Result of FASTA (omim) for
pF1KA1851
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1851, 504 aa
1>>>pF1KA1851 504 - 504 aa - 504 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2376+/-0.00039; mu= 13.7318+/- 0.024
mean_var=116.9052+/-24.302, 0's: 0 Z-trim(116.7): 293 B-trim: 2517 in 2/51
Lambda= 0.118620
statistics sampled from 27694 (28087) to 27694 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.329), width: 16
Scan time: 9.410
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_942015 (OMIM: 615691) amphoterin-induced protei ( 504) 3451 602.0 1.3e-171
NP_862830 (OMIM: 615690) amphoterin-induced protei ( 522) 872 160.6 9.9e-39
XP_005268894 (OMIM: 615690) PREDICTED: amphoterin- ( 522) 872 160.6 9.9e-39
NP_001137140 (OMIM: 615690) amphoterin-induced pro ( 522) 872 160.6 9.9e-39
XP_011540114 (OMIM: 615689) PREDICTED: amphoterin- ( 493) 659 124.2 8.9e-28
NP_065754 (OMIM: 615689) amphoterin-induced protei ( 493) 659 124.2 8.9e-28
NP_003053 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein is (1523) 344 70.7 3.5e-11
NP_001258875 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein (1530) 344 70.7 3.5e-11
NP_003052 (OMIM: 603742) slit homolog 1 protein pr (1534) 332 68.6 1.4e-10
NP_001264155 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-co ( 883) 322 66.7 3.1e-10
NP_003658 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-conta ( 907) 322 66.7 3.2e-10
NP_001017403 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-co ( 967) 320 66.4 4.3e-10
XP_006714049 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1509) 319 66.4 6.7e-10
NP_001276065 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein (1521) 319 66.4 6.7e-10
NP_001276064 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein (1525) 319 66.4 6.7e-10
NP_004778 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein is (1529) 319 66.4 6.7e-10
XP_005248268 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1533) 319 66.4 6.7e-10
NP_001264156 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-co ( 835) 306 64.0 2e-09
NP_056234 (OMIM: 300938) matrix-remodeling-associa (2828) 313 65.6 2.2e-09
XP_005274542 (OMIM: 300938) PREDICTED: matrix-remo (2853) 313 65.6 2.2e-09
NP_612490 (OMIM: 616236) chondroadherin-like prote ( 762) 301 63.1 3.4e-09
XP_005261427 (OMIM: 616236) PREDICTED: chondroadhe ( 771) 301 63.1 3.4e-09
XP_011512212 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1159) 288 61.0 2.2e-08
NP_060960 (OMIM: 606666,615311) leucine-rich repea ( 951) 286 60.6 2.4e-08
NP_001094861 (OMIM: 609792) leucine-rich repeat an ( 592) 277 58.9 4.9e-08
NP_056379 (OMIM: 610868) leucine-rich repeat trans ( 516) 272 58.0 7.9e-08
XP_016882791 (OMIM: 612809) PREDICTED: leucine-ric ( 628) 271 57.9 1e-07
NP_078785 (OMIM: 612809) leucine-rich repeat and f ( 628) 271 57.9 1e-07
NP_001005210 (OMIM: 615213) leucine-rich repeat-co ( 341) 267 56.9 1.1e-07
NP_036425 (OMIM: 269400,605158) peroxidasin homolo (1479) 273 58.5 1.5e-07
XP_016864334 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1495) 273 58.5 1.5e-07
XP_011512211 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1499) 273 58.5 1.6e-07
NP_001010847 (OMIM: 615212) leucine-rich repeat-co ( 294) 261 55.9 1.9e-07
XP_011531880 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-ric (1045) 268 57.5 2.2e-07
NP_056356 (OMIM: 608868) leucine-rich repeats and (1093) 268 57.6 2.2e-07
XP_016874406 (OMIM: 125255,610048) PREDICTED: deco ( 359) 260 55.8 2.5e-07
NP_598010 (OMIM: 125255,610048) decorin isoform a ( 359) 260 55.8 2.5e-07
NP_001911 (OMIM: 125255,610048) decorin isoform a ( 359) 260 55.8 2.5e-07
