Result of FASTA (omim) for pF1KA1469
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1469, 649 aa
  1>>>pF1KA1469 649 - 649 aa - 649 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0756+/-0.000551; mu= 15.7535+/- 0.034
 mean_var=122.7028+/-25.121, 0's: 0 Z-trim(110.7): 415  B-trim: 904 in 1/53
 Lambda= 0.115784
 statistics sampled from 18580 (19089) to 18580 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.224), width:  16
 Scan time:  8.230

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_037413 (OMIM: 604808,615271) leucine-rich repea ( 649) 4311 732.6 1.1e-210
XP_011527506 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leuc ( 649) 4311 732.6 1.1e-210
XP_011527507 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leuc ( 649) 4311 732.6 1.1e-210
NP_938205 (OMIM: 604808,615271) leucine-rich repea ( 649) 4311 732.6 1.1e-210
XP_005260739 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leuc ( 649) 4311 732.6 1.1e-210
XP_011543185 (OMIM: 604806) PREDICTED: leucine-ric ( 674) 2479 426.6 1.4e-118
NP_037412 (OMIM: 604806) leucine-rich repeat trans ( 674) 2479 426.6 1.4e-118
XP_005273918 (OMIM: 604806) PREDICTED: leucine-ric ( 674) 2479 426.6 1.4e-118
XP_005267547 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
XP_016876619 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
NP_001333074 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
NP_001333075 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
NP_001333073 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
XP_016876620 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
XP_016876624 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
XP_016876622 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
XP_016876621 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
NP_037363 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat trans ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
XP_016876618 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
XP_011534913 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
NP_001333072 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
XP_016876623 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
NP_001128217 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat tr ( 590)  457 88.8 6.2e-17
NP_001269853 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat tr ( 590)  457 88.8 6.2e-17
NP_001317299 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat tr ( 591)  457 88.8 6.2e-17
NP_079269 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat trans ( 518)  456 88.5 6.3e-17
NP_001269857 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat tr ( 519)  456 88.5 6.3e-17
XP_011538979 (OMIM: 608661) PREDICTED: podocan iso ( 402)  436 85.1 5.4e-16
XP_005270514 (OMIM: 608661) PREDICTED: podocan iso ( 613)  436 85.3 7.2e-16
NP_001186009 (OMIM: 608661) podocan isoform 2 [Hom ( 642)  436 85.3 7.5e-16
NP_001186010 (OMIM: 608661) podocan isoform 2 [Hom ( 642)  436 85.3 7.5e-16
XP_016855783 (OMIM: 608661) PREDICTED: podocan iso ( 652)  436 85.3 7.6e-16
NP_714914 (OMIM: 608661) podocan isoform 1 [Homo s ( 661)  436 85.3 7.6e-16
NP_071426 (OMIM: 610486) leucine-rich repeat-conta ( 653)  421 82.8 4.3e-15
XP_011514763 (OMIM: 610486) PREDICTED: leucine-ric ( 653)  421 82.8 4.3e-15
XP_016867994 (OMIM: 610486) PREDICTED: leucine-ric ( 653)  421 82.8 4.3e-15
NP_002014 (OMIM: 600245) fibromodulin precursor [H ( 376)  400 79.1 3.3e-14
XP_005269337 (OMIM: 603104) PREDICTED: carboxypept ( 545)  401 79.4 3.8e-14
NP_001073982 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N sub ( 545)  401 79.4 3.8e-14
NP_001278917 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N sub ( 545)  401 79.4 3.8e-14
XP_016873562 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640)  392 77.9 1.2e-13
XP_011518545 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640)  392 77.9 1.2e-13
XP_016873559 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640)  392 77.9 1.2e-13
XP_011518544 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640)  392 77.9 1.2e-13
XP_016873560 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640)  392 77.9 1.2e-13
XP_011518543 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640)  392 77.9 1.2e-13
XP_011518540 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640)  392 77.9 1.2e-13
XP_016873563 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640)  392 77.9 1.2e-13
XP_016873561 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640)  392 77.9 1.2e-13
XP_016873568 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640)  392 77.9 1.2e-13


>>NP_037413 (OMIM: 604808,615271) leucine-rich repeat tr  (649 aa)
 initn: 4311 init1: 4311 opt: 4311  Z-score: 3903.7  bits: 732.6 E(85289): 1.1e-210
Smith-Waterman score: 4311; 100.0% identity (100.0% similar) in 649 aa overlap (1-649:1-649)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640         
pF1KA1 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
              610       620       630       640         

