Result of FASTA (omim) for pF1KA0131
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0131, 946 aa
  1>>>pF1KA0131 946 - 946 aa - 946 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7774+/-0.000398; mu= 1.4718+/- 0.025
 mean_var=292.9351+/-61.903, 0's: 0 Z-trim(120.6): 391  B-trim: 0 in 0/59
 Lambda= 0.074936
 statistics sampled from 35608 (36022) to 35608 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.74), E-opt: 0.2 (0.422), width:  16
 Scan time: 13.970

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001657 (OMIM: 300023) rho GTPase-activating pro ( 946) 6252 690.3 1.2e-197
NP_001158213 (OMIM: 300023) rho GTPase-activating  ( 986) 4812 534.7 8.8e-151
NP_055665 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-acti (1099) 2703 306.7 4.1e-82
NP_065813 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho GTPa (1085) 2649 300.9 2.3e-80
XP_016863068 (OMIM: 606525) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 876) 2641 299.9 3.6e-80
XP_016863063 (OMIM: 606525) PREDICTED: SLIT-ROBO R (1117) 2641 300.0 4.3e-80
XP_011532597 (OMIM: 606525) PREDICTED: SLIT-ROBO R (1104) 2584 293.9 3.1e-78
XP_011532598 (OMIM: 606525) PREDICTED: SLIT-ROBO R (1085) 2526 287.6 2.4e-76
XP_011536882 (OMIM: 188470,606523) PREDICTED: SLIT (1045) 2518 286.7 4.2e-76
XP_011536883 (OMIM: 188470,606523) PREDICTED: SLIT (1045) 2518 286.7 4.2e-76
XP_016863065 (OMIM: 606525) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 979) 2266 259.4 6.3e-68
XP_016863066 (OMIM: 606525) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 979) 2266 259.4 6.3e-68
XP_016863067 (OMIM: 606525) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 979) 2266 259.4 6.3e-68
XP_011532603 (OMIM: 606525) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 941) 2029 233.8 3.2e-60
NP_001333130 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho G (1062) 1449 171.1 2.6e-41
XP_011532605 (OMIM: 606525) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 591) 1091 132.2 7.6e-30
XP_016863069 (OMIM: 606525) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 709) 1091 132.3 8.6e-30
NP_001028289 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1075) 1091 132.4 1.2e-29
XP_016863064 (OMIM: 606525) PREDICTED: SLIT-ROBO R (1093) 1091 132.4 1.2e-29
XP_016856330 (OMIM: 606524) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 840) 1083 131.5 1.8e-29
XP_016856329 (OMIM: 606524) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 931) 1084 131.6 1.8e-29
XP_016856328 (OMIM: 606524) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 931) 1084 131.6 1.8e-29
XP_016856327 (OMIM: 606524) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 931) 1084 131.6 1.8e-29
XP_011507661 (OMIM: 606524) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 841) 1083 131.5 1.8e-29
XP_011507658 (OMIM: 606524) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 986) 1084 131.7 1.9e-29
XP_011507657 (OMIM: 606524) PREDICTED: SLIT-ROBO R (1083) 1084 131.7   2e-29
XP_011507656 (OMIM: 606524) PREDICTED: SLIT-ROBO R (1084) 1084 131.7   2e-29
NP_001164108 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1070) 1083 131.6 2.1e-29
XP_005277568 (OMIM: 606524) PREDICTED: SLIT-ROBO R (1070) 1083 131.6 2.1e-29
NP_056141 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-acti (1071) 1083 131.6 2.1e-29
XP_005277567 (OMIM: 606524) PREDICTED: SLIT-ROBO R (1071) 1083 131.6 2.1e-29
NP_001287881 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 789) 1079 131.0 2.3e-29
XP_005277572 (OMIM: 606524) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 789) 1079 131.0 2.3e-29
XP_005277571 (OMIM: 606524) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 790) 1079 131.0 2.3e-29
XP_016857574 (OMIM: 614703) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 458) 1023 124.8   1e-27
NP_001258799 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 459) 1011 123.5 2.5e-27
NP_001258801 (OMIM: 614704) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 458)  999 122.2 6.2e-27
NP_001316913 (OMIM: 614704) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 459)  987 120.9 1.5e-26
XP_016857575 (OMIM: 614703) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 428)  908 112.3 5.4e-24
XP_011540317 (OMIM: 614704) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 428)  884 109.7 3.3e-23
NP_001317613 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 305)  784 98.8 4.6e-20
XP_016857581 (OMIM: 614703) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 305)  784 98.8 4.6e-20
XP_016857580 (OMIM: 614703) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 305)  784 98.8 4.6e-20
XP_016857577 (OMIM: 614703) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 306)  772 97.5 1.1e-19
XP_016857578 (OMIM: 614703) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 306)  772 97.5 1.1e-19
XP_005277478 (OMIM: 614703) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 306)  772 97.5 1.1e-19
XP_005277479 (OMIM: 614703) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 306)  772 97.5 1.1e-19
XP_016857638 (OMIM: 614704) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 306)  744 94.4 9.2e-19
XP_005277556 (OMIM: 614704) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 306)  744 94.4 9.2e-19
XP_016857576 (OMIM: 614703) PREDICTED: SLIT-ROBO R ( 307)  649 84.2 1.1e-15