XP_005268750 (OMIM: 125255,610048) PREDICTED: deco ( 359) 260 55.8 2.5e-07
XP_006719333 (OMIM: 125255,610048) PREDICTED: deco ( 359) 260 55.8 2.5e-07
NP_821079 (OMIM: 610869) leucine-rich repeat trans ( 581) 260 55.9 3.6e-07
NP_001004432 (OMIM: 609794) leucine-rich repeat an ( 593) 259 55.8 4.1e-07
XP_016877935 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 468) 256 55.2 4.9e-07
NP_612449 (OMIM: 608843) vasorin precursor [Homo s ( 673) 256 55.3 6.5e-07
NP_001013675 (OMIM: 613505) leucine-rich repeat-co ( 334) 251 54.2 7e-07
NP_001123609 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfa ( 745) 256 55.4 7e-07
XP_011520143 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 745) 256 55.4 7e-07
NP_065902 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfamil ( 745) 256 55.4 7e-07
NP_001123608 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfa ( 745) 256 55.4 7e-07
XP_011520142 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 745) 256 55.4 7e-07
>>NP_942015 (OMIM: 615691) amphoterin-induced protein 3 (504 aa)
initn: 3451 init1: 3451 opt: 3451 Z-score: 3201.8 bits: 602.0 E(85289): 1.3e-171
Smith-Waterman score: 3451; 100.0% identity (100.0% similar) in 504 aa overlap (1-504:1-504)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTWLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_942 MTWLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 AATADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_942 AATADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_942 LRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SATHLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_942 SATHLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 AVRDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRLYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_942 AVRDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRLYC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 NTSVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLADGSLAIGNVQEQHAGLFVCLATGPRLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_942 NTSVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLADGSLAIGNVQEQHAGLFVCLATGPRLH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 HNQTHEYNVSVHFPRPEPEAFNTGFTTLLGCAVGLVLVLLYLFAPPCRCCRRACRCRRWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_942 HNQTHEYNVSVHFPRPEPEAFNTGFTTLLGCAVGLVLVLLYLFAPPCRCCRRACRCRRWP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 QTPSPLQELSAQSSVLSTTPPDAPSRKASVHKHVVFLEPGRRGLNGRVQLAVAEEFDLYN
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NP_942 QTPSPLQELSAQSSVLSTTPPDAPSRKASVHKHVVFLEPGRRGLNGRVQLAVAEEFDLYN
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KA1 PGGLQLKAGSESASSIGSEGPMTT
::::::::::::::::::::::::
NP_942 PGGLQLKAGSESASSIGSEGPMTT
490 500
>>NP_862830 (OMIM: 615690) amphoterin-induced protein 2 (522 aa)
initn: 704 init1: 212 opt: 872 Z-score: 816.4 bits: 160.6 E(85289): 9.9e-39
Smith-Waterman score: 876; 36.5% identity (62.6% similar) in 513 aa overlap (10-501:23-517)
10 20 30 40
pF1KA1 MTWLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSC
:::.: . . . : : : :: ::::.:..::
NP_862 MSLRVHTLPTLLGAVVRPGCRELLCLLMITV----TVG--PGASGVCPTACICATDIVSC
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 TGLGLQDVPAELPAATADLDLSHNALQRLRPGWLAPLF-QLRALHLDHNELDALGRGVFV
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NP_862 TNKNLSKVPGNLFRLIKRLDLSYNRIGLLDSEWIPVSFAKLNTLILRHNNITSISTGSFS
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 NASGLRLLDLSSNTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGC
.. .:. :::::: :... .. : .:: :::.::.. .:: :: :: :..:::.
