Result of FASTA (ccds) for pF1KA1070
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1070, 823 aa
  1>>>pF1KA1070 823 - 823 aa - 823 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2500+/-0.000853; mu= 16.9469+/- 0.052
 mean_var=91.3620+/-18.610, 0's: 0 Z-trim(108.4): 32  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.134181
 statistics sampled from 10156 (10187) to 10156 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.313), width:  16
 Scan time:  3.840

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3222.1 NLGN1 gene_id:22871|Hs108|chr3          ( 823) 5668 1107.7       0
CCDS11103.1 NLGN2 gene_id:57555|Hs108|chr17        ( 835) 2724 537.8 2.9e-152
CCDS56619.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY        ( 648) 2133 423.3 6.4e-118
CCDS14126.1 NLGN4X gene_id:57502|Hs108|chrX        ( 816) 2134 423.6 6.8e-118
CCDS14788.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY        ( 816) 2133 423.4 7.7e-118
CCDS55442.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX         ( 808) 2081 413.3 8.2e-115
CCDS14407.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX         ( 828) 2081 413.3 8.4e-115
CCDS55441.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX         ( 848) 2081 413.3 8.6e-115
CCDS3198.1 BCHE gene_id:590|Hs108|chr3             ( 602)  854 175.7   2e-43
CCDS43896.1 CEL gene_id:1056|Hs108|chr9            ( 756)  748 155.3 3.7e-37
CCDS45489.1 CES1 gene_id:1066|Hs108|chr16          ( 566)  728 151.3 4.3e-36
CCDS45488.1 CES1 gene_id:1066|Hs108|chr16          ( 567)  723 150.3 8.4e-36
CCDS32450.1 CES1 gene_id:1066|Hs108|chr16          ( 568)  723 150.3 8.4e-36
CCDS54024.1 CES4A gene_id:283848|Hs108|chr16       ( 463)  683 142.6 1.5e-33
CCDS55553.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY        ( 256)  546 115.9 8.8e-26
CCDS42174.3 CES4A gene_id:283848|Hs108|chr16       ( 468)  522 111.4 3.7e-24
CCDS45507.1 CES2 gene_id:8824|Hs108|chr16          ( 607)  509 108.9 2.6e-23
CCDS10825.1 CES2 gene_id:8824|Hs108|chr16          ( 623)  509 108.9 2.7e-23
CCDS54025.1 CES4A gene_id:283848|Hs108|chr16       ( 374)  498 106.7 7.6e-23
CCDS34944.1 TG gene_id:7038|Hs108|chr8             (2768)  502 107.9 2.4e-22
CCDS54022.1 CES3 gene_id:23491|Hs108|chr16         ( 568)  483 103.9 8.1e-22
CCDS10826.1 CES3 gene_id:23491|Hs108|chr16         ( 571)  483 103.9 8.1e-22
CCDS54012.1 CES5A gene_id:221223|Hs108|chr16       ( 604)  480 103.3 1.3e-21
CCDS10755.1 CES5A gene_id:221223|Hs108|chr16       ( 525)  476 102.5 1.9e-21
CCDS45490.1 CES5A gene_id:221223|Hs108|chr16       ( 575)  476 102.5 2.1e-21


>>CCDS3222.1 NLGN1 gene_id:22871|Hs108|chr3               (823 aa)
 initn: 5668 init1: 5668 opt: 5668  Z-score: 5927.3  bits: 1107.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5668; 100.0% identity (100.0% similar) in 823 aa overlap (1-823:1-823)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MALPRCTWPNYVWRAVMACLVHRGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MALPRCTWPNYVWRAVMACLVHRGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 KIRGIKKELNNEILGPVIQFLGVPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KIRGIKKELNNEILGPVIQFLGVPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 IIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVVSSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVVSSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 GGSYMEGTGNLYDGSVLASYGNVIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GGSYMEGTGNLYDGSVLASYGNVIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRW
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 TSENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TSENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTAL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 SSWAVSFQPAKYARMLATKVGCNVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSWAVSFQPAKYARMLATKVGCNVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 DGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 NLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 SPTYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SPTYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVM
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 TYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 NKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTDITFRPTRKNSVPVTSAFPTAKQDDPKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTDITFRPTRKNSVPVTSAFPTAKQDDPKQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 QPSPFSVDQRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QPSPFSVDQRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTN
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 DLTHAQEEEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DLTHAQEEEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820   
pF1KA1 ITMIPNTIPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ITMIPNTIPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
              790       800       810       820   

>>CCDS11103.1 NLGN2 gene_id:57555|Hs108|chr17             (835 aa)
 initn: 2539 init1: 1948 opt: 2724  Z-score: 2847.2  bits: 537.8 E(32554): 2.9e-152
Smith-Waterman score: 3535; 62.2% identity (78.2% similar) in 858 aa overlap (12-823:1-835)

               10        20             30        40        50     
pF1KA1 MALPRCTWPNYVWRAVMACLV-----HRGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLV
                  .:  .. :::     .:: :.:      :  :  : .  ...    :.:
CCDS11            MWLLAL-CLVGLAGAQRGGGGPGGGAPGGPGLGLGSLGEERF----PVV
                           10        20        30        40        

          60        70        80        90       100       110     
pF1KA1 ATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLGVPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAP
        : .:..::...::::::::::.::::::::.:: : ::::::: :. :  .:::: . :
CCDS11 NTAYGRVRGVRRELNNEILGPVVQFLGVPYATPPLGARRFQPPEAPASWPGVRNATTLPP
           50        60        70        80        90       100    

