Result of FASTA (ccds) for pF1KA1592
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1592, 631 aa
  1>>>pF1KA1592 631 - 631 aa - 631 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9069+/-0.00109; mu= 15.8118+/- 0.066
 mean_var=66.7690+/-13.084, 0's: 0 Z-trim(103.0): 38  B-trim: 24 in 1/48
 Lambda= 0.156959
 statistics sampled from 7212 (7221) to 7212 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.222), width:  16
 Scan time:  2.530

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2024.2 CNNM4 gene_id:26504|Hs108|chr2          ( 775) 4075 932.2       0
CCDS44475.1 CNNM2 gene_id:54805|Hs108|chr10        ( 853) 2900 666.1 5.3e-191
CCDS44474.1 CNNM2 gene_id:54805|Hs108|chr10        ( 875) 2574 592.3  9e-169
CCDS7478.2 CNNM1 gene_id:26507|Hs108|chr10         ( 951) 1711 396.9 6.5e-110
CCDS7543.1 CNNM2 gene_id:54805|Hs108|chr10         ( 552) 1643 381.4 1.7e-105
CCDS2025.1 CNNM3 gene_id:26505|Hs108|chr2          ( 707) 1339 312.6 1.1e-84
CCDS2026.1 CNNM3 gene_id:26505|Hs108|chr2          ( 659)  530 129.4 1.5e-29


>>CCDS2024.2 CNNM4 gene_id:26504|Hs108|chr2               (775 aa)
 initn: 4075 init1: 4075 opt: 4075  Z-score: 4981.3  bits: 932.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4075; 100.0% identity (100.0% similar) in 631 aa overlap (1-631:145-775)

                                             10        20        30
pF1KA1                               MKLYALCTRAQPDGPWLKWTDKDSLLFMVE
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 LVVQQLVNVSRGNTSGVLVVLTKFLRRSESMKLYALCTRAQPDGPWLKWTDKDSLLFMVE
          120       130       140       150       160       170    

               40        50        60        70        80        90
pF1KA1 EPGRFLPLWLHILLITVLLVLSGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYARKIEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 EPGRFLPLWLHILLITVLLVLSGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYARKIEP
          180       190       200       210       220       230    

              100       110       120       130       140       150
pF1KA1 IRRKGNYLLCSLLLGNVLVNTSLTILLDNLIGSGLMAVASSTIGIVIFGEILPQALCSRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 IRRKGNYLLCSLLLGNVLVNTSLTILLDNLIGSGLMAVASSTIGIVIFGEILPQALCSRH
          240       250       260       270       280       290    

              160       170       180       190       200       210
pF1KA1 GLAVGANTILLTKFFMLLTFPLSFPISKLLDFFLGQEIRTVYNREKLMEMLKVTEPYNDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 GLAVGANTILLTKFFMLLTFPLSFPISKLLDFFLGQEIRTVYNREKLMEMLKVTEPYNDL
          300       310       320       330       340       350    

              220       230       240       250       260       270
pF1KA1 VKEELNMIQGALELRTKTVEDIMTQLQDCFMIRSDAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 VKEELNMIQGALELRTKTVEDIMTQLQDCFMIRSDAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEDE
          360       370       380       390       400       410    

              280       290       300       310       320       330
pF1KA1 QSNIVDILYVKDLAFVDPDDCTPLKTITRFYNHPVHFVFHDTKLDAMLEEFKKGKSHLAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 QSNIVDILYVKDLAFVDPDDCTPLKTITRFYNHPVHFVFHDTKLDAMLEEFKKGKSHLAI
          420       430       440       450       460       470    

              340       350       360       370       380       390
pF1KA1 VQKVNNEGEGDPFYEVLGLVTLEDVIEEIIKSEILDESDMYTDNRSRKRVSEKNKRDFSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 VQKVNNEGEGDPFYEVLGLVTLEDVIEEIIKSEILDESDMYTDNRSRKRVSEKNKRDFSA
          480       490       500       510       520       530    

