . :  
CCDS58 QEGCEPQAFAELASEGEG---P-----GPETRLSTSLSGLNEKNPYR--------DSAYF
             860          870            880       890             

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pF1KA1 TSLERAPAPSAVVSSRNGGETAPGPLGPAPKNGTLEPGTERRAPETGGAPRAPGAGRLDL
       ..::     ..   .. ::. ::::    :..:  .:. .        .   ::.     
CCDS58 SDLEAEAEATSGPEKKCGGDRAPGPELGLPSTG--QPSEQ--------VCLRPGV-----
         900       910       920         930               940     

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pF1KA1 GSGGRAPVGTGTAPGGGPGSGVDAKAGWVDNTRPQPPPPP---LPPPPEAQPRRLEPAPP
                .: : :.:::  :      .... :.:   :   .: ::: :      .: 
CCDS58 ---------SGEAQGSGPGE-VLPPLLQLEGSSPEPSTCPSGLVPEPPEPQ------GPA
                       950        960       970       980          

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pF1KA1 RARPEVAPEGEPGAPDSRAGGDTALSGDGDPPKPERKGPEMPRLFLDLGP-PQGNSEQIK
       ..::  .:   :.  .      . : ..:.  . : .::  : :.   :: ::       
CCDS58 KVRP--GP--SPSCSQFFLLTPVPLRSEGN--SSEFQGP--PGLLS--GPAPQ-------
            990        1000      1010          1020                

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pF1KA1 ARLSRLSLALPPLTLTPFPGPGPRRPPWEGADAGAAGGEAGGAGAPGPAEEDGEDEDEDE
          .:..            :::  : : . :     :  :.  : :   :::.:: ::..
CCDS58 ---KRMG------------GPGTPRAPLRLA---LPGLPAALEGRPEEEEEDSEDSDESD
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pF1KA1 EEDEEAAAPGAAAGPRGPGRARAAPVPVVVSSADADAARPLRGLLKSPRGADEPEDSELE
       :: .  ..      :   .. .:  :::::  :....:: ::.::: :   .:    .::
CCDS58 EELRCYSVQ----EPSEDSEEEAPAVPVVV--AESQSARNLRSLLKMPSLLSETFCEDLE
    1070          1080      1090        1100      1110      1120   

        1350      1360      1370      1380          1390      1400 
pF1KA1 RKRKMVSFHGDVTVYLFDQETPTNELSVQAPPEGDTDPS----TPPAPPTPPHPATPGDG
       ::.: :::  ::::::::::.:: ::.   :   .. :.    .: .: .: .:   .::
CCDS58 RKKKAVSFFDDVTVYLFDQESPTRELGEPFPGAKESPPTFLRGSPGSPSAPNRPQQ-ADG
          1130      1140      1150      1160      1170       1180  

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pF1KA1 FPSNDSGF-GGSFEWAEDFPL----------LPP--PGP------PLCFSRFSVSPALET
        :.....  ::.: : .::::          : :  :.:      :  ::::.::::   
CCDS58 SPNGSTAEEGGGFAWDDDFPLMTAKAAFAMALDPAAPAPAAPTPTPAPFSRFTVSPAPTS
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CCDS58 RFSITHVSDSDAESKRGPEAGAGGESKEA
           1250      1260      1270 




1460 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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