Result of FASTA (ccds) for pF1KA1132
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1132, 2053 aa
  1>>>pF1KA1132 2053 - 2053 aa - 2053 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.4503+/-0.00159; mu= -9.7108+/- 0.096
 mean_var=527.9252+/-110.410, 0's: 0 Z-trim(110.8): 142  B-trim: 486 in 1/52
 Lambda= 0.055820
 statistics sampled from 11747 (11878) to 11747 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.365), width:  16
 Scan time:  5.930

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8384.1 DSCAML1 gene_id:57453|Hs108|chr11       (2113) 13696 1119.8       0
CCDS42929.1 DSCAM gene_id:1826|Hs108|chr21         (2012) 8229 679.5 3.8e-194
CCDS43041.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3        (1026)  795 80.6 3.8e-14
CCDS30956.1 HMCN1 gene_id:83872|Hs108|chr1         (5635)  779 79.9 3.3e-13
CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3          (1028)  735 75.8 1.1e-12
CCDS54424.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2            (33423)  764 79.3 2.9e-12
CCDS74610.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2            (34350)  764 79.4   3e-12
CCDS59435.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2            (35991)  764 79.4 3.1e-12
CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11        (1386)  663 70.1 7.5e-11
CCDS2557.1 CNTN6 gene_id:27255|Hs108|chr3          (1028)  657 69.5 8.4e-11


>>CCDS8384.1 DSCAML1 gene_id:57453|Hs108|chr11            (2113 aa)
 initn: 13696 init1: 13696 opt: 13696  Z-score: 5978.1  bits: 1119.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 13696; 100.0% identity (100.0% similar) in 2053 aa overlap (1-2053:61-2113)

                                             10        20        30
pF1KA1                               MWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVND
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GGWERAERGRGAAARPATGPPPRRIGPLYGMWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVND
               40        50        60        70        80        90

               40        50        60        70        80        90
pF1KA1 SLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWYLATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWYLATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPS
              100       110       120       130       140       150

              100       110       120       130       140       150
pF1KA1 AFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 AFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPS
              160       170       180       190       200       210

              160       170       180       190       200       210
pF1KA1 SVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRFFITYHGGLYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQ
       :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SVQEYVSVVSWEKDTVSIIPEHRFFITYHGGLYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQ
              220       230       240       250       260       270

              220       230       240       250       260       270
pF1KA1 SNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADS
              280       290       300       310       320       330

              280       290       300       310       320       330
pF1KA1 RWTKRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RWTKRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGS
              340       350       360       370       380       390

              340       350       360       370       380       390
pF1KA1 TVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATR
              400       410       420       430       440       450

              400       410       420       430       440       450
pF1KA1 KAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVR
              460       470       480       490       500       510

              460       470       480       490       500       510
pF1KA1 DGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRA
              520       530       540       550       560       570

              520       530       540       550       560       570
pF1KA1 MRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDE
              580       590       600       610       620       630

              580       590       600       610       620       630
pF1KA1 GEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITW
              640       650       660       670       680       690

              640       650       660       670       680       690
pF1KA1 RKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPP
              700       710       720       730       740       750

              700       710       720       730       740       750
pF1KA1 RFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNS
              760       770       780       790       800       810

              760       770       780       790       800       810
pF1KA1 SLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNC
              820       830       840       850       860       870

              820       830       840       850       860       870
pF1KA1 TARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAI
              880       890       900       910       920       930

              880       890       900       910       920       930
pF1KA1 NSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDS
              940       950       960       970       980       990

              940       950       960       970       980       990
pF1KA1 WDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 WDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPP
             1000      1010      1020      1030      1040      1050

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KA1 MDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEV
             1060      1070      1080      1090      1100      1110

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KA1 YTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 YTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVIS
             1120      1130      1140      1150      1160      1170

             1120      1130      1140      1150      1160      1170
pF1KA1 WSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 WSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAY
             1180      1190      1200      1210      1220      1230

             1180      1190      1200      1210      1220      1230
pF1KA1 TQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSS
             1240      1250      1260      1270      1280      1290

             1240      1250      1260      1270      1280      1290
pF1KA1 PGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPA
             1300      1310      1320      1330      1340      1350

             1300      1310      1320      1330      1340      1350
pF1KA1 KIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLL
             1360      1370      1380      1390      1400      1410

             1360      1370      1380      1390      1400      1410
pF1KA1 RAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGG
             1420      1430      1440      1450      1460      1470

             1420      1430      1440      1450      1460      1470
pF1KA1 SSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEII
             1480      1490      1500      1510      1520      1530

             1480      1490      1500      1510      1520      1530
pF1KA1 EAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRA
             1540      1550      1560      1570      1580      1590

             1540      1550      1560      1570      1580      1590
pF1KA1 NSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVK
             1600      1610      1620      1630      1640      1650

             1600      1610      1620      1630      1640      1650
pF1KA1 KLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPP
             1660      1670      1680      1690      1700      1710

             1660      1670      1680      1690      1700      1710
pF1KA1 QGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLI
             1720      1730      1740      1750      1760      1770

             1720      1730      1740      1750      1760      1770
pF1KA1 QSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVG
             1780      1790      1800      1810      1820      1830

             1780      1790      1800      1810      1820      1830
pF1KA1 SQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFE
             1840      1850      1860      1870      1880      1890

             1840      1850      1860      1870      1880      1890
pF1KA1 ITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIP
             1900      1910      1920      1930      1940      1950

             1900      1910      1920      1930      1940      1950
pF1KA1 HRANKSDYCNLPLYAKSEAFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 HRANKSDYCNLPLYAKSEAFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPAS
             1960      1970      1980      1990      2000      2010

             1960      1970      1980      1990      2000      2010
pF1KA1 KSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEP
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             2020      2030      2040      2050   
pF1KA1 PRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
             2080      2090      2100      2110   

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pF1KA1 AVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRFFITYHG
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pF1KA1 GLYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAG
       .:::.:::.::.: .:::::.:.:.:::::::.::: :.:::.: :.:::::  ... ::
CCDS42 ALYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFDHRKAMAG
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pF1KA1 HTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTKRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTF
       . ::::: : :.: :  :::::. ::  ..:. : .::: : ..:  :::.:.:::.: .
CCDS42 QRVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRY
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pF1KA1 GSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEA
       :.:.. : :.: .::..:..:.:.:...:: : :::..::. .  . :::: :.. : . 
CCDS42 GTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKN
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pF1KA1 ISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVN
       . : :...:.:..    :: .::::::. .   .:::.. ..::::::.:.:.::::::.
CCDS42 VRITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVS
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pF1KA1 GVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYK
       ::::::: : .: . :::::::::: ::: :.::::.::::: :.:::::::::::::::
CCDS42 GVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYK
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       .. ::: :::::.::: :::::.:::: .::::: :.::.::::: ::::::.:::::.:
CCDS42 NSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFI
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pF1KA1 QPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSV
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CCDS42 QPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNL
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       :: ::::::::: : ::.: .. ::::::::.::::: .:::::::: .::::..::: :
CCDS42 SLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVP
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pF1KA1 KVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISK
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pF1KA1 SMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAI
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CCDS42 SMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPE-MARYLV
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CCDS42 STKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVK
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CCDS42 IRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGII
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       ::::::::: : :.: :..:. . ..:::::::::::.::.:::.:::: :::::::::.
CCDS42 RGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQ
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pF1KA1 EINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEW
       :: .:::::::: :::::.:.. . .   ::::   . .:::.:.:.:::.:.  .::: 
CCDS42 EIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGEL
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pF1KA1 GEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKA
       ::..:::::.  .:: :.::.::::.::::.:.:::::::  .. .:::::::::::.::
CCDS42 GEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKA
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pF1KA1 VPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAP-SEYETSPEQLFYRIAHLNRG
       . .::: : :::::: : ::.:::::.::: :    :.  ::.:.::... ::: .:.:.
CCDS42 AAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHP---YPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRN
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CCDS42 RQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPS
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CCDS42 PAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNL
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pF1KA1 LVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSER
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CCDS42 QVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSER
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pF1KA1 SFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARL
       :..:..::::::::  :.:.:.:: ::::::::::: :.::.:::.:.::. ::.:..::
CCDS42 SYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRL
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pF1KA1 NLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQ-GLRANSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSA
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CCDS42 NLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSA
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pF1KA1 GCGNETAQFATLDYDGSTIPP-IKSA-QGE-----GDDVKKLFTIGCPVILATLGVALLF
       ::... :.::::.:::::::: :::. :.:     .. .: : ::.: .. . :  .::.
CCDS42 GCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLL
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pF1KA1 IVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKE
       .::..:.:.:::::::::::::::.:::.:. ::  :   :  :.::::::.:::::...
CCDS42 VVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSK-QQQTLRMHIDIPRAQLLIEERD
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pF1KA1 GIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVS
        .. . ::..:. .:::.:..:.. .:. .  ..:. .. :.::::.:.:: ::::::..
CCDS42 TMETI-DDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTT
           1680      1690      1700      1710      1720      1730  

             1740      1750      1760      1770       1780         
pF1KA1 RKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTVT-ESDSYSASLSQ
       :.:.:.. ..::::.:::::.. . .  :.:::.:::    . . .:  ::::::.: ::
CCDS42 RRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQ
           1740      1750      1760      1770      1780      1790  

    1790      1800      1810      1820      1830      1840         
pF1KA1 DTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTN
       :::..:.:::::::::::::::::::::::.::::.:::: ::::::::.::.:.:.:::
CCDS42 DTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTN
           1800      1810      1820      1830      1840      1850  

    1850      1860      1870      1880      1890      1900         
pF1KA1 ENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSEA
       : .::.:: ::::: ::::::::::::::. :  :.:::  :: .  :  .:: : . . 
CCDS42 EYTDSLTS-STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPG--DLIHLPPYLRMD-
           1860       1870      1880      1890        1900         

    1910      1920      1930      1940      1950      1960         
pF1KA1 FFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATL
       :. .  :       :   .. :.:.     ::    :.: .::  : .:       :.  
CCDS42 FLLNRGG-------P---GTSRDLSLG---QA---CLEP-QKSRTLKRP-------TVLE
     1910                1920            1930       1940           

    1970      1980      1990      2000      2010         2020      
pF1KA1 PQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAG---GPHTKMGGSRDS
       :     .:   :..:        .    . :  : : .: : : :   :  .::..:..:
CCDS42 P-----IPMEAASSA--------SSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQES
              1950              1960      1970      1980      1990 

       2030      2040      2050   
pF1KA1 LLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
       ::.      .:.. .: . :.::::::
CCDS42 LLD------SRGHLKGNNPYAKSYTLV
                  2000      2010  

>>CCDS43041.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3             (1026 aa)
 initn: 443 init1: 151 opt: 795  Z-score: 367.5  bits: 80.6 E(32554): 3.8e-14
Smith-Waterman score: 867; 24.5% identity (53.1% similar) in 1010 aa overlap (332-1291:46-998)

             310       320       330       340       350       360 
pF1KA1 SAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAI
                                     : :.: . :.:.  :::  :   :  : ..
CCDS43 CLADDSTLHGPIFIQEPSPVMFPLDSEEKKVKLNCEVKGNPKPHIRWKLNGTDV--DTGM
          20        30        40        50        60          70   

              370       380        390           400       410     
pF1KA1 SIR-GLSNETLLITSAQKSH-SGAYQCFATRKAQTA----QDFAIIALEDGTPRIVSSFS
       ..: .. . .:::.. .:.. .:.::: :: .  :       . .  :..   :  :. :
CCDS43 DFRYSVVEGSLLINNPNKTQDAGTYQCTATNSFGTIVSREAKLQFAYLDNFKTRTRSTVS
            80        90       100       110       120       130   

         420       430            440       450       460       470
pF1KA1 EKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPP-----TVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHM
          :  :. . :.:.    :::     . .: ... :  .:. . ..: :       ...
CCDS43 ---VRRGQGMVLLCG----PPPHSGELSYAWIFNEYPSYQDNRRFVSQET-------GNL
              140           150       160       170                

              480       490       500       510                    
pF1KA1 NVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRN-----------------
        ..  .  : : : :.. : : . .      : :::.   .::                 
CCDS43 YIAKVEKSDVGNYTCVVTNTVTNHK------VLGPPTPLILRNDGVMGEYEPKIEVQFPE
     180       190       200             210       220       230   

            520       530       540        550       560       570 
pF1KA1 -ITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYK-DALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEG
        . .. :  . ..: ..: :  .: : . :.  .  . :.    :: :.. . :.  : :
CCDS43 TVPTAKGATVKLECFALGNPVPTIIWRRADGKPIARKARRHK-SNGILEIPNFQQ-EDAG
           240       250       260       270        280        290 

             580       590       600       610       620       630 
pF1KA1 EYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWR
        : : .  .   .....  .    :  :: ..   ... . ..  : ...   :    : 
CCDS43 LYECVAENSRGKNVARGQLTFYAQPNWIQKINDIHVAMEENVFWECKANGRPKPTY-KWL
             300       310       320       330       340        350

             640       650       660       670       680        690
pF1KA1 KDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQL-IVRVPP
       :.:. ... . . ::.    ..:.:. :.:.  : : :.: :  ...  . .: .. : :
CCDS43 KNGEPLLTRDRIQIEQ----GTLNITIVNLSDAGMYQCLAENKHGVIFSNAELSVIAVGP
              360           370       380       390       400      

                 700       710       720       730       740       
pF1KA1 RF---VVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQIL
        :   ...  .   . :.. :..:.  . : :   ::  ::    .. .      :: : 
CCDS43 DFSRTLLKRVTLVKVGGEV-VIECKPKASPKPVYTWK--KGRDILKENE------RITIS
        410       420        430       440         450             

       750       760       770       780       790       800       
pF1KA1 PNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKE
        ...: : .: . : : : : :.:  ::  :..  :.:: :. .   :..  .  :..  
CCDS43 EDGNLRIINVTKSDAGSYTCIATNHFGT-ASSTGNLVVKDPTRVMVPPSSMDVTVGESIV
       460       470       480        490       500       510      

       810         820       830         840        850       860  
pF1KA1 LNCTARGERP--IIIRWEKGDTVIDPDRVMRY--AIATKDN-GDEVVSTLKLKPADRGDS
       : : .  ..   :.. :  .  .:: ::   .   .. .:. :: .. ...:: : .   
CCDS43 LPCQVTHDHSLDIVFTWSFNGHLIDFDRDGDHFERVGGQDSAGDLMIRNIQLKHAGK---
        520       530       540       550       560       570      