>>NP_001657 (OMIM: 300023) rho GTPase-activating protein  (946 aa)
 initn: 6252 init1: 6252 opt: 6252  Z-score: 3669.6  bits: 690.3 E(85289): 1.2e-197
Smith-Waterman score: 6252; 100.0% identity (100.0% similar) in 946 aa overlap (1-946:1-946)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 AEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGATEAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQAKFMEHKLKCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGATEAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQAKFMEHKLKCT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 KARNEYLLSLASVNAAVSNYYLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KARNEYLLSLASVNAAVSNYYLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQVQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 GLGSLEEAVEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEILP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLGSLEEAVEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEILP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 RAQNIQSRLDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAQNIQSRLDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 PGSRQAGRRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEVSW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGSRQAGRRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEVSW
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 TQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 IFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 LLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCF
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 GPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCLGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCLGD
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 AQLESLGADNEPELEAEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLHERAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AQLESLGADNEPELEAEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLHERAS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 SDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHRPEPC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHRPEPC
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 TSPEAMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKTSVRQGLGPASTTSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSPEAMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKTSVRQGLGPASTTSP
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940      
pF1KA0 SPGPRSPKAPPSSRLGRNKGFSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPKPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPGPRSPKAPPSSRLGRNKGFSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPKPH
              910       920       930       940      

>>NP_001158213 (OMIM: 300023) rho GTPase-activating prot  (986 aa)
 initn: 4812 init1: 4812 opt: 4812  Z-score: 2828.0  bits: 534.7 E(85289): 8.8e-151
Smith-Waterman score: 6109; 95.9% identity (95.9% similar) in 978 aa overlap (9-946:9-986)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220                    
pF1KA0 AEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGATEAGPLRKSSLKKGGRLVEK-------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::             
NP_001 AEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGATEAGPLRKSSLKKGGRLVEKLWPPQRPVAASSC
              190       200       210       220       230       240

                                  230       240       250       260
pF1KA0 ---------------------------RQAKFMEHKLKCTKARNEYLLSLASVNAAVSNY
                                  :::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APVCWLQAGFLVHPPWWGAMCAPSTHQRQAKFMEHKLKCTKARNEYLLSLASVNAAVSNY
              250       260       270       280       290       300

              270       280       290       300       310       320
pF1KA0 YLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQVQGLGSLEEAVEALDPPGDKAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQVQGLGSLEEAVEALDPPGDKAK
              310       320       330       340       350       360

              330       340       350       360       370       380
pF1KA0 VLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEILPRAQNIQSRLDRQTIETEEVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEILPRAQNIQSRLDRQTIETEEVN
              370       380       390       400       410       420

              390       400       410       420       430       440
pF1KA0 KTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSDPGSRQAGRRRGQQQETETFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSDPGSRQAGRRRGQQQETETFY
              430       440       450       460       470       480

              450       460       470       480       490       500
pF1KA0 LTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEVSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEVSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQY
              490       500       510       520       530       540

              510       520       530       540       550       560
pF1KA0 NQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFER
              550       560       570       580       590       600

              570       580       590       600       610       620
pF1KA0 GEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRL
              610       620       630       640       650       660

              630       640       650       660       670       680
pF1KA0 LWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRV
              670       680       690       700       710       720

              690       700       710       720       730       740
pF1KA0 NQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCLGDAQLESLGADNEPELEAEMPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCLGDAQLESLGADNEPELEAEMPA
              730       740       750       760       770       780

              750       760       770       780       790       800
pF1KA0 QEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLHERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLHERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYI
              790       800       810       820       830       840

              810       820       830       840       850       860
pF1KA0 TLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHRPEPCTSPEAMGPSGHRRRCLVPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHRPEPCTSPEAMGPSGHRRRCLVPAS
              850       860       870       880       890       900

              870       880       890       900       910       920
pF1KA0 PEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKTSVRQGLGPASTTSPSPGPRSPKAPPSSRLGRNKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKTSVRQGLGPASTTSPSPGPRSPKAPPSSRLGRNKG
              910       920       930       940       950       960

              930       940      
pF1KA0 FSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPKPH
       ::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPKPH
              970       980      

>>NP_055665 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-activati  (1099 aa)
 initn: 2690 init1: 1124 opt: 2703  Z-score: 1595.1  bits: 306.7 E(85289): 4.1e-82
Smith-Waterman score: 2717; 47.3% identity (74.6% similar) in 924 aa overlap (1-917:1-905)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
       :... :..... . ::::.:.::.: :: ::..::: :.: : .:::.: ::.::.::.:
NP_055 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
       :::::.::::::::::.   . :::::: :.:.  ::::..:: ..:..::..::. :.:
NP_055 LEYSRSLEKLAERFSSK---IRSSREHQ-FKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATL
               70           80         90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
       .... . .  :::.:.::: :: :::...  :...:::.:..:: :. :::. :: ::..
NP_055 NDIFMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESIS
        120       130       140       150       160       170      

