seq1 = pF1KA1003.tfa, 2739 bp seq2 = pF1KA1003/gi568815589f_129752556.tfa (gi568815589f:129752556_129980270), 227715 bp >pF1KA1003 2739 >gi568815589f:129752556_129980270 (Chr9) 1-81 (100001-100081) 100% -> 82-135 (103752-103805) 100% -> 136-198 (105495-105557) 98% -> 199-330 (105912-106043) 100% -> 331-427 (108382-108478) 98% -> 428-497 (108988-109057) 98% -> 498-611 (110631-110744) 100% -> 612-690 (112748-112826) 100% -> 691-1132 (115450-115894) 99% -> 1133-1273 (116307-116447) 100% -> 1274-1389 (116755-116870) 99% -> 1390-1562 (117117-117289) 100% -> 1563-1657 (117898-117992) 100% -> 1658-1691 (120927-120960) 100% -> 1692-1737 (121144-121189) 100% -> 1738-1918 (122021-122201) 100% -> 1919-2045 (122274-122400) 99% -> 2046-2215 (122755-122924) 99% -> 2216-2297 (123005-123086) 100% -> 2298-2406 (123575-123683) 100% -> 2407-2509 (125783-125885) 100% -> 2510-2581 (127018-127089) 100% -> 2582-2739 (127558-127715) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGGGGACTCCAGGGACCTTTGCCCTCACCTTGACTCCATAGGAGAGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGGGGACTCCAGGGACCTTTGCCCTCACCTTGACTCCATAGGAGAGGT 50 . : . : . : . : . : 51 GACCAAAGAGGACTTGCTGCTCAAATCTAAG GGAACCTGTC |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 100051 GACCAAAGAGGACTTGCTGCTCAAATCTAAGGTA...CAGGGAACCTGTC 100 . : . : . : . : . : 92 AGTCGTGTGGGGTCACCGGACCAAACCTATGGGCCTGTCTGCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>... 103762 AGTCGTGTGGGGTCACCGGACCAAACCTATGGGCCTGTCTGCAGGTA... 150 . : . : . : . : . : 136 GTTGCCTGCCCCTATGTTGGCTGCGGAGAATCCTTCGCTGACCACAG >>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| 105492 CAGGTTGCCTGCCCCTATGTTGGCTGCGGAGAATCCTTTGCTGACCACAG 200 . : . : . : . : . : 183 CACCATTCATGCACAG GCAAAAAAGCACAACTTGACCGTGA ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 105542 CACCATTCATGCACAGGTG...TAGGCAAAAAAGCACAACTTGACCGTGA 250 . : . : . : . : . : 224 ACCTGACCACGTTCCGACTGTGGTGTTACGCCTGTGAGAAGGAGGTATTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105937 ACCTGACCACGTTCCGACTGTGGTGTTACGCCTGTGAGAAGGAGGTATTC 300 . : . : . : . : . : 274 CTGGAGCAGCGGCTGGCAGCCCCTCTGCTGGGCTCCTCTTCCAAGTTCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105987 CTGGAGCAGCGGCTGGCAGCCCCTCTGCTGGGCTCCTCTTCCAAGTTCTC 350 . : . : . : . : . : 324 TGAACAG GACTCCCCGCCACCCTCCCACCCTCTGAAAGCTG |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 106037 TGAACAGGTA...CAGGACTCCCCGCCACCCTCCCACCCTCTGAAAGCTG 400 . : . : . : . : . : 365 TTCCTATTGCTGTGGCTGATGAAGGAGAGTCTGAGTCAGAGGATGATGAC ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| 108416 TTCCTATTGCTGTGGCTGATGAAGGAGAGTCTGAGTCAGAGGACGATGAC 450 . : . : . : . : . : 415 CTGAAACCTCGAG GCCTCACGGGCATGAAGAACCTCGGGAA |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 108466 CTGAAACCTCGAGGTA...CAGGCCTCACGGGCATGAAGAACCTCGGGAA 500 . : . : . : . : . : 456 CTCCTGCTACATGAACGCCGCCCTGCAGGCCCTGTCCAATTG |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||>>>...