Result of FASTA (ccds) for pF1KA1047
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1047, 2337 aa
  1>>>pF1KA1047 2337 - 2337 aa - 2337 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7990+/-0.00105; mu= -2.3793+/- 0.064
 mean_var=339.2463+/-68.906, 0's: 0 Z-trim(114.3): 33  B-trim: 0 in 0/56
 Lambda= 0.069633
 statistics sampled from 14806 (14829) to 14806 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.728), E-opt: 0.2 (0.456), width:  16
 Scan time:  7.770

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS54095.1 NCOR1 gene_id:9611|Hs108|chr17         (2337) 15543 1576.8       0
CCDS11175.1 NCOR1 gene_id:9611|Hs108|chr17         (2440) 7525 771.4       0
CCDS54094.1 NCOR1 gene_id:9611|Hs108|chr17         ( 914) 5821 599.9 1.8e-170
CCDS41857.2 NCOR2 gene_id:9612|Hs108|chr12         (2458) 3013 318.1 3.3e-85
CCDS55892.1 NCOR2 gene_id:9612|Hs108|chr12         (2504) 3013 318.1 3.3e-85
CCDS41858.2 NCOR2 gene_id:9612|Hs108|chr12         (2514) 2808 297.5 5.3e-79


>>CCDS54095.1 NCOR1 gene_id:9611|Hs108|chr17              (2337 aa)
 initn: 15543 init1: 15543 opt: 15543  Z-score: 8446.5  bits: 1576.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 15543; 100.0% identity (100.0% similar) in 2337 aa overlap (1-2337:1-2337)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 QQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSHFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSHFQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 RVSAAVLPLVHPLPEGLRASADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPSKLSKEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RVSAAVLPLVHPLPEGLRASADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPSKLSKEE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 LIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 DENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHAR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 KQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 RVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINM
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 NGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDCVLYYYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDCVLYYYL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 TKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 KEDSKENTKEKDKIDGTAEETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KEDSKENTKEKDKIDGTAEETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 AAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 QCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSAQEDEDIEASNEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSAQEDEDIEASNEE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 ENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATSRGNTEPAVELEPTTETAPSTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATSRGNTEPAVELEPTTETAPSTS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 PSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQEHSAEEGSVCDPPPATKADSVDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQEHSAEEGSVCDPPPATKADSVDV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 EVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVEPRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVEPRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 ADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPMVSCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPMVSCT
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 PCNIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTSPCGTSKSPNREW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PCNIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTSPCGTSKSPNREW
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 EVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEKPSFIMGGSISQGTPGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEKPSFIMGGSISQGTPGT
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 YLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKSATLPYIKQEEFSPRSQNSQPEGLLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKSATLPYIKQEEFSPRSQNSQPEGLLV
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA1 RAQHEGVVRGTAGAIQEGSITRGTPTSKISVESIPSLRGSITQGTPALPQTGIPTEALVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RAQHEGVVRGTAGAIQEGSITRGTPTSKISVESIPSLRGSITQGTPALPQTGIPTEALVK
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA1 GSISRMPIEDSSPEKGREEAASKGHVIYEGKSGHILSYDNIKNAREGTRSPRTAHEISLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSISRMPIEDSSPEKGREEAASKGHVIYEGKSGHILSYDNIKNAREGTRSPRTAHEISLK
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA1 RSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPLEGLICRALPRGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPLEGLICRALPRGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRAT
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA1 TESFEDGLKYPKQIKRESPPIRAFEGAITKGKPYDGITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TESFEDGLKYPKQIKRESPPIRAFEGAITKGKPYDGITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQES
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA1 RKTPEVVQSTRPIIEGSISQGTPIKFDNNSGQSAIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RKTPEVVQSTRPIIEGSISQGTPIKFDNNSGQSAIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVP
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KA1 ENIKVVERGKYEDVKAGETVRSRHTSVVSSGPSVLRSTLHEAPKAQLSPGIYDDTSARRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ENIKVVERGKYEDVKAGETVRSRHTSVVSSGPSVLRSTLHEAPKAQLSPGIYDDTSARRT
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KA1 PVSYQNTMSRGSPMMNRTSDVTISSNKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PVSYQNTMSRGSPMMNRTSDVTISSNKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVSH
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KA1 SPFDPHHRGSTAGEVYRSHLPTHLDPAMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQYQLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SPFDPHHRGSTAGEVYRSHLPTHLDPAMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQYQLY
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KA1 AMENTRQTILNDYITSQQMQVNLRPDVARGLSPREQPLGLPYPATRGIIDLTNMPPTILV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AMENTRQTILNDYITSQQMQVNLRPDVARGLSPREQPLGLPYPATRGIIDLTNMPPTILV
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KA1 PHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSPGHPTHLAAAASAEREREREREKER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSPGHPTHLAAAASAEREREREREKER
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KA1 ERERIAAASSDLYLRPGSEQPGRPGSHGYVRSPSPSVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ERERIAAASSDLYLRPGSEQPGRPGSHGYVRSPSPSVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVI
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KA1 TPLDPTAQLRIMPLPAGGPSISQGLPASRYNTAADALAALVDAAASAPQMDVSKTKEISS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TPLDPTAQLRIMPLPAGGPSISQGLPASRYNTAADALAALVDAAASAPQMDVSKTKEISS
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KA1 HRYETPSDAIEVISPASSPAPPQEKLQTYQPEVVKANQAENDPTRQYEGPLHHYRPQQES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HRYETPSDAIEVISPASSPAPPQEKLQTYQPEVVKANQAENDPTRQYEGPLHHYRPQQES
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
pF1KA1 PSPQQQLPPSSQAEGMGQVPRTHRLITLADHICQIITQDFARNQVSSQTPQQPPTSTFQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PSPQQQLPPSSQAEGMGQVPRTHRLITLADHICQIITQDFARNQVSSQTPQQPPTSTFQN
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

             1990      2000      2010      2020      2030      2040
pF1KA1 SPSALVSTPVRTKTSNRYSPESQAQSVHHQRPGSRVSPENLVDKSRGSRPGKSPERSHVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SPSALVSTPVRTKTSNRYSPESQAQSVHHQRPGSRVSPENLVDKSRGSRPGKSPERSHVS
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

             2050      2060      2070      2080      2090      2100
pF1KA1 SEPYEPISPPQVPVVHEKQDSLLLLSQRGAEPAEQRNDARSPGSISYLPSFFTKLENTSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SEPYEPISPPQVPVVHEKQDSLLLLSQRGAEPAEQRNDARSPGSISYLPSFFTKLENTSP
             2050      2060      2070      2080      2090      2100

             2110      2120      2130      2140      2150      2160
pF1KA1 MVKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAAQPGTEIFNLPAVTTSGSVSSRGHSFADPASNLGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MVKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAAQPGTEIFNLPAVTTSGSVSSRGHSFADPASNLGL
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pF1KA1 EDIIRKALMGSFDDKVEDHGVVMSQPMGVVPGTANTSVVTSGETRREEGDPSPHSGGVCK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EDIIRKALMGSFDDKVEDHGVVMSQPMGVVPGTANTSVVTSGETRREEGDPSPHSGGVCK
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pF1KA1 PKLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHSEGDYHRQTPGWAWEDRPSSTGSTQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PKLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHSEGDYHRQTPGWAWEDRPSSTGSTQF
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pF1KA1 PYNPLTMRMLSSTPPTPIACAPSAVNQAAPHQQNRIWEREPAPLLSAQYETLSDSDD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PYNPLTMRMLSSTPPTPIACAPSAVNQAAPHQQNRIWEREPAPLLSAQYETLSDSDD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RVSAAVLPLVHPLPEGLRASADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPSKLSKEE
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pF1KA1 LIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHAR
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pF1KA1 KQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQ
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pF1KA1 RVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINM
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDCVLYYYL
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pF1KA1 TKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDE
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pF1KA1 KEDSKENTKEKDKIDGTAEETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KEDSKENTKEKDKIDGTAEETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAA
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pF1KA1 AAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEA
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pF1KA1 QCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSAQEDEDIEASNEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSAQEDEDIEASNEE
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pF1KA1 ENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATSRGNTEPAVELEPTTETAPSTS
       :::::::                :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ENPEDSE----------------VEAVKPSEDSPENATSRGNTEPAVELEPTTETAPSTS
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pF1KA1 PSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQEHSAEEGSVCDPPPATKADSVDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQEHSAEEGSVCDPPPATKADSVDV
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pF1KA1 EVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVEPRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVEPRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCS
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pF1KA1 ADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPMVSCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPMVSCT
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pF1KA1 PCNIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTSPCGTSKSPNREW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PCNIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTSPCGTSKSPNREW
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pF1KA1 EVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEKPSFIMGGSISQGTPGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEKPSFIMGGSISQGTPGT
         1010      1020      1030      1040      1050      1060    

