FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9440, 660 aa 1>>>pF1KB9440 660 - 660 aa - 660 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8996+/-0.00104; mu= 15.6373+/- 0.062 mean_var=64.7628+/-12.763, 0's: 0 Z-trim(102.6): 33 B-trim: 15 in 1/51 Lambda= 0.159372 statistics sampled from 7029 (7041) to 7029 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16 Scan time: 2.480 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11734.1 ACOX1 gene_id:51|Hs108|chr17 ( 660) 4389 1018.5 0 CCDS11735.1 ACOX1 gene_id:51|Hs108|chr17 ( 660) 4176 969.5 0 CCDS33775.1 ACOX2 gene_id:8309|Hs108|chr3 ( 681) 1850 434.7 2e-121 CCDS47017.1 ACOX3 gene_id:8310|Hs108|chr4 ( 624) 621 152.2 2.1e-36 CCDS3401.1 ACOX3 gene_id:8310|Hs108|chr4 ( 700) 621 152.2 2.4e-36 CCDS46389.1 ACOXL gene_id:55289|Hs108|chr2 ( 580) 591 145.2 2.4e-34 >>CCDS11734.1 ACOX1 gene_id:51|Hs108|chr17 (660 aa) initn: 4389 init1: 4389 opt: 4389 Z-score: 5448.8 bits: 1018.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4389; 99.7% identity (99.8% similar) in 660 aa overlap (1-660:1-660) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MNPDLRRERDSASFNPELLTHILDGSPEKTRRRREIENMILNDPDFQHEDLNFLTRSQRY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 MNPDLRRERDSASFNPELLTHILDGSPEKTRRRREIENMILNDPDFQHEDLNFLTRSQRY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 EVAVRKSAIMVKKMREFGIADPDEIMWFKNFVHRGRPEPLDLHLGMFLPTLLHQATAEQQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 EVAVRKSAIMVKKMREFGIADPDEIMWFKNFVHRGRPEPLDLHLGMFLPTLLHQATAEQQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 ERFFMPAWNLEIIGTYAQTEMGHGTHLRGLETIATYDPETQEFILNSPTVTSIKWWPGGL :::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 ERFFMPAWNLEIIGTYAQTEMGHGTHLRGLETTATYDPETQEFILNSPTVTSIKWWPGGL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 GKTSNHAIVLAQLITKGKCYGLHAFIVPIREIGTHKPLPGITVGDIGPKFGYDEIDNGYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 GKTSNHAIVLAQLITKGKCYGLHAFIVPIREIGTHKPLPGITVGDIGPKFGYDEIDNGYL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 KMDNHRIPRENMLMKYAQVKPDGTYVKPLSNKLTYGTMVFVRSFLVGEAARALSKACTIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 KMDNHRIPRENMLMKYAQVKPDGTYVKPLSNKLTYGTMVFVRSFLVGEAARALSKACTIA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 IRYSAVRHQSEMKPGEPEPQILDFQTQQYKLFPLLATAYAFQFVGAYMKETYHRINEGIG :::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 IRYSAVRHQSEIKPGEPEPQILDFQTQQYKLFPLLATAYAFQFVGAYMKETYHRINEGIG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 QGDLSELPELHALTAGLKAFTSWTANTGIEACRMACGGHGYSHCSGLPNIYVNFTPSCTF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 QGDLSELPELHALTAGLKAFTSWTANTGIEACRMACGGHGYSHCSGLPNIYVNFTPSCTF 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB9 EGENTVMMLQTARFLMKSYDQVHSGKLVCGMVSYLNDLPSQRIQPQQVAVWPTMVDINSP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 EGENTVMMLQTARFLMKSYDQVHSGKLVCGMVSYLNDLPSQRIQPQQVAVWPTMVDINSP 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB9 ESLTEAYKLRAARLVEIAAKNLQKEVIHRKSKEVAWNLTSVDLVRASEAHCHYVVVKLFS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 ESLTEAYKLRAARLVEIAAKNLQKEVIHRKSKEVAWNLTSVDLVRASEAHCHYVVVKLFS 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB9 EKLLKIQDKAIQAVLRSLCLLYSLYGISQNAGDFLQGSIMTEPQITQVNQRVKELLTLIR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 EKLLKIQDKAIQAVLRSLCLLYSLYGISQNAGDFLQGSIMTEPQITQVNQRVKELLTLIR 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB9 SDAVALVDAFDFQDVTLGSVLGRYDGNVYENLFEWAKNSPLNKAEVHESYKHLKSLQSKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 SDAVALVDAFDFQDVTLGSVLGRYDGNVYENLFEWAKNSPLNKAEVHESYKHLKSLQSKL 610 620 630 640 650 660 >>CCDS11735.1 ACOX1 gene_id:51|Hs108|chr17 (660 aa) initn: 4176 init1: 4176 opt: 4176 Z-score: 5184.1 bits: 969.