>> 109016 CTCCTGCTACATGAACGCTGCCCTGCAGGCCCTGTCCAATTGGTA...CA 550 . : . : . : . : . : 498 CCCGCCGCTGACTCAGTTCTTCTTGGAGTGTGGCGGCCTGGTGCGCACA >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110630 GCCCGCCGCTGACTCAGTTCTTCTTGGAGTGTGGCGGCCTGGTGCGCACA 600 . : . : . : . : . : 547 GATAAGAAGCCAGCCCTGTGCAAGAGCTACCAGAAGCTGGTCTCTGAGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110680 GATAAGAAGCCAGCCCTGTGCAAGAGCTACCAGAAGCTGGTCTCTGAGGT 650 . : . : . : . : . : 597 CTGGCATAAGAAACG GCCAAGCTACGTGGTCCCCACCAGTC |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 110730 CTGGCATAAGAAACGGTG...CAGGCCAAGCTACGTGGTCCCCACCAGTC 700 . : . : . : . : . : 638 TGTCTCATGGGATCAAGTTGGTCAACCCAATGTTCCGAGGCTATGCCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112774 TGTCTCATGGGATCAAGTTGGTCAACCCAATGTTCCGAGGCTATGCCCAG 750 . : . : . : . : . : 688 CAG GACACCCAAGAGTTCCTTCGCTGCCTGATGGACCAGCT |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112824 CAGGTA...TAGGACACCCAAGAGTTCCTTCGCTGCCTGATGGACCAGCT 800 . : . : . : . : . : 729 GCACGAGGAGCTCAAGGAGCCGGTGGTGGCCACGGTGGCGCTGACGGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115488 GCACGAGGAGCTCAAGGAGCCGGTGGTGGCCACGGTGGCGCTGACGGAGG 850 . : . : . : . : . : 779 CTCGGGACTCAGATTCGAGTGACACGGATGAGAAACGGGAGGGTGACCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115538 CTCGGGACTCAGATTCGAGTGACACGGATGAGAAACGGGAGGGTGACCGG 900 . : . : . : . : . : 829 AGCCCATCAGAAGATGAGTTCTTGTCCTGTGACTCGAGCAGTGACCGGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115588 AGCCCATCAGAAGATGAGTTCTTGTCCTGTGACTCGAGCAGTGACCGGGG 950 . : . : . : . : . : 879 TGAGGGTGACGGGCAGGGGCGTGGCGGGGGCAGCTCGCAGGCCGAGACGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115638 TGAGGGTGACGGGCAGGGGCGTGGCGGGGGCAGCTCGCAGGCCGAGACGG 1000 . : . : . : . : . : 929 AGCTGCTGATCCCAGATGAGGCGGGCCGAGTCATCTCTGAGAAGGAGCGG |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| 115688 AGCTGCTGATCCCAGATGAGGCGGGCCGAGCCATCTCTGAGAAGGAGCGG 1050 . : . : . : . : . : 979 ATGAAGGACCGCAAGTTCTCCTGGGGCCAGCAGCGTACAAACTCGGAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115738 ATGAAGGACCGCAAGTTCTCCTGGGGCCAGCAGCGTACAAACTCGGAGCA 1100 . : . : . : . : . : 1029 AGTGGACGAGGACGCTGATGTGGACACTGCCATGGCTGCCCTTGAC C ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|- 115788 AGTGGACGAGGACGCTGATGTGGACACTGCCATGGCTGCCCTTGACGACC 1150 . : . : . : . : . : 1076 AGCCCGCGGAGGCCCAGCCCCCGTCACCACGGTCCTCCAGCCCCTGCCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115838 AGCCCGCGGAGGCCCAGCCCCCGTCACCACGGTCCTCCAGCCCCTGCCGG 1200 . : . : . : . : . : 1126 ACGCCAG AGCCGGACAATGATGCTCACCTACGCAGCTCCTC |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 115888 ACGCCAGGTA...CAGAGCCGGACAATGATGCTCACCTACGCAGCTCCTC 1250 . : . : . : . : . : 1167 TCGCCCCTGCAGCCCCGTCCACCACCACGAGGGCCATGCCAAGCTGTCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116341 TCGCCCCTGCAGCCCCGTCCACCACCACGAGGGCCATGCCAAGCTGTCTA 1300 . : . : . : . : . : 1217 GCAGCCCCCCTCGTGCAAGCCCCGTGAGGATGGCACCGTCGTACGTGCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116391 GCAGCCCCCCTCGTGCAAGCCCCGTGAGGATGGCACCGTCGTACGTGCTC 