Result of FASTA (ccds) for pF1KA1071
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1071, 1084 aa
  1>>>pF1KA1071 1084 - 1084 aa - 1084 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.9311+/-0.00119; mu= -14.0365+/- 0.071
 mean_var=601.7599+/-127.009, 0's: 0 Z-trim(115.1): 26  B-trim: 132 in 1/53
 Lambda= 0.052283
 statistics sampled from 15640 (15661) to 15640 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.754), E-opt: 0.2 (0.481), width:  16
 Scan time:  4.040

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS48154.1 AMOT gene_id:154796|Hs108|chrX         (1084) 7122 553.0 1.3e-156
CCDS14563.1 AMOT gene_id:154796|Hs108|chrX         ( 675) 4259 336.8 9.5e-92
CCDS73368.1 AMOTL1 gene_id:154810|Hs108|chr11      ( 906) 1889 158.2 7.7e-38
CCDS44712.1 AMOTL1 gene_id:154810|Hs108|chr11      ( 956) 1884 157.8   1e-37
CCDS33860.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs108|chr3        ( 780) 1325 115.6 4.4e-25
CCDS63784.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs108|chr3        ( 837) 1325 115.6 4.7e-25
CCDS63783.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs108|chr3        ( 777) 1311 114.5 9.2e-25


>>CCDS48154.1 AMOT gene_id:154796|Hs108|chrX              (1084 aa)
 initn: 7122 init1: 7122 opt: 7122  Z-score: 2925.0  bits: 553.0 E(32554): 1.3e-156
Smith-Waterman score: 7122; 100.0% identity (100.0% similar) in 1084 aa overlap (1-1084:1-1084)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MRNSEEQPSGGTTVLQRLLQEQLRYGNPSENRSLLAIHQQATGNGPPFPSGSGNPGPQSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MRNSEEQPSGGTTVLQRLLQEQLRYGNPSENRSLLAIHQQATGNGPPFPSGSGNPGPQSD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 VLSPQDHHQQLVAHAARQEPQGQEIQSENLIMEKQLSPRMQNNEELPTYEEAKVQSQYFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VLSPQDHHQQLVAHAARQEPQGQEIQSENLIMEKQLSPRMQNNEELPTYEEAKVQSQYFR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 GQQHASVGAAFYVTGVTNQKMRTEGRPSVQRLNPGKMHQDEGLRDLKQGHVRSLSERLMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GQQHASVGAAFYVTGVTNQKMRTEGRPSVQRLNPGKMHQDEGLRDLKQGHVRSLSERLMQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 MSLATSGVKAHPPVTSAPLSPPQPNDLYKNPTSSSEFYKAQGPLPNQHSLKGMEHRGPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MSLATSGVKAHPPVTSAPLSPPQPNDLYKNPTSSSEFYKAQGPLPNQHSLKGMEHRGPPP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 EYPFKGMPPQSVVCKPQEPGHFYSEHRLNQPGRTEGQLMRYQHPPEYGAARPAQDISLPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EYPFKGMPPQSVVCKPQEPGHFYSEHRLNQPGRTEGQLMRYQHPPEYGAARPAQDISLPL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 SARNSQPHSPTSSLTSGGSLPLLQSPPSTRLSPARHPLVPNQGDHSAHLPRPQQHFLPNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SARNSQPHSPTSSLTSGGSLPLLQSPPSTRLSPARHPLVPNQGDHSAHLPRPQQHFLPNQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 AHQGDHYRLSQPGLSQQQQQQQQQHHHHHHHQQQQQQQPQQQPGEAYSAMPRAQPSSASY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AHQGDHYRLSQPGLSQQQQQQQQQHHHHHHHQQQQQQQPQQQPGEAYSAMPRAQPSSASY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 QPVPADPFAIVSRAQQMVEILSDENRNLRQELEGCYEKVARLQKVETEIQRVSEAYENLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QPVPADPFAIVSRAQQMVEILSDENRNLRQELEGCYEKVARLQKVETEIQRVSEAYENLV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 KSSSKREALEKAMRNKLEGEIRRMHDFNRDLRERLETANKQLAEKEYEGSEDTRKTISQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KSSSKREALEKAMRNKLEGEIRRMHDFNRDLRERLETANKQLAEKEYEGSEDTRKTISQL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 FAKNKESQREKEKLEAELATARSTNEDQRRHIEIRDQALSNAQAKVVKLEEELKKKQVYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FAKNKESQREKEKLEAELATARSTNEDQRRHIEIRDQALSNAQAKVVKLEEELKKKQVYV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 DKVEKMQQALVQLQAACEKREQLEHRLRTRLERELESLRIQQRQGNCQPTNVSEYNAAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DKVEKMQQALVQLQAACEKREQLEHRLRTRLERELESLRIQQRQGNCQPTNVSEYNAAAL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 MELLREKEERILALEADMTKWEQKYLEENVMRHFALDAAATVAAQRDTTVISHSPNTSYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MELLREKEERILALEADMTKWEQKYLEENVMRHFALDAAATVAAQRDTTVISHSPNTSYD
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 TALEARIQKEEEEILMANKRCLDMEGRIKTLHAQIIEKDAMIKVLQQRSRKEPSKTEQLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TALEARIQKEEEEILMANKRCLDMEGRIKTLHAQIIEKDAMIKVLQQRSRKEPSKTEQLS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 CMRPAKSLMSISNAGSGLLSHSSTLTGSPIMEEKRDDKSWKGSLGILLGGDYRAEYVPST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 CMRPAKSLMSISNAGSGLLSHSSTLTGSPIMEEKRDDKSWKGSLGILLGGDYRAEYVPST
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 PSPVPPSTPLLSAHSKTGSRDCSTQTERGTESNKTAAVAPISVPAPVAAAATAAAITATA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PSPVPPSTPLLSAHSKTGSRDCSTQTERGTESNKTAAVAPISVPAPVAAAATAAAITATA
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 ATITTTMVAAAPVAVAAAAAPAAAAAPSPATAAATAAAVSPAAAGQIPAAASVASAAAVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ATITTTMVAAAPVAVAAAAAPAAAAAPSPATAAATAAAVSPAAAGQIPAAASVASAAAVA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 PSAAAAAAVQVAPAAPAPVPAPALVPVPAPAAAQASAPAQTQAPTSAPAVAPTPAPTPTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PSAAAAAAVQVAPAAPAPVPAPALVPVPAPAAAQASAPAQTQAPTSAPAVAPTPAPTPTP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 AVAQAEVPASPATGPGPHRLSIPSLTCNPDKTDGPVFHSNTLERKTPIQILGQEPDAEMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AVAQAEVPASPATGPGPHRLSIPSLTCNPDKTDGPVFHSNTLERKTPIQILGQEPDAEMV
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