>>XP_011527506 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leucine-  (649 aa)
 initn: 4311 init1: 4311 opt: 4311  Z-score: 3903.7  bits: 732.6 E(85289): 1.1e-210
Smith-Waterman score: 4311; 100.0% identity (100.0% similar) in 649 aa overlap (1-649:1-649)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
              490       500       510       520       530       540

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pF1KA1 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
              550       560       570       580       590       600

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pF1KA1 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
              610       620       630       640         

>>XP_011527507 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leucine-  (649 aa)
 initn: 4311 init1: 4311 opt: 4311  Z-score: 3903.7  bits: 732.6 E(85289): 1.1e-210
Smith-Waterman score: 4311; 100.0% identity (100.0% similar) in 649 aa overlap (1-649:1-649)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
               10        20        30        40        50        60

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pF1KA1 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
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pF1KA1 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
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pF1KA1 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
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pF1KA1 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
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pF1KA1 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
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pF1KA1 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
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pF1KA1 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
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pF1KA1 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
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pF1KA1 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
              610       620       630       640         

>>NP_938205 (OMIM: 604808,615271) leucine-rich repeat tr  (649 aa)
 initn: 4311 init1: 4311 opt: 4311  Z-score: 3903.7  bits: 732.6 E(85289): 1.1e-210
Smith-Waterman score: 4311; 100.0% identity (100.0% similar) in 649 aa overlap (1-649:1-649)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
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pF1KA1 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
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              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
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pF1KA1 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
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pF1KA1 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
              310       320       330       340       350       360

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pF1KA1 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
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              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
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pF1KA1 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640         
pF1KA1 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
              610       620       630       640         

>>XP_005260739 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leucine-  (649 aa)
 initn: 4311 init1: 4311 opt: 4311  Z-score: 3903.7  bits: 732.6 E(85289): 1.1e-210
Smith-Waterman score: 4311; 100.0% identity (100.0% similar) in 649 aa overlap (1-649:1-649)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
               70        80        90       100       110       120

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pF1KA1 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
              130       140       150       160       170       180

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pF1KA1 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
              190       200       210       220       230       240

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pF1KA1 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
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pF1KA1 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
              310       320       330       340       350       360

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pF1KA1 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
              370       380       390       400       410       420

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pF1KA1 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
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pF1KA1 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
              490       500       510       520       530       540

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pF1KA1 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
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pF1KA1 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
              610       620       630       640         

>>XP_011543185 (OMIM: 604806) PREDICTED: leucine-rich re  (674 aa)
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pF1KA1                          MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVC
                                     : .::    :... .:    . . .:::::
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pF1KA1 RCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSL
       ::: :::::::: :::::. ::.::::::::::::::::::.:::. ..:. ::::.:.:
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pF1KA1 DEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNY
       :::: :::. ..:::::.::.:::. :::..:: ::.:::::::::.::::: :: ::. 
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       :.::::::::::.:: :::.:.:::::::::::::   ...::.::.::::::::: :. 
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pF1KA1 LGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYR
       ..: .:  : ::::::::::::.: :.:::...:.::::::: :...: :... .:.: :
XP_011 IADDTFSRLQNLTELSLVRNSLAAPPLNLPSAHLQKLYLQDNAISHIPYNTLAKMRELER
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pF1KA1 LDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQ
       ::.:::::..::.:.:::: :..::.::::::.:::.. :.:::...  . :::::::::
XP_011 LDLSNNNLTTLPRGLFDDLGNLAQLLLRNNPWFCGCNLMWLRDWVKARAAVVNVRGLMCQ
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pF1KA1 APEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSG----IVSTIQITTAIPN-TVYPAQGQWPAPVTKQPD
       .:::::::::::...:. .: ..:    ....   :::  . ..   ::.  .  .:.: 
XP_011 GPEKVRGMAIKDITSEMDECFETGPQGGVANAAAKTTASNHASATTPQGSLFTLKAKRPG
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pF1KA1 IKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFG
       .. :  . :.  . . . ::..: ::..:.:.:.:.:: .:: ...:::::.:::::: :
XP_011 LRLPDSNIDYPMATGDGAKTLAIHVKALTADSIRITWKATLPASSFRLSWLRLGHSPAVG
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pF1KA1 SITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPT
       :::::.: :...:::.::::: : : .::: ::::: :. :::::: ..:::    :.::
XP_011 SITETLVQGDKTEYLLTALEPKSTYIICMVTMETSNAYVADETPVCAKAETAD--SYGPT
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pF1KA1 TTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALVTIAL-LALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGR
       ::::.::.  :.   .::::.::::::::: . : :. .:::::. : :..:. ::..: 
XP_011 TTLNQEQNAGPMA--SLPLAGIIGGAVALVFLFLVLGAICWYVHQAGELLTRERAYNRGS
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pF1KA1 RRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPISNEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSE
       :.:::: :.::::::::::::  ..::::: :   .:::.:.::::: :: .: : .:. 
XP_011 RKKDDYMESGTKKDNSILEIRGPGLQMLPI-NPYRAKEEYVVHTIFPSNGSSLCKATHTI
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pF1KA1 S-SSNRSYRDSGIPDSDHSHS
       . ...:.:::.:::: :.:..
XP_011 GYGTTRGYRDGGIPDIDYSYT
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>>NP_037412 (OMIM: 604806) leucine-rich repeat transmemb  (674 aa)
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Smith-Waterman score: 2479; 58.7% identity (82.2% similar) in 651 aa overlap (6-649:34-674)

