FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1002, 840 aa 1>>>pF1KA1002 840 - 840 aa - 840 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.5302+/-0.00117; mu= -16.6658+/- 0.070 mean_var=446.1822+/-94.049, 0's: 0 Z-trim(115.0): 70 B-trim: 151 in 1/51 Lambda= 0.060718 statistics sampled from 15507 (15570) to 15507 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.772), E-opt: 0.2 (0.478), width: 16 Scan time: 5.380 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8937.2 R3HDM2 gene_id:22864|Hs108|chr12 ( 976) 5689 513.2 8.7e-145 CCDS81704.1 R3HDM2 gene_id:22864|Hs108|chr12 ( 966) 4631 420.5 6.9e-117 CCDS81703.1 R3HDM2 gene_id:22864|Hs108|chr12 (1010) 3749 343.3 1.3e-93 CCDS58823.1 ARPP21 gene_id:10777|Hs108|chr3 ( 813) 1239 123.3 1.7e-27 CCDS58824.1 ARPP21 gene_id:10777|Hs108|chr3 ( 793) 972 99.9 1.8e-20 CCDS63026.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 ( 971) 922 95.6 4.4e-19 CCDS2177.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (1099) 895 93.3 2.5e-18 CCDS2661.1 ARPP21 gene_id:10777|Hs108|chr3 ( 812) 888 92.6 3e-18 CCDS63024.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (1044) 877 91.7 7.2e-18 CCDS63025.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (1100) 877 91.7 7.5e-18 >>CCDS8937.2 R3HDM2 gene_id:22864|Hs108|chr12 (976 aa) initn: 5689 init1: 5689 opt: 5689 Z-score: 2712.8 bits: 513.2 E(32554): 8.7e-145 Smith-Waterman score: 5689; 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45.4% identity (67.1% similar) in 654 aa overlap (1-524:132-776) 10 20 30 pF1KA1 MLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNP :::.: ::::::::::::::::.::::.: CCDS58 EEDKSRKDDSEREKEKDKNKDKTSEKPKIRMLSKDCSQEYTDSTGIDLHEFLINTLKNNS 110 120 130 140 150 160 40 50 60 70 80 90 pF1KA1 RDRMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVII ::::.:::.::::..:: ::::..::::::.::.:::.::::::::.:::::::::.::: CCDS58 RDRMILLKMEQEIIDFIADNNNHYKKFPQMSSYQRMLVHRVAAYFGLDHNVDQTGKSVII 170 180 190 200 210 220 100 110 120 130 140 pF1KA1 NKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQT--GQNG-YLNDIRLS ::::.:::::::: ::.::::. : :.:::::::..:.:..:::. .:.. .... :: CCDS58 NKTSSTRIPEQRFCEHLKDEKGEESQKRFILKRDNSSIDKEDNQSVCSQESLFVENSRLL 230 240 250 260 270 280 150 160 170 180 190 200 pF1KA1 KEA-FSSSSHKRRQIFRGNREGLSRTSSSRQSSTDSELK-SLEPRPWSSTDSDGSVRSMR ... . . ..:.::.:::::.: .:::.:::::...::: : . : :::::::.: :... CCDS58 EDSNICNETYKKRQLFRGNRDGSGRTSGSRQSSSENELKWSDHQRAWSSTDSDSSNRNLK 290 300 310 320 330 340 210 220 230 pF1KA1 PPVTKASSFSGISILTRGDSIGSSKG---------------GSAGRISR----------- : .::..::.::..:::::: .:... ::.: .:: CCDS58 PAMTKTASFGGITVLTRGDSTSSTRSTGKLSKAGSESSSSAGSSGSLSRTHPPLQSTPLV 350 360 370 380 390 400 240 pF1KA1 -----------------------------------------PGMAL-------------G :: : : CCDS58 SGVAAGSPGCVPYPENGIGGQVAPSSTSYILLPLEAATGIPPGSILLNPHTGQPFVNPDG 410 420 430 440 450 460 250 260 270 280 290 pF1KA1 APEVCNQVTSSQSVRGLLPCTAQQQQQQQQQ----QLPALPPTPQQQPPLNNHMI----- .: . : ::.: .:. . .::: ::: : . :: ::. :: .. . CCDS58 TPAIYNPPTSQQPLRSAMVGQSQQQPPQQQPSPQPQQQVQPPQPQMAGPLVTQSVQGLQA 470 480 490 500 510 520 300 310 320 pF1KA1 -SQA-------------------------DDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADP-SAALFQT ::. ::... ::::.::::.: :. .: :. .. . CCDS58 SSQSVQYPAVSFPPQHLLPVSPTQHFPMRDDVATQFGQMTLSRQSSGETPEPPSGPVYPS 530 540 550 560 570 580 330 340 350 360 370 380 pF1KA1 PLISQHPQQTSFIMASTGQPLPTSNYSTSSHAPP-TQQVL-PP---QGYMQ--PPQQIQV :. : :: :...::::: :::...: : .:: .:::: :: ::..: :: :. : CCDS58 SLMPQPAQQPSYVIASTGQQLPTGGFSGS--GPPISQQVLQPPPSPQGFVQQPPPAQMPV 590 600 610 620 630 390 400 410 420 430 440 pF1KA1 SYYPPGQYPNSN-QQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMIGV ::: ::::.:. :::::.. :: :. ::.::.:: .:: : ::.. .:: ..::.::: CCDS58 YYYPSGQYPTSTTQQYRPMA-PVQYNAQRSQQMPQAAQQAGYQPVLSGQQ--GFQGLIGV 640 650 660 670 680 690 450 460 470 480 490 500 pF1KA1 QQP-QNQGLLSSQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGSDSQNVVQPPFQQPMLVPVSQ ::: :.:.....:. : .:...:.: . :::::. . ::.. : .:::...: .: CCDS58 QQPPQSQNVINNQQ---GTPVQSVMVSYPTMSSYQVPMTQGSQGLPQQSYQQPIMLP-NQ 700 710 720 730 740 750 510 520 530 540 550 560 pF1KA1 SVQGGLPAAGVPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQYQMPQSPSPCSPPQMPQQYS . ::.:::.:.::: .. ::. :: CCDS58 AGQGSLPATGMPVYCNVTPPTPQNNLRLIGPHCPSSTVPVMSASCRTNCASMSNAGWQVK 760 770 780 790 800 810 >>CCDS58824.1 ARPP21 gene_id:10777|Hs108|chr3 (793 aa) initn: 1193 init1: 747 opt: 972 Z-score: 481.0 bits: 99.9 E(32554): 1.8e-20 Smith-Waterman score: 1570; 44.9% identity (64.9% similar) in 650 aa overlap (1-524:132-756) 10 20 30 pF1KA1 MLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNP :::.: ::::::::::::::::.::::.: CCDS58 EEDKSRKDDSEREKEKDKNKDKTSEKPKIRMLSKDCSQEYTDSTGIDLHEFLINTLKNNS 110 120 130 140 150 160 40 50 60 70 80 90 pF1KA1 RDRMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVII ::::.:::.::::..:: ::::..::::::.::.:::.::::::::.:::::::::.::: CCDS58 RDRMILLKMEQEIIDFIADNNNHYKKFPQMSSYQRMLVHRVAAYFGLDHNVDQTGKSVII 170 180 190 200 210 220 100 110 120 130 140 150 pF1KA1 NKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQTGQNGYLNDIRLSKEA ::::.:::::::: ::.::::. : :.:::::::..:.:..:::. :.:. CCDS58 NKTSSTRIPEQRFCEHLKDEKGEESQKRFILKRDNSSIDKEDNQS---------VCSQES 230 240 250 260 270 160 170 180 190 200 pF1KA1 FSSSSHKRRQIFRGNREGLSRTSSSRQSSTDSELK-SLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVT . . ::::.: .:::.:::::...::: : . : :::::::.: :...: .: CCDS58 LFVEN-------RGNRDGSGRTSGSRQSSSENELKWSDHQRAWSSTDSDSSNRNLKPAMT 280 290 300 310 320 210 220 230 pF1KA1 KASSFSGISILTRGDSIGSSKG---------------GSAGRISR--------------- :..::.::..:::::: .:... ::.: .:: CCDS58 KTASFGGITVLTRGDSTSSTRSTGKLSKAGSESSSSAGSSGSLSRTHPPLQSTPLVSGVA 330 340 350 360 370 380 240 pF1KA1 -------------------------------------PGMAL-------------GAPEV :: : :.: . CCDS58 AGSPGCVPYPENGIGGQVAPSSTSYILLPLEAATGIPPGSILLNPHTGQPFVNPDGTPAI 390 400 410 420 430 440 250 260 270 280 290 pF1KA1 CNQVTSSQSVRGLLPCTAQQQQQQQQQ----QLPALPPTPQQQPPLNNHMI------SQA : ::.: .:. . .::: ::: : . :: ::. :: .. . ::. CCDS58 YNPPTSQQPLRSAMVGQSQQQPPQQQPSPQPQQQVQPPQPQMAGPLVTQSVQGLQASSQS 450 460 470 480 490 500 300 310 320 330 pF1KA1 -------------------------DDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADP-SAALFQTPLIS ::... ::::.::::.: :. .: :. .. . :. CCDS58 VQYPAVSFPPQHLLPVSPTQHFPMRDDVATQFGQMTLSRQSSGETPEPPSGPVYPSSLMP 510 520 530 540 550 560 340 350 360 370 380 pF1KA1 QHPQQTSFIMASTGQPLPTSNYSTSSHAPP-TQQVL-PP---QGYMQ--PPQQIQVSYYP : :: :...::::: :::...: : .:: .:::: :: ::..: :: :. : ::: CCDS58 QPAQQPSYVIASTGQQLPTGGFSGS--GPPISQQVLQPPPSPQGFVQQPPPAQMPVYYYP 570 580 590 600 610 620 390 400 410 420 430 440 pF1KA1 PGQYPNSN-QQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMIGVQQP- ::::.:. :::::.. :: :. ::.::.:: .:: : ::.. .:: ..::.:::::: CCDS58 SGQYPTSTTQQYRPMA-PVQYNAQRSQQMPQAAQQAGYQPVLSGQQ--GFQGLIGVQQPP 