FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9680, 807 aa 1>>>pF1KE9680 807 - 807 aa - 807 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9257+/-0.00108; mu= 8.6617+/- 0.065 mean_var=135.3393+/-26.516, 0's: 0 Z-trim(106.8): 56 B-trim: 99 in 1/51 Lambda= 0.110246 statistics sampled from 9151 (9179) to 9151 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16 Scan time: 2.520 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46422.1 EPC2 gene_id:26122|Hs108|chr2 ( 807) 5285 852.7 0 CCDS60511.1 EPC1 gene_id:80314|Hs108|chr10 ( 813) 2761 451.3 3e-126 CCDS73083.1 EPC1 gene_id:80314|Hs108|chr10 ( 763) 2481 406.8 7.2e-113 CCDS7172.1 EPC1 gene_id:80314|Hs108|chr10 ( 836) 2477 406.1 1.2e-112 >>CCDS46422.1 EPC2 gene_id:26122|Hs108|chr2 (807 aa) initn: 5285 init1: 5285 opt: 5285 Z-score: 4549.7 bits: 852.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5285; 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CCDS60 GFKMKDDVVLG-IGVNGVLPASGVYKGLHLSSTTPTALVHTSPSTAGSALLQPSNITQTS 650 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 750 pF1KE9 VGHTTTNHLIPALCTSSPQTLPMNNSCLTNAVHLNNVSVVSPVNV-HINTRTSAPSPTAL .:.. .: . : ... :.: :: :: . .:. ..:.:. :: :: .:: CCDS60 SSHSALSHQVTAANSATTQVLIGNNIRLTVPSSVATVNSIAPINARHIPRTLSAVPSSAL 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 pF1KE9 KLATVAASMDRVPKVTPSSAISSIARENHEPERLGLNGIAETTVAMEVT ::: ::. .: :: ::...:. ::::: :. .::.::..::::::: CCDS60 KLA--AAANCQVSKVPSSSSVDSVPRENHESEKPALNNIADNTVAMEVT 770 780 790 800 810 >>CCDS73083.1 EPC1 gene_id:80314|Hs108|chr10 (763 aa) initn: 2209 init1: 1271 opt: 2481 Z-score: 2139.8 bits: 406.8 E(32554): 7.2e-113 Smith-Waterman score: 2481; 53.6% identity (76.3% similar) in 778 aa overlap (52-807:2-763) 30 40 50 60 70 80 pF1KE9 GKDMPDLNDCVSINRAVPQMPTGMEKEEESEHHLQRAISAQQVFREKKESMVIPVPEAES :::::::::::::. ::...:::::::::: CCDS73 MEHHLQRAISAQQVYGEKRDNMVIPVPEAES 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE9 NVNYYNRLYKGEFKQPKQFIHIQPFNLDNEQPDYDMDSEDETLLNRLNRKMEIKPLQFEI :. ::. .: ::::.:::.::::::.:: ::::::.:::::...:.:..::.: ::::: CCDS73 NIAYYESIYPGEFKMPKQLIHIQPFSLDAEQPDYDLDSEDEVFVNKLKKKMDICPLQFEE 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE9 MIDRLEKASSNQLVTLQEAKLLLNEDDYLIKAVYDYWVRKRKNCRGPSLIPQIKQEKRDG :::::::.:..: :.::::::::.::: ::. ::.::..::::::::::::..::::::: CCDS73 MIDRLEKGSGQQPVSLQEAKLLLKEDDELIREVYEYWIKKRKNCRGPSLIPSVKQEKRDG 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE9 STNNDPYVAFRRRTEKMQTRKNRKNDEASYEKMLKLRREFSRAITILEMIKRREKTKREL :..:::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.:::::::::::.:::: CCDS73 SSTNDPYVAFRRRTEKMQTRKNRKNDEASYEKMLKLRRDLSRAVTILEMIKRREKSKREL 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 pF1KE9 LHLTLEVVEKRYHLGDYGGEILNEVKISRSE-KELYATPAT-LHNGNHHKVQECKTKHPH ::::::..::::.::::.:::..:: .:. : :: : . :... : :: . CCDS73 LHLTLEIMEKRYNLGDYNGEIMSEVMAQRQPMKPTYAIPIIPITNSSQFKHQEAMDVKEF 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KE9 HLSLKEEASDVVRQKKKYPKKPK---AEALITSQQPTPETLPVINKSDIKQYDFHSSDED ... :.. .:..: :.:: :::: . : : :: .: .:::.: .:..:::: ::::. CCDS73 KVN-KQDKADLIRPKRKYEKKPKVLPSSAAATPQQTSPAALPVFNAKDLNQYDFPSSDEE 280 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 430 pF1KE9 EFPQVLSPVSEPEEENDPDGPCAFRRRAGCQYYAPRLDQA-NHSCENSELADLDKLRYRH . :::: :: ::.:::::: ::::.::::::::.:::. : . . . : .:::. CCDS73 PLSQVLSGSSEAEEDNDPDGPFAFRRKAGCQYYAPHLDQTGNWPWTSPKDGGLGDVRYRY 340 350 360 370 380 390 440 450 460 470 480 490 pF1KE9 CLTTLTVPRRCIGFARRRIGRGGRVIMDRISTEHDPVLKQIDPEMLNSFSSSSQTIDFSS ::::::::.:::::::::.::::::..:: ...: :....: :::.: . : .. . CCDS73 