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4176; 95.5% identity (98.3% similar) in 660 aa overlap (1-660:1-660) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MNPDLRRERDSASFNPELLTHILDGSPEKTRRRREIENMILNDPDFQHEDLNFLTRSQRY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 MNPDLRRERDSASFNPELLTHILDGSPEKTRRRREIENMILNDPDFQHEDLNFLTRSQRY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 EVAVRKSAIMVKKMREFGIADPDEIMWFKNFVHRGRPEPLDLHLGMFLPTLLHQATAEQQ :::::::::::::::::::::::::::::.. . ::. :. .::.::::.:.:. :. 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CCDS33 PEFSCKDNYFMTQNERYKAAMRR-AFHIRLIARRLGWLEDGREL----GYAYRALSGDVA 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB9 LHLG-MFLPTLLHQATAEQQERFFMPAWNLEIIGTYAQTEMGHGTHLRGLETIATYDPET :.. .:. .: .. :: .. :..::.::::::.::::.:.:::: :::: : CCDS33 LNIHRVFVRALRSLGSEEQIAKWDPLCKNIQIIATYAQTELGHGTYLQGLETEATYDAAT 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB9 QEFILNSPTVTSIKWWPGGLGKTSNHAIVLAQLITKGKCYGLHAFIVPIREIGTHKPLPG :::...:::.:. ::::: ::....::.: :::: .: :.:::::::: . : :::: CCDS33 QEFVIHSPTLTATKWWPGDLGRSATHALVQAQLICSGARRGMHAFIVPIRSLQDHTPLPG 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB9 ITVGDIGPKFGYDEIDNGYLKMDNHRIPRENMLMKYAQVKPDGTYVKPLSNKLTYGTMVF : .::::::. .:. :::.:.... :.:::::: ..::: ::::::: . . .: :: CCDS33 IIIGDIGPKMDFDQTDNGFLQLNHVRVPRENMLSRFAQVLPDGTYVKLGTAQSNYLPMVV 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KB9 VR-SFLVGEAARALSKACTIAIRYSAVRHQSEMKPGEPEPQILDFQTQQYKLFPLLATAY :: .: :: :.:::.::.:::..:.::...:..:: ..::.:::: :::: :: .: CCDS33 VRVELLSGEILPILQKACVIAMRYSVIRRQSRLRPSDPEAKVLDYQTQQQKLFPQLAISY 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KB9 AFQFVGAYMKETYHRINEGIGQGDLSELPELHALTAGLKAFTSWTANTGIEACRMACGGH ::.:... . : ... .: . :.: :::::::..:.::. : . : : :: ::::: CCDS33 AFHFLAVSLLEFFQHSYTAILNQDFSFLPELHALSTGMKAMMSEFCTQGAEMCRRACGGH 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KB9 GYSHCSGLPNIYVNFTPSCTFEGENTVMMLQTARFLMKSY--DQVHSG----KLVCGMVS :::. ::::.. .... :::.::::::..::.::::.::: :. : . . :. 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CCDS47 LRETYQKLNQEKRSGSSDFEARNKCQVSHGRPLALAFVELTVVQRFHEHVHQPSVPPSLR 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 610 pF1KB9 AVLRSLCLLYSLYGISQNAGDFLQGSIMTEPQITQVNQRVKELLTLIRSDAVALVDAFDF ::: : ::.:...:..: CCDS47 AVLGRLSALYALWSLSRHAALLYRAERRCSCPGRRDRSS 590 600 610 620 >>CCDS3401.1 ACOX3 gene_id:8310|Hs108|chr4 (700 aa) initn: 810 init1: 242 opt: 621 Z-score: 766.1 bits: 152.2 E(32554): 2.4e-36 Smith-Waterman score: 992; 32.2% identity (63.1% similar) in 656 aa overlap (9-633:25-667) 10 20 30 40 pF1KB9 MNPDLRRERDSASFNPELLTHILDGSPEKTRRRREIENMILNDP : :::. . :. . .: : .. : . . ::: CCDS34 MASTVEGGDTALLPEFPRGPLDAYRARASFSWKELALFTEGEGM-LRFKKTIFSALENDP 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 pF1KB9 DF-----------QHEDLNFLTRSQRYEVAVRKSAIMVKKMREFGIADPDEIMWFKNFVH : ....:::: : .: . . . :. : . . : :. . . CCDS34 LFARSPGADLSLEKYRELNFL-RCKRI---FEYDFLSVEDMFKSPLKVPALIQCLGMYDS 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KB9 RGRPEPLDLHLGMFLPTLLHQATAEQQERFFMPAWNLEIIGTYAQTEMGHGTHLRGLETI . : :: .. . . .... .:.. ... . .::.: .: ::..::.. ....: CCDS34 SLAAKYL-LH-SLVFGSAVYSSGSERHLTYIQKIFRMEIFGCFALTELSHGSNTKAIRTT 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KB9 ATYDPETQEFILNSPTVTSIKWWPGGLGKTSNHAIVLAQLITKG-KCYGLHAFIVPIREI : ::: :.:::..:: . :.: :..:::..::.:.:.: . : .:.::: ::: ::. CCDS34 AHYDPATEEFIIHSPDFEAAKFWVGNMGKTATHAVVFAKLCVPGDQCHGLHPFIVQIRDP 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KB9 GTHKPLPGITVGDIGPKFGYDEIDNGYLKMDNHRIPRENMLMKYAQVKPDGTYVKPLSN- : :.::. ::::: :.: . .:::. . . :.::...: ....: :.::::.:... CCDS34 KTLLPMPGVMVGDIGKKLGQNGLDNGFAMFHKVRVPRQSLLNRMGDVTPEGTYVSPFKDV 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 pF1KB9 ----KLTYGTMVFVRSFLVGEAARALSKACTIAIRYSAVRHQSEMKPGEPEP-QILDFQT . :.. : .:. : :. : .::.:.::.:.: . : : : .:.. 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