seq1 = pF1KA1331.tfa, 1767 bp seq2 = pF1KA1331/gi568815595f_185486414.tfa (gi568815595f:185486414_185729841), 243428 bp >pF1KA1331 1767 >gi568815595f:185486414_185729841 (Chr3) 1-101 (100001-100101) 100% -> 102-157 (103701-103756) 100% -> 158-291 (111999-112132) 100% -> 292-358 (112545-112611) 100% -> 359-449 (114352-114442) 100% -> 450-618 (119917-120085) 100% -> 619-722 (122834-122937) 100% -> 723-817 (125238-125332) 100% -> 818-869 (126194-126245) 100% -> 870-933 (126932-126995) 98% -> 934-1110 (128151-128327) 100% -> 1111-1242 (131067-131198) 100% -> 1243-1446 (132886-133089) 100% -> 1447-1526 (135413-135492) 100% -> 1527-1611 (137585-137669) 100% -> 1612-1707 (139885-139980) 100% -> 1708-1767 (143369-143428) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGTACAGATGGCTGGTTAGGATTCTCGGCACCATTTTCCGTTTCTGCGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGTACAGATGGCTGGTTAGGATTCTCGGCACCATTTTCCGTTTCTGCGA 50 . : . : . : . : . : 51 CCGGTCGGTGCCCCCTGCCCGGGCCCTCCTGAAGAGGCGGCGCTCAGACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 CCGGTCGGTGCCCCCTGCCCGGGCCCTCCTGAAGAGGCGGCGCTCAGACA 100 . : . : . : . : . : 101 G CACTCTGTTTTCTACAGTGGACACTGATGAAATACCAGCC |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 GGTG...CAGCACTCTGTTTTCTACAGTGGACACTGATGAAATACCAGCC 150 . : . : . : . : . : 142 AAAAGACCAAGATTAG ATTGCTTTATTCACCAAGTGAAAAA ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 103741 AAAAGACCAAGATTAGGTA...TAGATTGCTTTATTCACCAAGTGAAAAA 200 . : . : . : . : . : 183 CAGTCTCTACAATGCTGCCAGCTTATTTGGATTCCCATTCCAGCTGACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112024 CAGTCTCTACAATGCTGCCAGCTTATTTGGATTCCCATTCCAGCTGACCA 250 . : . : . : . : . : 233 CAAAGCCCATGGTAACTTCTGCTTGTAATGGAACACGGAATGTGGCCCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112074 CAAAGCCCATGGTAACTTCTGCTTGTAATGGAACACGGAATGTGGCCCCT 300 . : . : . : . : . : 283 TCAGGAGAG GTATTTTCGAACTCTTCATCTTGTGAACTGAC |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| 112124 TCAGGAGAGGTC...AAGGTATTTTCGAACTCTTCATCTTGTGAACTGAC 350 . : . : . : . : . : 324 AGGTTCTGGATCCTGGAACAACATGCTGAAACTGG GTAATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 112577 AGGTTCTGGATCCTGGAACAACATGCTGAAACTGGGTG...TAGGTAATA 400 . : . : . : . : . : 365 AATCTCCTAATGGAATAAGTGACTATCCAAAGATCAGAGTGACAGTTACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114358 AATCTCCTAATGGAATAAGTGACTATCCAAAGATCAGAGTGACAGTTACC 450 . : . : . : . : . : 415 CGAGATCAGCCACGCAGAGTCCTGCCTTCCTTTGG TTTTAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 114408 CGAGATCAGCCACGCAGAGTCCTGCCTTCCTTTGGGTA...CAGTTTTAC 500 . : . : . : . : . : 456 TTTGAACTCAGAAGGCTGTAATAGAAGACCAGGTGGCCGTCGCCATAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119923 TTTGAACTCAGAAGGCTGTAATAGAAGACCAGGTGGCCGTCGCCATAGCA 550 . : . : . : . : . : 506 AAGGTAATCCAGAGAGTTCTTTAATGTGGAAACCTCAGGAACAGGCTGTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119973 AAGGTAATCCAGAGAGTTCTTTAATGTGGAAACCTCAGGAACAGGCTGTA 600 . : . : . : . : . : 556 ACAGAGATGATTTCTGAAGAGAGTGGCAAGGGTCTGAGGCGTCCCCATTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120023 ACAGAGATGATTTCTGAAGAGAGTGGCAAGGGTCTGAGGCGTCCCCATTG 650 . : . : . : . : . : 606 TACTGTGGAGGAG GGTGTTCAAAAAGAGGAAAGAGAGAAGT |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 120073 TACTGTGGAGGAGGTA...TAGGGTGTTCAAAAAGAGGAAAGAGAGAAGT 700 . : . : . : . : . : 647 ACCGAAAGTTATTGGAACGACTTAAAGAAAGTGGTCATGGAAACTCTGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122862 ACCGAAAGTTATTGGAACGACTTAAAGAAAGTGGTCATGGAAACTCTGTC 750 . : . : . : . : . : 697 TGTCCTGTAACTTCAAATTATCACAG TTCTCAAAGAAGTCA ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 122912 TGTCCTGTAACTTCAAATTATCACAGGTG...AAGTTCTCAAAGAAGTCA 800 . : . : . : . : . : 738 GATGGACACATTAAAGACCAAAGGCTGGGGGGAAGAGCAAAATCACGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125253 GATGGACACATTAAAGACCAAAGGCTGGGGGGAAGAGCAAAATCACGGAG 850 . : . : . : . : . : 788 TCAAAACAACTCAGTTTGTTCCAAAACAAT