Result of FASTA (ccds) for pF1KA0996
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0996, 848 aa
  1>>>pF1KA0996 848 - 848 aa - 848 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9142+/- 0.001; mu= -0.0585+/- 0.060
 mean_var=235.0653+/-49.893, 0's: 0 Z-trim(111.8): 48  B-trim: 98 in 1/50
 Lambda= 0.083653
 statistics sampled from 12610 (12644) to 12610 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.72), E-opt: 0.2 (0.388), width:  16
 Scan time:  3.780

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9477.1 DZIP1 gene_id:22873|Hs108|chr13         ( 848) 5569 685.7  9e-197
CCDS9478.1 DZIP1 gene_id:22873|Hs108|chr13         ( 867) 3029 379.2 1.7e-104
CCDS54645.1 DZIP1L gene_id:199221|Hs108|chr3       ( 539)  964 129.8 1.2e-29
CCDS3096.1 DZIP1L gene_id:199221|Hs108|chr3        ( 767)  964 129.9 1.7e-29


>>CCDS9477.1 DZIP1 gene_id:22873|Hs108|chr13              (848 aa)
 initn: 5569 init1: 5569 opt: 5569  Z-score: 3646.1  bits: 685.7 E(32554): 9e-197
Smith-Waterman score: 5569; 100.0% identity (100.0% similar) in 848 aa overlap (1-848:1-848)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MQAEAADWFSSMPFQKHVYYPLASGPEGPDVAVAAAAAGAASMACAPPSAASGPLPFFQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MQAEAADWFSSMPFQKHVYYPLASGPEGPDVAVAAAAAGAASMACAPPSAASGPLPFFQF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 RPRLESVDWRRLSAIDVDKVAGAVDVLTLQENIMNITFCKLEDEKCPHCQSGVDPVLLKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 RPRLESVDWRRLSAIDVDKVAGAVDVLTLQENIMNITFCKLEDEKCPHCQSGVDPVLLKL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 IRLAQFTIEYLLHSQEFLTSQLHTLEERLRLSHCDGEQSKKLLTKQAGEIKTLKEECKRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 IRLAQFTIEYLLHSQEFLTSQLHTLEERLRLSHCDGEQSKKLLTKQAGEIKTLKEECKRR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 KKMISTQQLMIEAKANYYQCHFCDKAFMNQAFLQSHIQRRHTEENSHFEYQKNAQIEKLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KKMISTQQLMIEAKANYYQCHFCDKAFMNQAFLQSHIQRRHTEENSHFEYQKNAQIEKLR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 SEIVVLKEELQLTRSELEAAHHASAVRFSKEYEMQKTKEEDFLKLFDRWKEEEKEKLVDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SEIVVLKEELQLTRSELEAAHHASAVRFSKEYEMQKTKEEDFLKLFDRWKEEEKEKLVDE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 MEKVKEMFMKEFKELTSKNSALEYQLSEIQKSNMQIKSNIGTLKDAHEFKEDRSPYPQDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MEKVKEMFMKEFKELTSKNSALEYQLSEIQKSNMQIKSNIGTLKDAHEFKEDRSPYPQDF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 HNVMQLLDSQESKWTARVQAIHQEHKKEKGRLLSHIEKLRTSMIDDLNASNVFYKKRIEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 HNVMQLLDSQESKWTARVQAIHQEHKKEKGRLLSHIEKLRTSMIDDLNASNVFYKKRIEE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 LGQRLQEQNELIITQRQQIKDFTCNPLNSISEPKVNAPALHTLETKSSLPMVHEQAFSSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LGQRLQEQNELIITQRQQIKDFTCNPLNSISEPKVNAPALHTLETKSSLPMVHEQAFSSH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 ILEPIEELSEEEKGRENEQKLNNNKMHLRKALKSNSSLTKGLRTMVEQNLMEKLETLGIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ILEPIEELSEEEKGRENEQKLNNNKMHLRKALKSNSSLTKGLRTMVEQNLMEKLETLGIN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 ADIRGISSDQLHRVLKSVESERHKQEREIPNFHQIREFLEHQVSCKIEEKALLSSDQCSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ADIRGISSDQLHRVLKSVESERHKQEREIPNFHQIREFLEHQVSCKIEEKALLSSDQCSV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 SQMDTLSTGEVPKMIQLPSKNRQLIRQKAVSTDRTSVPKIKKNVMEDPFPRKSSTITTPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SQMDTLSTGEVPKMIQLPSKNRQLIRQKAVSTDRTSVPKIKKNVMEDPFPRKSSTITTPP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 FSSEEEQEDDDLIRAYASPGPLPVPPPQNKGSFGKNTVKSDADGTEGSEIEDTDDSPKPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 FSSEEEQEDDDLIRAYASPGPLPVPPPQNKGSFGKNTVKSDADGTEGSEIEDTDDSPKPA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 GVAVKTPTEKVEKMFPHRKNVNKPVGGTNVPEMFIKKEELQELKCADVEDEDWDISSLEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 GVAVKTPTEKVEKMFPHRKNVNKPVGGTNVPEMFIKKEELQELKCADVEDEDWDISSLEE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 EISLGKKSGKEQKEPPPAKNEPHFAHVLNAWGAFNPKGPKGEGLQENESSTLKSSLVTVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 EISLGKKSGKEQKEPPPAKNEPHFAHVLNAWGAFNPKGPKGEGLQENESSTLKSSLVTVT
              790       800       810       820       830       840