           
pF1KA1 EYLI
       ::::
CCDS48 EYLI
           

>>CCDS14563.1 AMOT gene_id:154796|Hs108|chrX              (675 aa)
 initn: 4259 init1: 4259 opt: 4259  Z-score: 1760.6  bits: 336.8 E(32554): 9.5e-92
Smith-Waterman score: 4259; 100.0% identity (100.0% similar) in 675 aa overlap (410-1084:1-675)

     380       390       400       410       420       430         
pF1KA1 QQQQQHHHHHHHQQQQQQQPQQQPGEAYSAMPRAQPSSASYQPVPADPFAIVSRAQQMVE
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14                               MPRAQPSSASYQPVPADPFAIVSRAQQMVE
                                             10        20        30

     440       450       460       470       480       490         
pF1KA1 ILSDENRNLRQELEGCYEKVARLQKVETEIQRVSEAYENLVKSSSKREALEKAMRNKLEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ILSDENRNLRQELEGCYEKVARLQKVETEIQRVSEAYENLVKSSSKREALEKAMRNKLEG
               40        50        60        70        80        90

     500       510       520       530       540       550         
pF1KA1 EIRRMHDFNRDLRERLETANKQLAEKEYEGSEDTRKTISQLFAKNKESQREKEKLEAELA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EIRRMHDFNRDLRERLETANKQLAEKEYEGSEDTRKTISQLFAKNKESQREKEKLEAELA
              100       110       120       130       140       150

     560       570       580       590       600       610         
pF1KA1 TARSTNEDQRRHIEIRDQALSNAQAKVVKLEEELKKKQVYVDKVEKMQQALVQLQAACEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TARSTNEDQRRHIEIRDQALSNAQAKVVKLEEELKKKQVYVDKVEKMQQALVQLQAACEK
              160       170       180       190       200       210

     620       630       640       650       660       670         
pF1KA1 REQLEHRLRTRLERELESLRIQQRQGNCQPTNVSEYNAAALMELLREKEERILALEADMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 REQLEHRLRTRLERELESLRIQQRQGNCQPTNVSEYNAAALMELLREKEERILALEADMT
              220       230       240       250       260       270

     680       690       700       710       720       730         
pF1KA1 KWEQKYLEENVMRHFALDAAATVAAQRDTTVISHSPNTSYDTALEARIQKEEEEILMANK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KWEQKYLEENVMRHFALDAAATVAAQRDTTVISHSPNTSYDTALEARIQKEEEEILMANK
              280       290       300       310       320       330

     740       750       760       770       780       790         
pF1KA1 RCLDMEGRIKTLHAQIIEKDAMIKVLQQRSRKEPSKTEQLSCMRPAKSLMSISNAGSGLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RCLDMEGRIKTLHAQIIEKDAMIKVLQQRSRKEPSKTEQLSCMRPAKSLMSISNAGSGLL
              340       350       360       370       380       390

     800       810       820       830       840       850         
pF1KA1 SHSSTLTGSPIMEEKRDDKSWKGSLGILLGGDYRAEYVPSTPSPVPPSTPLLSAHSKTGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SHSSTLTGSPIMEEKRDDKSWKGSLGILLGGDYRAEYVPSTPSPVPPSTPLLSAHSKTGS
              400       410       420       430       440       450

     860       870       880       890       900       910         
pF1KA1 RDCSTQTERGTESNKTAAVAPISVPAPVAAAATAAAITATAATITTTMVAAAPVAVAAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RDCSTQTERGTESNKTAAVAPISVPAPVAAAATAAAITATAATITTTMVAAAPVAVAAAA
              460       470       480       490       500       510

     920       930       940       950       960       970         
pF1KA1 APAAAAAPSPATAAATAAAVSPAAAGQIPAAASVASAAAVAPSAAAAAAVQVAPAAPAPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 APAAAAAPSPATAAATAAAVSPAAAGQIPAAASVASAAAVAPSAAAAAAVQVAPAAPAPV
              520       530       540       550       560       570

     980       990      1000      1010      1020      1030         
pF1KA1 PAPALVPVPAPAAAQASAPAQTQAPTSAPAVAPTPAPTPTPAVAQAEVPASPATGPGPHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PAPALVPVPAPAAAQASAPAQTQAPTSAPAVAPTPAPTPTPAVAQAEVPASPATGPGPHR
              580       590       600       610       620       630

    1040      1050      1060      1070      1080    
pF1KA1 LSIPSLTCNPDKTDGPVFHSNTLERKTPIQILGQEPDAEMVEYLI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LSIPSLTCNPDKTDGPVFHSNTLERKTPIQILGQEPDAEMVEYLI
              640       650       660       670     