              190       200        210       220       230         
pF1KA0 AEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGAT-EAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQAKFMEHKLKC
       ::.::.:::.::::. ..:   .      :  : :.::.::  .. ::::::. :.::::
NP_055 AESKLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKC
        180       190       200       210       220       230      

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA0 TKARNEYLLSLASVNAAVSNYYLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQV
       :::::.:::.::..:::.:.::.::: ::.:::: ::: .:....:.: .::   ..:. 
NP_055 TKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYNLETSRH
        240       250       260       270       280       290      

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA0 QGLGSLEEAVEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEIL
       .::  .:.::. ::  .::  :...   ::::::.:...:: :::: .. ... .. :.:
NP_055 EGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQPVQTELL
        300       310       320       330       340       350      

     360       370       380       390       400       410         
pF1KA0 PRAQNIQSRLDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSS
        : ...::::    ::.::: ::: ::.:.: .... .: :: :.:: : ::::.::..:
NP_055 MRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTESVKSAAS
        360       370       380       390       400       410      

     420         430       440       450       460       470       
pF1KA0 DPGSRQAG--RRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQE
       .    . .  .::..::::: ::.::..::..: ....::::::. :...: .:.. :  
NP_055 ETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLGEGERAECG
        420       430       440       450       460       470      

       480       490       500       510       520       530       
pF1KA0 VSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQ
       ..       : :: :.::: : :...::.:.:: ::..::: .:::::::::.::: :::
NP_055 TTRPPCLPPKPQKMRRPRPLSVYSHKLFNGSMEAFIKDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQ
        480       490       500       510       520       530      

       540       550       560       570       580       590       
pF1KA0 HEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDL
       ..::::: :.:..:..:...:::::::::.  . .:..:::::::::::.:: :::: . 
NP_055 QQGIFRVPGSQVEVNDIKNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKER
        540       550       560       570       580       590      

       600       610       620       630       640       650       
pF1KA0 FGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLA
       : .:... .::  ::::......:  ::  :.::.::::.:::::.::::::::::::::
NP_055 FQDLISTIKLENPAERVHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLA
        600       610       620       630       640       650      

       660       670       680       690       700       710       
pF1KA0 VCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASC
       .::::::. .: :::::. :...:....:.:.. . .::    : :::::::::     :
NP_055 ICFGPTLMHIPDGQDPVSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYC
        660       670       680       690       700       710      

       720       730        740       750       760       770      
pF1KA0 LGDAQLESLGADNEPELE-AEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLH
         :.     :: .: . . .  :   :.    .::.: : : ::. .::::..:  : :.
NP_055 --DSPHSEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLY
          720       730       740       750       760       770    

        780       790       800       810       820       830      
pF1KA0 ERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHR
       .::: :::.:.:::. :::::.::..    .    . . .. .:..:.:  :: ..   .
NP_055 HRASEDWWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGP--LLDDKASSK
          780       790       800       810       820         830  

        840       850       860       870       880        890     
pF1KA0 PEPCTSPEAMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKT-SVRQGLGPA
        .  .  : ..  :     .  .  . ... : :.     :      : : :  .::::.
NP_055 NDLQSPTEHISDYG-----FGGVMGRVRLRSDGAAIPRRRSG-----GDTHSPPRGLGPS
            840            850       860            870       880  

         900         910       920       930       940             
pF1KA0 STTSPSPG--PRSPKAPPSSRLGRNKGFSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPKPH       
         : :  .  : ::.  : .: ::                                    
NP_055 IDTPPRAAACPSSPHKIPLTR-GRIESPEKRRMATFGSAGSINYPDKKALSEGHSMRSTC
            890       900        910       920       930       940 

>>NP_065813 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho GTPase-a  (1085 aa)
 initn: 2450 init1: 1140 opt: 2649  Z-score: 1563.7  bits: 300.9 E(85289): 2.3e-80
Smith-Waterman score: 2649; 47.1% identity (76.1% similar) in 858 aa overlap (1-854:1-847)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
       :.. ....... . ::::.::::.: :: :: .::: : :.: .:::.: .:.:..::.:
NP_065 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
        ::::.:::::::: .   .  :...::...:. .::::..:: .::...:..:.. :.:
NP_065 TEYSRNLEKLAERFMA---KTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATL
               70           80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
       :..  . . .:. .:.::  :. :::...  ::...:..:..:: :. :::. :: ::..
NP_065 SDIYLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESIS
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 AEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGATEAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQAKFMEHKLKCT
       ::.::.:::.::::. :::   .     :    :.::.::  .. ::::::. :.:::  
NP_065 AESKLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSI
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 KARNEYLLSLASVNAAVSNYYLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQVQ
       ::::::::.: ..::.: .::.::. ::.:::: :.: .:...::.: .::   ..:. .
NP_065 KARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHE
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 GLGSLEEAVEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEILP
       ::  .:.::. :.: .:: . .:.. ..::::..:... : :::: .. ... .. :.. 
NP_065 GLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELML
       300       310       320       330       340       350       

