FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7053, 543 aa 1>>>pF1KB7053 543 - 543 aa - 543 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.8149+/-0.000455; mu= -25.0789+/- 0.029 mean_var=563.4352+/-121.440, 0's: 0 Z-trim(124.1): 1482 B-trim: 2494 in 1/60 Lambda= 0.054032 statistics sampled from 43384 (45201) to 43384 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.795), E-opt: 0.2 (0.53), width: 16 Scan time: 13.220 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001955 (OMIM: 128990) early growth response pro ( 543) 3664 300.2 1.1e-80 NP_001186810 (OMIM: 602419) early growth response ( 333) 968 89.9 1.3e-17 NP_001186809 (OMIM: 602419) early growth response ( 349) 968 89.9 1.4e-17 XP_005273483 (OMIM: 602419) PREDICTED: early growt ( 349) 968 89.9 1.4e-17 NP_004421 (OMIM: 602419) early growth response pro ( 387) 968 90.0 1.5e-17 XP_011542731 (OMIM: 602419) PREDICTED: early growt ( 406) 968 90.0 1.5e-17 XP_005273482 (OMIM: 602419) PREDICTED: early growt ( 442) 968 90.0 1.7e-17 NP_001129651 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E ( 426) 823 78.7 4.1e-14 NP_001307966 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E ( 426) 823 78.7 4.1e-14 NP_001129649 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E ( 476) 823 78.7 4.4e-14 NP_001129650 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E ( 476) 823 78.7 4.4e-14 NP_000390 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E3 S ( 476) 823 78.7 4.4e-14 XP_011537729 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) P ( 489) 823 78.7 4.5e-14 NP_001956 (OMIM: 128992) early growth response pro ( 589) 598 61.2 1e-08 NP_001185480 (OMIM: 106210,136680,156240,194070,19 ( 302) 435 48.3 3.9e-05 NP_000369 (OMIM: 106210,136680,156240,194070,19407 ( 497) 435 48.5 5.8e-05 NP_077742 (OMIM: 106210,136680,156240,194070,19407 ( 514) 435 48.5 6e-05 NP_001185481 (OMIM: 106210,136680,156240,194070,19 ( 288) 419 47.1 9e-05 NP_077744 (OMIM: 106210,136680,156240,194070,19407 ( 517) 419 47.2 0.00014 XP_011525944 (OMIM: 111150,600599,613566,613673) P ( 324) 368 43.1 0.0015 NP_006554 (OMIM: 111150,600599,613566,613673) Krue ( 362) 368 43.2 0.0017 XP_005250017 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 595) 361 42.8 0.0037 XP_005250018 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 595) 361 42.8 0.0037 NP_997219 (OMIM: 614040) zinc finger protein 467 i ( 595) 361 42.8 0.0037 XP_005250016 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 595) 361 42.8 0.0037 XP_011514160 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 595) 361 42.8 0.0037 XP_006715927 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 636) 361 42.8 0.0039 NP_001303927 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 487) 355 42.2 0.0043 NP_001303926 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 487) 355 42.2 0.0043 XP_016867288 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 770) 361 42.8 0.0045 NP_001303925 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 531) 355 42.3 0.0046 XP_011514159 