seq1 = pF1KA1332.tfa, 2151 bp seq2 = pF1KA1332/gi568815597r_16150673.tfa (gi568815597r:16150673_16415418), 264746 bp >pF1KA1332 2151 >gi568815597r:16150673_16415418 (Chr1) (complement) 1-250 (100001-100250) 99% -> 251-367 (109500-109616) 100% -> 368-502 (120502-120636) 100% -> 503-656 (158660-158813) 100% -> 657-767 (159598-159708) 100% -> 768-864 (161688-161784) 100% -> 865-921 (162267-162323) 100% -> 922-1038 (163015-163131) 100% -> 1039-2151 (163634-164746) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCCAGCTCCTCAGACAGTGAAGATGACAGTTTCATGGCTGTGGACCA |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGCCAGCTCCTCGGACAGTGAAGATGACAGTTTCATGGCTGTGGACCA 50 . : . : . : . : . : 51 GGAAGAAACTGTGCTGGAAGGGACAATGGATCAAGATGAGGAGCCCCACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GGAAGAAACTGTGCTGGAAGGGACAATGGATCAAGATGAGGAGCCCCACC 100 . : . : . : . : . : 101 CAGTATTGGAGGCTGAGGAGACTAGACATAATAGGTCCATGTCGGAGCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 CAGTATTGGAGGCTGAGGAGACTAGACATAATAGGTCCATGTCGGAGCTG 150 . : . : . : . : . : 151 CCAGAAGAGGTTTTGGAGTATATCCTGTCCTTTCTCTCACCGTATCAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 CCAGAAGAGGTTTTGGAGTATATCCTGTCCTTTCTCTCACCGTATCAGGA 200 . : . : . : . : . : 201 ACACAAAACTGCGGCCCTTGTCTGCAAACAGTGGTATCGACTTATCAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100201 ACACAAAACTGCGGCCCTTGTCTGCAAACAGTGGTATCGACTTATCAAAG 250 . : . : . : . : . : 251 GTGTAGCCCATCAGTGTTATCATGGTTTCATGAAGGCTGTC >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100251 GTA...TAGGTGTAGCCCATCAGTGTTATCATGGTTTCATGAAGGCTGTC 300 . : . : . : . : . : 292 CAGGAAGGAAACATTCAGTGGGAGAGCCGTACCTATCCTTATCCTGGAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109541 CAGGAAGGAAACATTCAGTGGGAGAGCCGTACCTATCCTTATCCTGGAAC 350 . : . : . : . : . : 342 CCCAATCACTCAGCGCTTCTCGCACA GTGCATGCTATTATG ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 109591 CCCAATCACTCAGCGCTTCTCGCACAGTA...TAGGTGCATGCTATTATG 400 . : . : . : . : . : 383 ATGCTAATCAGTCTATGTATGTGTTTGGAGGCTGTACCCAGAGCAGCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120517 ATGCTAATCAGTCTATGTATGTGTTTGGAGGCTGTACCCAGAGCAGCTGC 450 . : . : . : . : . : 433 AATGCTGCTTTCAATGACCTCTGGAGACTTGACCTAAACAGCAAAGAGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120567 AATGCTGCTTTCAATGACCTCTGGAGACTTGACCTAAACAGCAAAGAGTG 500 . : . : . : . : . : 483 GATCCGACCTTTGGCTTCAG GGTCCTATCCTTCCCCCAAAG ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 120617 GATCCGACCTTTGGCTTCAGGTA...TAGGGTCCTATCCTTCCCCCAAAG 550 . : . : . : . : . : 524 CTGGAGCAACTCTGGTCGTGTACAAGGACTTGCTAGTGCTGTTTGGTGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 158681 CTGGAGCAACTCTGGTCGTGTACAAGGACTTGCTAGTGCTGTTTGGTGGC 600 . : . : . : . : . : 574 TGGACGCGGCCAAGCCCTTATCCCCTACACCAGCCAGAGAGATTCTTTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 158731 TGGACGCGGCCAAGCCCTTATCCCCTACACCAGCCAGAGAGATTCTTTGA 650 . : . : . : . : . : 624 TGAAATACACACTTACTCACCCTCTAAAAATTG