630 640 650 660 670 680 450 460 470 480 490 500 pF1KA1 QNQGLLSSQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGSDSQNVVQPPFQQPMLVPVSQSVQG :.:.....:. : .:...:.: . :::::. . ::.. : .:::...: .:. :: CCDS58 QSQNVINNQQ---GTPVQSVMVSYPTMSSYQVPMTQGSQGLPQQSYQQPIMLP-NQAGQG 690 700 710 720 730 510 520 530 540 550 560 pF1KA1 GLPAAGVPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQYQMPQSPSPCSPPQMPQQYSGVSP .:::.:.::: .. ::. :: CCDS58 SLPATGMPVYCNVTPPTPQNNLRLIGPHCPSSTVPVMSASCRTNCASMSNAGWQVKF 740 750 760 770 780 790 >>CCDS63026.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (971 aa) initn: 2094 init1: 746 opt: 922 Z-score: 456.1 bits: 95.6 E(32554): 4.4e-19 Smith-Waterman score: 2835; 51.6% identity (73.7% similar) in 900 aa overlap (1-831:92-962) 10 20 30 pF1KA1 MLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNP :::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS63 IQLTQSFEKEEKPSKDEAEKEKASDKLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNP 70 80 90 100 110 120 40 50 60 70 80 90 pF1KA1 RDRMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVII ::::::::::::::.::..:.. :::: :::::::::::::::::.::::::.::.::. CCDS63 RDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRKKFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIV 130 140 150 160 170 180 100 110 120 130 pF1KA1 NKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQT--------------- :::::::::.:.:.:::::.:. .::.:.:::::..:.:.:::: CCDS63 NKTSNTRIPDQKFNEHIKDDKGEDFQKRYILKRDNSSFDKDDNQMRIRLKDDRRSKSIEE 190 200 210 220 230 240 140 150 160 170 pF1KA1 -------------------GQNGYLNDIRLSKEAFSSSSHKRRQIFRGNREGLSRTSSSR .:..:. : ::. : .::...:::::: :... .:...:. CCDS63 REEEYQRARDRIFSQDSLCSQENYIIDKRLQDED-ASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSH 250 260 270 280 290 300 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 QSSTDSELKSLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVTKASSFSGISILTRGDSIGSSKGGSAGR ::::..::: :::::::::::.:.:...: :::::::::::.:::::: :::: : :: CCDS63 QSSTENELKYSEPRPWSSTDSDSSLRNLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSK--SIGR 310 320 330 340 350 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 ISRPGMAL----GAPEVCNQVTSSQSVRGLLPCTAQQQQQQQQQQLPALPPTPQQQPPLN .:. :. . :.: : : ..: ::. .: : : :: ::: : CCDS63 LSKTGQPFINPDGSPVVYNPPMTQQPVRSQVPGPPQ----------PPLPAPPQQ--PAA 360 370 380 390 400 300 310 320 330 340 pF1KA1 NHMISQADDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADPSAALFQTPLISQHPQQTSFIMAST------ ::..:: :.:.. :..:::.:: :....:: ::.::. .. : :::...::... CCDS63 NHIFSQQDNLGSQFSHMSLARQPSADGSDPHAAMFQSTVVLQSPQQSGYIMTAAPPPHPP 410 420 430 440 450 460 350 360 370 380 390 pF1KA1 --------------GQPLPTSNYSTSSHAPPTQQVLPPQGYMQPPQ-QIQVSYYPPGQYP :::.::..: .:.: : .: :: :::.: :. :. . : ::.: CCDS63 PPPPPPPPPPPLPPGQPVPTAGYPASGH-PVSQPVLQQQGYIQQPSPQMPACYCAPGHYH 470 480 490 500 510 520 400 410 420 430 440 450 pF1KA1 NSNQQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMIGVQQPQNQGLLS .:. ::::. : :. . .: ::::.:: : : ..::::: :::..::::::.:.:.: CCDS63 SSQPQYRPVPS-VHYNSHLNQPLPQPAQQTGYQ-VIPNQQQN-YQGIVGVQQPQSQSLVS 530 540 550 560 570 580 460 470 480 490 500 510 pF1KA1 SQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGSDSQNVVQPPFQQPMLVPVSQSVQGGLPAAGV .: .:.:.:.::.:. :: .:.::: . . ::.. . .:::.. : .:: ::..:..:. CCDS63 GQPNSIGNQIQGVVIPYTSVPTYQVSLPQGSQGIPHQTYQQPVMFP-NQSNQGSMPTTGM 590 600 610 620 630 