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 RAQNIQSRLDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSD
       : :..::::    ::.:::.:: .::::.. ..:. .: :: . :: : ::::.::: :.
NP_065 RYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSE
       360       370       380       390       400       410       

                430       440       450       460       470        
pF1KA0 P--GSRQAGRRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEV
          .. . ..::..::::: ::. ::.::: : ....::::::. ::..: .: . :  .
NP_065 TYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMT
       420       430       440       450       460       470       

      480       490       500       510       520       530        
pF1KA0 SWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQH
       .    .  : :: :. :: :::: .::.::.: :...::: .::.:::::::::: ::::
NP_065 TRPPNVPPKPQKHRKSRPRSQYNTKLFNGDLETFVKDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQH
       480       490       500       510       520       530       

      540       550       560       570       580       590        
pF1KA0 EGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLF
       .:::::::.:..:..:...:::::.::..  . ::..:::::::::::.:: :::: . :
NP_065 QGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERF
       540       550       560       570       580       590       

      600       610       620       630       640       650        
pF1KA0 GELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAV
       ..:..  ...   ::. :. .::  ::  ::.:.::::.:::::.::::::::::::::.
NP_065 NDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAI
       600       610       620       630       640       650       

      660       670       680       690       700       710        
pF1KA0 CFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCL
       ::::::.:::  :: :. :..::....:.:.. . .::    : :::::::::  .  : 
NP_065 CFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDY-C-
       660       670       680       690       700       710       

      720       730         740       750       760       770      
pF1KA0 GDAQLESLGADNEPELEA--EMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLH
        :.     :. .: . .:  :  ..::. : . ::.: : :.::.:.::::..:  : :.
NP_065 -DSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPI-EAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLY
          720       730       740        750       760       770   

        780       790       800       810       820       830      
pF1KA0 ERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHR
       .::: :::.:.:::. ::.::.::..    .      . .. .:..:.:    ..:    
NP_065 HRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGP----VTEDKSS
           780       790       800       810       820             

        840       850       860       870       880       890      
pF1KA0 PEPCTSPEAMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKTSVRQGLGPAS
        .  .::    :.:.  :                                          
NP_065 SKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSL
     830       840       850       860       870       880         

>>XP_016863068 (OMIM: 606525) PREDICTED: SLIT-ROBO Rho G  (876 aa)
 initn: 2628 init1: 1124 opt: 2641  Z-score: 1560.2  bits: 299.9 E(85289): 3.6e-80
Smith-Waterman score: 2641; 50.2% identity (77.8% similar) in 808 aa overlap (22-825:40-841)

                        10        20        30        40        50 
pF1KA0          MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAE
                                     .:.: :: ::..::: :.: : .:::.: :
XP_016 AGGAGGCLLMPCSTQDLQWELGSALGAAFRQEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQE
      10        20        30        40        50        60         

              60        70        80        90       100       110 
pF1KA0 FMRRRAEVELEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTR
       :.::.::.::::::.::::::::::.   . :::::: :.:.  ::::..:: ..:..::
XP_016 FFRRKAEIELEYSRSLEKLAERFSSK---IRSSREHQ-FKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTR
      70        80        90          100        110       120     

             120       130       140       150       160       170 
pF1KA0 QQSRESAALSEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTY
       ..::. :.:.... . .  :::.:.::: :: :::...  :...:::.:..:: :. :::
XP_016 RESRDHATLNDIFMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTY
         130       140       150       160       170       180     

             180       190       200        210       220       230
pF1KA0 QAYHMESVNAEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGAT-EAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQA
       . :: ::..::.::.:::.::::. ..:   .      :  : :.::.::  .. :::::
XP_016 HMYHAESISAESKLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQA
         190       200       210       220       230       240     

              240       250       260       270       280       290
pF1KA0 KFMEHKLKCTKARNEYLLSLASVNAAVSNYYLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAA
       :. :.:::::::::.:::.::..:::.:.::.::: ::.:::: ::: .:....:.: .:
XP_016 KYSENKLKCTKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSA
         250       260       270       280       290       300     

              300       310       320       330       340       350
pF1KA0 ESRTQASQVQGLGSLEEAVEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICV
       :   ..:. .::  .:.::. ::  .::  :...   ::::::.:...:: :::: .. .
XP_016 EYNLETSRHEGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSA
         310       320       330       340       350       360     

              360       370       380       390       400       410
pF1KA0 EMELRDEILPRAQNIQSRLDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPS
       .. .. :.: : ...::::    ::.::: ::: ::.:.: .... .: :: :.:: : :
XP_016 QQPVQTELLMRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRS
         370       380       390       400       410       420     