>>CCDS73368.1 AMOTL1 gene_id:154810|Hs108|chr11           (906 aa)
 initn: 2374 init1: 862 opt: 1889  Z-score: 792.8  bits: 158.2 E(32554): 7.7e-38
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                                             10        20        30
pF1KA1                               MRNSEEQPSGGTTVLQRLLQEQLRYGNPSE
                                     ::.::.  .:  ::::::.:::::::.:.:
CCDS73 RRGTCEPAVKVEDPLCNFHSPNFLRISEVEMRGSEDAAAG--TVLQRLIQEQLRYGTPTE
         10        20        30        40          50        60    

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pF1KA1 NRSLLAIHQQATGN-GPPFPSGSGNPGPQSDVLSPQDHHQQLVAHAARQEPQGQEIQSEN
       : .::::..::::. ::  :.   :   ... :. .:   :.: ..::::::::: : .:
CCDS73 NMNLLAIQHQATGSAGPAHPT---NNFSSTENLTQED--PQMVYQSARQEPQGQEHQVDN
           70        80           90         100       110         

      90         100       110       120            130       140  
pF1KA1 LIMEKQL--SPRMQNNEELPTYEEAKVQSQYFRGQQH-----ASVGAAFYVTGVTNQKMR
        .::::.  .  .:::::::::::::.:::.:::::.     ..:: ..:..: :.:: :
CCDS73 TVMEKQVRSTQPQQNNEELPTYEEAKAQSQFFRGQQQQQQQQGAVGHGYYMAGGTSQKSR
     120       130       140       150       160       170         

            150       160       170       180       190       200  
pF1KA1 TEGRPSVQRLNPGKMHQDEGLRDLKQGHVRSLSERLMQMSLATSGVKAHPPVTSAPLSPP
       :::::.:.: : :. :.::.:..::::::::::::.::.::  .:.: : : ..      
CCDS73 TEGRPTVNRANSGQAHKDEALKELKQGHVRSLSERIMQLSLERNGAKQHLPGSG------
     180       190       200       210       220       230         

            210       220       230       240       250       260  
pF1KA1 QPNDLYKNPTSSSEFYKAQGPLPNQHSLKGMEHRGPPPEYPFKGMPPQSVVCKPQEPGHF
                 ... :  . :: : : . : .. ::::::::::    .: : : :: : :
CCDS73 ----------NGKGFKVGGGPSPAQPAGKVLDPRGPPPEYPFKTKQMMSPVSKTQEHGLF
                     240       250       260       270       280   

                        270       280        290       300         
pF1KA1 YSE------HRL------NQPGRTEGQLMRYQHPPEYGA-ARPAQDISLPLSARNSQPHS
       :..      :..       :: ::.  ..::: :::::. .:: :   ::. . . : ::
CCDS73 YGDQHPGMLHEMVKPYPAPQPVRTDVAVLRYQPPPEYGVTSRPCQ---LPFPS-TMQQHS
           290       300       310       320          330          

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pF1KA1 PTSSLTSGGSLPLLQSPPSTRLSPARHPLVPNQGDHSAHLPRPQQHFLPNQAHQGDHYRL
       : :: ::..: ::                      ::. :: :    ::        . :
CCDS73 PMSSQTSSASGPL----------------------HSVSLPLP----LP--------MAL
     340       350                             360                 

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pF1KA1 SQPGLSQQQQQQQQQHHHHHHHQQQQQQQPQQQPGEAYSAMPRAQPSSASYQPVPADPFA
       . :                         ::   :       : :.::    : .  : ::
CCDS73 GAP-------------------------QP---P-------PAASPS----QQLGPDAFA
                                  370                     380      

     430       440       450       460       470       480         
pF1KA1 IVSRAQQMVEILSDENRNLRQELEGCYEKVARLQKVETEIQRVSEAYENLVKSSSKREAL
       :: :::::::::..::: :.:::.: :... .:.: : :.::.:::::.::::..:::.:
CCDS73 IVERAQQMVEILTEENRVLHQELQGYYDNADKLHKFEKELQRISEAYESLVKSTTKRESL
        390       400       410       420       430       440      

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pF1KA1 EKAMRNKLEGEIRRMHDFNRDLRERLETANKQLAEKEYEGSEDTRKTISQLFAKNKESQR
       .:::::::::::::.::::::::.::::::.::. .:::: :: . . ..  ..:::  .
CCDS73 DKAMRNKLEGEIRRLHDFNRDLRDRLETANRQLSSREYEGHED-KAAEGHYASQNKEFLK
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pF1KA1 EKEKLEAELATARSTNEDQRRHIEIRDQALSNAQAKVVKLEEELKKKQVYVDKVEKMQQA
       :::::: :::..:...::.:::::: :::::::::.:.::::::..::.::.::::.:::
CCDS73 EKEKLEMELAAVRTASEDHRRHIEILDQALSNAQARVIKLEEELREKQAYVEKVEKLQQA
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     610       620       630       640       650       660         
pF1KA1 LVQLQAACEKREQLEHRLRTRLERELESLRIQQRQGNCQPTNVSEYNAAALMELLREKEE
       :.:::.:::::::.:.:::: :::::..:: ::..:: ::.:. :::: ::.::.:::::
CCDS73 LTQLQSACEKREQMERRLRTWLERELDALRTQQKHGNGQPANMPEYNAPALLELVREKEE
         570       580       590       600       610       620     

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pF1KA1 RILALEADMTKWEQKYLEENVMRHFALDAAATVAAQRDTTVISHSPNTSY-DTALEARIQ
       :::::::::::::::::::...::::..::::.::.::::.:.:: : :: ...:::.: 
CCDS73 RILALEADMTKWEQKYLEESTIRHFAMNAAATAAAERDTTIINHSRNGSYGESSLEAHIW
         630       640       650       660       670       680     

