Result of FASTA (ccds) for pF1KA1204
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1204, 1444 aa
  1>>>pF1KA1204 1444 - 1444 aa - 1444 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8341+/-0.00102; mu= -5.6649+/- 0.061
 mean_var=349.9365+/-71.558, 0's: 0 Z-trim(114.1): 124  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.068561
 statistics sampled from 14603 (14724) to 14603 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.752), E-opt: 0.2 (0.452), width:  16
 Scan time:  5.890

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43135.1 ARHGAP31 gene_id:57514|Hs108|chr3      (1444) 9692 973.7       0
CCDS31718.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11      (1738) 1158 129.6 7.9e-29
CCDS44769.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11      (2087) 1158 129.7 9.2e-29
CCDS12477.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19    (1126) 1059 119.7 4.9e-26
CCDS54254.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19    (1123) 1054 119.2 6.9e-26
CCDS1215.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs108|chr1      ( 890) 1000 113.8 2.3e-24
CCDS30918.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs108|chr1     (1101) 1000 113.9 2.8e-24


>>CCDS43135.1 ARHGAP31 gene_id:57514|Hs108|chr3           (1444 aa)
 initn: 9692 init1: 9692 opt: 9692  Z-score: 5194.3  bits: 973.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9692; 99.9% identity (100.0% similar) in 1444 aa overlap (1-1444:1-1444)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MKNKGAKQKLKRKGAASAFGCDLTEYLESSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLSGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MKNKGAKQKLKRKGAASAFGCDLTEYLESSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLSGV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 TSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDIHCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEAVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDIHCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEAVS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 HCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNLLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNLLR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 SKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFNNGAPGSLENDENRPIMKSLTLPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFNNGAPGSLENDENRPIMKSLTLPA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 LSLPMKLVSLEEAQARSLATNHPARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LSLPMKLVSLEEAQARSLATNHPARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 SKKWKSIFNLGRSGSDSKSKLSRNGSVFVRGQRLSVEKATIRPAKSMDSLCSVPVEGKET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SKKWKSIFNLGRSGSDSKSKLSRNGSVFVRGQRLSVEKATIRPAKSMDSLCSVPVEGKET
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 KGNFNRTVTTGGFFIPATKMHSTGTGSSCDLTKQEGEWGQEGMPPGAEGGFDVSSDRSHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KGNFNRTVTTGGFFIPATKMHSTGTGSSCDLTKQEGEWGQEGMPPGAEGGFDVSSDRSHL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 QGAQARPPPEQLKVFRPVEDPESEQTAPKMLGMFYTSNDSPSKSVFTSSLFQMEPSPRNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QGAQARPPPEQLKVFRPVEDPESEQTAPKMLGMFYTSNDSPSKSVFTSSLFQMEPSPRNQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 RKALNISEPFAVSVPLRVSAVISTNSTPCRTPPKELQSLSSLEEFSFHGSESGGWPEEEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RKALNISEPFAVSVPLRVSAVISTNSTPCRTPPKELQSLSSLEEFSFHGSESGGWPEEEK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 PLGAETSAASVPKKAGLEDAKAVPEAPGTVECSKGLSQEPGAHLEEKKTPESSLSSQHLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PLGAETSAASVPKKAGLEDAKAVPEAPGTVECSKGLSQEPGAHLEEKKTPESSLSSQHLN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 ELEKRPNPEKVVEEGREAGEMESSTLQESPRARAEAVLLHEMDEDDLANALIWPEIQQEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ELEKRPNPEKVVEEGREAGEMESSTLQESPRARAEAVLLHEMDEDDLANALIWPEIQQEL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 KIIESEEELSSLPPPALKTSPIQPILESSLGPFIPSEPPGSLPCGSFPAPVSTPLEVWTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KIIESEEELSSLPPPALKTSPIQPILESSLGPFIPSEPPGSLPCGSFPAPVSTPLEVWTR
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 DPANQSTQGASTAASREKPEPEQGLHPDLASLAPLEIVPFEKASPQATVEVGGPGNLSPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DPANQSTQGASTAASREKPEPEQGLHPDLASLAPLEIVPFEKASPQATVEVGGPGNLSPP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 LPPAPPPPTPLEESTPVLLSKGSPEREDSSRKLRTDLYIDQLKSQDSPEISSLCQGEEAT
       ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LPPAPPPPTPLEESTPVLLSKGGPEREDSSRKLRTDLYIDQLKSQDSPEISSLCQGEEAT
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 PRHSDKQNSKNAASEGKGCGFPSPTREVEIVSQEEEDVTHSVQEPSDCDEDDTVTDIAQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PRHSDKQNSKNAASEGKGCGFPSPTREVEIVSQEEEDVTHSVQEPSDCDEDDTVTDIAQH
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 GLEMVEPWEEPQWVTSPLHSPTLKDAHKAQVQGLQGHQLEKRLSHRPSLRQSHSLDSKPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GLEMVEPWEEPQWVTSPLHSPTLKDAHKAQVQGLQGHQLEKRLSHRPSLRQSHSLDSKPT
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 VKSQWTLEVPSSSSCANLETERNSDPLQPQAPRREITGWDEKALRSFREFSGLKGAEAPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VKSQWTLEVPSSSSCANLETERNSDPLQPQAPRREITGWDEKALRSFREFSGLKGAEAPP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 NQKGPSGVQPNPAETSPISLAEGKELGTHLGHSSPQIRQGGVPGPESSKESSPSVQDSTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NQKGPSGVQPNPAETSPISLAEGKELGTHLGHSSPQIRQGGVPGPESSKESSPSVQDSTS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 PGEHPAKLQLKSTECGPPKGKNRPSSLNLDPAIPIADLFWFENVASFSSPGMQVSEPGDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PGEHPAKLQLKSTECGPPKGKNRPSSLNLDPAIPIADLFWFENVASFSSPGMQVSEPGDP
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA1 KVTWMTSSYCKADPWRVYSQDPQDLDIVAHALTGRRNSAPVSVSAVRTSFMVKMCQARAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KVTWMTSSYCKADPWRVYSQDPQDLDIVAHALTGRRNSAPVSVSAVRTSFMVKMCQARAV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA1 PVIPPKIQYTQIPQPLPSQSSGENGVQPLERSQEGPSSTSGTTQKPAKDDSPSSLESSKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PVIPPKIQYTQIPQPLPSQSSGENGVQPLERSQEGPSSTSGTTQKPAKDDSPSSLESSKE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA1 EKPKQDPGAIKSSPVDATAPCMCEGPTLSPEPGSSNLLSTQDAVVQCRKRMSETEPSGDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EKPKQDPGAIKSSPVDATAPCMCEGPTLSPEPGSSNLLSTQDAVVQCRKRMSETEPSGDN
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA1 LLSSKLERPSGGSKPFHRSRPGRPQSLILFSPPFPIMDHLPPSSTVTDSKVLLSPIRSPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LLSSKLERPSGGSKPFHRSRPGRPQSLILFSPPFPIMDHLPPSSTVTDSKVLLSPIRSPT
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA1 QTVSPGLLCGELAENTWVTPEGVTLRNKMTIPKNGQRLETSTSCFYQPQRRSVILDGRSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QTVSPGLLCGELAENTWVTPEGVTLRNKMTIPKNGQRLETSTSCFYQPQRRSVILDGRSG
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