         120       130       140       150       160               
pF1KA1 VCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVVSSYVQDQSEDCLYLNIYVPTED-----------
       .::::.  : :: .:::::::.::.....:::.:::::::::.::::::           
CCDS11 ACPQNL-HGALPAIMLPVWFTDNLEAAATYVQNQSEDCLYLNLYVPTEDGPLTKKRDEAT
          110        120       130       140       150       160   

                170       180       190       200       210        
pF1KA1 ------DIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGNVIVITVNYRLGVLGFL
             :::: :  ::::...:::::::::::..::::::.:::::: :.::::::::::
CCDS11 LNPPDTDIRDPG-KKPVMLFLHGGSYMEGTGNMFDGSVLAAYGNVIVATLNYRLGVLGFL
           170        180       190       200       210       220  

      220       230       240       250       260       270        
pF1KA1 STGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEG
       ::::::::::::::: :::::: ::::. ::::: :::.::::::.:::::: :::.:::
CCDS11 STGDQAAKGNYGLLDQIQALRWLSENIAHFGGDPERITIFGSGAGASCVNLLILSHHSEG
            230       240       250       260       270       280  

      280       290       300       310       320       330        
pF1KA1 NRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGCNVSDTVELVECLQKKP
                :::.::::::::.:::.:..:: ::.:.::.::::.  :..: ::::..::
CCDS11 ---------LFQKAIAQSGTAISSWSVNYQPLKYTRLLAAKVGCDREDSAEAVECLRRKP
                     290       300       310       320       330   

      340       350       360       370       380       390        
pF1KA1 YKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVEN
        .::::::.::::::::::::.::::.::::.:::.::::::::...::::::::::::.
CCDS11 SRELVDQDVQPARYHIAFGPVVDGDVVPDDPEILMQQGEFLNYDMLIGVNQGEGLKFVED
           340       350       360       370       380       390   

      400       410       420       430       440       450        
pF1KA1 IVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLA
        ..:.::.::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::: : : :::::::
CCDS11 SAESEDGVSASAFDFTVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRDNGEMRRKTLLA
           400       410       420       430       440       450   

      460       470       480       490       500       510        
pF1KA1 LFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMI
       ::::::::::::::: ::... ::.:::.::::::..  : :::::::::.:::.:.::.
CCDS11 LFTDHQWVAPAVATAKLHADYQSPVYFYTFYHHCQAEGRPEWADAAHGDELPYVFGVPMV
           460       470       480       490       500       510   

      520       530       540       550       560       570        
pF1KA1 GPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRY
       : :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:...
CCDS11 GATDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVVWSKF
           520       530       540       550       560       570   

      580       590       600       610       620       630        
pF1KA1 SQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTDITFRP
       ..:.. ::::::::::...:::::: .:::::::::::.  ..  .:::..:     . :
CCDS11 NSKEKQYLHIGLKPRVRDNYRANKVAFWLELVPHLHNLH--TELFTTTTRLPPYATRWPP
           580       590       600       610         620       630 

      640       650       660              670       680       690 
pF1KA1 TRKNSVPVTSAFPTAKQDDPKQQPSP-------FSVDQRDYSTELSVTIAVGASLLFLNI
           ..: :   :      :. .: :       :  :.::::::::::.:::::::::::
CCDS11 RPPAGAPGTRRPPPPATLPPEPEPEPGPRAYDRFPGDSRDYSTELSVTVAVGASLLFLNI
             640       650       660       670       680       690 

             700       710       720                   730         
pF1KA1 LAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTNDLTHA------------QEEEIMSLQMKHTD
       :::::::::.:.:..   :: ::   . . .  .             :::..:::.:.  
CCDS11 LAFAALYYKRDRRQELRCRRLSPPGGSGSGVPGGGPLLPAAGRELPPEEELVSLQLKRGG
             700       710       720       730       740       750 

     740       750       760       770       780        790        
pF1KA1 LDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNTI-PGIQP----L
             .  : :. :: :::::::::.::.::::::..:...:..:. . :   :    :
CCDS11 ----GVGADPAEA-LRPACPPDYTLALRRAPDDVPLLAPGALTLLPSGLGPPPPPPPPSL
                 760        770       780       790       800      

          800       810       820   
pF1KA1 HTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
       : :. :     ..  : .  :: ::::::
CCDS11 HPFGPFPPPPPTATSHNNTLPHPHSTTRV
        810       820       830     

>>CCDS56619.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY             (648 aa)
 initn: 2817 init1: 2089 opt: 2133  Z-score: 2230.6  bits: 423.3 E(32554): 6.4e-118
Smith-Waterman score: 3416; 75.6% identity (89.1% similar) in 663 aa overlap (176-823:1-648)

         150       160       170       180       190       200     
pF1KA1 VQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGNVIV
                                     :::::::::::::::. :::.:::::::::
CCDS56                               MVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIV
                                             10        20        30

         210       220       230       240       250       260     
pF1KA1 ITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGS
       ::.:::::.::::::::::::::::::: ::::::  ::.: ::::: :.:.::::::.:
CCDS56 ITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIFGSGAGAS
               40        50        60        70        80        90

         270       280       290       300       310       320     
pF1KA1 CVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGCNVS
       ::.:::::::::         ::::.:: :::::::::::..:::::.:.:: :::::. 
CCDS56 CVSLLTLSHYSE---------GLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKVGCNML
              100                110       120       130       140 

         330       340       350       360       370       380     
pF1KA1 DTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIML
       ::...::::..: ::::..: : :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DTTDMVECLKNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIML
             150       160       170       180       190       200 

         390       400       410       420       430       440     
pF1KA1 GVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWAD
       :::::::::::..:::..::.. .::::.::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS56 GVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWAD
             210       220       230       240       250       260 

