seq1 = pF1KA0089.tfa, 1053 bp seq2 = pF1KA0089/gi568815595f_32006712.tfa (gi568815595f:32006712_32265907), 259196 bp >pF1KA0089 1053 >gi568815595f:32006712_32265907 (Chr3) 1-47 (100001-100047) 100% -> 48-225 (121365-121542) 99% -> 226-366 (131876-132016) 100% -> 367-505 (133517-133655) 99% -> 506-618 (139911-140023) 99% -> 619-852 (152165-152398) 100% -> 853-959 (152857-152963) 100% -> 960-1053 (159103-159196) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCAGCGGCGCCCCTGAAAGTGTGCATCGTGGGCTCGGGGAACTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 100001 ATGGCAGCGGCGCCCCTGAAAGTGTGCATCGTGGGCTCGGGGAACTGGTG 50 . : . : . : . : . : 48 GGGTTCAGCTGTTGCAAAAATAATTGGTAATAACGTCAAGAAAC ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| 100051 ...TAGGGGTTCAGCTGTTGCAAAAATAATTGGTAATAATGTCAAGAAAC 100 . : . : . : . : . : 92 TTCAGAAATTTGCCTCCACAGTCAAGATGTGGGTCTTTGAAGAAACAGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121409 TTCAGAAATTTGCCTCCACAGTCAAGATGTGGGTCTTTGAAGAAACAGTG 150 . : . : . : . : . : 142 AATGGCAGAAAACTGACAGACATCATAAATAATGACCATGAAAATGTAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121459 AATGGCAGAAAACTGACAGACATCATAAATAATGACCATGAAAATGTAAA 200 . : . : . : . : . : 192 ATATCTTCCTGGACACAAGCTGCCAGAAAATGTG GTTGCCA ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 121509 ATATCTTCCTGGACACAAGCTGCCAGAAAATGTGGTA...CAGGTTGCCA 250 . : . : . : . : . : 233 TGTCAAATCTTAGCGAGGCTGTGCAGGATGCAGACCTGCTGGTGTTTGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131883 TGTCAAATCTTAGCGAGGCTGTGCAGGATGCAGACCTGCTGGTGTTTGTC 300 . : . : . : . : . : 283 ATTCCCCACCAGTTCATTCACAGAATCTGTGATGAGATCACTGGGAGAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131933 ATTCCCCACCAGTTCATTCACAGAATCTGTGATGAGATCACTGGGAGAGT 350 . : . : . : . : . : 333 GCCCAAGAAAGCGCTGGGAATCACCCTCATCAAG GGCATAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 131983 GCCCAAGAAAGCGCTGGGAATCACCCTCATCAAGGTA...TAGGGCATAG 400 . : . : . : . : . : 374 ACGAGGGCCCCGAGGGGCTGAAACTCATTTCTGACATCATCCGTGAGAAG |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| 133524 ACGAGGGCCCCGAGGGGCTGAAGCTCATTTCTGACATCATCCGTGAGAAG 450 . : . : . : . : . : 424 ATGGGTATTGACATCAGTGTGCTGATGGGAGCCAACATTGCCAATGAGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 133574 ATGGGTATTGACATCAGTGTGCTGATGGGAGCCAACATTGCCAATGAGGT 500 . : . : . : . : . : 474 GGCTGCAGAGAAGTTCTGTGAGACCACCATCG GCAGCAAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 133624 GGCTGCAGAGAAGTTCTGTGAGACCACCATCGGTA...CAGGCAGCAAAG 550 . : . : . : . : . : 515 TAATGGAGAACGGCCTTCTCTTCAAAGAACTTCTGCAGACTCCAAATTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139920 TAATGGAGAACGGCCTTCTCTTCAAAGAACTTCTGCAGACTCCAAATTTT 600 . : . : . : . : . : 565 CGAATTACGGTGGTTGATGATGCAGACACTGTTGAACTCTGTGGTGCGCT |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139970 CGAATTACCGTGGTTGATGATGCAGACACTGTTGAACTCTGTGGTGCGCT 650 . : . : . : . : . : 615 TAAG AACATCGTAGCTGTGGGAGCTGGGTTCTGCGACGGCC ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 140020 TAAGGTA...CAGAACATCGTAGCTGTGGGAGCTGGGTTCTGCGACGGCC 700 . : . : . : . : . : 656 TCCGCTGTGGAGACAACACCAAAGCGGCCGTCATCCGCCTGGGACTCATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152202 TCCGCTGTGGAGACAACACCAAAGCGGCCGTCATCCGCCTGGGACTCATG 750 . : . : . : . : . : 706 GAAATGATTGCTTTTGCCAGGATCTTCTGCAAAGGCCAAGTGTCTACAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152252 GAAATGATTGCTTTTGCCAGGATCTTCTGCAAAGGCCAAGTGTCTACAGC 800 . : . : . : . : . : 756 CACCTTCCTAGAGAGCTGCGGGGTGGCCGACCTGATCACCACCTGTTACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152302 CACCTTCCTAGAGAGCTGCGGGGTGGCCGACCTGATCACCACCTGTTACG 850 . : . : . : . : . : 806 GAGGGCGGAACCGCAGGGTGGCCGAGGCCTTCGCCAGAACTGGGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 152352 GAGGGCGGAACCGCAGGGTGGCCGAGGCCTTCGCCAGAACTGGGAAGGTA 900 . : . : . : . : . : 853 ACCATTGAAGAGTTGGAGAAGGAGATGCTGAATGGGCAAAAGCT ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152402 ...AAGACCATTGAAGAGTTGGAGAAGGAGATGCTGAATGGGCAAAAGCT 950 . : . : . : . : . : 897 CCAAGGACCGCAGACTTCTGCTGAAGTGTACCGCATCCTCAAACAGAAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152901 CCAAGGACCGCAGACTTCTGCTGAAGTGTACCGCATCCTCAAACAGAAGG 1000 . : . : . : . : . : 947 GACTACTGGACAA GTTTCCATTGTTTACTGCAGTGTATCAG |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 152951 GACTACTGGACAAGTA...TAGGTTTCCATTGTTTACTGCAGTGTATCAG 1050 . : . : . : . : . : 988 ATCTGCTACGAAAGCAGACCAGTTCAAGAGATGTTGTCTTGTCTTCAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 159131 ATCTGCTACGAAAGCAGACCAGTTCAAGAGATGTTGTCTTGTCTTCAGAG 1100 . : . 1038 CCATCCAGAGCATACA |||||||||||||||| 159181 CCATCCAGAGCATACA