Result of FASTA (ccds) for pF1KA0339
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0339, 1707 aa
  1>>>pF1KA0339 1707 - 1707 aa - 1707 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.0405+/-0.00124; mu= -20.0421+/- 0.076
 mean_var=777.4952+/-158.373, 0's: 0 Z-trim(117.7): 55  B-trim: 53 in 1/53
 Lambda= 0.045997
 statistics sampled from 18449 (18499) to 18449 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.787), E-opt: 0.2 (0.568), width:  16
 Scan time:  5.890

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32435.1 SETD1A gene_id:9739|Hs108|chr16        (1707) 11558 783.5       0
CCDS53838.1 SETD1B gene_id:23067|Hs108|chr12       (1923) 1561 120.2 7.2e-26


>>CCDS32435.1 SETD1A gene_id:9739|Hs108|chr16             (1707 aa)
 initn: 11558 init1: 11558 opt: 11558  Z-score: 4163.9  bits: 783.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 11558; 100.0% identity (100.0% similar) in 1707 aa overlap (1-1707:1-1707)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MDQEGGGDGQKAPSFQWRNYKLIVDPALDPALRRPSQKVYRYDGVHFSVNDSKYIPVEDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDQEGGGDGQKAPSFQWRNYKLIVDPALDPALRRPSQKVYRYDGVHFSVNDSKYIPVEDL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 QDPRCHVRSKNRDFSLPVPKFKLDEFYIGQIPLKEVTFARLNDNVRETFLKDMCRKYGEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QDPRCHVRSKNRDFSLPVPKFKLDEFYIGQIPLKEVTFARLNDNVRETFLKDMCRKYGEV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 EEVEILLHPRTRKHLGLARVLFTSTRGAKETVKNLHLTSVMGNIIHAQLDIKGQQRMKYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EEVEILLHPRTRKHLGLARVLFTSTRGAKETVKNLHLTSVMGNIIHAQLDIKGQQRMKYY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 ELIVNGSYTPQTVPTGGKALSEKFQGSGAATETAESRRRSSSDTAAYPAGTTAVGTPGNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ELIVNGSYTPQTVPTGGKALSEKFQGSGAATETAESRRRSSSDTAAYPAGTTAVGTPGNG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 TPCSQDTSFSSSRQDTPSSFGQFTPQSSQGTPYTSRGSTPYSQDSAYSSSTTSTSFKPRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TPCSQDTSFSSSRQDTPSSFGQFTPQSSQGTPYTSRGSTPYSQDSAYSSSTTSTSFKPRR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 SENSYQDAFSRRHFSASSASTTASTAIAATTAATASSSASSSSLSSSSSSSSSSSSSQFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SENSYQDAFSRRHFSASSASTTASTAIAATTAATASSSASSSSLSSSSSSSSSSSSSQFR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 SSDANYPAYYESWNRYQRHTSYPPRRATREEPPGAPFAENTAERFPPSYTSYLPPEPSRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSDANYPAYYESWNRYQRHTSYPPRRATREEPPGAPFAENTAERFPPSYTSYLPPEPSRP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 TDQDYRPPASEAPPPEPPEPGGGGGGGGPSPEREEVRTSPRPASPARSGSPAPETTNESV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDQDYRPPASEAPPPEPPEPGGGGGGGGPSPEREEVRTSPRPASPARSGSPAPETTNESV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 PFAQHSSLDSRIEMLLKEQRSKFSFLASDTEEEEENSSMVLGARDTGSEVPSGSGHGPCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PFAQHSSLDSRIEMLLKEQRSKFSFLASDTEEEEENSSMVLGARDTGSEVPSGSGHGPCT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 PPPAPANFEDVAPTGSGEPGATRESPKANGQNQASPCSSGDDMEISDDDRGGSPPPAPTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPPAPANFEDVAPTGSGEPGATRESPKANGQNQASPCSSGDDMEISDDDRGGSPPPAPTP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 PQQPPPPPPPPPPPPPYLASLPLGYPPHQPAYLLPPRPDGPPPPEYPPPPPPPPHIYDFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PQQPPPPPPPPPPPPPYLASLPLGYPPHQPAYLLPPRPDGPPPPEYPPPPPPPPHIYDFV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 NSLELMDRLGAQWGGMPMSFQMQTQMLTRLHQLRQGKGLIAASAGPPGGAFGEAFLPFPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NSLELMDRLGAQWGGMPMSFQMQTQMLTRLHQLRQGKGLIAASAGPPGGAFGEAFLPFPP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 PQEAAYGLPYALYAQGQEGRGAYSREAYHLPMPMAAEPLPSSSVSGEEARLPPREEAELA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PQEAAYGLPYALYAQGQEGRGAYSREAYHLPMPMAAEPLPSSSVSGEEARLPPREEAELA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 EGKTLPTAGTVGRVLAMLVQEMKSIMQRDLNRKMVENVAFGAFDQWWESKEEKAKPFQNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EGKTLPTAGTVGRVLAMLVQEMKSIMQRDLNRKMVENVAFGAFDQWWESKEEKAKPFQNA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 AKQQAKEEDKEKTKLKEPGLLSLVDWAKSGGTTGIEAFAFGSGLRGALRLPSFKVKRKEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AKQQAKEEDKEKTKLKEPGLLSLVDWAKSGGTTGIEAFAFGSGLRGALRLPSFKVKRKEP