              400       410       420       430       440       450
pF1KA1 FKDADNELKVKISPQLLLAAHRFLATEVSQFSPSLISEKILLRLLKYPDVIQELKFDEHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 FKDADNELKVKISPQLLLAAHRFLATEVSQFSPSLISEKILLRLLKYPDVIQELKFDEHN
          540       550       560       570       580       590    

              460       470       480       490       500       510
pF1KA1 KYYARHYLYTRNKPADYFILILQGKVEVEAGKENMKFETGAFSYYGTMALTSVPSDRSPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 KYYARHYLYTRNKPADYFILILQGKVEVEAGKENMKFETGAFSYYGTMALTSVPSDRSPA
          600       610       620       630       640       650    

              520       530       540       550       560       570
pF1KA1 HPTPLSRSASLSYPDRTDVSTAATLAGSSNQFGSSVLGQYISDFSVRALVDLQYIKITRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 HPTPLSRSASLSYPDRTDVSTAATLAGSSNQFGSSVLGQYISDFSVRALVDLQYIKITRQ
          660       670       680       690       700       710    

              580       590       600       610       620       630
pF1KA1 QYQNGLLASRMENSPQFPIDGCTTHMENLAEKSELPVVDETTTLLNERNSLLHKASHENA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 QYQNGLLASRMENSPQFPIDGCTTHMENLAEKSELPVVDETTTLLNERNSLLHKASHENA
          720       730       740       750       760       770    

        
pF1KA1 I
       :
CCDS20 I
        

>>CCDS44475.1 CNNM2 gene_id:54805|Hs108|chr10             (853 aa)
 initn: 2028 init1: 1974 opt: 2900  Z-score: 3542.6  bits: 666.1 E(32554): 5.3e-191
Smith-Waterman score: 2900; 72.2% identity (89.8% similar) in 626 aa overlap (12-627:224-845)

                                  10          20           30      
pF1KA1                    MKLYALCTRAQPDGPWLK--WT---DKDSLLFMVEEPGRFL
                                     :  :: .  :     .:. ... ::   .:
CCDS44 SLSTPALGAGGSGSTGGAVGGKGGSGVAGLPPPPWAETTWIYHDGEDTKMIVGEEKKFLL
           200       210       220       230       240       250   

         40        50        60        70        80        90      
pF1KA1 PLWLHILLITVLLVLSGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYARKIEPIRRKGN
       :.::....:..:: :::.:::::::::::::::::::::::::::. ::..:::.::.::
CCDS44 PFWLQVIFISLLLCLSGMFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKEKNYAKRIEPVRRQGN
           260       270       280       290       300       310   

        100       110       120       130       140       150      
pF1KA1 YLLCSLLLGNVLVNTSLTILLDNLIGSGLMAVASSTIGIVIFGEILPQALCSRHGLAVGA
       :::::::::::::::.::::::.. ::::.::. :::::::::::.:::.::::::::::
CCDS44 YLLCSLLLGNVLVNTTLTILLDDIAGSGLVAVVVSTIGIVIFGEIVPQAICSRHGLAVGA
           320       330       340       350       360       370   

        160       170       180       190       200       210      
pF1KA1 NTILLTKFFMLLTFPLSFPISKLLDFFLGQEIRTVYNREKLMEMLKVTEPYNDLVKEELN
       :::.::::::..::: :.:.:::::  ::::: ::::::::.:::.::.:::::::::::
CCDS44 NTIFLTKFFMMMTFPASYPVSKLLDCVLGQEIGTVYNREKLLEMLRVTDPYNDLVKEELN
           380       390       400       410       420       430   

        220       230       240       250       260       270      
pF1KA1 MIQGALELRTKTVEDIMTQLQDCFMIRSDAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEDEQSNIVD
       .::::::::::::::.:: :.::::: ..::::::::::::::::::::::: :.:::::
CCDS44 IIQGALELRTKTVEDVMTPLRDCFMITGEAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEGERSNIVD
           440       450       460       470       480       490   