      730       740       750       760       770       780        
pF1KA1 KEEEEILMANKRCLDMEGRIKTLHAQIIEKDAMIKVLQQRSRKEPSKTEQLSCMRPAKSL
       .::::...::.:: :::  ::.:::.:::::::::::::::::. .::.. : .:::.:.
CCDS73 QEEEEVVQANRRCQDMEYTIKNLHAKIIEKDAMIKVLQQRSRKDAGKTDS-SSLRPARSV
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pF1KA1 MSISNAGSGLLSHSSTLTGSPIMEEKRDDKSWKGSLGILLGGDYR----AEYVPSTP---
        ::. :..:  :....::.: . :::...:.::::.:.::: ...    :  .:  :   
CCDS73 PSIA-AATGTHSRQTSLTSSQLAEEKKEEKTWKGSIGLLLGKEHHEHASAPLLPPPPTSA
           750       760       770       780       790       800   

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pF1KA1 -SPVPPSTPLLSAHSKTGSRDCSTQTERGTESNKTAAVAPISVPAPVAAAATAAAITATA
        : .  .:   :::.::::.: ::::....:                             
CCDS73 LSSIASTTAASSAHAKTGSKDSSTQTDKSAELFWPSMASLPSRGRLSTTPAHSPVLKHPA
           810       820       830       840       850       860   

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 ATITTTMVAAAPVAVAAAAAPAAAAAPSPATAAATAAAVSPAAAGQIPAAASVASAAAVA
                                                                   
CCDS73 AKGTAEKLENSPGHGKSPDHRGRVSSLLHKPEFPDGEMMEVLI                 
           870       880       890       900                       

>>CCDS44712.1 AMOTL1 gene_id:154810|Hs108|chr11           (956 aa)
 initn: 2374 init1: 862 opt: 1884  Z-score: 790.5  bits: 157.8 E(32554): 1e-37
Smith-Waterman score: 2643; 52.5% identity (72.6% similar) in 901 aa overlap (1-871:87-884)

                                             10        20        30
pF1KA1                               MRNSEEQPSGGTTVLQRLLQEQLRYGNPSE
                                     ::.::.  .:  ::::::.:::::::.:.:
CCDS44 EATSSIREKVVEDPLCNFHSPNFLRISEVEMRGSEDAAAG--TVLQRLIQEQLRYGTPTE
         60        70        80        90         100       110    

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pF1KA1 NRSLLAIHQQATGN-GPPFPSGSGNPGPQSDVLSPQDHHQQLVAHAARQEPQGQEIQSEN
       : .::::..::::. ::  :.   :   ... :. .:   :.: ..::::::::: : .:
CCDS44 NMNLLAIQHQATGSAGPAHPT---NNFSSTENLTQED--PQMVYQSARQEPQGQEHQVDN
          120       130          140         150       160         

      90         100       110       120            130       140  
pF1KA1 LIMEKQL--SPRMQNNEELPTYEEAKVQSQYFRGQQH-----ASVGAAFYVTGVTNQKMR
        .::::.  .  .:::::::::::::.:::.:::::.     ..:: ..:..: :.:: :
CCDS44 TVMEKQVRSTQPQQNNEELPTYEEAKAQSQFFRGQQQQQQQQGAVGHGYYMAGGTSQKSR
     170       180       190       200       210       220         

            150       160       170       180       190       200  
pF1KA1 TEGRPSVQRLNPGKMHQDEGLRDLKQGHVRSLSERLMQMSLATSGVKAHPPVTSAPLSPP
       :::::.:.: : :. :.::.:..::::::::::::.::.::  .:.: : : ..      
CCDS44 TEGRPTVNRANSGQAHKDEALKELKQGHVRSLSERIMQLSLERNGAKQHLPGSG------
     230       240       250       260       270       280         

            210       220       230       240       250       260  
pF1KA1 QPNDLYKNPTSSSEFYKAQGPLPNQHSLKGMEHRGPPPEYPFKGMPPQSVVCKPQEPGHF
                 ... :  . :: : : . : .. ::::::::::    .: : : :: : :
CCDS44 ----------NGKGFKVGGGPSPAQPAGKVLDPRGPPPEYPFKTKQMMSPVSKTQEHGLF
                     290       300       310       320       330   

                        270       280        290       300         
pF1KA1 YSE------HRL------NQPGRTEGQLMRYQHPPEYGA-ARPAQDISLPLSARNSQPHS
       :..      :..       :: ::.  ..::: :::::. .:: :   ::. . . : ::
CCDS44 YGDQHPGMLHEMVKPYPAPQPVRTDVAVLRYQPPPEYGVTSRPCQ---LPFPS-TMQQHS
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pF1KA1 PTSSLTSGGSLPLLQSPPSTRLSPARHPLVPNQGDHSAHLPRPQQHFLPNQAHQGDHYRL
       : :: ::..: ::                      ::. :: :    ::        . :
CCDS44 PMSSQTSSASGPL----------------------HSVSLPLP----LP--------MAL
     390       400                             410                 

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pF1KA1 SQPGLSQQQQQQQQQHHHHHHHQQQQQQQPQQQPGEAYSAMPRAQPSSASYQPVPADPFA
       . :                         ::   :       : :.::    : .  : ::
CCDS44 GAP-------------------------QP---P-------PAASPS----QQLGPDAFA
                                  420                     430      

     430       440       450       460       470       480         
pF1KA1 IVSRAQQMVEILSDENRNLRQELEGCYEKVARLQKVETEIQRVSEAYENLVKSSSKREAL
       :: :::::::::..::: :.:::.: :... .:.: : :.::.:::::.::::..:::.:
CCDS44 IVERAQQMVEILTEENRVLHQELQGYYDNADKLHKFEKELQRISEAYESLVKSTTKRESL
        440       450       460       470       480       490      

