seq1 = pF1KA0116.tfa, 873 bp seq2 = pF1KA0116/gi568815595f_44876278.tfa (gi568815595f:44876278_45111336), 235059 bp >pF1KA0116 873 >gi568815595f:44876278_45111336 (Chr3) 1-57 (100001-100057) 100% -> 58-159 (112863-112964) 100% -> 160-254 (113273-113367) 100% -> 255-420 (120810-120975) 100% -> 421-491 (125261-125331) 100% -> 492-615 (129014-129137) 100% -> 616-771 (131143-131298) 100% -> 772-873 (134958-135059) 99% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCGTCCGTGACGCTGAGCGAGGCGGAGAAGGTGTACATCGTGCATGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGCGTCCGTGACGCTGAGCGAGGCGGAGAAGGTGTACATCGTGCATGG 50 . : . : . : . : . : 51 CGTCCAG GAAGACCTCCGTGTGGATGGCCGTGGCTGTGAGG |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 CGTCCAGGTA...TAGGAAGACCTCCGTGTGGATGGCCGTGGCTGTGAGG 100 . : . : . : . : . : 92 ACTACCGATGTGTCGAAGTGGAAACTGATGTGGTGTCCAACACTAGTGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112897 ACTACCGATGTGTCGAAGTGGAAACTGATGTGGTGTCCAACACTAGTGGG 150 . : . : . : . : . : 142 TCCGCCAGGGTCAAGCTG GGTCACACAGACATCTTGGTGGG ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| 112947 TCCGCCAGGGTCAAGCTGGTG...CAGGGTCACACAGACATCTTGGTGGG 200 . : . : . : . : . : 183 AGTGAAAGCAGAAATGGGGACGCCGAAGCTGGAGAAACCAAATGAAGGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113296 AGTGAAAGCAGAAATGGGGACGCCGAAGCTGGAGAAACCAAATGAAGGCT 250 . : . : . : . : . : 233 ACTTGGAGTTCTTTGTTGACTG TTCAGCCAGTGCTACCCCT ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 113346 ACTTGGAGTTCTTTGTTGACTGGTC...TAGTTCAGCCAGTGCTACCCCT 300 . : . : . : . : . : 274 GAATTTGAAGGTAGAGGAGGTGATGACCTTGGCACCGAGATCGCTAACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120829 GAATTTGAAGGTAGAGGAGGTGATGACCTTGGCACCGAGATCGCTAACAC 350 . : . : . : . : . : 324 CCTCTATCGGATATTTAACAATAAAAGCAGTGTCGACTTAAAGACCCTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120879 CCTCTATCGGATATTTAACAATAAAAGCAGTGTCGACTTAAAGACCCTCT 400 . : . : . : . : . : 374 GCATTAGTCCTCGGGAGCACTGCTGGGTTCTCTATGTGGATGTGCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 120929 GCATTAGTCCTCGGGAGCACTGCTGGGTTCTCTATGTGGATGTGCTGGTG 450 . : . : . : . : . : 421 CTTCTGGAATGTGGTGGAAATTTGTTTGATGCCATTTCCATTGC ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120979 ...TAGCTTCTGGAATGTGGTGGAAATTTGTTTGATGCCATTTCCATTGC 500 . : . : . : . : . : 465 TGTAAAGGCTGCTCTCTTCAATACAAG GATACCAAGGGTTC |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 125305 TGTAAAGGCTGCTCTCTTCAATACAAGGTA...CAGGATACCAAGGGTTC 550 . : . : . : . : . : 506 GAGTTTTGGAGGATGAAGAGGGGTCGAAGGACATTGAATTGTCAGATGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129028 GAGTTTTGGAGGATGAAGAGGGGTCGAAGGACATTGAATTGTCAGATGAC 600 . : . : . : . : . : 556 CCTTATGACTGCATACGACTAAGTGTGGAGAATGTCCCCTGCATTGTCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129078 CCTTATGACTGCATACGACTAAGTGTGGAGAATGTCCCCTGCATTGTCAC 650 . : . : . : . : . : 606 TCTGTGCAAG ATTGGCTATCGGCATGTGGTGGATGCTACTC ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 129128 TCTGTGCAAGGTA...CAGATTGGCTATCGGCATGTGGTGGATGCTACTC 700 . : . : . : . : . : 647 TTCAGGAGGAGGCCTGCTCGCTGGCCAGCTTGCTGGTGTCGGTGACCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131174 TTCAGGAGGAGGCCTGCTCGCTGGCCAGCTTGCTGGTGTCGGTGACCAGC 750 . : . : . : . : . : 697 AAGGGAGTTGTGACGTGCATGAGGAAAGTGGGGAAGGGCAGCCTGGACCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131224 AAGGGAGTTGTGACGTGCATGAGGAAAGTGGGGAAGGGCAGCCTGGACCC 800 . : . : . : . : . : 747 AGAGAGCATCTTCGAGATGATGGAG ACTGGCAAGCGTGTGG |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 131274 AGAGAGCATCTTCGAGATGATGGAGGTG...CAGACTGGCAAGCGTGTGG 850 . : . : . : . : . : 788 GCAAGGTACTGCATGCCTCCTTGCAGAGTGTTCTGCACAAGGAAGAAAGC |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| 134974 GCAAGGTACTGCATGCCTCCTTGCAGAGTGTTGTGCACAAGGAAGAAAGC 900 . : . : . : . 838 CTGGGGCCCAAGAGACAGAAAGTTGGATTCCTGGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||| 135024 CTGGGGCCCAAGAGACAGAAAGTTGGATTCCTGGGA