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 YLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKSATLPYIKQEEFSPRSQNSQPEGLLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKSATLPYIKQEEFSPRSQNSQPEGLLV
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pF1KA1 RAQHEGVVRGTAGAIQEGSITRGTPTSKISVESIPSLRGSITQGTPALPQTGIPTEALVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RAQHEGVVRGTAGAIQEGSITRGTPTSKISVESIPSLRGSITQGTPALPQTGIPTEALVK
         1130      1140      1150      1160      1170      1180    

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pF1KA1 GSISRMPIEDSSPEKGREEAASKGHVIYEGKSGHILSYDNIKNAREGTRSPRTAHEISLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GSISRMPIEDSSPEKGREEAASKGHVIYEGKSGHILSYDNIKNAREGTRSPRTAHEISLK
         1190      1200      1210      1220      1230      1240    

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA1 RSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPLEGLICRALPRGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPLEGLICRALPRGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRAT
         1250      1260      1270      1280      1290      1300    

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA1 TESFEDGLKYPKQIKRESPPIRAFEGAITKGKPYDGITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TESFEDGLKYPKQIKRESPPIRAFEGAITKGKPYDGITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQES
         1310      1320      1330      1340      1350      1360    

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA1 RKTPEVVQSTRPIIEGSISQGTPIKFDNNSGQSAIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RKTPEVVQSTRPIIEGSISQGTPIKFDNNSGQSAIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVP
         1370      1380      1390      1400      1410      1420    

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KA1 ENIKVVERGKYEDVKAGETVRSRHTSVVSSGPSVLRSTLHEAPKAQLSPGIYDDTSARRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ENIKVVERGKYEDVKAGETVRSRHTSVVSSGPSVLRSTLHEAPKAQLSPGIYDDTSARRT
         1430      1440      1450      1460      1470      1480    

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KA1 PVSYQNTMSRGSPMMNRTSDVTISSNKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PVSYQNTMSRGSPMMNRTSDVTISSNKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVSH
         1490      1500      1510      1520      1530      1540    

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KA1 SPFDPHHRGSTAGEVYRSHLPTHLDPAMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQYQLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPFDPHHRGSTAGEVYRSHLPTHLDPAMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQYQLY
         1550      1560      1570      1580      1590      1600    

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KA1 AMENTRQTILNDYITSQQMQVNLRPDVARGLSPREQPLGLPYPATRGIIDLTNMPPTILV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AMENTRQTILNDYITSQQMQVNLRPDVARGLSPREQPLGLPYPATRGIIDLTNMPPTILV
         1610      1620      1630      1640      1650      1660    

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KA1 PHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSPGHPTHLAAAASAEREREREREKER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSPGHPTHLAAAASAEREREREREKER
         1670      1680      1690      1700      1710      1720    

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KA1 ERERIAAASSDLYLRPGSEQPGRPGSHGYVRSPSPSVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ERERIAAASSDLYLRPGSEQPGRPGSHGYVRSPSPSVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVI
         1730      1740      1750      1760      1770      1780    

             1810      1820      1830      1840      1850          
pF1KA1 TPLDPTAQLRIMPLPAGGPSISQGLPASRYNTAADALAALVDAAASAPQMDVSKTKE---
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   
CCDS11 TPLDPTAQLRIMPLPAGGPSISQGLPASRYNTAADALAALVDAAASAPQMDVSKTKESKH
         1790      1800      1810      1820      1830      1840    

                                                                   
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
                                                                   
CCDS11 EAARLEENLRSRSAAVSEQQQLEQKTLEVEKRSVQCLYTSSAFPSGKPQPHSSVVYSEAG
         1850      1860      1870      1880      1890      1900    

                                                              1860 
pF1KA1 --------------------------------------------------------ISSH
                                                               .:::
CCDS11 KDKGPPPKSRYEEELRTRGKTTITAANFIDVIITRQIASDKDARERGSQSSDSSSSLSSH
         1910      1920      1930      1940      1950      1960    

            1870      1880      1890      1900      1910      1920 
pF1KA1 RYETPSDAIEVISPASSPAPPQEKLQTYQPEVVKANQAENDPTRQYEGPLHHYRPQQESP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RYETPSDAIEVISPASSPAPPQEKLQTYQPEVVKANQAENDPTRQYEGPLHHYRPQQESP
         1970      1980      1990      2000      2010      2020    

            1930      1940      1950      1960      1970      1980 
pF1KA1 SPQQQLPPSSQAEGMGQVPRTHRLITLADHICQIITQDFARNQVSSQTPQQPPTSTFQNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPQQQLPPSSQAEGMGQVPRTHRLITLADHICQIITQDFARNQVSSQTPQQPPTSTFQNS
         2030      2040      2050      2060      2070      2080    

            1990      2000      2010      2020      2030      2040 
pF1KA1 PSALVSTPVRTKTSNRYSPESQAQSVHHQRPGSRVSPENLVDKSRGSRPGKSPERSHVSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PSALVSTPVRTKTSNRYSPESQAQSVHHQRPGSRVSPENLVDKSRGSRPGKSPERSHVSS
         2090      2100      2110      2120      2130      2140    

            2050      2060      2070      2080      2090      2100 
pF1KA1 EPYEPISPPQVPVVHEKQDSLLLLSQRGAEPAEQRNDARSPGSISYLPSFFTKLENTSPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EPYEPISPPQVPVVHEKQDSLLLLSQRGAEPAEQRNDARSPGSISYLPSFFTKLENTSPM
         2150      2160      2170      2180      2190      2200    

            2110      2120      2130      2140      2150      2160 
pF1KA1 VKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAAQPGTEIFNLPAVTTSGSVSSRGHSFADPASNLGLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAAQPGTEIFNLPAVTTSGSVSSRGHSFADPASNLGLE
         2210      2220      2230      2240      2250      2260    

            2170      2180      2190      2200      2210      2220 
pF1KA1 DIIRKALMGSFDDKVEDHGVVMSQPMGVVPGTANTSVVTSGETRREEGDPSPHSGGVCKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DIIRKALMGSFDDKVEDHGVVMSQPMGVVPGTANTSVVTSGETRREEGDPSPHSGGVCKP
         2270      2280      2290      2300      2310      2320    

            2230      2240      2250      2260      2270      2280 
pF1KA1 KLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHSEGDYHRQTPGWAWEDRPSSTGSTQFP
       :::::::::::::::::::::::::::::                               
CCDS11 KLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHSEGDYHRQTPGWAWEDRPSSTGSTQFP
         2330      2340      2350      2360      2370      2380    

>--
 initn: 616 init1: 616 opt: 616  Z-score: 341.9  bits: 77.3 E(32554): 1e-12
Smith-Waterman score: 616; 100.0% identity (100.0% similar) in 87 aa overlap (2251-2337:2354-2440)

             2230      2240      2250      2260      2270      2280
pF1KA1 PKLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHSEGDYHRQTPGWAWEDRPSSTGSTQF
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PKLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHSEGDYHRQTPGWAWEDRPSSTGSTQF
          2330      2340      2350      2360      2370      2380   

             2290      2300      2310      2320      2330       
pF1KA1 PYNPLTMRMLSSTPPTPIACAPSAVNQAAPHQQNRIWEREPAPLLSAQYETLSDSDD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PYNPLTMRMLSSTPPTPIACAPSAVNQAAPHQQNRIWEREPAPLLSAQYETLSDSDD
          2390      2400      2410      2420      2430      2440

>>CCDS54094.1 NCOR1 gene_id:9611|Hs108|chr17              (914 aa)
 initn: 5821 init1: 5821 opt: 5821  Z-score: 3174.1  bits: 599.9 E(32554): 1.8e-170
Smith-Waterman score: 5846; 89.3% identity (89.3% similar) in 1021 aa overlap (1-1021:1-912)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::                        
CCDS54 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQ------------------------
               10        20        30                              

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 QQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSHFQ
                                                                   
CCDS54 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 RVSAAVLPLVHPLPEGLRASADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPSKLSKEE
                                :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 -------------------------DPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPSKLSKEE
                                  40        50        60        70 

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 LIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIY
              80        90       100       110       120       130 

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 DENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHAR
             140       150       160       170       180       190 

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 KQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQ
             200       210       220       230       240       250 

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 RVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINM
             260       270       280       290       300       310 

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 NGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDCVLYYYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDCVLYYYL
             320       330       340       350       360       370 

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 TKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDE
             380       390       400       410       420       430 

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 KEDSKENTKEKDKIDGTAEETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KEDSKENTKEKDKIDGTAEETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAA
             440       450       460       470       480       490 

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 AAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEA
             500       510       520       530       540       550 

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 QCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSAQEDEDIEASNEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSAQEDEDIEASNEE
             560       570       580       590       600       610 

