FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4210, 730 aa 1>>>pF1KE4210 730 - 730 aa - 730 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1763+/-0.000904; mu= 6.6117+/- 0.055 mean_var=140.2385+/-28.197, 0's: 0 Z-trim(111.3): 40 B-trim: 30 in 1/50 Lambda= 0.108303 statistics sampled from 12257 (12288) to 12257 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.377), width: 16 Scan time: 4.440 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS45573.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 730) 4863 771.6 0 CCDS82035.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 711) 4726 750.2 2.4e-216 CCDS45574.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 715) 4324 687.4 2e-197 CCDS53277.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 727) 2085 337.6 4.1e-92 CCDS218.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 663) 1990 322.7 1.1e-87 CCDS53276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 681) 1791 291.6 2.6e-78 CCDS81276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 748) 1782 290.2 7.5e-78 CCDS69663.1 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 ( 991) 755 129.8 2e-29 CCDS6869.2 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 (1013) 755 129.8 2e-29 CCDS61491.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1782) 725 125.2 8.5e-28 CCDS61490.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1783) 725 125.2 8.5e-28 CCDS9807.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1804) 725 125.2 8.6e-28 CCDS41474.1 SIPA1L2 gene_id:57568|Hs108|chr1 (1722) 717 124.0 2e-27 CCDS33007.1 SIPA1L3 gene_id:23094|Hs108|chr19 (1781) 715 123.7 2.5e-27 CCDS8108.1 SIPA1 gene_id:6494|Hs108|chr11 (1042) 664 115.6 3.9e-25 >>CCDS45573.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 (730 aa) initn: 4863 init1: 4863 opt: 4863 Z-score: 4113.0 bits: 771.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4863; 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CCDS53 MSGRKRSFTFGAYGGVDKSFTSRRSVWRSDGQNQHFPQALDLSRVNLVPSYTPSLYPKNT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 EFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPYPSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWI ..:::.::::: ...::. : : :...:::::::. ::. . ::.: ..::::::::: CCDS53 DLFEMIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPYPSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 EDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKLECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGS : :: . .:: : : ::.: ::::. :: ::.:::::.:.:.: . CCDS53 E-----GTNHEI-TSI--PETEPLQSPTT-KVKLECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 SLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHERIPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGL .::.:..:.: . :.::..::.: .: :. ::.. :...:.: :.:: :.:. CCDS53 ALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDVIPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVD 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 RFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLL :: ::::::::..::..::: ..:.::::::::: :: :::::..::::::: :::..: CCDS53 RFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 GDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRH :. . :::::::::::::::::::.:::: .::..:::::::::::.:.::::::::::: CCDS53 GQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRH 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 IGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGP :::::::..::.::::::::::::::::::.:::.: : . : ::::::::.::: ::: CCDS53 IGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGP 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 PLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQA :::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..::::::.:::::::..:..::: :.:. CCDS53 PLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQS 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 MLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISH :.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.::..: ..:: .. . : ::... CCDS53 MMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNT--VSTSHSGSFAP 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 NSMEVTKTTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLFPRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSST :. ...:.. .: ..:: ...:: : .. : :. . . . .: . CCDS53 NNPDLAKAAGISLIV------PGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAG 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 pF1KE4 PKTPDGGHSSQEIKSETSSNPSSPEI--CPNKEKPFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTA ::::.:: ::: :::.::. ::::. :. . . : . .::::::.:: .:.. CCDS53 QKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVV 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KE4 GEGEAMEEGDSG-GSQPSTTSPFKQEVFVYSP--SPSSESPSLGAAATPIIMSRSP-TDA : :... :.: : :. .: :.. :.:: : . : :.. : :::: :: CCDS53 EETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSPGP---SRSPHPDA 650 660 670 680 690 700 710 720 730 pF1KE4 KSRNSPRSNLKFRFDKLSHASSGAGH . ..: CCDS53 GKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC 710 720 >>CCDS218.