FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2800, 497 aa 1>>>pF1KE2800 497 - 497 aa - 497 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6913+/-0.000926; mu= 16.1521+/- 0.056 mean_var=70.2753+/-14.412, 0's: 0 Z-trim(104.7): 17 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.152993 statistics sampled from 8151 (8161) to 8151 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16 Scan time: 1.440 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS1280.1 SLC19A2 gene_id:10560|Hs109|chr1 ( 497) 3269 731.0 7.5e-211 CCDS2468.1 SLC19A3 gene_id:80704|Hs109|chr2 ( 496) 1607 364.1 2e-100 CCDS81398.1 SLC19A2 gene_id:10560|Hs109|chr1 ( 296) 1479 335.8 4.1e-92 CCDS56218.1 SLC19A1 gene_id:6573|Hs109|chr21 ( 489) 641 150.9 3.1e-36 CCDS13725.1 SLC19A1 gene_id:6573|Hs109|chr21 ( 591) 641 150.9 3.6e-36 CCDS56217.1 SLC19A1 gene_id:6573|Hs109|chr21 ( 551) 500 119.8 7.9e-27 >>CCDS1280.1 SLC19A2 gene_id:10560|Hs109|chr1 (497 aa) initn: 3269 init1: 3269 opt: 3269 Z-score: 3899.1 bits: 731.0 E(33420): 7.5e-211 Smith-Waterman score: 3269; 100.0% identity (100.0% similar) in 497 aa overlap (1-497:1-497) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MDVPGPVSRRAAAAAATVLLRTARVRRECWFLPTALLCAYGFFASLRPSEPFLTPYLLGP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 MDVPGPVSRRAAAAAATVLLRTARVRRECWFLPTALLCAYGFFASLRPSEPFLTPYLLGP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 DKNLTEREVFNEIYPVWTYSYLVLLFPVFLATDYLRYKPVVLLQGLSLIVTWFMLLYAQG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 DKNLTEREVFNEIYPVWTYSYLVLLFPVFLATDYLRYKPVVLLQGLSLIVTWFMLLYAQG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LLAIQFLEFFYGIATATEIAYYSYIYSVVDLGMYQKVTSYCRSATLVGFTVGSVLGQILV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 LLAIQFLEFFYGIATATEIAYYSYIYSVVDLGMYQKVTSYCRSATLVGFTVGSVLGQILV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 SVAGWSLFSLNVISLTCVSVAFAVAWFLPMPQKSLFFHHIPSTCQRVNGIKVQNGGIVTD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 SVAGWSLFSLNVISLTCVSVAFAVAWFLPMPQKSLFFHHIPSTCQRVNGIKVQNGGIVTD 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 TPASNHLPGWEDIESKIPLNMEEPPVEEPEPKPDRLLVLKVLWNDFLMCYSSRPLLCWSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 TPASNHLPGWEDIESKIPLNMEEPPVEEPEPKPDRLLVLKVLWNDFLMCYSSRPLLCWSV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 WWALSTCGYFQVVNYTQGLWEKVMPSRYAAIYNGGVEAVSTLLGAVAVFAVGYIKISWST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 WWALSTCGYFQVVNYTQGLWEKVMPSRYAAIYNGGVEAVSTLLGAVAVFAVGYIKISWST 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 WGEMTLSLFSLLIAAAVYIMDTVGNIWVCYASYVVFRIIYMLLITIATFQIAANLSMERY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 WGEMTLSLFSLLIAAAVYIMDTVGNIWVCYASYVVFRIIYMLLITIATFQIAANLSMERY 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 