         450       460       470       480       490       500     
pF1KA1 RHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAH
       ..:::::::::.:::::::::::::::::::...::::::::::::::... :.:::.::
CCDS56 KENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSWADSAH
             270       280       290       300       310       320 

         510       520       530       540       550       560     
pF1KA1 GDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHT
       :::::::.::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHT
             330       340       350       360       370       380 

         570       580       590       600       610       620     
pF1KA1 KPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTST
       ::::::::::..:. ::::::::::::::..::::.:: .::::::::::::.: ::.::
CCDS56 KPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIFQYVST
             390       400       410       420       430       440 

         630         640          650       660                 670
pF1KA1 TTKVPSTDITFRP--TRKNSV---PVTSAFPTAKQDDPKQQPSPFSVD----------QR
       :::::  :.:  :  ::.. .   :.:.    .  ..::.. .: ..           .:
CCDS56 TTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVLIETKR
             450       460       470       480       490       500 

              680       690       700       710       720       730
pF1KA1 DYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTNDLTHAQEEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::. ::::.::::.:: :.:::
CCDS56 DYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRHPSPQRNTTNDITHIQNEEI
             510       520       530       540       550       560 

              740       750       760       770       780       790
pF1KA1 MSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNTIPG
       ::::::. . ::::::.. :.. :: .:::::::..::::::.:.::::::::::::. :
CCDS56 MSLQMKQLEHDHECESLQAHDT-LRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPFMTPNTITMIPNTLMG
             570       580        590       600       610       620

              800       810       820   
pF1KA1 IQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
       .::::::.::.::::.:       ::.::::::
CCDS56 MQPLHTFKTFSGGQNST-----NLPHGHSTTRV
              630            640        

>>CCDS14126.1 NLGN4X gene_id:57502|Hs108|chrX             (816 aa)
 initn: 2831 init1: 2088 opt: 2134  Z-score: 2230.1  bits: 423.6 E(32554): 6.8e-118
Smith-Waterman score: 4052; 74.9% identity (88.8% similar) in 786 aa overlap (53-823:46-816)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KA1 RGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLG
                                     :.: ::.:::::..  : ::::::: :.::
CCDS14 PVCVMLNSNVLLWLTALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIRGLRTPLPNEILGPVEQYLG
          20        30        40        50        60        70     

             90       100       110       120       130       140  
pF1KA1 VPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVV
       ::::.::::::::::::::: :. :::.:::: ::::.. .  : . :::.::: :::..
CCDS14 VPYASPPTGERRFQPPEPPSSWTGIRNTTQFAAVCPQHLDERSLLHDMLPIWFTANLDTL
          80        90       100       110       120       130     

            150       160       170       180       190       200  
pF1KA1 SSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGN
        .:::::.::::::::::::::::.:... ::::::::::::::::::. :::.::::::
CCDS14 MTYVQDQNEDCLYLNIYVPTEDDIHDQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGN
         140       150       160       170       180       190     

            210       220       230       240       250       260  
pF1KA1 VIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGA
       :::::.:::::.::::::::::::::::::: ::::::  ::.: ::::: :.:.:::::
CCDS14 VIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIFGSGA
         200       210       220       230       240       250     

            270       280       290       300       310       320  
pF1KA1 GGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGC
       :.:::.::::::::::         :::.:: :::::::::::..:::::.:.:: ::::
CCDS14 GASCVSLLTLSHYSEG---------LFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKVGC
         260       270                280       290       300      

            330       340       350       360       370       380  
pF1KA1 NVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD
       :. ::...::::..: ::::..: : :: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NMLDTTDMVECLRNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD
        310       320       330       340       350       360      

            390       400       410       420       430       440  
pF1KA1 IMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTD
       ::::::::::::::..:::..::.. .::::.::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS14 IMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTD
        370       380       390       400       410       420      

            450       460       470       480       490       500  
pF1KA1 WADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWAD
       :::..:::::::::.:::::::::::::::::::...::::::::::::::... :.:::
CCDS14 WADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSWAD
        430       440       450       460       470       480      

            510       520       530       540       550       560  
pF1KA1 AAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF
       .:::::::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF
        490       500       510       520       530       540      

            570       580       590       600       610       620  
pF1KA1 IHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQY
       :::::::::::::..:. ::::::::::::::..::::.:: .::::::::::::.: ::
CCDS14 IHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIFQY
        550       560       570       580       590       600      

            630         640          650       660                 
pF1KA1 TSTTTKVPSTDITFRP--TRKNSV---PVTSAFPTAKQDDPKQQPSPFSVD---------
       .:::::::  :.:  :  ::.. .   :.:.    .  ..::.. .: ..          
CCDS14 VSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVLIE
        610       620       630       640       650       660      

       670       680       690       700       710       720       
pF1KA1 -QRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTNDLTHAQE
        .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::: ::::.::::..: :.
CCDS14 TKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRRPSPQRNTTNDIAHIQN
        670       680       690       700       710       720      

       730       740       750       760       770       780       
pF1KA1 EEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNT
       :::::::::. . ::::::.. :.. :: .:::::::..::::::.::::::::::::::
CCDS14 EEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDT-LRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNT
        730       740       750        760       770       780     

       790       800       810       820   
pF1KA1 IPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
       . :.:::::::::.::::.:       ::.::::::
CCDS14 LTGMQPLHTFNTFSGGQNST-----NLPHGHSTTRV
         790       800            810      