           
pF1KA1 RQIE
       ::::
CCDS43 RQIE
           

>>CCDS31718.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11           (1738 aa)
 initn: 1168 init1: 964 opt: 1158  Z-score: 631.1  bits: 129.6 E(32554): 7.9e-29
Smith-Waterman score: 1341; 28.8% identity (52.8% similar) in 1478 aa overlap (1-1366:1-1386)

               10          20        30        40        50        
pF1KA1 MKNKGAKQKLKRKGAAS--AFGCDLTEYLESSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLS
       ::.. .:::::..:  .  .::::: :.: .:: .:: ::.::. ::: .::::::::::
CCDS31 MKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLLNSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLS
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KA1 GVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDIHCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEA
       ::.:::::::.:: :.. ::::.: :.:::: :::::::::::::::::::.:::::..:
CCDS31 GVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDIHSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDA
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KA1 VSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNL
       ::   .: .: .:..:::.::: ::::::.:.:::. .:.. : :::::.:::.::::::
CCDS31 VSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEFLMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNL
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220          230     
pF1KA1 LRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFNNGAPGSLENDE---NRPIMKS
       ::::.::..  .: :::. ::.:.::.:::::::: .:..    ....     .::  ::
CCDS31 LRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFILNHVDVLFSGRISMAMQEGAASLSRP--KS
              190       200       210       220       230          

         240       250        260       270       280       290    
pF1KA1 LTLPALSLPMKLVSLEEAQARSLA-TNHPARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNK
       : . . :   ::..:::::::. : .: :   : .   . :    .   :::..:.: ..
CCDS31 LLVSSPS--TKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLER
      240         250       260       270       280       290      

          300            310       320       330           340     
pF1KA1 RKLSSKSKK-----WKSIFNLGRSGSDSKSKLSRNGSVFVRGQRLSVE----KATIRPAK
       .. ..: ::     :.:.::::.:.: :: ::.:: :   . . ....    ..:.: ::
CCDS31 KRPQNKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKRKLQRNESEPSEMKAMALKGGRAEGTLRSAK
        300       310       320       330       340       350      

         350       360       370       380          390       400  
pF1KA1 SMDSLCSVPVEGKETKGNFNRTVTTGGFFIPATKMHSTGTGSSC---DLTKQEGEWGQEG
       : .:: :. .   ..:    :   ...  . :. ...   :. :   :   ...:  .::
CCDS31 SEESLTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDALSAS-FNGEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEG
        360       370       380        390       400       410     

                  410       420       430       440       450      
pF1KA1 ----MPP--GAEGGFDVSSDRSHLQGAQARPPPEQLKVFRPVEDPESEQTAPKMLGMFYT
           .:   . ... ::. .   .  :.    : ...   :  . :  ... ..:     
CCDS31 GLLHIPALMSPHSAEDVDLSPPDIGVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSPGY
         420       430       440       450       460       470     

        460          470       480       490         500       510 
pF1KA1 SNDSPS---KSVFTSSLFQMEPSPRNQRKALNISEPFAVSVPL--RVSAVISTNSTPCRT
       :.:.::   :.. :.:   . :.   .      ::: .   ::  ..:  .. . .:  :
CCDS31 SKDKPSANKKDAETGSSQCQTPGSTAS------SEPVS---PLQEKLSPFFTLDLSP--T
         480       490       500                510       520      

             520       530       540       550       560       570 
pF1KA1 PPKELQSLSSLEEFSFHGSESGGWPEEEKPLGAETSAASVPKKAGLEDAKAVPEAPGTVE
         :  .  :  :.  .  : . :    ..:      . :. .  ..     : :. ::: 
CCDS31 EDKSSKPSSFTEKVVYAFSPKIGRKLSKSP------SMSISEPISVTLPPRVSEVIGTV-
          530       540       550             560       570        

             580       590       600       610       620       630 
pF1KA1 CSKGLSQEPGAHLEEKKTPESSLSSQHLNELEKRPNPEKVVEEGREAGEMESSTLQESPR
        :.  .:. ..   .: . : . ...  ... :  . : :..:. :      : .:   .
CCDS31 -SNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQIVKMKTNETVAQEAYE------SEVQPLDQ
        580       590       600       610       620             630

             640       650       660       670       680       690 
pF1KA1 ARAEAVLLHEMDEDDLANALIWPEIQQELKIIESEEELSSLPPPALKTSPIQPILESSLG
       . :: : :   ........        . : . : .  ..    :.  .: :  .  :  
CCDS31 VAAEEVELPGKEDQSVSSS--------QSKAVASGQTQTG----AVTHDPPQDSVPVSSV
              640               650       660           670        

             700       710       720             730       740     
pF1KA1 PFIPSEPPGSLPCGSFPAPVSTPLEVWTRDPANQ-STQ-----GASTAASREKPE-----
        .::  ::        :  :.  : .   . :.: :::     :.: :.  .  .     
CCDS31 SLIPPPPP--------PKNVARMLALALAESAQQASTQSLKRPGTSQAGYTNYGDIAVAT
      680               690       700       710       720       730