        280       290       300       310       320       330      
pF1KA1 ILYVKDLAFVDPDDCTPLKTITRFYNHPVHFVFHDTKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQKVNN
       .:.:::::::::::::::::::.:::::.::::.::::::::::::::::::::::.:::
CCDS44 LLFVKDLAFVDPDDCTPLKTITKFYNHPLHFVFNDTKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQRVNN
           500       510       520       530       540       550   

        340       350       360       370       380        390     
pF1KA1 EGEGDPFYEVLGLVTLEDVIEEIIKSEILDESDMYTDNRSRKRVSEKN-KRDFSAFKDAD
       ::::::::::::.::::::::::::::::::.:.:::::..:.:.... :.::::::..:
CCDS44 EGEGDPFYEVLGIVTLEDVIEEIIKSEILDETDLYTDNRTKKKVAHRERKQDFSAFKQTD
           560       570       580       590       600       610   

         400       410       420       430       440       450     
pF1KA1 NELKVKISPQLLLAAHRFLATEVSQFSPSLISEKILLRLLKYPDVIQELKFDEHNKYYAR
       .:.::::::::::: ::::::::  :::: .::::::::::.:.::::::.::.::   .
CCDS44 SEMKVKISPQLLLAMHRFLATEVEAFSPSQMSEKILLRLLKHPNVIQELKYDEKNKKAPE
           620       630       640       650       660       670   

         460       470       480       490       500        510    
pF1KA1 HYLYTRNKPADYFILILQGKVEVEAGKENMKFETGAFSYYGTMALTSVPSD-RSPAHPTP
       .::: ::::.:::.::::::::::::::.::::..::::::.::::. :.. .:: .:  
CCDS44 YYLYQRNKPVDYFVLILQGKVEVEAGKEGMKFEASAFSYYGVMALTASPGENKSPPRPCG
           680       690       700       710       720       730   

          520       530       540       550       560       570    
pF1KA1 LSRSASLSYPDRTDVSTAATLAGSSNQFGSSVLGQYISDFSVRALVDLQYIKITRQQYQN
       :..: :::  :: :. :  ::..:.::..::.:  :: :.::::: :::..::.::::::
CCDS44 LNHSDSLSRSDRIDAVTP-TLGSSNNQLNSSLLQVYIPDYSVRALSDLQFVKISRQQYQN
           740       750        760       770       780       790  

          580       590        600        610       620        630 
pF1KA1 GLLASRMENSPQFPIDGCTTHME-NLAEKSE-LPVVDETTTLLNERNSLLH-KASHENAI
       .:.::::...::   :. .:..: .:.:  . ::  :::..::::.: . : ::.:    
CCDS44 ALMASRMDKTPQSS-DSENTKIELTLTELHDGLP--DETANLLNEQNCVTHSKANHSLHN
            800        810       820         830       840         

CCDS44 EGAI
     850   

>>CCDS44474.1 CNNM2 gene_id:54805|Hs108|chr10             (875 aa)
 initn: 2872 init1: 1974 opt: 2574  Z-score: 3143.5  bits: 592.3 E(32554): 9e-169
Smith-Waterman score: 2855; 69.8% identity (86.6% similar) in 648 aa overlap (12-627:224-867)

                                  10          20           30      
pF1KA1                    MKLYALCTRAQPDGPWLK--WT---DKDSLLFMVEEPGRFL
                                     :  :: .  :     .:. ... ::   .:
CCDS44 SLSTPALGAGGSGSTGGAVGGKGGSGVAGLPPPPWAETTWIYHDGEDTKMIVGEEKKFLL
           200       210       220       230       240       250   

         40        50        60        70        80        90      
pF1KA1 PLWLHILLITVLLVLSGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYARKIEPIRRKGN
       :.::....:..:: :::.:::::::::::::::::::::::::::. ::..:::.::.::
CCDS44 PFWLQVIFISLLLCLSGMFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKEKNYAKRIEPVRRQGN
           260       270       280       290       300       310   