     490       500       510       520       530       540         
pF1KA1 EKAMRNKLEGEIRRMHDFNRDLRERLETANKQLAEKEYEGSEDTRKTISQLFAKNKESQR
       .:::::::::::::.::::::::.::::::.::. .:::: :: . . ..  ..:::  .
CCDS44 DKAMRNKLEGEIRRLHDFNRDLRDRLETANRQLSSREYEGHED-KAAEGHYASQNKEFLK
        500       510       520       530        540       550     

     550       560       570       580       590       600         
pF1KA1 EKEKLEAELATARSTNEDQRRHIEIRDQALSNAQAKVVKLEEELKKKQVYVDKVEKMQQA
       :::::: :::..:...::.:::::: :::::::::.:.::::::..::.::.::::.:::
CCDS44 EKEKLEMELAAVRTASEDHRRHIEILDQALSNAQARVIKLEEELREKQAYVEKVEKLQQA
         560       570       580       590       600       610     

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pF1KA1 LVQLQAACEKREQLEHRLRTRLERELESLRIQQRQGNCQPTNVSEYNAAALMELLREKEE
       :.:::.:::::::.:.:::: :::::..:: ::..:: ::.:. :::: ::.::.:::::
CCDS44 LTQLQSACEKREQMERRLRTWLERELDALRTQQKHGNGQPANMPEYNAPALLELVREKEE
         620       630       640       650       660       670     

     670       680       690       700       710        720        
pF1KA1 RILALEADMTKWEQKYLEENVMRHFALDAAATVAAQRDTTVISHSPNTSY-DTALEARIQ
       :::::::::::::::::::...::::..::::.::.::::.:.:: : :: ...:::.: 
CCDS44 RILALEADMTKWEQKYLEESTIRHFAMNAAATAAAERDTTIINHSRNGSYGESSLEAHIW
         680       690       700       710       720       730     

      730       740       750       760       770       780        
pF1KA1 KEEEEILMANKRCLDMEGRIKTLHAQIIEKDAMIKVLQQRSRKEPSKTEQLSCMRPAKSL
       .::::...::.:: :::  ::.:::.:::::::::::::::::. .::.. : .:::.:.
CCDS44 QEEEEVVQANRRCQDMEYTIKNLHAKIIEKDAMIKVLQQRSRKDAGKTDS-SSLRPARSV
         740       750       760       770       780        790    

      790       800       810       820       830           840    
pF1KA1 MSISNAGSGLLSHSSTLTGSPIMEEKRDDKSWKGSLGILLGGDYR----AEYVPSTP---
        ::. :..:  :....::.: . :::...:.::::.:.::: ...    :  .:  :   
CCDS44 PSIA-AATGTHSRQTSLTSSQLAEEKKEEKTWKGSIGLLLGKEHHEHASAPLLPPPPTSA
           800       810       820       830       840       850   

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 -SPVPPSTPLLSAHSKTGSRDCSTQTERGTESNKTAAVAPISVPAPVAAAATAAAITATA
        : .  .:   :::.::::.: ::::....:                             
CCDS44 LSSIASTTAASSAHAKTGSKDSSTQTDKSAELFWPSMASLPSRGRLSTTPAHSPVLKHPA
           860       870       880       890       900       910   

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 ATITTTMVAAAPVAVAAAAAPAAAAAPSPATAAATAAAVSPAAAGQIPAAASVASAAAVA
                                                                   
CCDS44 AKGTAEKLENSPGHGKSPDHRGRVSSLLHKPEFPDGEMMEVLI                 
           920       930       940       950                       

>>CCDS33860.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs108|chr3             (780 aa)
 initn: 1786 init1: 795 opt: 1325  Z-score: 563.7  bits: 115.6 E(32554): 4.4e-25
Smith-Waterman score: 1723; 42.7% identity (64.0% similar) in 885 aa overlap (1-875:1-740)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MRNSEEQPSGGTTVLQRLLQEQLRYGNPSENRSLLAIHQQATGNGPPFPSGSGNPGPQSD
       ::. :.  :.:: ::.::.:::::::: .:.:.::::.:::  .:    .:.:.:  . .
CCDS33 MRTLED--SSGT-VLHRLIQEQLRYGNLTETRTLLAIQQQALRGGAG-TGGTGSPQASLE
                 10         20        30        40         50      

               70        80         90          100       110      
pF1KA1 VLSPQDHHQQLVAHAARQEPQGQEIQS-ENLIMEK---QLSPRMQNNEELPTYEEAKVQS
       .:.:.:  .:.. .:.:::::::: :. :: . :.   .: :. ...::::::::::..:
CCDS33 ILAPED--SQVLQQATRQEPQGQEHQGGENHLAENTLYRLCPQPSKGEELPTYEEAKAHS
         60          70        80        90       100       110    

        120       130       140       150       160       170      
pF1KA1 QYFRGQQHASVGAAFYVTGVTNQKMRTEGRPSVQRLNPGKMHQDEGLRDLKQGHVRSLSE
       ::. .:: ..   :    :  . .    : :.      :. .:::.::.:..::::::::
CCDS33 QYYAAQQAGTRPHA----GDRDPR----GAPG------GSRRQDEALRELRHGHVRSLSE
          120           130                 140       150       160

        180       190       200       210       220       230      
pF1KA1 RLMQMSLATSGVKAHPPVTSAPLSPPQPNDLYKNPTSSSEFYKAQGPLPNQHSLKGMEHR
       ::.:.::  .:..: :   :.  : ::   : .:          ::: :          :
CCDS33 RLLQLSLERNGARA-PSHMSSSHSFPQ---LARNQ---------QGP-P---------LR
              170        180          190                          

