Result of SIM4 for pF1KA0418

seq1 = pF1KA0418.tfa, 2820 bp
seq2 = pF1KA0418/gi568815588r_103501819.tfa (gi568815588r:103501819_103761091), 259273 bp

>pF1KA0418 2820
>gi568815588r:103501819_103761091 (Chr10)

(complement)

1-109  (100001-100109)   100% ->
110-223  (133890-134003)   100% ->
224-341  (143778-143895)   100% ->
342-679  (147902-148239)   100% ->
680-729  (149462-149511)   100% ->
730-849  (155175-155294)   100% ->
850-2820  (157303-159273)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCCTGGAACAGTACGTGGTGGTGTCCAACTATAAGAAGCAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATCCTGGAACAGTACGTGGTGGTGTCCAACTATAAGAAGCAGGAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCGGAGCTGAGCCTCCAGGCCGGGGAGGTGGTGGATGTCATCGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCGGAGCTGAGCCTCCAGGCCGGGGAGGTGGTGGATGTCATCGAGAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGAGAGCG         GCTGGTGGTTCGTGAGCACTTCTGAGGAGCAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGAGAGCGGTG...CAGGCTGGTGGTTCGTGAGCACTTCTGAGGAGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCTGGGTCCCTGCCACCTACCTGGAGGCCCAGAATGGTACTCGGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133922 GGCTGGGTCCCTGCCACCTACCTGGAGGCCCAGAATGGTACTCGGGATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTCCGACATCAACACCTCTAAGACTGGAGAAG         AGGAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 133972 CTCCGACATCAACACCTCTAAGACTGGAGAAGGTG...CAGAGGAGAAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGTCACCGTGCAGCCTTACACCAGCCAAAGCAAGGACGAGATTGGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143787 ATGTCACCGTGCAGCCTTACACCAGCCAAAGCAAGGACGAGATTGGCTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGAAGGGCGTCACAGTGGAGGTGATCCGGAAGAATCTGGAAGGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143837 GAGAAGGGCGTCACAGTGGAGGTGATCCGGAAGAATCTGGAAGGCTGGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTATATCAG         ATACCTGGGCAAAGAGGGCTGGGCGCCAGCAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 143887 GTATATCAGGTA...CAGATACCTGGGCAAAGAGGGCTGGGCGCCAGCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCTACCTGAAGAAGGCCAAGGATGACCTGCCAACCCGGAAGAAGAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147934 CCTACCTGAAGAAGGCCAAGGATGACCTGCCAACCCGGAAGAAGAACCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCGGCCCAGTGGAGATCATTGGGAACATCATGGAGATCAGCAACCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147984 GCCGGCCCAGTGGAGATCATTGGGAACATCATGGAGATCAGCAACCTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAACAAGAAGGCGTCTGGGGACAAGGAAACTCCACCAGCCGAAGGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148034 GAACAAGAAGGCGTCTGGGGACAAGGAAACTCCACCAGCCGAAGGCGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCCATGAGGCCCCCATTGCCAAGAAGGAGATCAGCCTGCCCATCCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148084 GCCATGAGGCCCCCATTGCCAAGAAGGAGATCAGCCTGCCCATCCTCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AATGCCTCCAATGGCAGTGCCGTGGGCGTTCCTGACAGGACTGTCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148134 AATGCCTCCAATGGCAGTGCCGTGGGCGTTCCTGACAGGACTGTCTCCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCTGGCCCAGGGCTCTCCAGCTGTGGCCAGGATTGCCCCTCAGCGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148184 GCTGGCCCAGGGCTCTCCAGCTGTGGCCAGGATTGCCCCTCAGCGGGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGATCA         GCTCCCCGAACCTACGGACAAGACCTCCACCACGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148234 AGATCAGTA...TAGGCTCCCCGAACCTACGGACAAGACCTCCACCACGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AGAGAATCCAGCCTG         GGGTTCCAACTGCCAAAGCCACCAGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 149497 AGAGAATCCAGCCTGGTA...TAGGGGTTCCAACTGCCAAAGCCACCAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCCCCCTTCTGTTGAGGTGGAGTACTACACCATTGCCGAATTCCAGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155201 GCCCCCTTCTGTTGAGGTGGAGTACTACACCATTGCCGAATTCCAGTCGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GCATTTCCGATGGCATCAGCTTTCGGGGTGGACAGAAGGCAGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 155251 GCATTTCCGATGGCATCAGCTTTCGGGGTGGACAGAAGGCAGAGGTA...