NP_862 TTPNLKCLDLSSNKLKTVKNAVFQELKVLEVLLLYNNHISYLDPSAFGGLSQLQKLYLSG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 NELASFSFDHLHG-LSATHLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDC
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NP_862 NFLTQFPMDLYVGRFKLAELMFLDVSYNRIPSMPMHHINLVPGKQLRGIYLHGNPFVCDC
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 RLYHLLQRWHQRGLSAVRDFAREYVC-LAFKVPASR-VRFFQHSRVFENCSSAPALGLER
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NP_862 SLYSLLVFWYRRHFSSVMDFKNDYTCRLWSDSRHSRQVLLLQDS--FMNCSDSIINGSFR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 PEEHLY-ALVGRSLRLYCNTSVPAMR--IAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLADGSLAIG
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NP_862 ALGFIHEAQVGERLMVHCDSKTGNANTDFIWVGPDNRLLE-PDKEMENFYVFHNGSLVIE
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KA1 NVQEQHAGLFVCLATGPRLHHNQTHEYNVSV-HFPRPEP---EAFNTGFTTLLGCAVGLV
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NP_862 SPRFEDAGVYSCIAMNKQRLLNETVDVTINVSNFTVSRSHAHEAFNTAFTTLAACVASIV
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 LVLLYLFAPPCRCCRRACRCRRWPQTPSPLQELSAQSSVLSTTPPD---APSRKASVHKH
::::::. :: : :. .: . :.. .:.::.:: : . : :::.. :.
NP_862 LVLLYLYLTPCPC---KCKTKRQKNM---LHQSNAHSSILSPGPASDASADERKAGAGKR
420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KA1 VVFLEPGRR---GLNGRVQL----AVAEEFDLYNPGGLQLKAGSESASSIGSEGPMTT
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NP_862 VVFLEPLKDTAAGQNGKVRLFPSEAVIAEGILKSTRG---KSDSDSVNSVFSDTPFVAST
470 480 490 500 510 520
>>XP_005268894 (OMIM: 615690) PREDICTED: amphoterin-indu (522 aa)
initn: 704 init1: 212 opt: 872 Z-score: 816.4 bits: 160.6 E(85289): 9.9e-39
Smith-Waterman score: 876; 36.5% identity (62.6% similar) in 513 aa overlap (10-501:23-517)
10 20 30 40
pF1KA1 MTWLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSC
:::.: . . . : : : :: ::::.:..::
XP_005 MSLRVHTLPTLLGAVVRPGCRELLCLLMITV----TVG--PGASGVCPTACICATDIVSC
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 TGLGLQDVPAELPAATADLDLSHNALQRLRPGWLAPLF-QLRALHLDHNELDALGRGVFV
:. .:. ::..: ::::.: . : :. : .: .: : ::.. ... : :
XP_005 TNKNLSKVPGNLFRLIKRLDLSYNRIGLLDSEWIPVSFAKLNTLILRHNNITSISTGSFS
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 NASGLRLLDLSSNTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGC
.. .:. :::::: :... .. : .:: :::.::.. .:: :: :: :..:::.
XP_005 TTPNLKCLDLSSNKLKTVKNAVFQELKVLEVLLLYNNHISYLDPSAFGGLSQLQKLYLSG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 NELASFSFDHLHG-LSATHLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDC
: :..: .: : .. ..:. ::.: ::. . . .. .:. :.:::.::. :::
XP_005 NFLTQFPMDLYVGRFKLAELMFLDVSYNRIPSMPMHHINLVPGKQLRGIYLHGNPFVCDC
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 RLYHLLQRWHQRGLSAVRDFAREYVC-LAFKVPASR-VRFFQHSRVFENCSSAPALGLER
:: :: :..: .:.: :: .:.: : :: : ..: : : :::.. : :
XP_005 SLYSLLVFWYRRHFSSVMDFKNDYTCRLWSDSRHSRQVLLLQDS--FMNCSDSIINGSFR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 PEEHLY-ALVGRSLRLYCNTSVPAMR--IAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLADGSLAIG
.. : ::. : ..:.... . ::.:...::. : .. .. :. .:::.:
XP_005 ALGFIHEAQVGERLMVHCDSKTGNANTDFIWVGPDNRLLE-PDKEMENFYVFHNGSLVIE
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KA1 NVQEQHAGLFVCLATGPRLHHNQTHEYNVSV-HFPRPEP---EAFNTGFTTLLGCAVGLV
. . . ::.. :.: . . :.: . ...: .: . :::::.:::: .:....:
XP_005 SPRFEDAGVYSCIAMNKQRLLNETVDVTINVSNFTVSRSHAHEAFNTAFTTLAACVASIV
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 LVLLYLFAPPCRCCRRACRCRRWPQTPSPLQELSAQSSVLSTTPPD---APSRKASVHKH
::::::. :: : :. .: . :.. .:.::.:: : . : :::.. :.
