Result of FASTA (ccds) for pF1KA0481
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0481, 709 aa
  1>>>pF1KA0481 709 - 709 aa - 709 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3892+/-0.000905; mu= 8.4435+/- 0.055
 mean_var=191.1903+/-38.091, 0's: 0 Z-trim(113.9): 23  B-trim: 113 in 1/51
 Lambda= 0.092756
 statistics sampled from 14445 (14461) to 14445 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.754), E-opt: 0.2 (0.444), width:  16
 Scan time:  4.710

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS30984.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1          ( 709) 4609 629.2 6.3e-180
CCDS55676.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1          ( 631) 4079 558.3 1.3e-158
CCDS81418.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1          ( 514) 2960 408.4 1.3e-113
CCDS73010.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1          ( 469) 2942 406.0 6.5e-113
CCDS76257.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1          ( 484) 2942 406.0 6.7e-113
CCDS33855.1 TMCC1 gene_id:23023|Hs108|chr3         ( 653) 1964 275.2 2.1e-73
CCDS31877.1 TMCC3 gene_id:57458|Hs108|chr12        ( 477) 1574 222.9 8.5e-58
CCDS73506.1 TMCC3 gene_id:57458|Hs108|chr12        ( 446) 1555 220.4 4.7e-57


>>CCDS30984.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1               (709 aa)
 initn: 4609 init1: 4609 opt: 4609  Z-score: 3343.7  bits: 629.2 E(32554): 6.3e-180
Smith-Waterman score: 4609; 100.0% identity (100.0% similar) in 709 aa overlap (1-709:1-709)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MKRCRSDELQQQQGEEDGAGLEDAASHLPGADLRPGETTGANSAGGPTSDAGAAAAPNPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MKRCRSDELQQQQGEEDGAGLEDAASHLPGADLRPGETTGANSAGGPTSDAGAAAAPNPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 PRSKPPDLKKIQQLSEGSMFGHGLKHLFHSRRRSREREHQTSQDSQQHQQQQGMSDHDSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PRSKPPDLKKIQQLSEGSMFGHGLKHLFHSRRRSREREHQTSQDSQQHQQQQGMSDHDSP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 DEKERSPEMHRVSYAMSLHDLPARPTAFNRVLQQIRSRPSIKRGASLHSSSGGGSSGSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DEKERSPEMHRVSYAMSLHDLPARPTAFNRVLQQIRSRPSIKRGASLHSSSGGGSSGSSS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 RRTKSSSLEPQRGSPHLLRKAPQDSSLAAILHQHQCRPRSSSTTDTALLLADGSNVYLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RRTKSSSLEPQRGSPHLLRKAPQDSSLAAILHQHQCRPRSSSTTDTALLLADGSNVYLLA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 EEAEGIGDKVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAAIDHLHQKILKIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EEAEGIGDKVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAAIDHLHQKILKIT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 EQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIAQLHKKLEHYRRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIAQLHKKLEHYRRR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 LKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKGSLSGLSQATHTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKGSLSGLSQATHTA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 VVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLVSSPKYGSDDECS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLVSSPKYGSDDECS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 SASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKEGQSHLEDSMEDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKEGQSHLEDSMEDL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 KTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELASMEEKVAYQSYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELASMEEKVAYQSYE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 RARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANARALLGKFINVILALMAVLLVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANARALLGKFINVILALMAVLLVF
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700         
pF1KA0 VSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLPS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLPS
              670       680       690       700         

>>CCDS55676.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1               (631 aa)
 initn: 4079 init1: 4079 opt: 4079  Z-score: 2961.1  bits: 558.3 E(32554): 1.3e-158
Smith-Waterman score: 4079; 100.0% identity (100.0% similar) in 631 aa overlap (79-709:1-631)

       50        60        70        80        90       100        
pF1KA0 SDAGAAAAPNPGPRSKPPDLKKIQQLSEGSMFGHGLKHLFHSRRRSREREHQTSQDSQQH
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55                               MFGHGLKHLFHSRRRSREREHQTSQDSQQH
                                             10        20        30

      110       120       130       140       150       160        
pF1KA0 QQQQGMSDHDSPDEKERSPEMHRVSYAMSLHDLPARPTAFNRVLQQIRSRPSIKRGASLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QQQQGMSDHDSPDEKERSPEMHRVSYAMSLHDLPARPTAFNRVLQQIRSRPSIKRGASLH
               40        50        60        70        80        90