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    850    GTCATTGATAAGAACTCAGGTGGCTGGTGGTACGTGCAGATCGGTGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157300 CAGGTCATTGATAAGAACTCAGGTGGCTGGTGGTACGTGCAGATCGGTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GAAGGAGGGCTGGGCCCCCGCATCATACATCGATAAGCGCAAGAAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157350 GAAGGAGGGCTGGGCCCCCGCATCATACATCGATAAGCGCAAGAAGCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ACCTGAGCCGCCGCACAAGCACGCTGACCCGGCCCAAGGTGCCCCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157400 ACCTGAGCCGCCGCACAAGCACGCTGACCCGGCCCAAGGTGCCCCCGCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCACCCCCCAGCAAGCCCAAGGAGGCCGAGGAGGGCCCTACGGGGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157450 GCACCCCCCAGCAAGCCCAAGGAGGCCGAGGAGGGCCCTACGGGGGCCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TGAGAGCCAGGACTCCCCGCGGAAGCTCAAGTATGAGGAGCCTGAGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157500 TGAGAGCCAGGACTCCCCGCGGAAGCTCAAGTATGAGGAGCCTGAGTATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 ACATCCCTGCATTCGGCTTTGACTCAGAGCCTGAGCTGAGCGAGGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157550 ACATCCCTGCATTCGGCTTTGACTCAGAGCCTGAGCTGAGCGAGGAGCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GTGGAGGACAGAGCCTCAGGGGAGAGGCGGCCTGCCCAGCCCCACCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157600 GTGGAGGACAGAGCCTCAGGGGAGAGGCGGCCTGCCCAGCCCCACCGGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CTCGCCGGCCTCTTCTCTGCAGCGGGCCCGCTTCAAGGTGGGTGAGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157650 CTCGCCGGCCTCTTCTCTGCAGCGGGCCCGCTTCAAGGTGGGTGAGTCTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CAGAGGATGTGGCCCTGGAAGAGGAGACCATCTATGAGAATGAGGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157700 CAGAGGATGTGGCCCTGGAAGAGGAGACCATCTATGAGAATGAGGGCTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CGGCCATATGCAGAGGACACCCTGTCAGCCAGAGGCTCCTCCGGGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157750 CGGCCATATGCAGAGGACACCCTGTCAGCCAGAGGCTCCTCCGGGGACAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CGACTCCCCAGGCAGCTCCTCGCTGTCCCTGACCAGGAAAAACTCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157800 CGACTCCCCAGGCAGCTCCTCGCTGTCCCTGACCAGGAAAAACTCCCCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 AATCAGGCTCCCCCAAGTCATCATCACTCCTAAAGCTCAAGGCAGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157850 AATCAGGCTCCCCCAAGTCATCATCACTCCTAAAGCTCAAGGCAGAGAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 AATGCCCAGGCAGAAATGGGGAAGAACCACTCCTCAGCCTCCTTTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157900 AATGCCCAGGCAGAAATGGGGAAGAACCACTCCTCAGCCTCCTTTTCCTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 ATCCATCACCATCAACACCACTTGCTGCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157950 ATCCATCACCATCAACACCACTTGCTGCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 CTTCCTTGTCCAAAACCAGTGGCGACCTGAAGCCCCGCTCTGCTTCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158000 CTTCCTTGTCCAAAACCAGTGGCGACCTGAAGCCCCGCTCTGCTTCGGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 GCAGGCATCCGCGGCACTCCCAAGGTCAGGGCAAAGAAGGATGCTGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158050 GCAGGCATCCGCGGCACTCCCAAGGTCAGGGCAAAGAAGGATGCTGATGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 GAACGCTGGGCTGACCTCCTGTCCCCGGGCCAAGCCATCGGTCCGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158100 GAACGCTGGGCTGACCTCCTGTCCCCGGGCCAAGCCATCGGTCCGGCCCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 AGCCATTCCTAAACCGAGCAGAGTCGCAGAGCCAAGAGAAGATGGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158150 AGCCATTCCTAAACCGAGCAGAGTCGCAGAGCCAAGAGAAGATGGACATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 AGCACTTTACGGCGCCAGCTGAGACCCACAGGCCAGCTCCGTGGAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158200 AGCACTTTACGGCGCCAGCTGAGACCCACAGGCCAGCTCCGTGGAGGGCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 CAAGGGCTCCAAGAGTGAGGATTCGGAGCTGCCCCCGCAGACGGCCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158250 CAAGGGCTCCAAGAGTGAGGATTCGGAGCTGCCCCCGCAGACGGCCTCCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1847 