Result of FASTA (ccds) for pF1KA0802
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0802, 1545 aa
  1>>>pF1KA0802 1545 - 1545 aa - 1545 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2976+/-0.000965; mu= 11.3837+/- 0.058
 mean_var=219.6042+/-44.229, 0's: 0 Z-trim(112.0): 49  B-trim: 86 in 2/50
 Lambda= 0.086547
 statistics sampled from 12829 (12863) to 12829 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.395), width:  16
 Scan time:  3.790

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11841.1 MTCL1 gene_id:23255|Hs108|chr18        (1586) 6287 799.3       0
CCDS54459.1 SOGA1 gene_id:140710|Hs108|chr20       (1661) 1628 217.6 2.6e-55
CCDS46598.1 SOGA1 gene_id:140710|Hs108|chr20       (1016) 1622 216.7   3e-55
CCDS43505.1 SOGA3 gene_id:387104|Hs108|chr6        ( 947) 1353 183.1 3.7e-45


>>CCDS11841.1 MTCL1 gene_id:23255|Hs108|chr18             (1586 aa)
 initn: 6287 init1: 6287 opt: 6287  Z-score: 4250.8  bits: 799.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10228; 97.3% identity (97.4% similar) in 1577 aa overlap (10-1545:10-1586)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MEEMRDSYLEEDVYQLQELRRELDRANKNCRILQYRLRKAEQKSLKVAETGQVDGELIRS
                :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEEMRDSYLEEDVYQLQELRRELDRANKNCRILQYRLRKAEQKSLKVAETGQVDGELIRS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LEQDLKVAKDVSVRLHHELKTVEEKRAKAEDENETLRQQMIEVEISKQALQNELERLKES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LEQDLKVAKDVSVRLHHELKTVEEKRAKAEDENETLRQQMIEVEISKQALQNELERLKES
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 SLKRRSTREMYKEKKTFNQDDSADLRCQLQFAKEEAFLMRKKMAKLGREKDELEQELQKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLKRRSTREMYKEKKTFNQDDSADLRCQLQFAKEEAFLMRKKMAKLGREKDELEQELQKY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 KSLYGDVDSPLPTGEAGGPPSTREAELKLRLKLVEEEANILGRKIVELEVENRGLKAEME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KSLYGDVDSPLPTGEAGGPPSTREAELKLRLKLVEEEANILGRKIVELEVENRGLKAEME
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 DMRGQQEREGPGRDHAPSIPTSPFGDSLESSTELRRHLQFVEEEAELLRRSISEIEDHNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DMRGQQEREGPGRDHAPSIPTSPFGDSLESSTELRRHLQFVEEEAELLRRSISEIEDHNR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 QLTHELSKFKFEPPREPGWLGEGASPGAGGGAPLQEELKSARLQISELSGKVLKLQHENH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QLTHELSKFKFEPPREPGWLGEGASPGAGGGAPLQEELKSARLQISELSGKVLKLQHENH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 ALLSNIQRCDLAAHLGLRAPSPRDSDAESDAGKKESDGEESRLPQPKREGPVGGESDSEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ALLSNIQRCDLAAHLGLRAPSPRDSDAESDAGKKESDGEESRLPQPKREGPVGGESDSEE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 MFEKTSGFGSGKPSEASEPCPTELLKAREDSEYLVTLKHEAQRLERTVERLITDTDSFLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MFEKTSGFGSGKPSEASEPCPTELLKAREDSEYLVTLKHEAQRLERTVERLITDTDSFLH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 DAGLRGGAPLPGPGLQGEEERGEGDQQEPQLLGTINAKMKAFKKELQAFLEQVNRIGDGL
       ::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DAGLRGGAPLPGPGLQGEEEQGEGDQQEPQLLGTINAKMKAFKKELQAFLEQVNRIGDGL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 SPLPHLTESSSFLSTVTSVSRDSPIGNLGKELGPDLQSRLKEQLEWQLGPARGDERESLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPLPHLTESSSFLSTVTSVSRDSPIGNLGKELGPDLQSRLKEQLEWQLGPARGDERESLR
              550       560       570       580       590       600