        240       250       260       270       280       290      
pF1KA1 GPPPEYPFKGMPPQSVVCKPQEPGHFYSEHRLNQPGRTEGQLMRYQHPPEYGAARPAQDI
       ::: : : .  ::      :: : :    :. .  . :.         :.:         
CCDS33 GPPAEGPESRGPP------PQYP-HVVLAHETTT-AVTD---------PRY---------
       200       210              220                 230          

        300       310       320       330       340       350      
pF1KA1 SLPLSARNSQPHSPTSSLTSGGSLPLLQSPPSTRLSPARHPLVPNQGDHSAHLPRPQQHF
            ::.: ::              .:    .:.  :. : :                :
CCDS33 ----RARGS-PH--------------FQHAE-VRILQAQVPPV----------------F
                                240        250                     

        360       370       380       390       400       410      
pF1KA1 LPNQAHQGDHYRLSQPGLSQQQQQQQQQHHHHHHHQQQQQQQPQQQPGEAYSAMP-RAQP
       : .:              .: :  ::.:.:    :     . : .. .      :  :: 
CCDS33 LQQQ--------------QQYQYLQQSQEHPPPPHPAALGHGPLSSLSPPAVEGPVSAQA
                       260       270       280       290       300 

         420       430       440       450       460       470     
pF1KA1 SSASYQPVPADPFAIVSRAQQMVEILSDENRNLRQELEGCYEKVARLQKVETEIQRVSEA
       :::.   .    .  : : .     :. .:. :..:::.  ::..:..:.:.::::.:::
CCDS33 SSATSGSAHLAQMEAVLRENAR---LQRDNERLQRELESSAEKAGRIEKLESEIQRLSEA
             310       320          330       340       350        

         480       490       500       510       520       530     
pF1KA1 YENLVKSSSKREALEKAMRNKLEGEIRRMHDFNRDLRERLETANKQLAEKEYEGSEDTRK
       .:.:...:::::::::.::::...:.::..:::::::::::.::..:: :  :..  .. 
CCDS33 HESLTRASSKREALEKTMRNKMDSEMRRLQDFNRDLRERLESANRRLASKTQEAQAGSQD
      360       370       380       390       400       410        

         540       550       560       570       580       590     
pF1KA1 TISQLFAKNKESQREKEKLEAELATARSTNEDQRRHIEIRDQALSNAQAKVVKLEEELKK
        ...:.:.. :.:.:.:::: :.:  :.. :::::. :. .:::.:::..... ::::.:
CCDS33 MVAKLLAQSYEQQQEQEKLEREMALLRGAIEDQRRRAELLEQALGNAQGRAARAEEELRK
      420       430       440       450       460       470        

         600       610       620       630       640            650
pF1KA1 KQVYVDKVEKMQQALVQLQAACEKREQLEHRLRTRLERELESLRIQQRQ-----GNCQPT
       ::.::.:::..:::: ::::::::::::: :::::::.::..:: ::::     :.    
CCDS33 KQAYVEKVERLQQALGQLQAACEKREQLELRLRTRLEQELKALRAQQRQAGAPGGSSGSG
      480       490       500       510       520       530        

              660       670       680       690       700       710
pF1KA1 NVSEYNAAALMELLREKEERILALEADMTKWEQKYLEENVMRHFALDAAATVAAQRDTTV
       .  : .:  : : ::::::.:::::::::::::::::: .::.::.:::::.:::::::.
CCDS33 GSPELSALRLSEQLREKEEQILALEADMTKWEQKYLEERAMRQFAMDAAATAAAQRDTTL
      540       550       560       570       580       590        

              720       730       740       750       760       770
pF1KA1 ISHSPNTSYDTALEARIQKEEEEILMANKRCLDMEGRIKTLHAQIIEKDAMIKVLQQRSR
       : :::. : ....       .: .: ...:  .::.:.:.:::::.::::.:::::::::
CCDS33 IRHSPQPSPSSSF-------NEGLLTGGHRHQEMESRLKVLHAQILEKDAVIKVLQQRSR
      600       610              620       630       640       650 

              780       790       800       810       820       830
pF1KA1 KEPSKTEQLSCMRPAKSLMSISNAGSGLLSHSSTLTGSPIMEEKRDDKSWKGSLGILLGG
       ..:.:. : : .:::::. :.  :...  .  . :..:   :..  :   . .       
CCDS33 RDPGKAIQGS-LRPAKSVPSVFAAAAAGTQGWQGLSSS---ERQTADAPARLTT------
             660        670       680          690       700       

              840       850       860       870       880       890
pF1KA1 DYRAEYVPSTPSPVPPSTPLLSAHSKTGSRDCSTQTERGTESNKTAAVAPISVPAPVAAA
          :. .: :  ::  . :  .::.: :::: :::::   .:..:               
CCDS33 ---ADRAP-TEEPVVTAPP--AAHAKHGSRDGSTQTEGPPDSTSTCLPPEPDSLLGCSSS
                 710         720       730       740       750     

              900       910       920       930       940       950
pF1KA1 ATAAAITATAATITTTMVAAAPVAVAAAAAPAAAAAPSPATAAATAAAVSPAAAGQIPAA
                                                                   
CCDS33 QRAASLDSVATSRVQDLSDMVEILI                                   
         760       770       780                                   

>>CCDS63784.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs108|chr3             (837 aa)
 initn: 1800 init1: 795 opt: 1325  Z-score: 563.3  bits: 115.6 E(32554): 4.7e-25
Smith-Waterman score: 1719; 43.1% identity (64.0% similar) in 885 aa overlap (1-875:59-797)

