seq1 = pF1KA0830.tfa, 1500 bp seq2 = pF1KA0830/gi568815587f_94989928.tfa (gi568815587f:94989928_95229576), 239649 bp >pF1KA0830 1500 >gi568815587f:94989928_95229576 (Chr11) 1-300 (100001-100300) 100% -> 301-1500 (138450-139649) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGGCACCGCGCGCTGGCTCGCGCTGGGCAGCCTCTTCGCCCTGGCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGGCACCGCGCGCTGGCTCGCGCTGGGCAGCCTCTTCGCCCTGGCTGG 50 . : . : . : . : . : 51 GCTGCTGGAAGGCCGGCTCGTGGGCGAGGAGGAAGCCGGCTTTGGCGAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GCTGCTGGAAGGCCGGCTCGTGGGCGAGGAGGAAGCCGGCTTTGGCGAAT 100 . : . : . : . : . : 101 GTGACAAGTTCTTCTACGCCGGGACCCCGCCTGCGGGGCTGGCGGCCGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 GTGACAAGTTCTTCTACGCCGGGACCCCGCCTGCGGGGCTGGCGGCCGAT 150 . : . : . : . : . : 151 TCCCACGTGAAGATCTGTCAGCGCGCGGAGGGTGCTGAGCGCTTCGCCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 TCCCACGTGAAGATCTGTCAGCGCGCGGAGGGTGCTGAGCGCTTCGCCAC 200 . : . : . : . : . : 201 CCTCTACAGCACCCGGGACCGCATCCCCGTGTACTCCGCGTTCCGCGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100201 CCTCTACAGCACCCGGGACCGCATCCCCGTGTACTCCGCGTTCCGCGCCC 250 . : . : . : . : . : 251 CGCGCCCTGCGCCCGGCGGCGCCGAGCAGCGATGGCTGGTGGAGCCGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100251 CGCGCCCTGCGCCCGGCGGCGCCGAGCAGCGATGGCTGGTGGAGCCGCAG 300 . : . : . : . : . : 301 ATCGATGACCCCAACAGCAACCTTGAGGAGGCGATTAATGA >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100301 GTA...CAGATCGATGACCCCAACAGCAACCTTGAGGAGGCGATTAATGA 350 . : . : . : . : . : 342 GGCAGAGGCCATCACCTCTGTGAACAGCCTGGGAAGCAAGCAAGCCTTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 138491 GGCAGAGGCCATCACCTCTGTGAACAGCCTGGGAAGCAAGCAAGCCTTGA 400 . : . : . : . : . : 392 ATACAGATTACCTTGATTCTGATTACCAAAGAGGACAGCTTTACCCATTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 138541 ATACAGATTACCTTGATTCTGATTACCAAAGAGGACAGCTTTACCCATTC 450 . : . : . : . : . : 442 TCCCTTAGCAGTGATGTCCAGGTGGCCACATTTACTCTCACAAATTCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 138591 TCCCTTAGCAGTGATGTCCAGGTGGCCACATTTACTCTCACAAATTCAGC 500 . : . : . : . : . : 492 CCCAATGACTCAGTCCTTCCAGGAACGGTGGTATGTGAATCTCCACAGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 138641 CCCAATGACTCAGTCCTTCCAGGAACGGTGGTATGTGAATCTCCACAGCC 550 . : . : . : . : . : 542 TAATGGACCGGGCTTTGACCCCACAGTGTGGCAGTGGGGAAGACCTATAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 138691 TAATGGACCGGGCTTTGACCCCACAGTGTGGCAGTGGGGAAGACCTATAT 600 . : . : . : . : . : 592 ATCCTCACAGGCACAGTGCCCTCAGACTACAGAGTTAAAGACAAAGTGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 138741 ATCCTCACAGGCACAGTGCCCTCAGACTACAGAGTTAAAGACAAAGTGGC 650 . : . : . : . : . : 642 AGTCCCTGAGTTTGTTTGGCTGGCAGCCTGTTGTGCTGTCCCTGGAGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 138791 AGTCCCTGAGTTTGTTTGGCTGGCAGCCTGTTGTGCTGTCCCTGGAGGAG 700 . : . : . : . : . : 692 GCTGGGCCATGGGCTTTGTCAAGCACACCCGGGACAGTGACATCATAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 