              610       620                                        
pF1KA0 LRAARELHRRADGDTGSHGLGGQTCFSLE-------------------------------
       :::::::::::::::::::::::::::::                               
CCDS11 LRAARELHRRADGDTGSHGLGGQTCFSLELRGPPVLPEQSVSIEELQGQLVQAARLHQEE
              610       620       630       640       650       660

               630       640       650       660       670         
pF1KA0 ----------MEEEHLYALRWKELEMHSLALQNTLHERTWSDEKNLMQQELRSLKQNIFL
                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TETFTNKIHKMEEEHLYALRWKELEMHSLALQNTLHERTWSDEKNLMQQELRSLKQNIFL
              670       680       690       700       710       720

     680       690       700       710       720       730         
pF1KA0 FYVKLRWLLKHWRQGKQMEEEGEEFTEGEHPETLSRLGELGVQGGHQADGPDHDSDRSCG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS11 FYVKLRWLLKHWRQGKQMEEEGEEFTEGEHPETLSRLGELGVQGGHQADGPDHDSDRGCG
              730       740       750       760       770       780

     740       750       760       770       780       790         
pF1KA0 FPVGEHSPHSRVQIGDHSLRLQTADRGQPHKQVVENQQLFSAFKALLEDFRAELREDERA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FPVGEHSPHSRVQIGDHSLRLQTADRGQPHKQVVENQQLFSAFKALLEDFRAELREDERA
              790       800       810       820       830       840

     800       810       820       830       840       850         
pF1KA0 RLRLQQQYASDKAAWDVEWAVLKCRLEQLEEKTENKLGELGSSAESKGALKKEREVHQKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RLRLQQQYASDKAAWDVEWAVLKCRLEQLEEKTENKLGELGSSAESKGALKKEREVHQKL
              850       860       870       880       890       900

     860       870       880       890       900       910         
pF1KA0 LADSHSLVMDLRWQIHHSEKNWNREKVELLDRLDRDRQEWERQKKEFLWRIEQLQKENSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LADSHSLVMDLRWQIHHSEKNWNREKVELLDRLDRDRQEWERQKKEFLWRIEQLQKENSP
              910       920       930       940       950       960

     920       930       940       950       960       970         
pF1KA0 RRGGSFLCDQKDGNVRPFPHQGSLRMPRPVAMWPCADADSIPFEDRPLSKLKESDRCSAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RRGGSFLCDQKDGNVRPFPHQGSLRMPRPVAMWPCADADSIPFEDRPLSKLKESDRCSAS
              970       980       990      1000      1010      1020

     980       990      1000      1010      1020      1030         
pF1KA0 ENLYLDALSLDDEPEEPPAHRPEREFRNRLPEEEENHKGNLQRAVSVSSMSEFQRLMDIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ENLYLDALSLDDEPEEPPAHRPEREFRNRLPEEEENHKGNLQRAVSVSSMSEFQRLMDIS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

    1040      1050      1060      1070      1080      1090         
pF1KA0 PFLPEKGLPSTSSKEDVTPPLSPDDLKYIEEFNKSWDYTPNRGHNGGGPDLWADRTEVGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PFLPEKGLPSTSSKEDVTPPLSPDDLKYIEEFNKSWDYTPNRGHNGGGPDLWADRTEVGR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

    1100      1110      1120      1130      1140      1150         
pF1KA0 AGHEDSTEPFPDSSWYLTTSVTMTTDTMTSPEHCQKQPLRSHVLTEQSGLRVLHSPPAVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AGHEDSTEPFPDSSWYLTTSVTMTTDTMTSPEHCQKQPLRSHVLTEQSGLRVLHSPPAVR
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

    1160      1170      1180      1190      1200      1210         
pF1KA0 RVDSITAAGGEGPFPTSRARGSPGDTKGGPPEPMLSRWPCTSPRHSRDYVEGARRPLDSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RVDSITAAGGEGPFPTSRARGSPGDTKGGPPEPMLSRWPCTSPRHSRDYVEGARRPLDSP
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

    1220      1230      1240      1250      1260      1270         
pF1KA0 LCTSLGFASPLHSLEMSKNLSDDMKEVAFSVRNAICSGPGELQVKDMACQTNGSRTMGTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LCTSLGFASPLHSLEMSKNLSDDMKEVAFSVRNAICSGPGELQVKDMACQTNGSRTMGTQ
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