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 ENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATSRGNTEPAVELEPTTETAPSTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATSRGNTEPAVELEPTTETAPSTS
             620       630       640       650       660       670 

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 PSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQEHSAEEGSVCDPPPATKADSVDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQEHSAEEGSVCDPPPATKADSVDV
             680       690       700       710       720       730 

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 EVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVEPRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVEPRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCS
             740       750       760       770       780       790 

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 ADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPMVSCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPMVSCT
             800       810       820       830       840       850 

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 PCNIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTSPCGTSKSPNREW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PCNIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTSPCGTSKSPNREW
             860       870       880       890       900       910 

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 EVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEKPSFIMGGSISQGTPGT
       :                                                           
CCDS54 EGR                                                         
                                                                   

>>CCDS41857.2 NCOR2 gene_id:9612|Hs108|chr12              (2458 aa)
 initn: 3208 init1: 1955 opt: 3013  Z-score: 1643.3  bits: 318.1 E(32554): 3.3e-85
Smith-Waterman score: 4928; 42.0% identity (62.9% similar) in 2435 aa overlap (1-2170:1-2339)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQ
       ::.:  :  :   .::  ::::::..:    .: . . .. .:.  :   . ::.:   .
CCDS41 MSGSTQPVAQTWRATEP-RYPPHSLSYPVQIARTHTDVGLLEYQ--HHSRDYASHLSPGS
               10         20        30        40          50       

               70        80          90       100       110        
pF1KA1 QQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQER--RTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSH
         :  ::::::::::.::..: ::   :   . . :  .  . . .:::::::: . :  
CCDS41 IIQPQRRRPSLLSEFQPGNERSQELHLRPESHSYLPELGKSEMEFIESKRPRLELLPD--
        60        70        80        90       100       110       

      120       130           140       150       160       170    
pF1KA1 FQRVSAAVLPLVHPLP---EGLRA-SADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPS
                ::..: :    :  : : :  :: .. :: : : :: :      . .  : 
CCDS41 ---------PLLRPSPLLATGQPAGSEDLTKDRSLTGKLE-PVSPPSPPHTDPELELVPP
                  120       130       140        150       160     

          180       190       200       210       220       230    
pF1KA1 KLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRS
       .::::::::.::::::::. ::::: :::::::::::::::::::::::::::.:.::::
CCDS41 RLSKEELIQNMDRVDREITMVEQQISKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPIESKHRS
         170       180       190       200       210       220     

          240       250       260       270       280       290    
pF1KA1 IVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFK
       .::::::::::::: ::.:.:::::.::::::::::::. :::::: ::.:::::::.::
CCDS41 LVQIIYDENRKKAEAAHRILEGLGPQVELPLYNQPSDTRQYHENIKINQAMRKKLILYFK
         230       240       250       260       270       280     

          300       310       320       330       340       350    
pF1KA1 RRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQRE
       :::::::: :::.:::::::::::::::.::::::::.:::::.::::::::::::::::
CCDS41 RRNHARKQWEQKFCQRYDQLMEAWEKKVERIENNPRRRAKESKVREYYEKQFPEIRKQRE
         290       300       310       320       330       340     

          360       370       380       390       400       410    
pF1KA1 QQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRR
        :::.:::::::.::: . ::::::.:::::::::::: :::::::.:::::..::.:.:
CCDS41 LQERMQRVGQRGSGLSMSAARSEHEVSEIIDGLSEQENLEKQMRQLAVIPPMLYDADQQR
         350       360       370       380       390       400     

          420       430       440       450       460       470    
pF1KA1 VKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDC
       .::::::::: :::::::::: ::.:...::: :..::.:::::::::::.::::.: .:
CCDS41 IKFINMNGLMADPMKVYKDRQVMNMWSEQEKETFREKFMQHPKNFGLIASFLERKTVAEC
         410       420       430       440       450       460     

          480       490       500       510       520         530  
pF1KA1 VLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEED--KAEKTEKKEEEK
       ::::::::::::::.::::.: .:::..::  . .:... .....   .. . :: :.::
CCDS41 VLYYYLTKKNENYKSLVRRSY-RRRGKSQQQQQQQQQQQQQQQQQPMPRSSQEEKDEKEK
         470       480        490       500       510       520    

            540       550           560       570       580        
pF1KA1 KDEEEKDEKEDSKENTKE---KDKIDGTA-EETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRS
       . : ::.:..   :: ::   :.: : :. :...:.: .. .::::::::::::::::::
CCDS41 EKEAEKEEEKPEVENDKEDLLKEKTDDTSGEDNDEKEAVASKGRKTANSQGRRKGRITRS
          530       540       550       560       570       580    

      590       600       610       620       630       640        
pF1KA1 MTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWA
       :.:::          .::   :     :  : :  :.:::::::::.:::::.::::::.
CCDS41 MANEAN---------SEEAITP-QQSAELASMELNESSRWTEEEMETAKKGLLEHGRNWS
          590                 600       610       620       630    

      650       660       670       680       690       700        
pF1KA1 AIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSA
       :::.:::.:. .::::::::::.:.:::..::::: :  ..   .:  ..  ..::  .:
CCDS41 AIARMVGSKTVSQCKNFYFNYKKRQNLDEILQQHKLKMEKERNARRKKKKAPAAASEEAA
          640       650       660       670       680       690    

          710           720        730       740       750         
pF1KA1 ----QEDEDIEAS----NEEENPEDSEGA-ENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATS
            :::..:::    ::::  :..:.. .::::::: :::    :   ....:.  ..
CCDS41 FPPVVEDEEMEASGVSGNEEEMVEEAEATVNNSSDTESIPSPHTEAAKDTGQNGPKPPAT
          700       710       720       730       740       750    

     760        770       780       790       800       810        
pF1KA1 RG-NTEPAVELEPTTETAPSTSPSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQE
        : .  :     :  :  :  .:.  .:... :    .   .  : ::        ...:
CCDS41 LGADGPPPGPPTPPPEDIP--APTEPTPASE-ATGAPTPPPAPPSPSAPPPVVPKEEKEE
          760       770         780        790       800       810 

      820            830         840       850       860       870 
pF1KA1 HSA-----EEGSVCDPPPATK--ADSVDVEVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVE-
       ..:     :::    :: : .  .:.  .:  :  . . ..:   .: .: . :   .: 
CCDS41 ETAAAPPVEEGEEQKPPAAEELAVDTGKAEEPVKSECTEEAEEGPAKGKDAEAAEATAEG
             820       830       840       850       860       870 

                 880       890       900        910       920      
pF1KA1 ---PRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCSADEDVDGEP-ERQRMFPMDSKPSLLNP
           . ..   ..  .:.     .:.::::::::::  ..:  ...:.  .. .::::.:
CCDS41 ALKAEKKEGGSGRATTAKSSGAPQDSDSSATCSADEVDEAEGGDKNRL--LSPRPSLLTP
             880       890       900       910         920         

        930        940       950           960              970    
pF1KA1 TGSILVS-SPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPM----VSCTPCN-------IPIGTPVSGYA
       ::.  .. :: ::  ::: ::..:::.:::.    :   : .        : . :     
CCDS41 TGDPRANASPQKP--LDLKQLKQRAAAIPPIQVTKVHEPPREDAAPTKPAPPAPPPPQNL
     930       940         950       960       970       980       

          980       990      1000                     1010         
pF1KA1 LYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSST---------------SPCGTS--KSPN
         .     .  :.   ..:.     : : .. .                :: ::    : 
CCDS41 QPESDAPQQPGSSPRGKSRSPAPPADKEAEKPVFFPAFAAEAQKLPGDPPCWTSGLPFPV
       990      1000      1010      1020      1030      1040       

      1020          1030      1040           1050      1060        
pF1KA1 REWEVLQPAPH----QVITNLPEGVRLP-----TTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEK-PSF
          ::.. .::    ....  : :  ::     :.::. : :: : .    ..: : :: 
CCDS41 PPREVIKASPHAPDPSAFSYAPPGHPLPLGLHDTARPVLPRPPTISNPPPLISSAKHPSV
      1050      1060      1070      1080      1090      1100       

        1070      1080      1090      1100      1110      1120     
pF1KA1 I--MGGSISQGTPGTYLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKSATLPYIKQEE
       .  . :.::::     .. . .. :....  : :: ...:::  ..  : : .  .:::.
CCDS41 LERQIGAISQG-----MSVQLHVPYSEHAKAP-VGPVTMGLPLPMDPKKLAPFSGVKQEQ
      1110           1120      1130       1140      1150      1160 

        1130      1140       1150       1160      1170      1180   
pF1KA1 FSPRSQNSQPEGLLV-RAQHEGVVRGTA-GAIQEGSITRGTPTSKISVESIPSLRGSITQ
       .:::.: . ::.: :  ::. .:.:::: :..  ::::.: :....  .:  . :::::.
CCDS41 LSPRGQAGPPESLGVPTAQEASVLRGTALGSVPGGSITKGIPSTRVPSDSAITYRGSITH
            1170      1180      1190      1200      1210      1220 