138841 GCTGGGCCATGGGCTTTGTCAAGCACACCCGGGACAGTGACATCATAGAA 750 . : . : . : . : . : 742 GATGTGATGGTAAAAGATCTTCAGAAACTGCTTCCATTTAACCCTCAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 138891 GATGTGATGGTAAAAGATCTTCAGAAACTGCTTCCATTTAACCCTCAGCT 800 . : . : . : . : . : 792 GTTTCAGAACAACTGTGGTGAAACTGAGCAAGACACAGAGAAAATGAAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 138941 GTTTCAGAACAACTGTGGTGAAACTGAGCAAGACACAGAGAAAATGAAAA 850 . : . : . : . : . : 842 AAATCCTGGAAGTGGTTAACCAAATCCAGGATGAAGAACGAATGGTACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 138991 AAATCCTGGAAGTGGTTAACCAAATCCAGGATGAAGAACGAATGGTACAA 900 . : . : . : . : . : 892 TCTCAAAAGAGTTCTAGTCCCCTTTCTAGCACCAGGAGCAAGAGGTCTAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139041 TCTCAAAAGAGTTCTAGTCCCCTTTCTAGCACCAGGAGCAAGAGGTCTAC 950 . : . : . : . : . : 942 TCTGTTGCCTCCAGAGGCATCTGAGGGAAGTAGTAGCTTTTTGGGAAAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139091 TCTGTTGCCTCCAGAGGCATCTGAGGGAAGTAGTAGCTTTTTGGGAAAAC 1000 . : . : . : . : . : 992 TCATGGGCTTCATTGCTACCCCATTCATCAAGCTTTTTCAATTAATTTAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139141 TCATGGGCTTCATTGCTACCCCATTCATCAAGCTTTTTCAATTAATTTAT 1050 . : . : . : . : . : 1042 TACCTTGTGGTAGCAATCCTGAAGAACATTGTCTATTTCCTGTGGTGTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139191 TACCTTGTGGTAGCAATCCTGAAGAACATTGTCTATTTCCTGTGGTGTGT 1100 . : . : . : . : . : 1092 TACCAAGCAGGTGATTAATGGCATAGAAAGTTGCCTTTACCGCCTGGGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139241 TACCAAGCAGGTGATTAATGGCATAGAAAGTTGCCTTTACCGCCTGGGCT 1150 . : . : . : . : . : 1142 CAGCCACCATCTCATACTTCATGGCCATTGGGGAAGAGTTGGTGAGCATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139291 CAGCCACCATCTCATACTTCATGGCCATTGGGGAAGAGTTGGTGAGCATT 1200 . : . : . : . : . : 1192 CCCTGGAAGGTGCTCAAGGTCGTGGCCAAAGTCATCAGGGCTCTCCTCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139341 CCCTGGAAGGTGCTCAAGGTCGTGGCCAAAGTCATCAGGGCTCTCCTCCG 1250 . : . : . : . : . : 1242 GATCCTTTGTTGTCTGCTGAAGGCCATTTGCCGAGTTCTGAGCATCCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139391 GATCCTTTGTTGTCTGCTGAAGGCCATTTGCCGAGTTCTGAGCATCCCTG 1300 . : . : . : . : . : 1292 TCCGTGTCCTTGTGGATGTGGCCACTTTCCCTGTGTACACCATGGGCGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139441 TCCGTGTCCTTGTGGATGTGGCCACTTTCCCTGTGTACACCATGGGCGCT 1350 . : . : . : . : . : 1342 ATTCCAATTGTTTGCAAGGACATTGCACTGGGCCTTGGTGGCACTGTCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139491 ATTCCAATTGTTTGCAAGGACATTGCACTGGGCCTTGGTGGCACTGTCTC 1400 . : . : . : . : . : 1392 ACTGCTCTTTGACACTGCTTTTGGTACCCTGGGTGGCCTATTTCAGGTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139541 ACTGCTCTTTGACACTGCTTTTGGTACCCTGGGTGGCCTATTTCAGGTGG 1450 . : . : . : . : . : 1442 TTTTTAGTGTCTGCAAGCGGATTGGCTACAAGGTTACTTTTGACAATTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139591 TTTTTAGTGTCTGCAAGCGGATTGGCTACAAGGTTACTTTTGACAATTCT 1500 . 1492 GGGGAGTTA ||||||||| 139641 GGGGAGTTA