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 809) 361 42.9 0.0047 NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 i ( 563) 355 42.3 0.0049 XP_011514158 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 846) 361 42.9 0.0049 XP_011514157 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 846) 361 42.9 0.0049 NP_114124 (OMIM: 606139) Krueppel-like factor 16 [ ( 252) 343 41.1 0.0049 NP_001304919 (OMIM: 605878) zinc finger and BTB do ( 584) 353 42.1 0.0056 XP_005259628 (OMIM: 605878) PREDICTED: zinc finger ( 584) 353 42.1 0.0056 NP_056982 (OMIM: 605878) zinc finger and BTB domai ( 584) 353 42.1 0.0056 XP_016874442 (OMIM: 609951) PREDICTED: zinc finger ( 500) 350 41.9 0.0058 XP_016874441 (OMIM: 609951) PREDICTED: zinc finger ( 500) 350 41.9 0.0058 XP_016874440 (OMIM: 609951) PREDICTED: zinc finger ( 500) 350 41.9 0.0058 NP_660334 (OMIM: 616238) zinc finger and BTB domai ( 765) 356 42.5 0.0059 NP_001317554 (OMIM: 616238) zinc finger and BTB do ( 765) 356 42.5 0.0059 XP_005259627 (OMIM: 605878) PREDICTED: zinc finger ( 634) 353 42.2 0.006 NP_008894 (OMIM: 194529) zinc finger protein 22 [H ( 224) 336 40.5 0.0065 XP_005251444 (OMIM: 610192,610199) PREDICTED: zinc ( 708) 353 42.2 0.0065 XP_011516069 (OMIM: 610192,610199) PREDICTED: zinc ( 708) 353 42.2 0.0065 XP_005251445 (OMIM: 610192,610199) PREDICTED: zinc ( 708) 353 42.2 0.0065 XP_016882236 (OMIM: 165260) PREDICTED: zinc finger ( 327) 341 41.0 0.0067 >>NP_001955 (OMIM: 128990) early growth response protein (543 aa) initn: 3664 init1: 3664 opt: 3664 Z-score: 1569.8 bits: 300.2 E(85289): 1.1e-80 Smith-Waterman score: 3664; 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NP_001 ----QGDVEAMYPALP--PYSNCGDLYSEPVSFHDPQGNPGLA--YSPQDYQSAKPALDS 80 90 100 110 120 130 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 --VPMIPDYLFPQQQGDLGLGTPDQKPFQGLES-RTQQPSLTPLSTIKAFATQSGSQDLK :::::: . .. .:.: . :..:::::.. :.. : .::: ::::: . : NP_001 NLFPMIPDYNLYHHPNDMG-SIPEHKPFQGMDPIRVNPPPITPLETIKAFKDK---QIHP 140 150 160 170 180 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 ALNTSYQSQL-IKPSRMRKYPNRPSKTPPHERPYACPVESCDRRFSRSDELTRHIRIHTG .... : : .:: : ::::::::::: ::::.:::.:.::::::::::::::.::::: NP_001 GFGSLPQPPLTLKPIRPRKYPNRPSKTPLHERPHACPAEGCDRRFSRSDELTRHLRIHTG 190 200 210 220 230 240 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 QKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACDICGRKFARSDERKRHTKIHLRQKDK .::::::::::.::::::::::::::::::::::..::::::::::::::.::::.::.: NP_001 HKPFQCRICMRSFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACEFCGRKFARSDERKRHAKIHLKQKEK 250 260 270 280 290 300 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 KADKSVVASSATSSLSSYPSPVATSYPSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTYPS ::.:. : ::.:. .::.:. NP_001 KAEKGG-APSASSAPPVSLAPVVTTCA 310 320 330 >>NP_001186809 (OMIM: 602419) early growth response prot (349 aa) initn: 1004 init1: 716 opt: 968 Z-score: 436.8 bits: 89.9 E(85289): 1.4e-17 Smith-Waterman score: 1010; 50.4% identity (69.7% similar) in 357 aa overlap (103-449:14-347) 80 90 100 110 120 