Result of FASTA (ccds) for pF1KA1469
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1469, 649 aa
  1>>>pF1KA1469 649 - 649 aa - 649 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7812+/-0.00129; mu= 17.3542+/- 0.078
 mean_var=107.3470+/-21.264, 0's: 0 Z-trim(103.8): 193  B-trim: 96 in 1/49
 Lambda= 0.123788
 statistics sampled from 7360 (7577) to 7360 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.233), width:  16
 Scan time:  2.900

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13121.1 FLRT3 gene_id:23767|Hs108|chr20        ( 649) 4311 781.7       0
CCDS8057.1 FLRT1 gene_id:23769|Hs108|chr11         ( 674) 2479 454.6 2.1e-127
CCDS9877.1 FLRT2 gene_id:23768|Hs108|chr14         ( 660) 1684 312.6 1.1e-84
CCDS46346.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2        ( 590)  457 93.4 9.5e-19
CCDS82475.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2        ( 591)  457 93.4 9.5e-19
CCDS46347.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2        ( 518)  456 93.2 9.8e-19
CCDS74530.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2        ( 519)  456 93.2 9.8e-19
CCDS55601.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1         ( 519)  436 89.6 1.2e-17
CCDS55602.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1         ( 642)  436 89.7 1.4e-17
CCDS573.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1           ( 661)  436 89.7 1.4e-17
CCDS5799.1 LRRC4 gene_id:64101|Hs108|chr7          ( 653)  421 87.0 8.8e-17
CCDS30976.1 FMOD gene_id:2331|Hs108|chr1           ( 376)  400 83.0   8e-16
CCDS33920.1 CPN2 gene_id:1370|Hs108|chr3           ( 545)  401 83.4 9.2e-16
CCDS42595.1 LRRC4B gene_id:94030|Hs108|chr19       ( 713)  399 83.1 1.4e-15
CCDS54226.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19       ( 510)  395 82.3 1.8e-15
CCDS12300.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19       ( 512)  395 82.3 1.8e-15
CCDS31464.1 LRRC4C gene_id:57689|Hs108|chr11       ( 640)  392 81.8 3.1e-15
CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3        ( 581)  379 79.5 1.5e-14
CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3       ( 587)  379 79.5 1.5e-14
CCDS56578.1 ECM2 gene_id:1842|Hs108|chr9           ( 643)  378 79.3 1.8e-14
CCDS6698.1 ECM2 gene_id:1842|Hs108|chr9            ( 699)  378 79.4 1.9e-14
CCDS9037.1 KERA gene_id:11081|Hs108|chr12          ( 352)  365 76.8 5.8e-14
CCDS9465.1 SLITRK5 gene_id:26050|Hs108|chr13       ( 958)  365 77.2 1.2e-13
CCDS12130.1 LRG1 gene_id:116844|Hs108|chr19        ( 347)  359 75.7 1.2e-13
CCDS54225.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19       ( 421)  359 75.8 1.4e-13
CCDS9039.1 DCN gene_id:1634|Hs108|chr12            ( 359)  356 75.2 1.8e-13
CCDS31726.1 LRTM2 gene_id:654429|Hs108|chr12       ( 370)  349 73.9 4.3e-13
CCDS41903.1 SLITRK6 gene_id:84189|Hs108|chr13      ( 841)  349 74.3 7.8e-13
CCDS14680.1 SLITRK2 gene_id:84631|Hs108|chrX       ( 845)  346 73.7 1.1e-12
CCDS44933.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12       (1059)  342 73.1 2.2e-12
CCDS8960.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12        (1119)  342 73.1 2.3e-12
CCDS5754.1 LRRN3 gene_id:54674|Hs108|chr7          ( 708)  332 71.2 5.7e-12
CCDS33783.1 LRIG1 gene_id:26018|Hs108|chr3         (1093)  328 70.6 1.3e-11
CCDS14721.1 BGN gene_id:633|Hs108|chrX             ( 368)  318 68.4   2e-11
CCDS7957.1 RTN4RL2 gene_id:349667|Hs108|chr11      ( 420)  318 68.4 2.2e-11
CCDS58930.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4         ( 724)  321 69.2 2.2e-11
CCDS13777.1 RTN4R gene_id:65078|Hs108|chr22        ( 473)  316 68.1 3.1e-11
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1521)  322 69.7 3.4e-11
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1525)  322 69.7 3.4e-11
CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10         ( 536)  315 68.0 3.8e-11
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4           (1529)  321 69.5 3.8e-11
CCDS43276.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4         ( 757)  316 68.3 4.3e-11
CCDS75204.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4         ( 784)  316 68.3 4.4e-11
CCDS75205.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4         ( 626)  313 67.7 5.4e-11
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5           (1523)  318 69.0 5.5e-11
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5          (1530)  318 69.0 5.6e-11
CCDS47855.1 PXDNL gene_id:137902|Hs108|chr8        (1463)  317 68.8 6.1e-11
CCDS7568.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10          ( 582)  309 67.0 8.5e-11
CCDS45569.1 RTN4RL1 gene_id:146760|Hs108|chr17     ( 441)  307 66.5 8.9e-11