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 (663 aa) initn: 1964 init1: 1609 opt: 1990 Z-score: 1687.6 bits: 322.7 E(32554): 1.1e-87 Smith-Waterman score: 2181; 53.8% identity (76.0% similar) in 662 aa overlap (62-710:1-642) 40 50 60 70 80 pF1KE4 ANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPY :.::::: ...::. : : :...::::: CCDS21 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPY 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 PSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKL ::. ::. . ::.: ..:::::::::: :: . .:: : : . ::.: :: CCDS21 PSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIE-----GTNHEI-TSIPETEPLQ--SPTT-KVKL 40 50 60 70 80 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 ECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHER ::. :: ::.:::::.:.:.: ..::.:..:.: . :.::..::.: .: :. CCDS21 ECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDV 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 IPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQK ::.. :...:.: :.:: :.:. :: ::::::::..::..::: ..:.::::::::: CCDS21 IPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQK 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 ARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRD :: :::::..::::::: :::..::. . :::::::::::::::::::.:::: .::. CCDS21 LGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRN 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 REIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQ .:::::::::::.:.::::::::::::::::::..::.::::::::::::::::::.::: CCDS21 KEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQ 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 VETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDK .: : . : ::::::::.::: ::::::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..: CCDS21 AEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEK 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KE4 FAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHS :::::.:::::::..:..::: :.:.:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.: CCDS21 FAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQS 390 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 560 pF1KE4 METMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTKTTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLF :..: ..:: .. . : ::... :. ...:.. .: . .:: ...:: : CCDS21 MDAMGLSNKKPNT--VSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLIVPG------KSPTRKKSGPF 450 460 470 480 490 570 580 590 600 610 620 pF1KE4 PRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSSQEIKSETSSNPSSPEI--CPNKEK .. : :. . . . .: . ::::.:: ::: :::.::. ::::. :. . CCDS21 GSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAE 500 510 520 530 540 550 630 640 650 660 670 pF1KE4 PFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG-GSQPSTTSPFKQEVFVYSP-- . : . .::::::.:: .:.. : :... :.: : :. .: :.. :.:: CCDS21 TAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWL 560 570 580 590 600 610 680 690 700 710 720 730 pF1KE4 SPSSESPSLGAAATPIIMSRSP-TDAKSRNSPRSNLKFRFDKLSHASSGAGH : . : :.. : :::: :: . ..: CCDS21 EDSVSTTSGGSSPGP---SRSPHPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC 620 630 640 650 660 >>CCDS53276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 (681 aa) initn: 2002 init1: 1609 opt: 1791 Z-score: 1519.4 bits: 291.6 E(32554): 2.6e-78 Smith-Waterman score: 2138; 54.3% identity (76.1% similar) in 645 aa overlap (62-678:1-636) 40 50 60 70 80 pF1KE4 ANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPY :.::::: ...::. : : :...::::: CCDS53 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPY 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 PSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKL ::. ::. . ::.: ..:::::::::: :: . .:: : : ::.: :: CCDS53 PSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIE-----GTNHEI-TSI--PETEPLQSPTT-KVKL 40 50 60 70 80 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 ECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHER ::. :: ::.:::::.:.:.: ..::.:..:.: . :.::..::.: .: :. CCDS53 ECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDV 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 IPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQK ::.. :...:.: :.:: :.:. :: ::::::::..::..::: ..:.::::::::: CCDS53 IPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQK 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 ARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRD :: :::::..::::::: :::..::. . :::::::::::::::::::.:::: .::. CCDS53 LGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRN 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 REIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQ .:::::::::::.:.::::::::::::::::::..::.::::::::::::::::::.::: CCDS53 KEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQ 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 VETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDK .: : . : ::::::::.::: ::::::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..: CCDS53 AEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEK 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KE4 FAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHS :::::.:::::::..:..::: :.:.:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.: CCDS53 FAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQS 390 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 pF1KE4 METMVGGQKK------SHSGGI-PGS----LSGGISHNSMEVTKTTFS---PPVVAATVK :..: ..:: ::::.. :.. ..::: . . :. . .::. CCDS53 MDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLLIPGKSASRFGRRGSAIGIGTVE 450 460 470 480 490 500 560 570 580 590 600 pF1KE4 NQ----SRSPIKRRSGLFPRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSSQEIKSE .. ..:: ...:: : .. : :. . . . .: . ::::.:: ::: ::: CCDS53 ESLIVPGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSE 510 520 530 540 550 560 610 620 630 640 650 660 pF1KE4 TSSNPSSPEI--CPNKEKPFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG-GSQ .::. ::::. :. . . : . .::::::.:: .:.. : :... :.: : CCDS53 NSSTQSSPEMPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESV 570 580 590 600 610 620 670 680 690 700 710 720 pF1KE4 PSTTSPFKQEVFVYSPSPSSESPSLGAAATPIIMSRSPTDAKSRNSPRSNLKFRFDKLSH :. .: :.. :.:: CCDS53 SSSGTPHKRDSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC 630 640 650 660 670 680 >>CCDS81276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 (748 aa) initn: 2057 init1: 1609 opt: 1782 Z-score: 1511.1 bits: 290.2 E(32554): 7.5e-78 Smith-Waterman score: 2048; 50.3% identity (69.5% similar) in 704 aa overlap (62-678:1-695) 40 50 60 70 80 pF1KE4 ANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPY :.::::: ...::. : : :...::::: CCDS81 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPY 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 PSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKL ::. ::. . ::.: ..:::::::::: :: . .:: : : ::.: :: CCDS81 PSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIE-----GTNHEI-TSI--PETEPLQSPTT-KVKL 40 50 60 70 80 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 ECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHER ::. :: ::.:::::.:.:.: ..::.:..:.: . :.::..::.: .: :. CCDS81 ECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDV 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 IPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQK ::.. :...:.: :.:: :.:. :: ::::::::..::..::: ..:.::::::::: CCDS81 IPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQK 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 ARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRD :: :::::..::::::: :::..::. . :::::::::::::::::::.:::: .::. CCDS81 LGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRN 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 REIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQ .:::::::::::.:.::::::::::::::::::..::.::::::::::::::::::.::: CCDS81 KEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQ 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 VETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDK .: : . : ::::::::.::: ::::::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..: CCDS81 AEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEK 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KE4 FAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHS :::::.:::::::..:..::: :.:.:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.: CCDS81 FAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQS 390 400 410 420 430 440 510 520 pF1KE4 METMVGGQKK------SHSGG-----------------IPGSL----------------- :..: ..:: ::::. :::. CCDS81 MDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLLIPGKSASRFGRRGSAIGIGTVE 450 460 470 480 490 500 530 540 550 pF1KE4 ---------SGGISH--------NSMEVTKTTFSPPVVAATVKNQS-------------- ::: : .. .. .. :: : . : CCDS81 EVVVRGAAGSGGCLHALFSARSQDGGHIGDVAPLPPGQAPGRAGWSGGSSDGTQHLLWGL 510 520 530 540 550 560 560 570 580 590 600 pF1KE4 ------RSPIKRRSGLFPRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSSQEIKSET .:: ...:: : .. : :. . . . .: . ::::.:: ::: :::. CCDS81 SLIVPGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSEN 570 580 590 600 610 620 610 620 630 640 650 660 pF1KE4 SSNPSSPEI--CPNKEKPFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG-GSQP ::. ::::. :. . . : . .::::::.:: .:.. : :... :.: : CCDS81 SSTQSSPEMPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESVS 630 640 650 660 670 680 670 680 690 700 710 720 pF1KE4 STTSPFKQEVFVYSPSPSSESPSLGAAATPIIMSRSPTDAKSRNSPRSNLKFRFDKLSHA :. .: :.. :.:: CCDS81 SSGTPHKRDSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSPGPSRSPHPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQ 690 700 710 720 730 740 >>CCDS69663.1 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 (991 aa) initn: 608 init1: 608 opt: 755 Z-score: 641.9 bits: 129.8 E(32554): 2e-29 Smith-Waterman score: 755; 40.1% identity (69.0% similar) in 319 aa overlap (155-468:75-389) 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 SLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKLECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVK : : ..:::. : :. . . . ..::: CCDS69 ENGSSDENATALPGTWRRTDVHLENPEYHTRWYFKYFLGQVHQNYIGNDAEKSPFFLSVT 50 60 70 80 90 100 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 CEEAEG--IEYLRVILRSKLKTVHERIPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVLYP . .. . :.:: : : . .: . . : :: .: .:. : ...: CCDS69 LSDQNNQRVPQYRAILWRKTGTQKICLPYSPTKTL-SVKSILSAMNLDKFEKGPREIFHP 110 120 130 140 150 160 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 KASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQD . .. .. .:.: . .:::::.. : : ..:.:.:. : :..::.::::::::. 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