            870       880       890        900       910       920 
pF1KA1 VFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPE-LEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFD
         . : . .:  .  .  .: :. :: ::: . : :.   . .: :    :..: :: . 
CCDS43 --YVCMVQTSVDRLSAAADLIVRGPPGPPEAVTIDEITDTTAQLSWRPGPDNHSPITMYV
             580       590       600       610       620       630 

              930       940           950       960       970      
pF1KA1 IEYKNK-SDSWDFKQSTRNISPTIN----QANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKE
       :. ..  : .:   :.. ..   :.     :..: :.:   : .:  . : :: .:::. 
CCDS43 IQARTPFSVGW---QAVSTVPELIDGKTFTATVVGLNPWVEYEFRTVAANVIGIGEPSRP
             640          650       660       670       680        

        980        990      1000      1010      1020      1030     
pF1KA1 LTIS-TEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNG
            :::: :.  : .:.    ... . .::..  .:::::   :: ...:    :.  
CCDS43 SEKRRTEEALPEVTPANVSGGGGSKSELVITWETVPEELQNGRGFGYVVAFRPY--GKMI
      690       700       710       720       730       740        

        1040      1050      1060      1070      1080      1090     
pF1KA1 QYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPE
        .  :  .: ..  :.  .... :. . : : .::  : :: :    . . :. :..:: 
CCDS43 WMLTVLASADASRYVFRNESVHPFSPFEVKVGVFNNKGEGPFSPTTVVYSAEEEPTKPPA
        750       760       770       780       790       800      

        1100       1110      1120      1130      1140       1150   
pF1KA1 NVRALSIT-SDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITT-TRERVE
       .. : :.. .:. :. :. : ...  : ..::.: .:  . : : .  .  :. ..  ..
CCDS43 SIFARSLSATDIEVF-WASPLEKN-RGRIQGYEVKYWR-HEDKEENARKIRTVGNQTSTK
        810       820         830       840        850       860   

          1160      1170      1180      1190      1200      1210   
pF1KA1 LRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSW--
       . ...  . : . : ::..:: :  :... . :..  :. : :     :: :.....:  
CCDS43 ITNLKGSVLYHLAVKAYNSAGTGPSSATVNVTTRKPPPSQPPGNIIWNSSDSKIILNWDQ
           870       880       890       900       910       920   

            1220      1230      1240      1250      1260      1270 
pF1KA1 LPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSA
       .     .. .. : ..     . : . :  ::.  ..      :   ..:.. .   ...
CCDS43 VKALDNESEVKGYKVLYR--WNRQSSTSVIETNKTSVEL---SLPFDEDYIIEIKPFSDG
           930       940         950       960          970        

            1280      1290      1300      1310      1320      1330 
pF1KA1 GRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSA
       : :.:::.. :   ..: :.                                        
CCDS43 GDGSSSEQIRIPKISNAYARGSGASTSNACTLSAISTIMISLTARSSL            
      980       990      1000      1010      1020                  

>>CCDS30956.1 HMCN1 gene_id:83872|Hs108|chr1              (5635 aa)
 initn: 570 init1: 189 opt: 779  Z-score: 350.6  bits: 79.9 E(32554): 3.3e-13
Smith-Waterman score: 981; 24.0% identity (51.9% similar) in 1552 aa overlap (29-1527:3063-4477)

                 10        20        30        40        50        
pF1KA1   MWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVNDSLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALR
                                     ..::. :.   ...: . : . . :  .. 
CCDS30 YTCIAINQAGESKKKFSLTVYVPPSIKDHDSESLSVVNVREGTSVSLECESNAVPPPVIT
           3040      3050      3060      3070      3080      3090  

       60        70        80        90       100       110        
pF1KA1 WYLATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIR
       ::  .:  : .  :.. . :.:  :.  .. .  ..    ..: : : :.::.  . :..
CCDS30 WY-KNGRMITESTHVE-ILADG--QMLHIKKAEVSD---TGQYVCRAINVAGR-DDKNFH
            3100       3110        3120         3130       3140    

      120       130       140       150       160       170        
pF1KA1 VKAVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRFFITY
       .. :.  : ...  ... .  ...    :  ...     ...: :.   :   . . .  
CCDS30 LN-VYVPP-SIEGPEREVIVETISNPVTLTCDATGIPPPTIAWLKNHKRIENSDSLEVRI
          3150       3160      3170      3180      3190      3200  

      180          190       200       210       220       230     
pF1KA1 HGG---LYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQ
        .:   : :.  :. :. ..: ::...    : . ..   ::.  :    :..  .   .
CCDS30 LSGGSKLQIARSQHSDS-GNYTCIASNM---EGKAQKYYFLSIQVP----PSVAGAEIPS
           3210       3220         3230      3240          3250    

           240       250       260       270           280         
pF1KA1 EVWA--GHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTKRITG----LTISDLRTEDS
       .: .  :..::: :.:.: : : :.:::::.:. .      :...    :.:    : :.
CCDS30 DVSVLLGENVELVCNANGIPTPLIQWLKDGKPIASGETERIRVSANGSTLNIYGALTSDT
         3260      3270      3280      3290      3300      3310    

     290       300       310          320       330       340      
pF1KA1 GTYICEVTNTFGSAEATGILMV-IDPL--HVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTI
       : : : .::  :  .    : : . :         .:: : . ... . :  ::.:   :
CCDS30 GKYTCVATNPAGEEDRIFNLNVYVTPTIRGNKDEAEKLMTLVDTSINIECRATGTPPPQI
         3320      3330      3340      3350      3360      3370    

        350       360        370       380       390       400     
pF1KA1 RWYRNTELVLPDEAISIRGLS-NETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALED
        : .:  : ::  .  :: :. .... :. :: :  ..: : :. .: . .    . .  
CCDS30 NWLKNG-LPLPLSS-HIRLLAAGQVIRIVRAQVSDVAVYTCVASNRAGVDNKHYNLQVF-
         3380        3390      3400      3410      3420      3430  

         410         420       430       440       450       460   
pF1KA1 GTPRIVSSF-SEKV-VNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSD
       . : . .:. .:.. :  : . :. : . :.: :...:  : .:.  : .: :   . . 
CCDS30 APPNMDNSMGTEEITVLKGSSTSMACITDGTPAPSMAWLRDGQPLGLD-AHLT---VSTH
            3440      3450      3460      3470       3480          

           470       480       490       500       510          520
pF1KA1 GTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRA---MRNITAVAGR
       : ... ...   . .:.: : : : : .: .  .  ..:  :: : .    ..:..... 
CCDS30 GMVLQLLKA---ETEDSGKYTCIASNEAGEVSKHFILKVLEPPHINGSEEHEEISVIVNN
      3490         3500      3510      3520      3530      3540    

              530       540       550        560       570         
pF1KA1 DTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENG-TLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLI
          ..: . : :  .. :.::.  ::.. .  .. .: .:... .:   : :.: : .  
CCDS30 PLELTCIASGIPAPKMTWMKDGRPLPQTDQVQTLGGGEVLRISTAQV-EDTGRYTC-LAS
         3550      3560      3570      3580      3590        3600  

     580       590       600          610       620       630      
pF1KA1 QPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFP-PASI--GQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQV
       .:  . ..   : :.::: :   . :   ..  .. . . :  ..   :. ::: ..:. 
CCDS30 SPAGDDDKEYLVRVHVPPNIAGTDEPRDITVLRNRQVTLECKSDAVPPPV-ITWLRNGER
           3610      3620      3630      3640      3650       3660 

        640       650       660       670       680       690      
pF1KA1 IISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQP
       . .   : : :      :::....:  ..::::.::: :. ..::  : : ::: .   :
CCDS30 LQATPRVRILSG--GRYLQINNADLGDTANYTCVASNIAGKTTREFILTVNVPPNIKGGP
            3670        3680      3690      3700      3710         

        700       710       720         730       740       750    
pF1KA1 NNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKH--AKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLI
       ..   . .:. ::.: ..: : :.. :..  :  .::    :     .: .:: :. : :
CCDS30 QSLVILLNKSTVLECIAEGVPTPRITWRKDGAVLAGN----H-----ARYSILENGFLHI
    3720      3730      3740      3750               3760      3770

          760       770       780       790       800       810    
pF1KA1 RHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARG
       . .   : : :::.:.:..:::  . . : :..:  :.  :..  .: .    : : : :
CCDS30 QSAHVTDTGRYLCMATNAAGTD-RRRIDLQVHVPPSIAPGPTNMTVIVNVQTTLACEATG
             3780      3790       3800      3810      3820         

          820       830       840       850       860       870    
pF1KA1 ERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYG
            : :.:.  ... :.  . .    ..:. :.    ..:.   :.. . : . :. :
CCDS30 IPKPSINWRKNGHLLNVDQ-NQNSYRLLSSGSLVI----ISPS-VDDTATYECTVTNGAG
    3830      3840       3850      3860           3870      3880   

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pF1KA1 EDRGLIQLTVQEPP---DPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSI-ITGFDIEYKNKSDS
       .:.  ..:::: ::   : :   .   .: ..    ..     ::  :   :.   ..:.
CCDS30 DDKRTVDLTVQVPPSIADEPTDFLVTKHAPAVITCTASGVPFPSIHWTKNGIRLLPRGDG
          3890      3900      3910      3920      3930      3940   

              940       950       960       970       980       990
pF1KA1 WDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPP
       .      : .:    .   ..:. :. :.    . :  : ..  ...:. ..:  :   :
CCDS30 Y------RILSSGAIEILATQLNHAGRYT--CVARNAAGSAH--RHVTLHVHEP-PVIQP
                3950      3960        3970        3980       3990  

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KA1 MDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEV
       .   :. . .. : .  .:      .  :   . :   :. : :  ....   .   :..
CCDS30 QPSELHVILNNPILLPCEATGTP--SPFITWQKEGINVNTSGRN--HAVLPSGGLQISRA
           4000      4010        4020      4030        4040        

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KA1 YTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVIS
          :     . :  :.:  : :::. .. ..:. .   .  .  : : :..    ..  .
CCDS30 VREDA----GTYMCVAQ--NPAGTALGKIKLNVQVPPVISPHLKEYVIAVDKPITLSCEA
     4050          4060        4070      4080      4090      4100  

             1120      1130      1140      1150      1160      1170
pF1KA1 WSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAY
        . :: .           : :  . ::.      . . :.::   :       :.:. :.
CCDS30 DGLPPPD-----------ITW--HKDGR----AIVESIRQRVLSSG-------SLQI-AF
                      4110            4120      4130               

             1180      1190      1200      1210      1220      1230
pF1KA1 TQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSS
       .: ::. .    :     .: :         ::.:. ..  .:: .  ..  .::.  .:
CCDS30 VQPGDAGH----YTCMAANVAGS--------SSTSTKLTVHVPP-RIRSTEGHYTVNENS
      4140          4150              4160       4170      4180    

                                  1240        1250      1260       
pF1KA1 ----P--GSGQPAPS---------------EYETSP--EQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAA
           :  ..: :.:.               .: . :  : ..  ..  . :   .   .:
CCDS30 QAILPCVADGIPTPAINWKKDNVLLANLLGKYTAEPYGELILENVVLEDSG---FYTCVA
         4190      4200      4210      4220      4230         4240 

      1270      1280      1290      1300      1310      1320       
pF1KA1 VTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDS
        ..::. . . ..:..     :. .  . : :.    ...:: :...: : : . :: . 
CCDS30 NNAAGEDTHTVSLTVHVL---PT-FTELPGDVSLNKGEQLRLSCKATGIPLPKLTWTFN-
            4250         4260       4270      4280      4290       

      1330      1340      1350      1360      1370      1380       
pF1KA1 EDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQP
        .. ::. .:.   .. .. :... :. :::: :.::: :. ::   :  . :. ::   
CCDS30 -NNIIPAHFDS---VNGHSELVIERVSKEDSGTYVCTAENSVGFVKAIGFVYVKEPP---
        4300         4310      4320      4330      4340            

      1390      1400      1410      1420        1430      1440     
pF1KA1 RLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEW--KDVFISSSERSFKLDSL
          : : .  :   .::    ::..: .  .. .   . .:  : : :   : : .. .:
CCDS30 ---VFKGDYPS---NWIE-PLGGNAILNCEVKGDPTPTIQWNRKGVDI---EISHRIRQL
       4350         4360       4370      4380      4390            

        1450      1460      1470      1480      1490      1500     
pF1KA1 KCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNN
         :.   .  ......:.       :: .  :  :.. ..  .  .. ... .:  :   
CCDS30 GNGS-LAIYGTVNEDAGDYTCVATNEAGVVERSMSLTLQSPPIITLEPVETVINAGGKII
    4400       4410      4420      4430      4440      4450        

        1510      1520      1530      1540      1550      1560     
pF1KA1 GGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRANSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQ
        .:  :.   : .:  ::. ::                                      
CCDS30 LNCQATG---EPQPTITWSRQGHSISWDDRVNVLSNNSLYIADAQKEDTSEFECVARNLM
     4460         4470      4480      4490      4500      4510     

>>CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3               (1028 aa)
 initn: 604 init1: 198 opt: 735  Z-score: 341.4  bits: 75.8 E(32554): 1.1e-12
Smith-Waterman score: 897; 24.8% identity (52.8% similar) in 1032 aa overlap (307-1282:19-991)

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pF1KA1 TGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGST---VI
                                     : :..  :. .   :..    .::    . 
CCDS33             MMFPWKQLILLSFIGCLGGELLLQGPVFIK-EPSNSIFPVGSEDKKIT
                           10        20        30         40       

           340       350       360        370        380       390 
pF1KA1 LSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAISIR-GLSNETLLITSAQKS-HSGAYQCFATRK
       : :   :.:    ::  :   .  : ..  :  :.. .:.. . ...  .:.:::::: .
CCDS33 LHCEARGNPSPHYRWQLNGSDI--DMSMEHRYKLNGGNLVVINPNRNWDTGTYQCFATNS
        50        60          70        80        90       100     

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pF1KA1 AQTA----QDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPP-----TVTWA
         :       . .  ::.   .. :. :   :  :.   :.:.    :::     . .: 
CCDS33 LGTIVSREAKLQFAYLENFKTKMRSTVS---VREGQGVVLLCG----PPPHSGELSYAWI
         110       120       130          140           150        