>>CCDS13121.1 FLRT3 gene_id:23767|Hs108|chr20             (649 aa)
 initn: 4311 init1: 4311 opt: 4311  Z-score: 4169.3  bits: 781.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4311; 100.0% identity (100.0% similar) in 649 aa overlap (1-649:1-649)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640         
pF1KA1 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
              610       620       630       640         

>>CCDS8057.1 FLRT1 gene_id:23769|Hs108|chr11              (674 aa)
 initn: 2568 init1: 1535 opt: 2479  Z-score: 2400.9  bits: 454.6 E(32554): 2.1e-127
Smith-Waterman score: 2479; 58.7% identity (82.2% similar) in 651 aa overlap (6-649:34-674)

                                        10        20        30     
pF1KA1                          MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVC
                                     : .::    :... .:    . . .:::::
CCDS80 AHPTATATTTPTATVTATVVMTTATMDLRDW-LFLCYGLIAFLTEV----IDSTTCPSVC
            10        20        30         40            50        

          40        50        60        70        80        90     
pF1KA1 RCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSL
       ::: :::::::: :::::. ::.::::::::::::::::::.:::. ..:. ::::.:.:
CCDS80 RCDNGFIYCNDRGLTSIPADIPDDATTLYLQNNQINNAGIPQDLKTKVNVQVIYLYENDL
       60        70        80        90       100       110        

         100       110       120       130       140       150     
pF1KA1 DEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNY
       :::: :::. ..:::::.::.:::. :::..:: ::.:::::::::.::::: :: ::. 
CCDS80 DEFPINLPRSLRELHLQDNNVRTIARDSLARIPLLEKLHLDDNSVSTVSIEEDAFADSKQ
      120       130       140       150       160       170        

         160       170       180       190       200       210     
pF1KA1 LRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHG
       :.::::::::::.:: :::.:.:::::::::::::   ...::.::.::::::::: :. 
CCDS80 LKLLFLSRNHLSSIPSGLPHTLEELRLDDNRISTIPLHAFKGLNSLRRLVLDGNLLANQR
      180       190       200       210       220       230        

         220       230       240       250       260       270     
pF1KA1 LGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYR
       ..: .:  : ::::::::::::.: :.:::...:.::::::: :...: :... .:.: :
CCDS80 IADDTFSRLQNLTELSLVRNSLAAPPLNLPSAHLQKLYLQDNAISHIPYNTLAKMRELER
      240       250       260       270       280       290        

         280       290       300       310       320       330     
pF1KA1 LDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQ
       ::.:::::..::.:.:::: :..::.::::::.:::.. :.:::...  . :::::::::
CCDS80 LDLSNNNLTTLPRGLFDDLGNLAQLLLRNNPWFCGCNLMWLRDWVKARAAVVNVRGLMCQ
      300       310       320       330       340       350        

         340       350           360       370        380       390
pF1KA1 APEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSG----IVSTIQITTAIPN-TVYPAQGQWPAPVTKQPD
       .:::::::::::...:. .: ..:    ....   :::  . ..   ::.  .  .:.: 
CCDS80 GPEKVRGMAIKDITSEMDECFETGPQGGVANAAAKTTASNHASATTPQGSLFTLKAKRPG
      360       370       380       390       400       410        

              400       410       420       430       440       450
pF1KA1 IKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFG
       .. :  . :.  . . . ::..: ::..:.:.:.:.:: .:: ...:::::.:::::: :
CCDS80 LRLPDSNIDYPMATGDGAKTLAIHVKALTADSIRITWKATLPASSFRLSWLRLGHSPAVG
      420       430       440       450       460       470        

              460       470       480       490       500       510
pF1KA1 SITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPT
       :::::.: :...:::.::::: : : .::: ::::: :. :::::: ..:::    :.::
CCDS80 SITETLVQGDKTEYLLTALEPKSTYIICMVTMETSNAYVADETPVCAKAETAD--SYGPT
      480       490       500       510       520       530        

              520       530       540        550       560         
pF1KA1 TTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALVTIAL-LALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGR
       ::::.::.  :.   .::::.::::::::: . : :. .:::::. : :..:. ::..: 
CCDS80 TTLNQEQNAGPMA--SLPLAGIIGGAVALVFLFLVLGAICWYVHQAGELLTRERAYNRGS
        540         550       560       570       580       590    

     570       580       590       600       610       620         
pF1KA1 RRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPISNEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSE
       :.:::: :.::::::::::::  ..::::: :   .:::.:.::::: :: .: : .:. 
CCDS80 RKKDDYMESGTKKDNSILEIRGPGLQMLPI-NPYRAKEEYVVHTIFPSNGSSLCKATHTI
          600       610       620        630       640       650   

     630        640         
pF1KA1 S-SSNRSYRDSGIPDSDHSHS
       . ...:.:::.:::: :.:..
CCDS80 GYGTTRGYRDGGIPDIDYSYT
           660       670    