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pF1KA1                          MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVC
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NP_037 AHPTATATTTPTATVTATVVMTTATMDLRDW-LFLCYGLIAFLTEV----IDSTTCPSVC
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pF1KA1 RCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSL
       ::: :::::::: :::::. ::.::::::::::::::::::.:::. ..:. ::::.:.:
NP_037 RCDNGFIYCNDRGLTSIPADIPDDATTLYLQNNQINNAGIPQDLKTKVNVQVIYLYENDL
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pF1KA1 DEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNY
       :::: :::. ..:::::.::.:::. :::..:: ::.:::::::::.::::: :: ::. 
NP_037 DEFPINLPRSLRELHLQDNNVRTIARDSLARIPLLEKLHLDDNSVSTVSIEEDAFADSKQ
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pF1KA1 LRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHG
       :.::::::::::.:: :::.:.:::::::::::::   ...::.::.::::::::: :. 
NP_037 LKLLFLSRNHLSSIPSGLPHTLEELRLDDNRISTIPLHAFKGLNSLRRLVLDGNLLANQR
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pF1KA1 LGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYR
       ..: .:  : ::::::::::::.: :.:::...:.::::::: :...: :... .:.: :
NP_037 IADDTFSRLQNLTELSLVRNSLAAPPLNLPSAHLQKLYLQDNAISHIPYNTLAKMRELER
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pF1KA1 LDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQ
       ::.:::::..::.:.:::: :..::.::::::.:::.. :.:::...  . :::::::::
NP_037 LDLSNNNLTTLPRGLFDDLGNLAQLLLRNNPWFCGCNLMWLRDWVKARAAVVNVRGLMCQ
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pF1KA1 APEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSG----IVSTIQITTAIPN-TVYPAQGQWPAPVTKQPD
       .:::::::::::...:. .: ..:    ....   :::  . ..   ::.  .  .:.: 
NP_037 GPEKVRGMAIKDITSEMDECFETGPQGGVANAAAKTTASNHASATTPQGSLFTLKAKRPG
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pF1KA1 IKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFG
       .. :  . :.  . . . ::..: ::..:.:.:.:.:: .:: ...:::::.:::::: :
NP_037 LRLPDSNIDYPMATGDGAKTLAIHVKALTADSIRITWKATLPASSFRLSWLRLGHSPAVG
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pF1KA1 SITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPT
       :::::.: :...:::.::::: : : .::: ::::: :. :::::: ..:::    :.::
NP_037 SITETLVQGDKTEYLLTALEPKSTYIICMVTMETSNAYVADETPVCAKAETAD--SYGPT
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pF1KA1 TTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALVTIAL-LALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGR
       ::::.::.  :.   .::::.::::::::: . : :. .:::::. : :..:. ::..: 
NP_037 TTLNQEQNAGPMA--SLPLAGIIGGAVALVFLFLVLGAICWYVHQAGELLTRERAYNRGS
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pF1KA1 RRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPISNEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSE
       :.:::: :.::::::::::::  ..::::: :   .:::.:.::::: :: .: : .:. 
NP_037 RKKDDYMESGTKKDNSILEIRGPGLQMLPI-NPYRAKEEYVVHTIFPSNGSSLCKATHTI
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     630        640         
pF1KA1 S-SSNRSYRDSGIPDSDHSHS
       . ...:.:::.:::: :.:..
NP_037 GYGTTRGYRDGGIPDIDYSYT
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>>XP_005273918 (OMIM: 604806) PREDICTED: leucine-rich re  (674 aa)
 initn: 2568 init1: 1535 opt: 2479  Z-score: 2249.7  bits: 426.6 E(85289): 1.4e-118
Smith-Waterman score: 2479; 58.7% identity (82.2% similar) in 651 aa overlap (6-649:34-674)