        100       110       120       130       140       150      
pF1KA1 YLLCSLLLGNVLVNTSLTILLDNLIGSGLMAVASSTIGIVIFGEILPQALCSRHGLAVGA
       :::::::::::::::.::::::.. ::::.::. :::::::::::.:::.::::::::::
CCDS44 YLLCSLLLGNVLVNTTLTILLDDIAGSGLVAVVVSTIGIVIFGEIVPQAICSRHGLAVGA
           320       330       340       350       360       370   

        160       170       180       190       200       210      
pF1KA1 NTILLTKFFMLLTFPLSFPISKLLDFFLGQEIRTVYNREKLMEMLKVTEPYNDLVKEELN
       :::.::::::..::: :.:.:::::  ::::: ::::::::.:::.::.:::::::::::
CCDS44 NTIFLTKFFMMMTFPASYPVSKLLDCVLGQEIGTVYNREKLLEMLRVTDPYNDLVKEELN
           380       390       400       410       420       430   

        220       230       240       250       260       270      
pF1KA1 MIQGALELRTKTVEDIMTQLQDCFMIRSDAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEDEQSNIVD
       .::::::::::::::.:: :.::::: ..::::::::::::::::::::::: :.:::::
CCDS44 IIQGALELRTKTVEDVMTPLRDCFMITGEAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEGERSNIVD
           440       450       460       470       480       490   

        280       290       300       310       320       330      
pF1KA1 ILYVKDLAFVDPDDCTPLKTITRFYNHPVHFVFHDTKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQKVNN
       .:.:::::::::::::::::::.:::::.::::.::::::::::::::::::::::.:::
CCDS44 LLFVKDLAFVDPDDCTPLKTITKFYNHPLHFVFNDTKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQRVNN
           500       510       520       530       540       550   

        340       350       360       370       380        390     
pF1KA1 EGEGDPFYEVLGLVTLEDVIEEIIKSEILDESDMYTDNRSRKRVSEKN-KRDFSAFKDAD
       ::::::::::::.::::::::::::::::::.:.:::::..:.:.... :.::::::..:
CCDS44 EGEGDPFYEVLGIVTLEDVIEEIIKSEILDETDLYTDNRTKKKVAHRERKQDFSAFKQTD
           560       570       580       590       600       610   

         400       410       420       430       440       450     
pF1KA1 NELKVKISPQLLLAAHRFLATEVSQFSPSLISEKILLRLLKYPDVIQELKFDEHNKYYAR
       .:.::::::::::: ::::::::  :::: .::::::::::.:.::::::.::.::   .
CCDS44 SEMKVKISPQLLLAMHRFLATEVEAFSPSQMSEKILLRLLKHPNVIQELKYDEKNKKAPE
           620       630       640       650       660       670   

         460       470       480       490       500               
pF1KA1 HYLYTRNKPADYFILILQGKVEVEAGKENMKFETGAFSYYGTMALTSVP-----------
       .::: ::::.:::.::::::::::::::.::::..::::::.::::. :           
CCDS44 YYLYQRNKPVDYFVLILQGKVEVEAGKEGMKFEASAFSYYGVMALTASPVPLSLSRTFVV
           680       690       700       710       720       730   

                      510       520       530       540       550  
pF1KA1 ------------SDRSPAHPTPLSRSASLSYPDRTDVSTAATLAGSSNQFGSSVLGQYIS
                    ..:: .:  :..: :::  :: :. :  ::..:.::..::.:  :: 
CCDS44 SRTELLAAGSPGENKSPPRPCGLNHSDSLSRSDRIDAVTP-TLGSSNNQLNSSLLQVYIP
           740       750       760       770        780       790  

            560       570       580       590        600        610
pF1KA1 DFSVRALVDLQYIKITRQQYQNGLLASRMENSPQFPIDGCTTHME-NLAEKSE-LPVVDE
       :.::::: :::..::.::::::.:.::::...::   :. .:..: .:.:  . ::  ::
CCDS44 DYSVRALSDLQFVKISRQQYQNALMASRMDKTPQSS-DSENTKIELTLTELHDGLP--DE
            800       810       820        830       840           