          1190      1200      1210        1220      1230      1240 
pF1KA1 GTPALPQTGIPTEALVKGSISRMPIEDSSP--EKGREEAASKGHVIYEGKSGHILSYDN-
       ::::        ..: ::.:.:.  :::    ..:::..  :::::::::.::.:::.. 
CCDS41 GTPA--------DVLYKGTITRIIGEDSPSRLDRGREDSLPKGHVIYEGKKGHVLSYEGG
                    1230      1240      1250      1260      1270   

                1250        1260      1270      1280      1290     
pF1KA1 ---IKNAREGTRSPR-TAHEISL-KRSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPLEGLICRALP-
           . ..:  ::     :: .  ::.:. .:: . ...:      :: .:::. ::.: 
CCDS41 MSVTQCSKEDGRSSSGPPHETAAPKRTYDMMEGRVGRAIS------SASIEGLMGRAIPP
          1280      1290      1300      1310            1320       

          1300      1310      1320      1330            1340       
pF1KA1 -RGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRATTESFEDGLKYP-KQIKRES-----PPIRAFEGA
        : :::  :::.  . ::: :: ::. .:. :: :.   : .:::.     :: : .  :
CCDS41 ERHSPHH-LKEQHHIRGSITQGIPRSYVEAQEDYLRREAKLLKREGTPPPPPPSRDLTEA
      1330       1340      1350      1360      1370      1380      

             1350        1360      1370      1380      1390        
pF1KA1 IT-------KGKP-YDG-ITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQESRKTPEVVQSTRPIIEGSI
                : :: ..: ..:.:: :::::::::...     :.:::.  . ::. ::::
CCDS41 YKTQALGPLKLKPAHEGLVATVKEAGRSIHEIPREEL-----RHTPELPLAPRPLKEGSI
       1390      1400      1410      1420           1430      1440 

     1400      1410       1420      1430      1440      1450       
pF1KA1 SQGTPIKFDNNSGQS-AIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVPENIKVVERGKYEDVKAG
       .::::.:.:.... . . ::.:.::: .:..    . ::... .  ...::. ::     
CCDS41 TQGTPLKYDTGASTTGSKKHDVRSLIGSPGRTFPPVHPLDVMADA-RALERACYE-----
            1450      1460      1470      1480       1490          

      1460      1470         1480      1490      1500      1510    
pF1KA1 ETVRSRHTSVVSSGPSVLRST---LHEAPKAQLSPGIYDDTSARRTPVSYQNTMSRGSPM
       :...::  .. ::: :. :..   . :  : . ::  :.: .:   :  . . . ::::.
CCDS41 ESLKSRPGTASSSGGSIARGAPVIVPELGKPRQSPLTYEDHGA---P--FAGHLPRGSPV
        1500      1510      1520      1530           1540      1550

              1520      1530      1540      1550      1560         
pF1KA1 MNRT-----SDVTISSNKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVSH--SPFDPHH
        .:      .. ..::.:.. ..:: : :: .  . : .: ::   :   :  ::..   
CCDS41 TTREPTPRLQEGSLSSSKAS-QDRKLTSTPREIAKSP-HSTVPEHHP---HPISPYEHLL
             1560      1570       1580       1590         1600     

      1570      1580       1590      1600      1610      1620      
pF1KA1 RGSTAGEVYRSHLPTHLDP-AMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQYQLY------
       :: .. ..::::.:  .:: ..:    :: ::::: . :.:.:.: ::  :  :      
CCDS41 RGVSGVDLYRSHIPLAFDPTSIPRGIPLD-AAAAYYLPRHLAPNPTYPHLYPPYLIRGYP
        1610      1620      1630       1640      1650      1660    

                1630      1640            1650      1660       1670
pF1KA1 ---AMENTRQTILNDYITSQQMQVNL------RPDVARGLSPREQPLGLPYPA-TRGIID
          :.:: ::::.:::::::::. :       : :. :::::::. :.: : :  :::::
CCDS41 DTAALEN-RQTIINDYITSQQMHHNAATAMAQRADMLRGLSPRESSLALNYAAGPRGIID
         1670       1680      1690      1700      1710      1720   

              1680      1690      1700      1710      1720         
pF1KA1 LTNMPPT-ILVPHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSPGHPTHLA---AAA
       :...:   .:::   :: .  :::..:.: .   :  : ..:. .::: ::::.   ...
CCDS41 LSQVPHLPVLVPPTPGTPATAMDRLAYLPTAPQPFSSR-HSSSPLSPGGPTHLTKPTTTS
          1730      1740      1750      1760       1770      1780  

       1730      1740         1750          1760                   
pF1KA1 SAEREREREREKERERER---IAAASSDL----YLRPGSEQPG-----------RPGSHG
       :.::::.:.::..:.:::   : .... .      :::.:: .           ::.::.
CCDS41 SSERERDRDRERDRDREREKSILTSTTTVEHAPIWRPGTEQSSGSSGGGGGSSSRPASHS
           1790      1800      1810      1820      1830      1840  

     1770       1780      1790      1800        1810               
pF1KA1 YVRSPSP-SVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVITPLDPTAQ--LR-------IMPL----
       .... :: : :::.. :::::::...:.  ..:: ..:..   ::       . :     
CCDS41 HAHQHSPISPRTQDA-LQQRPSVLHNTGMKGIITAVEPSTPTVLRSTSTSSPVRPAATFP
           1850       1860      1870      1880      1890      1900 

                    1820                  1830      1840      1850 
pF1KA1 -----PAGG------PSISQG--LPAS----------RYNTAADALAALVDAAASAPQMD
            : ::      :.. .   ::            : .:.   ::     ..  :  .
CCDS41 PATHCPLGGTLDGVYPTLMEPVLLPKEAPRVARPERPRADTGHAFLAKPPARSGLEPASS
            1910      1920      1930      1940      1950      1960 

                   1860          1870      1880                    
pF1KA1 VSKTKE-------ISSHRY--ETPSD--AIEVISPASSPAPP-------QEKLQT-----
        :: .:       .:.:    .::.   : .  :: . ::::       .:: :.     
CCDS41 PSKGSEPRPLVPPVSGHATIARTPAKNLAPHHASP-DPPAPPASASDPHREKTQSKPFSI
            1970      1980      1990       2000      2010      2020

                   1890      1900        1910                 1920 
pF1KA1 --------------YQPEVVKANQAENDPTRQYEG--PLH-------HY----RPQQESP
                     :.:: :.  .  ..:.  ..   : :       :     ::.: .:
CCDS41 QELELRSLGYHGSSYSPEGVEPVSPVSSPSLTHDKGLPKHLEELDKSHLEGELRPKQPGP
             2030      2040      2050      2060      2070      2080

                     1930         1940         1950      1960      
pF1KA1 ----SPQQQLP-----PSSQAEG---MGQVP--RTH-RLITLADHICQIITQDFARNQVS
           .   .::     : ::  .   .  .:  . : :..:::.:: ..::::..:.. .
CCDS41 VKLGGEAAHLPHLRPLPESQPSSSPLLQTAPGVKGHQRVVTLAQHISEVITQDYTRHHPQ
             2090      2100      2110      2120      2130      2140

       1970       1980      1990         2000      2010      2020  
pF1KA1 SQTPQQP-PTSTFQNSPSALVSTPV---RTKTSNRYSPESQAQSVHHQRPGSRVSPENLV
       . .   : :  .:   :.:  : ::   :   :. : :  .     :  : .: ::.   
CCDS41 QLSAPLPAPLYSF---PGA--SCPVLDLRRPPSDLYLPPPD-----HGAP-ARGSPH---
             2150           2160      2170           2180          

           2030         2040      2050        2060      2070       
pF1KA1 DKSRGSRPGKSPERSHV---SSEPYEPISPPQ--VPVVHEKQDSLLLLSQRGAEPAEQRN
         :.:.. .  :... :   . .  ::.:::.  .   : ..    :: . : .   .: 
CCDS41 --SEGGKRSPEPNKTSVLGGGEDGIEPVSPPEGMTEPGHSRSAVYPLLYRDGEQTEPSRM
         2190      2200      2210      2220      2230      2240    

      2080      2090       2100      2110      2120      2130      
pF1KA1 DARSPGSISYLPSFFTKL-ENTSPMVKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAAQPGTEIFNLP
        ..:::. :  :.::.:: :..: ::::::::: .:::. . .. ..  .::::::::.:
CCDS41 GSKSPGNTSQPPAFFSKLTESNSAMVKSKKQEINKKLNTHNRNEPEYNISQPGTEIFNMP
         2250      2260      2270      2280      2290      2300    