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 SEISEASEEKRPRPSTPAEEDEDDPEQEKEAGEPGRPGTKPPKRDEERGKTQGKHRKSFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SEISEASEEKRPRPSTPAEEDEDDPEQEKEAGEPGRPGTKPPKRDEERGKTQGKHRKSFA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 LDSEGEEASQESSSEKDEEDDEEDEEDEDREEAVDTTKKETEVSDGEDEESDSSSKCSLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LDSEGEEASQESSSEKDEEDDEEDEEDEDREEAVDTTKKETEVSDGEDEESDSSSKCSLY
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 ADSDGENDSTSDSESSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSESSSEDEEEEERPAALPSASPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ADSDGENDSTSDSESSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSESSSEDEEEEERPAALPSASPP
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 PREVPVPTPAPVEVPVPERVAGSPVTPLPEQEASPARPAGPTEESPPSAPLRPPEPPAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PREVPVPTPAPVEVPVPERVAGSPVTPLPEQEASPARPAGPTEESPPSAPLRPPEPPAGP
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 PAPAPRPDERPSSPIPLLPPPKKRRKTVSFSAIEVVPAPEPPPATPPQAKFPGPASRKAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PAPAPRPDERPSSPIPLLPPPKKRRKTVSFSAIEVVPAPEPPPATPPQAKFPGPASRKAP
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 RGVERTIRNLPLDHASLVKSWPEEVSRGGRSRAGGRGRLTEEEEAEPGTEVDLAVLADLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RGVERTIRNLPLDHASLVKSWPEEVSRGGRSRAGGRGRLTEEEEAEPGTEVDLAVLADLA
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 LTPARRGLPALPAVEDSEATETSDEAERPRPLLSHILLEHNYALAVKPTPPAPALRPPEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTPARRGLPALPAVEDSEATETSDEAERPRPLLSHILLEHNYALAVKPTPPAPALRPPEP
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA0 VPAPAALFSSPADEVLEAPEVVVAEAEEPKPQQLQQQREEGEEEGEEEGEEEEEESSDSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPAPAALFSSPADEVLEAPEVVVAEAEEPKPQQLQQQREEGEEEGEEEGEEEEEESSDSS
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA0 SSSDGEGALRRRSLRSHARRRRPPPPPPPPPPRAYEPRSEFEQMTILYDIWNSGLDSEDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSSDGEGALRRRSLRSHARRRRPPPPPPPPPPRAYEPRSEFEQMTILYDIWNSGLDSEDM
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KA0 SYLRLTYERLLQQTSGADWLNDTHWVHHTITNLTTPKRKRRPQDGPREHQTGSARSEGYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SYLRLTYERLLQQTSGADWLNDTHWVHHTITNLTTPKRKRRPQDGPREHQTGSARSEGYY
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KA0 PISKKEKDKYLDVCPVSARQLEGVDTQGTNRVLSERRSEQRRLLSAIGTSAIMDSDLLKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PISKKEKDKYLDVCPVSARQLEGVDTQGTNRVLSERRSEQRRLLSAIGTSAIMDSDLLKL
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KA0 NQLKFRKKKLRFGRSRIHEWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQNIRQMVADMREKRYVQEGIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NQLKFRKKKLRFGRSRIHEWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQNIRQMVADMREKRYVQEGIG
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KA0 SSYLFRVDHDTIIDATKCGNLARFINHCCTPNCYAKVITIESQKKIVIYSKQPIGVDEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSYLFRVDHDTIIDATKCGNLARFINHCCTPNCYAKVITIESQKKIVIYSKQPIGVDEEI
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700       
pF1KA0 TYDYKFPLEDNKIPCLCGTESCRGSLN
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TYDYKFPLEDNKIPCLCGTESCRGSLN
             1690      1700       