>>CCDS9877.1 FLRT2 gene_id:23768|Hs108|chr14              (660 aa)
 initn: 1873 init1: 1395 opt: 1684  Z-score: 1633.7  bits: 312.6 E(32554): 1.1e-84
Smith-Waterman score: 1989; 47.3% identity (75.3% similar) in 649 aa overlap (15-649:24-660)

                        10        20        30        40        50 
pF1KA1          MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTS
                              .::. ::. :  .:  :::::::: .:.:::.: :::
CCDS98 MGLQTTKWPSHGAFFLKSWLIISLGLYSQVSKL--LA--CPSVCRCDRNFVYCNERSLTS
               10        20        30            40        50      

              60        70        80        90       100       110 
pF1KA1 IPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHL
       .: :::: .:.:::.::::::::.:..:.:. .:. .::: :.::::: :::: :. :::
CCDS98 VPLGIPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLPKNVRVLHL
         60        70        80        90       100       110      

             120       130       140       150       160       170 
pF1KA1 QENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPW
       :::::.::.  .:...  ::::::::::.:.:..:.::::..  :.:::::.::::..: 
CCDS98 QENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPV
        120       130       140       150       160       170      

             180       190       200       210       220       230 
pF1KA1 GLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELS
       :::  ..:::.:.:::..::. ..:.::::.::..:::::.:.:... .: .:..: :.:
CCDS98 GLPVDLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFS
        180       190       200       210       220       230      

             240       250       260       270       280       290 
pF1KA1 LVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIF
       .:::::.  : .::::.: .::::::.::..: .::: ::.: :::.:::.:  : ::.:
CCDS98 IVRNSLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRMLTQGVF
        240       250       260       270       280       290      

             300       310       320       330       340       350 
pF1KA1 DDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAE
       :.:.:. ::  :::::.: :..::: .::. .: ..::::.:::.::.:::::...:: .
CCDS98 DNLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMN
        300       310       320       330       340       350      

               360             370       380           390         
pF1KA1 LFDCKDS--GIV------STIQITTAIPNTVYPAQGQW---PAPVT-KQPDIKNPKLTKD
       :..:  .  :.       :: . ::  :.   :  ..    :.:.: : : :  :     
CCDS98 LLSCPTTTPGLPLFTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTI--PDWDGR
        360       370       380       390       400         410    

     400       410       420       430       440       450         
pF1KA1 HQTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTG
       ...:  :  . : .... :.. .:..::   . . : .:.:.:.::: . : . : ::.:
CCDS98 ERVT-PPISERIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQERIVSG
           420       430       440       450       460       470   

     460       470       480       490       500       510         
pF1KA1 ERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEK
       :...  .. ::: : :..:.::... :    ..: .: :. :    . : ..: . ... 
CCDS98 EKQHLSLVNLEPRSTYRICLVPLDAFNYRAVEDT-ICSEATTHASYLNNGSNTASSHEQT
           480       490       500        510       520       530  

     520         530       540       550       560       570       
pF1KA1 EPYK--NPNLPLAAIIGGAVALVTIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAE
         ..  .: : ::..::::: .: ..::.. ::..:..:   :..  :..::: :::: :
CCDS98 TSHSMGSPFL-LAGLIGGAVIFVLVVLLSVFCWHMHKKGRYTSQKWKYNRGRR-KDDYCE
            540        550       560       570       580        590

       580       590       600       610       620       630       
pF1KA1 AGTKKDNSILEIRETSFQMLPISNEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYR
       :::::::::::. :::::.. ..:. . : .: .. :. :::   : . :    .:  : 
CCDS98 AGTKKDNSILEMTETSFQIVSLNNDQLLKGDFRLQPIYTPNGGINYTDCHIP--NNMRYC
              600       610       620       630       640          

       640         
pF1KA1 DSGIPDSDHSHS
       .:..:: .: :.
CCDS98 NSSVPDLEHCHT
      650       660

>>CCDS46346.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2             (590 aa)
 initn: 322 init1: 115 opt: 457  Z-score: 450.1  bits: 93.4 E(32554): 9.5e-19
Smith-Waterman score: 457; 24.5% identity (56.4% similar) in 543 aa overlap (10-528:9-526)

               10        20            30        40        50      
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVM----AKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGI
                : : .. : :  . : ::     ..::. ::::. ..::... ...:: .:
CCDS46  MGFHLITQLKGMSVVLVLLPTLLLVMLTGAQRACPKNCRCDGKIVYCESHAFADIPENI
                10        20        30        40        50         

         60        70        80        90          100       110   
pF1KA1 PEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHN---SLDEFPTNLPKYVKELHLQE
          .  : :. :.:..    ... .: ..  .:: ::   :.::   .  . .::: :. 
CCDS46 SGGSQGLSLRFNSIQKLK-SNQFAGLNQLIWLYLDHNYISSVDEDAFQGIRRLKELILSS
      60        70         80        90       100       110        