>>CCDS14788.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY             (816 aa)
 initn: 2817 init1: 2089 opt: 2133  Z-score: 2229.0  bits: 423.4 E(32554): 7.7e-118
Smith-Waterman score: 3997; 73.9% identity (88.7% similar) in 786 aa overlap (53-823:46-816)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KA1 RGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLG
                                     :.: ::.:::.:..  : .:::::: :.::
CCDS14 SVCVMLNSNVLLWITALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIQGLRTPLPSEILGPVEQYLG
          20        30        40        50        60        70     

             90       100       110       120       130       140  
pF1KA1 VPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVV
       ::::.:::::::::::: :: :. :::::::. ::::.. .  : . :::.:::..::..
CCDS14 VPYASPPTGERRFQPPESPSSWTGIRNATQFSAVCPQHLDERFLLHDMLPIWFTTSLDTL
          80        90       100       110       120       130     

            150       160       170       180       190       200  
pF1KA1 SSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGN
        .:::::.::::::::::: ::::..... ::::::::::::::::::. :::.::::::
CCDS14 MTYVQDQNEDCLYLNIYVPMEDDIHEQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGN
         140       150       160       170       180       190     

            210       220       230       240       250       260  
pF1KA1 VIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGA
       :::::.:::::.::::::::::::::::::: ::::::  ::.: ::::: :.:.:::::
CCDS14 VIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIFGSGA
         200       210       220       230       240       250     

            270       280       290       300       310       320  
pF1KA1 GGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGC
       :.:::.::::::::::         :::.:: :::::::::::..:::::.:.:: ::::
CCDS14 GASCVSLLTLSHYSEG---------LFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKVGC
         260       270                280       290       300      

            330       340       350       360       370       380  
pF1KA1 NVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD
       :. ::...::::..: ::::..: : :: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NMLDTTDMVECLKNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD
        310       320       330       340       350       360      

            390       400       410       420       430       440  
pF1KA1 IMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTD
       ::::::::::::::..:::..::.. .::::.::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS14 IMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTD
        370       380       390       400       410       420      

            450       460       470       480       490       500  
pF1KA1 WADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWAD
       :::..:::::::::.:::::::::::::::::::...::::::::::::::... :.:::
CCDS14 WADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSWAD
        430       440       450       460       470       480      

            510       520       530       540       550       560  
pF1KA1 AAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF
       .:::::::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF
        490       500       510       520       530       540      

            570       580       590       600       610       620  
pF1KA1 IHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQY
       :::::::::::::..:. ::::::::::::::..::::.:: .::::::::::::.: ::
CCDS14 IHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIFQY
        550       560       570       580       590       600      

            630         640          650       660                 
pF1KA1 TSTTTKVPSTDITFRP--TRKNSV---PVTSAFPTAKQDDPKQQPSPFSVD---------
       .:::::::  :.:  :  ::.. .   :.:.    .  ..::.. .: ..          
CCDS14 VSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVLIE
        610       620       630       640       650       660      

       670       680       690       700       710       720       
pF1KA1 -QRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTNDLTHAQE
        .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::. ::::.::::.:: :.
CCDS14 TKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRHPSPQRNTTNDITHIQN
        670       680       690       700       710       720      

       730       740       750       760       770       780       
pF1KA1 EEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNT
       :::::::::. . ::::::.. :.. :: .:::::::..::::::.:.::::::::::::
CCDS14 EEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDT-LRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPFMTPNTITMIPNT
        730       740       750        760       770       780     

       790       800       810       820   
pF1KA1 IPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
       . :.::::::.::.::::.:       ::.::::::
CCDS14 LMGMQPLHTFKTFSGGQNST-----NLPHGHSTTRV
         790       800            810      

>>CCDS55442.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX              (808 aa)
 initn: 3565 init1: 2030 opt: 2081  Z-score: 2174.7  bits: 413.3 E(32554): 8.2e-115
Smith-Waterman score: 3789; 71.6% identity (86.3% similar) in 786 aa overlap (53-823:42-808)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KA1 RGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLG
                                     : : :.:::.:: .  : .:::::: :.::
CCDS55 LSPKPTVGRSLCLTLWFLSLALRASTQAPAPTVNTHFGKLRGARVPLPSEILGPVDQYLG
              20        30        40        50        60        70 

             90       100       110       120       130       140  
pF1KA1 VPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVV
       ::::::: ::.:: :::::  :: :::::.: :::::::  . .:::::::::: :::.:
CCDS55 VPYAAPPIGEKRFLPPEPPPSWSGIRNATHFPPVCPQNIHTA-VPEVMLPVWFTANLDIV
              80        90       100       110        120       130

            150       160       170       180       190       200  
pF1KA1 SSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGN
       ..:.:. .:::::::.::::::::::::. ::::::::::::::::::. :::.::::::
CCDS55 ATYIQEPNEDCLYLNVYVPTEDDIRDSGA-KPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGN
              140       150        160       170       180         

            210       220       230       240       250       260  
pF1KA1 VIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGA
       :::::.:::.::::::::::::::::::::: ::::::.::::.:::::: :::::::: 
CCDS55 VIVITLNYRVGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWVSENIAFFGGDPRRITVFGSGI
     190       200       210       220       230       240         

            270       280       290       300       310       320  
pF1KA1 GGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGC
       :.:::.::::::.:::         :::::: :::.:::::::..::.::. .:: ::::
CCDS55 GASCVSLLTLSHHSEG---------LFQRAIIQSGSALSSWAVNYQPVKYTSLLADKVGC
     250       260                270       280       290       300

            330       340       350       360       370       380  
pF1KA1 NVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD
       :: :::..:.::..:  ::::.:::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::
CCDS55 NVLDTVDMVDCLRQKSAKELVEQDIQPARYHVAFGPVIDGDVIPDDPEILMEQGEFLNYD
              310       320       330       340       350       360