>>CCDS53838.1 SETD1B gene_id:23067|Hs108|chr12            (1923 aa)
 initn: 2636 init1: 919 opt: 1561  Z-score: 577.9  bits: 120.2 E(32554): 7.2e-26
Smith-Waterman score: 3088; 38.5% identity (55.5% similar) in 1816 aa overlap (176-1707:185-1923)

         150       160       170       180       190       200     
pF1KA0 RGAKETVKNLHLTSVMGNIIHAQLDIKGQQRMKYYELIVNGSYTPQTVPTGGKALSEKFQ
                                     ::..:::.:.: :::::.:.:       . 
CCDS53 RGAKDAVQHLHSTSVMGNIIHVELDTKGETRMRFYELLVTGRYTPQTLPVGELDAVSPIV
          160       170       180       190       200       210    

         210       220       230       240       250       260     
pF1KA0 GSGAATETAESRRRSSSDTAAYPAGTTAVGTPGNGTPCSQDTSFSSSRQDTPSSFGQFTP
       .       : .: .... .:.  .:...:   ..::: ::::..:: : :::.:.::   
CCDS53 NETLQLSDALKRLKDGGLSAGCGSGSSSVTPNSGGTPFSQDTAYSSCRLDTPNSYGQ---
          220       230       240       250       260       270    

         270       280       290                 300       310     
pF1KA0 QSSQGTPYTSRGSTPYSQDSAYSSSTTSTS----------FKPRRSENSYQDAFSRRHFS
           ::: : : .::.::::.:::   . :          :: :: :... ::..:::  
CCDS53 ----GTPLTPRLGTPFSQDSSYSSRQPTPSYLFSQDPAVTFKARRHESKFTDAYNRRHEH
                 280       290       300       310       320       

         320       330       340       350       360       370     
pF1KA0 ASSASTTASTAIAATTAATASSSASSSSLSSSSSSSSSSSSSQFRSSDANYPAYYESWNR
           .. : ::.:..:::  .::       .. .....::.  :...  .  ..      
CCDS53 HYVHNSPAVTAVAGATAAFRGSSDLPF---GAVGGTGGSSGPPFKAQPQDSATFA-----
       330       340       350          360       370              

         380       390            400       410              420   
pF1KA0 YQRHTSYPPRRATREEPPG-----APFAENTAERFPPSYTSYLPPEPS-------RPTDQ
          ::  :: .::    ::     .:.   .:. :::      : ::.       : . .
CCDS53 ---HTP-PPAQAT--PAPGFKSAFSPYQTPVAH-FPPP-----PEEPTATAAFGARDSGE
        380          390       400        410            420       