       2140      2150       2160      2170      2180      2190     
pF1KA1 AVTTSGSVSSRGHSFADPAS-NLGLEDIIRKALMGSFDDKVEDHGVVMSQPMGVVPGTAN
       :.: .: .. :...  . :: :.::: ::::::::                         
CCDS41 AITGTGLMTYRSQAVQEHASTNMGLEAIIRKALMGGGGKAKVSGRPSSRKAKSPAPGLAS
         2310      2320      2330      2340      2350      2360    

        2200      2210      2220      2230      2240      2250     
pF1KA1 TSVVTSGETRREEGDPSPHSGGVCKPKLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHS
                                                                   
CCDS41 GDRPPSVSSVHSEGDCNRRTPLTNRVWEDRPSSAGSTPFPYNPLIMRLQAGVMASPPPPG
         2370      2380      2390      2400      2410      2420    

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               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQ
       ::.:  :  :   .::  ::::::..:    .: . . .. .:.  :   . ::.:   .
CCDS55 MSGSTQPVAQTWRATEP-RYPPHSLSYPVQIARTHTDVGLLEYQ--HHSRDYASHLSPGS
               10         20        30        40          50       

               70        80          90       100       110        
pF1KA1 QQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQER--RTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSH
         :  ::::::::::.::..: ::   :   . . :  .  . . .:::::::: . :  
CCDS55 IIQPQRRRPSLLSEFQPGNERSQELHLRPESHSYLPELGKSEMEFIESKRPRLELLPD--
        60        70        80        90       100       110       

      120       130           140       150       160       170    
pF1KA1 FQRVSAAVLPLVHPLP---EGLRA-SADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPS
                ::..: :    :  : : :  :: .. :: : : :: :      . .  : 
CCDS55 ---------PLLRPSPLLATGQPAGSEDLTKDRSLTGKLE-PVSPPSPPHTDPELELVPP
                  120       130       140        150       160     

          180       190       200       210       220       230    
pF1KA1 KLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRS
       .::::::::.::::::::. ::::: :::::::::::::::::::::::::::.:.::::
CCDS55 RLSKEELIQNMDRVDREITMVEQQISKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPIESKHRS
         170       180       190       200       210       220     

          240       250       260       270       280       290    
pF1KA1 IVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFK
       .::::::::::::: ::.:.:::::.::::::::::::. :::::: ::.:::::::.::
CCDS55 LVQIIYDENRKKAEAAHRILEGLGPQVELPLYNQPSDTRQYHENIKINQAMRKKLILYFK
         230       240       250       260       270       280     

          300       310       320       330       340       350    
pF1KA1 RRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQRE
       :::::::: :::.:::::::::::::::.::::::::.:::::.::::::::::::::::
CCDS55 RRNHARKQWEQKFCQRYDQLMEAWEKKVERIENNPRRRAKESKVREYYEKQFPEIRKQRE
         290       300       310       320       330       340     

          360       370       380       390       400       410    
pF1KA1 QQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRR
        :::.:::::::.::: . ::::::.:::::::::::: :::::::.:::::..::.:.:
CCDS55 LQERMQRVGQRGSGLSMSAARSEHEVSEIIDGLSEQENLEKQMRQLAVIPPMLYDADQQR
         350       360       370       380       390       400     

          420       430       440       450       460       470    
pF1KA1 VKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDC
       .::::::::: :::::::::: ::.:...::: :..::.:::::::::::.::::.: .:
CCDS55 IKFINMNGLMADPMKVYKDRQVMNMWSEQEKETFREKFMQHPKNFGLIASFLERKTVAEC
         410       420       430       440       450       460     

          480       490       500       510       520         530  
pF1KA1 VLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEED--KAEKTEKKEEEK
       ::::::::::::::.::::.: .:::..::  . .:... .....   .. . :: :.::
CCDS55 VLYYYLTKKNENYKSLVRRSY-RRRGKSQQQQQQQQQQQQQQQQQPMPRSSQEEKDEKEK
         470       480        490       500       510       520    

            540       550           560       570       580        
pF1KA1 KDEEEKDEKEDSKENTKE---KDKIDGTA-EETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRS
       . : ::.:..   :: ::   :.: : :. :...:.: .. .::::::::::::::::::
CCDS55 EKEAEKEEEKPEVENDKEDLLKEKTDDTSGEDNDEKEAVASKGRKTANSQGRRKGRITRS
          530       540       550       560       570       580    

      590       600       610       620       630       640        
pF1KA1 MTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWA
       :.:::          .::   :     :  : :  :.:::::::::.:::::.::::::.
CCDS55 MANEAN---------SEEAITP-QQSAELASMELNESSRWTEEEMETAKKGLLEHGRNWS
          590                 600       610       620       630    

      650       660       670       680       690       700        
pF1KA1 AIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSA
       :::.:::.:. .::::::::::.:.:::..::::: :  ..   .:  ..  ..::  .:
CCDS55 AIARMVGSKTVSQCKNFYFNYKKRQNLDEILQQHKLKMEKERNARRKKKKAPAAASEEAA
          640       650       660       670       680       690    

          710           720        730       740       750         
pF1KA1 ----QEDEDIEAS----NEEENPEDSEGA-ENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATS
            :::..:::    ::::  :..:.. .::::::: :::    :   ....:.  ..
CCDS55 FPPVVEDEEMEASGVSGNEEEMVEEAEATVNNSSDTESIPSPHTEAAKDTGQNGPKPPAT
          700       710       720       730       740       750    

     760        770       780       790       800       810        
pF1KA1 RG-NTEPAVELEPTTETAPSTSPSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQE
        : .  :     :  :  :.  :.  .:... :    .   .  : ::        ...:
CCDS55 LGADGPPPGPPTPPPEDIPA--PTEPTPASE-ATGAPTPPPAPPSPSAPPPVVPKEEKEE
          760       770         780        790       800       810 

      820            830         840       850       860       870 
pF1KA1 HSA-----EEGSVCDPPPATK--ADSVDVEVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVE-
       ..:     :::    :: : .  .:.  .:  :  . . ..:   .: .: . :   .: 
CCDS55 ETAAAPPVEEGEEQKPPAAEELAVDTGKAEEPVKSECTEEAEEGPAKGKDAEAAEATAEG
             820       830       840       850       860       870 

                 880       890       900        910       920      
pF1KA1 ---PRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCSADEDVDGEP-ERQRMFPMDSKPSLLNP
           . ..   ..  .:.     .:.::::::::::  ..:  ...:.  .. .::::.:
CCDS55 ALKAEKKEGGSGRATTAKSSGAPQDSDSSATCSADEVDEAEGGDKNRL--LSPRPSLLTP
             880       890       900       910         920         

        930        940       950           960              970    
pF1KA1 TGSILVS-SPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPM----VSCTPCN-------IPIGTPVSGYA
       ::.  .. :: :  :::: ::..:::.:::.    :   : .        : . :     
CCDS55 TGDPRANASPQK--PLDLKQLKQRAAAIPPIQVTKVHEPPREDAAPTKPAPPAPPPPQNL
     930       940         950       960       970       980       

          980       990      1000                     1010         
pF1KA1 LYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSST---------------SPCGTS--KSPN
         .     .  :.   ..:.     : : .. .                :: ::    : 
CCDS55 QPESDAPQQPGSSPRGKSRSPAPPADKEAEKPVFFPAFAAEAQKLPGDPPCWTSGLPFPV
       990      1000      1010      1020      1030      1040       

      1020          1030      1040           1050      1060        
pF1KA1 REWEVLQPAPH----QVITNLPEGVRLP-----TTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEK-PSF
          ::.. .::    ....  : :  ::     :.::. : :: : .    ..: : :: 
CCDS55 PPREVIKASPHAPDPSAFSYAPPGHPLPLGLHDTARPVLPRPPTISNPPPLISSAKHPSV
      1050      1060      1070      1080      1090      1100       

        1070      1080      1090      1100      1110      1120     
pF1KA1 I--MGGSISQGTPGTYLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKSATLPYIKQEE
       .  . :.::::     .. . .. :....  : :: ...:::  ..  : : .  .:::.
CCDS55 LERQIGAISQG-----MSVQLHVPYSEHAKAP-VGPVTMGLPLPMDPKKLAPFSGVKQEQ
      1110           1120      1130       1140      1150      1160 

        1130      1140       1150       1160      1170      1180   
pF1KA1 FSPRSQNSQPEGLLV-RAQHEGVVRGTA-GAIQEGSITRGTPTSKISVESIPSLRGSITQ
       .:::.: . ::.: :  ::. .:.:::: :..  ::::.: :....  .:  . :::::.
CCDS55 LSPRGQAGPPESLGVPTAQEASVLRGTALGSVPGGSITKGIPSTRVPSDSAITYRGSITH
            1170      1180      1190      1200      1210      1220 