AGGCTCCCAGTGAGGGGTCTAGGAGAAGCTCATCCGACCTCATCACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158300 AGGCTCCCAGTGAGGGGTCTAGGAGAAGCTCATCCGACCTCATCACCCTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1897 CCAGCCACCACTCCCCCATGTCCCACCAAGAAGGAATGGGAAGGGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158350 CCAGCCACCACTCCCCCATGTCCCACCAAGAAGGAATGGGAAGGGCCAGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1947 CACCTCGTACATGACATGCAGCGCCTACCAGAAGGTCCAGGACTCGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158400 CACCTCGTACATGACATGCAGCGCCTACCAGAAGGTCCAGGACTCGGAGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1997 TCAGCTTCCCCGCGGGCGTGGAGGTGCAGGTGCTGGAGAAGCAGGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158450 TCAGCTTCCCCGCGGGCGTGGAGGTGCAGGTGCTGGAGAAGCAGGAGAGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 GGGTGGTGGTATGTGAGGTTTGGGGAGCTGGAGGGCTGGGCCCCTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158500 GGGTGGTGGTATGTGAGGTTTGGGGAGCTGGAGGGCTGGGCCCCTTCCCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 CTATTTGGTGCTGGATGAGAACGAGCAACCTGACCCCTCTGGCAAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158550 CTATTTGGTGCTGGATGAGAACGAGCAACCTGACCCCTCTGGCAAAGAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2147 TGGACACAGTGCCCGCCAAGGGCAGGCAGAACGAAGGCAAGTCAGACAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 158600 TGGACACAGTGCCCGCCAAGGGCAGGCAGAACGAAGGCAAATCAGACAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2197 CTGGAGAAGATCGAGAGGCGCGTCCAAGCACTGAACACCGTCAACCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158650 CTGGAGAAGATCGAGAGGCGCGTCCAAGCACTGAACACCGTCAACCAGAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2247 CAAGAAGGCCACGCCCCCCATCCCCTCCAAACCTCCCGGGGGCTTTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 158700 CAAGAAGGCCACGCCCCCCATCCCCTCCAAACCTCCCGGGGGCTTCGGCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2297 AGACCTCAGGCACTCCAGCGGTGAAGATGAGGAACGGAGTGCGGCAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158750 AGACCTCAGGCACTCCAGCGGTGAAGATGAGGAACGGAGTGCGGCAGGTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2347 GCGGTCAGGCCCCAGTCGGTGTTTGTGTCCCCGCCACCCAAGGACAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158800 GCGGTCAGGCCCCAGTCGGTGTTTGTGTCCCCGCCACCCAAGGACAACAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2397 CCTGTCCTGCGCCCTGCGGAGGAATGAGTCACTCACGGCCACTGATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158850 CCTGTCCTGCGCCCTGCGGAGGAATGAGTCACTCACGGCCACTGATGGCC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2447 TCCGAGGCGTCCGACGGAACTCCTCCTTTAGCACTGCTCGCTCCGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158900 TCCGAGGCGTCCGACGGAACTCCTCCTTTAGCACTGCTCGCTCCGCTGCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2497 GCCGAGGCCAAGGGCCGCCTGGCCGAACGGGCTGCCAGCCAGGGTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158950 GCCGAGGCCAAGGGCCGCCTGGCCGAACGGGCTGCCAGCCAGGGTTCAGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2547 CTCACCCCTACTGCCCGCCCAGCGCAACAGCATCCCCGTGTCCCCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 159000 CTCACCCCTACTGCCCGCCCAGCGCAACAGCATACCCGTGTCCCCTGTGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2597 GCCCCAAGCCCATCGAGAAGTCTCAGTTCATCCACAATAACCTCAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159050 GCCCCAAGCCCATCGAGAAGTCTCAGTTCATCCACAATAACCTCAAAGAT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2647 GTGTACGTCTCTATCGCAGACTACGAGGGGGATGAGGAGACAGCAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159100 GTGTACGTCTCTATCGCAGACTACGAGGGGGATGAGGAGACAGCAGGCTT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2697 CCAGGAGGGGGTGTCCATGGAGGTTCTGGAGAGGAACCCTAATGGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159150 CCAGGAGGGGGTGTCCATGGAGGTTCTGGAGAGGAACCCTAATGGCTGGT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2747 GGTACTGCCAGATCCTGGATGGTGTGAAGCCCTTCAAAGGCTGGGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159200 GGTACTGCCAGATCCTGGATGGTGTGAAGCCCTTCAAAGGCTGGGTGCCT

   2850     .    :    .    :
   2797 TCCAACTACCTTGAGAAAAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||
 159250 TCCAACTACCTTGAGAAAAAGAAC

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