           430        440           450       460          470     
pF1KA0 DYRPPASEAPPPEPP-EPGG----GGGGGGPSPEREEVRTSPRPA---SPARSGSPAPET
         : ::   ::: :: :: .    :   : : :. . .. . ::.   ::    ::.  :
CCDS53 FRRAPA---PPPLPPAEPLAKEKPGTPPGPPPPDTNSMELGGRPTFGWSPEPCDSPGTPT
       430          440       450       460       470       480    

         480         490       500          510       520       530
pF1KA0 TNESV--PFAQHSSLDSRIEMLLKEQRSKFSFLA---SDTEEEEENSSMVLGARDTGSEV
        . :   :   :.::::::::::::::.:. ::    :::: . :.: .  .. . .  .
CCDS53 LESSPAGPEKPHDSLDSRIEMLLKEQRTKLLFLREPDSDTELQMEGSPISSSSSQLSPLA
          490       500       510       520       530       540    

                  540          550                         560     
pF1KA0 PSGSGHGPC----TPP---PAPANFEDVAPT-------------GSG-----EPGA----
       : :..  :     :::   :. ...::..::             : :     :::     
CCDS53 PFGTNSQPGFRGPTPPSSRPSSTGLEDISPTPLPDSDEDEELDLGLGPRPPPEPGPPDPA
          550       560       570       580       590       600    

                           570       580       590                 
pF1KA0 -----TRE---------SPKANGQNQASPCSSGDDMEISDDDRGGSP------P------
            : :         .: .. .....  :::.:::::::.  ..:      :      
CCDS53 GLLSQTAEVALDLVGDRTPTSEKMDEGQQ-SSGEDMEISDDEMPSAPITSADCPKPMVVT
          610       620       630        640       650       660   

                         600        610             620       630  
pF1KA0 ----------------PAPTPPQQPP-PPPPPPPPP------PPYLASLPLGYPPHQPAY
                       : : ::  :: :::::::::      :: :   :   :: .:: 
CCDS53 PGAAAVAAPSVLAPTLPLPPPPGFPPLPPPPPPPPPQPGFPMPPPLPPPPPPPPPAHPAV
           670       680       690       700       710       720   

                640        650       660       670       680       
pF1KA0 LLPP----RPDG-PPPPEYPPPPPPPPHIYDFVNSLELMDRLGAQWGGMPMSFQMQTQML
        .::     : : ::::  :: :: :: ..  : ....   ::.::::::::::::::.:
CCDS53 TVPPPPLPAPPGVPPPPILPPLPPFPPGLFP-VMQVDMSHVLGGQWGGMPMSFQMQTQVL
           730       740       750        760       770       780  

       690             700       710       720       730       740 
pF1KA0 TRLHQLRQGKG------LIAASAGPPGGAFGEAFLPFPPPQEAAYGLPYALYAQGQEGRG
       .::     :.:      ..::.:.  ... :  :. .::     :  :..:  .:  :::
CCDS53 SRLMT---GQGACPYPPFMAAAAA--AASAGLQFVNLPP-----YRGPFSLSNSGP-GRG
               790       800         810            820        830 

             750       760       770       780       790       800 
pF1KA0 AYSREAYHLPMPMAAEPLPSSSVSGEEARLPPREEAELAEGKTLPTAGTVGRVLAMLVQE
              : :      :::. . :       ::.:         :  .::  :: ....:
CCDS53 Q------HWP------PLPKFDPSVPPPGYMPRQED--------PHKATVDGVLLVVLKE
                         840       850               860       870 

             810       820       830       840        850       860
pF1KA0 MKSIMQRDLNRKMVENVAFGAFDQWWESKEEKAKPFQNAAKQ-QAKEEDKEKTKLKEPGL
       .:.::.::::::::: ::: :::.::..::. ::   . .:. . :.::. : : .  . 
CCDS53 LKAIMKRDLNRKMVEVVAFRAFDEWWDKKERMAKASLTPVKSGEHKDEDRPKPKDRIASC
             880       890       900       910       920       930 