640 520 530 540 550 560 pF1KA1 PVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQYQMPQSPSPCSPPQMPQQYSGVSPSGP---G :::::.:::.:::. : :::.:: ::::: :.:.. :::: :. . ..: : : CCDS63 PVYYSVIPPGQQNNLSSSVGYLQHPGSEQVQFPRTTSPCSSQQLQGHQCTAGPPPPPGGG 650 660 670 680 690 700 570 580 590 600 610 620 pF1KA1 VVVMQLNVPNGPQP-PQNPSMVQWSHCKYYSMDQRGQKPGDLYSPDSSPQANTQMSSSPV .:.:::.:::.:: ..: ::.. ::: ::::: .. : :. : . :.:: :. CCDS63 MVMMQLSVPNNPQSCAHSPP--QWKQNKYYCDHQRGQKCVEFSSVDNIVQHSPQLSS-PI 710 720 730 740 750 630 640 650 660 670 680 pF1KA1 TSPTQSPAPSPVTSLSSVCTGLSPLPVLTQFPRPGGPAQGDGRYSLLGQPLQYNLSICPP ::.:::::. ...:..: . :: .. :: :: :.:::.:: ::::::::: :: CCDS63 ISPAQSPAPAQLSTLKTVRPSGPPLSIMPQFSRPFVPGQGDSRYPLLGQPLQYN----PP 760 770 780 790 800 810 690 700 710 720 730 740 pF1KA1 -LLHGQSTYTVHQGQSGLKHGNRGKRQALKSASTDLGTADVVLGRVLEVTDLPEGITRTE .:::. .::: : .:::::.::: :.::::::....:.:.:::.:.::.:::: : CCDS63 AVLHGH--IPNQQGQPGSRHGNRGRRQAKKAASTDLGAGETVVGKVLEITELPDGITRME 820 830 840 850 860 870 750 760 770 780 790 800 pF1KA1 ADKLFTQLAMSGAKIQWLKDAQGLPGG-----GGGDNSGTAENGRHSDLAALYTIVAVFP :.::: .: ::::.::.: :. : :.:::... : .. ::::. ::..:.:: CCDS63 AEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPRRHPLCCGSGDNTANPERSKPSDLASTYTVLATFP 880 890 900 910 920 930 810 820 830 840 pF1KA1 SPLAAQNASLRLNNSVSRFKLRMAKKNYDLRILERASSQ : ::::: . :::..:::: .::.::. CCDS63 SISAAQNALKKQINSVNKFKLRTSKKHYDFHILERASSQ 940 950 960 970 >>CCDS2177.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (1099 aa) initn: 2075 init1: 746 opt: 895 Z-score: 442.5 bits: 93.3 E(32554): 2.5e-18 Smith-Waterman score: 2480; 48.8% identity (69.2% similar) in 887 aa overlap (1-751:136-1005) 10 20 30 pF1KA1 MLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNP :::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS21 IQLTQSFEKEEKPSKDEAEKEKASDKLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNP 110 120 130 140 150 160 40 50 60 70 80 90 pF1KA1 RDRMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVII ::::::::::::::.::..:.. :::: :::::::::::::::::.::::::.::.::. CCDS21 RDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRKKFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIV 170 180 190 200 210 220 100 110 120 130 pF1KA1 NKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQT--------------- :::::::::.:.:.:::::.:. .::.:.:::::..:.:.:::: CCDS21 NKTSNTRIPDQKFNEHIKDDKGEDFQKRYILKRDNSSFDKDDNQMRIRLKDDRRSKSIEE 230 240 250 260 270 280 140 150 160 170 pF1KA1 -------------------GQNGYLNDIRLSKEAFSSSSHKRRQIFRGNREGLSRTSSSR .:..:. : ::. : .::...:::::: :... .:...:. CCDS21 REEEYQRARDRIFSQDSLCSQENYIIDKRLQDED-ASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSH 290 300 310 320 330 340 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 QSSTDSELKSLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVTKASSFSGISILTRGDSIGSSK------ ::::..::: :::::::::::.:.:...: :::::::::::.:::::: :::: CCDS21 QSSTENELKYSEPRPWSSTDSDSSLRNLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSKSIGRLS 350 360 370 380 390 400 240 250 260 pF1KA1 ----------GGSAGRISR-----PGMAL-----GAPEVCNQVT--SSQSVRG------- :.:.: .:. :: :: ::: : :. :: : : CCDS21 KTGSESSGSVGSSTGSLSHIQQPLPGTALSQSSHGAPVVYPTVSTHSSLSFDGGLNGQVA 410 420 430 440 450 460 270 280 pF1KA1 -------LLPCTAQ------------------------------QQQQQQQQQLPALP-- ::: : . :: ..:.:. : CCDS21 SPSTSFFLLPLEAAGIPPGSILINPQTGQPFINPDGSPVVYNPPMTQQPVRSQVPGPPQP 470 480 490 500 510 520 290 300 