            390       400       410       420       430       440  
pF1KA1 IMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTD
       :::::::::::::::..:: .::.:..:::..::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS55 IMLGVNQGEGLKFVEGVVDPEDGVSGTDFDYSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTD
              370       380       390       400       410       420

            450       460       470       480       490       500  
pF1KA1 WADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWAD
       :::: :::::::::.::::::::: :.:.:::::. .::::::::::::::. . :::.:
CCDS55 WADRDNPETRRKTLVALFTDHQWVEPSVVTADLHARYGSPTYFYAFYHHCQSLMKPAWSD
              430       440       450       460       470       480

            510       520       530       540       550       560  
pF1KA1 AAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF
       ::::::::::.:.::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS55 AAHGDEVPYVFGVPMVGPTDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNKPVPQDTKF
              490       500       510       520       530       540

            570       580       590       600       610       620  
pF1KA1 IHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQY
       :::: ::::::::..:. .:::::::::::::..::::.:: .: .:::::.::.:. .:
CCDS55 IHTKANRFEEVAWSKYNPRDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWKHLVPHLYNLHDMFHY
              550       560       570       580       590       600

            630             640        650             660         
pF1KA1 TSTTTKVPSTD------ITFRPTRKN-SVPVTSAFPTAKQDDPK------QQPSPFSVDQ
       ::::::::  :      :: ::. :. :.   .  :. .... .      :. .:. :..
CCDS55 TSTTTKVPPPDTTHSSHITRRPNGKTWSTKRPAISPAYSNENAQGSWNGDQDAGPLLVEN
              610       620       630       640       650       660

      670       680       690       700       710        720       
pF1KA1 -RDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTT-TNDLTHAQE
        :::::::::::::::::::::.::::::::.:::::..  :. :::: . . .:  : :
CCDS55 PRDYSTELSVTIAVGASLLFLNVLAFAALYYRKDKRRQEPLRQPSPQRGAGAPELGAAPE
              670       680       690       700       710       720

       730       740       750       760       770       780       
pF1KA1 EEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNT
       ::. .::.  :   ::::.  ::.. :: .  :::::..::::::.:::::::::::::.
CCDS55 EELAALQLGPTH--HECEAGPPHDT-LRLTALPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNS
              730         740        750       760       770       

       790       800       810       820   
pF1KA1 IPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
       . :.: :: .:::..: :.:       :::::::::
CCDS55 LVGLQTLHPYNTFAAGFNST-----GLPHSHSTTRV
       780       790            800        

>>CCDS14407.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX              (828 aa)
 initn: 3571 init1: 2030 opt: 2081  Z-score: 2174.5  bits: 413.3 E(32554): 8.4e-115
Smith-Waterman score: 3739; 69.9% identity (84.1% similar) in 806 aa overlap (53-823:42-828)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KA1 RGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLG
                                     : : :.:::.:: .  : .:::::: :.::
CCDS14 LSPKPTVGRSLCLTLWFLSLALRASTQAPAPTVNTHFGKLRGARVPLPSEILGPVDQYLG
              20        30        40        50        60        70 

             90       100       110       120       130       140  
pF1KA1 VPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVV
       ::::::: ::.:: :::::  :: :::::.: :::::::  . .:::::::::: :::.:
CCDS14 VPYAAPPIGEKRFLPPEPPPSWSGIRNATHFPPVCPQNIHTA-VPEVMLPVWFTANLDIV
              80        90       100       110        120       130

            150       160                           170       180  
pF1KA1 SSYVQDQSEDCLYLNIYVPTED--------------------DIRDSGGPKPVMVYIHGG
       ..:.:. .:::::::.::::::                    ::::::. ::::::::::
CCDS14 ATYIQEPNEDCLYLNVYVPTEDGSGAKKQGEDLADNDGDEDEDIRDSGA-KPVMVYIHGG
              140       150       160       170        180         

            190       200       210       220       230       240  
pF1KA1 SYMEGTGNLYDGSVLASYGNVIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTS
       ::::::::. :::.:::::::::::.:::.::::::::::::::::::::: ::::::.:
CCDS14 SYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVITLNYRVGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWVS
     190       200       210       220       230       240         

            250       260       270       280       290       300  
pF1KA1 ENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSS
       :::.:::::: :::::::: :.:::.::::::.:::         :::::: :::.::::
CCDS14 ENIAFFGGDPRRITVFGSGIGASCVSLLTLSHHSEG---------LFQRAIIQSGSALSS
     250       260       270       280                290       300

            310       320       330       340       350       360  
pF1KA1 WAVSFQPAKYARMLATKVGCNVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDG
       :::..::.::. .:: :::::: :::..:.::..:  ::::.:::::::::.::::::::
CCDS14 WAVNYQPVKYTSLLADKVGCNVLDTVDMVDCLRQKSAKELVEQDIQPARYHVAFGPVIDG
              310       320       330       340       350       360

            370       380       390       400       410       420  
pF1KA1 DVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNL
       :::::::.:::::::::::::::::::::::::::..:: .::.:..:::..::::::::
CCDS14 DVIPDDPEILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVEGVVDPEDGVSGTDFDYSVSNFVDNL
              370       380       390       400       410       420

            430       440       450       460       470       480  
pF1KA1 YGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSP
       ::::::::.::::::::::::::: :::::::::.::::::::: :.:.:::::. .:::
CCDS14 YGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADRDNPETRRKTLVALFTDHQWVEPSVVTADLHARYGSP
              430       440       450       460       470       480