    1280      1290      1300      1310      1320      1330         
pF1KA0 TVQTISVGLQTEALRGSGVTSSPHKCLTPKAGGGATPVSSPSRSLRSRQVAPAIEKVQAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TVQTISVGLQTEALRGSGVTSSPHKCLTPKAGGGATPVSSPSRSLRSRQVAPAIEKVQAK
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

    1340      1350      1360      1370      1380      1390         
pF1KA0 FERTCCSPKYGSPKLQRKPLPKADQPNNRTSPGMAQKGYSESAWARSTTTRESPVHTTIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FERTCCSPKYGSPKLQRKPLPKADQPNNRTSPGMAQKGYSESAWARSTTTRESPVHTTIN
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

    1400      1410      1420      1430      1440      1450         
pF1KA0 DGLSSLFNIIDHSPVVQDPFQKGLRAGSRSRSAEPRPELGPGQETGTNSRGRSPSPIGVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DGLSSLFNIIDHSPVVQDPFQKGLRAGSRSRSAEPRPELGPGQETGTNSRGRSPSPIGVG
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

    1460      1470      1480      1490      1500      1510         
pF1KA0 SEMCREEGGEGTPVKQDLSAPPGYTLTENVARILNKKLLEHALKEERRQAAHGPPGLHSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SEMCREEGGEGTPVKQDLSAPPGYTLTENVARILNKKLLEHALKEERRQAAHGPPGLHSD
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

    1520      1530      1540     
pF1KA0 SHSLGDTAEPGPMENQTVLLTAPWGL
       ::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SHSLGDTAEPGPMENQTVLLTAPWGL
             1570      1580      

>>CCDS54459.1 SOGA1 gene_id:140710|Hs108|chr20            (1661 aa)
 initn: 1998 init1: 662 opt: 1628  Z-score: 1106.6  bits: 217.6 E(32554): 2.6e-55
Smith-Waterman score: 2633; 37.5% identity (61.8% similar) in 1583 aa overlap (1-1534:239-1612)

                                             10        20        30
pF1KA0                               MEEMRDSYLEEDVYQLQELRRELDRANKNC
                                     : :::: :.:::::::::::..::.:.:.:
CCDS54 CGPSGLVRELEELRSENDYLKDEIEELRAEMLEMRDVYMEEDVYQLQELRQQLDQASKTC
      210       220       230       240       250       260        

               40        50        60        70        80        90
pF1KA0 RILQYRLRKAEQKSLKVAETGQVDGELIRSLEQDLKVAKDVSVRLHHELKTVEEKRAKAE
       :::::::::::..::..:.::::::::::.::::.::.::.:.:::.::..::.:::. :
CCDS54 RILQYRLRKAERRSLRAAQTGQVDGELIRGLEQDVKVSKDISMRLHKELEVVEKKRARLE
      270       280       290       300       310       320        

              100       110       120       130        140         
pF1KA0 DENETLRQQMIEVEISKQALQNELERLKESSLKRRSTREMYK-EKKTFNQDDSADLRCQL
       .::: :::..::.:..::.::.:::: .: :::.:.:: . : .:::. :.:::::.:::
CCDS54 EENEELRQRLIETELAKQVLQTELERPREHSLKKRGTRSLGKADKKTLVQEDSADLKCQL
      330       340       350       360       370       380        

     150       160       170       180       190       200         
pF1KA0 QFAKEEAFLMRKKMAKLGREKDELEQELQKYKSLYGDVDSPLPTGEAGGPPSTREAELKL
       .:::::. :: ::..::..:.: ...:: ::.:::::.:: : . : .  : .::.:::.
CCDS54 HFAKEESALMCKKLTKLAKENDSMKEELLKYRSLYGDLDSALSAEELADAPHSRETELKV
      390       400       410       420       430       440        

     210       220       230       240       250       260         
pF1KA0 RLKLVEEEANILGRKIVELEVENRGLKAEMEDMRGQQEREGPGRDHAPSIPTSPFGDSLE
       .:::::::::.:.:.:::::::::::.:::.::. .    : : .   .. .   :.  :
CCDS54 HLKLVEEEANLLSRRIVELEVENRGLRAEMDDMKDHGGGCG-GPEARLAFSALGGGECGE
      450       460       470       480        490       500       