1350 . : . : . : . : . : 1267 AAGAAAG CCCAGGTATTGAGTGCTGGCAGCCGGAGGCGGAA |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 116441 AAGAAAGGTT...CAGCCCAGGTATTGAGTGCTGGCAGCCGGAGGCGGAA 1400 . : . : . : . : . : 1308 GGAGCAGCGCTACCGCAGCGTCATCTCAGACATCTTTGACGGCTCCATTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116789 GGAGCAGCGCTACCGCAGCGTCATCTCAGACATCTTTGACGGCTCCATTC 1450 . : . : . : . : . : 1358 TCAGCCTCGTGCAGTGTCTCACCTGTGACCGG GTATCCACC ||||||| ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 116839 TCAGCCTTGTGCAGTGTCTCACCTGTGACCGGGTG...CAGGTATCCACC 1500 . : . : . : . : . : 1399 ACAGTGGAAACGTTCCAGGACTTATCACTGCCCATTCCTGGAAAGGAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117126 ACAGTGGAAACGTTCCAGGACTTATCACTGCCCATTCCTGGAAAGGAGGA 1550 . : . : . : . : . : 1449 CCTGGCCAAGCTCCATTCAGCCATCTACCAGAATGTGCCGGCCAAGCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117176 CCTGGCCAAGCTCCATTCAGCCATCTACCAGAATGTGCCGGCCAAGCCAG 1600 . : . : . : . : . : 1499 GCGCCTGTGGGGACAGCTATGCCGCCCAGGGCTGGCTGGCCTTCATTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117226 GCGCCTGTGGGGACAGCTATGCCGCCCAGGGCTGGCTGGCCTTCATTGTG 1650 . : . : . : . : . : 1549 GAGTACATCCGACG GTTTGTGGTATCCTGTACCCCCAGCTG ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 117276 GAGTACATCCGACGGTG...TAGGTTTGTGGTATCCTGTACCCCCAGCTG 1700 . : . : . : . : . : 1590 GTTTTGGGGGCCTGTCGTCACCCTGGAAGACTGCCTTGCTGCCTTCTTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117925 GTTTTGGGGGCCTGTCGTCACCCTGGAAGACTGCCTTGCTGCCTTCTTTG 1750 . : . : . : . : . : 1640 CCGCTGATGAGTTAAAGG GTGACAACATGTACAGCTGTGAG ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| 117975 CCGCTGATGAGTTAAAGGGTG...TAGGTGACAACATGTACAGCTGTGAG 1800 . : . : . : . : . : 1681 CGGTGTAAGAA GCTGCGGAACGGAGTGAAGTACTGCAAAGT |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| 120950 CGGTGTAAGAAGTA...CAGGCTGCGGAACGGAGTGAAGTACTGCAAAGT 1850 . : . : . : . : . : 1722 CCTGCGGTTGCCCGAG ATCCTGTGCATTCACCTAAAGCGCT ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 121174 CCTGCGGTTGCCCGAGGTG...CAGATCCTGTGCATTCACCTAAAGCGCT 1900 . : . : . : . : . : 1763 TTCGGCACGAGGTGATGTACTCATTCAAGATCAACAGCCACGTCTCCTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122046 TTCGGCACGAGGTGATGTACTCATTCAAGATCAACAGCCACGTCTCCTTC 1950 . : . : . : . : . : 1813 CCCCTCGAGGGGCTCGACCTGCGCCCCTTCCTTGCCAAGGAGTGCACATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122096 CCCCTCGAGGGGCTCGACCTGCGCCCCTTCCTTGCCAAGGAGTGCACATC 2000 . : . : . : . : . : 1863 CCAGATCACCACCTACGACCTCCTCTCGGTCATCTGCCACCACGGCACGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122146 CCAGATCACCACCTACGACCTCCTCTCGGTCATCTGCCACCACGGCACGG 2050 . : . : . : . : . : 1913 CAGGCA GTGGGCACTACATCGCCTACTGCCAGAACGTGATT ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 122196 CAGGCAGTG...CAGGTGGGCACTACATCGCCTACTGCCAGAACGTGATC 2100 . : . : . : . : . : 1954 AATGGGCAGTGGTACGAGTTTGATGACCAGTACGTCACAGAAGTCCACGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122309 AATGGGCAGTGGTACGAGTTTGATGACCAGTACGTCACAGAAGTCCACGA 