           120       130       140       150       160       170   
pF1KA1 NNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGL
       :.:  .   ..  .: :..: :. :...... :.  :.    : .: :  : :.:.:  .
CCDS46 NKITYLHNKTFHPVPNLRNLDLSYNKLQTLQSEQ--FKGLRKLIILHLRSNSLKTVPIRV
      120       130       140       150         160       170      

              180       190       200       210       220       230
pF1KA1 P---RTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTEL
           :... : :  ::. ..:  .. :: .::.: :. : ... ...   :  : ::  .
CCDS46 FQDCRNLDFLDLGYNRLRSLSRNAFAGLLKLKELHLEHNQFSKINFAH--FPRLFNLRSI
        180       190       200       210       220         230    

              240         250       260       270       280        
pF1KA1 SLVRNSLTAAPVNLPGT--NLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQ
        :  : . .   .:  :  .:..: :. : :. . :..:. : .: .:....:.:.:. :
CCDS46 YLQWNRIRSISQGLTWTWSSLHNLDLSGNDIQGIEPGTFKCLPNLQKLNLDSNKLTNISQ
          240       250       260       270       280       290    

      290       300       310       320       330        340       
pF1KA1 GIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLM-CQAPEKVRGMAIKD
          .   .. .. : .: : :. ..  .  ::...  : : .. : : .:....:  ..:
CCDS46 ETVNAWISLISITLSGNMWECSRSICPLFYWLKNF--KGNKESTMICAGPKHIQGEKVSD
          300       310       320         330       340       350  

       350        360       370       380        390            400
pF1KA1 LNAELFD-CKDSGIVSTIQITTAIPNTVYPAQGQW-PAPVTKQPDI-----KNPKLTKDH
         .: .. :..  .:.: . .  .:.:  : .    : :.  .::.     ..:. .   
CCDS46 -AVETYNICSEVQVVNT-ERSHLVPQT--PQKPLIIPRPTIFKPDVTQSTFETPSPSPGF
             360        370         380       390       400        

              410       420       430       440       450          
pF1KA1 QTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITE--TIVT
       :  :. ..    .. ... . .. .  ..:. . .. .:: .    ::  .  .  ... 
CCDS46 QIPGAEQEYE-HVSFHKIIAGSVALFLSVAMILLVIYVSWKRY---PASMKQLQQHSLMK
      410        420       430       440       450          460    

      460       470       480       490       500       510        
pF1KA1 GERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTT-TLNREQ
        .:..   .  . .:: .           :  :  :.  ::    .   .: : :..  .
CCDS46 RRRKKARESERQMNSPLQE----------YYVDYKPTNSETMDISVNGSGPCTYTISGSR
          470       480                 490       500       510    

       520        530       540       550       560       570      
pF1KA1 EKE-PYKNPNLPLAAIIGGAVALVTIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYA
       : : :..   ::                                                
CCDS46 ECEMPHHMKPLPYYSYDQPVIGYCQAHQPLHVTKGYETVSPEQDESPGLELGRDHSFIAT
          520       530       540       550       560       570    

>>CCDS82475.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2             (591 aa)
 initn: 322 init1: 115 opt: 457  Z-score: 450.1  bits: 93.4 E(32554): 9.5e-19
Smith-Waterman score: 457; 24.5% identity (56.4% similar) in 543 aa overlap (10-528:10-527)

               10        20            30        40        50      
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVM----AKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGI
                : : .. : :  . : ::     ..::. ::::. ..::... ...:: .:
CCDS82 MPGFHLITQLKGMSVVLVLLPTLLLVMLTGAQRACPKNCRCDGKIVYCESHAFADIPENI
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90          100       110   
pF1KA1 PEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHN---SLDEFPTNLPKYVKELHLQE
          .  : :. :.:..    ... .: ..  .:: ::   :.::   .  . .::: :. 
CCDS82 SGGSQGLSLRFNSIQKLK-SNQFAGLNQLIWLYLDHNYISSVDEDAFQGIRRLKELILSS
               70         80        90       100       110         

           120       130       140       150       160       170   
pF1KA1 NNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGL
       :.:  .   ..  .: :..: :. :...... :.  :.    : .: :  : :.:.:  .
CCDS82 NKITYLHNKTFHPVPNLRNLDLSYNKLQTLQSEQ--FKGLRKLIILHLRSNSLKTVPIRV
     120       130       140       150         160       170       

              180       190       200       210       220       230
pF1KA1 P---RTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTEL
           :... : :  ::. ..:  .. :: .::.: :. : ... ...   :  : ::  .
CCDS82 FQDCRNLDFLDLGYNRLRSLSRNAFAGLLKLKELHLEHNQFSKINFAH--FPRLFNLRSI
       180       190       200       210       220         230     

              240         250       260       270       280        
pF1KA1 SLVRNSLTAAPVNLPGT--NLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQ
        :  : . .   .:  :  .:..: :. : :. . :..:. : .: .:....:.:.:. :
CCDS82 YLQWNRIRSISQGLTWTWSSLHNLDLSGNDIQGIEPGTFKCLPNLQKLNLDSNKLTNISQ
         240       250       260       270       280       290     