ALVFGVNTFIALALQTLLTLIVVDASGLGLEITTQFLIYASYFALIAVVFLASGAVSVMK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 ALVFGVNTFIALALQTLLTLIVVDASGLGLEITTQFLIYASYFALIAVVFLASGAVSVMK 430 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 KCRKLEDPQSSSQVTTS ::::::::::::::::: CCDS12 KCRKLEDPQSSSQVTTS 490 >>CCDS2468.1 SLC19A3 gene_id:80704|Hs109|chr2 (496 aa) initn: 1612 init1: 879 opt: 1607 Z-score: 1916.6 bits: 364.1 E(33420): 2e-100 Smith-Waterman score: 1607; 52.1% identity (79.4% similar) in 466 aa overlap (30-490:12-472) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MDVPGPVSRRAAAAAATVLLRTARVRRECWFLPTALLCAYGFFASLRPSEPFLTPYLLGP :. ::..:: .:::. .::::::: ::: :: CCDS24 MDCYRTSLSSSWIYPTVILCLFGFFSMMRPSEPFLIPYLSGP 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 DKNLTEREVFNEIYPVWTYSYLVLLFPVFLATDYLRYKPVVLLQGLSLIVTWFMLLYAQG ::::: :. :::.:::::::::::.:::. :::.:::::..:::.:.:.::..::..:: CCDS24 DKNLTSAEITNEIFPVWTYSYLVLLLPVFVLTDYVRYKPVIILQGISFIITWLLLLFGQG 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LLAIQFLEFFYGIATATEIAYYSYIYSVVDLGMYQKVTSYCRSATLVGFTVGSVLGQILV . ..: .:::::..::.:.:::.::::::. ::.:..::::.::...:.::::.:.:: CCDS24 VKTMQVVEFFYGMVTAAEVAYYAYIYSVVSPEHYQRVSGYCRSVTLAAYTAGSVLAQLLV 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 SVAGWSLFSLNVISLTCVSVAFAVAWFLPMPQKSLFFHHIPSTCQRVNGIKVQNGGIVTD :.:. : : ::::::. ::::: . :::::.::.::: :: . : .. . : . 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CCDS13 DKNFTREQVTNEITPVLSYSYLAVLVPVFLLTDYLRYTPVLLLQGLSFVSVWLLLLLGHS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LLAIQFLEFFYGIATATEIAYYSYIYSVVDLGMYQKVTSYCRSATLVGFTVGSVLGQILV . .:..:.::... :..::: :::.:.: . ::.:..: :.:.:.: ..:::::.:: CCDS13 VAHMQLMELFYSVTMAARIAYSSYIFSLVRPARYQRVAGYSRAAVLLGVFTSSVLGQLLV 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 SVAGWSLFSLNVISLTCVSVAFAVAWFLPMPQKSLFFHHIPSTCQRVNGIKVQNGGIVTD .:. :. .:: :::. .. . ..: :: :..::::. : . . ... ... CCDS13 TVGRVSFSTLNYISLAFLTFSVVLALFLKRPKRSLFFN-------RDDRGRCETS--ASE 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 pF1KE2 TPASNHLPGWEDIESKIPLNMEEPPVEEPEPKPDRLLVLKVLWNDFLMCYSSRPLL-CWS : :: .:. .. : . :. :. : .: : :: : :: CCDS13 LERMNPGPG-----GKLGHALR---VACGDSVLARM--LREL-GDSL----RRPQLRLWS 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 VWWALSTCGYFQVVNYTQGLWEKVMPSRYAA-IYNGGVEAVSTLLGAVAVFAVGYIKISW .::.... ::. :: :.. ::..: :. .: .:::...:.::::::.. ::.:..:: : CCDS13 LWWVFNSAGYYLVVYYVHILWNEVDPTTNSARVYNGAADAASTLLGAITSFAAGFVKIRW 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 STWGEMTLSLFSLLIAAAVYIMDTV---GNIWVCYASYVVFRIIYMLLITIATFQIAANL . :... .. . :. :... . ..::.:::..:.:: :..:. :::::::..: CCDS13 ARWSKLLIAGVTATQAGLVFLLAHTRHPSSIWLCYAAFVLFRGSYQFLVPIATFQIASSL 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 SMERYALVFGVNTFIALALQTLLTLIVVDASGLGLEITTQFLIYASYFALIAVVFLASGA : : :::::::::.: ..:..:.:: :. :::: . :: .:. :: ....... .. CCDS13 SKELCALVFGVNTFFATIVKTIITFIVSDVRGLGLPVRKQFQLYSVYFLILSIIYFLGAM 400 410 420 430 440 450 480 490 pF1KE2 VSVMKKCRKLEDPQSSSQVTTS .. ...:.. . :. CCDS13 LDGLRHCQRGHHPRQPPAQGLRSAAEEKAAQALSVQDKGLGGLQPAQSPPLSPEDSLGAV 460 470 480 490 500 510 >>CCDS56217.1 SLC19A1 gene_id:6573|Hs109|chr21 (551 aa) initn: 1024 init1: 497 opt: 500 Z-score: 595.3 bits: 119.8 E(33420): 7.9e-27 Smith-Waterman score: 1004; 38.8% identity (70.3% similar) in 448 aa overlap (47-489:4-425) 20 30 40 50 60 70 pF1KE2 TVLLRTARVRRECWFLPTALLCAYGFFASLRPSEPFLTPYLLGPDKNLTEREVFNEIYPV .:.:: .: : . . :: ::: :: CCDS56 MRPQPAEP--APGGRGNEACSIHSEVTNEITPV 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KE2 WTYSYLVLLFPVFLATDYLRYKPVVLLQGLSLIVTWFMLLYAQGLLAIQFLEFFYGIATA .::::..: :::: :::::: ::.::::::.. .:..:: .... .:..:.::... : CCDS56 LSYSYLAVLVPVFLLTDYLRYTPVLLLQGLSFVSVWLLLLLGHSVAHMQLMELFYSVTMA 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KE2 TEIAYYSYIYSVVDLGMYQKVTSYCRSATLVGFTVGSVLGQILVSVAGWSLFSLNVISLT ..::: :::.:.: . ::.:..: :.:.:.: ..:::::.::.:. :. .:: :::. CCDS56 ARIAYSSYIFSLVRPARYQRVAGYSRAAVLLGVFTSSVLGQLLVTVGRVSFSTLNYISLA 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 CVSVAFAVAWFLPMPQKSLFFHHIPSTCQRVNGIKVQNGGIVTDTPASNHLPGWEDIESK .. . ..: :: :..::::. : . . ... ... : :: .: CCDS56 FLTFSVVLALFLKRPKRSLFFN-------RDDRGRCETS--ASELERMNPGPG-----GK 160 170 180 190 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 IPLNMEEPPVEEPEPKPDRLLVLKVLWNDFLMCYSSRPLL-CWSVWWALSTCGYFQVVNY . .. : . :. :. : .: : :: : ::.::.... ::. :: : CCDS56 LGHALR---VACGDSVLARM--LREL-GDSL----RRPQLRLWSLWWVFNSAGYYLVVYY 200 210 220 230 240 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 TQGLWEKVMPSRYAA-IYNGGVEAVSTLLGAVAVFAVGYIKISWSTWGEMTLSLFSLLIA .. ::..: :. .: .:::...:.::::::.. ::.:..:: :. :... .. . : CCDS56 VHILWNEVDPTTNSARVYNGAADAASTLLGAITSFAAGFVKIRWARWSKLLIAGVTATQA 250 260 270 280 290 300 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 AAVYIMDTV---GNIWVCYASYVVFRIIYMLLITIATFQIAANLSMERYALVFGVNTFIA . :... . ..::.:::..:.:: :..:. :::::::..:: : :::::::::.: CCDS56 GLVFLLAHTRHPSSIWLCYAAFVLFRGSYQFLVPIATFQIASSLSKELCALVFGVNTFFA 310 320 330 340 350 360 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 LALQTLLTLIVVDASGLGLEITTQFLIYASYFALIAVVFLASGAVSVMKKCRKLEDPQSS ..:..:.:: :. :::: . :: .:. :: ....... .. .. ...:.. . :. CCDS56 TIVKTIITFIVSDVRGLGLPVRKQFQLYSVYFLILSIIYFLGAMLDGLRHCQRGHHPRQP 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 SQVTTS CCDS56 PAQGLRSAAEEKAAQALSVQDKGLGGLQPAQSPPLSPEDSLGAVGPASLEQRQSDPYLAQ 430 440 450 460 470 480 497 residues in 1 query sequences 18921897 residues in 33420 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Aug 16 14:42:35 2021 done: Mon Aug 16 14:42:35 2021 Total Scan time: 1.440 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]