              620        630     
pF1KA1 TTTLLNERNSLLH-KASHENAI    
       :..::::.: . : ::.:        
CCDS44 TANLLNEQNCVTHSKANHSLHNEGAI
     850       860       870     

>>CCDS7478.2 CNNM1 gene_id:26507|Hs108|chr10              (951 aa)
 initn: 1674 init1: 639 opt: 1711  Z-score: 2086.8  bits: 396.9 E(32554): 6.5e-110
Smith-Waterman score: 2144; 53.1% identity (76.4% similar) in 670 aa overlap (2-621:182-840)

                                            10        20        30 
pF1KA1                              MKLYALCTRAQPDGPWLKWTDKDSLLFMVEE
                                     ::..::  :     : .     ..:. :. 
CCDS74 GGVAGSALVQVRVRELRKGEAERGGAGGGGKLFSLC--AWDGRAWHHHGAAGGFLLRVRP
             160       170       180         190       200         

                    40        50        60        70        80     
pF1KA1 ----PGRFL--PLWLHILLITVLLVLSGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYA
           ::  :  : ::. :   .::.::..:::: :.:..:::.:::...: :.  :.. :
CCDS74 RLYGPGGDLLPPAWLRALGALLLLALSALFSGLRLSLLSLDPVELRVLRNSGSAAEQEQA
     210       220       230       240       250       260         

          90       100       110            120                    
pF1KA1 RKIEPIRRKGNYLLCSLLLGNVLVNTSL-----TILLDNLIGSG------------LMAV
       :... .: .:..:::.::::.. .:..:     : :  .. :.:            : :.
CCDS74 RRVQAVRGRGTHLLCTLLLGQAGANAALAGWLYTSLPPGFGGTGEDYSEEGIHFPWLPAL
     270       280       290       300       310       320         

      130        140       150       160       170       180       
pF1KA1 ASSTIGIVIFG-EILPQALCSRHGLAVGANTILLTKFFMLLTFPLSFPISKLLDFFLGQE
       . .  : :..: :: : ..:::::::...... ::...:  .::. .:...:::. : ::
CCDS74 VCT--GAVFLGAEICPYSVCSRHGLAIASHSVCLTRLLMAAAFPVCYPLGRLLDWALRQE
     330         340       350       360       370       380       

       190       200       210       220       230       240       
pF1KA1 IRTVYNREKLMEMLKVTEPYNDLVKEELNMIQGALELRTKTVEDIMTQLQDCFMIRSDAI
       : : :.::::.: :....::.::::::::.::::::::::.::...: : ::::.::::.
CCDS74 ISTFYTREKLLETLRAADPYSDLVKEELNIIQGALELRTKVVEEVLTPLGDCFMLRSDAV
       390       400       410       420       430       440       

       250       260        270       280       290       300      
pF1KA1 LDFNTMSEIMESGYTRIPVFE-DEQSNIVDILYVKDLAFVDPDDCTPLKTITRFYNHPVH
       ::: :.:::..::::::::.: :.. ::::::.::::::::::::::: :.:::::.:.:
CCDS74 LDFATVSEILRSGYTRIPVYEGDQRHNIVDILFVKDLAFVDPDDCTPLLTVTRFYNRPLH
       450       460       470       480       490       500       

        310       320       330       340       350       360      
pF1KA1 FVFHDTKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQKVNNEGEGDPFYEVLGLVTLEDVIEEIIKSEILD
        ::.::.::..:::::::::::::::.:::::::::::::.:.:::::.:::::::::::
CCDS74 CVFNDTRLDTVLEEFKKGKSHLAIVQRVNNEGEGDPFYEVMGIVTLEDIIEEIIKSEILD
       510       520       530       540       550       560       

        370       380         390       400       410       420    
pF1KA1 ESDMYTDNRSRKRVS--EKNKRDFSAFKDADNELKVKISPQLLLAAHRFLATEVSQFSPS
       :.:.:::::...::   :....::: :: .:.:..::::::::::.:::.::::  :.  
CCDS74 ETDLYTDNRKKQRVPQRERKRHDFSLFKLSDTEMRVKISPQLLLATHRFMATEVEPFKSL
       570       580       590       600       610       620       