      170       180       190       200       210       220        
pF1KA0 SSSGGGSSGSSSRRTKSSSLEPQRGSPHLLRKAPQDSSLAAILHQHQCRPRSSSTTDTAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSSGGGSSGSSSRRTKSSSLEPQRGSPHLLRKAPQDSSLAAILHQHQCRPRSSSTTDTAL
              100       110       120       130       140       150

      230       240       250       260       270       280        
pF1KA0 LLADGSNVYLLAEEAEGIGDKVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLADGSNVYLLAEEAEGIGDKVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAA
              160       170       180       190       200       210

      290       300       310       320       330       340        
pF1KA0 IDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIA
              220       230       240       250       260       270

      350       360       370       380       390       400        
pF1KA0 QLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKG
              280       290       300       310       320       330

      410       420       430       440       450       460        
pF1KA0 SLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLV
              340       350       360       370       380       390

      470       480       490       500       510       520        
pF1KA0 SSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKE
              400       410       420       430       440       450

      530       540       550       560       570       580        
pF1KA0 GQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELA
              460       470       480       490       500       510

      590       600       610       620       630       640        
pF1KA0 SMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANARALLGKFIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANARALLGKFIN
              520       530       540       550       560       570

      650       660       670       680       690       700        
pF1KA0 VILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLP
              580       590       600       610       620       630

        
pF1KA0 S
       :
CCDS55 S
        

>>CCDS81418.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1               (514 aa)
 initn: 2949 init1: 2949 opt: 2960  Z-score: 2153.1  bits: 408.4 E(32554): 1.3e-113
Smith-Waterman score: 2960; 94.5% identity (96.8% similar) in 495 aa overlap (216-709:22-514)

         190       200       210       220        230       240    
pF1KA0 SSLEPQRGSPHLLRKAPQDSSLAAILHQHQCRPRS-SSTTDTALLLADGSNVYLLAEEAE
                                     : : . ....:.  : : :..    :.  :
CCDS81          MAAAESGNSGTPARSPVLPRVCDPGGLTQSADSWGLRAPGTSSP--ARLRE
                        10        20        30        40           

          250       260       270       280       290       300    
pF1KA0 GIGDKVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIK
        .  .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TVPTQVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIK
      50        60        70        80        90       100         

          310       320       330       340       350       360    
pF1KA0 IEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEI
     110       120       130       140       150       160         

          370       380       390       400       410       420    
pF1KA0 EQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSK
     170       180       190       200       210       220         

          430       440       450       460       470       480    
pF1KA0 PREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASA
     230       240       250       260       270       280         

          490       500       510       520       530       540    
pF1KA0 SSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQL
     290       300       310       320       330       340         

          550       560       570       580       590       600    
pF1KA0 QRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELASMEEKVAYQSYERARD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELASMEEKVAYQSYERARD
     350       360       370       380       390       400         

          610       620       630       640       650       660    
pF1KA0 IQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANARALLGKFINVILALMAVLLVFVSTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANARALLGKFINVILALMAVLLVFVSTI
     410       420       430       440       450       460         

          670       680       690       700         
pF1KA0 ANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLPS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLPS
     470       480       490       500       510    

>>CCDS73010.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1               (469 aa)
 initn: 2942 init1: 2942 opt: 2942  Z-score: 2140.6  bits: 406.0 E(32554): 6.5e-113
Smith-Waterman score: 2942; 100.0% identity (100.0% similar) in 460 aa overlap (250-709:10-469)

     220       230       240       250       260       270         
pF1KA0 SSSTTDTALLLADGSNVYLLAEEAEGIGDKVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGA
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73                      MKSKEEETAVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGA
                                    10        20        30         

     280       290       300       310       320       330         
pF1KA0 PDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKK
      40        50        60        70        80        90         

     340       350       360       370       380       390         
pF1KA0 NQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFG
     100       110       120       130       140       150         

     400       410       420       430       440       450         
pF1KA0 GGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAAR
     160       170       180       190       200       210         

     460       470       480       490       500       510         
pF1KA0 ALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDAL
     220       230       240       250       260       270         

     520       530       540       550       560       570         
pF1KA0 LEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNE
     280       290       300       310       320       330         

     580       590       600       610       620       630         
pF1KA0 MTNLKQELASMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MTNLKQELASMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANA
     340       350       360       370       380       390         

     640       650       660       670       680       690         
pF1KA0 RALLGKFINVILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RALLGKFINVILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLT
     400       410       420       430       440       450         