                                             10        20        30
pF1KA1                               MRNSEEQPSGGTTVLQRLLQEQLRYGNPSE
                                     ::. :.  :.:: ::.::.:::::::: .:
CCDS63 ERLAAGDSVGCSGARCHRPLSRQLCASQRSMRTLED--SSGT-VLHRLIQEQLRYGNLTE
       30        40        50        60           70        80     

               40        50        60        70        80          
pF1KA1 NRSLLAIHQQATGNGPPFPSGSGNPGPQSDVLSPQDHHQQLVAHAARQEPQGQEIQS-EN
       .:.::::.:::  .:    .:.:.:  . ..:.:.:  .:.. .:.:::::::: :. ::
CCDS63 TRTLLAIQQQALRGGAG-TGGTGSPQASLEILAPED--SQVLQQATRQEPQGQEHQGGEN
          90       100        110       120         130       140  

      90          100       110       120       130       140      
pF1KA1 LIMEK---QLSPRMQNNEELPTYEEAKVQSQYFRGQQHASVGAAFYVTGVTNQKMRTEGR
        . :.   .: :. ...::::::::::..:::. .:: ..   :    :  . .    : 
CCDS63 HLAENTLYRLCPQPSKGEELPTYEEAKAHSQYYAAQQAGTRPHA----GDRDPR----GA
            150       160       170       180           190        

        150       160       170       180       190       200      
pF1KA1 PSVQRLNPGKMHQDEGLRDLKQGHVRSLSERLMQMSLATSGVKAHPPVTSAPLSPPQPND
       :.      :. .:::.::.:..::::::::::.:.::  .:..: :   :.  : ::   
CCDS63 PG------GSRRQDEALRELRHGHVRSLSERLLQLSLERNGARA-PSHMSSSHSFPQ---
                200       210       220       230        240       

        210       220       230       240       250       260      
pF1KA1 LYKNPTSSSEFYKAQGPLPNQHSLKGMEHRGPPPEYPFKGMPPQSVVCKPQEPGHFYSEH
       : .:          ::: :          :::: : : .  ::      :: : :    :
CCDS63 LARNQ---------QGP-P---------LRGPPAEGPESRGPP------PQYP-HVVLAH
                   250                 260             270         

        270       280       290       300       310       320      
pF1KA1 RLNQPGRTEGQLMRYQHPPEYGAARPAQDISLPLSARNSQPHSPTSSLTSGGSLPLLQSP
       . .  . :.         :.:              ::.: ::              .:  
CCDS63 ETTT-AVTD---------PRY-------------RARGS-PH--------------FQHA
      280                              290                      300

        330       340       350       360       370       380      
pF1KA1 PSTRLSPARHPLVPNQGDHSAHLPRPQQHFLPNQAHQGDHYRLSQPGLSQQQQQQQQQHH
         .:.  :. : :                :: .:              .: :  ::.:.:
CCDS63 E-VRILQAQVPPV----------------FLQQQ--------------QQYQYLQQSQEH
               310                                     320         

        390       400       410        420       430       440     
pF1KA1 HHHHHQQQQQQQPQQQPGEAYSAMP-RAQPSSASYQPVPADPFAIVSRAQQMVEILSDEN
           :     . : .. .      :  :: :::.   .    .  : : .     :. .:
CCDS63 PPPPHPAALGHGPLSSLSPPAVEGPVSAQASSATSGSAHLAQMEAVLRENAR---LQRDN
     330       340       350       360       370       380         

         450       460       470       480       490       500     
pF1KA1 RNLRQELEGCYEKVARLQKVETEIQRVSEAYENLVKSSSKREALEKAMRNKLEGEIRRMH
       . :..:::.  ::..:..:.:.::::.:::.:.:...:::::::::.::::...:.::..
CCDS63 ERLQRELESSAEKAGRIEKLESEIQRLSEAHESLTRASSKREALEKTMRNKMDSEMRRLQ
        390       400       410       420       430       440      

         510       520       530       540       550       560     
pF1KA1 DFNRDLRERLETANKQLAEKEYEGSEDTRKTISQLFAKNKESQREKEKLEAELATARSTN
       :::::::::::.::..:: :  :..  ..  ...:.:.. :.:.:.:::: :.:  :.. 
CCDS63 DFNRDLRERLESANRRLASKTQEAQAGSQDMVAKLLAQSYEQQQEQEKLEREMALLRGAI
        450       460       470       480       490       500      

         570       580       590       600       610       620     
pF1KA1 EDQRRHIEIRDQALSNAQAKVVKLEEELKKKQVYVDKVEKMQQALVQLQAACEKREQLEH
       :::::. :. .:::.:::..... ::::.:::.::.:::..:::: ::::::::::::: 
CCDS63 EDQRRRAELLEQALGNAQGRAARAEEELRKKQAYVEKVERLQQALGQLQAACEKREQLEL
        510       520       530       540       550       560      

         630       640            650       660       670       680
pF1KA1 RLRTRLERELESLRIQQRQ-----GNCQPTNVSEYNAAALMELLREKEERILALEADMTK
       :::::::.::..:: ::::     :.    .  : .:  : : ::::::.::::::::::
CCDS63 RLRTRLEQELKALRAQQRQAGAPGGSSGSGGSPELSALRLSEQLREKEEQILALEADMTK
        570       580       590       600       610       620      

              690       700       710       720       730       740
pF1KA1 WEQKYLEENVMRHFALDAAATVAAQRDTTVISHSPNTSYDTALEARIQKEEEEILMANKR
       :::::::: .::.::.:::::.:::::::.: :::. : ....       .: .: ...:
CCDS63 WEQKYLEERAMRQFAMDAAATAAAQRDTTLIRHSPQPSPSSSF-------NEGLLTGGHR
        630       640       650       660              670         