2150 . : . : . : . : . : 2004 GACGGTGGTGCAGAACGCCGAGGGCTACGTACTCTTCTACAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 122359 GACGGTGGTGCAGAACGCCGAGGGCTACGTACTCTTCTACAGGTG...CA 2200 . : . : . : . : . : 2046 GAAGAGCAGCGAGGAGGCCATGCGGGAGCGACAGCAGGTGGTGTCCCTG >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122754 GGAAGAGCAGCGAGGAGGCCATGCGGGAGCGACAGCAGGTGGTGTCCCTG 2250 . : . : . : . : . : 2095 GCCGCCATGCGGGAGCCCAGCCTGCTGCGGTTCTACGTGTCCCGCGAGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122804 GCCGCCATGCGGGAGCCCAGCCTGCTGCGGTTCTACGTGTCCCGCGAGTG 2300 . : . : . : . : . : 2145 GCTCAACAAGTTCAACACCTTCGCAGAGCCAGGCCCCATCACCAACCAGA |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| 122854 GCTCAACAAGTTCAACACCTTCGCGGAGCCAGGCCCCATCACCAACCAGA 2350 . : . : . : . : . : 2195 CCTTCCTCTGCTCCCACGGAG GCATCCCGCCCCACAAATAC |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| 122904 CCTTCCTCTGCTCCCACGGAGGTG...CAGGCATCCCGCCCCACAAATAC 2400 . : . : . : . : . : 2236 CACTACATCGACGACCTGGTGGTCATCCTGCCCCAGAACGTCTGGGAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123025 CACTACATCGACGACCTGGTGGTCATCCTGCCCCAGAACGTCTGGGAGCA 2450 . : . : . : . : . : 2286 CCTGTACAACAG ATTCGGGGGTGGCCCCGCCGTGAACCACC ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| 123075 CCTGTACAACAGGTG...CAGATTCGGGGGTGGCCCCGCCGTGAACCACC 2500 . : . : . : . : . : 2327 TGTACGTGTGCTCCATCTGCCAGGTGGAGATCGAGGCACTGGCCAAGCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123604 TGTACGTGTGCTCCATCTGCCAGGTGGAGATCGAGGCACTGGCCAAGCGC 2550 . : . : . : . : . : 2377 AGGAGGATCGAGATCGACACCTTCATCAAG TTGAACAAGGC ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 123654 AGGAGGATCGAGATCGACACCTTCATCAAGGTG...CAGTTGAACAAGGC 2600 . : . : . : . : . : 2418 CTTCCAGGCCGAGGAGTCGCCGGGCGTCATCTACTGCATCAGCATGCAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125794 CTTCCAGGCCGAGGAGTCGCCGGGCGTCATCTACTGCATCAGCATGCAGT 2650 . : . : . : . : . : 2468 GGTTCCGGGAGTGGGAGGCGTTCGTCAAGGGGAAGGACAACG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 125844 GGTTCCGGGAGTGGGAGGCGTTCGTCAAGGGGAAGGACAACGGTG...CA 2700 . : . : . : . : . : 2510 AGCCCCCCGGGCCCATTGACAACAGCAGGATTGCACAGGTCAAAGGAAG >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127017 GAGCCCCCCGGGCCCATTGACAACAGCAGGATTGCACAGGTCAAAGGAAG 2750 . : . : . : . : . : 2559 CGGCCATGTCCAGCTGAAGCAGG GAGCTGACTACGGGCAGA |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 127067 CGGCCATGTCCAGCTGAAGCAGGGTG...CAGGAGCTGACTACGGGCAGA 2800 . : . : . : . : . : 2600 TTTCGGAGGAGACCTGGACCTACCTGAACAGCCTGTATGGAGGTGGCCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127576 TTTCGGAGGAGACCTGGACCTACCTGAACAGCCTGTATGGAGGTGGCCCC 2850 . : . : . : . : . : 2650 GAGATTGCCATCCGCCAGAGTGTGGCGCAGCCGCTGGGCCCAGAGAACCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127626 GAGATTGCCATCCGCCAGAGTGTGGCGCAGCCGCTGGGCCCAGAGAACCT 2900 . : . : . : . : 2700 GCACGGGGAGCAGAAGATCGAAGCCGAGACGCGGGCCGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127676 GCACGGGGAGCAGAAGATCGAAGCCGAGACGCGGGCCGTG