XP_005 LVLLYLYLTPCPC---KCKTKRQKNM---LHQSNAHSSILSPGPASDASADERKAGAGKR
420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KA1 VVFLEPGRR---GLNGRVQL----AVAEEFDLYNPGGLQLKAGSESASSIGSEGPMTT
:::::: . : ::.:.: :: : : . : :. :.:..:. :. :
XP_005 VVFLEPLKDTAAGQNGKVRLFPSEAVIAEGILKSTRG---KSDSDSVNSVFSDTPFVAST
470 480 490 500 510 520
>>NP_001137140 (OMIM: 615690) amphoterin-induced protein (522 aa)
initn: 704 init1: 212 opt: 872 Z-score: 816.4 bits: 160.6 E(85289): 9.9e-39
Smith-Waterman score: 876; 36.5% identity (62.6% similar) in 513 aa overlap (10-501:23-517)
10 20 30 40
pF1KA1 MTWLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSC
:::.: . . . : : : :: ::::.:..::
NP_001 MSLRVHTLPTLLGAVVRPGCRELLCLLMITV----TVG--PGASGVCPTACICATDIVSC
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 TGLGLQDVPAELPAATADLDLSHNALQRLRPGWLAPLF-QLRALHLDHNELDALGRGVFV
:. .:. ::..: ::::.: . : :. : .: .: : ::.. ... : :
NP_001 TNKNLSKVPGNLFRLIKRLDLSYNRIGLLDSEWIPVSFAKLNTLILRHNNITSISTGSFS
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 NASGLRLLDLSSNTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGC
.. .:. :::::: :... .. : .:: :::.::.. .:: :: :: :..:::.
NP_001 TTPNLKCLDLSSNKLKTVKNAVFQELKVLEVLLLYNNHISYLDPSAFGGLSQLQKLYLSG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 NELASFSFDHLHG-LSATHLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDC
: :..: .: : .. ..:. ::.: ::. . . .. .:. :.:::.::. :::
NP_001 NFLTQFPMDLYVGRFKLAELMFLDVSYNRIPSMPMHHINLVPGKQLRGIYLHGNPFVCDC
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 RLYHLLQRWHQRGLSAVRDFAREYVC-LAFKVPASR-VRFFQHSRVFENCSSAPALGLER
:: :: :..: .:.: :: .:.: : :: : ..: : : :::.. : :
NP_001 SLYSLLVFWYRRHFSSVMDFKNDYTCRLWSDSRHSRQVLLLQDS--FMNCSDSIINGSFR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 PEEHLY-ALVGRSLRLYCNTSVPAMR--IAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLADGSLAIG
.. : ::. : ..:.... . ::.:...::. : .. .. :. .:::.:
NP_001 ALGFIHEAQVGERLMVHCDSKTGNANTDFIWVGPDNRLLE-PDKEMENFYVFHNGSLVIE
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KA1 NVQEQHAGLFVCLATGPRLHHNQTHEYNVSV-HFPRPEP---EAFNTGFTTLLGCAVGLV
. . . ::.. :.: . . :.: . ...: .: . :::::.:::: .:....:
NP_001 SPRFEDAGVYSCIAMNKQRLLNETVDVTINVSNFTVSRSHAHEAFNTAFTTLAACVASIV
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 LVLLYLFAPPCRCCRRACRCRRWPQTPSPLQELSAQSSVLSTTPPD---APSRKASVHKH
::::::. :: : :. .: . :.. .:.::.:: : . : :::.. :.