310 320 330 340 pF1KA1 --PTPQQQPPLNNHMISQADDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADPSAALFQTPLISQHPQQTS :.: ::: ::..:: :.:.. :..:::.:: :....:: ::.::. .. : :::.. CCDS21 PLPAPPQQPA-ANHIFSQ-DNLGSQFSHMSLARQPSADGSDPHAAMFQSTVVLQSPQQSG 530 540 550 560 570 580 350 360 370 pF1KA1 FIMAST--------------------GQPLPTSNYSTSSHAPPTQQVLPPQGYMQPPQ-Q .::... :::.::..: .:.: : .: :: :::.: :. : CCDS21 YIMTAAPPPHPPPPPPPPPPPPPLPPGQPVPTAGYPASGH-PVSQPVLQQQGYIQQPSPQ 590 600 610 620 630 640 380 390 400 410 420 430 pF1KA1 IQVSYYPPGQYPNSNQQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMI . . : ::.: .:. ::::. : :. . .: ::::.:: : : ..::::: :::.. CCDS21 MPACYCAPGHYHSSQPQYRPVPS-VHYNSHLNQPLPQPAQQTGYQ-VIPNQQQN-YQGIV 650 660 670 680 690 440 450 460 470 480 490 pF1KA1 GVQQPQNQGLLSSQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGSDSQNVVQPPFQQPMLVPVS ::::::.:.:.:.: .:.:.:.::.:. :: .:.::: . . ::.. . .:::.. : . CCDS21 GVQQPQSQSLVSGQPNSIGNQIQGVVIPYTSVPTYQVSLPQGSQGIPHQTYQQPVMFP-N 700 710 720 730 740 750 500 510 520 530 540 550 pF1KA1 QSVQGGLPAAGVPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQYQMPQSPSPCSPPQMPQQY :: ::..:..:.:::::.:::.:::. : :::.:: ::::: :.:.. :::: :. . CCDS21 QSNQGSMPTTGMPVYYSVIPPGQQNNLSSSVGYLQHPGSEQVQFPRTTSPCSSQQLQGHQ 760 770 780 790 800 810 560 570 580 590 600 610 pF1KA1 SGVSPSGP---GVVVMQLNVPNGPQP-PQNPSMVQWSHCKYYSMDQRGQKPGDLYSPDSS ..: : :.:.:::.:::.:: ..: ::.. ::: ::::: .. : :. CCDS21 CTAGPPPPPGGGMVMMQLSVPNNPQSCAHSPP--QWKQNKYYCDHQRGQKCVEFSSVDNI 820 830 840 850 860 870 620 630 640 650 660 670 pF1KA1 PQANTQMSSSPVTSPTQSPAPSPVTSLSSVCTGLSPLPVLTQFPRPGGPAQGDGRYSLLG : . :.:: :. ::.:::::. ...:..: . :: .. :: :: :.:::.:: ::: CCDS21 VQHSPQLSS-PIISPAQSPAPAQLSTLKTVRPSGPPLSIMPQFSRPFVPGQGDSRYPLLG 880 890 900 910 920 930 680 690 700 710 720 730 pF1KA1 QPLQYNLSICPP-LLHGQSTYTVHQGQSGLKHGNRGKRQALKSASTDLGTADVVLGRVLE :::::: :: .:::. .::: : .:::::.::: :.::::::....:.:.::: CCDS21 QPLQYN----PPAVLHGH--IPNQQGQPGSRHGNRGRRQAKKAASTDLGAGETVVGKVLE 940 950 960 970 980 740 750 760 770 780 790 pF1KA1 VTDLPEGITRTEADKLFTQLAMSGAKIQWLKDAQGLPGGGGGDNSGTAENGRHSDLAALY .:.::.:::: ::.::: CCDS21 ITELPDGITRMEAEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPRRHPLCCGSGDNTANPERSKPSD 990 1000 1010 1020 1030 1040 >>CCDS2661.1 ARPP21 gene_id:10777|Hs108|chr3 (812 aa) initn: 1498 init1: 743 opt: 888 Z-score: 441.1 bits: 92.6 E(32554): 3e-18 Smith-Waterman score: 1654; 45.9% identity (66.6% similar) in 653 aa overlap (1-524:132-775) 10 20 30 pF1KA1 MLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNP :::.: ::::::::::::::::.::::.: CCDS26 EEDKSRKDDSEREKEKDKNKDKTSEKPKIRMLSKDCSQEYTDSTGIDLHEFLINTLKNNS 110 120 130 140 150 160 40 50 60 70 80 90 pF1KA1 RDRMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVII ::::.:::.::::..:: ::::..::::::.::.:::.::::::::.:::::::::.::: CCDS26 RDRMILLKMEQEIIDFIADNNNHYKKFPQMSSYQRMLVHRVAAYFGLDHNVDQTGKSVII 170 180 190 200 210 220 100 110 120 130 140 pF1KA1 NKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQTGQNGYLNDIRLSK-- ::::.:::::::: ::.::::. : :.:::::::..:.:..::: .. . : : :: CCDS26 NKTSSTRIPEQRFCEHLKDEKGEESQKRFILKRDNSSIDKEDNQQNRMHPFRDDRRSKSI 230 240 250 260 270 280 150 160 170 pF1KA1 ------------EAFSSSS------------------------HKRRQIFRGNREGLSRT . :. .: .:.::.:::::.: .:: CCDS26 EEREEEYQRVRERIFAHDSVCSQESLFVENSRLLEDSNICNETYKKRQLFRGNRDGSGRT 290 300 310 320 330 340 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 