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pF1KA1 LDDEP-IVRDGSHR-TNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSA------
       ... : .:.. :.: ..: :       .:. ..  .  : : : :.. ..: .:      
CCDS33 FNEYPSFVEEDSRRFVSQET-------GHLYISKVEPSDVGNYTCVVTSMVTNARVLGSP
      160       170              180       190       200       210 

                      500       510       520       530       540  
pF1KA1 ------------EYQARINVRGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYK-D
                   ::. .:.:. : .. : .      :  . ..: ..: :  .:.: . :
CCDS33 TPLVLRSDGVMGEYEPKIEVQFPETLPAAK------GSTVKLECFALGNPIPQINWRRSD
             220       230       240             250       260     

             550       560       570       580       590       600 
pF1KA1 ALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQP
       .: . .. .   : .:.:.. . :.  : : : : .  .   .....  .    :  .: 
CCDS33 GLPFSSKIKLRKF-SGVLEIPNFQQ-EDAGSYECIAENSRGKNVARGRLTYYAKPHWVQL
         270        280        290       300       310       320   

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pF1KA1 FEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSL
       ..    .. . ::  : .:.   :    : :.: ...    . ::.    ..: ::..:.
CCDS33 IKDVEIAVEDSLYWECRASGKPKP-SYRWLKNGAALVLEERTQIEN----GALTISNLSV
           330       340        350       360           370        

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pF1KA1 KHNGNYTCIASNAAATVSRERQL-IVRVPPRFVVQPNNQ--DGIYGKAGVLNCSVDGYPP
         .: . ::: :  . :    .: .:   : :  .: ..  .   :.   :.:.  . : 
CCDS33 TDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKVVASAPDFSKNPMKKLVQVQVGSLVSLDCKPRASPR
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      720       730       740       750       760       770        
pF1KA1 PKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDIS
           ::  ::. . :...      ::..: ...: : .: . : : : :.: :  :   .
CCDS33 ALSSWK--KGDVSVQEHE------RISLLNDGGLKIANVTKADAGTYTCMAENQFGK-AN
      440         450             460       470       480          

      780       790        800       810          820       830    
pF1KA1 KSMFLTVKIPAMITSHP-NTTIAIKGHAKELNCTARGERP---IIIRWEKGDTVID--PD
        .  :.:  :. ::  : :  ... :..  : : .. . :   ::. :  . .. :   :
CCDS33 GTTHLVVTEPTRITLAPSNMDVSV-GESVILPCQVQHD-PLLDIIFTWYFNGALADFKKD
     490       500       510        520        530       540       

            840       850       860       870       880       890  
pF1KA1 RVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPE
             .. ...:: .. ...:: . .     . : . ..     .  .: :.  : :::
CCDS33 GSHFEKVGGSSSGDLMIRNIQLKHSGK-----YVCMVQTGVDSVSSAADLIVRGSPGPPE
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pF1KA1 -LEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNK-SDSWDFKQSTRNISPTIN----Q
        ... :.   . .: : .  :..: . ...:. ..  : .:   :.. ..  .:.     
CCDS33 NVKVDEITDTTAQLSWKEGKDNHSPVISYSIQARTPFSVGW---QTVTTVPEVIDGKTHT
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pF1KA1 ANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPS-KELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQV
       :..:.:.:   : .:. . :::: .:::     . ::::.:. :: .:.    . . . .
CCDS33 ATVVELNPWVEYEFRVVASNKIGGGEPSLPSEKVRTEEAVPEVPPSEVNGGGGSRSELVI
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pF1KA1 TWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSP-GSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGV
       ::    .:::::   :: ...:   : : .   . :  .      :.  ...  .. : :
CCDS33 TWDPVPEELQNGEGFGYVVAFR---PLGVTTWIQTVVTSPDTPRYVFRNESIVPYSPYEV
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pF1KA1 VVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGVLK
        : ..:  : :: :   .. . :. :.  : .: : :..:.   .::.  : .  :: : 
CCDS33 KVGVYNNKGEGPFSPVTTVFSAEEEPTVAPSQVSANSLSSSEIEVSWNTIPWKLSNGHLL
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pF1KA1 GYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYI
       ::.: .:.     : .  .... ..  ..:::...   : . : ::..:: :  :... .
CCDS33 GYEVRYWNGGGKEESSSKMKVAGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSAGAGPFSATVNV
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pF1KA1 QTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSW--LPPTKPNGVIRKYTIF--CSSPGSGQPAPSE
        ::.  :. : :  .  .. ..:...:  .   . .. .  : .:   :: .. :   ..
CCDS33 TTKKTPPSQPPGNVVWNATDTKVLLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTSSQNNVQVLNTN
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pF1KA1 YETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVT
        .:: : .      :   ..:.. : :.:..: :.:::.. :                  
CCDS33 -KTSAELV------LPIKEDYIIEVKATTDGGDGTSSEQIRIPRITSMDARGSTSAISNV
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pF1KA1 TPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGY
                                                                   
CCDS33 HPMSSYMPIVLFLIVYVLW                                         
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pF1KA1 PHIRHVHANGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAVFREP--YT
                                     : : : : :::    .  ..   .::  . 
CCDS54 IRPGGNYKMTLVENTATLTVLKVGKGDAGQYTCYASNIAGK---DSCSAQLGVQEPPRFI
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pF1KA1 VRVEDQRSMRGN-VAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRF---FITYHGGLYI
        ..: .: .. .  . ..: : .: .  ..:. : :: . :   ..:   :.   . : .
CCDS54 KKLEPSRIVKQDEFTRYECKIGGSPE--IKVL-WYKDETEIQESSKFRMSFVDSVAVLEM
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pF1KA1 SDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVE
        ... ::. . : :   :. .: .  :... :.: .:    : .    :  :.  :  :.
CCDS54 HNLSVEDS-GDYTC-EAHNAAGSA--SSSTSLKVKEP----PIFRKKPHPIETLKGADVH
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pF1KA1 LPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWT----KRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTF
       : :  .: :   . : :: : : . ...     . .:.. : .. . : : : :..::  
CCDS54 LECELQGTPPFHVSWYKDKRELRSGKKYKIMSENFLTSIHILNVDAADIGEYQCKATNDV
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pF1KA1 GSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYRNT-ELVLPDE
       ::   .: . .  : . .   . ..: .:. : :. .. :.  ... :...  :.:  ..
CCDS54 GSDTCVGSIALKAPPRFVKKLSDISTVVGKEVQLQTTIEGAEPISVVWFKDKGEIVRESD
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pF1KA1 AISIRGLSN-ETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKV
        : :    :  :: .. .. ...: : :     :   . :: ... .  :  .    :..
CCDS54 NIWISYSENIATLQFSRVEPANAGKYTCQIKNDAGMQECFATLSVLE--PATIVEKPESI
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pF1KA1 -VNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQI
        :. :.  .: :.. :.:  .. :  : . .. :     :.: .:  . .: ... .   
CCDS54 KVTTGDTCTLECTVAGTPELSTKWFKDGKELTSD-----NKYKISFFNKVSGLKIINVAP
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pF1KA1 RDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRG---PPSI-RAMRNITAVAGRDTLINCRVIGYPY
        :.:::   ..: ::.    : ..:     :::. : ... ....: .....:.: : : 
CCDS54 SDSGVYSFEVQNPVGKDSCTASLQVSDRTVPPSFTRKLKETNGLSGSSVVMECKVYGSPP
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pF1KA1 YSIKWYKDALLLPDNHR-QVVFENGTLKLT-DVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQ--SV
        :..:....  . .... :... ..:  :: .. .  : :.: :   :  ... :.  :.
CCDS54 ISVSWFHEGNEISSGRKYQTTLTDNTCALTVNMLEESDSGDYTC---IATNMAGSDECSA
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pF1KA1 HVAVKVPP-LIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESK
        ..:. :: ..:  .   .  :  . .  .:. :  :. ..: : .. .. :.  ..  .
CCDS54 PLTVREPPSFVQKPDPMDVLTGTNVTFTSIVK-GTPPFSVSWFKGSSELVPGDRCNVSLE
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pF1KA1 EFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGV
       . .. :.. .:. ...:.::::.:: :. .:   .: ...: .:: . :. .   ::  .
CCDS54 DSVAELELFDVDTSQSGEYTCIVSNEAGKASCTTHLYIKAPAKFVKRLNDYSIEKGKPLI
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pF1KA1 LNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQIL--PNSSLLIRHVLEEDIGYYL
       :. .  : :: .: ::.   . .:.:   .  : .  ::  :.:..       :: : : 
CCDS54 LEGTFTGTPPISVTWKKNGINVTPSQRCNITTTEKSAILEIPSSTV-------EDAGQYN
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pF1KA1 CQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGD
       :   :. : :  ....: .. : .. .   . ... : .  :.:   :   : . : :::
CCDS54 CYIENASGKDSCSAQILILEPPYFVKQLEPVKVSV-GDSASLQCQLAGTPEIGVSWYKGD
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pF1KA1 TVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQE
       : . :  .  : .  ..:    :.:: .. .: .::  . :.: :: ::  .   :::::
CCDS54 TKLRPTTT--YKMHFRNN----VATLVFNQVDINDSGEYICKAENSVGEVSASTFLTVQE
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pF1KA1 PPDPPEL--EIREVKAR-SMNLRWTQRFDGNSIIT-GFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISP
          :: .  ..:.:.   .. . .   ..:.  :. ..  . :  .:: . . :  . . 
CCDS54 QKLPPSFSRQLRDVQETVGLPVVFDCAISGSEPISVSWYKDGKPLKDSPNVQTSFLDNTA
           8060      8070      8080      8090      8100      8110  

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pF1KA1 TINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVT---
       :.:  . .:   :. ::    . : :: .  : .: : ::   :  : .:. : ::    
CCDS54 TLNIFK-TDRSLAGQYSCT--ATNPIGSASSSARL-ILTEGKNP--PFFDIRLAPVDAVV
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pF1KA1 ------------SQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGD
                   .: :.:.:   ..:...:    :::.: :::    .. .....   ::
CCDS54 GESADFECHVTGTQPIKVSWAKDSREIRSG--GKYQISYLENS----AHLTVLKVDK-GD
       8170      8180      8190        8200          8210          

      1050      1060      1070      1080      1090      1100       
pF1KA1 SEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVA
       :  ::               : :..:    ....:    : .   ::  .. :: :    
CCDS54 SGQYT-------------CYAVNEVGKDSCTAQLNIK--ERLI--PPSFTKRLSET----
    8220                   8230      8240          8250            

      1110      1120      1130       1140      1150            1160
pF1KA1 VISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDG-EWGEMQNITTTRE------RVELRGMEKF
        .  .:     :.: . : . :  . : .. :    .:   : .      .:.  ::.  
CCDS54 -VEETEGNSFKLEGRVAGSQPITVAWYKNNIEIQPTSNCEITFKNNTLVLQVRKAGMNDA
      8260      8270      8280      8290      8300      8310       

             1170      1180      1190      1200           1210     
pF1KA1 TNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVV-----VSWLPPT
         :. .:   ..::... .: . :.  .  :     .  :  : .  :     :.   : 
CCDS54 GLYTCKV--SNDAGSALCTSSIVIKEPKKPPVFDQHLTPVTVSEGEYVQLSCHVQGSEPI
      8320        8330      8340      8350      8360      8370     

