FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0672, 818 aa 1>>>pF1KA0672 818 - 818 aa - 818 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 18.6828+/-0.0005; mu= -43.1650+/- 0.031 mean_var=781.6071+/-161.260, 0's: 0 Z-trim(123.6): 279 B-trim: 0 in 0/62 Lambda= 0.045875 statistics sampled from 43538 (43846) to 43538 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.781), E-opt: 0.2 (0.514), width: 16 Scan time: 12.470 The best scores are: opt bits E(85289) NP_060524 (OMIM: 608293) rho GTPase-activating pro ( 803) 2325 169.6 5e-41 NP_001006635 (OMIM: 608293) rho GTPase-activating ( 881) 2193 160.9 2.3e-38 XP_011544180 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 835) 1329 103.7 3.6e-21 XP_016878879 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 794) 1323 103.3 4.5e-21 XP_011544179 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 836) 1197 94.9 1.5e-18 XP_011544178 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 872) 1197 94.9 1.6e-18 XP_011544177 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 885) 1197 94.9 1.6e-18 XP_011544176 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 912) 1197 95.0 1.7e-18 XP_011544175 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 913) 1197 95.0 1.7e-18 XP_011538317 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 359) 395 41.7 0.0071 XP_011538313 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 565) 403 42.3 0.0073 XP_016871961 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 552) 402 42.2 0.0074 XP_016871960 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 552) 402 42.2 0.0074 XP_011538314 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 552) 402 42.2 0.0074 XP_016871965 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 414) 395 41.7 0.008 NP_001242955 (OMIM: 610585) rho GTPase-activating ( 608) 402 42.3 0.0081 XP_016871962 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 420) 395 41.7 0.0081 XP_005270071 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 624) 402 42.3 0.0083 XP_011538307 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 624) 402 42.3 0.0083 XP_011538308 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 661) 403 42.3 0.0083 XP_011538315 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 436) 395 41.7 0.0084 XP_011538309 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 637) 402 42.3 0.0084 XP_016871959 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 655) 402 42.3 0.0086 NP_112595 (OMIM: 610586) rho GTPase-activating pro ( 655) 402 42.3 0.0086 XP_011530602 (OMIM: 610586) PREDICTED: rho GTPase- ( 653) 401 42.2 0.009 NP_001036134 (OMIM: 610586) rho GTPase-activating ( 653) 401 42.2 0.009 NP_067049 (OMIM: 610585) rho GTPase-activating pro ( 698) 402 42.3 0.0091 NP_001274734 (OMIM: 610586) rho GTPase-activating ( 663) 401 42.2 0.0091 NP_001242954 (OMIM: 610585) rho GTPase-activating ( 704) 402 42.3 0.0092 XP_011538306 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 704) 402 42.3 0.0092 NP_001242953 (OMIM: 610585) rho GTPase-activating ( 714) 402 42.3 0.0093 XP_011538305 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 720) 402 42.3 0.0094 XP_011538304 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 720) 402 42.3 0.0094 >>NP_060524 (OMIM: 608293) rho GTPase-activating protein (803 aa) initn: 1945 init1: 1324 opt: 2325 Z-score: 857.6 bits: 169.6 E(85289): 5e-41 Smith-Waterman score: 2325; 47.5% identity (73.7% similar) in 809 aa overlap (1-788:1-783) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA ::::::::.::::::::::::::::::::::.:.::. :... : .::.:.::.:::.:. 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XP_011 EEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHRKALAVLEKTLPEM 180 190 200 210 220 230 250 260 pF1KA0 KAQQ--------------------------------EAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREI .:.: . :.:::.:: :::::: ::::: XP_011 RAHQGSPLNPLACVDEVWCRCSVPLQLLGSLSWCHLDKWAEKPAFGTPLEEHLKRSGREI 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KA0 AFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLKKLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALK :.:::::: .::: ::.::::::.. .::::::::::::: . ..:. .::::.::::: XP_011 ALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALK 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KA0 SYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKLQALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKL :::::::::::::.::.:: :...::.:::::: :: .:.::: : :.:::::::.:: XP_011 SYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKL 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KA0 SEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNITEMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGE .. .:::::::::.:::::::::: . ::...:: ...:...:..::::::::::::: : XP_011 AQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWARNEGTLAEMAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPEE 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 pF1KA0 IEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPADRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDG .:::.. . :. .. ..:.: . : : . .. .:: :.:. : .. ::.. XP_011 VEFNVSEAF-VPL-TTPSSNHSFHTGNDSDSGTLER----KRPASMAV--MEGDLVKKES 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 pF1KA0 LRKIQ---SMGVRVMDTN--WVAR-----RGSSAGRKVSCAPPSMQPPAPPAEL--AAPL : . : .: . : .: .........: . : : : :. XP_011 PPKPKDPVSAAVPAPGRNNSQIASGQNQPQAAAGSHQLSMGQPHNAAGPSPHTLRRAVKK 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 610 pF1KA0 PSPLPEQPLDSPAA-PA-LSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSPGSAQKGSPGSSQGTACA :.: : .: . : . :. : :: . .: : . .. :: . . :.: .. .. XP_011 PAPAPPKPGNPPPGHPGGQSSSGTSQHP-PSLSPKPPTRSPSPPTQHTGQPPGQPSAPSQ 590 600 610 620 630 640 620 630 640 650 660 pF1KA0 GTQPGAQPGA-QPGASPS--PSQPPADQSP--HTLRKVSKKLAPIPPKVPFGQPGAMADQ . : .. .: .:. : :::.. .: :: : . ::. :.. :. . . XP_011 LSAPRRYSSSLSPIQAPNHPPPQPPTQATPLMHT-----KPNSQGPPN-PMALPSEHGLE 650 660 670 680 690 700 670 680 690 700 710 720 pF1KA0 SAGQLSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFTSTLSKSRPT . .. : .::::::: : : . : :: . : .. : :.: ..:: . ::. XP_011 QPSHTPP--QTPTPPSTP-PLGKQNP---SLPAPQTLAGGNPETAQPH--AGTLPRPRPV 710 720 730 740 750 730 740 750 760 770 780 pF1KA0 PKPRQRPTLPPP-QPPTVNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDI-PSIHIELG ::::.::..::: ::: :. ...: .. :: . . . .. : .: : .: . . XP_011 PKPRNRPSVPPPPQPPGVHSAGDSSLTNTAPTASKIVTDSNSRVSEPHRSIFPEMHSDSA 760 770 780 790 800 810 790 800 810 pF1KA0 STLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL : XP_011 SKDVPGRILLDIDNDTESTAL 820 830 >>XP_016878879 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase-acti (794 aa) initn: 1931 init1: 1034 opt: 1323 Z-score: 499.2 bits: 103.3 E(85289): 4.5e-21 Smith-Waterman score: 2245; 46.7% identity (71.8% similar) in 811 aa overlap (1-759:1-785) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA ::::::::.::::::::::::::::::::::.:.::. :... : .::.:.::.:::.:. XP_016 MKKQFNRMKQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQHGT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV .:..: ::::::.::: ..:.:. : .:.::::::. ::..:..:: :: . :. ::... XP_016 DAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQL-EDSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVEKEI 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR ..::. .:::::::::::::.::.:::: :: :.::.:. :::: ...: .: :.:. XP_016 VDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSG--TNFQGLPSKIDTLK 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI :::.::.:.:: :.:::.::::.:.::: .:...: ::.:.::.::::.:..:. .::.. XP_016 EEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHRKALAVLEKTLPEM 180 190 200 210 220 230 250 260 pF1KA0 KAQQ--------------------------------EAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREI .:.: . :.:::.:: :::::: ::::: XP_016 RAHQGSPLNPLACVDEVWCRCSVPLQLLGSLSWCHLDKWAEKPAFGTPLEEHLKRSGREI 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KA0 AFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLKKLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALK :.:::::: .::: ::.::::::.. .::::::::::::: . ..:. .::::.::::: XP_016 ALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALK 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KA0 SYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKLQALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKL :::::::::::::.::.:: :...::.:::::: :: .:.::: : :.:::::::.:: XP_016 SYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKL 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KA0 SEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNITEMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGE .. .:::::::::.:::::::::: . ::...:: ...:...:..::::::::::::: : XP_016 AQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWARNEGTLAEMAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPEE 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 pF1KA0 IEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPADRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDG .:::.. . :. .. ..:.: . : : . .. .:: :.:. : .. ::.. XP_016 VEFNVSEAF-VPL-TTPSSNHSFHTGNDSDSGTLER----KRPASMAV--MEGDLVKKES 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 pF1KA0 LRKIQ---SMGVRVMDTN--WVAR-----RGSSAGRKVSCAPPSMQPPAPPAEL--AAPL : . : .: . : .: .........: . : : : :. XP_016 PPKPKDPVSAAVPAPGRNNSQIASGQNQPQAAAGSHQLSMGQPHNAAGPSPHTLRRAVKK 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 610 pF1KA0 PSPLPEQPLDSPAA-PA-LSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSPGSAQKGSPGSSQGTACA :.: : .: . : . :. : :: . .: : . .. :: . . :.: .. .. XP_016 PAPAPPKPGNPPPGHPGGQSSSGTSQHP-PSLSPKPPTRSPSPPTQHTGQPPGQPSAPSQ 590 600 610 620 630 640 620 630 640 650 660 pF1KA0 GTQPGAQPGA-QPGASPS--PSQPPADQSP--HTLRKVSKKLAPIPPKVPFGQPGAMADQ . : .. .: .:. : :::.. .: :: : . ::. :.. :. . . XP_016 LSAPRRYSSSLSPIQAPNHPPPQPPTQATPLMHT-----KPNSQGPPN-PMALPSEHGLE 650 660 670 680 690 700 670 680 690 700 710 720 pF1KA0 SAGQLSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFTSTLSKSRPT . .. : .::::::: : : . : :: . : .. : :.: . .:: . ::. XP_016 QPSHTPP--QTPTPPSTP-PLGKQNP---SLPAPQTLAGGNPETAQPHA--GTLPRPRPV 710 720 730 740 750 730 740 750 760 770 780 pF1KA0 PKPRQRPTLPPP-QPPTVNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIPSIHIELGS ::::.::..::: ::: :. ...: .. :: XP_016 PKPRNRPSVPPPPQPPGVHSAGDSSLTNTAPTASKIVTDV 760 770 780 790 790 800 810 pF1KA0 TLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL >>XP_011544179 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase-acti (836 aa) initn: 1601 init1: 1034 opt: 1197 Z-score: 453.8 bits: 94.9 E(85289): 1.5e-18 Smith-Waterman score: 1978; 47.0% identity (70.9% similar) in 728 aa overlap (78-759:1-691) 50 60 70 80 90 100 pF1KA0 KKLTACLQGQQGAEADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQ ..:.:. : .:.::::::. ::..:..:: XP_011 MQEASTQL-EDSLLGKMLETCGDAENQLAL 10 20 110 120 130 140 150 160 pF1KA0 ELIHFELQVERDVIEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSS :: . :. ::.....::. .:::::::::::::.::.:::: :: :.::.:. :::: . XP_011 ELSQHEVFVEKEIVDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSG--T 30 40 50 60 70 80 170 180 190 200 210 220 pF1KA0 SLQPAGAKADALREEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHR ..: .: :.:.:::.::.:.:: :.:::.::::.:.::: .:...: ::.:.::.::: XP_011 NFQGLPSKIDTLKEEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHR 90 100 110 120 130 140 230 240 250 pF1KA0 KSLTLLQAVLPQIKAQQ--------------------------------EAWVEKPSFGK :.:..:. .::...:.: . :.:::.:: XP_011 KALAVLEKTLPEMRAHQGSPLNPLACVDEVWCRCSVPLQLLGSLSWCHLDKWAEKPAFGT 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 pF1KA0 PLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLKKLKAALDCCVVDVQE :::::: ::::::.:::::: .::: ::.::::::.. .::::::::::::: . ..: XP_011 PLEEHLKRSGREIALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDE 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 pF1KA0 YSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKLQALWNACEKLPKANH . .::::.::::::::::::::::::.::.:: :...::.:::::: :: .:.::: : XP_011 FYSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNF 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 pF1KA0 NNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNITEMMTTVSLQIVGIIE :.:::::::.::.. .:::::::::.:::::::::: . ::...:: ...:...:..:: XP_011 VNFRYLIKFLAKLAQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWARNEGTLAEMAAATSVHVVAVIE 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 pF1KA0 PIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPADRRQPEQARRPLSVA ::::::::::: :.:::.. . :. .. ..:.: . : : . .. .:: :.: XP_011 PIIQHADWFFPEEVEFNVSEAF-VPL-TTPSSNHSFHTGNDSDSGTLER----KRPASMA 390 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 550 pF1KA0 TDNMMLEFYKKDGLRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAPPSMQPPAPPAELAAP . : .. ::. :.::..:: . . :::.. .:: :..::: ::.. .. XP_011 V--MEGDLVKKE------SFGVKLMDFQ-AHRRGGTLNRK--HISPAFQPPLPPTDGSTV 450 460 470 480 490 560 570 580 590 600 pF1KA0 LPSPLPEQPLDSPAAPALS-----PSGLG-LQPGPERTSTTKSKELSPGSAQKGSPGSSQ .:. :: : .: : . : ::. : :. :: . . : .: :: .:: .. XP_011 VPAG-PEPPPQSSRAESSSGGGTVPSSAGILEQGPSPGDGSPPKPKDPVSAAVPAPGRNN 500 510 520 530 540 610 620 630 640 650 660 pF1KA0 