     270       280       290       300       310       320         
pF1KA0 SSTELRRHLQFVEEEAELLRRSISEIEDHNRQLTHELSKFKFEPPREPGWLGEGASPGAG
       : .::::::::::::::::::: .:.::.:. : .::.::. :   . . :.: .    .
CCDS54 SLAELRRHLQFVEEEAELLRRSSAELEDQNKLLLNELAKFRSEHELDVA-LSEDSCSVLS
       510       520       530       540       550        560      

     330       340       350       360       370       380         
pF1KA0 GGAPLQEELKSARLQISELSGKVLKLQHENHALLSNIQRCDLAAHLGLRAPSPRDSDAES
          : :::: .:.:::.:::::: :::.::..::::.::::::.  . : :   ..::: 
CCDS54 --EPSQEELAAAKLQIGELSGKVKKLQYENRVLLSNLQRCDLASCQSTR-PM-LETDAE-
          570       580       590       600       610         620  

     390       400       410       420       430       440         
pF1KA0 DAGKKESDGEESRLPQPKREGPVGGESDSEEMFEKTSGFGSGKPSEASEPCPTELLKARE
        ::    :. .  .: :                     .:  . :.: . :     .:::
CCDS54 -AG----DSAQC-VPAP---------------------LGETHESHAVRLC-----RARE
                   630                            640              

     450       460       470       480       490         500       
pF1KA0 DSEYLVTLKHEAQRLERTVERLITDTDSFLHDAGLRGGAPLPGPGLQGEE--ERGEGDQQ
        .: :  :...:  . .... :..:...:   ::::         .. .:  . .:: . 
CCDS54 -AEVLPGLREQAALVSKAIDVLVADANGFT--AGLRLCLDNECADFRLHEAPDNSEGPR-
      650       660       670         680       690       700      

       510       520       530       540       550       560       
pF1KA0 EPQLLGTINAKMKAFKKELQAFLEQVNRIGDGLSPLPHLTESSSFLSTVTSVSRDSPIGN
       . .:. .: ........::.:: .... .  : : . .  :: : :  . : . .. :  
CCDS54 DTKLIHAILVRLSVLQQELNAFTRKADAVL-GCS-VKEQQESFSSLPPLGSQGLSKEIL-
         710       720       730         740       750       760   

       570        580               590         600                
pF1KA0 LGKELGPDLQS-RLKEQLEWQ--------LGP--ARGDERESLR-LRA------ARELHR
       :.:.:: :.:   ...  ::.         :   .. :  .:.:  ::      : :...
CCDS54 LAKDLGSDFQPPDFRDLPEWEPRIREAFRTGDLDSKPDPSRSFRPYRAEDNDSYASEIKE
            770       780       790       800       810       820  

     610           620                   630          640       650
pF1KA0 R----ADGDTGSHGLGGQTC------------FSLEM---EEEHLYALRWKELEMHSLAL
            :..  . .::  :              :. .:   .:..  ::  .:.:..::.:
CCDS54 LQLVLAEAHDSLRGLQEQLSQERQLRKEEADNFNQKMVQLKEDQQRALLRREFELQSLSL
            830       840       850       860       870       880  

              660       670       680       690       700       710
pF1KA0 QNTLHERTWSDEKNLMQQELRSLKQNIFLFYVKLRWLLKHWRQGKQMEEEGEEFTEGEHP
       :  :... ::.:::.. :: ...:.:..:...::::.::.::::: .  ::..: :    
CCDS54 QRRLEQKFWSQEKNMLVQESQQFKHNFLLLFMKLRWFLKRWRQGKVLPSEGDDFLE----
            890       900       910       920       930            

              720       730       740       750       760       770
pF1KA0 ETLSRLGELGVQGGHQADGPDHDSDRSCGFPVGEHSPHSRVQIGDHSLRLQTADRGQPHK
         .. . :: .   ..  . .:.....:               ::      .  .. :..
CCDS54 --VNSMKELYLLMEEEEINAQHSDNKAC--------------TGD------SWTQNTPNE
        940       950       960                           970      

              780       790       800       810       820       830
pF1KA0 QVVENQQLFSAFKALLEDFRAELREDERARLRLQQQYASDKAAWDVEWAVLKCRLEQLEE
        .    . .. .:. :...   ::...:.  .::::.:. ::.:..: : :: .  :.: 
CCDS54 YI----KTLADMKVTLKELCWLLRDERRGLTELQQQFAKAKATWETERAELKGHTSQMEL
            980       990      1000      1010      1020      1030  