          1190      1200      1210        1220      1230      1240 
pF1KA1 GTPALPQTGIPTEALVKGSISRMPIEDSSP--EKGREEAASKGHVIYEGKSGHILSYDN-
       ::::        ..: ::.:.:.  :::    ..:::..  :::::::::.::.:::.. 
CCDS55 GTPA--------DVLYKGTITRIIGEDSPSRLDRGREDSLPKGHVIYEGKKGHVLSYEGG
                    1230      1240      1250      1260      1270   

                1250        1260      1270      1280      1290     
pF1KA1 ---IKNAREGTRSPR-TAHEISL-KRSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPLEGLICRALP-
           . ..:  ::     :: .  ::.:. .:: . ...:      :: .:::. ::.: 
CCDS55 MSVTQCSKEDGRSSSGPPHETAAPKRTYDMMEGRVGRAIS------SASIEGLMGRAIPP
          1280      1290      1300      1310            1320       

          1300      1310      1320      1330            1340       
pF1KA1 -RGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRATTESFEDGLKYP-KQIKRES-----PPIRAFEGA
        : :::  :::.  . ::: :: ::. .:. :: :.   : .:::.     :: : .  :
CCDS55 ERHSPHH-LKEQHHIRGSITQGIPRSYVEAQEDYLRREAKLLKREGTPPPPPPSRDLTEA
      1330       1340      1350      1360      1370      1380      

             1350        1360      1370      1380      1390        
pF1KA1 IT-------KGKP-YDG-ITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQESRKTPEVVQSTRPIIEGSI
                : :: ..: ..:.:: :::::::::...     :.:::.  . ::. ::::
CCDS55 YKTQALGPLKLKPAHEGLVATVKEAGRSIHEIPREEL-----RHTPELPLAPRPLKEGSI
       1390      1400      1410      1420           1430      1440 

     1400      1410       1420      1430      1440      1450       
pF1KA1 SQGTPIKFDNNSGQS-AIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVPENIKVVERGKYEDVKAG
       .::::.:.:.... . . ::.:.::: .:..    . ::... .  ...::. ::     
CCDS55 TQGTPLKYDTGASTTGSKKHDVRSLIGSPGRTFPPVHPLDVMADA-RALERACYE-----
            1450      1460      1470      1480       1490          

      1460      1470         1480      1490      1500      1510    
pF1KA1 ETVRSRHTSVVSSGPSVLRST---LHEAPKAQLSPGIYDDTSARRTPVSYQNTMSRGSPM
       :...::  .. ::: :. :..   . :  : . ::  :.: .:   :  . . . ::::.
CCDS55 ESLKSRPGTASSSGGSIARGAPVIVPELGKPRQSPLTYEDHGA---P--FAGHLPRGSPV
        1500      1510      1520      1530           1540      1550

              1520      1530      1540      1550      1560         
pF1KA1 MNRT-----SDVTISSNKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVSH--SPFDPHH
        .:      .. ..::.:.. ..:: : :: .  . : .: ::   :   :  ::..   
CCDS55 TTREPTPRLQEGSLSSSKAS-QDRKLTSTPREIAKSP-HSTVPEHHP---HPISPYEHLL
             1560      1570       1580       1590         1600     

      1570      1580       1590      1600      1610      1620      
pF1KA1 RGSTAGEVYRSHLPTHLDP-AMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQYQLY------
       :: .. ..::::.:  .:: ..:    :: ::::: . :.:.:.: ::  :  :      
CCDS55 RGVSGVDLYRSHIPLAFDPTSIPRGIPLD-AAAAYYLPRHLAPNPTYPHLYPPYLIRGYP
        1610      1620      1630       1640      1650      1660    

                1630      1640            1650      1660       1670
pF1KA1 ---AMENTRQTILNDYITSQQMQVNL------RPDVARGLSPREQPLGLPYPA-TRGIID
          :.:: ::::.:::::::::. :       : :. :::::::. :.: : :  :::::
CCDS55 DTAALEN-RQTIINDYITSQQMHHNAATAMAQRADMLRGLSPRESSLALNYAAGPRGIID
         1670       1680      1690      1700      1710      1720   

              1680      1690      1700      1710      1720         
pF1KA1 LTNMPPT-ILVPHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSPGHPTHLA---AAA
       :...:   .:::   :: .  :::..:.: .   :  : ..:. .::: ::::.   ...
CCDS55 LSQVPHLPVLVPPTPGTPATAMDRLAYLPTAPQPFSSR-HSSSPLSPGGPTHLTKPTTTS
          1730      1740      1750      1760       1770      1780  

       1730      1740         1750          1760                   
pF1KA1 SAEREREREREKERERER---IAAASSDL----YLRPGSEQPG-----------RPGSHG
       :.::::.:.::..:.:::   : .... .      :::.:: .           ::.::.
CCDS55 SSERERDRDRERDRDREREKSILTSTTTVEHAPIWRPGTEQSSGSSGGGGGSSSRPASHS
           1790      1800      1810      1820      1830      1840  

     1770       1780      1790      1800        1810               
pF1KA1 YVRSPSP-SVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVITPLDPTAQ--LR-------IMPL----
       .... :: : :::.. :::::::...:.  ..:: ..:..   ::       . :     
CCDS55 HAHQHSPISPRTQDA-LQQRPSVLHNTGMKGIITAVEPSTPTVLRSTSTSSPVRPAATFP
           1850       1860      1870      1880      1890      1900 

                    1820                  1830      1840      1850 
pF1KA1 -----PAGG------PSISQG--LPAS----------RYNTAADALAALVDAAASAPQMD
            : ::      :.. .   ::            : .:.   ::     ..  :  .
CCDS55 PATHCPLGGTLDGVYPTLMEPVLLPKEAPRVARPERPRADTGHAFLAKPPARSGLEPASS
            1910      1920      1930      1940      1950      1960 

                   1860          1870      1880                    
pF1KA1 VSKTKE-------ISSHRY--ETPSD--AIEVISPASSPAPP-------QEKLQT-----
        :: .:       .:.:    .::.   : .  :: . ::::       .:: :.     
CCDS55 PSKGSEPRPLVPPVSGHATIARTPAKNLAPHHASP-DPPAPPASASDPHREKTQSKPFSI
            1970      1980      1990       2000      2010      2020

                   1890      1900        1910                 1920 
pF1KA1 --------------YQPEVVKANQAENDPTRQYEG--PLH-------HY----RPQQESP
                     :.:: :.  .  ..:.  ..   : :       :     ::.: .:
CCDS55 QELELRSLGYHGSSYSPEGVEPVSPVSSPSLTHDKGLPKHLEELDKSHLEGELRPKQPGP
             2030      2040      2050      2060      2070      2080

                     1930         1940         1950      1960      
pF1KA1 ----SPQQQLP-----PSSQAEG---MGQVP--RTH-RLITLADHICQIITQDFARNQVS
           .   .::     : ::  .   .  .:  . : :..:::.:: ..::::..:.. .
CCDS55 VKLGGEAAHLPHLRPLPESQPSSSPLLQTAPGVKGHQRVVTLAQHISEVITQDYTRHHPQ
             2090      2100      2110      2120      2130      2140

       1970       1980      1990         2000      2010      2020  
pF1KA1 SQTPQQP-PTSTFQNSPSALVSTPV---RTKTSNRYSPESQAQSVHHQRPGSRVSPENLV
       . .   : :  .:   :.:  : ::   :   :. : :  .     :  : .: ::.   
CCDS55 QLSAPLPAPLYSF---PGA--SCPVLDLRRPPSDLYLPPPD-----HGAP-ARGSPH---
             2150           2160      2170           2180          

           2030         2040      2050        2060      2070       
pF1KA1 DKSRGSRPGKSPERSHV---SSEPYEPISPPQ--VPVVHEKQDSLLLLSQRGAEPAEQRN
         :.:.. .  :... :   . .  ::.:::.  .   : ..    :: . : .   .: 
CCDS55 --SEGGKRSPEPNKTSVLGGGEDGIEPVSPPEGMTEPGHSRSAVYPLLYRDGEQTEPSRM
         2190      2200      2210      2220      2230      2240    

      2080      2090       2100      2110      2120      2130      
pF1KA1 DARSPGSISYLPSFFTKL-ENTSPMVKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAAQPGTEIFNLP
        ..:::. :  :.::.:: :..: ::::::::: .:::. . .. ..  .::::::::.:
CCDS55 GSKSPGNTSQPPAFFSKLTESNSAMVKSKKQEINKKLNTHNRNEPEYNISQPGTEIFNMP
         2250      2260      2270      2280      2290      2300    

       2140      2150       2160      2170      2180      2190     
pF1KA1 AVTTSGSVSSRGHSFADPAS-NLGLEDIIRKALMGSFDDKVEDHGVVMSQPMGVVPGTAN
       :.: .: .. :...  . :: :.::: ::::::::..:                      
CCDS55 AITGTGLMTYRSQAVQEHASTNMGLEAIIRKALMGKYDQWEESPPLSANAFNPLNASASL
         2310      2320      2330      2340      2350      2360    