              870       880       890       900       910       920
pF1KA0 LSLVDWAKSGGTTGIEAFAFGSGLRGALRLPSFKVKRKEPSEISEASEEKRPRPSTPAEE
       : : .:.:. :  : :....: :::::.:::::::::::: . . ....:: :::: ..:
CCDS53 L-LESWGKGEGL-GYEGLGLGIGLRGAIRLPSFKVKRKEPPDTTSSGDQKRLRPSTSVDE
              940        950       960       970       980         

              930       940       950       960       970          
pF1KA0 DEDDPEQEKEAGEPGRPGTKPPKRDEERGKTQGKHRKSFALDSEGEEASQESSSEKDE--
       .... :.:..      :  .  ::: .   .. .  . . ::: :::  .:: ::..:  
CCDS53 EDEESERERDRDMADTP-CELAKRDPKGVGVRRRPARPLELDSGGEEDEKESLSEEQEST
     990      1000       1010      1020      1030      1040        

      980       990      1000      1010       1020         1030    
pF1KA0 EDDEEDEEDEDREEAVDTTKKETEVSDGEDEESD-SSSKCSLYADSDGENDS---TSDSE
       :..:: ::.:..:.  :  . . . :...::..  : .. .  .::: :.     :: .:
CCDS53 EEEEEAEEEEEEEDDDDDDSDDRDESENDDEDTALSEASEKDEGDSDEEETVSIVTSKAE
     1050      1060      1070      1080      1090      1100        

         1040      1050      1060           1070                   
pF1KA0 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSES-----SSEDEEEEER-------------P-----
       ..::: :: ::   ::: :: ::::.     . :.:::::.             :     
CCDS53 ATSSSESSESSEFESSSESSPSSSEDEEEVVAREEEEEEEEEEMVAEESMASAGPEDFEQ
     1110      1120      1130      1140      1150      1160        

                1080                           1090      1100      
pF1KA0 ----AALPSASPP------------------PREVPV---PTPAPVEVPVPERVAGSPVT
           :::  ..:                   :.: :      : :: :  :      :  
CCDS53 DGEEAALAPGAPAVDSLGMEEEVDIETEAVAPEERPSMLDEPPLPVGVEEPADSREPPEE
     1170      1180      1190      1200      1210      1220        

       1110          1120      1130              1140      1150    
pF1KA0 PLPEQEA----SPARPAGPTEESPPSAPLR-P-------PEPPAGPPAPAPRPDERPSSP
       :   ::.    ::  ::  .:  :: .: : :       ::::   : :   :   :  :
CCDS53 PGLSQEGAMLLSPEPPAKEVEARPPLSPERAPEHDLEVEPEPPMMLPLPLQPPLPPPRPP
     1230      1240      1250      1260      1270      1280        

         1160      1170       1180          1190                   
pF1KA0 IPLLPPPKKRRKTVSFSAIEVVP-APEPPPATP----PQAK---------FPG--PASRK
        :  :::. .   .:  ..   : : . :: ::      ::          ::  :    
CCDS53 RPPSPPPEPETTDASHPSVPPEPLAEDHPPHTPGLCGSLAKSQSTETVPATPGGEPPLSG
     1290      1300      1310      1320      1330      1340        

     1200      1210      1220      1230      1240      1250        
pF1KA0 APRGVERTIRNLPLDHASLVKSWPEEVSRGGRSRAGGRGRLTEEEEAEPGTEVDLAVL--
       .  :.  .  ..: .  :     :  .: ::  :. ::        .::.  . : :   
CCDS53 GSSGLSLSSPQVPGSPFSYPAPSPS-LSSGGLPRTPGRDFSFTPTFSEPSGPLLLPVCPL
     1350      1360      1370       1380      1390      1400       

                1260                   1270      1280      1290    
pF1KA0 ---------ADLALTPA--RRGLP-----------ALPAVEDSEATETSDEAERPRP-LL
                . :: .:.  . :::           :::::  ..:     .:  : : ::
CCDS53 PTGRRDERSGPLA-SPVLLETGLPLPLPLPLPLPLALPAVLRAQA-----RAPTPLPPLL
      1410      1420       1430      1440      1450           1460 