NP_001 LVLLYLYLTPCPC---KCKTKRQKNM---LHQSNAHSSILSPGPASDASADERKAGAGKR
420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
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:::::: . : ::.:.: :: : : . : :. :.:..:. :. :
NP_001 VVFLEPLKDTAAGQNGKVRLFPSEAVIAEGILKSTRG---KSDSDSVNSVFSDTPFVAST
470 480 490 500 510 520
>>XP_011540114 (OMIM: 615689) PREDICTED: amphoterin-indu (493 aa)
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Smith-Waterman score: 983; 37.7% identity (64.8% similar) in 483 aa overlap (29-502:29-491)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTWLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELP
::. .:: :.::...:::. : .:: ::
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pF1KA1 AATADLDLSHNALQRLRPGWLAP-LFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSN
. :: :::::: :.::: : : ::..: :.::.:. .. .: . .:: ::::::
XP_011 SYTALLDLSHNNLSRLRAEWTPTRLTQLHSLLLSHNHLNFISSEAFSPVPNLRYLDLSSN
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pF1KA1 TLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLH-
::.: . .. : .:: :::.::... .:. :: . :..:::. :... : .. ..
XP_011 QLRTLDEFLFSDLQVLEVLLLYNNHIMAVDRCAFDDMAQLQKLYLSQNQISRFPLELVKE
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pF1KA1 GLSATHLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRG
: . .: ::::::.: .. .:.: :::..::::::::::: :::.::.:...:. :
XP_011 GAKLPKLTLLDLSSNKLKNLPLPDLQKLPAWIKNGLYLHNNPLNCDCELYQLFSHWQYRQ
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pF1KA1 LSAVRDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRL
::.: :: .. :. : . :. : : ::. : :. : .: .: .
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pF1KA1 YCNTSVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLADGSLAIGNVQEQHAGLFVCLATGPR
:.:. .: .::.:..: . . .:...: :::: . .:: . .:...: : :
XP_011 KCDTKQQGMTKVWVTPSNERVLDEVT-NGTVSVSKDGSLLFQQVQVEDGGVYTCYAMGET
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pF1KA1 LHHNQTHEYNVSVHFPRPEPEAFNTGFTTLLGCAVGLVLVLLYLFAPPCRC-CRRACRCR
.... . : .: . . ...::..:::.:: ...::::.::. :::: :: .
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pF1KA1 RWPQTPSPLQELSAQSSVLSTTPPDAP----SRKASVHKHVVFLEPGR--RGLNGRVQLA
. :: : : .::.::::: : .. . ..:.::::. .: ::... .
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pF1KA1 VAEEFDLYNPGGLQLKAGSESASSIGSEGPMTT
. . : . . ::.::. :. :.
XP_011 NTLPVPEATGKGQRRMSDPESVSSVFSDTPIVV
470 480 490
>>NP_065754 (OMIM: 615689) amphoterin-induced protein 1 (493 aa)
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Smith-Waterman score: 983; 37.7% identity (64.8% similar) in 483 aa overlap (29-502:29-491)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTWLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELP
::. .:: :.::...:::. : .:: ::
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pF1KA1 AATADLDLSHNALQRLRPGWLAP-LFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSN
. :: :::::: :.::: : : ::..: :.::.:. .. .: . .:: ::::::
NP_065 SYTALLDLSHNNLSRLRAEWTPTRLTQLHSLLLSHNHLNFISSEAFSPVPNLRYLDLSSN
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pF1KA1 TLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLH-
::.: . .. : .:: :::.::... .:. :: . :..:::. :... : .. ..