               
pF1KA0 DWSDTSDV
       ::::::::
CCDS94 DWSDTSDV
               

>>CCDS9478.1 DZIP1 gene_id:22873|Hs108|chr13              (867 aa)
 initn: 3026 init1: 3026 opt: 3029  Z-score: 1989.3  bits: 379.2 E(32554): 1.7e-104
Smith-Waterman score: 5517; 97.7% identity (97.8% similar) in 867 aa overlap (1-848:1-867)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MQAEAADWFSSMPFQKHVYYPLASGPEGPDVAVAAAAAGAASMACAPPSAASGPLPFFQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MQAEAADWFSSMPFQKHVYYPLASGPEGPDVAVAAAAAGAASMACAPPSAASGPLPFFQF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 RPRLESVDWRRLSAIDVDKVAGAVDVLTLQENIMNITFCKLEDEKCPHCQSGVDPVLLKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 RPRLESVDWRRLSAIDVDKVAGAVDVLTLQENIMNITFCKLEDEKCPHCQSGVDPVLLKL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 IRLAQFTIEYLLHSQEFLTSQLHTLEERLRLSHCDGEQSKKLLTKQAGEIKTLKEECKRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 IRLAQFTIEYLLHSQEFLTSQLHTLEERLRLSHCDGEQSKKLLTKQAGEIKTLKEECKRR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 KKMISTQQLMIEAKANYYQCHFCDKAFMNQAFLQSHIQRRHTEENSHFEYQKNAQIEKLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KKMISTQQLMIEAKANYYQCHFCDKAFMNQAFLQSHIQRRHTEENSHFEYQKNAQIEKLR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 SEIVVLKEELQLTRSELEAAHHASAVRFSKEYEMQKTKEEDFLKLFDRWKEEEKEKLVDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SEIVVLKEELQLTRSELEAAHHASAVRFSKEYEMQKTKEEDFLKLFDRWKEEEKEKLVDE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 MEKVKEMFMKEFKELTSKNSALEYQLSEIQKSNMQIKSNIGTLKDAHEFKEDRSPYPQDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MEKVKEMFMKEFKELTSKNSALEYQLSEIQKSNMQIKSNIGTLKDAHEFKEDRSPYPQDF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 HNVMQLLDSQESKWTARVQAIHQEHKKEKGRLLSHIEKLRTSMIDDLNASNVFYKKRIEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 HNVMQLLDSQESKWTARVQAIHQEHKKEKGRLLSHIEKLRTSMIDDLNASNVFYKKRIEE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450                          460 
pF1KA0 LGQRLQEQNELIITQRQQIKDFTCNPLNSISEPK-------------------VNAPALH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::                   .::::::
CCDS94 LGQRLQEQNELIITQRQQIKDFTCNPLNSISEPKGNPLAWQAFESQPAAPAVPMNAPALH
              430       440       450       460       470       480