              750       760         770       780       790        
pF1KA1 PEQGLHPDLASLAPLEIVPFEKASP--QATVEVGGPGNLSPPLPPAPPPPTPLEESTP--
        :..:  . ...: :. . :.   :  :  .. ..::: . ::: .     : . .:   
CCDS31 TEDNLSSSYSAVA-LDKAYFQTDRPAEQFHLQNNAPGNCDHPLPETTATGDPTHSNTTES
              740        750       760       770       780         

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pF1KA1 ------VLLSKGSPERE----DSSRKLRTDLYIDQLKSQDS-------------PEISSL
             : :. ..:..     :  .   :.. .:. ::.:              : .: :
CCDS31 GEQHHQVDLTGNQPHQAYLSGDPEKARITSVPLDSEKSDDHVSFPEDQSGKNSMPTVSFL
     790       800       810       820       830       840         

           840         850       860       870       880       890 
pF1KA1 CQGEEATPRH--SDKQNSKNAASEGKGCGFPSPTREVEIVSQEEEDVTHSVQEPSDCDED
        : ... ::   .:.  :  .::  :   .  : . ..      .  . ..  ::   :.
CCDS31 DQ-DQSPPRFYSGDQPPSYLGASVDK---LHHPLEFADKSPTPPNLPSDKIYPPSGSPEE
     850        860       870          880       890       900     

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pF1KA1 DTVTDIAQHGLEMVEPW------EEPQWVTSPLHSPTLKDAHKAQVQGLQGHQLEKRLSH
       .: :  :      . :       .: .: ..  ..::  :   : .:  . :. .. :  
CCDS31 NTST--ATMTYMTTTPATAQMSTKEASWDVA--EQPTTADFAAATLQ--RTHRTNRPLPP
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pF1KA1 RPSLRQSHSLDSKPTVKSQWTLEVPSSSSCANLETERNSDPLQPQAPRREITGWDEKALR
        :: :...    .: : .:  ... .. .  : .  ..  :.  . :  :  . :. :  
CCDS31 PPSQRSAE----QPPVVGQ--VQAATNIGLNNSHKVQGVVPVPERPP--EPRAMDDPA-S
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        1010      1020      1030      1040       1050      1060    
pF1KA1 SFREFSGLKGAEAPPNQKGPSGVQPNPAETSPISLAEGKELGT-HLGHSSPQIRQGGVPG
       .:   ::  .:. :      ..:::.     : .. .: ..   ::   :   .  : :.
CCDS31 AFISDSGAAAAQCPM----ATAVQPG----LPEKVRDGARVPLLHLRAESVPAHPCGFPA
             1020          1030          1040      1050      1060  

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pF1KA1 P-------ESSKESS--PSVQDSTSPGEHPAKLQLKSTECGPPKGKNRPSSLNLDPAIPI
       :       ::.  ..   :  :.:: ... . .  .::           ..: :   .: 
CCDS31 PLPPTRMMESKMIAAIHSSSADATSSSNYHSFVTASSTSVD--------DALPLPLPVPQ
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pF1KA1 ADLFWFENV-ASFSSPGMQVSEPGDPK--VTWMTSSYCKADPWRVYSQDPQDLDIVAHAL
             ..: .::. : . ..::  :   . .  .  :.  :  :    :.   .  : .
CCDS31 PKHASQKTVYSSFARPDV-TTEPFGPDNCLHFNMTPNCQYRPQSV---PPHHNKLEQHQV
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pF1KA1 TGRRNSAPVSVSAVRTSFMV----------KMC-QARAVPVIPPKIQYTQIPQPLPSQSS
        : :.  :.:..   .....          : : ... :  .  ... :  :. .:   .
CCDS31 YGARSEPPASMGLRYNTYVAPGRNASGHHSKPCSRVEYVSSLSSSVRNTCYPEDIPPYPT
             1180      1190      1200      1210      1220      1230

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pF1KA1 GENGVQPLER--SQEGPSSTSGTTQKPAKDDSPSSLESSKEEKPKQDPGAIKSSPVDATA
        .  :: :.   :.   :   . :. :  :.     .   . :: :.  : ..  :    
CCDS31 IRR-VQSLHAPPSSMIRSVPISRTEVPPDDEPAYCPRPLYQYKPYQSSQARSDYHVTQLQ
              1240      1250      1260      1270      1280         

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pF1KA1 PCMCEGPT---LSPEPGSSN-------LLSTQDAVVQCRKRMSETEPSGD-NLLSSKLER
       : . .: .    ::  .::.        :   ::    . :  .  :. :  . . .:. 
CCDS31 PYFENGRVHYRYSPYSSSSSSYYSPDGALCDVDAYGTVQLRPLHRLPNRDFAFYNPRLQG
    1290      1300      1310      1320      1330      1340         

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pF1KA1 PSGGSKPFHRSRPGRPQSLILFSPPFPIMDHLPPSSTVTDSKVLLSPIRSPTQTVSPGLL
        :  :      :: : .    :::    .  .::.. :                      
CCDS31 KSLYSYAGLAPRP-RANVTGYFSPNDHNVVSMPPAADVKHTYTSWDLEDMEKYRMQSIRR
    1350      1360       1370      1380      1390      1400        