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pF1KA1                          MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVC
                                     : .::    :... .:    . . .:::::
XP_005 AHPTATATTTPTATVTATVVMTTATMDLRDW-LFLCYGLIAFLTEV----IDSTTCPSVC
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pF1KA1 RCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSL
       ::: :::::::: :::::. ::.::::::::::::::::::.:::. ..:. ::::.:.:
XP_005 RCDNGFIYCNDRGLTSIPADIPDDATTLYLQNNQINNAGIPQDLKTKVNVQVIYLYENDL
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pF1KA1 DEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNY
       :::: :::. ..:::::.::.:::. :::..:: ::.:::::::::.::::: :: ::. 
XP_005 DEFPINLPRSLRELHLQDNNVRTIARDSLARIPLLEKLHLDDNSVSTVSIEEDAFADSKQ
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pF1KA1 LRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHG
       :.::::::::::.:: :::.:.:::::::::::::   ...::.::.::::::::: :. 
XP_005 LKLLFLSRNHLSSIPSGLPHTLEELRLDDNRISTIPLHAFKGLNSLRRLVLDGNLLANQR
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pF1KA1 LGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYR
       ..: .:  : ::::::::::::.: :.:::...:.::::::: :...: :... .:.: :
XP_005 IADDTFSRLQNLTELSLVRNSLAAPPLNLPSAHLQKLYLQDNAISHIPYNTLAKMRELER
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pF1KA1 LDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQ
       ::.:::::..::.:.:::: :..::.::::::.:::.. :.:::...  . :::::::::
XP_005 LDLSNNNLTTLPRGLFDDLGNLAQLLLRNNPWFCGCNLMWLRDWVKARAAVVNVRGLMCQ
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pF1KA1 APEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSG----IVSTIQITTAIPN-TVYPAQGQWPAPVTKQPD
       .:::::::::::...:. .: ..:    ....   :::  . ..   ::.  .  .:.: 
XP_005 GPEKVRGMAIKDITSEMDECFETGPQGGVANAAAKTTASNHASATTPQGSLFTLKAKRPG
      360       370       380       390       400       410        