      290       300       310       320       330        340       
pF1KA1 GIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLM-CQAPEKVRGMAIKD
          .   .. .. : .: : :. ..  .  ::...  : : .. : : .:....:  ..:
CCDS82 ETVNAWISLISITLSGNMWECSRSICPLFYWLKNF--KGNKESTMICAGPKHIQGEKVSD
         300       310       320       330         340       350   

       350        360       370       380        390            400
pF1KA1 LNAELFD-CKDSGIVSTIQITTAIPNTVYPAQGQW-PAPVTKQPDI-----KNPKLTKDH
         .: .. :..  .:.: . .  .:.:  : .    : :.  .::.     ..:. .   
CCDS82 -AVETYNICSEVQVVNT-ERSHLVPQT--PQKPLIIPRPTIFKPDVTQSTFETPSPSPGF
            360        370         380       390       400         

              410       420       430       440       450          
pF1KA1 QTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITE--TIVT
       :  :. ..    .. ... . .. .  ..:. . .. .:: .    ::  .  .  ... 
CCDS82 QIPGAEQEYE-HVSFHKIIAGSVALFLSVAMILLVIYVSWKRY---PASMKQLQQHSLMK
     410        420       430       440       450          460     

      460       470       480       490       500       510        
pF1KA1 GERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTT-TLNREQ
        .:..   .  . .:: .           :  :  :.  ::    .   .: : :..  .
CCDS82 RRRKKARESERQMNSPLQE----------YYVDYKPTNSETMDISVNGSGPCTYTISGSR
         470       480                 490       500       510     

       520        530       540       550       560       570      
pF1KA1 EKE-PYKNPNLPLAAIIGGAVALVTIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYA
       : : :..   ::                                                
CCDS82 ECEMPHHMKPLPYYSYDQPVIGYCQAHQPLHVTKGYETVSPEQDESPGLELGRDHSFIAT
         520       530       540       550       560       570     

>>CCDS46347.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2             (518 aa)
 initn: 322 init1: 115 opt: 456  Z-score: 449.9  bits: 93.2 E(32554): 9.8e-19
Smith-Waterman score: 456; 24.1% identity (58.6% similar) in 503 aa overlap (10-491:9-497)

               10        20            30        40        50      
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVM----AKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGI
                : : .. : :  . : ::     ..::. ::::. ..::... ...:: .:
CCDS46  MGFHLITQLKGMSVVLVLLPTLLLVMLTGAQRACPKNCRCDGKIVYCESHAFADIPENI
                10        20        30        40        50         

         60        70        80        90          100       110   
pF1KA1 PEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHN---SLDEFPTNLPKYVKELHLQE
          .  : :. :.:..    ... .: ..  .:: ::   :.::   .  . .::: :. 
CCDS46 SGGSQGLSLRFNSIQKLK-SNQFAGLNQLIWLYLDHNYISSVDEDAFQGIRRLKELILSS
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pF1KA1 NNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGL
       :.:  .   ..  .: :..: :. :...... :.  :.    : .: :  : :.:.:  .
CCDS46 NKITYLHNKTFHPVPNLRNLDLSYNKLQTLQSEQ--FKGLRKLIILHLRSNSLKTVPIRV
      120       130       140       150         160       170      

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pF1KA1 P---RTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTEL
           :... : :  ::. ..:  .. :: .::.: :. : ... ...   :  : ::  .
CCDS46 FQDCRNLDFLDLGYNRLRSLSRNAFAGLLKLKELHLEHNQFSKINFAH--FPRLFNLRSI
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pF1KA1 SLVRNSLTAAPVNLPGT--NLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQ
        :  : . .   .:  :  .:..: :. : :. . :..:. : .: .:....:.:.:. :
CCDS46 YLQWNRIRSISQGLTWTWSSLHNLDLSGNDIQGIEPGTFKCLPNLQKLNLDSNKLTNISQ
          240       250       260       270       280       290    

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pF1KA1 GIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLM-CQAPEKVRGMAIKD
          .   .. .. : .: : :. ..  .  ::...  : : .. : : .:....:  ..:
CCDS46 ETVNAWISLISITLSGNMWECSRSICPLFYWLKNF--KGNKESTMICAGPKHIQGEKVSD
          300       310       320         330       340       350  

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pF1KA1 LNAELFD-CKDSGIVSTIQITTAIPNTVYPAQGQW-PAPVTKQPDI-----KNPKLTKDH
         .: .. :..  .:.: . .  .:.:  : .    : :.  .::.     ..:. .   
CCDS46 -AVETYNICSEVQVVNT-ERSHLVPQT--PQKPLIIPRPTIFKPDVTQSTFETPSPSPGF
             360        370         380       390       400        

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pF1KA1 QTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITE-TIVTG
       :  :. ..    .. ... . .. .  ..:. . .. .:: .  .  .. .. . ...  
CCDS46 QIPGAEQEYE-HVSFHKIIAGSVALFLSVAMILLVIYVSWKR--YPASMKQLQQHSLMKR
      410        420       430       440         450       460     