GTACAG-TQPGAQPGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKV---PFGQPGA . .: .:: : :.. . .: . : ::::::.. :: :: ::: : :.::. XP_011 SQIASGQNQPQAAAGSHQLSMGQPHNA-AGPSPHTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPPGHPGG 550 560 570 580 590 600 670 680 690 700 710 720 pF1KA0 MADQSAGQLSPVSLSPTPPS-TPSPYGLSYP-QGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFTSTL .......: : :::: ::. .::: : : . :: :.: :..: ..:.: XP_011 QSSSGTSQ-HPPSLSPKPPTRSPSP-----PTQHTGQPPGQ--PSAPSQLSAPRRYSSSL 610 620 630 640 650 660 730 740 750 760 770 780 pF1KA0 SKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPT--VNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIPS : : : :. ::::::: . : ..:.: : XP_011 S-------PIQAPNHPPPQPPTQATPLMHTKPNSQGPPNPMALPSEHGLEQPSHTPPQTP 670 680 690 700 710 790 800 810 pF1KA0 IHIELGSTLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL XP_011 TPPSTPPLGKQNPSLPAPQTLAGGNPETAQPHAGTLPRPRPVPKPRNRPSVPPPPQPPGV 720 730 740 750 760 770 >>XP_011544178 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase-acti (872 aa) initn: 1949 init1: 1034 opt: 1197 Z-score: 453.5 bits: 94.9 E(85289): 1.6e-18 Smith-Waterman score: 2358; 49.3% identity (73.0% similar) in 804 aa overlap (1-759:1-768) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA ::::::::.::::::::::::::::::::::.:.::. :... : .::.:.::.:::.:. XP_011 MKKQFNRMKQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQHGT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV .:..: ::::::.::: ..:.:. : .:.::::::. ::..:..:: :: . :. ::... XP_011 DAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQL-EDSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVEKEI 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR ..::. .:::::::::::::.::.:::: :: :.::.:. :::: ...: .: :.:. XP_011 VDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSG--TNFQGLPSKIDTLK 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI :::.::.:.:: :.:::.::::.:.::: .:...: ::.:.::.::::.:..:. .::.. XP_011 EEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHRKALAVLEKTLPEM 180 190 200 210 220 230 250 260 pF1KA0 KAQQ--------------------------------EAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREI .:.: . :.:::.:: :::::: ::::: XP_011 RAHQGSPLNPLACVDEVWCRCSVPLQLLGSLSWCHLDKWAEKPAFGTPLEEHLKRSGREI 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KA0 AFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLKKLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALK :.:::::: .::: ::.::::::.. .::::::::::::: . ..:. .::::.::::: XP_011 ALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALK 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KA0 SYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKLQALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKL :::::::::::::.::.:: :...::.:::::: :: .:.::: : :.:::::::.:: XP_011 SYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKL 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KA0 SEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNITEMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGE .. .:::::::::.:::::::::: . ::...:: ...:...:..::::::::::::: : XP_011 AQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWARNEGTLAEMAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPEE 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 pF1KA0 IEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPADRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDG .:::.. . :. .. ..:.: . : : . .. .:: :.:. : .. ::. 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XP_011 LSPKPPTRSPSP----PTQHTGQPPGQ--PSAPSQLSAPRRYSSSLS-------PIQAPN 700 710 720 730 740 740 750 760 770 780 790 pF1KA0 LPPPQPPT--VNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIPSIHIELGSTLRLSPL ::::::: . : ..:.: : XP_011 HPPPQPPTQATPLMHTKPNSQGPPNPMALPSEHGLEQPSHTPPQTPTPPSTPPLGKQNPS 750 760 770 780 790 800 >>XP_011544177 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase-acti (885 aa) initn: 1949 init1: 1034 opt: 1197 Z-score: 453.4 bits: 94.9 E(85289): 1.6e-18 Smith-Waterman score: 2358; 49.3% identity (73.0% similar) in 804 aa overlap (1-759:1-768) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA ::::::::.::::::::::::::::::::::.:.::. :... : .::.:.::.:::.:. XP_011 MKKQFNRMKQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQHGT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV .:..: ::::::.::: ..:.:. : .:.::::::. ::..:..:: :: . :. ::... 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