NP_065 QLRTLDEFLFSDLQVLEVLLLYNNHIMAVDRCAFDDMAQLQKLYLSQNQISRFPLELVKE
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180 190 200 210 220 230
pF1KA1 GLSATHLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRG
: . .: ::::::.: .. .:.: :::..::::::::::: :::.::.:...:. :
NP_065 GAKLPKLTLLDLSSNKLKNLPLPDLQKLPAWIKNGLYLHNNPLNCDCELYQLFSHWQYRQ
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pF1KA1 LSAVRDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRL
::.: :: .. :. : . :. : : ::. : :. : .: .: .
NP_065 LSSVMDFQEDLYCMNSKKLHN---VFNLS--FLNCG-------EYKERAWEAHLGDTLII
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pF1KA1 YCNTSVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLADGSLAIGNVQEQHAGLFVCLATGPR
:.:. .: .::.:..: . . .:...: :::: . .:: . .:...: : :
NP_065 KCDTKQQGMTKVWVTPSNERVLDEVT-NGTVSVSKDGSLLFQQVQVEDGGVYTCYAMGET
290 300 310 320 330 340
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pF1KA1 LHHNQTHEYNVSVHFPRPEPEAFNTGFTTLLGCAVGLVLVLLYLFAPPCRC-CRRACRCR
.... . : .: . . ...::..:::.:: ...::::.::. :::: :: .
NP_065 FNETLSVELKVHNFTLHGHHDTLNTAYTTLVGCILSVVLVLIYLYLTPCRCWCRGV----
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pF1KA1 RWPQTPSPLQELSAQSSVLSTTPPDAP----SRKASVHKHVVFLEPGR--RGLNGRVQLA
. :: : : .::.::::: : .. . ..:.::::. .: ::... .
NP_065 ---EKPSSHQGDSLSSSMLSTTPNHDPMAGGDKDDGFDRRVAFLEPAGPGQGQNGKLKPG
410 420 430 440 450 460
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pF1KA1 VAEEFDLYNPGGLQLKAGSESASSIGSEGPMTT
. . : . . ::.::. :. :.
NP_065 NTLPVPEATGKGQRRMSDPESVSSVFSDTPIVV
470 480 490
>>NP_003053 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein isofor (1523 aa)
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pF1KA1 MTWLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAE
:: . :: :: :.: ..: ::::. ::
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pF1KA1 LPAATADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSS
.: . :::..: . :. .: : .::.:::. :..... ::.: . . :. : :..
NP_003 IPRNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNK
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pF1KA1 NTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLH
: :..: . ... : .: : .:.. . ..::.:. ...: : :... . ..
NP_003 NKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFR
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pF1KA1 GLSATHLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRG
.: ..:::. .: ...: : . .: . : ::.: : :::.: : . .::
NP_003 ALRDLEILTLN--NNNISRILVTSFNHMPKI--RTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQR-
180 190 200 210 220 230
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pF1KA1 LSAVRDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRL
: .. .:.: :. ..: :. . : .. :: : :
NP_003 ----RTVGQFTLCMA---PV-HLRGFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCT
240 250 260 270 280
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pF1KA1 YCNTSVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLADGSLAIGNVQEQHAGLFVCLATGPR
NP_003 CSNNIVDCRGKGLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISD
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>--
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 WLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAA
.:: : :. ....: : ::...::.:: .
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pF1KA1 TADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLR
... : .:... :. :.:.. . :. .:.:.: .
NP_003 IVEIRLEQNSIK------------------------AIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQIS
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pF1KA1 ALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGLSA
.. ..:: .: .:.:..:..... . : :: .:. : :. :.. . . .. :.
NP_003 DIAPDAFQGLKSLTSLVLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQN
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pF1KA1 THLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLSAV
.::.: .:.: :: .: : .. . :.: .::. :::.:
NP_003 LNLLSL--YDNKLQTISKGLFAPLQSI--QTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETS
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pF1KA1 RDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRLYCNT
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>--
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Smith-Waterman score: 256; 35.3% identity (58.1% similar) in 136 aa overlap (34-169:725-859)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 LVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAAT
:: .: : .. :.. ::. .: .: .