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pF1KA1 ERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEK
       .:..   .  . .:: .  .: .. .:   .:                            
CCDS46 RRKKARESERQMNSPLQEYYVDYKPTNSETMDISVNGSGPCTYTISGSRECEV       
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pF1KA1 EPYKNPNLPLAAIIGGAVALVTIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAG

>>CCDS74530.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2             (519 aa)
 initn: 322 init1: 115 opt: 456  Z-score: 449.9  bits: 93.2 E(32554): 9.8e-19
Smith-Waterman score: 456; 24.1% identity (58.6% similar) in 503 aa overlap (10-491:10-498)

               10        20            30        40        50      
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVM----AKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGI
                : : .. : :  . : ::     ..::. ::::. ..::... ...:: .:
CCDS74 MPGFHLITQLKGMSVVLVLLPTLLLVMLTGAQRACPKNCRCDGKIVYCESHAFADIPENI
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90          100       110   
pF1KA1 PEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHN---SLDEFPTNLPKYVKELHLQE
          .  : :. :.:..    ... .: ..  .:: ::   :.::   .  . .::: :. 
CCDS74 SGGSQGLSLRFNSIQKLK-SNQFAGLNQLIWLYLDHNYISSVDEDAFQGIRRLKELILSS
               70         80        90       100       110         

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pF1KA1 NNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGL
       :.:  .   ..  .: :..: :. :...... :.  :.    : .: :  : :.:.:  .
CCDS74 NKITYLHNKTFHPVPNLRNLDLSYNKLQTLQSEQ--FKGLRKLIILHLRSNSLKTVPIRV
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pF1KA1 P---RTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTEL
           :... : :  ::. ..:  .. :: .::.: :. : ... ...   :  : ::  .
CCDS74 FQDCRNLDFLDLGYNRLRSLSRNAFAGLLKLKELHLEHNQFSKINFAH--FPRLFNLRSI
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pF1KA1 SLVRNSLTAAPVNLPGT--NLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQ
        :  : . .   .:  :  .:..: :. : :. . :..:. : .: .:....:.:.:. :
CCDS74 YLQWNRIRSISQGLTWTWSSLHNLDLSGNDIQGIEPGTFKCLPNLQKLNLDSNKLTNISQ
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pF1KA1 GIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLM-CQAPEKVRGMAIKD
          .   .. .. : .: : :. ..  .  ::...  : : .. : : .:....:  ..:
CCDS74 ETVNAWISLISITLSGNMWECSRSICPLFYWLKNF--KGNKESTMICAGPKHIQGEKVSD
         300       310       320       330         340       350   

       350        360       370       380        390            400
pF1KA1 LNAELFD-CKDSGIVSTIQITTAIPNTVYPAQGQW-PAPVTKQPDI-----KNPKLTKDH
         .: .. :..  .:.: . .  .:.:  : .    : :.  .::.     ..:. .   
CCDS74 -AVETYNICSEVQVVNT-ERSHLVPQT--PQKPLIIPRPTIFKPDVTQSTFETPSPSPGF
            360        370         380       390       400         

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pF1KA1 QTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITE-TIVTG
       :  :. ..    .. ... . .. .  ..:. . .. .:: .  .  .. .. . ...  
CCDS74 QIPGAEQEYE-HVSFHKIIAGSVALFLSVAMILLVIYVSWKR--YPASMKQLQQHSLMKR
     410        420       430       440       450         460      

     460       470       480       490       500       510         
pF1KA1 ERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEK
       .:..   .  . .:: .  .: .. .:   .:                            
CCDS74 RRKKARESERQMNSPLQEYYVDYKPTNSETMDISVNGSGPCTYTISGSRECEV       
        470       480       490       500       510                

     520       530       540       550       560       570         
pF1KA1 EPYKNPNLPLAAIIGGAVALVTIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAG

>>CCDS55601.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1              (519 aa)
 initn: 401 init1: 339 opt: 436  Z-score: 430.5  bits: 89.6 E(32554): 1.2e-17
Smith-Waterman score: 436; 32.9% identity (69.9% similar) in 246 aa overlap (63-305:244-488)

             40        50        60        70         80        90 
pF1KA1 SVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGI-PSDLKNLLKVERIYLY
                                     : :..::. . :: :  ...: ... ..::
CCDS55 PRSLVLLHLEKNAIRSVDANVLTPIRSLEYLLLHSNQLREQGIHPLAFQGLKRLHTVHLY
           220       230       240       250       260       270   

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pF1KA1 HNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFR
       .:.:.. :..::. :. : . .:.:  :  ....   .::::.:. : ... .... :::
CCDS55 NNALERVPSGLPRRVRTLMILHNQITGIGREDFATTYFLEELNLSYNRITSPQVHRDAFR
           280       290       300       310       320       330   

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pF1KA1 DSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLL
           :: : :: :.: :.: ::::... :..  :......  .: :...:..: : .: :
CCDS55 KLRLLRSLDLSGNRLHTLPPGLPRNVHVLKVKRNELAALARGALVGMAQLRELYLTSNRL
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pF1KA1 NNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLR
        ...:: ... .:..:  :... :.::  : .::  .:. ::::.:.:. :: :::.   
CCDS55 RSRALGPRAWVDLAHLQLLDIAGNQLTEIPEGLP-ESLEYLYLQNNKISAVPANAFDSTP
           400       410       420        430       440       450  