              750       760       770       780       790       800
pF1KA1 CLDMEGRIKTLHAQIIEKDAMIKVLQQRSRKEPSKTEQLSCMRPAKSLMSISNAGSGLLS
         .::.:.:.:::::.::::.:::::::::..:.:. : : .:::::. :.  :...  .
CCDS63 HQEMESRLKVLHAQILEKDAVIKVLQQRSRRDPGKAIQGS-LRPAKSVPSVFAAAAAGTQ
     680       690       700       710        720       730        

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pF1KA1 HSSTLTGSPIMEEKRDDKSWKGSLGILLGGDYRAEYVPSTPSPVPPSTPLLSAHSKTGSR
         . :..:   :..  :   .      :  : ::   : :  ::  . :  .::.: :::
CCDS63 GWQGLSSS---ERQTADAPAR------LTTD-RA---P-TEEPVVTAPP--AAHAKHGSR
      740          750             760            770         780  

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pF1KA1 DCSTQTERGTESNKTAAVAPISVPAPVAAAATAAAITATAATITTTMVAAAPVAVAAAAA
       : :::::   .:..:                                             
CCDS63 DGSTQTEGPPDSTSTCLPPEPDSLLGCSSSQRAASLDSVATSRVQDLSDMVEILI     
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       ::. :.  :.:: ::.::.:::::::: .:.:.::::.:::  .:    .:.:.:  . .
CCDS63 MRTLED--SSGT-VLHRLIQEQLRYGNLTETRTLLAIQQQALRGGAG-TGGTGSPQASLE
                 10         20        30        40         50      

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       .:.:.:  .:.. .:.:::::::: :. :: . :.   .: :. ...::::::::::..:
CCDS63 ILAPED--SQVLQQATRQEPQGQEHQGGENHLAENTLYRLCPQPSKGEELPTYEEAKAHS
         60          70        80        90       100       110    

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pF1KA1 QYFRGQQHASVGAAFYVTGVTNQKMRTEGRPSVQRLNPGKMHQDEGLRDLKQGHVRSLSE
       ::. .:: ..   :    :  . .    : :.      :. .:::.::.:..::::::::
CCDS63 QYYAAQQAGTRPHA----GDRDPR----GAPG------GSRRQDEALRELRHGHVRSLSE
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pF1KA1 RLMQMSLATSGVKAHPPVTSAPLSPPQPNDLYKNPTSSSEFYKAQGPLPNQHSLKGMEHR
       ::.:.::  .:..: :   :.  : ::   : .:          ::: :          :
CCDS63 RLLQLSLERNGARA-PSHMSSSHSFPQ---LARNQ---------QGP-P---------LR
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        240       250       260       270       280       290      
pF1KA1 GPPPEYPFKGMPPQSVVCKPQEPGHFYSEHRLNQPGRTEGQLMRYQHPPEYGAARPAQDI
       ::: : : .  ::      :: : :    :. .  . :.         :.:         
CCDS63 GPPAEGPESRGPP------PQYP-HVVLAHETTT-AVTD---------PRY---------
       200       210              220                 230          

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pF1KA1 SLPLSARNSQPHSPTSSLTSGGSLPLLQSPPSTRLSPARHPLVPNQGDHSAHLPRPQQHF
            ::.: ::              .:    .:.  :. : :                :
CCDS63 ----RARGS-PH--------------FQHAE-VRILQAQVPPV----------------F
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pF1KA1 LPNQAHQGDHYRLSQPGLSQQQQQQQQQHHHHHHHQQQQQQQPQQQPGEAYSAMP-RAQP
       : .:              .: :  ::.:.:    :     . : .. .      :  :: 
CCDS63 LQQQ--------------QQYQYLQQSQEHPPPPHPAALGHGPLSSLSPPAVEGPVSAQA
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       :::.   .    .  : : .     :. .:. :..:::.  ::..:..:.:.::::.:::
CCDS63 SSATSGSAHLAQMEAVLRENAR---LQRDNERLQRELESSAEKAGRIEKLESEIQRLSEA
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pF1KA1 YENLVKSSSKREALEKAMRNKLEGEIRRMHDFNRDLRERLETANKQLAEKEYEGSEDTRK
       .:.:...:::::::::.::::...:.::..:::::::::::.::..:: :  :..  .. 
CCDS63 HESLTRASSKREALEKTMRNKMDSEMRRLQDFNRDLRERLESANRRLASKTQEAQAGSQD
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        ...:.:.. :.:.:.:::: :.:  :.. :::::. :. .:::.:::..... ::::.:
CCDS63 MVAKLLAQSYEQQQEQEKLEREMALLRGAIEDQRRRAELLEQALGNAQGRAARAEEELRK
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       ::.::.:::..:::: ::::::::::::: :::::::.::..:: ::     :.    . 
CCDS63 KQAYVEKVERLQQALGQLQAACEKREQLELRLRTRLEQELKALRAQQAGAPGGSSGSGGS
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        : .:  : : ::::::.:::::::::::::::::: .::.::.:::::.:::::::.: 
CCDS63 PELSALRLSEQLREKEEQILALEADMTKWEQKYLEERAMRQFAMDAAATAAAQRDTTLIR
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       :::. : ....       .: .: ...:  .::.:.:.:::::.::::.:::::::::..
CCDS63 HSPQPSPSSSF-------NEGLLTGGHRHQEMESRLKVLHAQILEKDAVIKVLQQRSRRD
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CCDS63 PGKAIQGS-LRPAKSVPSVFAAAAAGTQGWQGLSSS---ERQTADAPAR------LTTD-
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       ::   : :  ::  . :  .::.: :::: :::::   .:..:                 
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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