FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3891, 343 aa 1>>>pF1KE3891 343 - 343 aa - 343 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7510+/-0.00109; mu= 9.3561+/- 0.065 mean_var=88.4249+/-17.191, 0's: 0 Z-trim(103.8): 27 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.136391 statistics sampled from 7679 (7691) to 7679 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16 Scan time: 1.220 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS1181.1 AIM2 gene_id:9447|Hs109|chr1 ( 343) 2159 435.0 4.3e-122 CCDS58039.1 IFI16 gene_id:3428|Hs109|chr1 ( 729) 649 138.0 2.4e-32 CCDS1177.1 MNDA gene_id:4332|Hs109|chr1 ( 407) 581 124.5 1.5e-28 CCDS1180.3 IFI16 gene_id:3428|Hs109|chr1 ( 729) 529 114.4 3.1e-25 CCDS30908.1 PYHIN1 gene_id:149628|Hs109|chr1 ( 452) 517 112.0 1e-24 CCDS30907.1 PYHIN1 gene_id:149628|Hs109|chr1 ( 461) 517 112.0 1e-24 CCDS1179.1 PYHIN1 gene_id:149628|Hs109|chr1 ( 483) 517 112.0 1.1e-24 CCDS1178.1 PYHIN1 gene_id:149628|Hs109|chr1 ( 492) 517 112.0 1.1e-24 >>CCDS1181.1 AIM2 gene_id:9447|Hs109|chr1 (343 aa) initn: 2159 init1: 2159 opt: 2159 Z-score: 2305.6 bits: 435.0 E(33420): 4.3e-122 Smith-Waterman score: 2159; 100.0% identity (100.0% similar) in 343 aa overlap (1-343:1-343) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MESKYKEILLLTGLDNITDEELDRFKFFLSDEFNIATGKLHTANRIQVATLMIQNAGAVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 MESKYKEILLLTGLDNITDEELDRFKFFLSDEFNIATGKLHTANRIQVATLMIQNAGAVS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 AVMKTIRIFQKLNYMLLAKRLQEEKEKVDKQYKSVTKPKPLSQAEMSPAASAAIRNDVAK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 AVMKTIRIFQKLNYMLLAKRLQEEKEKVDKQYKSVTKPKPLSQAEMSPAASAAIRNDVAK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 QRAAPKVSPHVKPEQKQMVAQQESIREGFQKRCLPVMVLKAKKPFTFETQEGKQEMFHAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 QRAAPKVSPHVKPEQKQMVAQQESIREGFQKRCLPVMVLKAKKPFTFETQEGKQEMFHAT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 VATEKEFFFVKVFNTLLKDKFIPKRIIIIARYYRHSGFLEVNSASRVLDAESDQKVNVPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 VATEKEFFFVKVFNTLLKDKFIPKRIIIIARYYRHSGFLEVNSASRVLDAESDQKVNVPL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 NIIRKAGETPKINTLQTQPLGTIVNGLFVVQKVTEKKKNILFDLSDNTGKMEVLGVRNED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 NIIRKAGETPKINTLQTQPLGTIVNGLFVVQKVTEKKKNILFDLSDNTGKMEVLGVRNED 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 TMKCKEGDKVRLTFFTLSKNGEKLQLTSGVHSTIKVIKAKKKT ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 TMKCKEGDKVRLTFFTLSKNGEKLQLTSGVHSTIKVIKAKKKT 310 320 330 340 >>CCDS58039.1 IFI16 gene_id:3428|Hs109|chr1 (729 aa) initn: 679 init1: 437 opt: 649 Z-score: 694.4 bits: 138.0 E(33420): 2.4e-32 Smith-Waterman score: 649; 37.1% identity (69.0% similar) in 345 aa overlap (1-343:1-336) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MESKYKEILLLTGLDNITDEELDRFKFFLSDEFNIATGKLHTANRIQVATLMIQNAGAVS : .:::.:.:: ::. :.: .. : .::..... . ..::.: :: .. . . 