SSSRQSSTDSELK-SLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVTKASSFSGISILTRGDSIGSSKG :.:::::...::: : . : :::::::.: :...: .::..::.::..:::::: .:... CCDS26 SGSRQSSSENELKWSDHQRAWSSTDSDSSNRNLKPAMTKTASFGGITVLTRGDSTSSTRS 350 360 370 380 390 400 240 250 pF1KA1 ---------------GSAGRISR--P---------GMALGAPE--------VCNQVTSSQ ::.: .:: : :.: :.: . .::. :. CCDS26 TGKLSKAGSESSSSAGSSGSLSRTHPPLQSTPLVSGVAAGSPGCVPYPENGIGGQVAPSS 410 420 430 440 450 460 260 270 pF1KA1 SVRGLLPCTAQ-------------------------------------------QQQQQQ . ::: : :.::: CCDS26 TSYILLPLEAATGIPPGSILLNPHTGQPFVNPDGTPAIYNPPTSQQPLRSAMVGQSQQQP 470 480 490 500 510 520 280 290 300 310 320 330 pF1KA1 QQQLPALPPTPQQQPP---LNNHMISQADDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADP-SAALFQTP :: :. : : ::: . . ...: ::... ::::.::::.: :. .: :. .. . CCDS26 PQQQPSPQPQQQVQPPQPQMAGPLVTQRDDVATQFGQMTLSRQSSGETPEPPSGPVYPSS 530 540 550 560 570 580 340 350 360 370 380 pF1KA1 LISQHPQQTSFIMASTGQPLPTSNYSTSSHAPP-TQQVL-PP---QGYMQ--PPQQIQVS :. : :: :...::::: :::...: : .:: .:::: :: ::..: :: :. : CCDS26 LMPQPAQQPSYVIASTGQQLPTGGFSGS--GPPISQQVLQPPPSPQGFVQQPPPAQMPVY 590 600 610 620 630 390 400 410 420 430 440 pF1KA1 YYPPGQYPNSN-QQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMIGVQ ::: ::::.:. :::::.. :: :. ::.::.:: .:: : ::.. .:: ..::.:::: CCDS26 YYPSGQYPTSTTQQYRPMA-PVQYNAQRSQQMPQAAQQAGYQPVLSGQQ--GFQGLIGVQ 640 650 660 670 680 690 450 460 470 480 490 500 pF1KA1 QP-QNQGLLSSQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGSDSQNVVQPPFQQPMLVPVSQS :: :.:.....:. : .:...:.: . :::::. . ::.. : .:::...: .:. CCDS26 QPPQSQNVINNQQ---GTPVQSVMVSYPTMSSYQVPMTQGSQGLPQQSYQQPIMLP-NQA 700 710 720 730 740 750 510 520 530 540 550 560 pF1KA1 VQGGLPAAGVPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQYQMPQSPSPCSPPQMPQQYSG ::.:::.:.::: .. ::. :: CCDS26 GQGSLPATGMPVYCNVTPPTPQNNLRLIGPHCPSSTVPVMSASCRTNCASMSNAGWQVKF 760 770 780 790 800 810 >>CCDS63024.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (1044 aa) initn: 2094 init1: 746 opt: 877 Z-score: 434.3 bits: 91.7 E(32554): 7.2e-18 Smith-Waterman score: 2491; 48.8% identity (69.2% similar) in 887 aa overlap (1-751:80-950) 10 20 30 pF1KA1 MLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNP :::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS63 IQLTQSFEKEEKPSKDEAEKEKASDKLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNP 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 pF1KA1 RDRMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVII ::::::::::::::.::..:.. :::: :::::::::::::::::.::::::.::.::. CCDS63 RDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRKKFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIV 110 120 130 140 150 160 100 110 120 130 pF1KA1 NKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQT--------------- :::::::::.:.:.:::::.:. .::.:.:::::..:.:.:::: CCDS63 NKTSNTRIPDQKFNEHIKDDKGEDFQKRYILKRDNSSFDKDDNQMRIRLKDDRRSKSIEE 170 180 190 200 210 220 140 150 160 170 pF1KA1 -------------------GQNGYLNDIRLSKEAFSSSSHKRRQIFRGNREGLSRTSSSR .:..:. : ::. : .::...:::::: :... .:...:. CCDS63 REEEYQRARDRIFSQDSLCSQENYIIDKRLQDED-ASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSH 230 240 250 260 270 280 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 QSSTDSELKSLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVTKASSFSGISILTRGDSIGSSK------ ::::..::: :::::::::::.:.:...: :::::::::::.:::::: :::: CCDS63 