          1300           1310                       1320      1330 
pF1KA0 SHILLEHNYALAVKP-----TPPA------PALRPPE-----------PVPAPAALFSSP
          :      .  ::     .::.      : .:::            :    . .: : 
CCDS53 PAPLASCPPPMKRKPGRPRRSPPSMLSLDGPLVRPPAGAALGRELLLLPGQPQTPVFPST
            1470      1480      1490      1500      1510      1520 

                      1340      1350           1360      1370      
pF1KA0 ADEV----------LEAPEVVVAEAEEPKP-----QQLQQQREEGEEEGEEEGEEEEEES
        :            . ::   .     : :     .  .   .: ...   :.     ..
CCDS53 HDPRTVTLDFRNAGIPAPPPPLPPQPPPPPPPPPVEPTKLPFKELDNQWPSEAIPPGPRG
            1530      1540      1550      1560      1570      1580 

       1380      1390      1400            1410      1420      1430
pF1KA0 SDSSSSSDGEGALRRRSLRSHARRRRP---PPPPPP---PPPRAYEPRSEFEQMTILYDI
        :  .    : :  :   :   ..:.    ::   :   ::   ..::::::.:::::::
CCDS53 RDEVTEEYMELAKSRGPWRRPPKKRHEDLVPPAGSPELSPPQPLFRPRSEFEEMTILYDI
            1590      1600      1610      1620      1630      1640 

             1440      1450      1460      1470      1480      1490
pF1KA0 WNSGLDSEDMSYLRLTYERLLQQTSGADWLNDTHWVHHTITNLTTPKRKRRPQDGPREHQ
       ::.:.: ::. .: .:::::::: .: :::::: ::.:  :.:.. :.:.: .:: ::: 
CCDS53 WNGGIDEEDIRFLCVTYERLLQQDNGMDWLNDTLWVYHPSTSLSSAKKKKR-DDGIREHV
            1650      1660      1670      1680      1690       1700

             1500      1510      1520               1530      1540 
pF1KA0 TGSARSEGYYPISKKEKDKYLDVCPVSARQLEGVDTQG---------TNRVLSERRSEQR
       :: :::::.: :.::.: .::.   .:. .   .::::         ..:. ::::::::
CCDS53 TGCARSEGFYTIDKKDKLRYLNSSRASTDE-PPADTQGMSIPAQPHASTRAGSERRSEQR
             1710      1720      1730       1740      1750         

            1550      1560      1570      1580      1590      1600 
pF1KA0 RLLSAIGTSAIMDSDLLKLNQLKFRKKKLRFGRSRIHEWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQN
       ::::..  :   ::::::.::::::::::.: .:.::.::::::::::::::::::::::
CCDS53 RLLSSFTGSC--DSDLLKFNQLKFRKKKLKFCKSHIHDWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQN
    1760        1770      1780      1790      1800      1810       

            1610      1620      1630      1640      1650      1660 
pF1KA0 IRQMVADMREKRYVQEGIGSSYLFRVDHDTIIDATKCGNLARFINHCCTPNCYAKVITIE
       :::..:::::::: .:::::::.::::::::::::::::.:::::: :.:::::::::.:
CCDS53 IRQVIADMREKRYEDEGIGSSYMFRVDHDTIIDATKCGNFARFINHSCNPNCYAKVITVE
      1820      1830      1840      1850      1860      1870       

            1670      1680      1690      1700       
pF1KA0 SQKKIVIYSKQPIGVDEEITYDYKFPLEDNKIPCLCGTESCRGSLN
       ::::::::::: :.:.::::::::::.:: :::::::.:.:::.::
CCDS53 SQKKIVIYSKQHINVNEEITYDYKFPIEDVKIPCLCGSENCRGTLN
      1880      1890      1900      1910      1920   




1707 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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