Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2774
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2774, 705 aa
1>>>pF1KE2774 705 - 705 aa - 705 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7953+/-0.00118; mu= 18.9347+/- 0.071
mean_var=141.1112+/-26.496, 0's: 0 Z-trim(107.5): 89 B-trim: 33 in 1/49
Lambda= 0.107968
statistics sampled from 9677 (9760) to 9677 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16
Scan time: 1.720
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS5515.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 ( 705) 5002 791.8 0
CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1210) 4447 705.6 1.1e-202
CCDS5516.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 ( 628) 4443 704.7 1.1e-202
CCDS87507.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1091) 3246 518.5 2.1e-146
CCDS87506.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1165) 3246 518.5 2.2e-146
CCDS47587.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 ( 405) 2815 450.8 1.8e-126
CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1292) 2195 354.9 4.5e-97
CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1308) 2195 354.9 4.5e-97
CCDS31833.1 ERBB3 gene_id:2065|Hs109|chr12 (1342) 2085 337.8 6.6e-92
CCDS77017.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 ( 603) 1721 280.6 4.7e-75
CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (1055) 1721 281.0 6.6e-75
CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (1225) 1721 281.0 7.3e-75
CCDS74052.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (1240) 1721 281.0 7.3e-75
CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (1255) 1721 281.0 7.4e-75
>>CCDS5515.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (705 aa)
initn: 5002 init1: 5002 opt: 5002 Z-score: 4222.4 bits: 791.8 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 5002; 99.9% identity (100.0% similar) in 705 aa overlap (1-705:1-705)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS55 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGPGNESLKAMLFCLFKLSSCNQSNDGSVSHQSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGPGNESLKAMLFCLFKLSSCNQSNDGSVSHQSGS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KE2 PAAQESCLGWIPSLLPSEFQLGWGGCSHLHAWPSASVIITASSCH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PAAQESCLGWIPSLLPSEFQLGWGGCSHLHAWPSASVIITASSCH
670 680 690 700
>>CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1210 aa)
initn: 4443 init1: 4443 opt: 4447 Z-score: 3752.6 bits: 705.6 E(33420): 1.1e-202
Smith-Waterman score: 4447; 99.2% identity (99.4% similar) in 634 aa overlap (1-631:1-634)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS55 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KE2 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYG---PGNESLKAMLFCLFKLSSCNQSNDGSVSHQ
::::::::::::::::::::::::::: :: :
CCDS55 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700
pF1KE2 SGSPAAQESCLGWIPSLLPSEFQLGWGGCSHLHAWPSASVIITASSCH
CCDS55 ALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGS
670 680 690 700 710 720
>>CCDS5516.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (628 aa)
initn: 4443 init1: 4443 opt: 4443 Z-score: 3752.4 bits: 704.7 E(33420): 1.1e-202
Smith-Waterman score: 4443; 99.8% identity (100.0% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-627)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS55 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGPGNESLKAMLFCLFKLSSCNQSNDGSVSHQSGS
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS
610 620
>>CCDS87507.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1091 aa)
initn: 4110 init1: 3228 opt: 3246 Z-score: 2742.1 bits: 518.5 E(33420): 2.1e-146
Smith-Waterman score: 4026; 92.1% identity (92.3% similar) in 634 aa overlap (1-631:1-589)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::: :
CCDS87 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQ----G----------------------------------
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 -------QKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS87 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
500 510 520 530 540 550
610 620 630 640 650
pF1KE2 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYG---PGNESLKAMLFCLFKLSSCNQSNDGSVSHQ
::::::::::::::::::::::::::: :: :
CCDS87 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
560 570 580 590 600 610
660 670 680 690 700
pF1KE2 SGSPAAQESCLGWIPSLLPSEFQLGWGGCSHLHAWPSASVIITASSCH
CCDS87 ALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGS
620 630 640 650 660 670
>>CCDS87506.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1165 aa)
initn: 4110 init1: 3228 opt: 3246 Z-score: 2741.8 bits: 518.5 E(33420): 2.2e-146
Smith-Waterman score: 4026; 92.1% identity (92.3% similar) in 634 aa overlap (1-631:1-589)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::: :
CCDS87 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQ----G----------------------------------
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 -------QKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
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pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
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370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS87 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
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550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
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pF1KE2 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYG---PGNESLKAMLFCLFKLSSCNQSNDGSVSHQ
::::::::::::::::::::::::::: :: :
CCDS87 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
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pF1KE2 SGSPAAQESCLGWIPSLLPSEFQLGWGGCSHLHAWPSASVIITASSCH
CCDS87 ALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
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pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
190 200 210 220 230 240
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pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
310 320 330 340 350 360
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pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS47 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGLS
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:.:. :. . ..::.: . . . ..:: :: :::..:. .:... .:.....::::
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pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
:.:::::: ...: :::::....::.::::.::: . .:::::.::::. ::. ::::
CCDS42 VMGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALA
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pF1KE2 VLSNY--DANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSM
.. :: :.: ::.:: ..:: :::.:.: ..: :: ...:.:.::: . . ::...