QSSTENELKYSEPRPWSSTDSDSSLRNLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSKSIGRLS 290 300 310 320 330 340 240 250 260 pF1KA1 ----------GGSAGRISR-----PGMAL-----GAPEVCNQVT--SSQSVRG------- :.:.: .:. :: :: ::: : :. :: : : CCDS63 KTGSESSGSVGSSTGSLSHIQQPLPGTALSQSSHGAPVVYPTVSTHSSLSFDGGLNGQVA 350 360 370 380 390 400 270 280 pF1KA1 -------LLPCTAQ------------------------------QQQQQQQQQLPALP-- ::: : . :: ..:.:. : CCDS63 SPSTSFFLLPLEAAGIPPGSILINPQTGQPFINPDGSPVVYNPPMTQQPVRSQVPGPPQP 410 420 430 440 450 460 290 300 310 320 330 340 pF1KA1 --PTPQQQPPLNNHMISQADDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADPSAALFQTPLISQHPQQTS :.: ::: ::..:: :.:.. :..:::.:: :....:: ::.::. .. : :::.. CCDS63 PLPAPPQQPA-ANHIFSQQDNLGSQFSHMSLARQPSADGSDPHAAMFQSTVVLQSPQQSG 470 480 490 500 510 520 350 360 370 pF1KA1 FIMAST--------------------GQPLPTSNYSTSSHAPPTQQVLPPQGYMQPPQ-Q .::... :::.::..: .:.: : .: :: :::.: :. : CCDS63 YIMTAAPPPHPPPPPPPPPPPPPLPPGQPVPTAGYPASGH-PVSQPVLQQQGYIQQPSPQ 530 540 550 560 570 580 380 390 400 410 420 430 pF1KA1 IQVSYYPPGQYPNSNQQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMI . . : ::.: .:. ::::. : :. . .: ::::.:: : : ..::::: :::.. CCDS63 MPACYCAPGHYHSSQPQYRPVPS-VHYNSHLNQPLPQPAQQTGYQ-VIPNQQQN-YQGIV 590 600 610 620 630 640 440 450 460 470 480 490 pF1KA1 GVQQPQNQGLLSSQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGSDSQNVVQPPFQQPMLVPVS ::::::.:.:.:.: .:.:.:.::.:. :: .:.::: . . ::.. . .:::.. : . CCDS63 GVQQPQSQSLVSGQPNSIGNQIQGVVIPYTSVPTYQVSLPQGSQGIPHQTYQQPVMFP-N 650 660 670 680 690 700 500 510 520 530 540 550 pF1KA1 QSVQGGLPAAGVPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQYQMPQSPSPCSPPQMPQQY :: ::..:..:.:::::.:::.:::. : :::.:: ::::: :.:.. :::: :. . 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CCDS63 CTAGPPPPPGGGMVMMQLSVPNNPQSCAHSPP--QWKQNKYYCDHQRGQKCVEFSSVDNI 770 780 790 800 810 820 620 630 640 650 660 670 pF1KA1 PQANTQMSSSPVTSPTQSPAPSPVTSLSSVCTGLSPLPVLTQFPRPGGPAQGDGRYSLLG : . :.:: :. ::.:::::. ...:..: . :: .. :: :: :.:::.:: ::: CCDS63 VQHSPQLSS-PIISPAQSPAPAQLSTLKTVRPSGPPLSIMPQFSRPFVPGQGDSRYPLLG 830 840 850 860 870 680 690 700 710 720 730 pF1KA1 QPLQYNLSICPP-LLHGQSTYTVHQGQSGLKHGNRGKRQALKSASTDLGTADVVLGRVLE :::::: :: .:::. .::: : .:::::.::: :.::::::....:.:.::: CCDS63 QPLQYN----PPAVLHGH--IPNQQGQPGSRHGNRGRRQAKKAASTDLGAGETVVGKVLE 880 890 900 910 920 930 740 750 760 770 780 790 pF1KA1 VTDLPEGITRTEADKLFTQLAMSGAKIQWLKDAQGLPGGGGGDNSGTAENGRHSDLAALY .:.::.:::: ::.::: CCDS63 ITELPDGITRMEAEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPRRHPLCCGSGDNTANPERSKPSD 940 950 960 970 980 990 >>CCDS63025.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (1100 aa) initn: 2094 init1: 746 opt: 877 Z-score: 434.0 bits: 91.7 E(32554): 7.5e-18 Smith-Waterman score: 2491; 48.8% identity (69.2% similar) in 887 aa overlap (1-751:136-1006) 10 20 30 pF1KA1 MLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNP :::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS63 IQLTQSFEKEEKPSKDEAEKEKASDKLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNP 110 120 130 140 150 160 40 50 60 70 80 90 pF1KA1 RDRMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVII ::::::::::::::.::..:.. :::: :::::::::::::::::.::::::.::.::. CCDS63 RDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRKKFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIV 170 180 190 200 210 220 100 110 120 130 pF1KA1 NKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQT--------------- :::::::::.:.:.:::::.:. .::.:.:::::..:.:.:::: CCDS63 NKTSNTRIPDQKFNEHIKDDKGEDFQKRYILKRDNSSFDKDDNQMRIRLKDDRRSKSIEE 230 240 250 260 270 280 140 150 160 170 pF1KA1 -------------------GQNGYLNDIRLSKEAFSSSSHKRRQIFRGNREGLSRTSSSR .:..:. : ::. : .::...:::::: :... .:...:. CCDS63 REEEYQRARDRIFSQDSLCSQENYIIDKRLQDED-ASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSH 290 300 310 320 330 340 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 QSSTDSELKSLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVTKASSFSGISILTRGDSIGSSK------ ::::..::: :::::::::::.:.:...: :::::::::::.:::::: :::: CCDS63 QSSTENELKYSEPRPWSSTDSDSSLRNLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSKSIGRLS 350 360 370 380 390 400 240 250 260 pF1KA1 ----------GGSAGRISR-----PGMAL-----GAPEVCNQVT--SSQSVRG------- :.:.: .:. :: :: ::: : :. :: : : CCDS63 KTGSESSGSVGSSTGSLSHIQQPLPGTALSQSSHGAPVVYPTVSTHSSLSFDGGLNGQVA 410 420 430 440 450 460 270 280 pF1KA1 -------LLPCTAQ------------------------------QQQQQQQQQLPALP-- ::: : . :: ..:.:. : CCDS63 SPSTSFFLLPLEAAGIPPGSILINPQTGQPFINPDGSPVVYNPPMTQQPVRSQVPGPPQP 470 480 490 500 510 520 290 300 310 320 330 340 pF1KA1 --PTPQQQPPLNNHMISQADDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADPSAALFQTPLISQHPQQTS :.: ::: ::..:: :.:.. :..:::.:: :....:: ::.::. .. : :::.. CCDS63 PLPAPPQQPA-ANHIFSQQDNLGSQFSHMSLARQPSADGSDPHAAMFQSTVVLQSPQQSG 530 540 550 560 570 580 350 360 370 pF1KA1 FIMAST--------------------GQPLPTSNYSTSSHAPPTQQVLPPQGYMQPPQ-Q .::... :::.::..: .:.: : .: :: :::.: :. : CCDS63 YIMTAAPPPHPPPPPPPPPPPPPLPPGQPVPTAGYPASGH-PVSQPVLQQQGYIQQPSPQ 590 600 610 620 630 640 380 390 400 410 420 430 pF1KA1 IQVSYYPPGQYPNSNQQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMI . . : ::.: .:. ::::. : :. . .: ::::.:: : : ..::::: :::.. CCDS63 MPACYCAPGHYHSSQPQYRPVPS-VHYNSHLNQPLPQPAQQTGYQ-VIPNQQQN-YQGIV 650 660 670 680 690 440 450 460 470 480 490 pF1KA1 GVQQPQNQGLLSSQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGSDSQNVVQPPFQQPMLVPVS ::::::.:.:.:.: .:.:.:.::.:. :: .:.::: . . ::.. . .:::.. : . CCDS63 GVQQPQSQSLVSGQPNSIGNQIQGVVIPYTSVPTYQVSLPQGSQGIPHQTYQQPVMFP-N 700 710 720 730 740 750 500 510 520 530 540 550 pF1KA1 QSVQGGLPAAGVPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQYQMPQSPSPCSPPQMPQQY :: ::..:..:.:::::.:::.:::. : :::.:: ::::: :.:.. :::: :. . 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CCDS63 CTAGPPPPPGGGMVMMQLSVPNNPQSCAHSPP--QWKQNKYYCDHQRGQKCVEFSSVDNI 820 830 840 850 860 870 620 630 640 650 660 670 pF1KA1 PQANTQMSSSPVTSPTQSPAPSPVTSLSSVCTGLSPLPVLTQFPRPGGPAQGDGRYSLLG : . :.:: :. ::.:::::. ...:..: . :: .. :: :: :.:::.:: ::: CCDS63 VQHSPQLSS-PIISPAQSPAPAQLSTLKTVRPSGPPLSIMPQFSRPFVPGQGDSRYPLLG 880 890 900 910 920 930 680 690 700 710 720 730 pF1KA1 QPLQYNLSICPP-LLHGQSTYTVHQGQSGLKHGNRGKRQALKSASTDLGTADVVLGRVLE :::::: :: .:::. .::: : .:::::.::: :.::::::....:.:.::: CCDS63 QPLQYN----PPAVLHGH--IPNQQGQPGSRHGNRGRRQAKKAASTDLGAGETVVGKVLE 940 950 960 970 980 740 750 760 770 780 790 pF1KA1 VTDLPEGITRTEADKLFTQLAMSGAKIQWLKDAQGLPGGGGGDNSGTAENGRHSDLAALY .:.::.:::: ::.::: CCDS63 ITELPDGITRMEAEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPRRHPLCCGSGDNTANPERSKPSD 990 1000 1010 1020 1030 1040 840 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Wed Nov 2 20:13:31 2016 done: Wed Nov 2 20:13:32 2016 Total Scan time: 5.380 Total Display time: 0.320 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]