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pF1KA1 QLYRLDMSNNNLS--NLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNV
       .:  . .  :.:.  .. .. :  : ..  : ...:                        
CCDS55 NLKGIFLRFNKLAVGSVVDSAFRRLKHLQVLDIEGNLEFGDISKDRGRLGKEKEEEEEEE
            460       470       480       490       500       510  

     330       340       350       360       370       380         
pF1KA1 RGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGIVSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQP
                                                                   
CCDS55 EEEEETR                                                     
                                                                   

>>CCDS55602.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1              (642 aa)
 initn: 401 init1: 339 opt: 436  Z-score: 429.4  bits: 89.7 E(32554): 1.4e-17
Smith-Waterman score: 436; 32.9% identity (69.9% similar) in 246 aa overlap (63-305:367-611)

             40        50        60        70         80        90 
pF1KA1 SVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGI-PSDLKNLLKVERIYLY
                                     : :..::. . :: :  ...: ... ..::
CCDS55 PRSLVLLHLEKNAIRSVDANVLTPIRSLEYLLLHSNQLREQGIHPLAFQGLKRLHTVHLY
        340       350       360       370       380       390      

             100       110       120       130       140       150 
pF1KA1 HNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFR
       .:.:.. :..::. :. : . .:.:  :  ....   .::::.:. : ... .... :::
CCDS55 NNALERVPSGLPRRVRTLMILHNQITGIGREDFATTYFLEELNLSYNRITSPQVHRDAFR
        400       410       420       430       440       450      

             160       170       180       190       200       210 
pF1KA1 DSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLL
           :: : :: :.: :.: ::::... :..  :......  .: :...:..: : .: :
CCDS55 KLRLLRSLDLSGNRLHTLPPGLPRNVHVLKVKRNELAALARGALVGMAQLRELYLTSNRL
        460       470       480       490       500       510      

             220       230       240       250       260       270 
pF1KA1 NNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLR
        ...:: ... .:..:  :... :.::  : .::  .:. ::::.:.:. :: :::.   
CCDS55 RSRALGPRAWVDLAHLQLLDIAGNQLTEIPEGLP-ESLEYLYLQNNKISAVPANAFDSTP
        520       530       540       550        560       570     

             280         290       300       310       320         
pF1KA1 QLYRLDMSNNNLS--NLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNV
       .:  . .  :.:.  .. .. :  : ..  : ...:                        
CCDS55 NLKGIFLRFNKLAVGSVVDSAFRRLKHLQVLDIEGNLEFGDISKDRGRLGKEKEEEEEEE
         580       590       600       610       620       630     

     330       340       350       360       370       380         
pF1KA1 RGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGIVSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQP
                                                                   
CCDS55 EEEEETR                                                     
         640                                                       

>--
 initn: 428 init1: 242 opt: 347  Z-score: 343.5  bits: 73.8 E(32554): 8.2e-13
Smith-Waterman score: 359; 28.7% identity (59.2% similar) in 272 aa overlap (28-273:94-364)

                  10        20        30         40        50      
pF1KA1    MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDA-GFIYCNDRFLTSIPTGI
                                     : :::  : :.  : . :.   :  .:  .
CCDS55 GHSLSPEENEFAEEEPVLVLSPEEPGPGPAAVSCPRDCACSQEGVVDCGGIDLREFPGDL
            70        80        90       100       110       120   

         60        70                                 80        90 
pF1KA1 PEDATTLYLQNNQI--------------------NNA----GIPSD-LKNLLKVERIYLY
       :: .. : :::::.                    ::     :.:   ...: ... .:: 
CCDS55 PEHTNHLSLQNNQLEKIYPEELSRLHRLETLNLQNNRLTSRGLPEKAFEHLTNLNYLYLA
           130       140       150       160       170       180   

             100       110       120       130       140       150 
pF1KA1 HNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFR
       .:.:   :  ::. .  . .  : .  :   .... : :. ..: .:... ... .. : 
CCDS55 NNKLTLAPRFLPNALISVDFAANYLTKIYGLTFGQKPNLRSVYLHNNKLADAGLPDNMFN
           190       200       210       220       230       240   

             160       170       180       190       200       210 
pF1KA1 DSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLL
        :. ...:.:: : :  .:  :: .. .:.: .:..  :   ... :.::..: :..: :
CCDS55 GSSNVEVLILSSNFLRHVPKHLPPALYKLHLKNNKLEKIPPGAFSELSSLRELYLQNNYL
           250       260       270       280       290       300   

             220       230       240       250       260       270 
pF1KA1 NNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLR
       ...:: ...:..: .:  :.:  :.:. .:..::  .:  :.:. : :  :  :... .:
CCDS55 TDEGLDNETFWKLSSLEYLDLSSNNLSRVPAGLP-RSLVLLHLEKNAIRSVDANVLTPIR
           310       320       330        340       350       360  