CCDS42 IFLNYRKDGN-FGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTL
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pF1KE2 DFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAA
: ..: .: :: .: ::: :..:: ::. .::.::.::: : ::::: .::.
CCDS42 VSTNGSSGCGRCHKSC-TGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAG
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pF1KE2 GCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRN
::.::...::..: .: : ..: :: ..:::::.:.. : ..::..:: ::::::.:
CCDS42 GCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHN
240 250 260 270 280 290
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pF1KE2 YVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKH
.:: : .:::::: ....:.::.:.. :: : : :.:.::: : . .. .....:: .
CCDS42 FVV-DSSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDK
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pF1KE2 FKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLH
: :::.:.:.: .: ....:: .. .::..:....::.:::::: ::.:: : ::.
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360 370 380 390 400 410
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pF1KE2 AFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWK
.: :: : ::. : : . . .:::: ..:::::: :.. :. :.:::: .::::
CCDS42 VFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWT
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::.: .:. : .:: ..: : :.::. ::: .::::: : .:.::: :::: :...
CCDS42 TLFSTINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIES
480 490 500 510 520 530
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pF1KE2 CNLLEGEPREFVENSECIQCHPEC--LPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCP
::: .:: ::: ..: :..: :.: . ... .:: : ::::: .:.:. :::.::. ::
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:..: : ....:::: . :: :::::: :
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CCDS42 AAGVIGGLFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRIL
660 670 680 690 700 710
>>CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1308 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
:.:. :. . ..::.: . . . ..:: :: :::..:. .:... .:.....::::
CCDS23 MKPA-TGLWVWVSLLVA-AGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEV
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pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
:.:::::: ...: :::::....::.::::.::: . .:::::.::::. ::. ::::
CCDS23 VMGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALA
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pF1KE2 VLSNY--DANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSM
.. :: :.: ::.:: ..:: :::.:.: ..: :: ...:.:.::: . . ::...
CCDS23 IFLNYRKDGN-FGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTL
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pF1KE2 DFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAA
: ..: .: :: .: ::: :..:: ::. .::.::.::: : ::::: .::.
CCDS23 VSTNGSSGCGRCHKSC-TGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRN
::.::...::..: .: : ..: :: ..:::::.:.. : ..::..:: ::::::.:
CCDS23 GCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHN
240 250 260 270 280 290
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pF1KE2 YVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKH
.:: : .:::::: ....:.::.:.. :: : : :.:.::: : . .. .....:: .
CCDS23 FVV-DSSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDK
300 310 320 330 340 350
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pF1KE2 FKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLH
: :::.:.:.: .: ....:: .. .::..:....::.:::::: ::.:: : ::.
CCDS23 FINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFS
360 370 380 390 400 410
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pF1KE2 AFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWK
.: :: : ::. : : . . .:::: ..:::::: :.. :. :.:::: .::::
CCDS23 VFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWT
420 430 440 450 460 470
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pF1KE2 KLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDK
::.: .:. : .:: ..: : :.::. ::: .::::: : .:.::: :::: :...
