FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2594, 3664 aa 1>>>pF1KE2594 3664 - 3664 aa - 3664 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.6671+/-0.000598; mu= -29.7097+/- 0.038 mean_var=751.9715+/-156.875, 0's: 0 Z-trim(122.5): 134 B-trim: 657 in 1/59 Lambda= 0.046771 statistics sampled from 40525 (40691) to 40525 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.477), width: 16 Scan time: 29.700 The best scores are: opt bits E(85289) NP_055816 (OMIM: 613484) msx2-interacting protein (3664) 24115 1645.0 0 NP_002448 (OMIM: 158370) mucin-2 precursor [Homo s (5289) 553 55.2 4e-05 NP_001291288 (OMIM: 158373) mucin-5AC precursor [H (5654) 483 50.5 0.0011 NP_001188474 (OMIM: 606077) putative RNA-binding p ( 969) 448 47.7 0.0013 NP_073605 (OMIM: 606077) putative RNA-binding prot ( 977) 448 47.7 0.0013 XP_011536691 (OMIM: 601234) 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