            1220       1230      1240      1250      1260      1270
pF1KA1 K----PNGVIRKYTIFCS-SPGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTS
       .      :   : .  :: : .::        :.  .:   .:. . :. :.  .. :  
CCDS54 RIQWLKAGREIKPSDRCSFSFASG--------TAVLEL-RDVAKADSGD-YVCKASNV--
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pF1KA1 AGRGNSSEKVTIE--PAGKAPA-KIISFGGT---VTTPWMKDVRLPCNSV--------GD
       ::  ... ::::.  ::  ::: :  .  :    :. :  ...:.  ...        ::
CCDS54 AGSDTTKSKVTIKDKPA-VAPATKKAAVDGRLFFVSEP--QSIRVVEKTTATFIAKVGGD
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pF1KA1 PAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGT---LLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDT
       : : ::::: .  .   ... :. .:: .:    : .: .   ::: : :.: :  :   
CCDS54 PIPNVKWTKGKWRQ---LNQGGRVFIHQKGDEAKLEIRDTTKTDSGLYRCVAFNEHGEIE
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CCDS54 SNVNLQVDERKKQEKIEGDLRAMLKKTPILKKGAGEEEEIDIMELLKNVDPKEYEKYARM
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CCDS54 ELTLGSKYKISVTDTVSILKIISTEKKDSGEYTFEVQNDVGR-SSCKARINVLDLIIPPS
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CCDS54 FTKKLKKMDSIKGSFIDLECIVAGS--HPISI-QWFKDDQEISASEKYKFSFHDNTAFLE
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CCDS54 ISQLEGTDS-GTYTCSATNK-AGHN-QCSG-HLTVKEP----PYFVEKPQSQDVNPNTRV
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CCDS54 QLKALVGGTAPMTIKWFKDNKELHSGAARSVWKDDTSTSLELFAAKATDSGTYICQLSND
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CCDS54 VGTATSKATLFVKEPPQFIKKPSPVLVLRNGQSTTFECQITGTPKIRVSWYLDGNEITAI
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         ..:: : ::.  :. :..:.  .::.: : :   : ::.    . ...  : ..  ..
CCDS54 QKHGISFIDGLA--TFQISGARVENSGTYVCEARNDAGTASCSIELKVKE-PPTFIRELK
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pF1KA1 EKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGP
          :    .  : : . :.::  :::  ... :     . ...::..: ... ....:  
CCDS54 PVEVVKYSDVELECEVTGTPPFEVTWLKNNREI-----RSSKKYTLTDRVSVFNLHITKC
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pF1KA1 QIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPS-IRAMRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYY
       .  : : :.: . :  ::   ..:. .. ::: :. ..: :.:   .. ..  : : :  
CCDS54 DPSDTGEYQCIVSNEGGSCSCSTRVALKEPPSFIKKIENTTTVLKSSATFQSTVAGSPPI
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CCDS54 SITWLKDDQILDEDDNVYISFVDSVATLQIRSVDNGHS-GRYTCQAKNESGVERCYAFLL
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       . .   ...  .   ..  . . . :::. :   ... : :::. :. .   ..  .. .
CCDS54 VQEPAQIVEKAKSVDVTEKDPMTLECVVA-GTPELKVKWLKDGKQIVPSRYFSMSFENNV
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pF1KA1 SSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIV---RVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGV
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CCDS54 ASFRIQSVMKQDSGQYTFKVENDFGSSSCDAYLRVLDQNIPPSFTKKLTKMDKVLGSSIH
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pF1KA1 LNCSVDGYPPPKVMW-KHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLC
       ..:.:.:  : ...: : .:  ..  .:. :     .      :: . ..  :: . : :
CCDS54 MECKVSGSLPISAQWFKDGKEISTSAKYRLVCHERSV------SLEVNNLELEDTANYTC
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pF1KA1 QASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDT
       ..:: .: : . : .:::: :  .  .:.   ::   . :..   .:  :. :.: : :.
CCDS54 KVSNVAGDD-ACSGILTVKEPPSFLVKPGRQQAIPDSTVEFKAILKGTPPFKIKWFKDDV
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pF1KA1 --VIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQ
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CCDS54 ELVSGPKCFIGLEGST--------SFLNLYSVDASKTGQYTCHVTNDVGSDSCTTMLLVT
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       :::    .::  ..   . . :   .. :.  :    . ..:. .   .  : .     :
CCDS54 EPPKFVKKLEASKIVKAGDSSRLECKIAGSPEIRV--VWFRNEHE---LPASDKYRMTFI
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pF1KA1 NQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSE-PSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSI
       ... .....  :. .    : . : ... :.   . ::.  . . ::.  .. :.. ...
CCDS54 DSVAVIQMNNLSTED----SGDFICEAQNPAGSTSCSTKVIVKE-PPVFSSFPPIV-ETL
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pF1KA1 QVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSP-GSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQY
       . .  . . :: .:.     . :...    :. .:.:.  .   . .. ..:. . ...:
CCDS54 KNAEVSLECEL-SGTPPFEVVWYKDKRQLRSSKKYKIASKNFHTSIHILNVDT-SDIGEY
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pF1KA1 GVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGV
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CCDS54 HCKAQ--NEVG---SDTCVCTVKLKE----PPRFVSKLNSLTVVA----GEP--AELQAS
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pF1KA1 LKGYRVIFWSLYVDGEW-GEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSV
       ..: . ::       .:  : ...    : ...  .:     .: .: ...: . . .. 
CCDS54 IEGAQPIFV------QWLKEKEEVIRESENIRITFVE-----NVATLQFAKA-EPANAGK
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pF1KA1 LYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAPSEY
          : :.:  :   .. ..     .:.:    :   . : .  :. :.  :. . .   :
CCDS54 YICQIKND-GGMRENMATLMVLEPAVIVEKAGPMTVT-VGETCTLECKVAGTPELSVEWY
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       .     :: ..    ::      ::  ..: .       . ...:... .  : .   . 
CCDS54 KDGKLLTSSQKHKFSFYNKISSLRILSVERQDAGTYTFQVQNNVGKSSCTAVVDVSDRAV
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        :.   .. . ::.. .  .    : :. .:.   .: : .  : . : ::   ..   .
CCDS54 PPSFTRRLKNTGGVLGASCI----LECKVAGSSPISVAWFH--EKTKI-VSGAKYQTTFS
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pF1KA1 NG--TLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLT
       ..  :: : .. . : : :::.:.:..: :   . : :: ::     .  :       : 
CCDS54 DNVCTLQLNSLDSSDMGNYTCVAANVAGSDECRAVLTVQEPP-----SFVKEPEP---LE
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pF1KA1 WIPGDNGG--SSIRG---FVLQYSVDNSEEWK----DVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKV
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CCDS54 VLPGKNVTFTSVIRGTPPFKVNWFRGARELVKGDRCNIYFEDTVAELELFNIDISQSGEY
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pF1KA1 KLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREPS-FSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITA
         ...:..:..  .  . .:    ::. : :  .:  :       . :..  .:  ::. 
CCDS54 TCVVSNNAGQASCTTRLFVK----EPAAFLK--RLSDHSVEPGKSIILESTYTGTLPIS-
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pF1KA1 IVLEYRPKGTWAWQGLRAN--SSGEVFLTELREATWYELRMRAC---NSAG---CGNETA
         . ..  :     . . :  .. .. . :. ..:  .  . .:   : ::   ::   :
CCDS54 --VTWKKDGFNITTSEKCNIVTTEKTCILEILNSTKRDAGQYSCEIENEAGRDVCG---A
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pF1KA1 QFATLD--YDGSTIPPIKSAQGEGDDVKKLFTI-GCPVILATL--GVALLFIVRKKRKEK
         .::.  :  . . :...: :  :.:.    . : : : ..   : . :    .   : 
CCDS54 LVSTLEPPYFVTELEPLEAAVG--DSVSLQCQVAGTPEITVSWYKGDTKL----RPTPEY
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pF1KA1 RLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDK
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CCDS54 RTYFTNNVATLVFNKVNINDSGEYTCKAENSIGTASSKTVFRIQERQLPPSFARQLKDIE
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pF1KA1 ATI--PVTDAEFSQAVNPQSFC---TGVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNV
        :.  ::: .   ..  : . :    :: :.    .:..  ..:        : .. : .
CCDS54 QTVGLPVTLTCRLNGSAPIQVCWYRDGVLLRDDENLQTS--FVD--------NVATLKIL
        6190      6200      6210      6220                6230     

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pF1KA1 KSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKG
       ..  :  ..::       :.::.:  : .:. :                           
CCDS54 QTDLSHSGQYS-------CSASNPLGTASSSARLTAREPKKSPFFDIKPVSIDVIAGESA
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pF1KA1 RNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTNENADS
                                                                   
CCDS54 DFECHVTGAQPMRITWSKDNKEIRPGGNYTITCVGNTPHLRILKVGKGDSGQYTCQATND
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CCDS54 DMCSAQLSVKEPPKFVKKLEASKVAKQGESIQLECKISGSPEIKVSWF-RNDSELHESWK
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pF1KA1 IRHVHANGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIR-SPNIRVKAVFREP-YTVR
             :..  :     :: .:    .::.: :.:..:    :  . :::    : .: .
CCDS54 YNMSFINSVALLTINEASAEDS----GDYICEAHNGVGDASCSTALTVKA---PPVFTQK
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pF1KA1 VEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRFFIT---YHGGLYISDV
            ...:. ....: : :..  .  :  : ::  ..   ..: ::   .  .:.: ..
CCDS54 PSPVGALKGSDVILQCEI-SGTPPFEVV--WVKDRKQVRNSKKFKITSKHFDTSLHILNL
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pF1KA1 QKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVELPC
       .  : .. :.: . .. ...:    .  ..  .:    : ..  . .  .  : .:::  
CCDS54 EASD-VGEYHCKATNEVGSDT---CSCSVKFKEP----PRFVKKLSDTSTLIGDAVELRA
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pF1KA1 TASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTK-----RITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGS
        . :.   .. ::::   .  .:. :.      :. : ... .. .:: :::.. :  : 
CCDS54 IVEGFQPISVVWLKDRGEVIRESENTRISFIDNIATLQLGSPEASNSGKYICQIKNDAGM
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pF1KA1 AEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAIS
        : ...: :..: ..   :. . .  :.   : :..::.::.. .:... . .  :    
CCDS54 RECSAVLTVLEPARIIEKPEPMTVTTGNPFALECVVTGTPELSAKWFKDGRELSADSKHH
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pF1KA1 IRGLSN-ETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAI-IALEDGTPRIVS-SFSEKV-
       :  ...  .: :  :. : .: :. : ....   .. .. . . :   :::  :: .:. 
CCDS54 ITFINKVASLKIPCAEMSDKGLYS-FEVKNSVGKSNCTVSVHVSD---RIVPPSFIRKLK
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pF1KA1 -VNP--GEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGP
        ::   : .  : : ..:. : .: :  : . ::   :    : ..:...   ....  :
CCDS54 DVNAILGASVVLECRVSGSAPISVGWFQDGNEIV---SGPKCQSSFSENVCTLNLSLLEP
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pF1KA1 QIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRN-ITAVAGRDTLINCRVIGYPYY
       .  : :.: :.: :..:: : .: ..:. :::..   . . .. : .  ..  . : : .
CCDS54 S--DTGIYTCVAANVAGSDECSAVLTVQEPPSFEQTPDSVEVLPGMSLTFTSVIRGTPPF
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pF1KA1 SIKWYKDAL-LLPDNHRQVVFEN--GTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVHV
       ..::.: .  :.: .  .. .:.    :.: .::  .. :.: : :  .   : : ..:.
CCDS54 KVKWFKGSRELVPGESCNISLEDFVTELELFEVQP-LESGDYSCLVT-NDAGSASCTTHL
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pF1KA1 AVKVPP-LIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEF
        :: :  ... .    .  :. . .  . . :  :: ..: ::  .: ..   .:   : 
CCDS54 FVKEPATFVKRLADFSVETGSPIVLEATYT-GTPPISVSWIKDEYLISQSERCSITMTEK
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pF1KA1 MSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLN
        . :.:   ...  ..:.:.  : :.    :  . :  :: :.   .. ... :. ..:.
CCDS54 STILEILESTIEDYAQYSCLIENEAGQDICEALVSVLEPPYFIEPLEHVEAVIGEPATLQ
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pF1KA1 CSVDGYPPPKVMW--KHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPN-SSLLIRHVLEEDIGYYLC
       :.::: :  .. :  .:.:  . :          ..:.  : .::.: .: . :.: : :
CCDS54 CKVDGTPEIRISWYKEHTKLRSAPAY--------KMQFKNNVASLVINKVDHSDVGEYSC
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pF1KA1 QASNGVGTDISKSMFLTVK---IPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEK
       .:.:.::. ...:  :..:   .: ... . . .    :    ..:   : .:. . : :
CCDS54 KADNSVGA-VASSAVLVIKARKLPPFFARKLKDVHETLGFPVAFECRINGSEPLQVSWYK
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pF1KA1 GDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTV
         ...  :  .. ... .      :.::..  .:..    ..: : :  :   .  .: .
CCDS54 DGVLLKDDANLQTSFVHN------VATLQILQTDQSHIGQYNCSASNPLGTASSSAKLIL
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pF1KA1 QEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTI
       .:   :: .... :                                              
CCDS54 SEHEVPPFFDLKPVSVDLALGESGTFKCHVTGTAPIKITWAKDNREIRPGGNYKMTLVEN
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CCDS74 IRPGGNYKMTLVENTATLTVLKVGKGDAGQYTCYASNIAGK---DSCSAQLGVQEPPRFI
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pF1KA1 VRVEDQRSMRGN-VAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRF---FITYHGGLYI
        ..: .: .. .  . ..: : .: .  ..:. : :: . :   ..:   :.   . : .
CCDS74 KKLEPSRIVKQDEFTRYECKIGGSPE--IKVL-WYKDETEIQESSKFRMSFVDSVAVLEM
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pF1KA1 SDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVE
        ... ::. . : :   :. .: .  :... :.: .:    : .    :  :.  :  :.
CCDS74 HNLSVEDS-GDYTC-EAHNAAGSA--SSSTSLKVKEP----PIFRKKPHPIETLKGADVH
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pF1KA1 LPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWT----KRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTF
       : :  .: :   . : :: : : . ...     . .:.. : .. . : : : :..::  
CCDS74 LECELQGTPPFHVSWYKDKRELRSGKKYKIMSENFLTSIHILNVDAADIGEYQCKATNDV
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pF1KA1 GSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYRNT-ELVLPDE
       ::   .: . .  : . .   . ..: .:. : :. .. :.  ... :...  :.:  ..
CCDS74 GSDTCVGSIALKAPPRFVKKLSDISTVVGKEVQLQTTIEGAEPISVVWFKDKGEIVRESD
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pF1KA1 AISIRGLSN-ETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKV
        : :    :  :: .. .. ...: : :     :   . :: ... .  :  .    :..
CCDS74 NIWISYSENIATLQFSRVEPANAGKYTCQIKNDAGMQECFATLSVLE--PATIVEKPESI
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pF1KA1 -VNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQI
        :. :.  .: :.. :.:  .. :  : . .. :     :.: .:  . .: ... .   
CCDS74 KVTTGDTCTLECTVAGTPELSTKWFKDGKELTSD-----NKYKISFFNKVSGLKIINVAP
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CCDS74 SDSGVYSFEVQNPVGKDSCTASLQVSDRTVPPSFTRKLKETNGLSGSSVVMECKVYGSPP
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pF1KA1 YSIKWYKDALLLPDNHR-QVVFENGTLKLT-DVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQ--SV
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CCDS74 ISVSWFHEGNEISSGRKYQTTLTDNTCALTVNMLEESDSGDYTC---IATNMAGSDECSA
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pF1KA1 HVAVKVPP-LIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESK
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CCDS74 PLTVREPPSFVQKPDPMDVLTGTNVTFTSIVK-GTPPFSVSWFKGSSELVPGDRCNVSLE
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pF1KA1 EFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGV
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CCDS74 DSVAELELFDVDTSQSGEYTCIVSNEAGKASCTTHLYIKAPAKFVKRLNDYSIEKGKPLI
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pF1KA1 LNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQIL--PNSSLLIRHVLEEDIGYYL
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CCDS74 LEGTFTGTPPISVTWKKNGINVTPSQRCNITTTEKSAILEIPSSTV-------EDAGQYN
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pF1KA1 CQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGD
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CCDS74 CYIENASGKDSCSAQILILEPPYFVKQLEPVKVSV-GDSASLQCQLAGTPEIGVSWYKGD
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pF1KA1 TVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQE
       : . :  .  : .  ..:    :.:: .. .: .::  . :.: :: ::  .   :::::
CCDS74 TKLRPTTT--YKMHFRNN----VATLVFNQVDINDSGEYICKAENSVGEVSASTFLTVQE
        8930        8940          8950      8960      8970         

        890         900        910        920       930       940  
pF1KA1 PPDPPEL--EIREVKAR-SMNLRWTQRFDGNSIIT-GFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISP
          :: .  ..:.:.   .. . .   ..:.  :. ..  . :  .:: . . :  . . 
CCDS74 QKLPPSFSRQLRDVQETVGLPVVFDCAISGSEPISVSWYKDGKPLKDSPNVQTSFLDNTA
    8980      8990      9000      9010      9020      9030         