GTGGAACT |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 158781 TGAAATACACACTTACTCACCCTCTAAAAATTGGTA...TAGGTGGAACT 700 . : . : . : . : . : 665 GCATTGTGACAACCCATGGGCCACCTCCCATGGCTGGCCACTCCTCCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 159606 GCATTGTGACAACCCATGGGCCACCTCCCATGGCTGGCCACTCCTCCTGT 750 . : . : . : . : . : 715 GTGATAGATGATAAAATGATTGTCTTTGGTGGCTCTTTAGGATCCCGGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 159656 GTGATAGATGATAAAATGATTGTCTTTGGTGGCTCTTTAGGATCCCGGCA 800 . : . : . : . : . : 765 AAT GAGCAATGATGTCTGGGTCCTTGACCTTGAGCAGTGGG |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 159706 AATGTA...CAGGAGCAATGATGTCTGGGTCCTTGACCTTGAGCAGTGGG 850 . : . : . : . : . : 806 CGTGGTCCAAGCCGAACATCTCTGGCCCCAGTCCTCATCCTCGAGGTGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 161726 CGTGGTCCAAGCCGAACATCTCTGGCCCCAGTCCTCATCCTCGAGGTGGC 900 . : . : . : . : . : 856 CAATCTCAG ATTGTCATAGATGATGCAACTATCTTAATCCT |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| 161776 CAATCTCAGGTG...CAGATTGTCATAGATGATGCAACTATCTTAATCCT 950 . : . : . : . : . : 897 CGGAGGGTGTGGCGGTCCCAATGCT CTATTCAAGGATGCTT |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 162299 CGGAGGGTGTGGCGGTCCCAATGCTGTG...CAGCTATTCAAGGATGCTT 1000 . : . : . : . : . : 938 GGTTGTTGCACATGCATTCTGGTCCTTGGGCCTGGCAGCCACTCAAGGTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 163031 GGTTGTTGCACATGCATTCTGGTCCTTGGGCCTGGCAGCCACTCAAGGTA 1050 . : . : . : . : . : 988 GAAAATGAAGAGCATGGGGCCCCAGAACTGTGGTGCCATCCAGCTTGCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 163081 GAAAATGAAGAGCATGGGGCCCCAGAACTGTGGTGCCATCCAGCTTGCCG 1100 . : . : . : . : . : 1038 G GTGGGACAGTGTGTGGTGGTCTTCAGCCAGGCTCCTAGTG |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 163131 GGTA...CAGGTGGGACAGTGTGTGGTGGTCTTCAGCCAGGCTCCTAGTG 1150 . : . : . : . : . : 1079 GGAGAGCCCCACTCAGCCCCAGTTTGAACTCTCGCCCATCACCTATCAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 163674 GGAGAGCCCCACTCAGCCCCAGTTTGAACTCTCGCCCATCACCTATCAGT 1200 . : . : . : . : . : 1129 GCCACTCCTCCAGCTCTCGTTCCTGAAACCCGAGAGTACCGCTCTCAGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 163724 GCCACTCCTCCAGCTCTCGTTCCTGAAACCCGAGAGTACCGCTCTCAGTC 1250 . : . : . : . : . : 1179 TCCAGTAAGAAGCATGGATGAAGCTCCTTGTGTTAACGGCCGCTGGGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 163774 TCCAGTAAGAAGCATGGATGAAGCTCCTTGTGTTAACGGCCGCTGGGGAA 1300 . : . : . : . : . : 1229 CACTGAGACCCAGGGCTCAAAGGCAGACTCCTTCAGGTTCCCGGGAAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 163824 CACTGAGACCCAGGGCTCAAAGGCAGACTCCTTCAGGTTCCCGGGAAGGG 1350 . : . : . : . : . : 1279 AGCCTTTCCCCAGCCAGAGGAGACGGCTCTCCTATCCTCAATGGTGGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 163874 AGCCTTTCCCCAGCCAGAGGAGACGGCTCTCCTATCCTCAATGGTGGGAG 1400 . : . : . : . : . : 1329 TTTGTCTCCAGGAACGGCAGCTGTGGGTGGCTCTTCTTTGGACAGTCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 163924 TTTGTCTCCAGGAACGGCAGCTGTGGGTGGCTCTTCTTTGGACAGTCCTG 