            490       500       510       520       530       540  
pF1KA1 TYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTY
       :::::::::::. . :::.:::::::::::.:.::.:::.::::::::::::::::::::
CCDS14 TYFYAFYHHCQSLMKPAWSDAAHGDEVPYVFGVPMVGPTDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTY
              490       500       510       520       530       540

            550       560       570       580       590       600  
pF1KA1 WTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANK
       :::::::::::.:::::::::::: ::::::::..:. .:::::::::::::..::::.:
CCDS14 WTNFAKTGDPNKPVPQDTKFIHTKANRFEEVAWSKYNPRDQLYLHIGLKPRVRDHYRATK
              550       560       570       580       590       600

            610       620       630             640        650     
pF1KA1 VNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTD------ITFRPTRKN-SVPVTSAFPTAKQ
       : .: .:::::.::.:. .:::::::::  :      :: ::. :. :.   .  :. ..
CCDS14 VAFWKHLVPHLYNLHDMFHYTSTTTKVPPPDTTHSSHITRRPNGKTWSTKRPAISPAYSN
              610       620       630       640       650       660

               660        670       680       690       700        
pF1KA1 DDPK------QQPSPFSVDQ-RDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDV
       .. .      :. .:. :.. :::::::::::::::::::::.::::::::.:::::.. 
CCDS14 ENAQGSWNGDQDAGPLLVENPRDYSTELSVTIAVGASLLFLNVLAFAALYYRKDKRRQEP
              670       680       690       700       710       720

      710        720       730       740       750       760       
pF1KA1 HRRCSPQRTT-TNDLTHAQEEEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMR
        :. :::: . . .:  : :::. .::.  :   ::::.  ::.. :: .  :::::..:
CCDS14 LRQPSPQRGAGAPELGAAPEEELAALQLGPTH--HECEAGPPHDT-LRLTALPDYTLTLR
              730       740       750         760        770       

       770       780       790       800       810       820   
pF1KA1 RSPDDVPLMTPNTITMIPNTIPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
       :::::.:::::::::::::.. :.: :: .:::..: :.:       :::::::::
CCDS14 RSPDDIPLMTPNTITMIPNSLVGLQTLHPYNTFAAGFNST-----GLPHSHSTTRV
       780       790       800       810            820        

>>CCDS55441.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX              (848 aa)
 initn: 3571 init1: 2030 opt: 2081  Z-score: 2174.4  bits: 413.3 E(32554): 8.6e-115
Smith-Waterman score: 3699; 68.2% identity (82.1% similar) in 826 aa overlap (53-823:42-848)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KA1 RGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLG
                                     : : :.:::.:: .  : .:::::: :.::
CCDS55 LSPKPTVGRSLCLTLWFLSLALRASTQAPAPTVNTHFGKLRGARVPLPSEILGPVDQYLG
              20        30        40        50        60        70 

             90       100       110       120       130       140  
pF1KA1 VPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVV
       ::::::: ::.:: :::::  :: :::::.: :::::::  . .:::::::::: :::.:
CCDS55 VPYAAPPIGEKRFLPPEPPPSWSGIRNATHFPPVCPQNIHTA-VPEVMLPVWFTANLDIV
              80        90       100       110        120       130

            150       160                                          
pF1KA1 SSYVQDQSEDCLYLNIYVPTED--------------------------------------
       ..:.:. .:::::::.::::::                                      
CCDS55 ATYIQEPNEDCLYLNVYVPTEDVKRISKECARKPNKKICRKGGSGAKKQGEDLADNDGDE
              140       150       160       170       180       190

            170       180       190       200       210       220  
pF1KA1 --DIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGNVIVITVNYRLGVLGFLSTGD
         ::::::. ::::::::::::::::::. :::.:::::::::::.:::.::::::::::
CCDS55 DEDIRDSGA-KPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVITLNYRVGVLGFLSTGD
               200       210       220       230       240         

            230       240       250       260       270       280  
pF1KA1 QAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEGNRWS
       ::::::::::: ::::::.::::.:::::: :::::::: :.:::.::::::.:::    
CCDS55 QAAKGNYGLLDQIQALRWVSENIAFFGGDPRRITVFGSGIGASCVSLLTLSHHSEG----
     250       260       270       280       290       300         

            290       300       310       320       330       340  
pF1KA1 NSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGCNVSDTVELVECLQKKPYKEL
            :::::: :::.:::::::..::.::. .:: :::::: :::..:.::..:  :::
CCDS55 -----LFQRAIIQSGSALSSWAVNYQPVKYTSLLADKVGCNVLDTVDMVDCLRQKSAKEL
              310       320       330       340       350       360

            350       360       370       380       390       400  
pF1KA1 VDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVENIVDS
       :.:::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::..:: 
CCDS55 VEQDIQPARYHVAFGPVIDGDVIPDDPEILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVEGVVDP
              370       380       390       400       410       420

            410       420       430       440       450       460  
pF1KA1 DDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLALFTD
       .::.:..:::..::::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::::.:::::
CCDS55 EDGVSGTDFDYSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADRDNPETRRKTLVALFTD
              430       440       450       460       470       480

            470       480       490       500       510       520  
pF1KA1 HQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMIGPTE
       :::: :.:.:::::. .::::::::::::::. . :::.:::::::::::.:.::.:::.
CCDS55 HQWVEPSVVTADLHARYGSPTYFYAFYHHCQSLMKPAWSDAAHGDEVPYVFGVPMVGPTD
              490       500       510       520       530       540

            530       540       550       560       570       580  
pF1KA1 LFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRYSQKD
       :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: ::::::::..:. .:
CCDS55 LFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNKPVPQDTKFIHTKANRFEEVAWSKYNPRD
              550       560       570       580       590       600