              420         430       440       450       460        
pF1KA0 TESLKSTSSDPGSRQAG--RRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEAL
       :::.::..:.    . .  .::..::::: ::.::..::..: ....::::::. :...:
XP_016 TESVKSAASETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTL
         430       440       450       460       470       480     

      470       480       490       500       510       520        
pF1KA0 QRGDKEEQEVSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCI
        .:.. :  ..       : :: :.::: : :...::.:.:: ::..::: .::::::::
XP_016 GEGERAECGTTRPPCLPPKPQKMRRPRPLSVYSHKLFNGSMEAFIKDSGQAIPLVVESCI
         490       500       510       520       530       540     

      530       540       550       560       570       580        
pF1KA0 RFINLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSL
       :.::: :::..::::: :.:..:..:...:::::::::.  . .:..:::::::::::.:
XP_016 RYINLYGLQQQGIFRVPGSQVEVNDIKNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGL
         550       560       570       580       590       600     

      590       600       610       620       630       640        
pF1KA0 EPPLFPPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDE
       : :::: . : .:... .::  ::::......:  ::  :.::.::::.:::::.:::::
XP_016 ENPLFPKERFQDLISTIKLENPAERVHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDE
         610       620       630       640       650       660     

      650       660       670       680       690       700        
pF1KA0 NMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEK
       :::::::::.::::::. .: :::::. :...:....:.:.. . .::    : ::::::
XP_016 NMMDPYNLAICFGPTLMHIPDGQDPVSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEK
         670       680       690       700       710       720     

      710       720       730        740       750       760       
pF1KA0 CMAPPSASCLGDAQLESLGADNEPELE-AEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSF
       :::     :  :.     :: .: . . .  :   :.    .::.: : : ::. .::::
XP_016 CMAGGEEYC--DSPHSEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSF
         730         740       750       760       770       780   

       770       780       790       800       810       820       
pF1KA0 RRGDVLRLHERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEG
       ..:  : :..::: :::.:.:::. :::::.::..    .    . . .. .:..:.:  
XP_016 KKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGPLL
           790       800       810       820       830       840   

       830       840       850       860       870       880       
pF1KA0 LLASELVHRPEPCTSPEAMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKTS
                                                                   
XP_016 DDKASSKNDLQSPTEHISDYGFGGVMGRTSRRP                           
           850       860       870                                 

>>XP_016863063 (OMIM: 606525) PREDICTED: SLIT-ROBO Rho G  (1117 aa)
 initn: 2628 init1: 1124 opt: 2641  Z-score: 1558.8  bits: 300.0 E(85289): 4.3e-80
Smith-Waterman score: 2655; 47.5% identity (74.3% similar) in 903 aa overlap (22-917:40-923)

                        10        20        30        40        50 
pF1KA0          MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAE
                                     .:.: :: ::..::: :.: : .:::.: :
XP_016 AGGAGGCLLMPCSTQDLQWELGSALGAAFRQEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQE
      10        20        30        40        50        60         

              60        70        80        90       100       110 
pF1KA0 FMRRRAEVELEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTR
       :.::.::.::::::.::::::::::.   . :::::: :.:.  ::::..:: ..:..::
XP_016 FFRRKAEIELEYSRSLEKLAERFSSK---IRSSREHQ-FKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTR
      70        80        90          100        110       120     

             120       130       140       150       160       170 
pF1KA0 QQSRESAALSEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTY
       ..::. :.:.... . .  :::.:.::: :: :::...  :...:::.:..:: :. :::
XP_016 RESRDHATLNDIFMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTY
         130       140       150       160       170       180     

             180       190       200        210       220       230
pF1KA0 QAYHMESVNAEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGAT-EAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQA
       . :: ::..::.::.:::.::::. ..:   .      :  : :.::.::  .. :::::
XP_016 HMYHAESISAESKLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQA
         190       200       210       220       230       240     

              240       250       260       270       280       290
pF1KA0 KFMEHKLKCTKARNEYLLSLASVNAAVSNYYLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAA
       :. :.:::::::::.:::.::..:::.:.::.::: ::.:::: ::: .:....:.: .:
XP_016 KYSENKLKCTKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSA
         250       260       270       280       290       300     

              300       310       320       330       340       350
pF1KA0 ESRTQASQVQGLGSLEEAVEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICV
       :   ..:. .::  .:.::. ::  .::  :...   ::::::.:...:: :::: .. .
XP_016 EYNLETSRHEGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSA
         310       320       330       340       350       360     

              360       370       380       390       400       410
pF1KA0 EMELRDEILPRAQNIQSRLDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPS
       .. .. :.: : ...::::    ::.::: ::: ::.:.: .... .: :: :.:: : :
XP_016 QQPVQTELLMRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRS
         370       380       390       400       410       420     

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pF1KA0 TESLKSTSSDPGSRQAG--RRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEAL
       :::.::..:.    . .  .::..::::: ::.::..::..: ....::::::. :...:
XP_016 TESVKSAASETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTL
         430       440       450       460       470       480     