              840       850       860       870       880       890
pF1KA0 KTENKLGELGSSAESKGALKKEREVHQKLLADSHSLVMDLRWQIHHSEKNWNREKVELLD
       :: .  ::  .. . :.::..::: .:.:::.:.: ::.:  :.. ::.::..::..:..
CCDS54 KTGKGAGER-AGPDWKAALQREREEQQHLLAESYSAVMELTRQLQISERNWSQEKLQLVE
           1040       1050      1060      1070      1080      1090 

              900       910       920       930       940       950
pF1KA0 RLDRDRQEWERQKKEFLWRIEQLQKENSPRRGGSFLCDQKDGNVRPFPHQGSLRMPRPVA
       ::. ..:. :.: ::.  :. ::::  .:                               
CCDS54 RLQGEKQQVEQQVKELQNRLSQLQKAADP-------------------------------
            1100      1110      1120                               

              960       970       980       990      1000      1010
pF1KA0 MWPCADADSIPFEDRPLSKLKESDRCSASENLYLDALSLDDEPEEPPAHRPEREFRNRLP
        :    ..        : :  .: . . ::...      : :                . 
CCDS54 -WVLKHSE--------LEKQDNSWKETRSEKIH------DKEA---------------VS
                      1130      1140                           1150

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KA0 EEEENHKGNLQRAVSVSSMSEFQRLMDISPFLPEKGLPSTSSKEDVTPPLSPDDLKYIEE
       : : . .: :.:. ::::::::. :.: ::.:   :  . ..:   .: ..         
CCDS54 EVELGGNG-LKRTKSVSSMSEFESLLDCSPYLA--GGDARGKKLPNNPAFG---------
              1160      1170      1180        1190                 

             1080      1090      1100      1110      1120      1130
pF1KA0 FNKSWDYTPNRGHNGGGPDLWADRTEVGRAGHEDSTEPFPDSSWYLTTSVTMTTDTMTSP
       : .:    :      : :.             .:. :  :     :..       ...  
CCDS54 FVSS---EP------GDPE-------------KDTKEK-PG----LSSRDCNHLGALACQ
     1200                            1210           1220      1230 

             1140      1150      1160      1170            1180    
pF1KA0 EHCQKQPLRSHVLTEQSGLRVLHSPPAVRRVDSITAAGGEG-----P-FPTSRARGSPGD
       .   .:  ::..  ...:.:: .:::..::.   ..   ::     : :  . :. . . 
CCDS54 DPPGRQMQRSYTAPDKTGIRVYYSPPVARRLGVPVVHDKEGKIIIEPGFLFTTAKPKESA
            1240      1250      1260      1270      1280      1290 

         1190      1200      1210      1220      1230      1240    
pF1KA0 TKGGPPEPMLSRWPCTSPRHSRDYVEGARRPLDSPLCTSLGFASPLHSLEMSKNLSDDMK
          :  :   .:: :.    ::. ..:.     ::  .. :: . ::..::: :.:::::
CCDS54 EADGLAESSYGRWLCN---FSRQRLDGGSA--GSPSAAGPGFPAALHDFEMSGNMSDDMK
            1300         1310        1320      1330      1340      

         1250      1260      1270      1280      1290      1300    
pF1KA0 EVAFSVRNAICSGPGELQVKDMACQTNGSRTMGTQTVQTISVGLQTEALRGSGVTSSPHK
       :..  ::.:. ::  : .::. . :: :  ..::::..:.::::::.  :     :: : 
CCDS54 EITNCVRQAMRSGSLERKVKSTSSQTVGLASVGTQTIRTVSVGLQTDPPR-----SSLH-
       1350      1360      1370      1380      1390           1400 

         1310      1320      1330      1340      1350      1360    
pF1KA0 CLTPKAGGGATPVSSPSRSLRSRQVAPAIEKVQAKFERTCCSPKYGSPKLQRKPLPKADQ
             : . .: ::   :.::.:.. ...::....:: :::::::::::::. . : :.
CCDS54 ------GKAWSPRSSSLVSVRSKQISSSLDKVHSRIERPCCSPKYGSPKLQRRSVSKLDS
                   1410      1420      1430      1440      1450    