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pF1KA1 CGELAENTWVTPEGVTLRNKMTIPKNGQRLETSTSCFYQPQRRSVILDGRSGRQIE    
                                                                   
CCDS31 ESRARQKVKGPVMSQYDNMTPAVQDDLGGIYVIHLRSKSDPGKTGLLSVAEGKESRHAAK
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>>CCDS44769.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11           (2087 aa)
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pF1KA1                               MKNKGAKQKLKRKGAAS--AFGCDLTEYLE
                                     ::.. .:::::..:  .  .::::: :.: 
CCDS44 NQKVPQSVTNSVPKPVSKKHGKLITFLRTFMKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLL
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pF1KA1 SSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLSGVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDI
       .:: .:: ::.::. ::: .::::::::::::.:::::::.:: :.. ::::.: :.:::
CCDS44 NSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDI
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pF1KA1 HCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEAVSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEY
       : :::::::::::::::::::.:::::..:::   .: .: .:..:::.::: ::::::.
CCDS44 HSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEF
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pF1KA1 LIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFI
       :.:::. .:.. : :::::.:::.::::::::::.::..  .: :::. ::.:.::.:::
CCDS44 LMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFI
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pF1KA1 LNHVDQIFNNGAPGSLENDE---NRPIMKSLTLPALSLPMKLVSLEEAQARSLA-TNHPA
       ::::: .:..    ....     .::  ::: . . :   ::..:::::::. : .: : 
CCDS44 LNHVDVLFSGRISMAMQEGAASLSRP--KSLLVSSPS--TKLLTLEEAQARTQAQVNSPI
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pF1KA1 RKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSKSKK-----WKSIFNLGRSGSDSKS
         : .   . :    .   :::..:.: .... ..: ::     :.:.::::.:.: :: 
CCDS44 VTENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQNKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKR
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pF1KA1 KLSRNGSVFVRGQRLSVE----KATIRPAKSMDSLCSVPVEGKETKGNFNRTVTTGGFFI
       ::.:: :   . . ....    ..:.: ::: .:: :. .   ..:    :   ...  .
CCDS44 KLQRNESEPSEMKAMALKGGRAEGTLRSAKSEESLTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDAL
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        :. ...   :. :   :   ...:  .::    .:   . ... ::. .   .  :.  
CCDS44 SAS-FNGEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHIPALMSPHSAEDVDLSPPDIGVASLD
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         : ...   :  . :  ... ..:     :.:.::   :.. :.:   . :.   .   
CCDS44 FDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKPSANKKDAETGSSQCQTPGSTAS---
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pF1KA1 LNISEPFAVSVPL--RVSAVISTNSTPCRTPPKELQSLSSLEEFSFHGSESGGWPEEEKP
          ::: .   ::  ..:  .. . .:  :  :  .  :  :.  .  : . :    ..:
CCDS44 ---SEPVS---PLQEKLSPFFTLDLSP--TEDKSSKPSSFTEKVVYAFSPKIGRKLSKSP
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pF1KA1 LGAETSAASVPKKAGLEDAKAVPEAPGTVECSKGLSQEPGAHLEEKKTPESSLSSQHLNE
             . :. .  ..     : :. :::  :.  .:. ..   .: . : . ...  ..
CCDS44 ------SMSISEPISVTLPPRVSEVIGTV--SNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQ
                 910       920         930       940       950     

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pF1KA1 LEKRPNPEKVVEEGREAGEMESSTLQESPRARAEAVLLHEMDEDDLANALIWPEIQQELK
       . :  . : :..:. :      : .:   .. :: : :   ........        . :
CCDS44 IVKMKTNETVAQEAYE------SEVQPLDQVAAEEVELPGKEDQSVSSS--------QSK
         960       970             980       990              1000 

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pF1KA1 IIESEEELSSLPPPALKTSPIQPILESSLGPFIPSEPPGSLPCGSFPAPVSTPLEVWTRD
        . : .  ..    :.  .: :  .  :   .::  ::        :  :.  : .   .
CCDS44 AVASGQTQTG----AVTHDPPQDSVPVSSVSLIPPPPP--------PKNVARMLALALAE
            1010          1020      1030              1040         

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pF1KA1 PANQ-STQ-----GASTAASREKPE-----PEQGLHPDLASLAPLEIVPFEKASP--QAT
        :.: :::     :.: :.  .  .      :..:  . ...: :. . :.   :  :  
CCDS44 SAQQASTQSLKRPGTSQAGYTNYGDIAVATTEDNLSSSYSAVA-LDKAYFQTDRPAEQFH
    1050      1060      1070      1080      1090       1100        

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pF1KA1 VEVGGPGNLSPPLPPAPPPPTPLEESTP--------VLLSKGSPERE----DSSRKLRTD
       .. ..::: . ::: .     : . .:         : :. ..:..     :  .   :.
CCDS44 LQNNAPGNCDHPLPETTATGDPTHSNTTESGEQHHQVDLTGNQPHQAYLSGDPEKARITS
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pF1KA1 LYIDQLKSQDS-------------PEISSLCQGEEATPRH--SDKQNSKNAASEGKGCGF
       . .:. ::.:              : .: : : ... ::   .:.  :  .::  :   .
CCDS44 VPLDSEKSDDHVSFPEDQSGKNSMPTVSFLDQ-DQSPPRFYSGDQPPSYLGASVDK---L
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pF1KA1 PSPTREVEIVSQEEEDVTHSVQEPSDCDEDDTVTDIAQHGLEMVEPW------EEPQWVT
         : . ..      .  . ..  ::   :..: :  :      . :       .: .: .
CCDS44 HHPLEFADKSPTPPNLPSDKIYPPSGSPEENTST--ATMTYMTTTPATAQMSTKEASWDV
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pF1KA1 SPLHSPTLKDAHKAQVQGLQGHQLEKRLSHRPSLRQSHSLDSKPTVKSQWTLEVPSSSSC
       .  ..::  :   : .:  . :. .. :   :: :...    .: : .:  ... .. . 
CCDS44 A--EQPTTADFAAATLQ--RTHRTNRPLPPPPSQRSAE----QPPVVGQ--VQAATNIGL
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pF1KA1 ANLETERNSDPLQPQAPRREITGWDEKALRSFREFSGLKGAEAPPNQKGPSGVQPNPAET
        : .  ..  :.  . :  :  . :. :  .:   ::  .:. :      ..:::.    
CCDS44 NNSHKVQGVVPVPERPP--EPRAMDDPA-SAFISDSGAAAAQCPM----ATAVQPG----
           1340        1350       1360      1370          1380     

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pF1KA1 SPISLAEGKELGT-HLGHSSPQIRQGGVPGP-------ESSKESS--PSVQDSTSPGEHP
        : .. .: ..   ::   :   .  : :.:       ::.  ..   :  :.:: ... 
CCDS44 LPEKVRDGARVPLLHLRAESVPAHPCGFPAPLPPTRMMESKMIAAIHSSSADATSSSNYH
            1390      1400      1410      1420      1430      1440 