          430       440       450       460       470       480    
pF1KA1 LISEKILLRLLKYPDVIQELKFDEHNKYYARHYLYTRNKPADYFILILQGKVEVEAGKEN
        .::::::::::.:.:::::::::.::   .:::: ::.:.:::.:.::::::::.:::.
CCDS74 YLSEKILLRLLKHPNVIQELKFDEKNKKAPEHYLYQRNRPVDYFVLLLQGKVEVEVGKEG
       630       640       650       660       670       680       

          490                         500       510       520      
pF1KA1 MKFETGAFSYYG------------------TMALTSVPSDRSPAHPTPLSRSASLSYPDR
       ..::.:::.:::                  ..: .::  .:::.. . :.:: :   :.:
CCDS74 LRFENGAFTYYGVPAIMTTACSDNDVRKVGSLAGSSVFLNRSPSRCSGLNRSES---PNR
       690       700       710       720       730       740       

        530       540       550       560       570       580      
pF1KA1 TDVSTAATLAGSSNQFGSSVLGQYISDFSVRALVDLQYIKITRQQYQNGLLASRMENSPQ
             . ..::..:. ::  . :. :.::. : :.:..:::::::::.: : .:..:::
CCDS74 ER----SDFGGSNTQLYSSSNNLYMPDYSVHILSDVQFVKITRQQYQNALTACHMDSSPQ
              750       760       770       780       790       800

             590       600       610       620       630           
pF1KA1 FP-----IDGCTTHMENLAEKSELPVVDETTTLLNERNSLLHKASHENAI          
        :      :: .:.  .     . :  : . ::::.::::                    
CCDS74 SPDMEAFTDGDSTKAPTTRGTPQTPKDDPAITLLNNRNSLPCSRSDGLRSPSEVVYLRME
              810       820       830       840       850       860

CCDS74 ELAFTQEEMTDFEEHSTQQLTLSPAAVPTRAASDSECCNINLDTETSPCSSDFEENVGKK
              870       880       890       900       910       920

>>CCDS7543.1 CNNM2 gene_id:54805|Hs108|chr10              (552 aa)
 initn: 1629 init1: 1629 opt: 1643  Z-score: 2007.5  bits: 381.4 E(32554): 1.7e-105
Smith-Waterman score: 1643; 77.3% identity (91.8% similar) in 317 aa overlap (12-323:224-540)

                                  10          20           30      
pF1KA1                    MKLYALCTRAQPDGPWLK--WT---DKDSLLFMVEEPGRFL
                                     :  :: .  :     .:. ... ::   .:
CCDS75 SLSTPALGAGGSGSTGGAVGGKGGSGVAGLPPPPWAETTWIYHDGEDTKMIVGEEKKFLL
           200       210       220       230       240       250   

         40        50        60        70        80        90      
pF1KA1 PLWLHILLITVLLVLSGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYARKIEPIRRKGN
       :.::....:..:: :::.:::::::::::::::::::::::::::. ::..:::.::.::
CCDS75 PFWLQVIFISLLLCLSGMFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKEKNYAKRIEPVRRQGN
           260       270       280       290       300       310   

        100       110       120       130       140       150      
pF1KA1 YLLCSLLLGNVLVNTSLTILLDNLIGSGLMAVASSTIGIVIFGEILPQALCSRHGLAVGA
       :::::::::::::::.::::::.. ::::.::. :::::::::::.:::.::::::::::
CCDS75 YLLCSLLLGNVLVNTTLTILLDDIAGSGLVAVVVSTIGIVIFGEIVPQAICSRHGLAVGA
           320       330       340       350       360       370   