         1370      1380      1390      1400      1410      1420    
pF1KA0 PNNRTSPGMAQKGYSESAWARSTTTRESPVHTTINDGLSSLFNIIDHSPVVQDPFQKGLR
        ..:.  .. :   . ::::::::::.:::  .:::::::::....::  ... .. :. 
CCDS54 SKDRSLWNLHQGKQNGSAWARSTTTRDSPVLRNINDGLSSLFSVVEHSGSTESVWKLGM-
         1460      1470      1480      1490      1500      1510    

         1430      1440      1450      1460      1470      1480    
pF1KA0 AGSRSRSAEPRPELGPGQETGTNSRGRSPSPIGVGSEMCREEGGEGTPVKQDLSAPPGYT
         :..:.    :. :  ::   :  ::.::: . ..:       :::   . :: : .: 
CCDS54 --SETRAKPEPPKYGIVQEFFRNVCGRAPSPTSSAGE-------EGTKKPEPLS-PASYH
            1520      1530      1540             1550       1560   

         1490      1500      1510         1520      1530      1540 
pF1KA0 LTENVARILNKKLLEHALKEERRQAAH---GPPGLHSDSHSLGDTAEPGPMENQTVLLTA
         :.::::::::  . . .:: : .     :  :.  :    :: :   : :.       
CCDS54 QPEGVARILNKKAAKLGSSEEVRLTMLPQVGKDGVLRD----GDGAVVLPNEDAVCDCST
          1570      1580      1590      1600          1610         

                                                 
pF1KA0 PWGL                                      
                                                 
CCDS54 QSLTSCFARSSRSAIRHSPSKCRLHPSESSWGGEERALPPSE
    1620      1630      1640      1650      1660 

>>CCDS46598.1 SOGA1 gene_id:140710|Hs108|chr20            (1016 aa)
 initn: 1496 init1: 662 opt: 1622  Z-score: 1105.3  bits: 216.7 E(32554): 3e-55
Smith-Waterman score: 1947; 41.3% identity (68.3% similar) in 959 aa overlap (1-919:1-882)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MEEMRDSYLEEDVYQLQELRRELDRANKNCRILQYRLRKAEQKSLKVAETGQVDGELIRS
       : :::: :.:::::::::::..::.:.:.::::::::::::..::..:.::::::::::.
CCDS46 MLEMRDVYMEEDVYQLQELRQQLDQASKTCRILQYRLRKAERRSLRAAQTGQVDGELIRG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LEQDLKVAKDVSVRLHHELKTVEEKRAKAEDENETLRQQMIEVEISKQALQNELERLKES
       ::::.::.::.:.:::.::..::.:::. :.::: :::..::.:..::.::.:::: .: 
CCDS46 LEQDVKVSKDISMRLHKELEVVEKKRARLEEENEELRQRLIETELAKQVLQTELERPREH
               70        80        90       100       110       120

              130        140       150       160       170         
pF1KA0 SLKRRSTREMYK-EKKTFNQDDSADLRCQLQFAKEEAFLMRKKMAKLGREKDELEQELQK
       :::.:.:: . : .:::. :.:::::.:::.:::::. :: ::..::..:.: ...:: :
CCDS46 SLKKRGTRSLGKADKKTLVQEDSADLKCQLHFAKEESALMCKKLTKLAKENDSMKEELLK
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KA0 YKSLYGDVDSPLPTGEAGGPPSTREAELKLRLKLVEEEANILGRKIVELEVENRGLKAEM
       :.:::::.:: : . : .  : .::.:::..:::::::::.:.:.:::::::::::.:::
CCDS46 YRSLYGDLDSALSAEELADAPHSRETELKVHLKLVEEEANLLSRRIVELEVENRGLRAEM
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA0 EDMRGQQEREGPGRDHAPSIPTSPFGDSLESSTELRRHLQFVEEEAELLRRSISEIEDHN
       .::. .    : : .   .. .   :.  :: .::::::::::::::::::: .:.::.:
CCDS46 DDMKDHGGGCG-GPEARLAFSALGGGECGESLAELRRHLQFVEEEAELLRRSSAELEDQN
              250        260       270       280       290         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA0 RQLTHELSKFKFEPPREPGWLGEGASPGAGGGAPLQEELKSARLQISELSGKVLKLQHEN
       . : .::.::. :   . . :.: .    .   : :::: .:.:::.:::::: :::.::
CCDS46 KLLLNELAKFRSEHELDVA-LSEDSCSVLS--EPSQEELAAAKLQIGELSGKVKKLQYEN
     300       310        320         330       340       350      