pF1KB7 GGGGSNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHLTAESFPDISLNNEKVLVETSYPSQTTRLP--- :. ::.:.::: : :: .. : NP_001 MEPCAAWSPRGGRENVMDIGLTNEKPNPELSYSGSFQPAPGNK 10 20 30 40 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 PITYTGRFSLEPAPNSGNTLW-PEPLFSLVSGLVSMTNPPASSSSAPSPAASSASASQSP .:: :.:... : : . ..::.:. . . :::: .: : .:.:: : : NP_001 TVTYLGKFAFDSPSN-----WCQDNIISLMSAGI-LGVPPAS--GALSTQTSTASMVQ-P 50 60 70 80 90 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 PLSCAVPSNDSSPIYSAAPTFPTPNTDIFPEPQSQAFP-GSAGTALQYPPPAYPAAKGGF : ..: .: : : . . :.. :: : : :. : : : : : .:: .. NP_001 P------QGDVEAMYPALPPY-SNCGDLYSEPVSFHDPQGNPGLA--YSPQDYQSAKPAL 100 110 120 130 140 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 Q---VPMIPDYLFPQQQGDLGLGTPDQKPFQGLES-RTQQPSLTPLSTIKAFATQSGSQD . :::::: . .. .:.: . :..:::::.. :.. : .::: ::::: . : NP_001 DSNLFPMIPDYNLYHHPNDMG-SIPEHKPFQGMDPIRVNPPPITPLETIKAFKDK---QI 150 160 170 180 190 200 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 LKALNTSYQSQL-IKPSRMRKYPNRPSKTPPHERPYACPVESCDRRFSRSDELTRHIRIH .... : : .:: : ::::::::::: ::::.:::.:.::::::::::::::.::: NP_001 HPGFGSLPQPPLTLKPIRPRKYPNRPSKTPLHERPHACPAEGCDRRFSRSDELTRHLRIH 210 220 230 240 250 260 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 TGQKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACDICGRKFARSDERKRHTKIHLRQK ::.::::::::::.::::::::::::::::::::::..::::::::::::::.::::.:: NP_001 TGHKPFQCRICMRSFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACEFCGRKFARSDERKRHAKIHLKQK 270 280 290 300 310 320 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 DKKADKSVVASSATSSLSSYPSPVATSYPSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTY .:::.:. : ::.:. .::.:. NP_001 EKKAEKGG-APSASSAPPVSLAPVVTTCA 330 340 >>XP_005273483 (OMIM: 602419) PREDICTED: early growth re (349 aa) initn: 1004 init1: 716 opt: 968 Z-score: 436.8 bits: 89.9 E(85289): 1.4e-17 Smith-Waterman score: 1010; 50.4% identity (69.7% similar) in 357 aa overlap (103-449:14-347) 80 90 100 110 120 pF1KB7 GGGGSNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHLTAESFPDISLNNEKVLVETSYPSQTTRLP--- :. ::.:.::: : :: .. : XP_005 MEPCAAWSPRGGRENVMDIGLTNEKPNPELSYSGSFQPAPGNK 10 20 30 40 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 PITYTGRFSLEPAPNSGNTLW-PEPLFSLVSGLVSMTNPPASSSSAPSPAASSASASQSP .:: :.:... : : . ..::.:. . . :::: .: : .:.:: : : XP_005 TVTYLGKFAFDSPSN-----WCQDNIISLMSAGI-LGVPPAS--GALSTQTSTASMVQ-P 50 60 70 80 90 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 PLSCAVPSNDSSPIYSAAPTFPTPNTDIFPEPQSQAFP-GSAGTALQYPPPAYPAAKGGF : ..: .: : : . . :.. :: : : :. : : : : : .:: .. XP_005 P------QGDVEAMYPALPPY-SNCGDLYSEPVSFHDPQGNPGLA--YSPQDYQSAKPAL 100 110 120 130 140 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 Q---VPMIPDYLFPQQQGDLGLGTPDQKPFQGLES-RTQQPSLTPLSTIKAFATQSGSQD . :::::: . .. .:.: . :..:::::.. :.. : .::: ::::: . : XP_005 DSNLFPMIPDYNLYHHPNDMG-SIPEHKPFQGMDPIRVNPPPITPLETIKAFKDK---QI 150 160 170 180 190 200 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 LKALNTSYQSQL-IKPSRMRKYPNRPSKTPPHERPYACPVESCDRRFSRSDELTRHIRIH .... : : .:: : ::::::::::: ::::.:::.:.::::::::::::::.::: XP_005 HPGFGSLPQPPLTLKPIRPRKYPNRPSKTPLHERPHACPAEGCDRRFSRSDELTRHLRIH 210 220 230 240 250 260 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 TGQKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACDICGRKFARSDERKRHTKIHLRQK ::.::::::::::.::::::::::::::::::::::..::::::::::::::.::::.:: XP_005 TGHKPFQCRICMRSFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACEFCGRKFARSDERKRHAKIHLKQK 270 280 290 300 310 320 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 DKKADKSVVASSATSSLSSYPSPVATSYPSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTY .:::.:. : ::.:. .::.:. XP_005 EKKAEKGG-APSASSAPPVSLAPVVTTCA 330 340 >>NP_004421 (OMIM: 602419) early growth response protein (387 aa) initn: 1043 init1: 716 opt: 968 Z-score: 436.1 bits: 90.0 E(85289): 1.5e-17 Smith-Waterman score: 1025; 48.9% identity (69.7% similar) in 380 aa overlap (81-449:31-385) 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 AAGAPEGSGSNSSSSSSGGGGGGGGGSNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHLTAESFPDISL :. . :. ..:. . :.....:. ::.: NP_004 MTGKLAEKLPVTMSSLLNQLPDNLYPEEIPSALNLFSGSSDSVVH-YNQMATENVMDIGL 10 20 30 40 50 120 130 140 150 160 pF1KB7 NNEKVLVETSYPSQTTRLP---PITYTGRFSLEPAPNSGNTLW-PEPLFSLVSGLVSMTN .::: : :: .. : .:: :.:... : : . ..::.:. . . 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NP_001 IRTHTGEKPFACDYCGRKFARSDERKRHTKIHLRQKERKSSAPSASVPAPSTASCSGGVQ 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 PSPVATSYPSPVTTSYP-SPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTYPSPVHSGFPSPSVATTYSS :. . : : . : .: .. .: NP_001 PGGTLCSSNSSSLGGGPLAPCSSRTRTP 400 410 420 >>NP_001129649 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E3 SU (476 aa) initn: 939 init1: 708 opt: 823 Z-score: 373.8 bits: 78.7 E(85289): 4.4e-14 Smith-Waterman score: 1019; 43.1% identity (66.7% similar) in 448 aa overlap (80-469:32-476) 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 GAAGAPEGSGSNSSSSSSGGGGGGGGGSNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHLTA---ESFP ...: :. :.:. : :...... ... NP_001 MTAKAVDKIPVTLSGFVHQLSDNIYPVEDLAATSVTIFPNAELG-GPFDQMNGVAGDGMI 10 20 30 40 50 60 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 DISLNNEKVLVETSYPSQ-----TTRLPPITYTGRFSLEPAPNSGNTLWPEPLFSLVS-G .:....:: .. :::. . : .:: :.::..: : . .:: ....:: : NP_001 NIDMTGEKRSLDLPYPSSFAPVSAPRNQTFTYMGKFSIDPQ-YPGASCYPEGIINIVSAG 70 80 90 100 110 170 180 190 200 210 pF1KB7 LVSMTNPPASSSSAPSPAASSASASQSPPLS-CAVPSN--DSSPIYSAAPTFPTPNT--- ... .. :::.... : ...: . . ::. :.. .. : . .:: : : : . NP_001 ILQGVTSPASTTASSSVTSASPNPLATGPLGVCTMSQTQPDLDHLYSPPPP-PPPYSGCA 120 130 140 150 160 170 220 230 240 250 260 pF1KB7 -DIFPEPQS--QAFPGSAGTALQYPPP-AYPAAKGGFQ---VPMIPDY--LFPQQ-QGDL :.. .:.. .: :....: :::: .::. : . . :::::: .::.: : :: NP_001 GDLYQDPSAFLSAATTSTSSSLAYPPPPSYPSPKPATDPGLFPMIPDYPGFFPSQCQRDL 180 190 200 210 220 230 270 280 290 300 pF1KB7 -GLGTPDQKPFQ-GLESRTQQPSLTPLSTIKAFA------------TQSGSQDLK----- : . ::.::: :.. : :::::::. :. ...::. . 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