        160       170       180       190       200       210      
pF1KA1 NTILLTKFFMLLTFPLSFPISKLLDFFLGQEIRTVYNREKLMEMLKVTEPYNDLVKEELN
       :::.::::::..::: :.:.:::::  ::::: ::::::::.:::.::.:::::::::::
CCDS75 NTIFLTKFFMMMTFPASYPVSKLLDCVLGQEIGTVYNREKLLEMLRVTDPYNDLVKEELN
           380       390       400       410       420       430   

        220       230       240       250       260       270      
pF1KA1 MIQGALELRTKTVEDIMTQLQDCFMIRSDAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEDEQSNIVD
       .::::::::::::::.:: :.::::: ..::::::::::::::::::::::: :.:::::
CCDS75 IIQGALELRTKTVEDVMTPLRDCFMITGEAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEGERSNIVD
           440       450       460       470       480       490   

        280       290       300       310       320       330      
pF1KA1 ILYVKDLAFVDPDDCTPLKTITRFYNHPVHFVFHDTKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQKVNN
       .:.:::::::::::::::::::.:::::.::::.:::::::::::::             
CCDS75 LLFVKDLAFVDPDDCTPLKTITKFYNHPLHFVFNDTKLDAMLEEFKKEHTNKKPKSYQH 
           500       510       520       530       540       550   

        340       350       360       370       380       390      
pF1KA1 EGEGDPFYEVLGLVTLEDVIEEIIKSEILDESDMYTDNRSRKRVSEKNKRDFSAFKDADN

>>CCDS2025.1 CNNM3 gene_id:26505|Hs108|chr2               (707 aa)
 initn: 1678 init1: 808 opt: 1339  Z-score: 1633.6  bits: 312.6 E(32554): 1.1e-84
Smith-Waterman score: 1715; 49.3% identity (74.2% similar) in 617 aa overlap (24-627:115-690)

                      10        20        30             40        
pF1KA1        MKLYALCTRAQPDGPWLKWTDKDSLLFMVEEPG-----RFLPLWLHILLITVL
                                     .:: .  :::     .  : :   :  . :
CCDS20 GCREEAASPAGEWRALLRLRLRAEAVRPHSALLAVRVEPGGGAAEEAAPPWALGLGAAGL
           90       100       110       120       130       140    

       50        60        70        80        90       100        
pF1KA1 LVLSGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYARKIEPIRRKGNYLLCSLLLGNVL
       :.:...  ::.:. .:: : :...... :.: ::  ::..:: :: ..  : .:::   :
CCDS20 LALAALARGLQLSALALAPAEVQVLRESGSEAERAAARRLEPARRWAGCALGALLLLASL
          150       160       170       180       190       200    

      110       120       130        140       150       160       
pF1KA1 VNTSLTILLDNLIGSGLMAVASSTIGIVIF-GEILPQALCSRHGLAVGANTILLTKFFML
       ....:..::    :.  . .. .. :.:.. ::..: :. .:  ::..  .. :... .:
CCDS20 AQAALAVLLYRAAGQRAVPAVLGSAGLVFLVGEVVPAAVSGRWTLALAPRALGLSRLAVL
          210       220       230       240       250       260    

       170       180       190       200        210       220      
pF1KA1 LTFPLSFPISKLLDFFLGQEIRTVYNREKLMEMLKVT-EPYNDLVKEELNMIQGALELRT
       ::.:...:...::..      :    ::...:. .   .::.:: :       :.:  : 
CCDS20 LTLPVALPVGQLLEL----AARPGRLRERVLELARGGGDPYSDLSK-------GVL--RC
          270           280       290       300                310 

        230       240       250       260       270       280      
pF1KA1 KTVEDIMTQLQDCFMIRSDAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEDEQSNIVDILYVKDLAFV
       .::::..: :.::::. ....:::.... ::.::.:::::.:.:.:::::.::.::::::
CCDS20 RTVEDVLTPLEDCFMLDASTVLDFGVLASIMQSGHTRIPVYEEERSNIVDMLYLKDLAFV
             320       330       340       350       360       370 