     700         
pF1KA0 YLLEHVLLPS
       ::::::::::
CCDS73 YLLEHVLLPS
     460         

>>CCDS76257.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1               (484 aa)
 initn: 2942 init1: 2942 opt: 2942  Z-score: 2140.4  bits: 406.0 E(32554): 6.7e-113
Smith-Waterman score: 2942; 100.0% identity (100.0% similar) in 460 aa overlap (250-709:25-484)

     220       230       240       250       260       270         
pF1KA0 SSSTTDTALLLADGSNVYLLAEEAEGIGDKVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGA
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76       MNQVVQPLMSRHSACRGSQAHLSWVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGA
                     10        20        30        40        50    

     280       290       300       310       320       330         
pF1KA0 PDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKK
           60        70        80        90       100       110    

     340       350       360       370       380       390         
pF1KA0 NQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFG
          120       130       140       150       160       170    

     400       410       420       430       440       450         
pF1KA0 GGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAAR
          180       190       200       210       220       230    

     460       470       480       490       500       510         
pF1KA0 ALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDAL
          240       250       260       270       280       290    

     520       530       540       550       560       570         
pF1KA0 LEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNE
          300       310       320       330       340       350    

     580       590       600       610       620       630         
pF1KA0 MTNLKQELASMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MTNLKQELASMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANA
          360       370       380       390       400       410    

     640       650       660       670       680       690         
pF1KA0 RALLGKFINVILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RALLGKFINVILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLT
          420       430       440       450       460       470    

     700         
pF1KA0 YLLEHVLLPS
       ::::::::::
CCDS76 YLLEHVLLPS
          480    

>>CCDS33855.1 TMCC1 gene_id:23023|Hs108|chr3              (653 aa)
 initn: 1984 init1: 862 opt: 1964  Z-score: 1431.3  bits: 275.2 E(32554): 2.1e-73
Smith-Waterman score: 2132; 55.2% identity (75.6% similar) in 685 aa overlap (47-703:3-646)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KA0 DGAGLEDAASHLPGADLRPGETTGANSAGGPTSDAGAAAAPNPGPRSKPPDLKKI----Q
                                     :...      :.:: .:.  . .:     :
CCDS33                             MEPSGSEQLFEDPDPGGKSQDAEARKQTESEQ
                                           10        20        30  

                     80         90       100       110       120   
pF1KA0 QLSEGS--------MFGHGLKHLF-HSRRRSREREHQTSQDSQQHQQQQGMSDHDSPDEK
       .::. .        ..:.:::::: :.::::    :    : :: : .        :.  
CCDS33 KLSKMTHNALENINVIGQGLKHLFQHQRRRSSVSPH----DVQQIQAD--------PE--
             40        50        60            70                  

           130         140       150       160       170       180 
pF1KA0 ERSPEMHRVSYAMS--LHDLPARPTAFNRVLQQIRSRPSIKRGASLHSSSGGGSSGSSSR
          :::   :      .  .:..:::.::::::::  :..:::.::::           :
CCDS33 ---PEMDLESQNACAEIDGVPTHPTALNRVLQQIRVPPKMKRGTSLHS-----------R
          80        90       100       110       120               

             190       200       210       220               230   
pF1KA0 RTKSSSLEPQRGSPHLLRKAPQDSSLAAILHQHQCRPRSSSTTD----TALL----LADG
       : :    :  .:::.. ::. :.  ..:....   :::::::::    .:..     : .
CCDS33 RGKP---EAPKGSPQINRKSGQE--MTAVMQSG--RPRSSSTTDAPTSSAMMEIACAAAA
             130       140         150         160       170       

           240       250       260         270       280       290 
pF1KA0 SNVYLLAEEAEGIGDKVDKGDLVALSLPAGH--GDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAAIDH
       . .  :  : :: ...... .. .:.  ..   ..::: :  :  ::.:::::::::: :
CCDS33 AAAACLPGE-EGTAERIERLEVSSLAQTSSAVASSTDGSIHTDSVDGTPDPQRTKAAIAH
       180        190       200       210       220       230      

             300       310       320       330       340       350 
pF1KA0 LHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIAQLH
       :.:::::.:::::: : ::::::::::::::.:::::..::::::::::::::::: ::.
CCDS33 LQQKILKLTEQIKIAQTARDDNVAEYLKLANSADKQQAARIKQVFEKKNQKSAQTILQLQ
        240       250       260       270       280       290      

             360       370       380       390       400       410 
pF1KA0 KKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKGSLS
       ::::::.:.:.:.::::  ::::::.:::.::::::::.:    .::. :::..:::..:
CCDS33 KKLEHYHRKLREVEQNGIPRQPKDVFRDMHQGLKDVGAKV----TGFSEGVVDSVKGGFS
        300       310       320       330           340       350  

