seq1 = pF1KA1477.tfa, 2274 bp seq2 = pF1KA1477/gi568815597f_220428823.tfa (gi568815597f:220428823_220762163), 333341 bp >pF1KA1477 2274 >gi568815597f:220428823_220762163 (Chr1) 1-51 (100001-100051) 100% -> 52-255 (150532-150735) 100% -> 256-309 (152243-152296) 100% -> 310-358 (169509-169557) 100% -> 359-429 (175245-175315) 100% -> 430-486 (187117-187173) 100% -> 487-723 (189488-189724) 100% -> 724-843 (189814-189933) 100% -> 844-943 (202213-202312) 100% -> 944-1056 (203379-203491) 100% -> 1057-1210 (206554-206707) 100% -> 1211-1404 (207011-207204) 100% -> 1405-1505 (221798-221898) 100% -> 1506-1670 (223164-223328) 100% -> 1671-1922 (224279-224530) 100% -> 1923-2274 (232990-233341) 99% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGTCGGCCCGGACGCCATTGCCGACGGTGAACGAGCGGGACACGGAAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGTCGGCCCGGACGCCATTGCCGACGGTGAACGAGCGGGACACGGAAAA 50 . : . : . : . : . : 51 T CATACATCTGTGGATGGATATACTGAACCACACATCCAGC |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 TGTG...TAGCATACATCTGTGGATGGATATACTGAACCACACATCCAGC 100 . : . : . : . : . : 92 CTACCAAGTCGAGTAGCAGACAGAACATCCCCCGGTGTAGAAACTCCATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 150572 CTACCAAGTCGAGTAGCAGACAGAACATCCCCCGGTGTAGAAACTCCATT 150 . : . : . : . : . : 142 ACGTCAGCAACAGATGAACAGCCTCACATTGGAAATTACCGTTTACAAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 150622 ACGTCAGCAACAGATGAACAGCCTCACATTGGAAATTACCGTTTACAAAA 200 . : . : . : . : . : 192 AACAATAGGGAAGGGAAATTTTGCCAAAGTCAAATTGGCAAGACACGTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 150672 AACAATAGGGAAGGGAAATTTTGCCAAAGTCAAATTGGCAAGACACGTTC 250 . : . : . : . : . : 242 TAACTGGTAGAGAG GTTGCTGTGAAAATAATAGACAAAACT ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 150722 TAACTGGTAGAGAGGTA...TAGGTTGCTGTGAAAATAATAGACAAAACT 300 . : . : . : . : . : 283 CAGCTAAATCCTACCAGTCTACAAAAG TTATTTCGAGAAGT |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 152270 CAGCTAAATCCTACCAGTCTACAAAAGGTA...CAGTTATTTCGAGAAGT 350 . : . : . : . : . : 324 ACGAATAATGAAGATACTGAATCATCCTAATATAG GTGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 169523 ACGAATAATGAAGATACTGAATCATCCTAATATAGGTA...CAGGTGAAG 400 . : . : . : . : . : 365 TATTTGATTACTTAGTTGCCCATGGAAGAATGAAAGAGAAAGAGGCCCGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 175251 TATTTGATTACTTAGTTGCCCATGGAAGAATGAAAGAGAAAGAGGCCCGT 450 . : . : . : . : . : 415 GCAAAATTTAGGCAG ATTGTATCTGCTGTACAGTATTGTCA |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 175301 GCAAAATTTAGGCAGGTA...CAGATTGTATCTGCTGTACAGTATTGTCA 500 . : . : . : . : . : 456 TCAAAAGTACATTGTTCACCGTGATCTTAAG GCTGAAAACC |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 187143 TCAAAAGTACATTGTTCACCGTGATCTTAAGGTA...TAGGCTGAAAACC 550 . : . : . : . : . : 497 TTCTCCTTGATGGTGATATGAATATTAAAATTGCTGACTTTGGTTTTAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 189498 TTCTCCTTGATGGTGATATGAATATTAAAATTGCTGACTTTGGTTTTAGT 600 . : . : . : . : . : 547 AATGAATTTACAGTTGGGAACAAATTGGACACATTTTGTGGAAGCCCACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 189548 AATGAATTTACAGTTGGGAACAAATTGGACACATTTTGTGGAAGCCCACC 650 . : . : . : . : . : 597 CTATGCTGCTCCCGAGCTTTTCCAAGGAAAGAAGTATGATGGGCCTGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 189598 