            950       960       970       980       990            
pF1KA1 TINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVT---
       :.:  . .:   :. ::    . : :: .  : .: : ::   :  : .:. : ::    
CCDS74 TLNIFK-TDRSLAGQYSCT--ATNPIGSASSSARL-ILTEGKNP--PFFDIRLAPVDAVV
    9040       9050        9060      9070         9080      9090   

                1000      1010      1020      1030      1040       
pF1KA1 ------------SQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGD
                   .: :.:.:   ..:...:    :::.: :::    .. .....   ::
CCDS74 GESADFECHVTGTQPIKVSWAKDSREIRSG--GKYQISYLENS----AHLTVLKVDK-GD
          9100      9110      9120        9130          9140       

      1050      1060      1070      1080      1090      1100       
pF1KA1 SEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVA
       :  ::               : :..:    ....:    : .   ::  .. :: :    
CCDS74 SGQYT-------------CYAVNEVGKDSCTAQLNIK--ERLI--PPSFTKRLSET----
       9150                   9160      9170          9180         

      1110      1120      1130       1140      1150            1160
pF1KA1 VISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDG-EWGEMQNITTTRE------RVELRGMEKF
        .  .:     :.: . : . :  . : .. :    .:   : .      .:.  ::.  
CCDS74 -VEETEGNSFKLEGRVAGSQPITVAWYKNNIEIQPTSNCEITFKNNTLVLQVRKAGMNDA
         9190      9200      9210      9220      9230      9240    

             1170      1180      1190      1200           1210     
pF1KA1 TNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVV-----VSWLPPT
         :. .:   ..::... .: . :.  .  :     .  :  : .  :     :.   : 
CCDS74 GLYTCKV--SNDAGSALCTSSIVIKEPKKPPVFDQHLTPVTVSEGEYVQLSCHVQGSEPI
         9250        9260      9270      9280      9290      9300  

            1220       1230      1240      1250      1260      1270
pF1KA1 K----PNGVIRKYTIFCS-SPGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTS
       .      :   : .  :: : .::        :.  .:   .:. . :. :.  .. :  
CCDS74 RIQWLKAGREIKPSDRCSFSFASG--------TAVLEL-RDVAKADSGD-YVCKASNV--
           9310      9320              9330       9340       9350  

             1280        1290          1300      1310              
pF1KA1 AGRGNSSEKVTIE--PAGKAPA-KIISFGGT---VTTPWMKDVRLPCNSV--------GD
       ::  ... ::::.  ::  ::: :  .  :    :. :  ...:.  ...        ::
CCDS74 AGSDTTKSKVTIKDKPA-VAPATKKAAVDGRLFFVSEP--QSIRVVEKTTATFIAKVGGD
             9360       9370      9380        9390      9400       

       1320      1330      1340         1350      1360      1370   
pF1KA1 PAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGT---LLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDT
       : : ::::: .  .   ... :. .:: .:    : .: .   ::: : :.: :  :   
CCDS74 PIPNVKWTKGKWRQ---LNQGGRVFIHQKGDEAKLEIRDTTKTDSGLYRCVAFNEHGEIE
      9410      9420         9430      9440      9450      9460    

          1380      1390      1400      1410      1420      1430   
pF1KA1 IIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFI
         ::: :.    : ..                                            
CCDS74 SNVNLQVDERKKQEKIEGDLRAMLKKTPILKKGAGEEEEIDIMELLKNVDPKEYEKYARM
         9470      9480      9490      9500      9510      9520    

>--
 initn: 1239 init1: 210 opt: 842  Z-score: 367.4  bits: 85.6 E(32554): 3.8e-14
Smith-Waterman score: 944; 22.6% identity (51.7% similar) in 1743 aa overlap (100-1767:5575-7188)

      70        80        90       100       110       120         
pF1KA1 VPHIRHVHANGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKA---VFREP
                                     .:   ..: .:.  : . :...   ..   
CCDS74 ELTLGSKYKISVTDTVSILKIISTEKKDSGEYTFEVQNDVGR-SSCKARINVLDLIIPPS
         5550      5560      5570      5580       5590      5600   

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pF1KA1 YTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRFFITYHGG---LY
       .: ... . :..:.   ..:.. .:  . .:. .: ::   :   ... ...: .   : 
CCDS74 FTKKLKKMDSIKGSFIDLECIVAGS--HPISI-QWFKDDQEISASEKYKFSFHDNTAFLE
          5610      5620        5630       5640      5650      5660

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pF1KA1 ISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTV
       ::...  :. .:: : . .: .:.. : .: .:.: .:    : ...  .::.:  .  :
CCDS74 ISQLEGTDS-GTYTCSATNK-AGHN-QCSG-HLTVKEP----PYFVEKPQSQDVNPNTRV
              5670       5680        5690          5700      5710  

           250       260          270        280       290         
pF1KA1 ELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPL---PADSRWTKRI-TGLTISDLRTEDSGTYICEVTNT
       .:   ..:    .:.:.::.. :    : : :     :.: .   .. :::::::...: 
CCDS74 QLKALVGGTAPMTIKWFKDNKELHSGAARSVWKDDTSTSLELFAAKATDSGTYICQLSND
           5720      5730      5740      5750      5760      5770  

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pF1KA1 FGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKK-LKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELV--L
        :.: . . :.: .: .    :.  :    :... . : .::.:.. . :: . . .  .
CCDS74 VGTATSKATLFVKEPPQFIKKPSPVLVLRNGQSTTFECQITGTPKIRVSWYLDGNEITAI
           5780      5790      5800      5810      5820      5830  

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pF1KA1 PDEAIS-IRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFS
         ..:: : ::.  :. :..:.  .::.: : :   : ::.    . ...  : ..  ..
CCDS74 QKHGISFIDGLA--TFQISGARVENSGTYVCEARNDAGTASCSIELKVKE-PPTFIRELK
           5840        5850      5860      5870      5880          

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pF1KA1 EKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGP
          :    .  : : . :.::  :::  ... :     . ...::..: ... ....:  
CCDS74 PVEVVKYSDVELECEVTGTPPFEVTWLKNNREI-----RSSKKYTLTDRVSVFNLHITKC
    5890      5900      5910      5920           5930      5940    

         480       490       500        510       520       530    
pF1KA1 QIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPS-IRAMRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYY
       .  : : :.: . :  ::   ..:. .. ::: :. ..: :.:   .. ..  : : :  
CCDS74 DPSDTGEYQCIVSNEGGSCSCSTRVALKEPPSFIKKIENTTTVLKSSATFQSTVAGSPPI
         5950      5960      5970      5980      5990      6000    

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pF1KA1 SIKWYKDALLLP-DNHRQVVFENG--TLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVHV
       :: : ::  .:  :..  . : ..  ::.. .:..: . :.: :..  .  .    .  .
CCDS74 SITWLKDDQILDEDDNVYISFVDSVATLQIRSVDNGHS-GRYTCQAKNESGVERCYAFLL
         6010      6020      6030      6040       6050      6060   

             600       610       620       630       640       650 
pF1KA1 AVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEFM
       . .   ...  .   ..  . . . :::. :   ... : :::. :. .   ..  .. .
CCDS74 VQEPAQIVEKAKSVDVTEKDPMTLECVVA-GTPELKVKWLKDGKQIVPSRYFSMSFENNV
          6070      6080      6090       6100      6110      6120  

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pF1KA1 SSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIV---RVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGV
       .:..:.::  . .:.::  . :  .. : .  : :    .:: :. . ...: . :..  
CCDS74 ASFRIQSVMKQDSGQYTFKVENDFGSSSCDAYLRVLDQNIPPSFTKKLTKMDKVLGSSIH
           6130      6140      6150      6160      6170      6180  

      710       720        730       740       750       760       
pF1KA1 LNCSVDGYPPPKVMW-KHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLC
       ..:.:.:  : ...: : .:  ..  .:. :     .      :: . ..  :: . : :
CCDS74 MECKVSGSLPISAQWFKDGKEISTSAKYRLVCHERSV------SLEVNNLELEDTANYTC
           6190      6200      6210            6220      6230      

       770       780       790       800       810       820       
pF1KA1 QASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDT
       ..:: .: : . : .:::: :  .  .:.   ::   . :..   .:  :. :.: : :.
CCDS74 KVSNVAGDD-ACSGILTVKEPPSFLVKPGRQQAIPDSTVEFKAILKGTPPFKIKWFKDDV
       6240       6250      6260      6270      6280      6290     

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pF1KA1 --VIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQ
         :  :   .    .:        : :.:  .: . .  ..::. :. : :    .: : 
CCDS74 ELVSGPKCFIGLEGST--------SFLNLYSVDASKTGQYTCHVTNDVGSDSCTTMLLVT
        6300      6310              6320      6330      6340       

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pF1KA1 EPPD-PPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTI
       :::    .::  ..   . . :   .. :.  :    . ..:. .   .  : .     :
CCDS74 EPPKFVKKLEASKIVKAGDSSRLECKIAGSPEIRV--VWFRNEHE---LPASDKYRMTFI
      6350      6360      6370      6380        6390         6400  

          950       960       970        980       990      1000   
pF1KA1 NQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSE-PSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSI
       ... .....  :. .    : . : ... :.   . ::.  . . ::.  .. :.. ...
CCDS74 DSVAVIQMNNLSTED----SGDFICEAQNPAGSTSCSTKVIVKE-PPVFSSFPPIV-ETL
           6410          6420      6430      6440       6450       

          1010      1020      1030       1040      1050      1060  
pF1KA1 QVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSP-GSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQY
       . .  . . :: .:.     . :...    :. .:.:.  .   . .. ..:. . ...:
CCDS74 KNAEVSLECEL-SGTPPFEVVWYKDKRQLRSSKKYKIASKNFHTSIHILNVDT-SDIGEY
       6460       6470      6480      6490      6500       6510    

           1070      1080      1090      1100      1110      1120  
pF1KA1 GVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGV
          .:  :..:   :.. . .. :..    ::. :  :.  . ::    .::  . :.. 
CCDS74 HCKAQ--NEVG---SDTCVCTVKLKE----PPRFVSKLNSLTVVA----GEP--AELQAS
           6520         6530          6540      6550               

           1130       1140      1150      1160      1170      1180 
pF1KA1 LKGYRVIFWSLYVDGEW-GEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSV
       ..: . ::       .:  : ...    : ...  .:     .: .: ...: . . .. 
CCDS74 IEGAQPIFV------QWLKEKEEVIRESENIRITFVE-----NVATLQFAKA-EPANAGK
    6560            6570      6580      6590           6600        

            1190      1200      1210      1220      1230      1240 
pF1KA1 LYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAPSEY
          : :.:  :   .. ..     .:.:    :   . : .  :. :.  :. . .   :
CCDS74 YICQIKND-GGMRENMATLMVLEPAVIVEKAGPMTVT-VGETCTLECKVAGTPELSVEWY
      6610       6620      6630      6640       6650      6660     

                    1250            1260      1270      1280       
pF1KA1 E-----TSPEQL---FY------RIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGK
       .     :: ..    ::      ::  ..: .       . ...:... .  : .   . 
CCDS74 KDGKLLTSSQKHKFSFYNKISSLRILSVERQDAGTYTFQVQNNVGKSSCTAVVDVSDRAV
        6670      6680      6690      6700      6710      6720     

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pF1KA1 APA---KIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHT
        :.   .. . ::.. .  .    : :. .:.   .: : .  : . : ::   ..   .
CCDS74 PPSFTRRLKNTGGVLGASCI----LECKVAGSSPISVAWFH--EKTKI-VSGAKYQTTFS
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pF1KA1 NG--TLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLT
       ..  :: : .. . : : :::.:.:..: :   . : :: ::     .  :       : 
CCDS74 DNVCTLQLNSLDSSDMGNYTCVAANVAGSDECRAVLTVQEPP-----SFVKEPEP---LE
     6780      6790      6800      6810      6820              6830

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pF1KA1 WIPGDNGG--SSIRG---FVLQYSVDNSEEWK----DVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKV
        .:: :    : :::   : ...     :  :    .... ..   ..: ..  .   . 
CCDS74 VLPGKNVTFTSVIRGTPPFKVNWFRGARELVKGDRCNIYFEDTVAELELFNIDISQSGEY
             6840      6850      6860      6870      6880      6890

          1460      1470      1480       1490      1500      1510  
pF1KA1 KLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREPS-FSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITA
         ...:..:..  .  . .:    ::. : :  .:  :       . :..  .:  ::. 
CCDS74 TCVVSNNAGQASCTTRLFVK----EPAAFLK--RLSDHSVEPGKSIILESTYTGTLPIS-
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pF1KA1 IVLEYRPKGTWAWQGLRAN--SSGEVFLTELREATWYELRMRAC---NSAG---CGNETA
         . ..  :     . . :  .. .. . :. ..:  .  . .:   : ::   ::   :
CCDS74 --VTWKKDGFNITTSEKCNIVTTEKTCILEILNSTKRDAGQYSCEIENEAGRDVCG---A
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pF1KA1 QFATLD--YDGSTIPPIKSAQGEGDDVKKLFTI-GCPVILATL--GVALLFIVRKKRKEK
         .::.  :  . . :...: :  :.:.    . : : : ..   : . :    .   : 
CCDS74 LVSTLEPPYFVTELEPLEAAVG--DSVSLQCQVAGTPEITVSWYKGDTKL----RPTPEY
     7000      7010      7020        7030      7040          7050  

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pF1KA1 RLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDK
       :     .. .:.   .. :. .  :       :      . :.:         .:: : .
CCDS74 RTYFTNNVATLVFNKVNINDSGEYTCKAENSIGTASSKTVFRIQERQLPPSFARQLKDIE
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pF1KA1 ATI--PVTDAEFSQAVNPQSFC---TGVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNV
        :.  ::: .   ..  : . :    :: :.    .:..  ..:        : .. : .
CCDS74 QTVGLPVTLTCRLNGSAPIQVCWYRDGVLLRDDENLQTS--FVD--------NVATLKIL
           7120      7130      7140      7150                7160  

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pF1KA1 KSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKG
       ..  :  ..::       :.::.:  : .:. :                           
CCDS74 QTDLSHSGQYS-------CSASNPLGTASSSARLTAREPKKSPFFDIKPVSIDVIAGESA
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pF1KA1 RNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTNENADS
                                                                   