CCDS23 TLFSTINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIES
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 CNLLEGEPREFVENSECIQCHPEC--LPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCP
::: .:: ::: ..: :..: :.: . ... .:: : ::::: .:.:. :::.::. ::
CCDS23 CNLYDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGL-LTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCP
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 AGVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGPGNESLKAMLFCLFKLSSCNQSNDGSVSH
:..: : ....:::: . :: :::::: :
CCDS23 DGLQGAN-SFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLI
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KE2 QSGSPAAQESCLGWIPSLLPSEFQLGWGGCSHLHAWPSASVIITASSCH
CCDS23 AAGVIGGLFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRIL
660 670 680 690 700 710
>>CCDS31833.1 ERBB3 gene_id:2065|Hs109|chr12 (1342 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
.:.:: .: .:.. . . :: :: : :. : :... .: .... :::
CCDS31 MRANDALQVLGLLFSLARGSEVGNSQAVCPGTLNGLSVTGDAENQYQTLYKLYERCEV
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pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
:.:::::. . .: :::::. :.::.::::.:.: .:: ::...::.. :....:.
CCDS31 VMGNLEIVLTGHNADLSFLQWIREVTGYVLVAMNEFSTLPLPNLRVVRGTQVYDGKFAIF
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 VLSNYDANKT-GLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMD
:. ::..:.. .:..: . .: ::: :.: . .: ::....:.::::: . . .
CCDS31 VMLNYNTNSSHALRQLRLTQLTEILSGGVYIEKNDKLCHMDTIDWRDIVRD---RDAEIV
120 130 140 150 160 170
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pF1KE2 FQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAG
... :: : : .: ::: : :.:: ::: ::: ::.:.: : .:..:::..::.:
CCDS31 VKDNGRSCPPCHEVC-KGRCWGPGSEDCQTLTKTICAPQCNGHCFGPNPNQCCHDECAGG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 CTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNY
:.::...::..::.: : ..: :: ..:: :.:.. ::. ::..:..:: .::.:.
CCDS31 CSGPQDTDCFACRHFNDSGACVPRCPQPLVYNKLTFQLEPNPHTKYQYGGVCVASCPHNF
240 250 260 270 280 290
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pF1KE2 VVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIG-EFKDSLSINATNIKH
:: :. :::::: :..:....:.. :. : : : :.:.: : : .:. .....::
CCDS31 VV-DQTSCVRACPPDKMEVDKNGLKMCEPCGGLCPKACEGTGSGSRFQ---TVDSSNIDG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 FKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLH
: :::.: :.: .: ... :: . . : :::..:....::.::::.: ::.:: . ..
CCDS31 FVNCTKILGNLDFLITGLNGDPWHKIPALDPEKLNVFRTVREITGYLNIQSWPPHMHNFS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 AFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVV-SLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINW
.: :: : ::. . ::: .. .::.::::.::::::: : . ::.:..::: ...::
CCDS31 VFSNLTTIGGRSLYNRGFSLLIMKNLNVTSLGFRSLKEISAGRIYISANRQLCYHHSLNW
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 KKLF-GTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECV
:.. : . .. : :: . .: : :.:: ::: ::::: : .:.:::: ::: ::
CCDS31 TKVLRGPTEERLDIKHNRPRRDCVAEGKVCDPLCSSGGCWGPGPGQCLSCRNYSRGGVCV
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 DKCNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCP
.::.:.::::::....::..::::: :. . ::.: : :.: ::::. ::::::..::
CCDS31 THCNFLNGEPREFAHEAECFSCHPECQPMEGTATCNGSGSDTCAQCAHFRDGPHCVSSCP
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 AGVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGPGNESLKAMLFCLFKLSSCNQSNDGSVSH
::.: .. ..:: :. . :. :: ::: :
CCDS31 HGVLGAKGP-IYKYPDVQNECRPCHENCTQGCKGPELQDCLGQTLVLIGKTHLTMALTVI
600 610 620 630 640
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pF1KE2 QSGSPAAQESCLGWIPSLLPSEFQLGWGGCSHLHAWPSASVIITASSCH
CCDS31 AGLVVIFMMLGGTFLYWRGRRIQNKRAMRRYLERGESIEPLDPSEKANKVLARIFKETEL
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