            590       600       610       620       630            
pF1KA1 QLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTD------ITF
       ::::::::::::..::::.:: .: .:::::.::.:. .:::::::::  :      :: 
CCDS55 QLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWKHLVPHLYNLHDMFHYTSTTTKVPPPDTTHSSHITR
              610       620       630       640       650       660

        640        650             660        670       680        
pF1KA1 RPTRKN-SVPVTSAFPTAKQDDPK------QQPSPFSVDQ-RDYSTELSVTIAVGASLLF
       ::. :. :.   .  :. .... .      :. .:. :.. :::::::::::::::::::
CCDS55 RPNGKTWSTKRPAISPAYSNENAQGSWNGDQDAGPLLVENPRDYSTELSVTIAVGASLLF
              670       680       690       700       710       720

      690       700       710        720       730       740       
pF1KA1 LNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTT-TNDLTHAQEEEIMSLQMKHTDLDHECESI
       ::.::::::::.:::::..  :. :::: . . .:  : :::. .::.  :   ::::. 
CCDS55 LNVLAFAALYYRKDKRRQEPLRQPSPQRGAGAPELGAAPEEELAALQLGPTH--HECEAG
              730       740       750       760       770          

       750       760       770       780       790       800       
pF1KA1 HPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNTIPGIQPLHTFNTFTGGQNNT
        ::.. :: .  :::::..::::::.:::::::::::::.. :.: :: .:::..: :.:
CCDS55 PPHDT-LRLTALPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNSLVGLQTLHPYNTFAAGFNST
      780        790       800       810       820       830       

       810       820   
pF1KA1 LPHPHPHPHSHSTTRV
              :::::::::
CCDS55 -----GLPHSHSTTRV
            840        

>>CCDS3198.1 BCHE gene_id:590|Hs108|chr3                  (602 aa)
 initn: 994 init1: 199 opt: 854  Z-score: 892.9  bits: 175.7 E(32554): 2e-43
Smith-Waterman score: 1086; 34.3% identity (60.7% similar) in 618 aa overlap (14-613:4-557)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MALPRCTWPNYVWRAVMACLVHRGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFG
                    .... :.  : :   : ::::      :.  :.  ::.  ..::. :
CCDS31           MHSKVTIICI--RFLFWFLLLCML-----IGK--SHTEDDI--IIATKNG
                         10          20               30           

               70         80        90       100       110         
pF1KA1 KIRGIKKELNNEILG-PVIQFLGVPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQ
       :.::    .:  ..:  :  :::.::: :: :. ::. :.  . :::: :::..:  : :
CCDS31 KVRG----MNLTVFGGTVTAFLGIPYAQPPLGRLRFKKPQSLTKWSDIWNATKYANSCCQ
      40            50        60        70        80        90     

     120       130        140       150       160       170        
pF1KA1 NIIDGRLPEVM-LPVWFTNNLDVVSSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKP----
       :: :  .:      .:  :.         : ::::::::...:.         :::    
CCDS31 NI-DQSFPGFHGSEMWNPNT---------DLSEDCLYLNVWIPA---------PKPKNAT
          100       110                120                130      

          180       190         200       210       220        230 
pF1KA1 VMVYIHGGSYMEGTGNL--YDGSVLASYGNVIVITVNYRLGVLGFLST-GDQAAKGNYGL
       :...:.::... ::..:  :::. ::    :::...:::.:.::::.  :.  : ::.::
CCDS31 VLIWIYGGGFQTGTSSLHVYDGKFLARVERVIVVSMNYRVGALGFLALPGNPEAPGNMGL
        140       150       160       170       180       190      

             240       250       260       270       280       290 
pF1KA1 LDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQR
       .:   ::.:...::. :::.:  .:.:: .::.. :.:  ::  :..         :: :
CCDS31 FDQQLALQWVQKNIAAFGGNPKSVTLFGESAGAASVSLHLLSPGSHS---------LFTR
        200       210       220       230       240                

             300        310        320       330       340         
pF1KA1 AIAQSGTALSSWAV-SFQPAKYARM-LATKVGCNVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQP
       :: :::.  . ::: :.  :.   . ::  .::.  . .:...::..:  .:.. ..   
CCDS31 AILQSGSFNAPWAVTSLYEARNRTLNLAKLTGCSRENETEIIKCLRNKDPQEILLNEAFV
       250       260       270       280       290       300       

     350           360       370       380       390       400     
pF1KA1 ARY----HIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDG
       . :     . :::..::: . : :.::.: :.: . .:..:::. ::  :   .: .  :
CCDS31 VPYGTPLSVNFGPTVDGDFLTDMPDILLELGQFKKTQILVGVNKDEGTAF---LVYGAPG
       310       320       330       340       350          360    

         410        420        430       440       450       460   
pF1KA1 ISASDFDFAV-SNFVDNL-YGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLALFTDH
       .: .. .. . ..: ..:   .:  ..  .:.: : ::::.: . ::. :..:  .  :.
CCDS31 FSKDNNSIITRKEFQEGLKIFFPGVSEFGKESILFHYTDWVDDQRPENYREALGDVVGDY
          370       380       390       400       410       420    

           470       480       490       500       510       520   
pF1KA1 QWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMIGPTEL
       ... ::.  .   :..:. ..:: : :. .    : :  . :: :. .:.:.:.      
CCDS31 NFICPALEFTKKFSEWGNNAFFYYFEHRSSKLPWPEWMGVMHGYEIEFVFGLPLERRD--
          430       440       450       460       470       480    