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CCDS11 FTSIKSLLAYDLGLTTKMQEEYNRIKITDLMEKKFQGVACLDKLIELA-KDMPSLKNLVN 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 pF1KE3 D---EFNIATGKLHTANRIQVATLMIQNAGAVSAVMKTIRIFQKLNYMLLAKRLQEEKEK . : . .. :..: .. : . ...: ..: : : .::. .. .:.: CCDS11 NLRKEKSKVAKKIKTQEKAPVKKINQEEVG-LAAPAPTAR--NKLTSEARGRIPVAQKRK 90 100 110 120 130 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 VDKQYKSVTKPKPLSQAEMSP------AASAAIRNDVAKQRAAPKVS-PHVKPEQKQMVA . .. :. .: . .:: . .: ..:::. . : .. : :.:. .. CCDS11 TPNKEKTEAKRNKVSQEQSKPPGPSGASTSAAVDHPPLPQTSSSTPSNTSFTPNQETQAQ 140 150 160 170 180 190 150 160 170 180 190 pF1KE3 QQESIREGF-QKRCLPVMVLKAKKPFTFETQE-GKQEMFHATVATEKEFFFVKVFNTLLK .: . :.. :. . :.:::: :: .:. : ::. :::::::.. ..: ::::. :: CCDS11 RQVDARRNVPQNDPVTVVVLKATAPFKYESPENGKSTMFHATVASKTQYFHVKVFDINLK 200 210 220 230 240 250 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 DKFIPKRIIIIARYYRHSGFLEVNSASRVLDAESDQKVNVPLNIIRKAGETPKINTLQTQ .::. :..: :. : . .: .:.. :: : : .:. .:: ::. :..::::. : : CCDS11 EKFVRKKVITISDYSECKGVMEIKEASSVSDF--NQNFEVPNRIIEIANKTPKISQLYKQ 260 270 280 290 300 310 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 PLGTIVNGLFVVQKVTEKKKNILFDLSDNTGKMEVLGVRNEDTMKCKEGDKVRLTFFTLS ::.: :::..:: . .::: .....::::.:.:.: . ..::..:::.:: . : CCDS11 ASGTMVYGLFMLQKKSVHKKNTIYEIQDNTGSMDVVGSGKWHNIKCEKGDKLRLFCLQLR 320 330 340 350 360 370 320 330 340 pF1KE3 KNGEKLQLTSGVHSTIKVIKAKKKT .::.:. : :: :::::::: CCDS11 TVDRKLKLVCGSHSFIKVIKAKKNKEGPMNVN 380 390 400 >>CCDS1180.3 IFI16 gene_id:3428|Hs109|chr1 (729 aa) initn: 673 init1: 437 opt: 529 Z-score: 566.7 bits: 114.4 E(33420): 3.1e-25 Smith-Waterman score: 553; 42.0% identity (69.4% similar) in 245 aa overlap (98-341:468-709) 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 IFQKLNYMLLAKRLQEEKEKVDKQYKSVTKPKPLSQAEMSPAASAAIRNDVAKQRAAPKV : :. .. ..:: : .. . . . CCDS11 SSFFTKKSEDTISKMNDFMRMQILKEGSHFPGPF-MTSIGPAESHPHTPQMPPSTPSSSF 440 450 460 470 480 490 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 SPHVKPEQKQMVAQQESIREGFQKRCLPVMVLKAKKPFTFETQEGKQEMFHATVATEKEF .::. : .. ::... :. ::::.: . :..: .: :. :::::::::.: CCDS11 LTTLKPRLKTE-PEEVSIEDSAQSDLKEVMVLNATESFVYEPKEQKK-MFHATVATENEV 500 510 520 530 540 550 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 FFVKVFNTLLKDKFIPKRIIIIARYYRHSGFLEVNSASRVLDAESDQKVNVPLNIIRKAG : ::::: ::.:: ::.:: :: : ..::::: . : :...:.....: ..::.:. CCDS11 FRVKVFNIDLKEKFTPKKIIAIANYVCRNGFLEVYPFTLVADVNADRNMEIPKGLIRSAS 560 570 580 590 600 610 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 ETPKINTLQTQPLGTIVNGLFVVQKVTEKKKNILFDLSDNTGKMEVLGVRNEDTMKCKEG ::::: : .: :..:::.: :.: . . . ....::::::::. :..:.:: CCDS11 VTPKINQLCSQTKGSFVNGVFEVHKKNVRGEFTYYEIQDNTGKMEVVVHGRLTTINCEEG 620 630 640 650 660 670 310 320 330 340 pF1KE3 DKVRLTFFTLS-KNGEKLQLTSGVHSTIKVIKAKKKT ::..:: : :. :.:. .: : .:: :::::..: CCDS11 DKLKLTCFELAPKSGNTGELRSVIHSHIKVIKTRKNKKDILNPDSSMETSPDFFF 680 690 700 710 720 >-- initn: 683 init1: 437 opt: 538 Z-score: 576.3 bits: 116.1 E(33420): 9.1e-26 Smith-Waterman score: 538; 39.4% identity (69.1% similar) in 269 aa overlap (84-343:127-392) 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 QNAGAVSAVMKTIRIFQKLNYMLLAKRLQEEKEKVDKQYKSVTKPKPLSQAEMSPAASAA .:.: . . :. : . .:. . .: . :. CCDS11 KRKKEVDATSPAPSTSSTVKTEGAEATPGAQKRKKSTKEKAGPKGSKVSEEQTQPPSPAG 100 110 120 130 140 150 120 130 140 150 160 pF1KE3 IRNDVAKQRA-APKVSPHVKP-----EQKQMVAQ-QESIREG-FQKRCLPVMVLKAKKPF ..: :. .::.: . : :. . ::. : . :.. .::: . : ::.. ::: CCDS11 AGMSTAMGRSPSPKTSLSAPPNSSSTENPKTVAKCQVTPRRNVLQKRPVIVKVLSTTKPF 160 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 TFETQEGKQE-MFHATVATEKEFFFVKVFNTLLKDKFIPKRIIIIARYYRHSGFLEVNSA .:: : ... ::::::::. .:: :::.:: ::.:: :.::::. : .....:::: CCDS11 EYETPEMEKKIMFHATVATQTQFFHVKVLNTSLKEKFNGKKIIIISDYLEYDSLLEVNEE 220 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 SRVLDAESDQKVNVPLNIIRKAGETPKINTLQTQPLGTIVNGLFVVQKVTEKKKNILFDL : : .: .: .:: .:: .: :: ::. :. : :.:: :.:...: : ..:. .... CCDS11 STVSEAGPNQTFEVPNKIINRAKETLKIDILHKQASGNIVYGVFMLHKKTVNQKTTIYEI 280 290 300 310 320 330 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 SDNTGKMEVLGVRNEDTMKCKEGDKVRLTFFTLSKNGEKLQLTSGVHSTIKVIKAKKKT .:. :::.:.:. . .. :.::::..: : : :... .: : .:: :.. :::: CCDS11 QDDRGKMDVVGTGQCHNIPCEEGDKLQLFCFRLRKKNQMSKLISEMHSFIQI---KKKTN 340 350 360 370 380 390 CCDS11 PRNNDPKSMKLPQEQRQLPYPSEASTTFPESHLRTPQMPPTTPSSSFFTKKSEDTISKMN 400 410 420 430 440 450 >>CCDS30908.1 PYHIN1 gene_id:149628|Hs109|chr1 (452 aa) initn: 619 init1: 449 opt: 517 Z-score: 557.4 bits: 112.0 E(33420): 1e-24 Smith-Waterman score: 536; 38.2% identity (67.8% similar) in 267 aa overlap (81-338:125-391) 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 LMIQNAGAVSAVMKTIRIFQKLNYMLLAKRLQEEKEKVDKQYKSVTKPKPLSQAEMSPAA : .:.: .. .. :: . .:. . :. 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CCDS30 NEASSVSEAGPDQTFEVPKDIIRRAKKIPKINILHKQTSGYIVYGLFMLHTKIVNRKTTI 280 290 300 310 320 330 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 FDLSDNTGKMEVLGVRNEDTMKCKEGDKVRLTFFTLSKNGEKLQLTSGVHSTIKVIKAKK ....:.::.: :.: . .. :..:::.:: : : : . .: : .:: :.. : CCDS30 YEIQDKTGSMAVVGKGECHNIPCEKGDKLRLFCFRLRKRENMSKLMSEMHSFIQIQKNTN 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 KT CCDS30 QRSHDSRSMALPQEQSQHPKPSEASTTLPESHLKTPQMPPTTPSSSSFTKVTKDKDIK 400 410 420 430 440 450 >>CCDS30907.1 PYHIN1 gene_id:149628|Hs109|chr1 (461 aa) initn: 567 init1: 449 opt: 517 Z-score: 557.3 bits: 112.0 E(33420): 1e-24 Smith-Waterman score: 536; 38.2% identity (67.8% similar) in 267 aa overlap (81-338:134-400) 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 LMIQNAGAVSAVMKTIRIFQKLNYMLLAKRLQEEKEKVDKQYKSVTKPKPLSQAEMSPAA : .:.: .. .. :: . .:. . :. 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