CCDS74 DFECHVTGAQPMRITWSKDNKEIRPGGNYTITCVGNTPHLRILKVGKGDSGQYTCQATND
        7220      7230      7240      7250      7260      7270     

>--
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pF1KA1 LHKARPEDVGTSLYFVNDSLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWYLATGDDIYDVPH
                                     . . :  .:::   . :.  . .....  .
CCDS74 DMCSAQLSVKEPPKFVKKLEASKVAKQGESIQLECKISGSPEIKVSWF-RNDSELHESWK
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pF1KA1 IRHVHANGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIR-SPNIRVKAVFREP-YTVR
             :..  :     :: .:    .::.: :.:..:    :  . :::    : .: .
CCDS74 YNMSFINSVALLTINEASAEDS----GDYICEAHNGVGDASCSTALTVKA---PPVFTQK
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pF1KA1 VEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRFFIT---YHGGLYISDV
            ...:. ....: : :..  .  :  : ::  ..   ..: ::   .  .:.: ..
CCDS74 PSPVGALKGSDVILQCEI-SGTPPFEVV--WVKDRKQVRNSKKFKITSKHFDTSLHILNL
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pF1KA1 QKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVELPC
       .  : .. :.: . .. ...:    .  ..  .:    : ..  . .  .  : .:::  
CCDS74 EASD-VGEYHCKATNEVGSDT---CSCSVKFKEP----PRFVKKLSDTSTLIGDAVELRA
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pF1KA1 TASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTK-----RITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGS
        . :.   .. ::::   .  .:. :.      :. : ... .. .:: :::.. :  : 
CCDS74 IVEGFQPISVVWLKDRGEVIRESENTRISFIDNIATLQLGSPEASNSGKYICQIKNDAGM
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pF1KA1 AEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAIS
        : ...: :..: ..   :. . .  :.   : :..::.::.. .:... . .  :    
CCDS74 RECSAVLTVLEPARIIEKPEPMTVTTGNPFALECVVTGTPELSAKWFKDGRELSADSKHH
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pF1KA1 IRGLSN-ETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAI-IALEDGTPRIVS-SFSEKV-
       :  ...  .: :  :. : .: :. : ....   .. .. . . :   :::  :: .:. 
CCDS74 ITFINKVASLKIPCAEMSDKGLYS-FEVKNSVGKSNCTVSVHVSD---RIVPPSFIRKLK
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pF1KA1 -VNP--GEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGP
        ::   : .  : : ..:. : .: :  : . ::   :    : ..:...   ....  :
CCDS74 DVNAILGASVVLECRVSGSAPISVGWFQDGNEIV---SGPKCQSSFSENVCTLNLSLLEP
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pF1KA1 QIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRN-ITAVAGRDTLINCRVIGYPYY
       .  : :.: :.: :..:: : .: ..:. :::..   . . .. : .  ..  . : : .
CCDS74 S--DTGIYTCVAANVAGSDECSAVLTVQEPPSFEQTPDSVEVLPGMSLTFTSVIRGTPPF
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pF1KA1 SIKWYKDAL-LLPDNHRQVVFEN--GTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVHV
       ..::.: .  :.: .  .. .:.    :.: .::  .. :.: : :  .   : : ..:.
CCDS74 KVKWFKGSRELVPGESCNISLEDFVTELELFEVQP-LESGDYSCLVT-NDAGSASCTTHL
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pF1KA1 AVKVPP-LIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEF
        :: :  ... .    .  :. . .  . . :  :: ..: ::  .: ..   .:   : 
CCDS74 FVKEPATFVKRLADFSVETGSPIVLEATYT-GTPPISVSWIKDEYLISQSERCSITMTEK
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pF1KA1 MSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLN
        . :.:   ...  ..:.:.  : :.    :  . :  :: :.   .. ... :. ..:.
CCDS74 STILEILESTIEDYAQYSCLIENEAGQDICEALVSVLEPPYFIEPLEHVEAVIGEPATLQ
      7910      7920      7930      7940      7950      7960       

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pF1KA1 CSVDGYPPPKVMW--KHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPN-SSLLIRHVLEEDIGYYLC
       :.::: :  .. :  .:.:  . :          ..:.  : .::.: .: . :.: : :
CCDS74 CKVDGTPEIRISWYKEHTKLRSAPAY--------KMQFKNNVASLVINKVDHSDVGEYSC
      7970      7980      7990              8000      8010         

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pF1KA1 QASNGVGTDISKSMFLTVK---IPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEK
       .:.:.::. ...:  :..:   .: ... . . .    :    ..:   : .:. . : :
CCDS74 KADNSVGA-VASSAVLVIKARKLPPFFARKLKDVHETLGFPVAFECRINGSEPLQVSWYK
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pF1KA1 GDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTV
         ...  :  .. ... .      :.::..  .:..    ..: : :  :   .  .: .
CCDS74 DGVLLKDDANLQTSFVHN------VATLQILQTDQSHIGQYNCSASNPLGTASSSAKLIL
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pF1KA1 QEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTI
       .:   :: .... :                                              
CCDS74 SEHEVPPFFDLKPVSVDLALGESGTFKCHVTGTAPIKITWAKDNREIRPGGNYKMTLVEN
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>>CCDS59435.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2                 (35991 aa)
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pF1KA1 PHIRHVHANGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAVFREP--YT
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CCDS59 IRPGGNYKMTLVENTATLTVLKVGKGDAGQYTCYASNIAGK---DSCSAQLGVQEPPRFI
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pF1KA1 VRVEDQRSMRGN-VAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRF---FITYHGGLYI
        ..: .: .. .  . ..: : .: .  ..:. : :: . :   ..:   :.   . : .
CCDS59 KKLEPSRIVKQDEFTRYECKIGGSPE--IKVL-WYKDETEIQESSKFRMSFVDSVAVLEM
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pF1KA1 SDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVE
        ... ::. . : :   :. .: .  :... :.: .:    : .    :  :.  :  :.
CCDS59 HNLSVEDS-GDYTC-EAHNAAGSA--SSSTSLKVKEP----PIFRKKPHPIETLKGADVH
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pF1KA1 LPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWT----KRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTF
       : :  .: :   . : :: : : . ...     . .:.. : .. . : : : :..::  
CCDS59 LECELQGTPPFHVSWYKDKRELRSGKKYKIMSENFLTSIHILNVDAADIGEYQCKATNDV
            8670      8680      8690      8700      8710      8720 

              310       320       330       340       350          
pF1KA1 GSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYRNT-ELVLPDE
       ::   .: . .  : . .   . ..: .:. : :. .. :.  ... :...  :.:  ..
CCDS59 GSDTCVGSIALKAPPRFVKKLSDISTVVGKEVQLQTTIEGAEPISVVWFKDKGEIVRESD
            8730      8740      8750      8760      8770      8780 

     360        370       380       390       400       410        
pF1KA1 AISIRGLSN-ETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKV
        : :    :  :: .. .. ...: : :     :   . :: ... .  :  .    :..
CCDS59 NIWISYSENIATLQFSRVEPANAGKYTCQIKNDAGMQECFATLSVLE--PATIVEKPESI
            8790      8800      8810      8820        8830         

       420       430       440       450       460       470       
pF1KA1 -VNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQI
        :. :.  .: :.. :.:  .. :  : . .. :     :.: .:  . .: ... .   
CCDS59 KVTTGDTCTLECTVAGTPELSTKWFKDGKELTSD-----NKYKISFFNKVSGLKIINVAP
    8840      8850      8860      8870           8880      8890    

       480       490       500           510       520       530   
pF1KA1 RDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRG---PPSI-RAMRNITAVAGRDTLINCRVIGYPY
        :.:::   ..: ::.    : ..:     :::. : ... ....: .....:.: : : 
CCDS59 SDSGVYSFEVQNPVGKDSCTASLQVSDRTVPPSFTRKLKETNGLSGSSVVMECKVYGSPP
         8900      8910      8920      8930      8940      8950    

           540       550        560        570       580           
pF1KA1 YSIKWYKDALLLPDNHR-QVVFENGTLKLT-DVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQ--SV
        :..:....  . .... :... ..:  :: .. .  : :.: :   :  ... :.  :.
CCDS59 ISVSWFHEGNEISSGRKYQTTLTDNTCALTVNMLEESDSGDYTC---IATNMAGSDECSA
         8960      8970      8980      8990         9000      9010 

     590        600       610       620       630       640        
pF1KA1 HVAVKVPP-LIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESK
        ..:. :: ..:  .   .  :  . .  .:. :  :. ..: : .. .. :.  ..  .
CCDS59 PLTVREPPSFVQKPDPMDVLTGTNVTFTSIVK-GTPPFSVSWFKGSSELVPGDRCNVSLE
            9020      9030      9040       9050      9060      9070

      650       660       670       680       690       700        
pF1KA1 EFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGV
       . .. :.. .:. ...:.::::.:: :. .:   .: ...: .:: . :. .   ::  .
CCDS59 DSVAELELFDVDTSQSGEYTCIVSNEAGKASCTTHLYIKAPAKFVKRLNDYSIEKGKPLI
             9080      9090      9100      9110      9120      9130

      710       720       730       740         750       760      
pF1KA1 LNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQIL--PNSSLLIRHVLEEDIGYYL
       :. .  : :: .: ::.   . .:.:   .  : .  ::  :.:..       :: : : 
CCDS59 LEGTFTGTPPISVTWKKNGINVTPSQRCNITTTEKSAILEIPSSTV-------EDAGQYN
             9140      9150      9160      9170             9180   

        770       780       790       800       810       820      
pF1KA1 CQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGD
       :   :. : :  ....: .. : .. .   . ... : .  :.:   :   : . : :::
CCDS59 CYIENASGKDSCSAQILILEPPYFVKQLEPVKVSV-GDSASLQCQLAGTPEIGVSWYKGD
          9190      9200      9210       9220      9230      9240  

        830       840       850       860       870       880      
pF1KA1 TVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQE
       : . :  .  : .  ..:    :.:: .. .: .::  . :.: :: ::  .   :::::
CCDS59 TKLRPTTT--YKMHFRNN----VATLVFNQVDINDSGEYICKAENSVGEVSASTFLTVQE
           9250            9260      9270      9280      9290      

        890         900        910        920       930       940  
pF1KA1 PPDPPEL--EIREVKAR-SMNLRWTQRFDGNSIIT-GFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISP
          :: .  ..:.:.   .. . .   ..:.  :. ..  . :  .:: . . :  . . 
CCDS59 QKLPPSFSRQLRDVQETVGLPVVFDCAISGSEPISVSWYKDGKPLKDSPNVQTSFLDNTA
       9300      9310      9320      9330      9340      9350      

            950       960       970       980       990            
pF1KA1 TINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVT---
       :.:  . .:   :. ::    . : :: .  : .: : ::   :  : .:. : ::    
CCDS59 TLNIFK-TDRSLAGQYSCT--ATNPIGSASSSARL-ILTEGKNP--PFFDIRLAPVDAVV
       9360       9370        9380       9390        9400      9410

                1000      1010      1020      1030      1040       
pF1KA1 ------------SQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGD
                   .: :.:.:   ..:...:    :::.: :::    .. .....   ::
CCDS59 GESADFECHVTGTQPIKVSWAKDSREIRSG--GKYQISYLENS----AHLTVLKVDK-GD
             9420      9430      9440        9450          9460    

      1050      1060      1070      1080      1090      1100       
pF1KA1 SEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVA
       :  ::               : :..:    ....:    : .   ::  .. :: :    
CCDS59 SGQYT-------------CYAVNEVGKDSCTAQLNIK--ERLI--PPSFTKRLSET----
                       9470      9480        9490        9500      

      1110      1120      1130       1140      1150            1160
pF1KA1 VISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDG-EWGEMQNITTTRE------RVELRGMEKF
        .  .:     :.: . : . :  . : .. :    .:   : .      .:.  ::.  
CCDS59 -VEETEGNSFKLEGRVAGSQPITVAWYKNNIEIQPTSNCEITFKNNTLVLQVRKAGMNDA
            9510      9520      9530      9540      9550      9560 

             1170      1180      1190      1200           1210     
pF1KA1 TNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVV-----VSWLPPT
         :. .:   ..::... .: . :.  .  :     .  :  : .  :     :.   : 
CCDS59 GLYTCKV--SNDAGSALCTSSIVIKEPKKPPVFDQHLTPVTVSEGEYVQLSCHVQGSEPI
              9570      9580      9590      9600      9610         

            1220       1230      1240      1250      1260      1270
pF1KA1 K----PNGVIRKYTIFCS-SPGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTS
       .      :   : .  :: : .::        :.  .:   .:. . :. :.  .. :  
CCDS59 RIQWLKAGREIKPSDRCSFSFASG--------TAVLEL-RDVAKADSGD-YVCKASNV--
    9620      9630      9640               9650       9660         

             1280        1290          1300      1310              
pF1KA1 AGRGNSSEKVTIE--PAGKAPA-KIISFGGT---VTTPWMKDVRLPCNSV--------GD
       ::  ... ::::.  ::  ::: :  .  :    :. :  ...:.  ...        ::
CCDS59 AGSDTTKSKVTIKDKPA-VAPATKKAAVDGRLFFVSEP--QSIRVVEKTTATFIAKVGGD
      9670      9680       9690      9700        9710      9720    

       1320      1330      1340         1350      1360      1370   
pF1KA1 PAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGT---LLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDT
       : : ::::: .  .   ... :. .:: .:    : .: .   ::: : :.: :  :   
CCDS59 PIPNVKWTKGKWRQ---LNQGGRVFIHQKGDEAKLEIRDTTKTDSGLYRCVAFNEHGEIE
         9730         9740      9750      9760      9770      9780 

          1380      1390      1400      1410      1420      1430   
pF1KA1 IIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFI
         ::: :.    : ..                                            
CCDS59 SNVNLQVDERKKQEKIEGDLRAMLKKTPILKKGAGEEEEIDIMELLKNVDPKEYEKYARM
            9790      9800      9810      9820      9830      9840 

>--
 initn: 1239 init1: 210 opt: 842  Z-score: 367.1  bits: 85.7 E(32554): 4e-14
Smith-Waterman score: 944; 22.6% identity (51.7% similar) in 1743 aa overlap (100-1767:5892-7505)