NP_003 FLKEIPIQDVAIQDFTCDGNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDV
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pF1KA1 ADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRA
..: : : : . : :. : .: . :..: .. : .: : : : : :: : ::
NP_003 TELYLEGNHLTAV-PRELSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRC
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pF1KA1 LGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGLSAT
. : ..:: .:. : : .: . . : .:. : .:::: :: : :
NP_003 IPVHAFNGLRSLRVLTLHGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVK
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pF1KA1 HLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVR
NP_003 AGYKEPGIARCSSPEPMADRLLLTTPTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQ
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>--
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 LVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAAT
:: :: : . ...:.. : .:..:: .
NP_003 ISQIKSKKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYV
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pF1KA1 ADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRA
.:: :. : .. :. . :.: . .:: ..::.: ..
NP_003 TDLRLNDNEVSVLE-----------------------ATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKE
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pF1KA1 LGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGLSAT
. . .:: .....:.: .:.: . ..:.:: .:. :.: : .. : : . :::..
NP_003 VREGAFDGAASVQELMLTGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSV
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pF1KA1 HLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVR
.::. : .::. :. ...: .. . . : .::. :.:.: : .: ..
NP_003 RLLS--LYDNRITTITPGAFTTLVSL--STINLLSNPFNCNCHLA-WLGKWLRKRRIVSG
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pF1KA1 DFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRLYCNTS
NP_003 NPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTCDGNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRAL
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>>NP_001258875 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein iso (1530 aa)
initn: 334 init1: 276 opt: 344 Z-score: 321.8 bits: 70.7 E(85289): 3.5e-11
Smith-Waterman score: 349; 30.6% identity (60.1% similar) in 258 aa overlap (27-284:29-271)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MTWLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAE
:: . :: :: :.: ..: ::::. ::
NP_001 MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAV--ACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRG
10 20 30 40 50
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pF1KA1 LPAATADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSS
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NP_001 IPRNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNK
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pF1KA1 NTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLH
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NP_001 NKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFR
120 130 140 150 160 170
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pF1KA1 GLSATHLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRG
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NP_001 ALRDLEILTLN--NNNISRILVTSFNHMPKI--RTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQR-
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pF1KA1 LSAVRDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRL
: .. .:.: :. ..: :. . : .. :: : :
NP_001 ----RTVGQFTLCMA---PV-HLRGFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCT
240 250 260 270 280
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pF1KA1 YCNTSVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLADGSLAIGNVQEQHAGLFVCLATGPR
NP_001 CSNNIVDCRGKGLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISD
290 300 310 320 330 340
>--
initn: 452 init1: 199 opt: 247 Z-score: 232.1 bits: 54.1 E(85289): 3.4e-06
Smith-Waterman score: 267; 26.7% identity (60.0% similar) in 195 aa overlap (33-227:279-445)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 WLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAA
.:: : :. ....: : ::...::.:: .
NP_001 RGFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLMEIPANLPEG
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pF1KA1 TADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLR
... : .:... :. :.:.. . :. .:.:.: .
NP_001 IVEIRLEQNSIK------------------------AIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQIS
310 320 330 340
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGLSA
.. ..:: .: .:.:..:..... . : :: .:. : :. :.. . . .. :.
NP_001 DIAPDAFQGLKSLTSLVLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQN
350 360 370 380 390 400
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 THLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLSAV
.::.: .:.: :: .: : .. . :.: .::. :::.:
NP_001 LNLLSL--YDNKLQTISKGLFAPLQSI--QTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETS
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..: : : : . : :. : .: . :..: .. : .: : : : : :: : ::
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:: :: : . ...:.. : .:..:: .
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:.:. : . :.. . .: : :::.:.: .:.. :. ::.: . . :. : :. : :.
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: . ... :: .: : .: . . ..::.: :..: : :... . ...: .
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start: Wed Nov 2 22:07:57 2016 done: Wed Nov 2 22:07:58 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]