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pF1KA1 AKLQLKSTECGPPKGKNRPSSLNLDPAIPIADLFWFENV-ASFSSPGMQVSEPGDPK--V
       . .  .::           ..: :   .:       ..: .::. : . ..::  :   .
CCDS44 SFVTASSTSVD--------DALPLPLPVPQPKHASQKTVYSSFARPDV-TTEPFGPDNCL
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pF1KA1 TWMTSSYCKADPWRVYSQDPQDLDIVAHALTGRRNSAPVSVSAVRTSFMV----------
        .  .  :.  :  :    :.   .  : . : :.  :.:..   .....          
CCDS44 HFNMTPNCQYRPQSV---PPHHNKLEQHQVYGARSEPPASMGLRYNTYVAPGRNASGHHS
           1500         1510      1520      1530      1540         

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pF1KA1 KMC-QARAVPVIPPKIQYTQIPQPLPSQSSGENGVQPLER--SQEGPSSTSGTTQKPAKD
       : : ... :  .  ... :  :. .:   . .  :: :.   :.   :   . :. :  :
CCDS44 KPCSRVEYVSSLSSSVRNTCYPEDIPPYPTIRR-VQSLHAPPSSMIRSVPISRTEVPPDD
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pF1KA1 DSPSSLESSKEEKPKQDPGAIKSSPVDATAPCMCEGPT---LSPEPGSSN-------LLS
       .     .   . :: :.  : ..  :    : . .: .    ::  .::.        : 
CCDS44 EPAYCPRPLYQYKPYQSSQARSDYHVTQLQPYFENGRVHYRYSPYSSSSSSYYSPDGALC
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pF1KA1 TQDAVVQCRKRMSETEPSGD-NLLSSKLERPSGGSKPFHRSRPGRPQSLILFSPPFPIMD
         ::    . :  .  :. :  . . .:.  :  :      :: : .    :::    . 
CCDS44 DVDAYGTVQLRPLHRLPNRDFAFYNPRLQGKSLYSYAGLAPRP-RANVTGYFSPNDHNVV
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pF1KA1 HLPPSSTVTDSKVLLSPIRSPTQTVSPGLLCGELAENTWVTPEGVTLRNKMTIPKNGQRL
        .::.. :                                                    
CCDS44 SMPPAADVKHTYTSWDLEDMEKYRMQSIRRESRARQKVKGPVMSQYDNMTPAVQDDLGGI
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>>CCDS12477.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19         (1126 aa)
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pF1KA1                               MKNKGAKQKLKRKGA--ASAFGCDLTEYLE
                                     :... ..:.:...:     .::::: :.: 
CCDS12 CGIPAPQGISSLTSAVPRPRGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLS
            270       280       290       300       310       320  

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pF1KA1 SSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLSGVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDI
       .:::::: ::. :.::::.::.::::::::::.:::::::.:: :.. :.:.  ..::::
CCDS12 NSGQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDI
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pF1KA1 HCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEAVSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEY
       : :.:::::::::::::::::.:: ::.::.:   :: .:.:...:::.::: :::::::
CCDS12 HSVSSLCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEY
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pF1KA1 LIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFI
       :.::::..:  :..:.:::::::.::::::::: :.:..: .: :::  ::::.::.::.
CCDS12 LLRHLARMARHSANTSMHARNLAIVWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSVVVEFL
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pF1KA1 LNHVDQIFNNGAPGSLENDENRPIMKSLTLPALSLP-MKLVSLEEAQARSLAT-NHPARK
       :.::: .:..   ..  .  .: ..      : : :  .:..:::::::. .  . :.  
CCDS12 LTHVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCLLPRPKSLAGSCPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTPT--
            510       520       530       540       550       560  

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pF1KA1 ERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSKSKKWKSIFNLGRSGSDSKSK-LSRNG
          : . :.   : .   .   :  ...:: ...:  ::..: :::. :  ..: :   :
CCDS12 ---EPTTPKA--PASPAERRKGERGEKQRKPGGSS--WKTFFALGRGPSVPRKKPLPWLG
                   570       580       590         600       610   

         330         340       350       360       370       380   
pF1KA1 SVFVRGQRLSV--EKATIRPAKSMDSLCSVPVEGKETKGNFNRTVTTGGFFIPATKMHST
       .. .  :  .   . .:.: ::: .:: :  . : :  :       .::    ::   . 
CCDS12 GTRAPPQPSGSRPDTVTLRSAKSEESLSS-QASGAELLG-------AGGAPASATPTPAL
           620       630       640        650              660     

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pF1KA1 GTGSSCDLTKQEGEWGQEGMPP----GAEGGF-DVSSDR--SHLQGAQARPPPEQLKVFR
       . : :           .  . :    :::. . :. ...  :.:.:::.   :.      
CCDS12 SPGRSL----------RPHLIPLLLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLGPD------
         670                 680       690       700               

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pF1KA1 PVEDPESEQTAPKMLGMFYTSNDSPSKSVFTSSLFQMEPSPRNQRKALNISEPFAVSVPL
        .:.:      :  :...  ..  :             : :.:  . .      :...  
CCDS12 -MESP----LPPPPLSLLRPGGAPP-------------PPPKNPARLM------ALALAE
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pF1KA1 RVSAVISTNSTP-CRTPPKELQSLSSLEEFSFHGS---ESGGWPEEEKPLGAETSAASVP
       :.. :   .:   :   :   ::        :: :   : ::     .:::  ::... :
CCDS12 RAQQVAEQQSQQECGGTPPASQS-------PFHRSLSLEVGG-----EPLG--TSGSGPP
         750       760              770       780              790 

            560       570       580       590       600       610  
pF1KA1 KKAGLEDAKAVPEAPGTVECSKGLSQEPGAHLEEKKTPESSLSSQHLNELEKRPNPEKVV
        ..  . .  ::  :  .       :.  . : ... : .. : . :    .     .. 
CCDS12 PNSLAHPGAWVPGPPPYLP-----RQQSDGSLLRSQRPMGT-SRRGLRGPAQVSAQLRAG
             800       810            820        830       840     

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pF1KA1 EEGREAGEMESSTLQESPRARAEAVLLHEMDEDDLANALIWPEIQQELKIIESEEELSSL
         ::.: :  ...    :       ..    .. :   :  :.             :  :
CCDS12 GGGRDAPEAAAQSPCSVPSQVPTPGFFSPAPRECLPPFLGVPK-----------PGLYPL
         850       860       870       880                  890    