1450 . : . : . : . : . : 1379 TACAGGCCATATCTCCAAGTACTCCATCTGCTCCTGAAGGATACGACCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 163974 TACAGGCCATATCTCCAAGTACTCCATCTGCTCCTGAAGGATACGACCTG 1500 . : . : . : . : . : 1429 AAAATAGGACTTTCTTTGGCCCCCCGACGAGGATCACTACCAGATCAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164024 AAAATAGGACTTTCTTTGGCCCCCCGACGAGGATCACTACCAGATCAGAA 1550 . : . : . : . : . : 1479 AGATCTGAGATTAGGATCCATAGATCTGAATTGGGATCTGAAACCCGCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164074 AGATCTGAGATTAGGATCCATAGATCTGAATTGGGATCTGAAACCCGCTT 1600 . : . : . : . : . : 1529 CCAGTAGTAATCCCATGGATGGCATGGACAATAGGACAGTTGGGGGAAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164124 CCAGTAGTAATCCCATGGATGGCATGGACAATAGGACAGTTGGGGGAAGT 1650 . : . : . : . : . : 1579 ATGAGACACCCTCCTGAACAGACAAATGGTGTGCATACCCCACCTCACGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164174 ATGAGACACCCTCCTGAACAGACAAATGGTGTGCATACCCCACCTCACGT 1700 . : . : . : . : . : 1629 GGCCAGTGCCCTTGCAGGGGCCGTCTCCCCAGGTGCCCTGCGTCGGAGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164224 GGCCAGTGCCCTTGCAGGGGCCGTCTCCCCAGGTGCCCTGCGTCGGAGTC 1750 . : . : . : . : . : 1679 TGGAAGCCATCAAAGCGATGTCCTCCAAAGGCCCCTCGGCCTCTGCAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164274 TGGAAGCCATCAAAGCGATGTCCTCCAAAGGCCCCTCGGCCTCTGCAGCA 1800 . : . : . : . : . : 1729 CTAAGTCCTCCTCTTGGGTCTTCTCCAGGCTCTCCTGGGAGCCAGAGTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164324 CTAAGTCCTCCTCTTGGGTCTTCTCCAGGCTCTCCTGGGAGCCAGAGTTT 1850 . : . : . : . : . : 1779 GAGCAGTGGAGAAACAGTGCCCATCCCTCGCCCAGGGCCTGCCCAAGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164374 GAGCAGTGGAGAAACAGTGCCCATCCCTCGCCCAGGGCCTGCCCAAGGAG 1900 . : . : . : . : . : 1829 ATGGACATTCCTTACCTCCCATTGCTCGCCGCCTGGGCCACCACCCTCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164424 ATGGACATTCCTTACCTCCCATTGCTCGCCGCCTGGGCCACCACCCTCCA 1950 . : . : . : . : . : 1879 CAGTCCCTAAATGTTGGCAAACCCCTATACCAGAGTATGAACTGCAAGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164474 CAGTCCCTAAATGTTGGCAAACCCCTATACCAGAGTATGAACTGCAAGCC 2000 . : . : . : . : . : 1929 CATGCAGATGTACGTGCTGGACATTAAAGACACCAAGGAGAAGGGGCGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164524 CATGCAGATGTACGTGCTGGACATTAAAGACACCAAGGAGAAGGGGCGGG 2050 . : . : . : . : . : 1979 TCAAATGGAAAGTATTTAATAGCAGTTCTGTGGTTGGACCTCCTGAAACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164574 TCAAATGGAAAGTATTTAATAGCAGTTCTGTGGTTGGACCTCCTGAAACC 2100 . : . : . : . : . : 2029 AGCCTGCATACCGTGGTACAAGGCAGGGGTGAACTCATCATATTTGGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164624 AGCCTGCATACCGTGGTACAAGGCAGGGGTGAACTCATCATATTTGGAGG 2150 . : . : . : . : . : 2079 ACTCATGGACAAGAAACAGAATGTGAAGTACTATCCAAAAACAAACGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164674 ACTCATGGACAAGAAACAGAATGTGAAGTACTATCCAAAAACAAACGCCT 2200 . : . : 2129 TGTACTTTGTACGAGCAAAGAGA ||||||||||||||||||||||| 164724 TGTACTTTGTACGAGCAAAGAGA