     360       370       380       390       400       410         
pF1KA0 HALLSNIQRCDLAAHLGLRAPSPRDSDAESDAGKKESDGEESRLPQPKREGPVGGESDSE
       ..::::.::::::.  . : :   ..:::  ::    :. .  .: :             
CCDS46 RVLLSNLQRCDLASCQSTR-PM-LETDAE--AG----DSAQC-VPAP-------------
        360       370         380             390                  

     420       430       440       450       460       470         
pF1KA0 EMFEKTSGFGSGKPSEASEPCPTELLKAREDSEYLVTLKHEAQRLERTVERLITDTDSFL
               .:  . :.: . :     .::: .: :  :...:  . .... :..:...: 
CCDS46 --------LGETHESHAVRLC-----RARE-AEVLPGLREQAALVSKAIDVLVADANGF-
                  400            410        420       430          

     480       490         500       510       520       530       
pF1KA0 HDAGLRGGAPLPGPGLQGEE--ERGEGDQQEPQLLGTINAKMKAFKKELQAFLEQVNRIG
         ::::         .. .:  . .:: . . .:. .: ........::.:: .... . 
CCDS46 -TAGLRLCLDNECADFRLHEAPDNSEGPR-DTKLIHAILVRLSVLQQELNAFTRKADAVL
      440       450       460        470       480       490       

       540       550       560       570        580                
pF1KA0 DGLSPLPHLTESSSFLSTVTSVSRDSPIGNLGKELGPDLQS-RLKEQLEWQ--------L
        : : . .  :: : :  . : . .. :  :.:.:: :.:   ...  ::.         
CCDS46 -GCS-VKEQQESFSSLPPLGSQGLSKEIL-LAKDLGSDFQPPDFRDLPEWEPRIREAFRT
        500        510       520        530       540       550    

      590         600              610           620               
pF1KA0 GP--ARGDERESLR-LRA------ARELHRR----ADGDTGSHGLGGQTC----------
       :   .. :  .:.:  ::      : :...     :..  . .::  :            
CCDS46 GDLDSKPDPSRSFRPYRAEDNDSYASEIKELQLVLAEAHDSLRGLQEQLSQERQLRKEEA
          560       570       580       590       600       610    

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pF1KA0 --FSLEM---EEEHLYALRWKELEMHSLALQNTLHERTWSDEKNLMQQELRSLKQNIFLF
         :. .:   .:..  ::  .:.:..::.::  :... ::.:::.. :: ...:.:..:.
CCDS46 DNFNQKMVQLKEDQQRALLRREFELQSLSLQRRLEQKFWSQEKNMLVQESQQFKHNFLLL
          620       630       640       650       660       670    

              690       700       710       720       730       740
pF1KA0 YVKLRWLLKHWRQGKQMEEEGEEFTEGEHPETLSRLGELGVQGGHQADGPDHDSDRSCGF
       ..::::.::.::::: .  ::..: :      .. . :: .   ..  . .:.....:  
CCDS46 FMKLRWFLKRWRQGKVLPSEGDDFLE------VNSMKELYLLMEEEEINAQHSDNKAC--
          680       690       700             710       720        

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pF1KA0 PVGEHSPHSRVQIGDHSLRLQTADRGQPHKQVVENQQLFSAFKALLEDFRAELREDERAR
                    ::      .  .. :.. .    . .. .:. :...   ::...:. 
CCDS46 ------------TGD------SWTQNTPNEYI----KTLADMKVTLKELCWLLRDERRGL
                          730       740           750       760    