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pF1KA1 PPPALKTSPIQPILESSLGPFIPSEPPGSL--PCG-SFPAPVSTPLEVWT--------RD
        ::... :   :. .:::::  : .   .:    : :  .: : : . :.        : 
CCDS12 GPPSFQPSSPAPVWRSSLGPPAPLDRGENLYYEIGASEGSPYSGPTRSWSPFRSMPPDRL
          900       910       920       930       940       950    

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pF1KA1 PANQSTQGASTAASREK------PEPEQGLHPD-LASLAPLEIVPFEKASPQATVEVG--
        :. .  : :    :        :   . . :: :.  :: .  : .. .:   . :.  
CCDS12 NASYGMLGQSPPLHRSPDFLLSYPPAPSCFPPDHLGYSAPQH--PARRPTPPEPLYVNLA
          960       970       980       990        1000      1010  

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pF1KA1 -GPGNLSPPLPPAPPPPT-PLEESTPVLLSKGSPEREDSSRKLRTDLYIDQLKSQDSPEI
        :: . ::    .  ::. :  .: :       :... .    ::   .        :: 
CCDS12 LGPRGPSPASSSSSSPPAHPRSRSDPGPPVPRLPQKQRAPWGPRTPHRVPG--PWGPPEP
           1020      1030      1040      1050      1060        1070

               840          850       860       870       880      
pF1KA1 SSLCQGEE-ATPRHSDKQNS---KNAASEGKGCGFPSPTREVEIVSQEEEDVTHSVQEPS
         : ..   :  : .. . .   .:....:.: : : :                      
CCDS12 LLLYRAAPPAYGRGGELHRGSLYRNGGQRGEGAGPPPPYPTPSWSLHSEGQTRSYC    
             1080      1090      1100      1110      1120          

        890       900       910       920       930       940      
pF1KA1 DCDEDDTVTDIAQHGLEMVEPWEEPQWVTSPLHSPTLKDAHKAQVQGLQGHQLEKRLSHR

>>CCDS54254.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19         (1123 aa)
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Smith-Waterman score: 1186; 32.8% identity (57.0% similar) in 905 aa overlap (1-845:157-1034)

                                             10          20        
pF1KA1                               MKNKGAKQKLKRKGA--ASAFGCDLTEYLE
                                     :... ..:.:...:     .::::: :.: 
CCDS54 CGIPAPQGISSLTSAVPRPRGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLS
        130       140       150       160       170       180      

       30        40        50        60        70        80        
pF1KA1 SSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLSGVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDI
       .:::::: ::. :.::::.::.::::::::::.:::::::.:: :.. :.:.  ..::::
CCDS54 NSGQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDI
        190       200       210       220       230       240      

       90       100       110       120       130       140        
pF1KA1 HCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEAVSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEY
       : :.:::::::::::::::::.:: ::.::.:   :: .:.:...:::.::: :::::::
CCDS54 HSVSSLCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEY
        250       260       270       280       290       300      

      150       160       170       180       190       200        
pF1KA1 LIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFI
       :.::::..:  :..:.:::::::.::::::::: :.:..: .: :::  ::::.::.::.
CCDS54 LLRHLARMARHSANTSMHARNLAIVWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSVVVEFL
        310       320       330       340       350       360      

      210       220       230       240        250       260       
pF1KA1 LNHVDQIFNNGAPGSLENDENRPIMKSLTLPALSLP-MKLVSLEEAQARSLAT-NHPARK
       :.::: .:..   ..  .  .: ..      : : :  .:..:::::::. .  . :.  
CCDS54 LTHVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCLLPRPKSLAGSCPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTPT--
        370       380       390       400       410       420      

        270       280       290       300       310       320      
pF1KA1 ERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSKSKKWKSIFNLGRSGSDSKSK-LSRNG
          : . :.   : .   .   :  ...:: ...:  ::..: :::. :  ..: :   :
CCDS54 ---EPTTPKA--PASPAERRKGERGEKQRKPGGSS--WKTFFALGRGPSVPRKKPLPWLG
             430         440       450         460       470       

         330         340       350        360       370            
pF1KA1 SVFVRGQRLSV--EKATIRPAKSMDSLCS-VPVEGKETKGNFNRTVTTGGFF----IPAT
       .. .  :  .   . .:.: ::: .:: : .   : .    . :  ...  :     :: 
CCDS54 GTRAPPQPSGSRPDTVTLRSAKSEESLSSQASGAGLQRLHRLRRPHSSSDAFPVGPAPAG
       480       490       500       510       520       530       

      380       390       400       410       420              430 
pF1KA1 KMHSTGTGSSCDLTKQEGEWGQEGMPPGAEGGFDVSSDRSHLQGAQARP-------PPEQ
       . .: ...:: . ...:.  .. .   .: :   .:.. ::  .:           ::. 
CCDS54 SCESLSSSSSSESSSSES--SSSSSESSAAGLGALSGSPSHRTSAWLDDGDELDFSPPRC
       540       550         560       570       580       590     

              440        450       460         470       480       
pF1KA1 LKVFRPVE-DPESEQ-TAPKMLGMFYTSNDSPSK--SVFTSSLFQMEPSPRNQRK-----
       :. .: .. :: . . ..:        .. .:    :.:   .  .  :::.  .     
CCDS54 LEGLRGLDFDPLTFRCSSPTPGDPAPPASPAPPAPASAFPPRVTPQAISPRGPTSPASPA
         600       610       620       630       640       650     

            490       500       510        520           530       
pF1KA1 ALNISEPFAVSVPLRVSAVISTNSTPCR-TPPKELQSLSSLEE----FSFHGSESGGWPE
       ::.::::.:::::  :  .......:   ::   :.   ::.     . ..:.:.     
CCDS54 ALDISEPLAVSVPPAVLELLGAGGAPASATPTPALSPGRSLRPHLIPLLLRGAEAPLTDA
         660       670       680       690       700       710     

       540       550       560       570       580       590       
pF1KA1 EEKPLGAETSAASVPKKAGLEDAKAVPEAPGTVECSKGLSQEPGAHLEEKKTPESSLSSQ
        .. . ..  .:. :    .:.   .:  : .      : .  ::     :.: . : . 
CCDS54 CQQEMCSKLRGAQGPLGPDMESP--LPPPPLS------LLRPGGAPPPPPKNP-ARLMAL
         720       730         740             750       760       