             470       480       490       500       510       520 
pF1KA0 TLETKSSLPMVHEQAFSSHILEPIEELSEEEKGRENEQKLNNNKMHLRKALKSNSSLTKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 TLETKSSLPMVHEQAFSSHILEPIEELSEEEKGRENEQKLNNNKMHLRKALKSNSSLTKG
              490       500       510       520       530       540

             530       540       550       560       570       580 
pF1KA0 LRTMVEQNLMEKLETLGINADIRGISSDQLHRVLKSVESERHKQEREIPNFHQIREFLEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LRTMVEQNLMEKLETLGINADIRGISSDQLHRVLKSVESERHKQEREIPNFHQIREFLEH
              550       560       570       580       590       600

             590       600       610       620       630       640 
pF1KA0 QVSCKIEEKALLSSDQCSVSQMDTLSTGEVPKMIQLPSKNRQLIRQKAVSTDRTSVPKIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 QVSCKIEEKALLSSDQCSVSQMDTLSTGEVPKMIQLPSKNRQLIRQKAVSTDRTSVPKIK
              610       620       630       640       650       660

             650       660       670       680       690       700 
pF1KA0 KNVMEDPFPRKSSTITTPPFSSEEEQEDDDLIRAYASPGPLPVPPPQNKGSFGKNTVKSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KNVMEDPFPRKSSTITTPPFSSEEEQEDDDLIRAYASPGPLPVPPPQNKGSFGKNTVKSD
              670       680       690       700       710       720

             710       720       730       740       750       760 
pF1KA0 ADGTEGSEIEDTDDSPKPAGVAVKTPTEKVEKMFPHRKNVNKPVGGTNVPEMFIKKEELQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ADGTEGSEIEDTDDSPKPAGVAVKTPTEKVEKMFPHRKNVNKPVGGTNVPEMFIKKEELQ
              730       740       750       760       770       780

             770       780       790       800       810       820 
pF1KA0 ELKCADVEDEDWDISSLEEEISLGKKSGKEQKEPPPAKNEPHFAHVLNAWGAFNPKGPKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ELKCADVEDEDWDISSLEEEISLGKKSGKEQKEPPPAKNEPHFAHVLNAWGAFNPKGPKG
              790       800       810       820       830       840

             830       840        
pF1KA0 EGLQENESSTLKSSLVTVTDWSDTSDV
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 EGLQENESSTLKSSLVTVTDWSDTSDV
              850       860       

>>CCDS54645.1 DZIP1L gene_id:199221|Hs108|chr3            (539 aa)
 initn: 727 init1: 611 opt: 964  Z-score: 645.5  bits: 129.8 E(32554): 1.2e-29
Smith-Waterman score: 1067; 35.8% identity (67.4% similar) in 567 aa overlap (52-609:12-539)

              30        40        50              60        70     
pF1KA0 LASGPEGPDVAVAAAAAGAASMACAPPSAASGPL------PFFQFRPRLESVDWRRLSAI
                                     ::::      : :.:.:: .:.::::.:..
CCDS54                    MQSPAATAEGLSGPLFGAYTFPTFKFQPRHDSMDWRRISTL
                                  10        20        30        40 