              810       820       830       840       850       860
pF1KA0 LRLQQQYASDKAAWDVEWAVLKCRLEQLEEKTENKLGELGSSAESKGALKKEREVHQKLL
        .::::.:. ::.:..: : :: .  :.: :: .  ::  .. . :.::..::: .:.::
CCDS46 TELQQQFAKAKATWETERAELKGHTSQMELKTGKGAGER-AGPDWKAALQREREEQQHLL
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pF1KA0 ADSHSLVMDLRWQIHHSEKNWNREKVELLDRLDRDRQEWERQKKEFLWRIEQLQKENSPR
       :.:.: ::.:  :.. ::.::..::..:..::. ..:. :.: ::.  :. ::::  .: 
CCDS46 AESYSAVMELTRQLQISERNWSQEKLQLVERLQGEKQQVEQQVKELQNRLSQLQKAADPW
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pF1KA0 RGGSFLCDQKDGNVRPFPHQGSLRMPRPVAMWPCADADSIPFEDRPLSKLKESDRCSASE
                                                                   
CCDS46 VLKHSELEKQDNSWKETRSEKIHDKEAVSEVELGGNGLKRTKSVSSMSEFESLLDCSPYL
           890       900       910       920       930       940   

>>CCDS43505.1 SOGA3 gene_id:387104|Hs108|chr6             (947 aa)
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pF1KA0                               MEEMRDSYLEEDVYQLQELRRELDRANKNC
                                     :.::::...:::. ::::.:.::.::::::
CCDS43 QEQEEMQEEMEKLREENETLKNEIDELRTEMDEMRDTFFEEDACQLQEMRHELERANKNC
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pF1KA0 RILQYRLRKAEQKSLKVAETGQVDGELIRSLEQDLKVAKDVSVRLHHELKTVEEKRAKAE
       :::::::::::.: :. :.::..::::.:::::::::::::::::::::..:::::. .:
CCDS43 RILQYRLRKAERKRLRYAQTGEIDGELLRSLEQDLKVAKDVSVRLHHELENVEEKRTTTE
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pF1KA0 DENETLRQQMIEVEISKQALQNELERLKESSLKRRSTREMYK-EKK---TFNQDDSADLR
       :::: ::::.:::::.:::::::::..:: :::::..... : :::   : ...:. ::.
CCDS43 DENEKLRQQLIEVEIAKQALQNELEKMKELSLKRRGSKDLPKSEKKAQQTPTEEDNEDLK
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pF1KA0 CQLQFAKEEAFLMRKKMAKLGREKDELEQELQKYKSLYGDVDSPLPTGEAGGPPSTREAE
       :::::.:::: ::::::::. .:::..:.:::::.:.:::.::::: :::::::::::::
CCDS43 CQLQFVKEEAALMRKKMAKIDKEKDRFEHELQKYRSFYGDLDSPLPKGEAGGPPSTREAE
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pF1KA0 LKLRLKLVEEEANILGRKIVELEVENRGLKAEMEDMRGQQEREGPGRDHAPSIPTSPFG-
       :::::.::::::::::::::::::::::::::..:.::.        :   :  ..:.  
CCDS43 LKLRLRLVEEEANILGRKIVELEVENRGLKAELDDLRGD--------DFNGS--ANPLMR
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pF1KA0 DSLESSTELRRHLQFVEEEAELLRRSISEIEDHNRQLTHELSKFKFEPPREPGWLGEGAS
       .. :: .:::.:::.::.:.:::::.....:..:...: ::.:.:.    . :    .  
CCDS43 EQSESLSELRQHLQLVEDETELLRRNVADLEEQNKRITAELNKYKY----KSGGHDSARH
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pF1KA0 PGAGGGAPLQEELKSARLQISELSGKVLKLQHENHALLSNIQRCDLAAHLGLRAPSPRDS
          .    ::::::.:::::.::::::..::.::..:.::.:: :::.:::.:. :::::
CCDS43 HDNAKTEALQEELKAARLQINELSGKVMQLQYENRVLMSNMQRYDLASHLGIRG-SPRDS
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       :::::::::::: ..:: :. :::::.::::::::.     ..    :...  : :    
CCDS43 DAESDAGKKESD-DDSRPPHRKREGPIGGESDSEEV----RNIRCLTPTRSFYPAPGPWP
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       :.  : . .  .. ::.:: .:..:::.::.... .: .  ... : :  :. ::. : .
CCDS43 KSFSDRQQMKDIRSEAERLGKTIDRLIADTSTIITEARIYVANGDLFG--LMDEEDDG-S
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CCDS43 RIREHELLYRINAQMKAFRKELQTFIDRLEVPKSADDRGAEEPISVSQMFQPIILLILIL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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