       600       610       620       630       640           650   
pF1KA1 HLNELEKRPNPEKVVEEGREAGEMESSTLQESPRARAEAVLLHEMDE----DDLANALIW
        : :  ..   ..  .:   .    .: ...:   .. .  :         ..::.   :
CCDS54 ALAERAQQVAEQQSQQECGGTPPASQSPFHRSLSLEVGGEPLGTSGSGPPPNSLAHPGAW
        770       780       790       800       810       820      

                   660       670           680         690         
pF1KA1 --------PEIQQELKIIESEEELSS----LPPPALKTSP--IQPILESSLGPFIPSEPP
               :. :.. ....:.. ...    :  ::   .:  ..:  .  : ::.    :
CCDS54 VPGPPPYLPRQQSDGSLLRSQRPMGTSRRGLRGPAQVPTPGFFSPAPRECLPPFLGVPKP
        830       840       850       860       870       880      

     700       710       720       730        740       750        
pF1KA1 GSLPCGSFPAPVSTPLEVWTRDPANQSTQGASTAASR-EKPEPEQGLHPDLASLAPLEI-
       :  : :      :.:  ::      .:. :  .  .: :.   : :        .: .  
CCDS54 GLYPLGPPSFQPSSPAPVW------RSSLGPPAPLDRGENLYYEIGASEGSPYSGPTRSW
        890       900             910       920       930       940

       760       770       780            790       800       810  
pF1KA1 VPFEKASPQATVEVGGPGNLSPPLPPAPP-----PPTPLEESTPVLLSKGSPEREDSSRK
        ::..  :.      :  . ::::  .:      ::.:     :  :. ..:..      
CCDS54 SPFRSMPPDRLNASYGMLGQSPPLHRSPDFLLSYPPAP-SCFPPDHLGYSAPQHPARRPT
              950       960       970        980       990         

            820        830       840        850       860       870
pF1KA1 LRTDLYIDQLKSQDSPE-ISSLCQGEEATPR-HSDKQNSKNAASEGKGCGFPSPTREVEI
           ::..   .  .:   ::  ..  : :: .::                         
CCDS54 PPEPLYVNLALGPRGPSPASSSSSSPPAHPRSRSDPGPPVPRLPQKQRAPWGPRTPHRVP
    1000      1010      1020      1030      1040      1050         

              880       890       900       910       920       930
pF1KA1 VSQEEEDVTHSVQEPSDCDEDDTVTDIAQHGLEMVEPWEEPQWVTSPLHSPTLKDAHKAQ
                                                                   
CCDS54 GPWGPPEPLLLYRAAPPAYGRGGELHRGSLYRNGGQRGEGAGPPPPYPTPSWSLHSEGQT
    1060      1070      1080      1090      1100      1110         

>>CCDS1215.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs108|chr1           (890 aa)
 initn: 1262 init1: 970 opt: 1000  Z-score: 550.8  bits: 113.8 E(32554): 2.3e-24
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               10          20        30        40        50        
pF1KA1 MKNKGAKQKLKRKGAAS--AFGCDLTEYLESSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLS
            ..:: :.::.:.  .::::: :.:. :::.:: ::::::::.: .:.::::::::
CCDS12    MKSRQKGKKKGSAKERVFGCDLQEHLQHSGQEVPQVLKSCAEFVEEYGVVDGIYRLS
                  10        20        30        40        50       

       60        70        80        90       100       110        
pF1KA1 GVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDIHCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEA
       ::.::::.::::: :.. ::: :.:::::::::.:::: ::::::.:::::.::.::.::
CCDS12 GVSSNIQKLRQEFESERKPDLRRDVYLQDIHCVSSLCKAYFRELPDPLLTYRLYDKFAEA
        60        70        80        90       100       110       

      120       130       140       150       160       170        
pF1KA1 VSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNL
       :.   :  .:..: .:..:::  .:::::.:.:::.:.::::..:::::::::.::::::
CCDS12 VGVQLEPERLVKILEVLRELPVPNYRTLEFLMRHLVHMASFSAQTNMHARNLAIVWAPNL
       120       130       140       150       160       170       

      180       190       200       210       220       230        
pF1KA1 LRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFNNGAPGSLENDENRPIMKSLTL
       ::::.:::.: :: :::. ::::..:.::::.::::.:...:   : . : .   .::  
CCDS12 LRSKDIEASGFNGTAAFMEVRVQSIVVEFILTHVDQLFGGAA---LSGGEVESGWRSL--
       180       190       200       210          220       230    

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA1 PALSLPMKLVSLEEAQARSLATNHPARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLS
       :.        : :. . : :  . :.  .  ..      ::.   .::..:. ..::: :
CCDS12 PGTRASG---SPEDLMPRPLPYHLPSILQAGDG------PPQMRPYHTIIEIAEHKRKGS
               240       250       260             270       280   

      300       310       320       330       340       350        
pF1KA1 SKSKKWKSIFNLGRSGSDSKSKLSRNGSVFVRGQRLSVEKATIRPAKSMDSLCSVPVEGK
        : .::.::::::::: ..: :: :..    . .. . .:.:.::::::::: ..   . 
CCDS12 LKVRKWRSIFNLGRSGHETKRKLPRGA----EDREDKSNKGTLRPAKSMDSLSAAAGASD
           290       300       310           320       330         

      360       370       380       390       400        410       
pF1KA1 ETKGNFNRTVTTGGFFIPATKMHSTGTGSSCDLTKQEGEWGQEGMPPGA-EGGFDV----
       : .:  . .    . ..: .  ...  ..  .   .    :  .  ::. ..: ..    
CCDS12 EPEGLVGPSSPRPSPLLPESLENDSIEAAEGEQEPEAEALGGTNSEPGTPRAGRSAIRAG
     340       350       360       370       380       390         

            420       430       440       450       460         470
pF1KA1 -SSDRSHLQGAQARPPPEQLKVFRPVEDPESEQTAPKMLGMFYTSNDSPSKSV--FTSSL
        ::   .  :..   :    .:  :..     .. :...     :: : .. .  .    
CCDS12 GSSRAERCAGVHISDP---YNVNLPLHITSILSVPPNII-----SNVSLARLTRGLECPA
     400       410          420       430            440       450 