             280       290       300       310       320       330 
pF1KA1 QLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRG
       .:                                                          
CCDS55 SLEYLLLHSNQLREQGIHPLAFQGLKRLHTVHLYNNALERVPSGLPRRVRTLMILHNQIT
            370       380       390       400       410       420  

>>CCDS573.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1                (661 aa)
 initn: 404 init1: 339 opt: 436  Z-score: 429.2  bits: 89.7 E(32554): 1.4e-17
Smith-Waterman score: 436; 32.9% identity (69.9% similar) in 246 aa overlap (63-305:386-630)

             40        50        60        70         80        90 
pF1KA1 SVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGI-PSDLKNLLKVERIYLY
                                     : :..::. . :: :  ...: ... ..::
CCDS57 PRSLVLLHLEKNAIRSVDANVLTPIRSLEYLLLHSNQLREQGIHPLAFQGLKRLHTVHLY
         360       370       380       390       400       410     

             100       110       120       130       140       150 
pF1KA1 HNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFR
       .:.:.. :..::. :. : . .:.:  :  ....   .::::.:. : ... .... :::
CCDS57 NNALERVPSGLPRRVRTLMILHNQITGIGREDFATTYFLEELNLSYNRITSPQVHRDAFR
         420       430       440       450       460       470     

             160       170       180       190       200       210 
pF1KA1 DSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLL
           :: : :: :.: :.: ::::... :..  :......  .: :...:..: : .: :
CCDS57 KLRLLRSLDLSGNRLHTLPPGLPRNVHVLKVKRNELAALARGALVGMAQLRELYLTSNRL
         480       490       500       510       520       530     

             220       230       240       250       260       270 
pF1KA1 NNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLR
        ...:: ... .:..:  :... :.::  : .::  .:. ::::.:.:. :: :::.   
CCDS57 RSRALGPRAWVDLAHLQLLDIAGNQLTEIPEGLP-ESLEYLYLQNNKISAVPANAFDSTP
         540       550       560        570       580       590    

             280         290       300       310       320         
pF1KA1 QLYRLDMSNNNLS--NLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNV
       .:  . .  :.:.  .. .. :  : ..  : ...:                        
CCDS57 NLKGIFLRFNKLAVGSVVDSAFRRLKHLQVLDIEGNLEFGDISKDRGRLGKEKEEEEEEE
          600       610       620       630       640       650    

     330       340       350       360       370       380         
pF1KA1 RGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGIVSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQP
                                                                   
CCDS57 EEEEETR                                                     
          660                                                      

>--
 initn: 428 init1: 242 opt: 347  Z-score: 343.3  bits: 73.8 E(32554): 8.4e-13
Smith-Waterman score: 359; 28.7% identity (59.2% similar) in 272 aa overlap (28-273:113-383)

                  10        20        30         40        50      
pF1KA1    MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDA-GFIYCNDRFLTSIPTGI
                                     : :::  : :.  : . :.   :  .:  .
CCDS57 GHSLSPEENEFAEEEPVLVLSPEEPGPGPAAVSCPRDCACSQEGVVDCGGIDLREFPGDL
             90       100       110       120       130       140  

         60        70                                 80        90 
pF1KA1 PEDATTLYLQNNQI--------------------NNA----GIPSD-LKNLLKVERIYLY
       :: .. : :::::.                    ::     :.:   ...: ... .:: 
CCDS57 PEHTNHLSLQNNQLEKIYPEELSRLHRLETLNLQNNRLTSRGLPEKAFEHLTNLNYLYLA
            150       160       170       180       190       200  

             100       110       120       130       140       150 
pF1KA1 HNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFR
       .:.:   :  ::. .  . .  : .  :   .... : :. ..: .:... ... .. : 
CCDS57 NNKLTLAPRFLPNALISVDFAANYLTKIYGLTFGQKPNLRSVYLHNNKLADAGLPDNMFN
            210       220       230       240       250       260  

             160       170       180       190       200       210 
pF1KA1 DSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLL
        :. ...:.:: : :  .:  :: .. .:.: .:..  :   ... :.::..: :..: :
CCDS57 GSSNVEVLILSSNFLRHVPKHLPPALYKLHLKNNKLEKIPPGAFSELSSLRELYLQNNYL
            270       280       290       300       310       320  

             220       230       240       250       260       270 
pF1KA1 NNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLR
       ...:: ...:..: .:  :.:  :.:. .:..::  .:  :.:. : :  :  :... .:
CCDS57 TDEGLDNETFWKLSSLEYLDLSSNNLSRVPAGLP-RSLVLLHLEKNAIRSVDANVLTPIR
            330       340       350        360       370       380 

             280       290       300       310       320       330 
pF1KA1 QLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRG
       .:                                                          
CCDS57 SLEYLLLHSNQLREQGIHPLAFQGLKRLHTVHLYNNALERVPSGLPRRVRTLMILHNQIT
             390       400       410       420       430       440 




649 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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