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pF1KA1 IKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFG
       .. :  . :.  . . . ::..: ::..:.:.:.:.:: .:: ...:::::.:::::: :
XP_005 LRLPDSNIDYPMATGDGAKTLAIHVKALTADSIRITWKATLPASSFRLSWLRLGHSPAVG
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pF1KA1 SITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPT
       :::::.: :...:::.::::: : : .::: ::::: :. :::::: ..:::    :.::
XP_005 SITETLVQGDKTEYLLTALEPKSTYIICMVTMETSNAYVADETPVCAKAETAD--SYGPT
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pF1KA1 TTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALVTIAL-LALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGR
       ::::.::.  :.   .::::.::::::::: . : :. .:::::. : :..:. ::..: 
XP_005 TTLNQEQNAGPMA--SLPLAGIIGGAVALVFLFLVLGAICWYVHQAGELLTRERAYNRGS
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pF1KA1 RRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPISNEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSE
       :.:::: :.::::::::::::  ..::::: :   .:::.:.::::: :: .: : .:. 
XP_005 RKKDDYMESGTKKDNSILEIRGPGLQMLPI-NPYRAKEEYVVHTIFPSNGSSLCKATHTI
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     630        640         
pF1KA1 S-SSNRSYRDSGIPDSDHSHS
       . ...:.:::.:::: :.:..
XP_005 GYGTTRGYRDGGIPDIDYSYT
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>>XP_005267547 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-rich re  (660 aa)
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pF1KA1 IPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHL
       .: :::: .:.:::.::::::::.:..:.:. .:. .::: :.::::: :::: :. :::
XP_005 VPLGIPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLPKNVRVLHL
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pF1KA1 QENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPW
       :::::.::.  .:...  ::::::::::.:.:..:.::::..  :.:::::.::::..: 
XP_005 QENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPV
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pF1KA1 GLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELS
       :::  ..:::.:.:::..::. ..:.::::.::..:::::.:.:... .: .:..: :.:
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pF1KA1 LVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIF
       .:::::.  : .::::.: .::::::.::..: .::: ::.: :::.:::.:  : ::.:
XP_005 IVRNSLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRMLTQGVF
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pF1KA1 DDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAE
       :.:.:. ::  :::::.: :..::: .::. .: ..::::.:::.::.:::::...:: .
XP_005 DNLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMN
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pF1KA1 LFDCKDS--GIV------STIQITTAIPNTVYPAQGQW---PAPVT-KQPDIKNPKLTKD
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XP_005 LLSCPTTTPGLPLFTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTI--PDWDGR
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pF1KA1 HQTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTG
       ...:  :  . : .... :.. .:..::   . . : .:.:.:.::: . : . : ::.:
XP_005 ERVT-PPISERIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQERIVSG
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pF1KA1 ERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEK
       :...  .. ::: : :..:.::... :    ..: .: :. :    . : ..: . ... 
XP_005 EKQHLSLVNLEPRSTYRICLVPLDAFNYRAVEDT-ICSEATTHASYLNNGSNTASSHEQT
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pF1KA1 EPYK--NPNLPLAAIIGGAVALVTIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAE
         ..  .: : ::..::::: .: ..::.. ::..:..:   :..  :..::: :::: :
XP_005 TSHSMGSPFL-LAGLIGGAVIFVLVVLLSVFCWHMHKKGRYTSQKWKYNRGRR-KDDYCE
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pF1KA1 AGTKKDNSILEIRETSFQMLPISNEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYR
       :::::::::::. :::::.. ..:. . : .: .. :. :::   : . :    .:  : 
XP_005 AGTKKDNSILEMTETSFQIVSLNNDQLLKGDFRLQPIYTPNGGINYTDCHIP--NNMRYC
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pF1KA1 DSGIPDSDHSHS
       .:..:: .: :.
XP_005 NSSVPDLEHCHT
      650       660

>>XP_016876619 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-rich re  (660 aa)
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Smith-Waterman score: 1989; 47.3% identity (75.3% similar) in 649 aa overlap (15-649:24-660)

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pF1KA1          MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTS
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XP_016 MGLQTTKWPSHGAFFLKSWLIISLGLYSQVSKL--LA--CPSVCRCDRNFVYCNERSLTS
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pF1KA1 IPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHL
       .: :::: .:.:::.::::::::.:..:.:. .:. .::: :.::::: :::: :. :::
XP_016 VPLGIPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLPKNVRVLHL
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pF1KA1 QENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPW
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XP_016 QENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPV
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pF1KA1 GLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELS
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pF1KA1 LVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIF
       .:::::.  : .::::.: .::::::.::..: .::: ::.: :::.:::.:  : ::.:
XP_016 IVRNSLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRMLTQGVF
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pF1KA1 DDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAE
       :.:.:. ::  :::::.: :..::: .::. .: ..::::.:::.::.:::::...:: .
XP_016 DNLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMN
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pF1KA1 LFDCKDS--GIV------STIQITTAIPNTVYPAQGQW---PAPVT-KQPDIKNPKLTKD
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XP_016 LLSCPTTTPGLPLFTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTI--PDWDGR
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pF1KA1 HQTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTG
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XP_016 ERVT-PPISERIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQERIVSG
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pF1KA1 ERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEK
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XP_016 EKQHLSLVNLEPRSTYRICLVPLDAFNYRAVEDT-ICSEATTHASYLNNGSNTASSHEQT
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pF1KA1 EPYK--NPNLPLAAIIGGAVALVTIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAE
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XP_016 TSHSMGSPFL-LAGLIGGAVIFVLVVLLSVFCWHMHKKGRYTSQKWKYNRGRR-KDDYCE
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pF1KA1 AGTKKDNSILEIRETSFQMLPISNEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYR
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pF1KA1 DSGIPDSDHSHS
       .:..:: .: :.
XP_016 NSSVPDLEHCHT
      650       660




649 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Wed Nov  2 21:13:57 2016 done: Wed Nov  2 21:13:58 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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