          80        90       100       110       120       130     
pF1KA0 DVDKVAGAVDVLTLQENIMNITFCKLEDEKCPHCQSGVDPVLLKLIRLAQFTIEYLLHSQ
       :::.::  .:: :::::: .::::.:. : : .: . :::.:::..::::. :::::: :
CCDS54 DVDRVARELDVATLQENIAGITFCNLDREVCSRCGQPVDPALLKVLRLAQLIIEYLLHCQ
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pF1KA0 EFLTSQLHTLEERLRLSHCDGEQSKKLLTKQAGEIKTLKEECKRRKKMIST-QQLMIEAK
       . :....  :: ::. :  . ..... : .:: :.: ..:: .::.::::: :::.... 
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pF1KA0 AN-YYQCHFCDKAFMNQAFLQSHIQRRHTEENSHFEYQKNAQ-IEKLRSEIVVLKEELQL
       .. :. ::.:::.::: .::..::::::.      . .:. : .:..  :   :. .:. 
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       :..:::: ..:   :  .: :. . .: .  : ::.:::.:  ::  :..:.:..:  ::
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       :.....::.:: .:  .:. .. ..:..:.:.:  : .:.     .... . .  . :..
CCDS54 KNVAKQNSTLEEKLRALQSHSV-MESKLGSLRD--EESEEWLRQARELQALREKTEIQKT
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pF1KA0 KWTARVQAIHQEHKKEKGRLLSHIEKLRTSMIDDLNASNVFYKKRIEELGQRLQEQNELI
       .:  .:. .:.::  :: .:  . ..:..:. .: . . .  . .:  :  .:::: ..:
CCDS54 EWKRKVKELHEEHMAEKKELQEENQRLQASLSQDQKKAAAQSQCQISTLRAQLQEQARII
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pF1KA0 ITQRQQIKDFTCNPLNSISEPKVNAPALHTLETKSSLPMVHEQAFSSHILEPIEELSEEE
        .:...:.        :.:  ::..  .:      ..:    .: ..      :: : ::
CCDS54 ASQEEMIQ--------SLSLRKVEG--IH------KVP----KAVDT------EEDSPEE
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pF1KA0 KGRENEQKLNNNKMHLRKALKSNSSLTKGLRTMVEQNLMEKLETLGINADIRGISSDQLH
       .  :. :   ... ..  ::. : .: : .: ..:..: ::::..::  : .::: . :.
CCDS54 E-MEDSQ---DEQHKVLAALRRNPTLLKHFRPILEDTLEEKLESMGIRKDAKGISIQTLR
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pF1KA0 RVLKSVESERHKQEREIPNFHQIREFLEHQVSCKIEEKALLSSDQCSVSQMDTLSTGEVP
       .. . .. .:... :.. .: ..:  : ..:. . .:.   . .   ::: :   .:   
CCDS54 HLESLLRVQREQKARKFSEFLSLRGKLVKEVTSRAKER---QENGAVVSQPDGQPSG   
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>>CCDS3096.1 DZIP1L gene_id:199221|Hs108|chr3             (767 aa)
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CCDS30                    MQSPAATAEGLSGPLFGAYTFPTFKFQPRHDSMDWRRISTL
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pF1KA0 EFLTSQLHTLEERLRLSHCDGEQSKKLLTKQAGEIKTLKEECKRRKKMIST-QQLMIEAK
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       .. :. ::.:::.::: .::..::::::.      . .:. : .:..  :   :. .:. 
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       :..:::: ..:   :  .: :. . .: .  : ::.:::.:  ::  :..:.:..:  ::
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pF1KA0 KELTSKNSALEYQLSEIQKSNMQIKSNIGTLKDAHEFKEDRSPYPQDFHNVMQLLDSQES
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CCDS30 KNVAKQNSTLEEKLRALQSHSV-MESKLGSLRD--EESEEWLRQARELQALREKTEIQKT
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CCDS30 EWKRKVKELHEEHMAEKKELQEENQRLQASLSQDQKKAAAQSQCQISTLRAQLQEQARII
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        ..  ..::::::::..: : . :.  .:  .:   :: :..  ..      ::   :: 
CCDS30 SSGPGMSTPPFSSEEDSEGDRVQRVSLQPPKVPSRMVPRPKDDWDW------SD---TET
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       :: :...   . .:. :.. ....::..  .  ..::.::...   :.   ..      :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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