ATAGACTTGTT ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 125303 TCAAAACAACTCAGTTTGTTCCAAAACAATGTG...CAGATAGACTTGTT 900 . : . : . : . : . : 829 GAAACAAGGGGACCTCTATGTTCATTGAGAAGTGAAAAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 126205 GAAACAAGGGGACCTCTATGTTCATTGAGAAGTGAAAAGAGGTA...TAG 950 . : . : . : . : . : 870 GTGTTCAAAGGGGAAAATTACTGATACAGAGAAGATGGTCGGAATCAGAT |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| 126932 GTGTTCAAAGGGGAAAATTACTGATACAGAGACGATGGTCGGAATCAGAT 1000 . : . : . : . : . : 920 TTGAAAATGAAAGT AGGAGGGGATACCAACTGGAGCCTGAC ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 126982 TTGAAAATGAAAGTGTA...CAGAGGAGGGGATACCAACTGGAGCCTGAC 1050 . : . : . : . : . : 961 CTATCAGAAGAAGTGTCGGCCCGACTCCGCCTGGGCAGTGGAAGCAATGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128178 CTATCAGAAGAAGTGTCGGCCCGACTCCGCCTGGGCAGTGGAAGCAATGG 1100 . : . : . : . : . : 1011 CTTACTCAGGAGGAAAGTGTCAATAATTGAGACAAAGGAAAAGAATTGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128228 CTTACTCAGGAGGAAAGTGTCAATAATTGAGACAAAGGAAAAGAATTGCT 1150 . : . : . : . : . : 1061 CAGGCAAAGAGAGGGACAGAAGAACGGACGATCTCCTTGAACTTACAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128278 CAGGCAAAGAGAGGGACAGAAGAACGGACGATCTCCTTGAACTTACAGAG 1200 . : . : . : . : . : 1111 GACATGGAAAAGGAAATCAGTAATGCCCTAGGCCATGGCCC >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128328 GTA...CAGGACATGGAAAAGGAAATCAGTAATGCCCTAGGCCATGGCCC 1250 . : . : . : . : . : 1152 ACAGGATGAAATCCTAAGTAGTGCTTTCAAATTGCGAATTACTCGAGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131108 ACAGGATGAAATCCTAAGTAGTGCTTTCAAATTGCGAATTACTCGAGGAG 1300 . : . : . : . : . : 1202 ATATTCAGACATTAAAGAACTATCACTGGCTCAATGATGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 131158 ATATTCAGACATTAAAGAACTATCACTGGCTCAATGATGAAGTA...TAG 1350 . : . : . : . : . : 1243 GTCATTAATTTTTACATGAATCTTCTGGTGGAAAGAAATAAAAAGCAAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 132886 GTCATTAATTTTTACATGAATCTTCTGGTGGAAAGAAATAAAAAGCAAGG 1400 . : . : . : . : . : 1293 CTATCCAGCACTTCATGTATTCAGTACTTTCTTCTATCCTAAATTAAAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 132936 CTATCCAGCACTTCATGTATTCAGTACTTTCTTCTATCCTAAATTAAAGT 1450 . : . : . : . : . : 1343 CTGGGGGTTACCAAGCAGTGAAACGATGGACCAAAGGGGTAAATCTCTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 132986 CTGGGGGTTACCAAGCAGTGAAACGATGGACCAAAGGGGTAAATCTCTTT 1500 . : . : . : . : . : 1393 GAACAAGAAATTATTCTGGTGCCTATTCATCGGAAGGTACATTGGAGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 133036 GAACAAGAAATTATTCTGGTGCCTATTCATCGGAAGGTACATTGGAGCCT 1550 . : . : . : . : . : 1443 GGTG GTGATTGACCTAAGAAAAAAGTGTCTTAAATATCTGG ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 133086 GGTGGTG...TAGGTGATTGACCTAAGAAAAAAGTGTCTTAAATATCTGG 1600 . : . : . : . : . : 1484 ATTCTATGGGACAAAAGGGCCACAGGATCTGTGAGATTCTCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 135450 ATTCTATGGGACAAAAGGGCCACAGGATCTGTGAGATTCTCCTGTA...T 1650 . : . : . : . : . : 1527 TCAGTATTTACAGGATGAAAGTAAGACCAAAAGAAATAGTGATCTGAA >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 137583 AGTCAGTATTTACAGGATGAAAGTAAGACCAAAAGAAATAGTGATCTGAA 1700 . : . : . : . : . : 1575 TCTTTTAGAGTGGACCCATCACAGCATGAAACCACAC GAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 137633 TCTTTTAGAGTGGACCCATCACAGCATGAAACCACACGTG...TAGGAGA 1750 . : . : . : . : . : 1616 TTCCTCAACAGCTGAATGGGAGTGATTGTGGAATGTTTACTTGTAAATAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139889 TTCCTCAACAGCTGAATGGGAGTGATTGTGGAATGTTTACTTGTAAATAT 1800 . : . : . : . : . : 1666 GCAGATTATATTTCTAGGGACAAACCTATCACATTTACTCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 139939 GCAGATTATATTTCTAGGGACAAACCTATCACATTTACTCAGGTG...CA 1850 . : . : . : . : . : 1708 CACCAGATGCCTCTCTTCCGGAAGAAGATGGTGTGGGAAATCCTTCATC >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 143368 GCACCAGATGCCTCTCTTCCGGAAGAAGATGGTGTGGGAAATCCTTCATC 1900 . : 1757 AGCAGTTGCTG ||||||||||| 143418 AGCAGTTGCTG