      70        80        90       100       110       120         
pF1KA1 VPHIRHVHANGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKA---VFREP
                                     .:   ..: .:.  : . :...   ..   
CCDS59 ELTLGSKYKISVTDTVSILKIISTEKKDSGEYTFEVQNDVGR-SSCKARINVLDLIIPPS
            5870      5880      5890      5900       5910      5920

        130       140       150       160       170       180      
pF1KA1 YTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRFFITYHGG---LY
       .: ... . :..:.   ..:.. .:  . .:. .: ::   :   ... ...: .   : 
CCDS59 FTKKLKKMDSIKGSFIDLECIVAGS--HPISI-QWFKDDQEISASEKYKFSFHDNTAFLE
             5930      5940        5950       5960      5970       

           190       200       210       220       230       240   
pF1KA1 ISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTV
       ::...  :. .:: : . .: .:.. : .: .:.: .:    : ...  .::.:  .  :
CCDS59 ISQLEGTDS-GTYTCSATNK-AGHN-QCSG-HLTVKEP----PYFVEKPQSQDVNPNTRV
      5980       5990       6000        6010          6020         

           250       260          270        280       290         
pF1KA1 ELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPL---PADSRWTKRI-TGLTISDLRTEDSGTYICEVTNT
       .:   ..:    .:.:.::.. :    : : :     :.: .   .. :::::::...: 
CCDS59 QLKALVGGTAPMTIKWFKDNKELHSGAARSVWKDDTSTSLELFAAKATDSGTYICQLSND
    6030      6040      6050      6060      6070      6080         

     300       310       320        330       340       350        
pF1KA1 FGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKK-LKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELV--L
        :.: . . :.: .: .    :.  :    :... . : .::.:.. . :: . . .  .
CCDS59 VGTATSKATLFVKEPPQFIKKPSPVLVLRNGQSTTFECQITGTPKIRVSWYLDGNEITAI
    6090      6100      6110      6120      6130      6140         

        360        370       380       390       400       410     
pF1KA1 PDEAIS-IRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFS
         ..:: : ::.  :. :..:.  .::.: : :   : ::.    . ...  : ..  ..
CCDS59 QKHGISFIDGLA--TFQISGARVENSGTYVCEARNDAGTASCSIELKVKE-PPTFIRELK
    6150      6160        6170      6180      6190       6200      

         420       430       440       450       460       470     
pF1KA1 EKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGP
          :    .  : : . :.::  :::  ... :     . ...::..: ... ....:  
CCDS59 PVEVVKYSDVELECEVTGTPPFEVTWLKNNREI-----RSSKKYTLTDRVSVFNLHITKC
       6210      6220      6230           6240      6250      6260 

         480       490       500        510       520       530    
pF1KA1 QIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPS-IRAMRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYY
       .  : : :.: . :  ::   ..:. .. ::: :. ..: :.:   .. ..  : : :  
CCDS59 DPSDTGEYQCIVSNEGGSCSCSTRVALKEPPSFIKKIENTTTVLKSSATFQSTVAGSPPI
            6270      6280      6290      6300      6310      6320 

          540        550         560       570       580       590 
pF1KA1 SIKWYKDALLLP-DNHRQVVFENG--TLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVHV
       :: : ::  .:  :..  . : ..  ::.. .:..: . :.: :..  .  .    .  .
CCDS59 SITWLKDDQILDEDDNVYISFVDSVATLQIRSVDNGHS-GRYTCQAKNESGVERCYAFLL
            6330      6340      6350       6360      6370      6380

             600       610       620       630       640       650 
pF1KA1 AVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEFM
       . .   ...  .   ..  . . . :::. :   ... : :::. :. .   ..  .. .
CCDS59 VQEPAQIVEKAKSVDVTEKDPMTLECVVA-GTPELKVKWLKDGKQIVPSRYFSMSFENNV
             6390      6400       6410      6420      6430         

             660       670       680          690       700        
pF1KA1 SSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIV---RVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGV
       .:..:.::  . .:.::  . :  .. : .  : :    .:: :. . ...: . :..  
CCDS59 ASFRIQSVMKQDSGQYTFKVENDFGSSSCDAYLRVLDQNIPPSFTKKLTKMDKVLGSSIH
    6440      6450      6460      6470      6480      6490         

      710       720        730       740       750       760       
pF1KA1 LNCSVDGYPPPKVMW-KHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLC
       ..:.:.:  : ...: : .:  ..  .:. :     .      :: . ..  :: . : :
CCDS59 MECKVSGSLPISAQWFKDGKEISTSAKYRLVCHERSV------SLEVNNLELEDTANYTC
    6500      6510      6520      6530            6540      6550   

       770       780       790       800       810       820       
pF1KA1 QASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDT
       ..:: .: : . : .:::: :  .  .:.   ::   . :..   .:  :. :.: : :.
CCDS59 KVSNVAGDD-ACSGILTVKEPPSFLVKPGRQQAIPDSTVEFKAILKGTPPFKIKWFKDDV
          6560       6570      6580      6590      6600      6610  

         830       840       850       860       870       880     
pF1KA1 --VIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQ
         :  :   .    .:        : :.:  .: . .  ..::. :. : :    .: : 
CCDS59 ELVSGPKCFIGLEGST--------SFLNLYSVDASKTGQYTCHVTNDVGSDSCTTMLLVT
           6620              6630      6640      6650      6660    

          890       900       910       920       930       940    
pF1KA1 EPPD-PPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTI
       :::    .::  ..   . . :   .. :.  :    . ..:. .   .  : .     :
CCDS59 EPPKFVKKLEASKIVKAGDSSRLECKIAGSPEIRV--VWFRNEHE---LPASDKYRMTFI
         6670      6680      6690        6700         6710         

          950       960       970        980       990      1000   
pF1KA1 NQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSE-PSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSI
       ... .....  :. .    : . : ... :.   . ::.  . . ::.  .. :.. ...
CCDS59 DSVAVIQMNNLSTED----SGDFICEAQNPAGSTSCSTKVIVKE-PPVFSSFPPIV-ETL
    6720      6730          6740      6750       6760      6770    

          1010      1020      1030       1040      1050      1060  
pF1KA1 QVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSP-GSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQY
       . .  . . :: .:.     . :...    :. .:.:.  .   . .. ..:. . ...:
CCDS59 KNAEVSLECEL-SGTPPFEVVWYKDKRQLRSSKKYKIASKNFHTSIHILNVDT-SDIGEY
          6780       6790      6800      6810      6820       6830 

           1070      1080      1090      1100      1110      1120  
pF1KA1 GVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGV
          .:  :..:   :.. . .. :..    ::. :  :.  . ::    .::  . :.. 
CCDS59 HCKAQ--NEVG---SDTCVCTVKLKE----PPRFVSKLNSLTVVA----GEP--AELQAS
              6840         6850          6860          6870        

           1130       1140      1150      1160      1170      1180 
pF1KA1 LKGYRVIFWSLYVDGEW-GEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSV
       ..: . ::       .:  : ...    : ...  .:     .: .: ...: . . .. 
CCDS59 IEGAQPIFV------QWLKEKEEVIRESENIRITFVE-----NVATLQFAKA-EPANAGK
       6880            6890      6900           6910       6920    

            1190      1200      1210      1220      1230      1240 
pF1KA1 LYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAPSEY
          : :.:  :   .. ..     .:.:    :   . : .  :. :.  :. . .   :
CCDS59 YICQIKND-GGMRENMATLMVLEPAVIVEKAGPMTVT-VGETCTLECKVAGTPELSVEWY
         6930       6940      6950      6960       6970      6980  

                    1250            1260      1270      1280       
pF1KA1 E-----TSPEQL---FY------RIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGK
       .     :: ..    ::      ::  ..: .       . ...:... .  : .   . 
CCDS59 KDGKLLTSSQKHKFSFYNKISSLRILSVERQDAGTYTFQVQNNVGKSSCTAVVDVSDRAV
           6990      7000      7010      7020      7030      7040  

      1290         1300      1310      1320      1330      1340    
pF1KA1 APA---KIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHT
        :.   .. . ::.. .  .    : :. .:.   .: : .  : . : ::   ..   .
CCDS59 PPSFTRRLKNTGGVLGASCI----LECKVAGSSPISVAWFH--EKTKI-VSGAKYQTTFS
           7050      7060          7070        7080       7090     

           1350      1360      1370      1380      1390      1400  
pF1KA1 NG--TLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLT
       ..  :: : .. . : : :::.:.:..: :   . : :: ::     .  :       : 
CCDS59 DNVCTLQLNSLDSSDMGNYTCVAANVAGSDECRAVLTVQEPP-----SFVKEPEP---LE
        7100      7110      7120      7130           7140          

           1410           1420          1430      1440      1450   
pF1KA1 WIPGDNGG--SSIRG---FVLQYSVDNSEEWK----DVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKV
        .:: :    : :::   : ...     :  :    .... ..   ..: ..  .   . 
CCDS59 VLPGKNVTFTSVIRGTPPFKVNWFRGARELVKGDRCNIYFEDTVAELELFNIDISQSGEY
      7150      7160      7170      7180      7190      7200       

          1460      1470      1480       1490      1500      1510  
pF1KA1 KLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREPS-FSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITA
         ...:..:..  .  . .:    ::. : :  .:  :       . :..  .:  ::. 
CCDS59 TCVVSNNAGQASCTTRLFVK----EPAAFLK--RLSDHSVEPGKSIILESTYTGTLPIS-
      7210      7220          7230        7240      7250      7260 

           1520      1530        1540      1550            1560    
pF1KA1 IVLEYRPKGTWAWQGLRAN--SSGEVFLTELREATWYELRMRAC---NSAG---CGNETA
         . ..  :     . . :  .. .. . :. ..:  .  . .:   : ::   ::   :
CCDS59 --VTWKKDGFNITTSEKCNIVTTEKTCILEILNSTKRDAGQYSCEIENEAGRDVCG---A
               7270      7280      7290      7300      7310        

         1570        1580      1590       1600        1610         
pF1KA1 QFATLD--YDGSTIPPIKSAQGEGDDVKKLFTI-GCPVILATL--GVALLFIVRKKRKEK
         .::.  :  . . :...: :  :.:.    . : : : ..   : . :    .   : 
CCDS59 LVSTLEPPYFVTELEPLEAAVG--DSVSLQCQVAGTPEITVSWYKGDTKL----RPTPEY
        7320      7330        7340      7350      7360             

    1620      1630      1640      1650      1660      1670         
pF1KA1 RLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDK
       :     .. .:.   .. :. .  :       :      . :.:         .:: : .
CCDS59 RTYFTNNVATLVFNKVNINDSGEYTCKAENSIGTASSKTVFRIQERQLPPSFARQLKDIE
    7370      7380      7390      7400      7410      7420         

    1680        1690         1700      1710      1720      1730    
pF1KA1 ATI--PVTDAEFSQAVNPQSFC---TGVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNV
        :.  ::: .   ..  : . :    :: :.    .:..  ..:        : .. : .
CCDS59 QTVGLPVTLTCRLNGSAPIQVCWYRDGVLLRDDENLQTS--FVD--------NVATLKIL
    7430      7440      7450      7460        7470                 

         1740      1750      1760      1770      1780      1790    
pF1KA1 KSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKG
       ..  :  ..::       :.::.:  : .:. :                           
CCDS59 QTDLSHSGQYS-------CSASNPLGTASSSARLTAREPKKSPFFDIKPVSIDVIAGESA
    7480      7490             7500      7510      7520      7530  

         1800      1810      1820      1830      1840      1850    
pF1KA1 RNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTNENADS
                                                                   
CCDS59 DFECHVTGAQPMRITWSKDNKEIRPGGNYTITCVGNTPHLRILKVGKGDSGQYTCQATND
           7540      7550      7560      7570      7580      7590  

>--
 initn: 367 init1: 196 opt: 826  Z-score: 360.2  bits: 84.4 E(32554): 9.7e-14
Smith-Waterman score: 848; 24.1% identity (54.9% similar) in 884 aa overlap (43-898:7626-8463)

             20        30        40        50        60        70  
pF1KA1 LHKARPEDVGTSLYFVNDSLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWYLATGDDIYDVPH
                                     . . :  .:::   . :.  . .....  .
CCDS59 DMCSAQLSVKEPPKFVKKLEASKVAKQGESIQLECKISGSPEIKVSWF-RNDSELHESWK
        7600      7610      7620      7630      7640       7650    

             80        90       100       110        120        130
pF1KA1 IRHVHANGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIR-SPNIRVKAVFREP-YTVR
             :..  :     :: .:    .::.: :.:..:    :  . :::    : .: .
CCDS59 YNMSFINSVALLTINEASAEDS----GDYICEAHNGVGDASCSTALTVKA---PPVFTQK
         7660      7670          7680      7690      7700          

              140       150       160       170          180       
pF1KA1 VEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRFFIT---YHGGLYISDV
            ...:. ....: : :..  .  :  : ::  ..   ..: ::   .  .:.: ..
CCDS59 PSPVGALKGSDVILQCEI-SGTPPFEVV--WVKDRKQVRNSKKFKITSKHFDTSLHILNL
      7710      7720       7730        7740      7750      7760    

       190       200       210       220       230       240       
pF1KA1 QKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVELPC
       .  : .. :.: . .. ...:    .  ..  .:    : ..  . .  .  : .:::  
CCDS59 EASD-VGEYHCKATNEVGSDT---CSCSVKFKEP----PRFVKKLSDTSTLIGDAVELRA
          7770      7780         7790          7800      7810      

       250       260       270            280       290       300  
pF1KA1 TASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTK-----RITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGS
        . :.   .. ::::   .  .:. :.      :. : ... .. .:: :::.. :  : 
CCDS59 IVEGFQPISVVWLKDRGEVIRESENTRISFIDNIATLQLGSPEASNSGKYICQIKNDAGM
       7820      7830      7840      7850      7860      7870      

            310       320       330       340       350       360  
pF1KA1 AEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAIS
        : ...: :..: ..   :. . .  :.   : :..::.::.. .:... . .  :    
CCDS59 RECSAVLTVLEPARIIEKPEPMTVTTGNPFALECVVTGTPELSAKWFKDGRELSADSKHH
       7880      7890      7900      7910      7920      7930      

             370       380       390       400        410          
pF1KA1 IRGLSN-ETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAI-IALEDGTPRIVS-SFSEKV-
       :  ...  .: :  :. : .: :. : ....   .. .. . . :   :::  :: .:. 
CCDS59 ITFINKVASLKIPCAEMSDKGLYS-FEVKNSVGKSNCTVSVHVSD---RIVPPSFIRKLK
       7940      7950      7960       7970      7980         7990  