      470       480       490       500       510       520        
pF1KA0 QRGDKEEQEVSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCI
        .:.. :  ..       : :: :.::: : :...::.:.:: ::..::: .::::::::
XP_016 GEGERAECGTTRPPCLPPKPQKMRRPRPLSVYSHKLFNGSMEAFIKDSGQAIPLVVESCI
         490       500       510       520       530       540     

      530       540       550       560       570       580        
pF1KA0 RFINLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSL
       :.::: :::..::::: :.:..:..:...:::::::::.  . .:..:::::::::::.:
XP_016 RYINLYGLQQQGIFRVPGSQVEVNDIKNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGL
         550       560       570       580       590       600     

      590       600       610       620       630       640        
pF1KA0 EPPLFPPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDE
       : :::: . : .:... .::  ::::......:  ::  :.::.::::.:::::.:::::
XP_016 ENPLFPKERFQDLISTIKLENPAERVHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDE
         610       620       630       640       650       660     

      650       660       670       680       690       700        
pF1KA0 NMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEK
       :::::::::.::::::. .: :::::. :...:....:.:.. . .::    : ::::::
XP_016 NMMDPYNLAICFGPTLMHIPDGQDPVSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEK
         670       680       690       700       710       720     

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pF1KA0 CMAPPSASCLGDAQLESLGADNEPELE-AEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSF
       :::     :  :.     :: .: . . .  :   :.    .::.: : : ::. .::::
XP_016 CMAGGEEYC--DSPHSEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSF
         730         740       750       760       770       780   

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pF1KA0 RRGDVLRLHERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEG
       ..:  : :..::: :::.:.:::. :::::.::..    .    . . .. .:..:.:  
XP_016 KKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGP--
           790       800       810       820       830       840   

       830       840       850       860       870       880       
pF1KA0 LLASELVHRPEPCTSPEAMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKT-
       :: ..   . .  .  : ..  :     .  .  . ... : :.     :      : : 
XP_016 LLDDKASSKNDLQSPTEHISDYG-----FGGVMGRVRLRSDGAAIPRRRS-----GGDTH
             850       860            870       880            890 

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pF1KA0 SVRQGLGPASTTSPSPG--PRSPKAPPSSRLGRNKGFSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPK
       :  .::::.  : :  .  : ::.  : .: ::                           
XP_016 SPPRGLGPSIDTPPRAAACPSSPHKIPLTR-GRIESPEKRRMATFGSAGSINYPDKKALS
             900       910       920        930       940       950

                                                                   
pF1KA0 PH                                                          
                                                                   
XP_016 EGHSMRSTCGSTRHSSLGDHKSLEAEALAEDIEKTMSTALHELRELERQNTVKQAPDVVL
              960       970       980       990      1000      1010

>>XP_011532597 (OMIM: 606525) PREDICTED: SLIT-ROBO Rho G  (1104 aa)
 initn: 2592 init1: 866 opt: 2584  Z-score: 1525.6  bits: 293.9 E(85289): 3.1e-78
Smith-Waterman score: 2598; 46.0% identity (73.3% similar) in 931 aa overlap (1-917:1-910)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
       :... :..... . ::::.:.::.: :: ::..::: :.: : .:::.: ::.::.::.:
XP_011 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
       :::::.::::::::::.   . :::::: :.:.  ::::..:: ..:..::..::. :.:
XP_011 LEYSRSLEKLAERFSSK---IRSSREHQ-FKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATL
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pF1KA0 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
       .... . .  :::.:.::: :: :::...  :...:::.:..:: :. :::. :: ::..
XP_011 NDIFMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESIS
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pF1KA0 AEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGAT-EAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQAKFMEHKLKC
       ::.::.:::.::::. ..:   .      :  : :.::.::  .. ::::::. :.::::
XP_011 AESKLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKC
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pF1KA0 TKARNEYLLSLASVNAAVSNYYLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQV
       :::::.:::.::..:::.:.::.::: ::.:::: ::: .:....:.: .::   ..:. 
XP_011 TKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYNLETSRH
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pF1KA0 QGLGSLEEAVEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEIL
       .::  .:.::. ::  .::  :...   ::::::.:...:: :::: .. ... .. :.:
XP_011 EGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQPVQTELL
        300       310       320       330       340       350      

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pF1KA0 PRAQNIQSRLDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSS
        : ...::::    ::.::: ::: ::.:.: .... .: :: :.:: : ::::.::..:
XP_011 MRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTESVKSAAS
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pF1KA0 DPGSRQAG--RRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQE
       .    . .  .::..::::: ::.::..::..: ....::::::. :...:  :. :. :
XP_011 ETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTL--GEGERAE
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pF1KA0 VSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRL-----FGG--DMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRF
        . :.  . ...  . : ::     ..     . :  . .   :.::: .:::::::::.
XP_011 CGTTSRRDGRLRLPHFPWPSCPPAPHFVPHPALQGRRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRY
          480       490       500       510       520       530    

