seq1 = pF1KA1070.tfa, 2469 bp seq2 = pF1KA1070/gi568815595f_173504599.tfa (gi568815595f:173504599_174381255), 876657 bp >pF1KA1070 2469 >gi568815595f:173504599_174381255 (Chr3) 1-493 (100001-100493) 100% -> 494-646 (303082-303234) 100% -> 647-859 (770717-770929) 100% -> 860-1649 (774263-775052) 100% -> 1650-2469 (775883-776702) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCACTGCCCAGATGCACGTGGCCAAATTATGTTTGGAGAGCAGTGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGCACTGCCCAGATGCACGTGGCCAAATTATGTTTGGAGAGCAGTGAT 50 . : . : . : . : . : 51 GGCATGCTTGGTACACCGGGGATTGGGTGCCCCATTGACTCTCTGTATGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GGCATGCTTGGTACACCGGGGATTGGGTGCCCCATTGACTCTCTGTATGT 100 . : . : . : . : . : 101 TGGGATGTTTGCTTCAGGCTGGCCATGTGCTATCACAAAAATTGGATGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 TGGGATGTTTGCTTCAGGCTGGCCATGTGCTATCACAAAAATTGGATGAT 150 . : . : . : . : . : 151 GTGGACCCACTGGTGGCTACCAACTTTGGAAAGATAAGAGGGATTAAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 GTGGACCCACTGGTGGCTACCAACTTTGGAAAGATAAGAGGGATTAAGAA 200 . : . : . : . : . : 201 GGAACTCAATAATGAAATTTTGGGGCCTGTTATTCAATTTCTTGGGGTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100201 GGAACTCAATAATGAAATTTTGGGGCCTGTTATTCAATTTCTTGGGGTTC 250 . : . : . : . : . : 251 CATATGCAGCCCCACCAACAGGGGAACGTCGTTTTCAGCCTCCAGAACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100251 CATATGCAGCCCCACCAACAGGGGAACGTCGTTTTCAGCCTCCAGAACCA 300 . : . : . : . : . : 301 CCATCTCCCTGGTCAGATATCAGAAATGCCACTCAATTTGCTCCTGTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100301 CCATCTCCCTGGTCAGATATCAGAAATGCCACTCAATTTGCTCCTGTGTG 350 . : . : . : . : . : 351 TCCCCAGAATATCATTGATGGCAGATTGCCAGAAGTCATGCTTCCTGTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100351 TCCCCAGAATATCATTGATGGCAGATTGCCAGAAGTCATGCTTCCTGTGT 400 . : . : . : . : . : 401 GGTTTACTAATAACTTGGATGTGGTTTCATCATATGTGCAAGACCAGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100401 GGTTTACTAATAACTTGGATGTGGTTTCATCATATGTGCAAGACCAGAGC 450 . : . : . : . : . : 451 GAAGACTGCCTATATTTAAATATATATGTCCCGACTGAGGATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 100451 GAAGACTGCCTATATTTAAATATATATGTCCCGACTGAGGATGGTG...C 500 . : . : . : . : . : 494 ATATTCGGGACAGTGGGGGTCCCAAACCAGTGATGGTGTATATCCATG >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 303080 AGATATTCGGGACAGTGGGGGTCCCAAACCAGTGATGGTGTATATCCATG 550 . : . : . : . : . : 542 GTGGCTCATATATGGAAGGTACTGGAAATTTATATGATGGAAGTGTCTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 303130 GTGGCTCATATATGGAAGGTACTGGAAATTTATATGATGGAAGTGTCTTG 600 . : . : . : . : . : 592 GCAAGTTATGGCAATGTGATCGTCATCACAGTCAACTATCGACTTGGAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 303180 GCAAGTTATGGCAATGTGATCGTCATCACAGTCAACTATCGACTTGGAGT 650 . : . : . : . : . : 642 ACTCG GTTTCTTGAGTACAGGCGATCAGGCTGCAAAGGGGA |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 303230 ACTCGGTA...CAGGTTTCTTGAGTACAGGCGATCAGGCTGCAAAGGGGA 700 . : . : . : . : . : 683 ACTATGGACTCCTTGATCTCATACAAGCTTTAAGATGGACTAGTGAAAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 770753 ACTATGGACTCCTTGATCTCATACAAGCTTTAAGATGGACTAGTGAAAAC 750 . : . : . : . : . : 733 ATTGGATTCTTTGGTGGTGACCCCTTAAGAATCACTGTTTTTGGATCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 770803 