        290       300       310       320       330       340      
pF1KA1 DPDDCTPLKTITRFYNHPVHFVFHDTKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQKVNNEGEGDPFYEV
       ::.:::::.:::::::::.::::.::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS20 DPEDCTPLSTITRFYNHPLHFVFNDTKLDAVLEEFKRGKSHLAIVQKVNNEGEGDPFYEV
             380       390       400       410       420       430 

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pF1KA1 LGLVTLEDVIEEIIKSEILDESDMYTDNRSRKRVSE-----KNKRDFSAFKDADNELKVK
       ::::::::::::::.:::::::. : :.  ... .      : :..:: :: .:.: :: 
CCDS20 LGLVTLEDVIEEIIRSEILDESEDYRDTVVKRKPASLMAPLKRKEEFSLFKVSDDEYKVT
             440       450       460       470       480       490 

             410       420       430       440       450       460 
pF1KA1 ISPQLLLAAHRFLATEVSQFSPSLISEKILLRLLKYPDVIQELKFDEHNKYYARHYLYTR
       ::::::::..:::. ::. :::  ::::.::.:::.:.: ::..::: :.  ..:::: :
CCDS20 ISPQLLLATQRFLSREVDVFSPLRISEKVLLHLLKHPSVNQEVRFDESNRLATHHYLYQR
             500       510       520       530       540       550 

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pF1KA1 NKPADYFILILQGKVEVEAGKENMKFETGAFSYYGTMALTSVPSDRSPAHPTPLSRSASL
       ..:.:::::::::.:::: :::..:::.:::.:::. ::: :::.   .: .:.:   ::
CCDS20 SQPVDYFILILQGRVEVEIGKEGLKFENGAFTYYGVSALT-VPSS---VHQSPVS---SL
             560       570       580       590           600       

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pF1KA1 SYPDRTDVSTAATLAGSSNQFGSSVLGQYISDFSVRALVDLQYIKITRQQYQNGLLASRM
       . : : :..      :....  ::.   :  :..:::: ::: ::.:: :: :.:::.: 
CCDS20 Q-PIRHDLQPDP---GDGTH--SSA---YCPDYTVRALSDLQLIKVTRLQYLNALLATRA
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pF1KA1 ENSPQFPIDGCTTHMENLAEKSELPVVDETTT-LLNERNSLLHKASHENAI         
       .: :: :            :...: :.  . : ::.:...    .::             
CCDS20 QNLPQSP------------ENTDLQVIPGSQTRLLGEKTTTAAGSSHSRPGVPVEGSPGR
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CCDS20 NPGV
           

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                                     .:: .  :::     .  : :   :  . :
CCDS20 GCREEAASPAGEWRALLRLRLRAEAVRPHSALLAVRVEPGGGAAEEAAPPWALGLGAAGL
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       :.:...  ::.:. .:: : :...... :.: ::  ::..:: :: ..  : .:::   :
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       ....:..::    :.  . .. .. :.:.. ::..: :. .:  ::..  .. :... .:
CCDS20 AQAALAVLLYRAAGQRAVPAVLGSAGLVFLVGEVVPAAVSGRWTLALAPRALGLSRLAVL
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       ::.:...:...::..      :    ::...:. .   .::.:: :       :.:  : 
CCDS20 LTLPVALPVGQLLEL----AARPGRLRERVLELARGGGDPYSDLSK-------GVL--RC
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       .::::..: :.::::. ....:::.... ::.::.:::::.:.:.:::::.::.::::::
CCDS20 RTVEDVLTPLEDCFMLDASTVLDFGVLASIMQSGHTRIPVYEEERSNIVDMLYLKDLAFV
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CCDS20 DPEDCTPLSTITRFYNHPLHFVFNDTKLDAVLEEFKRGDT---VVKR-------KPASLM
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CCDS20 APL---------------------------------KRKEEFSLFKVSDDEYKVTISPQL
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CCDS20 YFILILQGRVEVEIGKEGLKFENGAFTYYGVSALT-VPSS---VHQSPVS---SLQ-PIR
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CCDS20 HDLQPDP---GDGTH--SSA---YCPDYTVRALSDLQLIKVTRLQYLNALLATRAQNLPQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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