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pF1KA0 INLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEP
       ::: :::..::::: :.:..:..:...:::::::::.  . .:..:::::::::::.:: 
XP_011 INLYGLQQQGIFRVPGSQVEVNDIKNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLEN
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pF1KA0 PLFPPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENM
       :::: . : .:... .::  ::::......:  ::  :.::.::::.:::::.:::::::
XP_011 PLFPKERFQDLISTIKLENPAERVHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENM
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pF1KA0 MDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCM
       :::::::.::::::. .: :::::. :...:....:.:.. . .::    : ::::::::
XP_011 MDPYNLAICFGPTLMHIPDGQDPVSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCM
          660       670       680       690       700       710    

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pF1KA0 APPSASCLGDAQLESLGADNEPELE-AEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRR
       :     :  :.     :: .: . . .  :   :.    .::.: : : ::. .::::..
XP_011 AGGEEYC--DSPHSEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKK
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pF1KA0 GDVLRLHERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLL
       :  : :..::: :::.:.:::. :::::.::..    .    . . .. .:..:.:  ::
XP_011 GASLLLYHRASEDWWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGP--LL
            780       790       800       810       820         830

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pF1KA0 ASELVHRPEPCTSPEAMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKT-SV
        ..   . .  .  : ..  :     .  .  . ... : :.     :      : : : 
XP_011 DDKASSKNDLQSPTEHISDYG-----FGGVMGRVRLRSDGAAIPRRRSG-----GDTHSP
              840       850            860       870            880

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pF1KA0 RQGLGPASTTSPSPG--PRSPKAPPSSRLGRNKGFSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPKPH
        .::::.  : :  .  : ::.  : .: ::                             
XP_011 PRGLGPSIDTPPRAAACPSSPHKIPLTR-GRIESPEKRRMATFGSAGSINYPDKKALSEG
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XP_011 HSMRSTCGSTRHSSLGDHKSLEAEALAEDIEKTMSTALHELRELERQNTVKQAPDVVLDT
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>>XP_011532598 (OMIM: 606525) PREDICTED: SLIT-ROBO Rho G  (1085 aa)
 initn: 2534 init1: 866 opt: 2526  Z-score: 1491.8  bits: 287.6 E(85289): 2.4e-76
Smith-Waterman score: 2540; 46.3% identity (73.0% similar) in 910 aa overlap (22-917:3-891)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
                            ::.: :: ::..::: :.: : .:::.: ::.::.::.:
XP_011                    MCKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
                                  10        20        30        40 

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
       :::::.::::::::::   .. :::::: :.:.  ::::..:: ..:..::..::. :.:
XP_011 LEYSRSLEKLAERFSS---KIRSSREHQ-FKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATL
              50           60         70        80        90       

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
       .... . .  :::.:.::: :: :::...  :...:::.:..:: :. :::. :: ::..
XP_011 NDIFMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESIS
       100       110       120       130       140       150       

              190       200        210       220       230         
pF1KA0 AEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGAT-EAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQAKFMEHKLKC
       ::.::.:::.::::. ..:   .      :  : :.::.::  .. ::::::. :.::::
XP_011 AESKLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKC
       160       170       180       190       200       210       

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pF1KA0 TKARNEYLLSLASVNAAVSNYYLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQV
       :::::.:::.::..:::.:.::.::: ::.:::: ::: .:....:.: .::   ..:. 
XP_011 TKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYNLETSRH
       220       230       240       250       260       270       

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pF1KA0 QGLGSLEEAVEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEIL
       .::  .:.::. ::  .::  :...   ::::::.:...:: :::: .. ... .. :.:
XP_011 EGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQPVQTELL
       280       290       300       310       320       330       

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pF1KA0 PRAQNIQSRLDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSS
        : ...::::    ::.::: ::: ::.:.: .... .: :: :.:: : ::::.::..:
XP_011 MRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTESVKSAAS
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pF1KA0 DPGSRQAG--RRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQE
       .    . .  .::..::::: ::.::..::..: ....::::::. :...:  :. :. :
XP_011 ETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTL--GEGERAE
       400       410       420       430       440         450     

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pF1KA0 VSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRL-----FGG--DMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRF
        . :.  . ...  . : ::     ..     . :  . .   :.::: .:::::::::.
XP_011 CGTTSRRDGRLRLPHFPWPSCPPAPHFVPHPALQGRRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRY
         460       470       480       490       500       510     

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pF1KA0 INLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEP
       ::: :::..::::: :.:..:..:...:::::::::.  . .:..:::::::::::.:: 
XP_011 INLYGLQQQGIFRVPGSQVEVNDIKNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLEN
         520       530       540       550       560       570     