           530       540       550       560       570       580   
pF1KA1 FPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQ
          :..: . .::  ..  :.:::: :.::.          :. :    ..:  ... .:
CCDS31 ---NYTKAEEILSRSIVKRWANFAKYGNPNE----------TQNNS---TSWPVFKSTEQ
               490       500       510                    520      

           590        600       610       620       630       640  
pF1KA1 LYLHIGLKP-RVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTDITFRPTRKN
        :: .. .  :.  . ::..  .:  . :..                             
CCDS31 KYLTLNTESTRIMTKLRAQQCRFWTSFFPKVLEMTGNIDEAEWEWKAGFHRWNNYMMDWK
        530       540       550       560       570       580      

            650       660       670       680       690       700  
pF1KA1 SVPVTSAFPTAKQDDPKQQPSPFSVDQRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKD
                                                                   
CCDS31 NQFNDYTSKKESCVGL                                            
        590       600                                              

>>CCDS43896.1 CEL gene_id:1056|Hs108|chr9                 (756 aa)
 initn: 735 init1: 334 opt: 748  Z-score: 780.6  bits: 155.3 E(32554): 3.7e-37
Smith-Waterman score: 977; 34.0% identity (56.8% similar) in 648 aa overlap (55-668:29-612)

           30        40        50        60        70         80   
pF1KA1 LGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQ-FLGV
                                     : :. : ..:..:.:.  .::  .. : :.
CCDS43   MLTMGRLQLVVLGLTCCWAVASAAKLGAVYTEGGFVEGVNKKLG--LLGDSVDIFKGI
                 10        20        30        40          50      

            90       100       110       120       130       140   
pF1KA1 PYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVVS
       :.:::    . .. :.:   :.   .: .:   : :  :             :..    :
CCDS43 PFAAP---TKALENPQPHPGWQGTLKAKNFKKRCLQATI-------------TQD----S
         60           70        80        90                       

           150       160       170       180       190             
pF1KA1 SYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGN--------LYDGS
       .:    .::::::::.::  .  .. .   :::..:.::... :.:.        :::: 
CCDS43 TY---GDEDCLYLNIWVP--QGRKQVSRDLPVMIWIYGGAFLMGSGHGANFLNNYLYDGE
           100       110         120       130       140       150 

         200       210       220       230       240       250     
pF1KA1 VLASYGNVIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRI
        .:. :::::.: :::.: ::::::::    ::::: :  .:. :...::. :::::  :
CCDS43 EIATRGNVIVVTFNYRVGPLGFLSTGDANLPGNYGLRDQHMAIAWVKRNIAAFGGDPNNI
             160       170       180       190       200       210 

         260       270       280       290       300       310     
pF1KA1 TVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARM
       :.:: .:::. :.: ::: :.         :::..:::.:::.::: :... .:  .:. 
CCDS43 TLFGESAGGASVSLQTLSPYN---------KGLIRRAISQSGVALSPWVIQKNPLFWAKK
             220       230                240       250       260  

         320       330              340       350       360        
pF1KA1 LATKVGCNVSDTVELVECLQ-KKP------YKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDD
       .: :::: :.:......::.   :      ::  .     :  ....: :::::: :: :
CCDS43 VAEKVGCPVGDAARMAQCLKVTDPRALTLAYKVPLAGLEYPMLHYVGFVPVIDGDFIPAD
            270       280       290       300       310       320  

      370       380       390           400       410         420  
pF1KA1 PQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKF----VENIVDSDDGISASDFDFAVSNFV--DNL
       :  :. ..   . : . :.:. .:  :    .  :  ..  ..  ::   ::.:.   .:
CCDS43 PINLYANAA--DIDYIAGTNNMDGHIFASIDMPAINKGNKKVTEEDFYKLVSEFTITKGL
            330         340       350       360       370       380

            430       440       450       460        470       480 
pF1KA1 YGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPA-VATADLHSNFGS
        :     ::  :.       ::.  . :...::.. . ::  ...:. .: :. ..:  :
CCDS43 RGAKTTFDVYTES-------WAQDPSQENKKKTVVDFETDVLFLVPTEIALAQHRANAKS
              390              400       410       420       430   

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 P-TYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVM
         :: : : :  .    : :. : :.:.. ::.: :.  ::   :     .:  .: ...
CCDS43 AKTYAYLFSHPSRMPVYPKWVGADHADDIQYVFGKPFATPTGYRP-----QDRTVSKAMI
           440       450       460       470            480        

              550       560       570       580       590          
pF1KA1 TYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLK---PRVKEH
       .::::::::::::.    :.      :..     :  :. ... ::.:  :     .:. 
CCDS43 AYWTNFAKTGDPNMG---DSAV----PTH-----WEPYTTENSGYLEITKKMGSSSMKRS
      490       500              510            520       530      

       600       610       620       630       640              650
pF1KA1 YRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTDITFRPTRKNS----VPVTS---AF
        :.: .  :      : ...:  : .. .  . ... :  :   .:    :: :.   : 
CCDS43 LRTNFLRYWTLTYLALPTVTD--QEATPVPPTGDSEATPVPPTGDSETAPVPPTGDSGAP
        540       550         560       570       580       590    

              660       670       680       690       700       710
pF1KA1 PTAKQDDPKQQPSPFSVDQRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHR
       :.    :    : : . :                                          
CCDS43 PVPPTGDSGAPPVPPTGDSGAPPVPPTGDSGAPPVPPTGDSGAPPVPPTGDSGAPPVPPT
          600       610       620       630       640       650    




823 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Wed Nov  2 20:22:02 2016 done: Wed Nov  2 20:22:02 2016
 Total Scan time:  3.840 Total Display time:  0.260

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com