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pF1KA1 TSVVTSGETRREEGDPSPHSGGVCKPKLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHS
                                                                   
CCDS55 PAAMPITAADGRSDHTLTSPGGGGKAKVSGRPSSRKAKSPAPGLASGDRPPSVSSVHSEG
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>>CCDS41858.2 NCOR2 gene_id:9612|Hs108|chr12              (2514 aa)
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pF1KA1 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQ
       ::.:  :  :   .::  ::::::..:    .: . . .. .:.  :   . ::.:   .
CCDS41 MSGSTQPVAQTWRATEP-RYPPHSLSYPVQIARTHTDVGLLEYQ--HHSRDYASHLSPGS
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pF1KA1 QQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQER--RTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSH
         :  ::::::::::.::..: ::   :   . . :  .  . . .:::::::: . :  
CCDS41 IIQPQRRRPSLLSEFQPGNERSQELHLRPESHSYLPELGKSEMEFIESKRPRLELLPD--
        60        70        80        90       100       110       

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pF1KA1 FQRVSAAVLPLVHPLP---EGLRA-SADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPS
                ::..: :    :  : : :  :: .. :: : : :: :      . .  : 
CCDS41 ---------PLLRPSPLLATGQPAGSEDLTKDRSLTGKLE-PVSPPSPPHTDPELELVPP
                  120       130       140        150       160     

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pF1KA1 KLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRS
       .::::::::.::::::::. ::::: :::::::::::::::::::::::::::.:.::::
CCDS41 RLSKEELIQNMDRVDREITMVEQQISKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPIESKHRS
         170       180       190       200       210       220     

          240       250       260       270       280       290    
pF1KA1 IVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFK
       .::::::::::::: ::.:.:::::.::::::::::::. :::::: ::.:::::::.::
CCDS41 LVQIIYDENRKKAEAAHRILEGLGPQVELPLYNQPSDTRQYHENIKINQAMRKKLILYFK
         230       240       250       260       270       280     

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pF1KA1 RRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQRE
       :::::::: :::.:::::::::::::::.::::::::.:::::.::::::::::::::::
CCDS41 RRNHARKQWEQKFCQRYDQLMEAWEKKVERIENNPRRRAKESKVREYYEKQFPEIRKQRE
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pF1KA1 QQERFQ-RVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQR
        :::.: ::::::.::: . ::::::.:::::::::::: :::::::.:::::..::.:.
CCDS41 LQERMQSRVGQRGSGLSMSAARSEHEVSEIIDGLSEQENLEKQMRQLAVIPPMLYDADQQ
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       :.::::::::: :::::::::: ::.:...::: :..::.:::::::::::.::::.: .
CCDS41 RIKFINMNGLMADPMKVYKDRQVMNMWSEQEKETFREKFMQHPKNFGLIASFLERKTVAE
         410       420       430       440       450       460     

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pF1KA1 CVLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEED--KAEKTEKKEEE
       :::::::::::::::.::::.: .:::..::  . .:... .....   .. . :: :.:
CCDS41 CVLYYYLTKKNENYKSLVRRSY-RRRGKSQQQQQQQQQQQQQQQQQPMPRSSQEEKDEKE
         470       480        490       500       510       520    

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pF1KA1 KKDEEEKDEKEDSKENTKE---KDKIDGTA-EETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITR
       :. : ::.:..   :: ::   :.: : :. :...:.: .. .:::::::::::::::::
CCDS41 KEKEAEKEEEKPEVENDKEDLLKEKTDDTSGEDNDEKEAVASKGRKTANSQGRRKGRITR
          530       540       550       560       570       580    

       590       600       610       620       630       640       
pF1KA1 SMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNW
       ::.:::          .::   :     :  : :  :.:::::::::.:::::.::::::
CCDS41 SMANEAN---------SEEAITP-QQSAELASMELNESSRWTEEEMETAKKGLLEHGRNW
          590                 600       610       620       630    

       650       660       670       680       690       700       
pF1KA1 AAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVS
       .:::.:::.:. .::::::::::.:.:::..::::: :  ..   .:  ..  ..::  .
CCDS41 SAIARMVGSKTVSQCKNFYFNYKKRQNLDEILQQHKLKMEKERNARRKKKKAPAAASEEA
          640       650       660       670       680       690    

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pF1KA1 A----QEDEDIEAS----NEEENPEDSE-----GAE-------------NSSDTESAPSP
       :     :::..:::    ::::  :..:     : :             ::::::: :::
CCDS41 AFPPVVEDEEMEASGVSGNEEEMVEEAEALHASGNEVPRGECSGPATVNNSSDTESIPSP
          700       710       720       730       740       750    

             750       760        770       780       790       800
pF1KA1 SPVEAVKPSEDSPENATSRG-NTEPAVELEPTTETAPSTSPSLAVPSTKPAEDESVETQV
           :   ....:.  .. : .  :     :  :  :.  :.  .:... :    .   .
CCDS41 HTEAAKDTGQNGPKPPATLGADGPPPGPPTPPPEDIPA--PTEPTPASE-ATGAPTPPPA
          760       770       780       790         800        810 

              810       820            830         840       850   
pF1KA1 NDSISAETAEQMDVDQQEHSA-----EEGSVCDPPPATK--ADSVDVEVRVPENHASKVE
         : ::        ...:..:     :::    :: : .  .:.  .:  :  . . ..:
CCDS41 PPSPSAPPPVVPKEEKEEETAAAPPVEEGEEQKPPAAEELAVDTGKAEEPVKSECTEEAE
             820       830       840       850       860       870 

           860       870           880       890       900         
pF1KA1 GDNTKERDLDRASEKVE----PRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCSADEDVDGEP
          .: .: . :   .:     . ..   ..  .:.     .:.::::::::::  ..: 
CCDS41 EGPAKGKDAEAAEATAEGALKAEKKEGGSGRATTAKSSGAPQDSDSSATCSADEVDEAEG
             880       890       900       910       920       930 

      910       920       930        940       950           960   
pF1KA1 -ERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVS-SPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPM----VSCTPCN
        ...:.  .. .::::.:::.  .. :: :  :::: ::..:::.:::.    :   : .
CCDS41 GDKNRL--LSPRPSLLTPTGDPRANASPQK--PLDLKQLKQRAAAIPPIQVTKVHEPPRE
               940       950         960       970       980       

                  970       980       990      1000                
pF1KA1 -------IPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTS-------P
               : . :       .     .  :.   ..:.     : :  .. .       :
CCDS41 DAAPTKPAPPAPPPPQNLQPESDAPQQPGSSPRGKSRSPAPPADKEAFAAEAQKLPGDPP
       990      1000      1010      1020      1030      1040       

    1010        1020          1030      1040           1050        
pF1KA1 CGTS--KSPNREWEVLQPAPH----QVITNLPEGVRLP-----TTRPTRPPPPLIPSSKT
       : ::    :    ::.. .::    ....  : :  ::     :.::. : :: : .   
CCDS41 CWTSGLPFPVPPREVIKASPHAPDPSAFSYAPPGHPLPLGLHDTARPVLPRPPTISNPPP
      1050      1060      1070      1080      1090      1100       

     1060         1070      1080      1090      1100      1110     
pF1KA1 TVASEK-PSFI--MGGSISQGTPGTYLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKS
        ..: : :: .  . :.::::     .. . .. :....  : :: ...:::  ..  : 
CCDS41 LISSAKHPSVLERQIGAISQG-----MSVQLHVPYSEHAKAP-VGPVTMGLPLPMDPKKL
      1110      1120           1130      1140       1150      1160 

        1120      1130      1140       1150       1160      1170   
pF1KA1 ATLPYIKQEEFSPRSQNSQPEGLLV-RAQHEGVVRGTA-GAIQEGSITRGTPTSKISVES
       : .  .:::..:::.: . ::.: :  ::. .:.:::: :..  ::::.: :....  .:
CCDS41 APFSGVKQEQLSPRGQAGPPESLGVPTAQEASVLRGTALGSVPGGSITKGIPSTRVPSDS
            1170      1180      1190      1200      1210      1220 

          1180      1190      1200      1210        1220      1230 
pF1KA1 IPSLRGSITQGTPALPQTGIPTEALVKGSISRMPIEDSSP--EKGREEAASKGHVIYEGK
         . :::::.::::        ..: ::.:.:.  :::    ..:::..  :::::::::
CCDS41 AITYRGSITHGTPA--------DVLYKGTITRIIGEDSPSRLDRGREDSLPKGHVIYEGK
            1230              1240      1250      1260      1270   

