seq1 = pF1KA0471.tfa, 1110 bp seq2 = pF1KA0471/gi568815597f_174700333.tfa (gi568815597f:174700333_175089998), 389666 bp >pF1KA0471 1110 >gi568815597f:174700333_175089998 (Chr1) 1-168 (100001-100168) 100% -> 169-297 (111500-111628) 100% -> 298-390 (257125-257217) 100% -> 391-501 (268945-269055) 100% -> 502-606 (275746-275850) 100% -> 607-690 (278475-278558) 100% -> 691-762 (282502-282573) 100% -> 763-960 (288309-288506) 100% -> 961-1110 (289517-289666) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGAAGAAGGGGTGCCCTGCCCAGCCCCAGCTGCTAAGCTCACACCTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGAAGAAGGGGTGCCCTGCCCAGCCCCAGCTGCTAAGCTCACACCTCC 50 . : . : . : . : . : 51 TGTCAAAAAGTCCCAGGACATGCACGACGAGAGGAGCAAGCTGGTGAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 TGTCAAAAAGTCCCAGGACATGCACGACGAGAGGAGCAAGCTGGTGAATG 100 . : . : . : . : . : 101 AGTATGCGTGTCGAGTGCTGGAACTTCTGGGGATGGGGCATCGTCTGTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 AGTATGCGTGTCGAGTGCTGGAACTTCTGGGGATGGGGCATCGTCTGTTT 150 . : . : . : . : . : 151 GTGCCTCGGCTTCTGGCG ACCTCAAAGGAAGACCTTCTGCA ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| 100151 GTGCCTCGGCTTCTGGCGGTG...CAGACCTCAAAGGAAGACCTTCTGCA 200 . : . : . : . : . : 192 GGCTGATTTTGAAGGTGCTTTAAAGTTCTTTAGAGTTCAGCTTCCAAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111523 GGCTGATTTTGAAGGTGCTTTAAAGTTCTTTAGAGTTCAGCTTCCAAAGA 250 . : . : . : . : . : 242 GATACAGGGCAGAGGAAAATGCAAGAAGACTGATGGAGCAGGCTTGCAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111573 GATACAGGGCAGAGGAAAATGCAAGAAGACTGATGGAGCAGGCTTGCAAT 300 . : . : . : . : . : 292 ATTAAA GTACCAACCAAGAAGCTGAAGAAATATGAGAAAGA ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111623 ATTAAAGTA...CAGGTACCAACCAAGAAGCTGAAGAAATATGAGAAAGA 350 . : . : . : . : . : 333 ATATCAGACAATGCGAGAGAGTCAGCTGCAACAGGAAGACCCAATGGATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 257160 ATATCAGACAATGCGAGAGAGTCAGCTGCAACAGGAAGACCCAATGGATA 400 . : . : . : . : . : 383 GATACAAG AGGGAGAACCGAAGATTACAGGAGGCCAGCATG ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| 257210 GATACAAGGTA...CAGAGGGAGAACCGAAGATTACAGGAGGCCAGCATG 450 . : . : . : . : . : 424 AGGTTGGAACAAGAGAATGATGACCTTGCCCATGAACTAGTAACAAGCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 268978 AGGTTGGAACAAGAGAATGATGACCTTGCCCATGAACTAGTAACAAGCAA 500 . : . : . : . : . : 474 AATTGCTCTACGGAATGACTTGGATCAG GCAGAAGACAAGG ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 269028 AATTGCTCTACGGAATGACTTGGATCAGGTA...CAGGCAGAAGACAAGG 550 . : . : . : . : . : 515 CAGATGTGTTGAATAAAGAGCTCCTTTTGACCAAACAGAGGCTGGTGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 275759 CAGATGTGTTGAATAAAGAGCTCCTTTTGACCAAACAGAGGCTGGTGGAG 600 . : . : . : . : . : 565 ACTGAAGAGGAGAAGAGGAAGCAAGAGGAAGAGACTGCCCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 275809 ACTGAAGAGGAGAAGAGGAAGCAAGAGGAAGAGACTGCCCAGGTA...TA 650 . : . : . : . : . : 607 CTAAAAGAAGTCTTCAGGAAACAGCTAGAGAAGGCAGAATATGAAATAA >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 278474 GCTAAAAGAAGTCTTCAGGAAACAGCTAGAGAAGGCAGAATATGAAATAA 700 . : . : . : . : . : 656 AGAAGACTACAGCTATCATTGCTGAGTATAAACAG ATCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 278524 AGAAGACTACAGCTATCATTGCTGAGTATAAACAGGTA...TAGATCTGT 750 . : . : . : . : . : 697 TCGCAGTTGAGTACCAGGCTGGAGAAACAGCAAGCAGCCAGCAAGGAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 282508 TCGCAGTTGAGTACCAGGCTGGAGAAACAGCAAGCAGCCAGCAAGGAGGA 800 . : . : . : . : . : 747 GCTGGAAGTGGTAAAG GGTAAGATGATGGCATGCAAACACT ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 282558 GCTGGAAGTGGTAAAGGTA...TAGGGTAAGATGATGGCATGCAAACACT 850 . : . : . : . : . : 788 GCAGTGACATTTTCAGCAAGGAGGGTGCTTTGAAACTAGCAGCCACAGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 288334 GCAGTGACATTTTCAGCAAGGAGGGTGCTTTGAAACTAGCAGCCACAGGC 900 . : . : . : . : . : 838 AGAGAGGACCAGGGAATTGAAACAGATGATGAGAAGGACTCACTTAAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 288384 AGAGAGGACCAGGGAATTGAAACAGATGATGAGAAGGACTCACTTAAGAA 950 . : . : . : . : . : 888 GCAGCTGAGAGAGATGGAACTGGAACTGGCACAAACCAAACTGCAGTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 288434 GCAGCTGAGAGAGATGGAACTGGAACTGGCACAAACCAAACTGCAGTTGG 1000 . : . : . : . : . : 938 TGGAGGCCAAGTGTAAAATTCAG GAACTTGAACATCAGAGA |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 288484 TGGAGGCCAAGTGTAAAATTCAGGTT...TAGGAACTTGAACATCAGAGA 1050 . : . : . : . : . : 979 GGAGCCCTTATGAATGAAATCCAAGCTGCGAAAAACTCTTGGTTTAGCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 289535 GGAGCCCTTATGAATGAAATCCAAGCTGCGAAAAACTCTTGGTTTAGCAA 1100 . : . : . : . : . : 1029 AACCCTGAACTCTATCAAAACGGCCACGGGCACCCAGCCATTGCAGCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 289585 AACCCTGAACTCTATCAAAACGGCCACGGGCACCCAGCCATTGCAGCCAG 1150 . : . : . : 1079 CACCGGTCACCCAGCCACCCAAGGAGAGCACA |||||||||||||||||||||||||||||||| 289635 CACCGGTCACCCAGCCACCCAAGGAGAGCACA