CTATGCTGCTCCCGAGCTTTTCCAAGGAAAGAAGTATGATGGGCCTGAAG 700 . : . : . : . : . : 647 TGGATGTGTGGAGTCTGGGCGTCATTCTCTATACATTAGTCAGTGGCTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 189648 TGGATGTGTGGAGTCTGGGCGTCATTCTCTATACATTAGTCAGTGGCTCC 750 . : . : . : . : . : 697 TTGCCTTTCGATGGCCAGAATTTAAAG GAACTGCGAGAGCG |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 189698 TTGCCTTTCGATGGCCAGAATTTAAAGGTA...AAGGAACTGCGAGAGCG 800 . : . : . : . : . : 738 AGTTTTACGAGGGAAGTACCGTATTCCCTTCTATATGTCCACAGACTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 189828 AGTTTTACGAGGGAAGTACCGTATTCCCTTCTATATGTCCACAGACTGTG 850 . : . : . : . : . : 788 AAAATCTTCTGAAGAAATTATTAGTCCTGAATCCAATAAAGAGAGGCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 189878 AAAATCTTCTGAAGAAATTATTAGTCCTGAATCCAATAAAGAGAGGCAGC 900 . : . : . : . : . : 838 TTGGAA CAAATAATGAAAGATCGATGGATGAATGTTGGTCA ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 189928 TTGGAAGTA...TAGCAAATAATGAAAGATCGATGGATGAATGTTGGTCA 950 . : . : . : . : . : 879 TGAAGAGGAAGAACTAAAGCCATATACTGAGCCTGATCCGGATTTCAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 202248 TGAAGAGGAAGAACTAAAGCCATATACTGAGCCTGATCCGGATTTCAATG 1000 . : . : . : . : . : 929 ACACAAAAAGAATAG ACATTATGGTCACCATGGGCTTTGCA |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 202298 ACACAAAAAGAATAGGTA...TAGACATTATGGTCACCATGGGCTTTGCA 1050 . : . : . : . : . : 970 CGAGATGAAATAAATGATGCCTTAATAAATCAGAAGTATGATGAAGTTAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 203405 CGAGATGAAATAAATGATGCCTTAATAAATCAGAAGTATGATGAAGTTAT 1100 . : . : . : . : . : 1020 GGCTACTTATATTCTTCTAGGTAGAAAACCACCTGAA TTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 203455 GGCTACTTATATTCTTCTAGGTAGAAAACCACCTGAAGTA...TAGTTTG 1150 . : . : . : . : . : 1061 AAGGTGGTGAATCGTTATCCAGTGGAAACTTGTGTCAGAGGTCCCGGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 206558 AAGGTGGTGAATCGTTATCCAGTGGAAACTTGTGTCAGAGGTCCCGGCCC 1200 . : . : . : . : . : 1111 AGTAGTGACTTAAACAACAGCACTCTTCAGTCCCCTGCTCACCTGAAGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 206608 AGTAGTGACTTAAACAACAGCACTCTTCAGTCCCCTGCTCACCTGAAGGT 1250 . : . : . : . : . : 1161 CCAGAGAAGTATCTCAGCAAATCAGAAGCAGCGGCGTTTCAGTGATCATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 206658 CCAGAGAAGTATCTCAGCAAATCAGAAGCAGCGGCGTTTCAGTGATCATG 1300 . : . : . : . : . : 1211 CTGGTCCATCCATTCCTCCTGCTGTATCATATACCAAAAGA >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 206708 GTA...TAGCTGGTCCATCCATTCCTCCTGCTGTATCATATACCAAAAGA 1350 . : . : . : . : . : 1252 CCTCAGGCTAACAGTGTGGAAAGTGAACAGAAAGAGGAGTGGGACAAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 207052 CCTCAGGCTAACAGTGTGGAAAGTGAACAGAAAGAGGAGTGGGACAAAGA 1400 . : . : . : . : . : 1302 TGTGGCTCGAAAACTTGGCAGCACAACAGTTGGATCAAAAAGCGAGATGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 207102 TGTGGCTCGAAAACTTGGCAGCACAACAGTTGGATCAAAAAGCGAGATGA 1450 . : . : . : . : . : 1352 CTGCAAGCCCTCTTGTAGGGCCAGAGAGGAAAAAATCTTCAACTATTCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 207152 CTGCAAGCCCTCTTGTAGGGCCAGAGAGGAAAAAATCTTCAACTATTCCA 1500 . : . : . : . : . : 1402 AGT AACAATGTGTATTCTGGAGGTAGCATGGCAAGAAGGAA |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 207202 AGTGTG...AAGAACAATGTGTATTCTGGAGGTAGCATGGCAAGAAGGAA 1550 . : . : . : . : . : 1443 TACATATGTCTGTGAAAGGACCACAGATCGATACGTAGCATTGCAGAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 221836 TACATATGTCTGTGAAAGGACCACAGATCGATACGTAGCATTGCAGAATG 1600 . : . : . : . : . : 1493 GAAAAGACAGCAG CCTTACGGAGATGTCTGTGAGTAGCATA |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 221886 GAAAAGACAGCAGGTA...AAGCCTTACGGAGATGTCTGTGAGTAGCATA 1650 . : . : . : . : . : 1534 TCTTCTGCAGGCTCTTCTGTGGCCTCTGCTGTCCCCTCAGCACGACCCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 223192 TCTTCTGCAGGCTCTTCTGTGGCCTCTGCTGTCCCCTCAGCACGACCCCG 1700 . : . : . : . : . : 1584 CCACCAGAAGTCCATGTCCACTTCTGGTCATCCTATTAAAGTCACACTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 223242 CCACCAGAAGTCCATGTCCACTTCTGGTCATCCTATTAAAGTCACACTGC 1750 . : . : . : . : . : 1634 CAACCATTAAAGACGGCTCTGAAGCTTACCGGCCTGG TACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 223292 CAACCATTAAAGACGGCTCTGAAGCTTACCGGCCTGGGTA...CAGTACA 1800 . : . : . : . : . : 1675 ACCCAGAGAGTGCCTGCTGCTTCCCCATCTGCTCACAGTATTAGTACTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 224283 ACCCAGAGAGTGCCTGCTGCTTCCCCATCTGCTCACAGTATTAGTACTGC 1850 . : . : . : . : . : 1725 GACTCCAGACCGGACCCGTTTTCCCCGAGGGAGCTCAAGCCGAAGCACTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 224333 GACTCCAGACCGGACCCGTTTTCCCCGAGGGAGCTCAAGCCGAAGCACTT 1900 . : . : . : . : . : 1775 TCCATGGTGAACAGCTCCGGGAGCGACGCAGCGTTGCTTATAATGGGCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 224383 TCCATGGTGAACAGCTCCGGGAGCGACGCAGCGTTGCTTATAATGGGCCA 1950 . : . : . : . : . : 1825 CCTGCTTCACCATCCCATGAAACGGGTGCATTTGCACATGCCAGAAGGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 224433 CCTGCTTCACCATCCCATGAAACGGGTGCATTTGCACATGCCAGAAGGGG 2000 . : . : . : . : . : 1875 AACGTCAACTGGTATAATAAGCAAAATCACATCCAAATTTGTTCGCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 224483 AACGTCAACTGGTATAATAAGCAAAATCACATCCAAATTTGTTCGCAGGT 2050 . : . : . : . : . : 1923 AAGTACATCAGGGGAACCAAAAGAAAGAGACAAGGAAGAGGGT >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 224533 C...CAGAAGTACATCAGGGGAACCAAAAGAAAGAGACAAGGAAGAGGGT 2100 . : . : . : . : . : 1966 AAAGATTCTAAGCCGCGTTCTTTGCGGTTCACATGGAGTATGAAGACCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 233033 AAAGATTCTAAGCCGCGTTCTTTGCGGTTCACATGGAGTATGAAGACCAC 2150 . : . : . : . : . : 2016 TAGTTCAATGGACCCTAATGACATGATGAGAGAAATCCGAAAAGTGTTAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 233083 TAGTTCAATGGACCCTAATGACATGATGAGAGAAATCCGAAAAGTGTTAG 2200 . : . : . : . : . : 2066 ATGCAAATAACTGTGATTATGAGCAAAAAGAGAGATTTTTGCTTTTCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 233133 ATGCAAATAACTGTGATTATGAGCAAAAAGAGAGATTTTTGCTTTTCTGT 2250 . : . : . : . : . : 2116 GTCCATGGAGACGCTAGACAGGATAGCCTCGTGCAGTGGGAGATGGAAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 233183 GTCCATGGAGACGCTAGACAGGATAGCCTCGTGCAGTGGGAGATGGAAGT 2300 . : . : . : . : . : 2166 CTGCAAGTTGCCACGACTGTCACTTAATGGGGTTCGCTTCAAGCGAATAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 233233 CTGCAAGTTGCCACGACTGTCACTTAATGGGGTTCGCTTCAAGCGAATAT 2350 . : . : . : . : . : 2216 CTGGGACATCTATTGCCTTTAAGAACATTGCATCAAAAATAGCAAATGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 233283 CTGGGACATCTATTGCCTTTAAGAACATTGCATCAAAAATAGCAAATGAG 2400 . 2266 CTTATGCTG |||| |||| 233333 CTTAAGCTG