             420          430       440       450       460        
pF1KA0 GLSQATHTA---VVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLV
       ..:::::.:   :::::::.:::::::::::::: .::: ::.:  ..:..::.  ... 
CCDS33 SFSQATHSAAGAVVSKPREIASLIRNKFGSADNIPNLKDSLEEGQVDDAGKALGVISNFQ
            360       370       380       390       400       410  

      470       480       490       500       510       520        
pF1KA0 SSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKE
       :::::::...::::...:.::.:..:.   :: .: :.:.:    ...::::.:..::.:
CCDS33 SSPKYGSEEDCSSATSGSVGANSTTGGIAVGA-SSSKTNTLDMQSSGFDALLHEIQEIRE
            420       430       440        450       460       470 

      530       540       550       560       570       580        
pF1KA0 GQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELA
        :..::.:.: :: . ::::. . : ::::::: :::::::::::::::::. :::::::
CCDS33 TQARLEESFETLKEHYQRDYSLIMQTLQEERYRCERLEEQLNDLTELHQNEILNLKQELA
             480       490       500       510       520       530 

      590       600       610       620       630       640        
pF1KA0 SMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANARALLGKFIN
       :::::.::::::::::::::.:.: ::..:.::::::::::::::.:::.:: ::::.::
CCDS33 SMEEKIAYQSYERARDIQEALEACQTRISKMELQQQQQQVVQLEGLENATARNLLGKLIN
             540       550       560       570       580       590 

      650       660       670       680       690       700        
pF1KA0 VILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLP
       ..::.::::::::::.:: ..:::::: :  :: .::. . .::::::.:   .:     
CCDS33 ILLAVMAVLLVFVSTVANCVVPLMKTRNRTFSTLFLVVFIAFLWKHWDALFSYVERFFSS
             600       610       620       630       640       650 

         
pF1KA0 S 
         
CCDS33 PR
         

>>CCDS31877.1 TMCC3 gene_id:57458|Hs108|chr12             (477 aa)
 initn: 1522 init1: 516 opt: 1574  Z-score: 1151.1  bits: 222.9 E(32554): 8.5e-58
Smith-Waterman score: 1581; 55.6% identity (81.8% similar) in 466 aa overlap (249-708:26-476)

      220       230       240       250       260         270      
pF1KA0 RSSSTTDTALLLADGSNVYLLAEEAEGIGDKVDKGDLVALSLPAG--HGDTDGPISLDVP
                                     .:.. :. .:::: .  .: .:  ...:::
CCDS31      MPGSDTALTVDRTYSYPGRHHRCKSRVERHDMNTLSLPLNIRRGGSDTNLNFDVP
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pF1KA0 DGAPDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVF
       ::  : ...: . : :.:::::.:::::::: .:: ::::::::.:::::::..::::::
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       ::::::::..::::.::::.:.:.:.:::::: ::. ::.    :.:....:::  :.:.
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pF1KA0 AGISGFGGGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDG
          :  .   .:. :... :.: .  . : .: ::::.::::::::::::::::. ::. 
CCDS31 ---SRTAPHCMESSKSGMPGVSLTPPVFVFNKSREFANLIRNKFGSADNIAHLKNSLEEF
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        :: .::: .::::.:..:::::::::::....:: ...:.. : :::       .   .
CCDS31 RPEASARAYGGSATIVNKPKYGSDDECSSGTSGSADSNGNQSFGAGGA-------STLDS
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pF1KA0 PGNLDALLEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDL
        :.: ..::::::::. :..: ...: ::.:..:.: ...: ::::::::::::.::.::
CCDS31 QGKLAVILEELREIKDTQAQLAEDIEALKVQFKREYGFISQTLQEERYRYERLEDQLHDL
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pF1KA0 TELHQNEMTNLKQELASMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLE
       :.:::.: .::::::::.:::::::.:::.::::::.::: ::..::::.::.::..: .
CCDS31 TDLHQHETANLKQELASIEEKVAYQAYERSRDIQEALESCQTRISKLELHQQEQQALQTD
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        :   ::..:::. ::::::.:.:.:: :::::.:..:.::.: .: .: . : .: .. 
CCDS31 TV---NAKVLLGRCINVILAFMTVILVCVSTIAKFVSPMMKSRCHILGTFFAVTLLAIFC
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       :.:: .   .:....: 
CCDS31 KNWDHILCAIERMIIPR
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CCDS73                            MNTLSLPLNIRRGGSDTNLNFDVPDGILDFHKV
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