CLTTLTVPQRCIGFARRRVGRGGRVLLDRAHSDYDSVFHHLDLEMLSSPQHSP--VNQFA 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 550 pF1KE9 NFSRTNASSKHCENRLSLSEILSNIRSCRLQCFQPRLLNLQDSDSEECTSRKPGQTVNNK : :.::.:.: . .::.:: ::.::: . :.:: .:.:::..: . :: ...: CCDS73 NTSETNTSDKSFSK--DLSQILVNIKSCRWRHFRPRTPSLHDSDNDELSCRKLYRSINRT 450 460 470 480 490 500 560 570 580 590 600 610 pF1KE9 RVSAASVALLNTSKNGISVTGG----ITEEQFQTHQQQLVQMQRQQLAQLQQKQQSQHSS .. .. .:: .. : .:. .: ::.: :::::. ::.:::::.::.: ...:: CCDS73 GTAQPGTQTCSTSTQSKSSSGSAHFAFTAEQYQQHQQQLALMQKQQLAQIQQQQANSNSS 510 520 530 540 550 560 620 630 640 650 660 670 pF1KE9 QQTHPKAQGSSTSDCMSKTLDSASAHFAASAVVSAPVPSRSEVAKEQNTGHNNINGVVQP .: .:: .:::::::::.:::::.:.. .. . : ..:::. CCDS73 TNT---SQG-----FVSKTLDSASAQFAASALVTSEQLMGFKMKDDVVLG-IGVNGVLPA 570 580 590 600 610 680 690 700 710 720 pF1KE9 SGTSKTLY---STNMAL-SSSPGISAVQLVR-------TVGHTTTNHLIPALCTSSPQTL ::. : :. .: :: .::. .. :.. . .:.. .: . : ... :.: CCDS73 SGVYKGLHLSSTTPTALVHTSPSTAGSALLQPSNITQTSSSHSALSHQVTAANSATTQVL 620 630 640 650 660 670 730 740 750 760 770 pF1KE9 PMNNSCLTNAVHLNNVSVVSPVNV-HINTRTSAPSPTALKLATVAASMDRVPKVTPSSAI :: :: . .:. ..:.:. :: :: .::::: ::. .: :: ::.. CCDS73 IGNNIRLTVPSSVATVNSIAPINARHIPRTLSAVPSSALKLA--AAANCQVSKVPSSSSV 680 690 700 710 720 730 780 790 800 pF1KE9 SSIARENHEPERLGLNGIAETTVAMEVT .:. ::::: :. .::.::..::::::: CCDS73 DSVPRENHESEKPALNNIADNTVAMEVT 740 750 760 >>CCDS7172.1 EPC1 gene_id:80314|Hs108|chr10 (836 aa) initn: 2479 init1: 1551 opt: 2477 Z-score: 2135.8 bits: 406.1 E(32554): 1.2e-112 Smith-Waterman score: 2742; 54.3% identity (76.4% similar) in 844 aa overlap (1-807:1-836) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MSKLSFRARALDAAKPLPIYRGKDMPDLNDCVSINRAVPQMPTGMEKEEESEHHLQRAIS :::::::::::::.::::..: .:.:::.. .:::::::::::::::::::::::::::: CCDS71 MSKLSFRARALDASKPLPVFRCEDLPDLHEYASINRAVPQMPTGMEKEEESEHHLQRAIS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 AQQVFREKKESMVIPVPEAESNVNYYNRLYKGEFKQPKQFIHIQPFNLDNEQPDYDMDSE ::::. ::...:::::::::::. ::. .: ::::.:::.::::::.:: ::::::.::: CCDS71 AQQVYGEKRDNMVIPVPEAESNIAYYESIYPGEFKMPKQLIHIQPFSLDAEQPDYDLDSE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 DETLLNRLNRKMEIKPLQFEIMIDRLEKASSNQLVTLQEAKLLLNEDDYLIKAVYDYWVR ::...:.:..::.: ::::: :::::::.:..: :.::::::::.::: ::. ::.::.. CCDS71 DEVFVNKLKKKMDICPLQFEEMIDRLEKGSGQQPVSLQEAKLLLKEDDELIREVYEYWIK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 KRKNCRGPSLIPQIKQEKRDGSTNNDPYVAFRRRTEKMQTRKNRKNDEASYEKMLKLRRE ::::::::::::..::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::. 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CCDS71 TGNWPWTSPKDGGLGDVRYRYCLTTLTVPQRCIGFARRRVGRGGRVLLDRAHSDYDSVFH 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE9 QIDPEMLNSFSSSSQTIDFSSNFSRTNASSKHCENRLSLSEILSNIRSCRLQCFQPRLLN ..: :::.: . : .. .: :.::.:.: . .::.:: ::.::: . :.:: . CCDS71 HLDLEMLSSPQHS--PVNQFANTSETNTSDKSFSK--DLSQILVNIKSCRWRHFRPRTPS 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE9 LQDSDSEECTSRKPGQTVNNKRVSAASVALLNTSKNGISVTGG----ITEEQFQTHQQQL :.:::..: . :: ...: .. .. .:: .. : .:. .: ::.: ::::: CCDS71 LHDSDNDELSCRKLYRSINRTGTAQPGTQTCSTSTQSKSSSGSAHFAFTAEQYQQHQQQL 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KE9 VQMQRQQLAQLQQKQQSQHSSQQTHPK-------------AQG--SSTSDCMSKTLDSAS . ::.:::::.::.: ...:: .: . :: . . .:::::::: CCDS71 ALMQKQQLAQIQQQQANSNSSTNTSQNLASNQQKSGFRLNIQGLERTLQGFVSKTLDSAS 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 690 pF1KE9 AHFAASAVVSAPVPSRSEVAKEQNTGHNNINGVVQPSGTSKTLY---STNMAL-SSSPGI :.:::::.:.. .. . : ..:::. ::. : :. .: :: .::. 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