ATTGGATTCTTTGGTGGTGACCCCTTAAGAATCACTGTTTTTGGATCTGG 800 . : . : . : . : . : 783 TGCTGGGGGTTCATGTGTCAACCTGCTGACTTTATCCCATTATTCTGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 770853 TGCTGGGGGTTCATGTGTCAACCTGCTGACTTTATCCCATTATTCTGAAG 850 . : . : . : . : . : 833 GTAACCGTTGGAGCAATTCAACCAAAG GACTTTTTCAACGA |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 770903 GTAACCGTTGGAGCAATTCAACCAAAGGTA...TAGGACTTTTTCAACGA 900 . : . : . : . : . : 874 GCAATAGCTCAAAGTGGAACAGCCCTTTCCAGCTGGGCTGTTAGTTTTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 774277 GCAATAGCTCAAAGTGGAACAGCCCTTTCCAGCTGGGCTGTTAGTTTTCA 950 . : . : . : . : . : 924 ACCTGCAAAATATGCTAGAATGTTGGCCACAAAAGTTGGTTGCAATGTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 774327 ACCTGCAAAATATGCTAGAATGTTGGCCACAAAAGTTGGTTGCAATGTTT 1000 . : . : . : . : . : 974 CAGATACAGTAGAGTTAGTGGAATGCCTACAGAAGAAGCCTTACAAAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 774377 CAGATACAGTAGAGTTAGTGGAATGCCTACAGAAGAAGCCTTACAAAGAA 1050 . : . : . : . : . : 1024 CTTGTTGACCAAGATATTCAACCAGCTCGATACCACATAGCCTTTGGACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 774427 CTTGTTGACCAAGATATTCAACCAGCTCGATACCACATAGCCTTTGGACC 1100 . : . : . : . : . : 1074 TGTGATTGATGGTGATGTAATACCAGACGACCCCCAGATATTGATGGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 774477 TGTGATTGATGGTGATGTAATACCAGACGACCCCCAGATATTGATGGAGC 1150 . : . : . : . : . : 1124 AAGGAGAGTTTCTCAACTATGATATAATGTTAGGAGTGAACCAAGGGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 774527 AAGGAGAGTTTCTCAACTATGATATAATGTTAGGAGTGAACCAAGGGGAA 1200 . : . : . : . : . : 1174 GGGTTAAAATTTGTTGAAAATATAGTAGATAGCGATGATGGTATATCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 774577 GGGTTAAAATTTGTTGAAAATATAGTAGATAGCGATGATGGTATATCAGC 1250 . : . : . : . : . : 1224 TAGTGATTTTGACTTTGCTGTTTCAAATTTTGTTGATAATTTATATGGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 774627 TAGTGATTTTGACTTTGCTGTTTCAAATTTTGTTGATAATTTATATGGAT 1300 . : . : . : . : . : 1274 ATCCTGAAGGCAAAGATGTTTTGAGAGAAACCATTAAGTTCATGTATACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 774677 ATCCTGAAGGCAAAGATGTTTTGAGAGAAACCATTAAGTTCATGTATACT 1350 . : . : . : . : . : 1324 GACTGGGCTGACCGTCATAACCCTGAAACCAGAAGAAAGACATTACTGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 774727 GACTGGGCTGACCGTCATAACCCTGAAACCAGAAGAAAGACATTACTGGC 1400 . : . : . : . : . : 1374 TTTGTTTACGGACCATCAGTGGGTGGCACCAGCTGTAGCCACAGCGGATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 774777 TTTGTTTACGGACCATCAGTGGGTGGCACCAGCTGTAGCCACAGCGGATC 1450 . : . : . : . : . : 1424 TTCACTCAAACTTTGGTTCACCTACGTACTTCTATGCCTTTTACCATCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 774827 TTCACTCAAACTTTGGTTCACCTACGTACTTCTATGCCTTTTACCATCAT 1500 . : . : . : . : . : 1474 TGCCAAACAGATCAGGTTCCAGCTTGGGCTGATGCAGCCCACGGAGACGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 774877 TGCCAAACAGATCAGGTTCCAGCTTGGGCTGATGCAGCCCACGGAGACGA 1550 . : . : . : . : . : 1524 GGTTCCCTATGTACTGGGAATCCCCATGATTGGCCCTACAGAGTTATTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 774927 GGTTCCCTATGTACTGGGAATCCCCATGATTGGCCCTACAGAGTTATTTC 1600 . : . : . : . : . : 1574 CTTGCAATTTCTCCAAAAATGATGTGATGCTGAGTGCAGTTGTAATGACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 774977 CTTGCAATTTCTCCAAAAATGATGTGATGCTGAGTGCAGTTGTAATGACA 1650 . : . : . : . : . : 1624 TACTGGACAAATTTTGCTAAAACTGG TGACCCAAATCAACC ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 775027 TACTGGACAAATTTTGCTAAAACTGGGTA...TAGTGACCCAAATCAACC 1700 . : . : . : . : . : 1665 AGTCCCTCAAGACACGAAATTCATTCATACCAAACCCAACCGTTTTGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 775898 AGTCCCTCAAGACACGAAATTCATTCATACCAAACCCAACCGTTTTGAAG 1750 . : . : . : . : . : 1715 AAGTAGCATGGACCAGATATTCCCAGAAAGACCAACTTTATCTCCATATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 775948 AAGTAGCATGGACCAGATATTCCCAGAAAGACCAACTTTATCTCCATATT 1800 . : . : . : . : . : 1765 GGATTAAAACCAAGAGTTAAAGAACATTACAGAGCCAATAAGGTGAACCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 775998 GGATTAAAACCAAGAGTTAAAGAACATTACAGAGCCAATAAGGTGAACCT 1850 . : . : . : . : . : 1815 CTGGTTGGAGTTGGTACCTCATCTGCATAATCTCAATGACATTTCTCAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 776048 CTGGTTGGAGTTGGTACCTCATCTGCATAATCTCAATGACATTTCTCAGT 1900 . : . : . : . : . : 1865 ATACCTCTACAACAACTAAAGTGCCATCAACTGACATCACTTTCAGACCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 776098 ATACCTCTACAACAACTAAAGTGCCATCAACTGACATCACTTTCAGACCT 1950 . : . : . : . : . : 1915 ACGAGAAAAAATTCTGTACCTGTCACGTCAGCCTTTCCCACTGCCAAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 776148 ACGAGAAAAAATTCTGTACCTGTCACGTCAGCCTTTCCCACTGCCAAGCA 2000 . : . : . : . : . : 1965 GGATGATCCCAAACAACAACCAAGTCCATTTTCAGTGGATCAAAGGGACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 776198 GGATGATCCCAAACAACAACCAAGTCCATTTTCAGTGGATCAAAGGGACT 2050 . : . : . : . : . : 2015 ACTCAACAGAGCTGAGTGTCACTATTGCAGTTGGAGCATCACTGCTGTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 776248 ACTCAACAGAGCTGAGTGTCACTATTGCAGTTGGAGCATCACTGCTGTTT 2100 . : . : . : . : . : 2065 CTGAACATCTTGGCCTTTGCAGCCCTGTACTACAAAAAGGATAAGAGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 776298 CTGAACATCTTGGCCTTTGCAGCCCTGTACTACAAAAAGGATAAGAGGAG 2150 . : . : . : . : . : 2115 ACATGATGTTCACAGGAGATGCAGCCCTCAGCGCACTACTACCAATGATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 776348 ACATGATGTTCACAGGAGATGCAGCCCTCAGCGCACTACTACCAATGATC 2200 . : . : . : . : . : 2165 TAACCCATGCACAAGAAGAGGAAATCATGTCCCTCCAAATGAAGCACACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 776398 TAACCCATGCACAAGAAGAGGAAATCATGTCCCTCCAAATGAAGCACACT 2250 . : . : . : . : . : 2215 GATTTGGATCATGAATGTGAGTCCATTCATCCACATGAGGTGGTTCTTCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 776448 GATTTGGATCATGAATGTGAGTCCATTCATCCACATGAGGTGGTTCTTCG 2300 . : . : . : . : . : 2265 GACCGCCTGTCCCCCAGATTACACACTAGCTATGAGGAGGTCACCTGATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 776498 GACCGCCTGTCCCCCAGATTACACACTAGCTATGAGGAGGTCACCTGATG 2350 . : . : . : . : . : 2315 ATGTTCCCTTAATGACACCCAACACCATTACAATGATTCCCAACACTATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 776548 ATGTTCCCTTAATGACACCCAACACCATTACAATGATTCCCAACACTATA 2400 . : . : . : . : . : 2365 CCAGGGATTCAGCCCTTACACACATTCAATACATTTACTGGAGGACAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 776598 CCAGGGATTCAGCCCTTACACACATTCAATACATTTACTGGAGGACAGAA 2450 . : . : . : . : . : 2415 CAATACTCTGCCCCATCCCCATCCCCACCCCCATTCACATTCAACAACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 776648 CAATACTCTGCCCCATCCCCATCCCCACCCCCATTCACATTCAACAACCA 2500 . 2465 GGGTA ||||| 776698 GGGTA