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pF1KA0 PLFPPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENM
       :::: . : .:... .::  ::::......:  ::  :.::.::::.:::::.:::::::
XP_011 PLFPKERFQDLISTIKLENPAERVHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENM
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pF1KA0 MDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCM
       :::::::.::::::. .: :::::. :...:....:.:.. . .::    : ::::::::
XP_011 MDPYNLAICFGPTLMHIPDGQDPVSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCM
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pF1KA0 APPSASCLGDAQLESLGADNEPELE-AEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRR
       :     :  :.     :: .: . . .  :   :.    .::.: : : ::. .::::..
XP_011 AGGEEYC--DSPHSEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKK
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pF1KA0 GDVLRLHERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLL
       :  : :..::: :::.:.:::. :::::.::..    .    . . .. .:..:.:  ::
XP_011 GASLLLYHRASEDWWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGP--LL
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pF1KA0 ASELVHRPEPCTSPEAMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKT-SV
        ..   . .  .  : ..  :     .  .  . ... : :.     :      : : : 
XP_011 DDKASSKNDLQSPTEHISDYG-----FGGVMGRVRLRSDGAAIPRRRS-----GGDTHSP
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pF1KA0 RQGLGPASTTSPSPG--PRSPKAPPSSRLGRNKGFSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPKPH
        .::::.  : :  .  : ::.  : .: ::                             
XP_011 PRGLGPSIDTPPRAAACPSSPHKIPLTR-GRIESPEKRRMATFGSAGSINYPDKKALSEG
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XP_011 HSMRSTCGSTRHSSLGDHKSLEAEALAEDIEKTMSTALHELRELERQNTVKQAPDVVLDT
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>>XP_011536882 (OMIM: 188470,606523) PREDICTED: SLIT-ROB  (1045 aa)
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               20        30        40        50        60        70
pF1KA0 RGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVELEYSRGLEKL
                                     .: .:::.: .:.:..::.: ::::.::::
XP_011                               MRVQLLQDLQDFFRKKAEIETEYSRNLEKL
                                             10        20        30

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pF1KA0 AERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAALSEVLAGPLAQ
       :::: ..     :...::...:. .::::..:: .::...:..:.. :.::..  . . .
XP_011 AERFMAK---TRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDIYLNNVIM
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pF1KA0 RLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVNAEAKLREAER
       :. .:.::  :. :::...  ::...:..:..:: :. :::. :: ::..::.::.:::.
XP_011 RFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAESKLKEAEK
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pF1KA0 QEEKRAGRSVPTTTAGATEAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQAKFMEHKLKCTKARNEYLLSL
       ::::. :::   .     :    :.::.::  .. ::::::. :.:::  ::::::::.:
XP_011 QEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKARNEYLLTL
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pF1KA0 ASVNAAVSNYYLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQVQGLGSLEEAVE
        ..::.: .::.::. ::.:::: :.: .:...::.: .::   ..:. .::  .:.::.
XP_011 EATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLDIIENAVD
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pF1KA0 ALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEILPRAQNIQSRLD
        :.: .:: . .:.. ..::::..:... : :::: .. ... .. :.. : :..:::: 
XP_011 NLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQQLQSRLA
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pF1KA0 RQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSDP--GSRQAGR
          ::.:::.:: .::::.. ..:. .: :: . :: : ::::.::: :.   .. . ..
XP_011 TLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYLSKPSIAK
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       ::..::::: ::. ::.::: : ....::::::. ::..: .: . :  ..    .  : 
XP_011 RRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTRPPNVPPKP
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pF1KA0 QKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQ
       :: :. :: :::: .::.::.: :...::: .::.:::::::::: ::::.:::::::.:
XP_011 QKHRKSRPRSQYNTKLFNGDLETFVKDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQ
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       ..:..:...:::::.::..  . ::..:::::::::::.:: :::: . :..:..  ...
XP_011 VEVNDIKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRID
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          ::. :. .::  ::  ::.:.::::.:::::.::::::::::::::.::::::.:::
XP_011 NLYERALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVP
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pF1KA0 AGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCLGDAQLESLGA
         :: :. :..::....:.:.. . .::    : :::::::::  .  :  :.     :.
XP_011 EIQDQVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDY-C--DSPYSEHGT
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pF1KA0 DNEPELEA--EMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLHERASSDWWRG
        .: . .:  :  ..::. : . ::.: : :.::.:.::::..:  : :..::: :::.:
XP_011 LEEVDQDAGTEPHTSEDECEPI-EAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEG
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pF1KA0 EHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHRPEPCTSPEAM
       .:::. ::.::.::..    .      . .. .:..:.:    ..:     .  .::   
XP_011 RHNGIDGLVPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGP----VTEDKSSSKDMNSPTDR
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pF1KA0 GPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKTSVRQGLGPASTTSPSPGPRS
        :.:.  :                                                    
XP_011 HPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQN
     800       810       820       830       840       850         

>>XP_011536883 (OMIM: 188470,606523) PREDICTED: SLIT-ROB  (1045 aa)
 initn: 2310 init1: 1140 opt: 2518  Z-score: 1487.3  bits: 286.7 E(85289): 4.2e-76
Smith-Waterman score: 2518; 47.1% identity (75.9% similar) in 818 aa overlap (41-854:1-807)

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