            1240          1250        1260      1270      1280     
pF1KA1 SGHILSYDN----IKNAREGTRSPR-TAHEISL-KRSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPL
       .::.:::..     . ..:  ::     :: .  ::.:. .:: . ...:      :: .
CCDS41 KGHVLSYEGGMSVTQCSKEDGRSSSGPPHETAAPKRTYDMMEGRVGRAIS------SASI
          1280      1290      1300      1310      1320             

        1290        1300      1310      1320      1330             
pF1KA1 EGLICRALP--RGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRATTESFEDGLKYP-KQIKRES----
       :::. ::.:  : :::  :::.  . ::: :: ::. .:. :: :.   : .:::.    
CCDS41 EGLMGRAIPPERHSPHH-LKEQHHIRGSITQGIPRSYVEAQEDYLRREAKLLKREGTPPP
      1330      1340       1350      1360      1370      1380      

      1340             1350        1360      1370      1380        
pF1KA1 -PPIRAFEGAIT-------KGKP-YDG-ITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQESRKTPEVVQ
        :: : .  :         : :: ..: ..:.:: :::::::::...     :.:::.  
CCDS41 PPPSRDLTEAYKTQALGPLKLKPAHEGLVATVKEAGRSIHEIPREEL-----RHTPELPL
       1390      1400      1410      1420      1430           1440 

     1390      1400      1410       1420      1430      1440       
pF1KA1 STRPIIEGSISQGTPIKFDNNSGQS-AIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVPENIKVVE
       . ::. ::::.::::.:.:.... . . ::.:.::: .:..    . ::... .  ...:
CCDS41 APRPLKEGSITQGTPLKYDTGASTTGSKKHDVRSLIGSPGRTFPPVHPLDVMADA-RALE
            1450      1460      1470      1480      1490       1500

      1450      1460      1470         1480      1490      1500    
pF1KA1 RGKYEDVKAGETVRSRHTSVVSSGPSVLRST---LHEAPKAQLSPGIYDDTSARRTPVSY
       :. ::     :...::  .. ::: :. :..   . :  : . ::  :.: .:   :  .
CCDS41 RACYE-----ESLKSRPGTASSSGGSIARGAPVIVPELGKPRQSPLTYEDHGA---P--F
                  1510      1520      1530      1540           1550

         1510           1520      1530      1540      1550         
pF1KA1 QNTMSRGSPMMNRT-----SDVTISSNKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVS
        . . ::::. .:      .. ..::.:.. ..:: : :: .  . : .: ::   :   
CCDS41 AGHLPRGSPVTTREPTPRLQEGSLSSSKAS-QDRKLTSTPREIAKSP-HSTVPEHHP---
             1560      1570      1580       1590       1600        

    1560        1570      1580       1590      1600      1610      
pF1KA1 H--SPFDPHHRGSTAGEVYRSHLPTHLDP-AMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQ
       :  ::..   :: .. ..::::.:  .:: ..:    :: ::::: . :.:.:.: ::  
CCDS41 HPISPYEHLLRGVSGVDLYRSHIPLAFDPTSIPRGIPLD-AAAAYYLPRHLAPNPTYPHL
        1610      1620      1630      1640       1650      1660    

       1620               1630      1640            1650      1660 
pF1KA1 YQLY---------AMENTRQTILNDYITSQQMQVNL------RPDVARGLSPREQPLGLP
       :  :         :.:: ::::.:::::::::. :       : :. :::::::. :.: 
CCDS41 YPPYLIRGYPDTAALEN-RQTIINDYITSQQMHHNAATAMAQRADMLRGLSPRESSLALN
         1670      1680       1690      1700      1710      1720   

             1670       1680      1690      1700      1710         
pF1KA1 YPA-TRGIIDLTNMPPT-ILVPHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSPGHP
       : :  ::::::...:   .:::   :: .  :::..:.: .   :  : ..:. .::: :
CCDS41 YAAGPRGIIDLSQVPHLPVLVPPTPGTPATAMDRLAYLPTAPQPFSSR-HSSSPLSPGGP
          1730      1740      1750      1760      1770       1780  

    1720         1730      1740         1750          1760         
pF1KA1 THLA---AAASAEREREREREKERERER---IAAASSDL----YLRPGSEQPG-------
       :::.   ...:.::::.:.::..:.:::   : .... .      :::.:: .       
CCDS41 THLTKPTTTSSSERERDRDRERDRDREREKSILTSTTTVEHAPIWRPGTEQSSGSSGGGG
           1790      1800      1810      1820      1830      1840  

               1770       1780      1790      1800        1810     
pF1KA1 ----RPGSHGYVRSPSP-SVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVITPLDPTAQ--LR-----
           ::.::..... :: : :::.. :::::::...:.  ..:: ..:..   ::     
CCDS41 GSSSRPASHSHAHQHSPISPRTQDA-LQQRPSVLHNTGMKGIITAVEPSTPTVLRSTSTS
           1850      1860       1870      1880      1890      1900 

                              1820                  1830      1840 
pF1KA1 --IMPL---------PAGG------PSISQG--LPAS----------RYNTAADALAALV
         . :          : ::      :.. .   ::            : .:.   ::   
CCDS41 SPVRPAATFPPATHCPLGGTLDGVYPTLMEPVLLPKEAPRVARPERPRADTGHAFLAKPP
            1910      1920      1930      1940      1950      1960 

            1850             1860          1870      1880          
pF1KA1 DAAASAPQMDVSKTKE-------ISSHRY--ETPSD--AIEVISPASSPAPP-------Q
         ..  :  . :: .:       .:.:    .::.   : .  :: . ::::       .
CCDS41 ARSGLEPASSPSKGSEPRPLVPPVSGHATIARTPAKNLAPHHASP-DPPAPPASASDPHR
            1970      1980      1990      2000       2010      2020

                             1890      1900        1910            
pF1KA1 EKLQT-------------------YQPEVVKANQAENDPTRQYEG--PLH-------HY-
       :: :.                   :.:: :.  .  ..:.  ..   : :       :  
CCDS41 EKTQSKPFSIQELELRSLGYHGSSYSPEGVEPVSPVSSPSLTHDKGLPKHLEELDKSHLE
             2030      2040      2050      2060      2070      2080

            1920               1930         1940         1950      
pF1KA1 ---RPQQESP----SPQQQLP-----PSSQAEG---MGQVP--RTH-RLITLADHICQII
          ::.: .:    .   .::     : ::  .   .  .:  . : :..:::.:: ..:
CCDS41 GELRPKQPGPVKLGGEAAHLPHLRPLPESQPSSSPLLQTAPGVKGHQRVVTLAQHISEVI
             2090      2100      2110      2120      2130      2140

       1960      1970       1980      1990         2000      2010  
pF1KA1 TQDFARNQVSSQTPQQP-PTSTFQNSPSALVSTPV---RTKTSNRYSPESQAQSVHHQRP
       :::..:.. .. .   : :  .:   :.:  : ::   :   :. : :  .     :  :
CCDS41 TQDYTRHHPQQLSAPLPAPLYSF---PGA--SCPVLDLRRPPSDLYLPPPD-----HGAP
             2150      2160           2170      2180           2190

           2020      2030         2040      2050        2060       
pF1KA1 GSRVSPENLVDKSRGSRPGKSPERSHV---SSEPYEPISPPQ--VPVVHEKQDSLLLLSQ
        .: ::.     :.:.. .  :... :   . .  ::.:::.  .   : ..    :: .
CCDS41 -ARGSPH-----SEGGKRSPEPNKTSVLGGGEDGIEPVSPPEGMTEPGHSRSAVYPLLYR
                   2200      2210      2220      2230      2240    

      2070      2080      2090       2100      2110      2120      
pF1KA1 RGAEPAEQRNDARSPGSISYLPSFFTKL-ENTSPMVKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAA
        : .   .:  ..:::. :  :.::.:: :..: ::::::::: .:::. . .. ..  .
CCDS41 DGEQTEPSRMGSKSPGNTSQPPAFFSKLTESNSAMVKSKKQEINKKLNTHNRNEPEYNIS
         2250      2260      2270      2280      2290      2300    

       2130      2140      2150       2160      2170      2180     
pF1KA1 QPGTEIFNLPAVTTSGSVSSRGHSFADPAS-NLGLEDIIRKALMGSFDDKVEDHGVVMSQ
       ::::::::.::.: .: .. :...  . :: :.::: ::::::::..:            
CCDS41 QPGTEIFNMPAITGTGLMTYRSQAVQEHASTNMGLEAIIRKALMGKYDQWEESPPLSANA
         2310      2320      2330      2340      2350      2360    

        2190      2200      2210      2220      2230      2240     
pF1KA1 PMGVVPGTANTSVVTSGETRREEGDPSPHSGGVCKPKLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTE
                                                                   
CCDS41 FNPLNASASLPAAMPITAADGRSDHTLTSPGGGGKAKVSGRPSSRKAKSPAPGLASGDRP
         2370      2380      2390      2400      2410      2420    




2337 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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