              480       490       500         510       520        
pF1KA1 FQMEPSPRNQRKALNISEPFAVSVPLRVSAVIS--TNSTPCRTPPKELQSLSS--LEEFS
       .: .::: .         :   .  :..: . :  ..: :    :   .:::.   . ::
CCDS12 LQHRPSPASGPGPGPGLGPGPPDEKLEASPASSPLADSGPDDLAPALEDSLSQEVQDSFS
             460       470       480       490       500       510 

        530       540       550       560       570          580   
pF1KA1 FHGSESGGWPEEEKPLGAETSAASVPKKAGLEDAKAVPEAPGTVECSKGLSQE---PGAH
       :  . :.. ::    .::: . ..  . ::      .  .::  . . :  .:    : .
CCDS12 FLEDSSSSEPEW---VGAEDGEVAQAEAAG------AAFSPGEDDPGMGYLEELLGVGPQ
             520          530             540       550       560  

           590       600       610       620       630       640   
pF1KA1 LEEKKTPESSLSSQHLNELEKRPNPEKVVEEGREAGEMESSTLQESPRARAEAVLLHEMD
       .:: .. :  :..  :.: .    :     ..  ::        :  .  .: :.:  . 
CCDS12 VEEFSV-EPPLDDLSLDEAQFVLAPSCCSLDS--AGPRP-----EVEEENGEEVFLSAY-
             570       580       590              600       610    

           650        660       670        680       690       700 
pF1KA1 EDDLANAL-IWPEIQQELKIIESEEELSSLPPPAL-KTSPIQPILESSLGPFIPSEPPGS
        :::.  :   : : .    .:.:   ..    :: . .  :   :  .:    .:: : 
CCDS12 -DDLSPLLGPKPPIWKGSGSLEGEA--AGCGRQALGQGGEEQACWE--VGEDKQAEPGGR
            620       630         640       650         660        

             710       720        730       740       750       760
pF1KA1 LPCGSFPAPVSTPLEVWTRDPANQ-STQGASTAASREKPEPEQGLHPDLASLAPLEIVPF
       :        .  : .    .: .: : .:     :       . :   :...  .. :: 
CCDS12 LDIREEAEGTPQPPQPEEMEPEGQPSPDGCLCPCSLGLGGVGMRLASTLVQVQQVRSVPV
      670       680       690       700       710       720        

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pF1KA1 EKASPQATVEVGGPGNLSPPLPPAPPPPTPLEESTPVLLSKGSP-EREDSSRKLRTDLYI
          .:: .     :. .   .  ::  : :     :  :. :.: ::  .::  :..   
CCDS12 VPPKPQFAKM---PSAMCSKIHVAPANPCP----RPGRLD-GTPGERAWGSRASRSSWRN
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pF1KA1 DQLKSQDSPEISSLCQGEEATPRHSDKQNSKNAASEGKGCGFPSPTREVEIVSQEEEDVT
           : :.    .: . .. :  .. .. ... .  :  : .:  :    ..: .     
CCDS12 GGSLSFDA--AVALARDRQRTEAQGVRR-TQTCTEGGDYCLIPR-TSPCSMISAHSPRPL
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pF1KA1 HSVQEPSDCDEDDTVTDIAQHGLEMVEPWEEPQWVTSPLHSPTLKD-AHKAQVQGLQGHQ
         .. ::.  : .   .      ..  : .::: : .:: :   .. : ..:..  .:. 
CCDS12 SCLELPSEGAEGSGSRS------RLSLPPREPQ-VPDPLLSSQRRSYAFETQANPGKGEG
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CCDS12 L                                                           
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       :.   :  .:..: .:..:::  .:::::.:.:::.:.::::..:::::::::.::::::
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CCDS30 LRSKDIEASGFNGTAAFMEVRVQSIVVEFILTHVDQLFGGAA---LSGGEVESGWRS--L
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       :.        : :. . : :  . :.  .  ..      ::.   .::..:. ..::: :
CCDS30 PGTRASG---SPEDLMPRPLPYHLPSILQAGDG------PPQMRPYHTIIEIAEHKRKGS
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        : .::.::::::::: ..: :: :.    .. .. . .:.:.::::::::: ..   . 
CCDS30 LKVRKWRSIFNLGRSGHETKRKLPRG----AEDREDKSNKGTLRPAKSMDSLSAAAGASD
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        .: : ..::.:. :..::......:.       ::. ....: : ... .: :  .   
CCDS30 AERCAGVHISDPYNVNLPLHITSILSV-------PPNIISNVS-LARLT-RGLECPAL--
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CCDS30 QHRPSPASGPGPGPGLGPGPPDEK-LEASPASSPLADSGPDDLAPALEDSLSQEVQDSFS
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CCDS30 FL-EDSSSSEPEWVGAEDGEVAQAEAAGAAFSP------------GEDDPGMGYL----E
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       . : .  . ::.:  ::   :. .  : .:       .: ::    :  ..    :   .
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         .:.  :   .:    .. : .: ... .:      :.:       :  :.   ..: :
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        . ...   .. ::               : :  .:.: .: ... . .: . . . . .
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       ..       .:.    ...:....:..   : :  . .  .: ::  .:.:.  .. :. 
CCDS30 ETEAKEEKSKGQ----KKADSMEAKGVEEPG-GDEY-TDEKEKEIEREEDEQREEAQVEA
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CCDS30 GRDLEQGAQEDQVAEEKWEVVQKQEAEGVREDEDKGQREKGYHEARKD--QGDGEDSR-S
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pF1KA1 HRPSLRQSHSLDSKPTVKSQWTLEVPSSSSCANLETERNSDPLQPQAPRREITGWDEKAL
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CCDS30 PEAATEGGAGEVSKERESGDGEAEGDQRAGGYYLEEDTLSE--GSGVASLEVDCAKEGNP
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pF1KA1 RSFREFSGLKGAEAPPNQKGPSGVQPNP-AETSPISLAEGKELGTHLGHSSPQIRQ-GGV
       .:  :.  .      :..  : : ::.: .   : ::. :  .: .:. .  :..:  .:
CCDS30 HS-SEMEEVAPQPPQPEEMEPEG-QPSPDGCLCPCSLGLGG-VGMRLASTLVQVQQVRSV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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