       420         430       440       450       460       470     
pF1KA1 -VNP--GEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGP
        ::   : .  : : ..:. : .: :  : . ::   :    : ..:...   ....  :
CCDS59 DVNAILGASVVLECRVSGSAPISVGWFQDGNEIV---SGPKCQSSFSENVCTLNLSLLEP
           8000      8010      8020         8030      8040         

         480       490       500       510        520       530    
pF1KA1 QIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRN-ITAVAGRDTLINCRVIGYPYY
       .  : :.: :.: :..:: : .: ..:. :::..   . . .. : .  ..  . : : .
CCDS59 S--DTGIYTCVAANVAGSDECSAVLTVQEPPSFEQTPDSVEVLPGMSLTFTSVIRGTPPF
    8050        8060      8070      8080      8090      8100       

          540        550         560       570       580       590 
pF1KA1 SIKWYKDAL-LLPDNHRQVVFEN--GTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVHV
       ..::.: .  :.: .  .. .:.    :.: .::  .. :.: : :  .   : : ..:.
CCDS59 KVKWFKGSRELVPGESCNISLEDFVTELELFEVQP-LESGDYSCLVT-NDAGSASCTTHL
      8110      8120      8130      8140       8150       8160     

              600       610       620       630       640       650
pF1KA1 AVKVPP-LIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEF
        :: :  ... .    .  :. . .  . . :  :: ..: ::  .: ..   .:   : 
CCDS59 FVKEPATFVKRLADFSVETGSPIVLEATYT-GTPPISVSWIKDEYLISQSERCSITMTEK
        8170      8180      8190       8200      8210      8220    

              660       670       680       690       700       710
pF1KA1 MSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLN
        . :.:   ...  ..:.:.  : :.    :  . :  :: :.   .. ... :. ..:.
CCDS59 STILEILESTIEDYAQYSCLIENEAGQDICEALVSVLEPPYFIEPLEHVEAVIGEPATLQ
         8230      8240      8250      8260      8270      8280    

              720         730       740        750       760       
pF1KA1 CSVDGYPPPKVMW--KHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPN-SSLLIRHVLEEDIGYYLC
       :.::: :  .. :  .:.:  . :          ..:.  : .::.: .: . :.: : :
CCDS59 CKVDGTPEIRISWYKEHTKLRSAPAY--------KMQFKNNVASLVINKVDHSDVGEYSC
         8290      8300      8310              8320      8330      

       770       780          790       800       810       820    
pF1KA1 QASNGVGTDISKSMFLTVK---IPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEK
       .:.:.::. ...:  :..:   .: ... . . .    :    ..:   : .:. . : :
CCDS59 KADNSVGA-VASSAVLVIKARKLPPFFARKLKDVHETLGFPVAFECRINGSEPLQVSWYK
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pF1KA1 GDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTV
         ...  :  .. ... .      :.::..  .:..    ..: : :  :   .  .: .
CCDS59 DGVLLKDDANLQTSFVHN------VATLQILQTDQSHIGQYNCSASNPLGTASSSAKLIL
        8400      8410            8420      8430      8440         

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pF1KA1 QEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTI
       .:   :: .... :                                              
CCDS59 SEHEVPPFFDLKPVSVDLALGESGTFKCHVTGTAPIKITWAKDNREIRPGGNYKMTLVEN
    8450      8460      8470      8480      8490      8500         

>>CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11             (1386 aa)
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           380       390       400       410       420       430   
pF1KA1 TSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKG
                                     ::. :::: .  . .:. ::  .: : :.:
CCDS44 LLGFNSSLAALNHTLLPPGDPSLNGSRVGPEDAMPRIVEQPPDLLVSRGEPATLPCRAEG
      30        40        50        60        70        80         

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pF1KA1 APPPTVTWALDDEPI--VRDGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIR-DGGVYRCTARNL
        : :.. :  .   .  ::. . :...  . .:. .    : : . : : ::: :.::: 
CCDS44 RPRPNIEWYKNGARVATVRE-DPRAHRLLLPSGALFFPRIVHGRRARPDEGVYTCVARNY
      90       100        110       120       130       140        

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pF1KA1 VGSAEYQA---RINVRGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVI-GYPYYSIKWYKDALLLP
       .:.:  .    .. :      ..  :.....:. ....:    :.:  :..: ::.  : 
CCDS44 LGAAASRNASLEVAVLRDDFRQSPGNVVVAVGEPAVLECVPPRGHPEPSVSWRKDGARLK
      150       160       170       180       190       200        

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pF1KA1 DNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLC--SVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEF
       ... ......: : .. . :. : : :.:  : .   . : .  : :  .   : .: . 
CCDS44 EEEGRITIRGGKLMMSHTLKS-DAGMYVCVASNMAGERESAAAEVMVLERPSFLRRPVNQ
      210       220        230       240       250       260       

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pF1KA1 PPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHN
          . . . .. : :. :: : :. :::.   . .:    :.: .   :: :. :: . .
CCDS44 VVLADAPVTFL-CEVK-GDPPPRLRWRKEDGELPTGR-YEIRSDH---SLWIGHVSAEDE
       270        280        290       300           310       320 

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pF1KA1 GNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWK
       :.:::.: :... .    .: :.:::..:.::..: .  :.. ...: . : ::: ..:.
CCDS44 GTYTCVAENSVGRAEASGSLSVHVPPQLVTQPQDQMAAPGESVAFQCETKGNPPPAIFWQ
             330       340       350       360       370       380 

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pF1KA1 HAKGSGN---PQQ-YHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKS
       . .::     :.:  .:   :::... : ..: :  : . : :::.::: . .:. ..:.
CCDS44 K-EGSQVLLFPSQSLQP---TGRFSVSPRGQLNITAVQRGDAGYYVCQAVSVAGSILAKA
              390          400       410       420       430       

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pF1KA1 MFLTVK------IPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRV
       . : .:      .: .: . : .   . : .  : : . :.    .::.:    .. : .
CCDS44 L-LEIKGASLDGLPPVILQGPANQTLVLGSSVWLPCRVTGNPQPSVRWKKDGQWLQGDDL
        440       450       460       470       480       490      

          840       850       860       870                  880   
pF1KA1 MRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGE-----------DRGLIQLT
       .  ..:   ::     :: .  ... :  :.:: : .: ::           : :.    
CCDS44 QFKTMA---NG-----TLYIANVQEMDMGFYSCVAKSSTGEATWSGWLKMREDWGVSPDP
        500               510       520       530       540        

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pF1KA1 VQEPPDPP----ELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRN
         :: .::    .  . :.   :..: :    . .. .:.. ::  . . .  ..  . .
CCDS44 PTEPSSPPGAPSQPVVTEITKNSITLTWKPNPQTGAAVTSYVIEAFSPAAGNTWRTVADG
      550       560       570       580       590       600        

     940       950       960       970        980       990        
pF1KA1 ISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSK-ELTISTEEAAPDGPPMD------
       ..  ..  ..  :.: ..: . . . .  : ::::     . :....:. :  :      
CCDS44 VQ--LETHTVSGLQPNTIYLFLVRAVGAWGLSEPSPVSEPVRTQDSSPSRPVEDPWRGQQ
      610         620       630       640       650       660      

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pF1KA1 ------VTLQ-PVT--SQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMK
             : :: :..   ...::.: .    .:  ...:.....:  .:  .:........
CCDS44 GLAEVAVRLQEPIVLGPRTLQVSWTVDGP-VQ--LVQGFRVSWRVAGP-EGGSWTMLDLQ
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pF1KA1 ATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVR-ALSI
       . ... . .: .:   .:  . ::: .. : :  :  .. .  :..:: ::..:  ::. 
CCDS44 SPSQQST-VLRGLPPGTQIQIKVQAQGQEGLGAESLSVTRSIPEEAPSGPPQGVAVALGG
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pF1KA1 TSDVAV-ISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFT
        .. .. .::  :  :  :::.  :..  : :  ....   .. .   . . :::.    
CCDS44 DGNSSITVSWEPPLPSQQNGVITEYQI--WCLGNESRFHLNRSAAGWARSAMLRGLVPGL
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            1170      1180      1190      1200      1210      1220 
pF1KA1 NYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVI
        : . : : :.:: :: :. . .:    .:.::                           
CCDS44 LYRTLVAAATSAGVGVPSAPVLVQ----LPSPPDLEPGLEVGAGLAVRLARVLREPAFLA
     840       850       860           870       880       890     

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pF1KA1 RKYTIFCSSPGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVT
                                                                   
CCDS44 GSGAACGALLLGLCAALYWRRKQRKELSHYTASFAYTPAVSFPHSEGLSGASSRPPMGLG
         900       910       920       930       940       950     

>>CCDS2557.1 CNTN6 gene_id:27255|Hs108|chr3               (1028 aa)
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         270       280       290       300       310       320     
pF1KA1 LPADSRWTKRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLK
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CCDS25                  MRLLWKLVILLPLINSSAGDGLLSRPIFTQEP-HDVIFPLDLS
                                10        20        30         40  

         330       340       350       360        370       380    
pF1KA1 TGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAISIRG-LSNETLLITSAQKSHS-GA
           : :::.:: .: :    :: .:   .  : ..: .  :.. .: :.: . ... : 
CCDS25 K---SEVILNCAANGYPSPHYRWKQNGTDI--DFTMSYHYRLDGGSLAINSPHTDQDIGM
                50        60          70        80        90       

                   390       400       410       420       430     
pF1KA1 YQCFAT--------RKAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAP
       :::.::        :::.   .:: :  ::   .  :. :   :  :.   :.:.    :
CCDS25 YQCLATNLLGTILSRKAKL--QFAYI--EDFETKTRSTVS---VREGQGVVLLCG----P
       100       110         120         130          140          

              440       450       460       470       480          
pF1KA1 PP-----TVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRC-----
       ::     . .:...:.:.     .. :.  .:. :  ... ..  .  : : : :     
CCDS25 PPHFGDLSYAWTFNDNPLY---VQEDNRRFVSQET--GNLYIAKVEPSDVGNYTCFITNK
        150       160          170         180       190       200 

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pF1KA1 -TARNLVGS------------AEYQARINVRGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVIGYP
        . :.. :             .::. .:.:: : .:.: .. ..:      ..: ..: :
CCDS25 EAQRSVQGPPTPLVQRTDGVMGEYEPKIEVRFPETIQAAKD-SSVK-----LECFALGNP
             210       220       230       240             250     

            540        550       560       570         580         
pF1KA1 YYSIKWYK-DALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLC--SVLIQPQLSISQSV
         .:.: . :.  :: .. .    .. :.. . :.  ::: : :  : :   .:. .: .
CCDS25 VPDISWRRLDGSPLP-GKVKYSKSQAILEIPNFQQ-EDEGFYECIASNLRGRNLAKGQLI
         260       270        280        290       300       310   

     590        600       610       620       630       640        
pF1KA1 HVAVKVPPLI-QPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESK
         :   ::   : ..    :: . :   : .:.   :   :: :.:. .     . ::. 
CCDS25 FYA---PPEWEQKIQNTHLSIYDNLLWECKASGKPNPWY-TWLKNGERLNPEERIQIEN-
              320       330       340        350       360         

      650       660       670       680        690       700       
pF1KA1 EFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQL-IVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAG
          ..: :. .... .: : : : :    .  . .: ..   : :  .: .. ..   .:
CCDS25 ---GTLIITMLNVSDSGVYQCAAENKYQIIYANAELRVLASAPDFSKSPVKKKSFVQVGG
         370       380       390       400       410       420     

         710       720       730       740       750       760     
pF1KA1 --VLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYY
         :..:. ...:   . ::  .:. . .:      . :: .: ..:: : .. . : : :
CCDS25 DIVIGCKPNAFPRAAISWK--RGTETLRQ------SKRIFLLEDGSLKIYNITRSDAGSY
         430       440         450             460       470       

         770       780       790       800       810         820   
pF1KA1 LCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPI--IIRWE
        : :.:  ::  ...  : ::  ..::  :.   .  :..  : : .  .  :  .. : 
CCDS25 TCIATNQFGT-AKNTGSLIVKERTVITVPPSKMDVTVGESIVLPCQVSHDPSIEVVFVWF
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pF1KA1 KGDTVIDPDRVMRYAIATKDN-GDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQL
        .  :::    .. ..:  .  : : :. : ..  .   :  . : . ..     .. ..
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pF1KA1 TVQEPPDPPE-LEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNK-SDSWDFKQSTRNI
        :. :: ::: ........ . .: :    :.:: :  : :. ..  : .:   :.. ..
CCDS25 IVRGPPGPPEDVQVEDISSTTSQLSWRAGPDNNSPIQIFTIQTRTPFSVGW---QAVATV
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          .:    .:..: : :   : .:. . :.:: .:::.  :: . :. ..:   :... 
CCDS25 PEILNGKTYNATVVGLSPWVEYEFRVVAGNSIGIGEPSEPSEL-LRTKASVPVVAPVNIH
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pF1KA1 LQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSE-VYTL
           . . . .::..  .:::::   :: : .:   : ..  .:  ..... .:. ::  
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       ...  .. . : : ..:  : :  :.   . . :: :.  :...   :....   .::. 
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          .  .: . ::.:..:.    ..  :...   :.::     .. :..  : : ..: :
CCDS25 IAWNRNTGRVLGYEVLYWTDDSKESMIGKIRVSGNVTTK----NITGLKANTIYFASVRA
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pF1KA1 YTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPG-PPAGIKAVPSSASSVVVSW--LPPTKPNGVIRKYTI
       :. :: :  :  . . ::.. :. :::.: :   . :.. ..:  .   . .. .  : :
CCDS25 YNTAGTGPSSPPVNVTTKKSPPSQPPANI-AWKLTNSKLCLNWEHVKTMENESEVLGYKI
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pF1KA1 FCSSPGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAG
       .  .  ...    : ...  .:.  .      ..::. . .:...: :.:::.. :   .
CCDS25 LYRQNRQSKTHILETNNTSAELLVPFE-----EDYLIEIRTVSDGGDGSSSEEIRIPKMS
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pF1KA1 KAPAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNG
       .  .. :.:                                                   
CCDS25 SLSSRGIQFLEPSTHFLSIVIVIFHCFAIQPLI                           
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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