FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5486, 339 aa 1>>>pF1KE5486 339 - 339 aa - 339 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7423+/-0.00109; mu= 13.2762+/- 0.064 mean_var=133.9867+/-43.388, 0's: 0 Z-trim(104.3): 410 B-trim: 941 in 2/48 Lambda= 0.110801 statistics sampled from 7279 (7827) to 7279 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16 Scan time: 1.750 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 2279 376.5 1.7e-104 CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1313 222.1 4.9e-58 CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1312 221.9 5.5e-58 CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 1299 219.8 2.3e-57 CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1271 215.4 5.2e-56 CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 1270 215.2 5.7e-56 CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 1268 214.9 7.1e-56 CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 1264 214.3 1.2e-55 CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1261 213.8 1.5e-55 CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1248 211.7 6.6e-55 CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 1190 202.4 4e-52 CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1082 185.1 6.4e-47 CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1075 184.0 1.4e-46 CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1069 183.1 2.7e-46 CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1057 181.2 1e-45 CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1056 181.0 1.1e-45 CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1056 181.0 1.1e-45 CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1049 179.9 2.5e-45 CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1025 176.1 3.8e-44 CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1018 174.9 7.6e-44 CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1014 174.3 1.2e-43 CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1001 172.2 5.1e-43 CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 998 171.7 7e-43 CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 990 170.4 1.7e-42 CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 987 170.0 2.4e-42 CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 982 169.2 4.2e-42 CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 969 167.1 1.7e-41 CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 955 164.8 8.2e-41 CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 910 157.7 1.2e-38 CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 909 157.5 1.4e-38 CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 898 155.7 4.6e-38 CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 897 155.6 5e-38 CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 882 153.2 2.7e-37 CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 881 153.0 3e-37 CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 880 152.9 3.4e-37 CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 877 152.4 4.7e-37 CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 873 151.8 7.4e-37 CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 871 151.4 9e-37 CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 870 151.3 1e-36 CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 869 151.1 1.1e-36 CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 866 150.6 1.6e-36 CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 864 150.3 2e-36 CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 ( 321) 861 149.8 2.8e-36 CCDS11023.1 OR3A1 gene_id:4994|Hs108|chr17 ( 315) 851 148.2 8.3e-36 CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 847 147.6 1.3e-35 CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 846 147.4 1.4e-35 CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 846 147.4 1.4e-35 CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 846 147.5 1.6e-35 CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 845 147.3 1.7e-35 CCDS42233.1 OR3A2 gene_id:4995|Hs108|chr17 ( 321) 844 147.1 1.8e-35 >>CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 (339 aa) initn: 2279 init1: 2279 opt: 2279 Z-score: 1989.6 bits: 376.5 E(32554): 1.7e-104 Smith-Waterman score: 2279; 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CCDS12 FFVLFGGLDSLLLAVMAYDRFVAICHPLHYTVIMNPRLCGLLVLASWMIAALNSLSQSLM 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV .: :. :..: .:::. .:..:: :::::.:.: .:: ..... :. ::: :: ::: CCDS12 VLWLSFCTDLEIPHFFCELNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGPLVGILCSYSKIV 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 SPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVVT : : . ...:::::::::.:::.:: :: ::: ::.::. . . : .:::::::.: CCDS12 SSIRAISSAQGKYKAFSTCASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVAT 230 240 250 260 270 280 310 320 330 pF1KE5 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG :::::::::::::::. :: CCDS12 PMLNPFIYSLRNKDIKRALKMSFRGKQ 290 300 >>CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 (320 aa) initn: 1308 init1: 1260 opt: 1271 Z-score: 1119.1 bits: 215.4 E(32554): 5.2e-56 Smith-Waterman score: 1271; 62.4% identity (83.7% similar) in 306 aa overlap (20-325:2-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN : : : ..::::::.: :.: .: :::::::::: :: CCDS12 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGN 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS ::::::. :::::::::::::::::.::. :::::::::.... :... :.: :::.:. CCDS12 LLIILAICSDSHLHTPMYFFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIF 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI ::. :.:.:..::.:::::::::.:::::: .::::.:::.:.: :. ::.. : :..: CCDS12 FFTSFGCLDNLLLTVMAYDRFVAVCHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLT 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV .:.:. ...: .:::: ..:.: :::::::..:::: ...: . ..::.::::::: CCDS12 VLRLSFCTEMEIPHFFCDLLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGVLGVISFTGIFFSYYKIV 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 SPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVVT :::. .. :.::::::::::.:: ::::::. :::::. :: : :.:::::::.:: CCDS12 FSILRISSAGRKHKAFSTCGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMVT 230 240 250 260 270 280 310 320 330 pF1KE5 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG :::::::::::: :.. :: :: .: CCDS12 PMLNPFIYSLRNTDMKRALGRLLSRATFFNGDITAGLS 290 300 310 320 >>CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 (312 aa) initn: 1266 init1: 1266 opt: 1270 Z-score: 1118.3 bits: 215.2 E(32554): 5.7e-56 Smith-Waterman score: 1270; 60.7% identity (86.7% similar) in 308 aa overlap (23-330:5-312) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN :.. . ::.::::: ::::::.: :::::::.:.::: CCDS32 MKAGNFSDTPEFFLLGLSGDPELQPILFMLFLSMYLATMLGN 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS :::::::.:::::::::::.:: :::.:: :::::.:::.:..:.... :.: :::::. CCDS32 LLIILAVNSDSHLHTPMYFLLSILSLVDICFTSTTMPKMLVNIQAQAQSINYTGCLTQIC 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI : ..:. ... .: .:::::::::::::.: .::::.:::.:.::::..:.::. ::.:. CCDS32 FVLVFVGLENGILVMMAYDRFVAICHPLRYNVIMNPKLCGLLLLLSFIVSVLDALLHTLM 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV .:::: :..: .:::. ...:.: :::..::....:.. ...: .:.:::.::: .:: CCDS32 VLQLTFCIDLEIPHFFCELAHILKLACSDVLINNILVYLVTSLLGVVPLSGIIFSYTRIV 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 SPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVVT : ....:.. ::::::: ::::: :: ::::::. ::::.. : ::. .::::::::: CCDS32 SSVMKIPSAGGKYKAFSICGSHLIVVSLFYGTGFGVYLSSGATHSSRKGAIASVMYTVVT 230 240 250 260 270 280 310 320 330 pF1KE5 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG :::::.::::::::. .:: .: .:: . : CCDS32 PMLNPLIYSLRNKDMLKALRKLISRIPSFH 290 300 310 >>CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 (309 aa) initn: 1300 init1: 1263 opt: 1268 Z-score: 1116.6 bits: 214.9 E(32554): 7.1e-56 Smith-Waterman score: 1268; 64.6% identity (86.2% similar) in 297 aa overlap (23-319:5-301) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN : : . ::::::.::.:::: : :::::::::::::: CCDS32 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGN 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS ::::::. :::::::::::::::::..:: :.:::::::.:..:::..::.: ::.::: CCDS32 LLIILATISDSHLHTPMYFFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMC 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI ::.::. .:..::.:::::::::::::::: .::::.:::.:.: :...:.:.:.:..:. 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CCDS32 PMLNPFIYSLRNKHIKGAMKTFFRGKQ 290 300 >>CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 (345 aa) initn: 1263 init1: 1263 opt: 1264 Z-score: 1112.6 bits: 214.3 E(32554): 1.2e-55 Smith-Waterman score: 1264; 58.4% identity (85.3% similar) in 320 aa overlap (7-326:10-329) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTV ...: .. . : .: :..:.:::::: ::::::::: .:::::::::. CCDS32 MPMQLLLTDFIIFSIRFIINSMEARNQTAISKFLLLGLIEDPELQPVLFSLFLSMYLVTI 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LGNLLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLT ::::::.::: :::::::::::::::::. :: ...::.:::.:..:...: :.: :::: CCDS32 LGNLLILLAVISDSHLHTPMYFFLSNLSFLDICLSTTTIPKMLVNIQAQNRSITYSGCLT 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 QMSFFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLH :. : ..:: ... ::..:::::.:::::::.: .::::::::.:::::.. :.... : CCDS32 QICFVLFFAGLENCLLAAMAYDRYVAICHPLRYTVIMNPRLCGLLILLSLLTSVVNALLL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 NLIMLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYY .:..:.:. :..: :::. .:...: ::::.::...::: . ::: .:.:::..:: CCDS32 SLMVLRLSFCTDLEIPLFFCELAQVIQLTCSDTLINNILIYFAACIFGGVPLSGIILSYT 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 KIVSPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYT .:.: .::.:...::.:: :::::::..: ::::.:: :.::.: ::::. ::::::. CCDS32 QITSCVLRMPSASGKHKAVSTCGSHLSIVLLFYGAGLGVYISSVVTDSPRKTAVASVMYS 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 pF1KE5 VVTPMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG : :.:::::::::::....: .. ::: CCDS32 VFPQMVNPFIYSLRNKDMKGTLRKFIGRIPSLLWCAICFGFRFLE 310 320 330 340 >>CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 (312 aa) initn: 1282 init1: 1253 opt: 1261 Z-score: 1110.5 bits: 213.8 E(32554): 1.5e-55 Smith-Waterman score: 1261; 61.8% identity (82.7% similar) in 306 aa overlap (20-325:2-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN : : :: ::.:::::::::::: . :::::::::::::: CCDS32 MEAGNQTGFLEFILLGLSEDPELQPFIFGLFLSMYLVTVLGN 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS ::::::.:::::::::::::::::: .:: :.. ::::.:..::....::: ::::. CCDS32 LLIILAISSDSHLHTPMYFFLSNLSWVDICFSTCIVPKMLVNIQTENKAISYMDCLTQVY 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI : ..: .: .::.:::::::::.:::::: :::::.:::.:......:... : :: . CCDS32 FSMFFPILDTLLLTVMAYDRFVAVCHPLHYMIIMNPHLCGLLVFVTWLIGVMTSLLHISL 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV :..: :: .: .:::. . .:.: :::::.: .:::: ...: .:. ::.::: .:. 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